PROSITE entry PS51085
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51085
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | 2FE2S_FER_2 |
Accession [info] | PS51085 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-MAR-2005 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00175 |
Associated ProRule [info] | PRU00465 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8041449; R2=0.0109195; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2220.8164062; R2=6.3996887; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=614; H_SCORE=6150; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=431; H_SCORE=4979; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B1=-200; E1=-200; MI=-35; MD=-35; IM=-35; DM=-35; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-35; BD=-35; /M: M= -6,-10,-23,-11, -7, -8,-16, -2,-10, -7,-10, -2, -8, -4, -5, -8, -6, -5,-10,-18, 0, -8; /M: SY='K'; M= -7, 0,-24, -1, 6,-22,-16, -6,-19, 11,-18, -9, 1, -8, 6, 7, -1, -1,-15,-26,-12, 5; /M: SY='I'; M= -5,-28,-19,-33,-27, 3,-32,-27, 31,-24, 17, 13,-24,-24,-24,-23,-16, -5, 31,-22, -3,-27; /M: SY='T'; M= -4, -3,-18, -7, -2,-14,-19,-10,-12, 1,-13, -8, -1,-14, -3, 2, 4, 12, -6,-26, -8, -3; /M: SY='F'; M=-10,-28,-20,-33,-25, 21,-31,-22, 20,-25, 20, 11,-23,-26,-25,-19,-19, -8, 17,-13, 7,-25; /M: M= -7, -8,-22,-11, -5, -8,-21, -9, -4, -6, -5, -3, -6,-16, -5, -6, -5, -1, -4,-18, -3, -6; /M: SY='I'; M= -8,-13,-24,-15,-12, -7,-20,-14, 1,-13, -4, -2,-10, -8,-12,-11, -8, -4, 1,-22, -8,-14; /I: I=-5; MD=-4; /M: SY='N'; M= -9, 11,-24, 9, 6,-19,-10, 3,-20, 2,-21,-14, 13, -4, 3, 1, -1, -6,-22,-22,-10, 3; D=-5; /I: I=-5; MD=-4; /M: SY='D'; M= -6, 11,-20, 15, 3,-22, 7, -5,-23, -2,-19,-14, 7, -8, -2, -4, 1, -7,-18,-22,-15, 1; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='E'; M= -4, -2,-17, -1, 5,-14,-10, -4,-12, 3,-11, -6, -1, -8, 4, 3, 0, -1,-10,-17, -8, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-4; /M: SY='G'; M= -4, -3,-21, -2, -2,-18, 7,-11,-19, -6,-16,-11, -1,-11, -5, -6, 0, -4,-14,-21,-15, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-4; /M: SY='R'; M= -9, -9,-25, -9, -2,-11,-20, -2,-10, 3,-10, -4, -7,-17, 0, 5, -8, -6, -8,-18, 1, -2; /M: SY='T'; M= -4, -3,-20, -4, 5,-16,-18,-11,-13, -3,-13,-10, -4, -8, 0, -4, 4, 8, -8,-27,-12, 2; /M: SY='I'; M= -7,-24,-19,-29,-23, 14,-28,-19, 16,-21, 12, 8,-21,-25,-22,-18,-15, -5, 16,-14, 7,-23; /M: SY='E'; M= -7, 8,-25, 12, 18,-23,-15, -4,-22, 2,-19,-15, 2, -5, 5, -2, 2, -2,-19,-29,-14, 11; /M: SY='V'; M= 7,-21, 1,-25,-22, -7,-18,-24, 7,-19, 1, 0,-20,-23,-21,-20, -5, -2, 18,-27,-13,-22; /M: SY='E'; M= -5, 5,-27, 9, 10,-26,-12, -7,-22, 0,-22,-16, 1, 8, 2, -4, 0, -5,-21,-29,-18, 4; /M: SY='P'; M= -2, -2,-26, 2, 8,-24,-13,-11,-19, -3,-19,-14, -4, 11, -2, -8, -1, -5,-17,-28,-19, 2; /M: SY='G'; M= -5, 6,-26, 8, -4,-28, 25, -9,-33, -8,-27,-19, 7,-15, -8, -9, 