PROSITE entry PS51100
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | PTS_EIIB_TYPE_3 |
Accession [info] | PS51100 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00795 |
Associated ProRule [info] | PRU00423 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | PTS_EIIB type-3 domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0987334; R2=0.0149791; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7160.5034180; R2=5.0758986; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=561; H_SCORE=10008; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=294; H_SCORE=8653; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -5, 1,-25, 2, 13,-21,-17, -4,-14, 10,-10, 6, -5,-10, 6, 1, -7, -9,-13,-25,-12, 10; /M: SY='M'; M= -9,-12,-25,-16, -6,-15,-25,-13, 1, 6, -1, 8,-10,-16, 3, 0,-10, -2, -2,-21, -6, -3; /M: SY='K'; M=-10, 4,-24, -1, 2,-22,-17, 5,-24, 21,-23,-10, 9,-14, 4, 18, -1, 3,-18,-26, -8, 2; /M: SY='I'; M= -5,-28,-22,-32,-28, -2,-24,-28, 30,-25, 15, 12,-23,-25,-24,-24,-16, -7, 29,-24, -7,-28; /M: SY='M'; M= -8,-25,-21,-28,-23, 4,-20,-14, 18,-20, 19, 21,-23,-26,-16,-18,-19, -9, 14,-16, 5,-21; /M: SY='L'; M= -7,-30,-20,-32,-25, 5,-32,-25, 29,-27, 33, 17,-28,-28,-23,-22,-23, -7, 25,-23, -3,-25; /M: SY='L'; M=-10,-29, -2,-32,-25, 19,-30,-23, 12,-28, 25, 9,-27,-31,-28,-21,-21, -8, 14,-19, 1,-25; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='A'; M= 26, -6,-12,-11, -8,-20, 6,-17,-17,-11,-19,-14, -1,-11, -8,-16, 20, 9, -7,-28,-20, -8; /M: SY='G'; M= 13,-15,-25,-18,-18,-19, 29,-21,-23,-18,-15,-13,-10,-19,-17,-20, -4,-14,-17, -3,-18,-17; /M: SY='G'; M= 1, -9,-28, -9,-18,-29, 61,-19,-38,-19,-30,-20, 1,-19,-18,-19, 5,-15,-28,-22,-29,-18; /M: SY='M'; M= 4,-17,-20,-25,-20, 4, 5,-13, -6,-17, -1, 12,-13,-20,-15,-17, -8,-10, -4,-14, -6,-17; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15, -9,-15,-15,-10,-21,-15, 5,-10, -5,-10, 31, 34, -5,-35,-15, -5; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15, 5,-10, -5,-10, 29, 36, -5,-35,-15, -5; /M: SY='S'; M= 13, -3,-14, -5, -6,-22, 15,-13,-23,-12,-28,-19, 5,-12, -6,-13, 27, 9,-13,-33,-22, -6; /M: SY='L'; M= -4,-23,-21,-26,-15, -1,-26,-16, 15,-21, 29, 18,-22,-23, -7,-16,-20, -9, 6,-20, -3,-12; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-18, 20,-28, 47, 25,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='A'; M= 29,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24, 7,-14, -2, -2,-18,-18,-18,-20, 2, 0, 21,-24,-16,-18; /M: SY='N'; M= -4, 14,-20, 6, 3,-23, -9, -2,-21, 9,-27,-15, 23,-13, 8, 4, 12, 6,-20,-32,-16, 6; /M: SY='K'; M= 4, 5,-23, -2, 2,-24,-11, -7,-23, 