PROSITE entry PS51101
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PTS_EIIB_TYPE_4 |
| Accession [info] | PS51101 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00795 |
| Associated ProRule [info] | PRU00424 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PTS_EIIB type-4 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=166; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=161; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0512714; R2=0.0125248; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=24594.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=795; H_SCORE=24594; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=356; H_SCORE=24594; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= -8,-15,-28,-17,-20, -5, 20, -3,-15,-15,-10, 3,-10,-23,-13,-15,-10,-15,-15, -5, 10,-18; /M: SY='K'; M=-10, 0,-26, -2, 3,-23,-20, 14,-26, 23,-23, -8, 2,-12, 6, 14, -4, 1,-18,-25, -3, 3; /M: SY='M'; M=-13, -1,-25, -2,-10,-12,-22, -7, 9,-12, 5, 23, -8,-17, -5,-15,-14,-10, 3,-26, -6, -9; /M: SY='K'; M=-12, 23,-27, 21, 9,-29,-12, -2,-29, 24,-30,-17, 23,-13, 5, 12, -2, -7,-25,-30,-15, 7; /M: SY='I'; M=-12,-30,-28,-40,-30, 19,-38,-28, 38,-30, 18, 15,-20,-22,-25,-28,-20,-10, 23,-13, 7,-30; /M: SY='K'; M= 4,-12,-20,-14, -7,-18,-18,-15,-11, 15,-13, -5,-10,-17, -4, 15, -5, -5, 2,-22,-12, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23, 2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20, 4, 0, 15,-23,-17,-16; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30, 0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='D'; M= -6, 27,-21, 38, 11,-31, -5, -5,-31, -5,-30,-25, 15,-10, 0,-10, 18, 4,-21,-40,-20, 5; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M= -7,-30,-19,-32,-25, 5,-32,-25, 30,-27, 31, 17,-28,-28,-23,-22,-21, -7, 27,-23, -3,-25; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30, 0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30; /M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23, 2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20, 4, 0, 15,-23,-17,-16; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M= 4,-11,-21,-14, -6,-19,-17,-14,-12, 16,-14, -6, -9,-17, -3, 17, -5, -5, 0,-22,-12, -6; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='T'; M= 0, -9,-10,-16,-16, -7,-23,-23, 2,-13, -4, -4, -9,-16,-16,-13, 11, 35, 15,-30,-10,-16; /M: SY='K'; M=-10, 12,-27, 6, 7,-27,-14, -4,-27, 35,-30,-13, 18,-13, 7, 21, -4, -7,-23,-26,-13, 7; /M: SY='E'; M= 7, 3,-21, 4, 28,-23,-15, -9,-21, 1,-15,-15, -2, -5, 6, -7, 7, 5,-16,-28,-18, 17; /M: SY='T'; M= 0, -6,-10,-14,-14, -8,-22,-22, -1,-12, -6, -6, -6,-14,-14,-12, 14, 39, 11,-30,-10,-14; /M: SY='Q'; M= -6, 9,-23, 5, 8,-28,-11, 0,-23, 16,-28,-12, 16,-12, 17, 9, 8, -1,-23,-29,-15, 13; /M: SY='P'; M= 11,-19,-24,-18,-10,-20,-16,-22, -5,-12,-14,-10,-19, 31,-15,-20, -4, -5, -2,-27,-22,-15; /M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 15, 2,-22, -5, 5,-22, 12,-30,-18, 46,-18, 2, 7, 5, -2,-28,-35,-18, 2; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 3,-23,-20, -3,-30, 36,-23,-10, 0,-17, 10, 58,-10,-10,-20,-20,-10, 3; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28, 