2,-11,-25,-26,-22, -6; /M: SY='E'; M= -6, 4,-23, 6, 13,-23,-14, -6,-19, 1,-15,-10, 0, -9, 6, -2, 1, 0,-16,-28,-14, 9; /I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='T'; M= -3, -2,-17, -7, -6,-10,-15, -9,-10, -7,-11, -6, 1,-11, -5, -7, 10, 17, -7,-26, -6, -6; /M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-32,-25, 5,-32,-24, 29,-26, 29, 18,-27,-27,-22,-22,-22, -7, 24,-21, -2,-25; /M: SY='L'; M= -7,-27,-18,-29,-20, 6,-28,-19, 18,-26, 38, 19,-26,-28,-18,-18,-25, -9, 10,-20, -2,-19; /M: SY='D'; M=-11, 19,-27, 27, 19,-29,-13, 1,-28, 2,-23,-18, 8,-10, 8, -1, 1, -6,-24,-28,-13, 13; /M: SY='A'; M= 20,-15,-13,-21,-15, -7,-10,-18, -2,-14, -3, -4,-13,-17,-14,-17, 0, -1, 5,-18, -8,-14; /M: SY='L'; M= 12,-21,-11,-26,-17, -4,-16,-20, 6,-21, 16, 7,-19,-21,-16,-20,-11, -6, 6,-21, -9,-17; /M: SY='R'; M=-10, -9,-25,-10, 1,-13,-21, -4, -8, -1, -2, -1, -6,-18, 0, 8,-10, -8, -8,-23, -7, -1; /M: SY='E'; M= -6, 3,-26, 5, 13,-23,-14, -3,-24, 11,-19,-13, 2,-12, 8, 13, -1, -7,-20,-24,-12, 9; /M: SY='N'; M= 1, -1,-22, -6, -1,-18,-15, 0, -8, -5, -9, -5, 4,-16, 3, -6, -2, -5,-10,-26,-10, 0; /I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='G'; M= -3, 1,-26, 0, -8,-27, 35,-10,-33,-10,-28,-19, 7,-16, -9,-10, 4,-11,-26,-26,-23, -9; /M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-30,-22, 4,-31,-21, 24,-23, 23, 14,-23,-25,-19,-19,-19, -7, 19,-20, -1,-22; /M: SY='D'; M= -6, 7,-23, 9, 7,-20,-14, -7,-21, -2,-19,-15, 2, -4, -2, -5, 2, 1,-17,-26,-12, 2; /I: I=-6; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='I'; M= -9,-23,-21,-29,-22, 9,-28,-19, 16,-22, 15, 9,-19,-21,-19,-18,-15, -2, 12,-17, 3,-21; /M: SY='P'; M=-10, -9,-31, -4, 5,-23,-18, -9,-21, 6,-21,-12, -9, 23, -1, 5, -7, -9,-21,-26,-17, 0; /M: SY='Y'; M= -7,-12,-23,-14,-10, -2,-14, 4,-12, -7, -9, -5, -8,-19, -7, -2, -6, -6,-10,-12, 8,-10; /M: SY='S'; M= 4, -3,-20, -4, -5,-16, 7,-13,-18,-12,-17,-13, 1,-14, -8,-13, 9, -2,-13,-27,-17, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M= -9, -5,-27, -4, 0,-20, 2, -3,-27, 5,-19,-12, -1,-18, 0, 15, -5,-11,-21,-19,-10, -2; /I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='E'; M= 1, 0,-19, -1, 6,-17, -7, -3,-14, -3,-12, -7, 0,-11, 1, -5, 1, -4,-12,-23,-11, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-5; /M: SY='G'; M= 3, -9,-28,-10,-18,-29, 61,-19,-37,-19,-29,-19, 0,-18,-18,-19, 3,-16,-27,-21,-29,-18; /I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='A'; M= 9, -8,-17,-12, -9,-17, -5,-15, -6,-11,-11, -6, -4,-16, -7,-13, 4, 0, -2,-26,-15, -9; /I: I=-10; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 2, -7,-24, -8,-12,-24, 33,-14,-30,-11,-25,-16, 1,-17,-12, -9, 6, -7,-20,-24,-22,-13; /M: SY='T'; M= 11, -5,-12,-11, -7,-15,-12,-16, -9,-10,-11, -7, -3,-12, -5,-11, 15, 20, -1,-29,-14, -6; /M: SY='C'; M=-10,-17,114,-26,-28,-21,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-18,-39,-29,-29,-10,-10,-11,-50,-30,-28; /I: I=-8; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='A'; M= 3, -9,-20,-13, -8,-15,-10, -1,-12, -4, -9, -4, -6,-16, -5, -2, -1, 0, -7,-23, -8, -8; /M: SY='V'; M= -2,-24, -7,-27,-25, -3,-23,-23, 17,-18, 7, 11,-23,-26,-22,-18,-11, -4, 28,-27,-10,-24; /M: SY='R'; M=-11, -7,-24, -8, 0,-11,-22, -4, -6, 0, -4, 0, -5,-18, -1, 2, -9, -7, -7,-22, -3, -2; /M: SY='V'; M= -5,-28,-16,-33,-28, 1,-32,-27, 32,-24, 16, 14,-25,-26,-24,-23,-15, -5, 34,-25, -5,-27; /M: SY='D'; M= -8, 11,-22, 12, 6,-21,-12, -6,-17, -3,-15,-13, 9,-14, -1, -4, 1, -2,-14,-31,-15, 2; /M: SY='G'; M= -2, 1,-27, 3, 1,-28, 23,-10,-32, -5,-26,-18, 3,-11, -5, -8, 3,-10,-25,-26,-22, -2; /I: I=-3; MD=-2; /M: SY='G'; M= -1, -4,-17, -4, -5,-13, 16, -8,-16, -8,-12, -9, -1, -9, -7, -8, -1, -7,-13,-12,-10, -6; D=-3; /I: I=-3; MD=-2; /M: M= -4, -1,-15, 0, 0, -7, -8, -4, -9, -4, -8, -6, -2, -9, -2, -5, -2, -3, -8, -9, -4, -1; D=-3; /I: I=-3; MD=-2; /M: M= -4, -5,-13, -4, -4, -5,-10, -6, -2, -6, -4, -3, -6, -7, -6, -7, -5, -4, -1,-11, -1, -6; D=-3; /I: I=-3; MD=-2; /M: SY='D'; M= -4, 6,-12, 8, 7,-13, -7, 0,-12, 0,-10, -7, 3, -5, 3, -1, 1, -2,-10,-16, -7, 4; D=-3; /I: I=-3; MD=-2; /M: SY='Q'; M= -3, -4,-11, -5, -1, -8, -9, -3, -4, -2, -2, -1, -4, -7, 1, -2, -3, -3, -5,-12, -4, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: M= -1, -5,-10, -5, -2, -4, -7, -5, -3, -5, -1, 0, -4, -7, -3, -5, -1, -1, -3,-12, -4, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: M= -2, -3,-11, -4, -4, -1, -6, -3, -6, -7, -2, -3, -4, -9, -6, -7, -3, -3, -4,-10, -2, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='L'; M= -4, -8,-11, -7, -6, -2, -9, -8, 1, -8, 7, 2, -8,-11, -7, -6, -8, -5, 0,-11, -4, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='S'; M= 1, -1,-11, -2, -1, -8, -6, -7, -8, -4, -8, -5, -1, -5, -3, -5, 4, 2, -5,-15, -8, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='D'; M= -1, 0,-14, 1, 0, -9, -8, -5,-10, -3, -8, -7, -3, -6, -4, -5, -2, -3, -8,-11, -6, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='D'; M= -3, 3,-17, 4, 3,-15, 2, -5,-17, 0,-14,-10, 1, -6, -1, -2, -1, -6,-14,-15,-10, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='E'; M= -5, 3,-15, 5, 12,-15, -8, 0,-13, 3, -9, -7, 0, -4, 7, 1, -1, -5,-12,-15, -8, 9; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='L'; M= -3,-10,-14,-11, -6, -4,-13, -8, 2, -5, 4, 3, -9,-12, -5, -1, -8, -4, 2,-13, -4, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='E'; M= 0, 0,-15, 1, 7,-16, -9, -5,-14, 2,-12, -9, -1, -2, 3, 0, 2, -1,-11,-17,-11, 5; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='E'; M= -3, 1,-19, 3, 9,-18,-10, -1,-16, 2,-14, -9, -1, 1, 6, 1, -1, -5,-15,-18,-10, 7; D=-3; /I: I=-3; DM=-2; /M: SY='G'; M= -6, -3,-24, -5, -4,-21, 9, -9,-26, 1,-22,-13, 2,-16, -4, 2, -1, -7,-20,-22,-15, -5; /M: M= -4, -8,-22,-10, -8, -6,-14, -8,-10, -9,-12, -9, -3, -9, -8, -9, -1, -2,-11,-14, -1, -9; /M: SY='R'; M= -4,-16,-18,-18,-12,-12,-19,-15, -3, 0, -6, -1,-12,-20, -8, 10, -6, -2, 6,-24,-10,-12; /I: I=-9; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='L'; M= -8,-19,-18,-22,-15, 0,-24,-15, 7,-18, 26, 10,-17,-22,-13,-10,-19, -7, 1,-23, -5,-15; /M: SY='A'; M= 23, -8,-12,-13, -9,-17, 0,-17,-13,-12,-13,-11, -4,-11, -9,-16, 15, 8, -5,-27,-18, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Q'; M= -5,-12,-19,-15, -4,-17,-22, -9, -2, -5, -2, 3,-10,-18, 10, -3, -6, -3, -3,-24, -9, 2; /M: SY='T'; M= 5,-12, -9,-19,-14, -9,-19,-18, 1,-13, -2, 0,-10,-17,-11,-14, 3, 12, 6,-26,-10,-13; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-25,-15, -8, -5,-22, -8, -7, -3, -5, -3,-11, -6, -7, 0,-11, -6, -8,-16, 1, -9; /M: SY='V'; M= 3,-23,-20,-24,-18, -9,-23,-23, 10,-18, 4, 4,-22, 2,-18,-20,-10, -4, 12,-25,-13,-19; /M: SY='R'; M= -4, -5,-16, -7, -3,-17,-14,-10,-15, 0,-14, -8, -3,-14, -2, 2, 1, 2, -9,-25,-11, -3; /M: SY='S'; M= -1, 7,-21, 9, 8,-26, -4, -6,-24, -2,-24,-16, 6, -7, 3, -6, 11, 3,-19,-31,-18, 5; /I: I=-7; MD=-6; /M: M= -1, -5, -6, -5, -2, -4, -9, -6, -3, -6, 0, -2, -6, -9, -5, -7, -4, -3, -1,-12, -4, -4; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='D'; M= -8, 15,-28, 21, 1,-31, 20, -8,-35, -7,-28,-22, 10,-10, -7,-12, 1,-12,-28,-30,-23, -3; /M: SY='M'; M= -3,-18, -5,-23,-17, -6,-22,-16, 6,-16, 9, 11,-17,-23,-13,-14,-12, -5, 7,-25, -9,-16; /M: SY='T'; M= -2, -6,-18, -7, 0,-15,-19,-11, -8, 0,-11, -7, -5,-15, -4, -1, 1, 4, -1,-27,-11, -3; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-28, 3,-34,-28, 35,-25, 19, 15,-25,-25,-24,-24,-17, -6, 34,-23, -3,-28; /M: SY='E'; M= -8, -1,-24, 1, 12,-18,-20, -3,-17, 3,-13, -9, -3,-12, 4, 3, -1, 1,-13,-25, -8, 7; /M: SY='T'; M= -3,-14,-17,-19,-15, -5,-24,-21, 4,-15, 1, -1,-13, -9,-15,-15, 0, 15, 7,-24, -8,-16; /M: SY='P'; M= -8,-10,-26,-10, -5,-14,-20, -6, -5,-10, -6, -3, -9, 1, -6,-10, -8, -6, -7,-26,-10, -7; /M: SY='E'; M= -5, 0,-26, 3, 14,-22,-14, -7,-21, 1,-19,-14, -2, 4, 3, -4, 0, -4,-19,-26,-14, 7; /M: SY='E'; M= -6, -3,-27, -1, 4,-19, -1, -4,-21, -5,-17,-11, -2, -8, -2, -7, -3, -7,-19,-20,-10, 0; /M: M= -7, -9,-23, -9, -3,-12,-19,-11, -6, -8, -3, -1, -9, -8, -5, -6, -6, -3, -6,-24, -9, -5; /I: E1=0; IE=-35; DE=-35;» more |
Post-processing [info]
COMPETES_HIT_WITH | PS51379 |
Numerical results [info]
Total number of hits | 456 in 456 different sequences |
Number of true positive hits | 456 in 456 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 14 |
Number of 'partial' sequences | 10 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.02 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | window20 |
Author [info] | N_Hulo |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | 2Fe-2S ferredoxin-type |
Version [info] | 6 |
Cross-references [info]