22,-24,-12, 10,-13, 3, 16, -1, -5,-17,-24,-15, 2; /M: SY='M'; M= -8,-25,-19,-31,-23, 1,-26,-13, 26,-17, 22, 39,-23,-23,-12,-16,-19, -8, 21,-22, -2,-18; /M: SY='R'; M=-11, 3,-23, -3, -2,-20,-16, -3,-17, 12,-19, -9, 12,-18, 6, 24, -1, 0,-13,-27,-13, 1; /M: SY='K'; M= 4, -3,-25, -4, 13,-25,-17,-12,-18, 20,-19,-10, -4, -9, 5, 6, -4, -8,-13,-22,-14, 8; /M: SY='A'; M= 19, -3,-19, -5, 9,-26, 2,-11,-20, -4,-18,-13, -3, -9, 5,-11, 9, -4,-15,-24,-20, 7; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='N'; M= -3, 11,-22, 7, 11,-14,-13, -6,-21, 2,-19,-15, 12,-12, -1, -4, 3, 1,-18,-27,-13, 6; /M: SY='E'; M= -8, 2,-23, 1, 12,-20,-17, -7,-19, 10,-14,-11, 4,-12, 4, 9, 1, 1,-16,-28,-13, 8; /M: SY='Q'; M=-12, -7,-27, -6, 8, -9,-24, 3,-13, 1, -7, -4, -8,-16, 12, 4, -7, -3,-16,-10, 12, 8; /M: SY='G'; M= -4, 2,-29, 1, 3,-29, 38,-11,-35,-10,-28,-20, 8,-15, -7,-12, 1,-15,-30,-25,-26, -2; /M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-33,-27, 2,-32,-24, 33,-24, 22, 21,-26,-26,-21,-22,-18, -6, 31,-24, -4,-26; /M: SY='D'; M=-17, 21,-33, 35, 16,-34,-15, -5,-33, 2,-28,-24, 5, 15, 0, -2, -4,-10,-29,-34,-21, 6; /M: SY='V'; M= 13,-22, 17,-27,-24,-10,-21,-27, 5,-19, -2, -2,-22,-26,-24,-22, -4, -2, 22,-31,-17,-24; /M: SY='V'; M= -7,-14,-21,-18,-14,-11,-25, 1, 6, -9, -5, 3, -9,-19, -9,-10, -4, 0, 9,-27, -3,-14; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='V'; M= 15,-23,-16,-30,-23, -7,-22,-26, 22,-20, 6, 6,-20,-20,-20,-23, -6, -3, 26,-23,-10,-23; /M: SY='E'; M= 5, 7,-22, 7, 14,-24, -2, -9,-20, -3,-18,-16, 4,-11, -1,-10, 3, -7,-15,-29,-20, 6; /M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17, 5, -2,-25,-20, -8; /M: SY='F'; M= -3,-20,-26,-25,-23, 9, 7,-19, -5,-23, -5, -4,-12,-22,-23,-21,-10,-13, -5, -8, 1,-23; /M: SY='G'; M= 12, -8,-20,-10,-10,-23, 18,-18,-23,-13,-23,-16, -3, -1,-11,-17, 11, 2,-16,-26,-23,-11; /M: SY='E'; M= -5, -2,-26, 0, 21,-12,-20, 2,-17, 1,-13,-11, -6,-11, 9, -5, -2, -3,-18,-13, 7, 14; /M: SY='G'; M= 2,-12,-25,-15,-19,-17, 29,-17,-19,-18,-17,-11, -5,-19,-17,-19, -1, -7,-14,-16,-12,-19; /M: SY='E'; M= 5, -2,-24, -1, 22,-22,-16,-10,-19, 8,-11,-10, -6, -8, 5, -1, -3, -7,-15,-24,-15, 14; /M: SY='H'; M= -6,-16,-21,-22,-16, 10,-22, 12, -1,-18, 4, 8,-10,-21,-12,-14,-11, -5, -3,-17, 8,-15; /M: SY='R'; M= -7, -3,-27, -6, -3,-18, -6, -4,-25, 18,-22,-11, 3,-17, 1, 21, -6, -9,-19,-16, -3, -3; /M: SY='D'; M=-14, 22,-29, 33, 24,-30,-17, -4,-29, 9,-19,-18, 6,-10, 5, 0, -5,-10,-24,-31,-16, 15; /M: SY='Y'; M=-13,-11,-29,-13, -3, -4,-26, -1, -4, 10, -7, 5,-11,-18, 0, 2,-15,-10, -8, -6, 19, -4; /M: SY='M'; M= 3, -7,-21,-12, -5,-15, -4, -9, -8, -4, -3, 