2,-35,-28, 37,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28; /M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30, 0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='S'; M= 1, 15,-16, 21, 6,-26, -3, -7,-26, -7,-30,-23, 13,-10, 0,-10, 28, 11,-16,-40,-20, 3; /M: SY='D'; M=-17, 35,-30, 49, 20,-40,-13, 3,-34, 3,-27,-21, 14,-10, 18, -4, 0,-10,-30,-34,-17, 19; /M: SY='E'; M= 1, -4,-25, -2, 19, -9,-18, 1,-16, -1,-11,-11, -9,-12, 4, -8, -4, -8,-17, -9, 11, 10; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 22, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 38,-27, -7,-27; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='T'; M= 7, -2,-19, -8, 1,-24,-15,-11,-17, 9,-17, -8, -2,-10, 10, 2, 6, 11,-11,-23,-12, 6; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 55, 14,-34, -7, 3,-34, 0,-30,-27, 32,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='E'; M= 3, 13,-21, 16, 19,-25,-13, -9,-23, -1,-18,-18, 3, -7, 2, -9, 7, 6,-16,-30,-18, 10; /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-22, 14,-30,-10, 16,-21, 25, 11,-27,-30,-19,-17,-22, -8, 13, -7, 22,-22; /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16, -6,-11,-23, -6,-15, 12, 1, -1, -9,-23, 1, 42,-16,-10,-11,-20, -7, -6; /M: SY='K'; M= -1, 0,-19, -2, 2,-22,-14,-12,-22, 17,-25,-13, 3,-10, 2, 8, 12, 13,-12,-29,-13, 2; /M: SY='R'; M=-11,-10,-25,-14, -6,-16,-24,-14, -8, 12,-11, -4, -4,-15, -1, 20, -5, 4, -4,-22, -8, -6; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 38, 17,-30,-30,-23,-20,-24, -7, 22,-23, -3,-23; /M: SY='I'; M=-13,-30,-25,-38,-28, 27,-35,-25, 28,-30, 24, 14,-22,-25,-26,-25,-22,-10, 16,-11, 9,-28; /M: SY='K'; M= -8, -4,-26, -2, 13,-24,-22,-12,-17, 25,-19, -8, -6,-12, 4, 12, -8, -8, -7,-25,-12, 9; /M: SY='Q'; M=-10, -6,-27, -9, 8,-28,-20, 7, -8, 4, -8, 18, -6,-13, 42, 4, -6,-10,-18,-20, -7, 25; /M: SY='A'; M= 38,-15,-10,-22,-15,-15, -7,-22, -1,-12, -5, -5,-15,-15,-15,-20, 5, 0, 12,-22,-18,-15; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M= -4,-14,-31, -7, 0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11, 59, -7,-17, 5, -1,-24,-33,-27, -7; /M: SY='G'; M= -3, 5,-27, -1,-14,-27, 49,-11,-34,-14,-30,-20, 18,-20,-14,-14, 3,-14,-30,-26,-27,-14; /M: SY='I'; M= -5,-30,-19,-33,-28, 2,-33,-28, 34,-25, 23, 15,-27,-27,-25,-23,-18, -5, 34,-25, -5,-28; /M: SY='D'; M= -8, 15,-25, 21, 11,-31,-12, -7,-31, 20,-30,-19, 9,-10, 5, 8, 5, -3,-21,-31,-15, 8; /M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23, 2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20, 4, 0, 15,-23,-17,-16; /M: SY='N'; M= -6, 18,-19, 9, 0,-20, -5, 25,-22, -5,-28,-15, 33,-17, 2, -3, 14, 1,-24,-38,-11, 0; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='I'; M= -8,-27,-22,-35,-27, 0,-31,-21, 36,-21, 18, 30,-22,-22,-16,-21,-18, -8, 29,-22, -2,-24; /M: SY='P'; M= 8, 4,-22, 6, 0,-25,-11,-15,-20, -8,-20,-17, -3, 14, -8,-15, 5, 6,-14,-29,-20, -5; /M: SY='V'; M= -5,-27,-24,-26,-21, -9,-29,-27, 19,-19, 0, 3,-25, 9,-21,-22,-12, -5, 21,-28,-14,-24; /M: SY='N'; M= 7, 21,-17, 17, 2,-24, -2, -4,-22, -5,-25,-20, 23,-13, -2, -9, 15, 3,-18,-35,-20, 0; /M: SY='K'; M=-13, 