7, -4,-16, -4, -8, -7, -8, -8,-23,-13, -4; /M: SY='E'; M= -9, 2,-30, 4, 17,-31, -7, -4,-27, 10,-25,-13, 4, 3, 17, 3, -2,-10,-28,-26,-18, 16; /M: SY='E'; M=-11, 13,-27, 18, 22,-28,-17, -3,-21, 1,-21,-16, 6, 0, 9, -5, -1, -8,-20,-32,-19, 15; /M: SY='Y'; M= 2,-22, -2,-27,-22, 11,-23,-14, 3,-19, 3, -1,-21,-27,-21,-19,-11, -6, 8,-10, 12,-22; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= 2,-28,-15,-30,-25, 0,-28,-26, 25,-22, 19, 11,-27,-27,-24,-21,-14, -4, 32,-25, -8,-25; /M: SY='V'; M= 5,-25, -1,-30,-25, -5,-27,-27, 19,-22, 9, 6,-23,-25,-23,-23,-11, -4, 25,-27,-11,-25; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23, 6,-32,-21, 28,-28, 39, 24,-26,-26,-18,-22,-26,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-22, 8,-31,-22, 25,-29, 42, 19,-29,-29,-21,-21,-27, -9, 17,-21, -1,-22; /M: SY='G'; M= 18, -8,-23,-11, -8,-26, 35,-18,-28,-13,-22,-16, -4,-14,-12,-18, 4,-12,-19,-21,-25,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='R'; M= 5, -7,-21, -9, -1,-21,-11, -8,-23, 14,-21,-12, -1,-14, 3, 26, 5, -1,-13,-24,-15, -1; /M: SY='Y'; M=-12,-14,-24,-15,-14, 18,-21, 16, -8,-12, -9, -5, -9,-24, -9,-10, -4, -3,-11, 4, 43,-14; /M: SY='M'; M=-11,-12,-21,-19,-16, 6,-22, 0, 7,-13, 12, 21,-10,-23, -7,-11,-15, -3, -1,-12, 15,-13; /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-20,-13, 18,-27, -7, -5, 0, 4, 1,-16,-24,-13, -2,-19,-10, -7, -1, 23,-13; /M: SY='D'; M=-12, 17,-28, 23, 9,-30,-13, -5,-30, 12,-29,-20, 11, 0, 2, 8, 0, -6,-25,-32,-18, 4; /M: SY='E'; M= -9, 20,-25, 24, 25,-28,-13, -3,-28, 6,-24,-20, 12, -8, 7, -2, 6, 1,-24,-34,-18, 16; /M: SY='M'; M= -8,-25,-20,-31,-23, 9,-27,-17, 22,-22, 20, 23,-21,-23,-16,-19,-16, -6, 16,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M=-11, 2,-30, 5, 27,-31,-20, -1,-28, 26,-23,-11, 0, -8, 25, 20, -4,-10,-26,-23,-13, 26; /M: SY='K'; M= 2, -5,-21, -5, 5,-22,-15,-11,-18, 15,-20,-11, -3,-13, 2, 11, 3, -2, -8,-26,-14, 3; /M: SY='L'; M=-11,-10,-25, -8, -3,-12,-26,-15, 3, -6, 5, 1,-12,-19, -7, -4,-14, -9, 2,-25, -8, -6; /M: SY='A'; M= 13,-18, -2,-24,-17, -6,-19,-22, 2,-20, 12, 1,-18,-22,-17,-20, -6, 2, 7,-25,-12,-17; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='D'; M= -4, 16,-20, 24, 12,-26, 2, -5,-27, -4,-25,-21, 10, -9, 0, -9, 13, 0,-20,-31,-19, 6; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='E'; M= -7, -1,-21, 2, 14,-20,-13, -5,-20, 14,-19,-12, -1, 4, 6, 12, 0, -4,-17,-20,-13, 9; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='Y'; M= -9,-12,-19,-11, -7, 3,-17, 0, -3, -3, -1, -1,-12, -2, -6, -5,-12, -6, -8, 1, 19, -9; D=-5; /I: I=-5; MI=-10; MD=-10; IM=-10; DM=-10; /M: SY='N'; M= -4, 15,-18, 6, -6,-18, 21, -2,-21, -6,-22,-15, 26,-15, -6, -6, 4, -6,-22,-24,-18, -6; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-24,-18, -4,-28,-21, 21,-13, 11, 9,-15,-17,-13,-14,-12, -1, 16,-19, -3,-18; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='P'; M= -9,-15,-32, -9, -2,-25, -6,-15,-21, -5,-25,-16,-13, 52, -8, -7, -7,-10,-25,-24,-24, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='V'; M= -4,-22, 0,-27,-24, -3,-28,-25, 21,-21, 6, 6,-19,-22,-21,-21, -9, 1, 25,-25, -8,-24; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='E'; M= 9, 8,-18, 9, 10,-24, -9, -7,-19, -2,-15,-13, 1, -7, 6, -8, 5, 0,-14,-24,-15, 8; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='V'; M= -3,-18,-13,-22,-22, -1,-24,-20, 22,-17, 9, 7,-14,-24,-20,-16,-10, -2, 28,-25, -8,-22; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='I'; M= -6,-26,-22,-32,-26, 0,-32,-26, 39,-24, 15, 15,-20,-20,-20,-24,-15, -6, 31,-20, -2,-26; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= -3, 16,-23, 21, 6,-26, -7, -7,-23, -4,-24,-20, 9, 10, -3,-11, 4, -3,-20,-30,-19, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='S'; M= -1, -1,-13, -8, -7,-10, -8, -5, -4, -8, -9, 7, 4,-13, -1, -8, 11, 10, -4,-28,-10, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='M'; M= 3,-13,-17,-16, -7,-10,-14, -9, -3, -6, 5, 6,-10,-16, 1, -1, -5, -4, -3,-19, -8, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= -4, 11,-21, 18, -1,-21, -2,-10,-16, -9,-10,-12, 0,-15, -9,-13, -4, -8, -9,-27,-15, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-23,-23,-20, 33,-25, 6, 2,-13, 5, 7,-17,-25,-14,-11,-17, -9, -4, 15, 49,-18; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= 4, -6,-24, -6, -6,-25, 43,-15,-30,-13,-23,-16, -1,-14,-11,-15, 1,-14,-23,-19,-24, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='M'; M=-10,-13,-20,-17,-10, -2,-20, -3, 0, 1, 4, 17,-12,-17, -2, 5,-12, -3, -2,-12, 7, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='M'; M= -7,-21,-17,-27,-20, 1,-22, -9, 22,-14, 19, 37,-20,-20, -8,-13,-17, -7, 16,-19, -1,-15; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M=-14, 23,-24, 25, 7,-25,-10, 13,-27, 8,-24,-16, 20,-13, 4, 8, -2, -8,-24,-29,-10, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= -1,-11,-25,-11,-17,-21, 48,-17,-27,-19,-16,-12, -4,-19,-17,-17, -4,-16,-21,-17,-22,-17; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= -9, 10,-20, 12, 5,-17,-15, -8,-13, -1, -9,-10, 4,-13, -3, -5, -2, 1, -9,-27,-12, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='K'; M= -7, 0,-26, 1, 11,-26, -6, -9,-27, 30,-25,-11, 0, -9, 6, 16, -6,-10,-20,-18,-12, 8; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='V'; M= 4,-20,-15,-24,-20, -5,-22,-22, 22,-18, 5, 6,-16,-18,-17,-19, -3, -1, 24,-23, -8,-20; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='L'; M= -9,-25,-20,-24,-15, 4,-25,-17, 12,-24, 33, 12,-25,-11,-16,-17,-24, -9, 4,-19, -4,-16; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='K'; M= -7, 15,-23, 13, 11,-26,-12, -5,-26, 16,-27,-17, 15,-11, 4, 7, 6, 3,-21,-31,-15, 8; /M: SY='Q'; M= -3, -8,-25, -9, 6,-25,-20, -3,-11, 4, -5, 2, -8,-14, 27, 2, -7, -9,-16,-20, -9, 17; /M: SY='A'; M= 32,-12,-17,-20,-14,-20, 13,-21,-11,-14,-12, -9, -9,-13,-13,-21, 4, -6, -4,-20,-20,-14; /M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-32,-24, 6,-32,-24, 28,-29, 38, 19,-28,-28,-21,-22,-25, -9, 20,-21, -1,-24; /M: SY='A'; M= 15, -3,-19, -6, 4,-26, 0,-11,-21, 1,-21,-13, -1,-10, 5, -6, 10, -2,-14,-25,-18, 5; /M: SY='L'; M= -4,-28,-19,-30,-20, 15,-26,-20, 14,-28, 38, 14,-26,-28,-21,-20,-24, -9, 8,-16, 1,-20; /M: SY='I'; M= -1,-26,-19,-31,-24, 0,-27,-21, 27,-21, 20, 23,-23,-23,-17,-20,-16, -6, 24,-23, -5,-22; /M: SY='K'; M= -4, 7,-24, 11, 10,-25,-15, -9,-23, 13,-17,-13, 1,-12, 2, 3, -2, -6,-16,-27,-14, 6; /M: SY='N'; M= -1, 8,-21, 2, 8,-23,-13, -6,-20, 10,-21,-12, 11,-11, 8, 3, 5, 6,-18,-28,-15, 8; /M: SY='E'; M= 8, -2,-23, -3, 13,-25,-13, 4,-23, 11,-19,-11, -2,-10, 6, 6, -1, -8,-17,-24,-12, 9; /M: SY='G'; M= -1, 1,-24, 1, -3,-18, 4, -8,-19, -4,-18,-13, 2,-17, -8, -9, -2, -9,-14,-20, -8, -6; /M: SY='A'; M= 8, 0,-20, -4, 5,-22,-11, -8,-16, 6,-15, -9, 2,-12, 7, -1, 3, -3,-14,-25,-15, 6; /M: SY='Q'; M= 7, 4,-20, 0, 9,-26, -9, -6,-21, 9,-23,-13, 7,-10, 10, 2, 10, 0,-17,-28,-16, 9; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 22 in 22 different sequences |
Number of true positive hits | 22 in 22 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | V_Lesaux |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | PTS EIIB type-3 |
Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
22 sequences
PTCB_LACLA (Q9CIF0), PTCB_LACLM (A2RIE6), PTEB_AERHY (P55901), PTEB_BACSU (O05505), PTEB_GEOSE (Q45399), PTJB_BACSU (P46318), PTLCB_LACCA (P24400), PTLCB_LACLL (P23531), PTLCB_STAAC (Q5HE15), PTLCB_STAAM (Q931G6), PTLCB_STAAN (Q99S77), PTLCB_STAAR (Q6GEN9), PTLCB_STAAS (Q6G7C4), PTLCB_STAAU (P11162), PTLCB_STAAW (Q7A092), PTLCB_STAEQ (Q5HM40), PTLCB_STAES (Q8CNF7), PTLCB_STAHJ (Q4L869), PTLCB_STRMU (P50976), PTQB_ECO57 (P69830), PTQB_ECOL6 (P69796), PTQB_ECOLI (P69795)» more
|
PDB [Detailed view] |
5 PDB
1E2B; 1H9C; 1IIB; 2WWV; 2WY2 |