15,-30, 21, 13,-33,-17, -7,-33, 35,-30,-16, 6,-10, 7, 18, -7,-10,-23,-26,-13, 10; /M: SY='M'; M=-13,-23, 13,-33,-25, 20,-25,-13, 2,-21, 7, 23,-20,-28,-19,-18,-18,-10, 2,-18, 2,-21; /M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-35,-30, 0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30; /M: SY='E'; M=-15, 18,-30, 28, 34,-31,-17, 0,-33, 12,-23,-21, 6, -8, 11, 14, -2,-10,-28,-31,-18, 21; /M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-32,-27, 0,-29,-21, 31,-19, 15, 27,-25,-25,-19,-19,-15, -5, 33,-25, -5,-24; /M: SY='Y'; M= 3,-21,-19,-23,-21, 9,-23, -5, 7,-13, 1, 1,-21,-25,-16,-15,-10, -5, 11, 0, 28,-21; /M: SY='K'; M=-10, 9,-28, 5, 10,-30,-15, -1,-25, 29,-28,-10, 14,-12, 18, 19, -3, -8,-25,-25,-12, 14; /M: SY='D'; M= -8, 32,-21, 37, 9,-29, -5, -1,-29, -3,-30,-25, 26,-12, 0, -8, 15, 2,-24,-40,-20, 5; /M: SY='P'; M= -6,-10,-30, -5, 6,-31,-16, -9,-20, -4,-27,-14, -7, 38, 14, -9, 4, -4,-26,-29,-22, 7; /M: SY='R'; M=-15, 6,-28, 13, 4,-22,-19, -7,-22, 13,-10,-10, 0,-17, 0, 17,-11,-10,-17,-26,-11, 1; /M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-32,-25, 47,-30,-11, 6,-25, 20, 6,-23,-30,-27,-18,-23,-10, 1, 6, 33,-25; /M: SY='G'; M= 8, 3,-25, 5, -9,-30, 36,-16,-33,-13,-25,-20, 2,-15,-13,-18, 2,-13,-23,-24,-25,-11; /M: SY='B'; M=-13, 37,-25, 35, 19,-28, -7, 5,-28, 2,-28,-23, 35,-13, 4, -3, 5, -5,-30,-38,-20, 12; /M: SY='N'; M= -5, 8,-18, 2, 5,-16,-16, -8, -9, -4,-14,-11, 12,-15, -4, -7, 6, 10, -5,-33,-15, 1; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 39,-25,-10, 0,-15, 10, 52,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='Y'; M= 4,-20,-23,-20,-16, -2,-21,-10, 0,-12, -7, -4,-20, 1,-15,-17, -8, -5, 2, -9, 11,-18; /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23, 5,-31,-18, 29,-25, 34, 29,-25,-25,-15,-21,-25,-10, 16,-20, 0,-21; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20, 0,-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M=-16,-24,-18,-34,-26, 61,-28,-20, -2,-26, 6, -2,-16,-26,-34,-18,-11, 3, 0, 1, 21,-26; /M: SY='E'; M=-10, 13,-25, 18, 19,-27,-18, -8,-27, 15,-23,-17, 4, -8, 5, 5, 2, 4,-20,-29,-15, 12; /M: SY='N'; M= -8, 10,-18, -2, -8, -9,-14, -6, -6,-11, -1, -6, 19,-21, -8, -8, 0, 8,-11,-32,-12, -8; /M: SY='P'; M= -7,-23,-31,-16, -9,-21,-23,-23, -5,-13,-18,-11,-23, 53,-16,-20,-10, -7, -5,-30,-24,-16; /M: SY='D'; M=-11, 18,-25, 24, 22,-30,-17, -3,-26, 2,-21,-16, 6, -8, 15, -3, 5, 4,-23,-31,-15, 19; /M: SY='B'; M=-15, 45,-25, 44, 10,-30, -5, 5,-30, 0,-30,-25, 41,-15, 0, -5, 5, -5,-30,-40,-20, 5; /M: SY='V'; M= -5,-28,-15,-30,-25, 3,-28,-20, 25,-21, 24, 24,-28,-28,-20,-18,-18, -5, 29,-25, -5,-23; /M: SY='L'; M= 3,-16,-21,-19, -9, -9,-20,-17, -2, -1, 13, 4,-16,-20, -9, -5,-15, -8, -1,-20, -7, -9; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10, 0,-15, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='C'; M= -8,-27, 25,-30,-25, -2,-30,-25, 7,-28, 19, 5,-27,-33,-25,-23,-19, -8, 13,-32,-12,-25; /M: SY='V'; M= -6,-30,-13,-33,-30, 25,-30,-27, 21,-23, 10, 7,-27,-30,-33,-20,-13, -3, 35,-18, 2,-30; /M: SY='E'; M= 0, 18,-26, 27, 33,-31,-13, -4,-29, 3,-21,-21, 4, -5, 7, -7, 2, -8,-24,-31,-20, 20; /M: SY='G'; M= 11, 4,-24, 6, -7,-29, 30,-15,-31,-12,-24,-19, 2,-15,-12,-18, 3,-11,-21,-25,-25,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M= -8,-30,-15,-33,-28, 27,-30,-25, 19,-25, 19, 9,-27,-30,-31,-20,-17, -5, 26,-16, 4,-28; /M: SY='D'; M= -8, 25,-24, 37, 23,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-25, 12, -8, 5, -8, 12, -1,-24,-38,-20, 14; /M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-37,-30, 17,-35,-28, 33,-27, 15, 13,-23,-25,-27,-25,-17, -7, 30,-17, 3,-30; /M: SY='D'; M= -6, 11,-23, 17, 4,-26,-13,-12,-24, -7,-25,-21, 3, 14, -5,-12, 11, 11,-19,-35,-20, -2; /M: SY='E'; M= -5, 5,-25, 11, 35,-28,-15, -5,-28, 14,-25,-18, 2, -5, 13, 4, 7, -3,-23,-30,-18, 24; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='N'; M=-12, 30,-25, 25, 10,-30, -8, 8,-24, 3,-27,-16, 33,-15, 18, 1, 5, -5,-30,-34,-17, 14; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-38,-30, 0,-38,-30, 45,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 35,-22, -2,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 5, -5,-21, -5,-11,-25, 38,-15,-31,-15,-30,-20, 5,-15,-11,-15, 18, -2,-21,-29,-25,-11; /M: SY='M'; M=-10,-25,-23,-33,-23, 2,-28,-14, 29,-20, 26, 39,-22,-22,-10,-18,-22,-10, 16,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 35,-10,-16,-17,-13,-23, 21,-20,-19,-13,-16,-13, -7,-13,-13,-20, 7, -6, -9,-20,-23,-13; /M: SY='F'; M= 1,-17,-19,-24,-17, 25,-18, 9,-10,-19, -3, -3,-10,-21,-19,-15, -8, -9, -7, -9, 12,-17; /M: SY='N'; M= -3, 10,-18, 4, 0,-20, -5, -1,-22, 3,-28,-18, 23,-15, 2, 12, 19, 7,-19,-35,-18, 0; /M: SY='A'; M= 24,-12,-15,-18, -8,-20,-12,-15, -3, -8, -8, -3,-12,-15, 2,-13, 3, -2, 5,-22,-15, -3; /M: SY='G'; M= -6, 8,-30, 15, -8,-33, 45,-14,-40,-14,-30,-23, 6,-17,-14,-17, 0,-17,-30,-26,-27,-11; /M: SY='R'; M=-13, -7,-28,-10, 0,-20,-20, -5,-19, 31,-16, 5, -4,-15, 8, 34,-12,-10,-14,-20, -8, 3; /M: SY='V'; M= -3,-14,-16,-16,-13,-12,-25,-21, 2, 4, -7, -1,-14,-19,-13, -2, -3, 9, 17,-27,-10,-13; /M: SY='M'; M= -8,-21,-20,-23,-13, -6,-25,-11, 13,-14, 17, 22,-21,-23, 1,-11,-16, -8, 10,-22, -5, -6; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='T'; M= -6, 3,-19, -4, -8, -3,-14, 2,-12, -8,-16,-12, 11,-19, -5, -8, 10, 13,-13,-16, 13, -8; /M: SY='N'; M=-10, 18,-25, 9, 9,-29,-11, 5,-22, 15,-27,-11, 27,-15, 21, 10, 2, -5,-28,-29,-15, 15; /M: SY='A'; M= 26,-12,-10,-16,-12,-15, -7,-19, -3,-12,-11, -8, -9,-15,-12,-17, 14, 6, 9,-29,-18,-12; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28, 2,-35,-28, 37,-27, 24, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28; /M: SY='A'; M= 31, -5,-10,-10, -5,-20, 0,-15,-15,-10,-20,-15, 0,-10, -5,-15, 24, 10, -5,-30,-20, -5; /M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-32,-25, 3,-30,-20, 29,-23, 27, 27,-25,-25,-18,-20,-21, -8, 24,-22, -2,-22; /M: SY='G'; M= -2, 7,-24, 12, -4,-29, 30,-12,-34,-12,-30,-22, 8,-15, -9,-15, 12, -5,-24,-31,-25, -7; /M: SY='E'; M=-10, 5,-30, 11, 42,-35,-20, 5,-25, 10,-20,-11, 0, -5, 38, 5, 0,-10,-30,-25,-15, 40; /M: SY='L'; M= 5, -9,-18,-11, 4,-11,-19,-15, -6,-11, 6, -3,-11,-14, -6,-13, -2, 6, -4,-25,-11, -1; /M: SY='D'; M=-15, 29,-30, 44, 41,-35,-15, 0,-35, 5,-25,-25, 10, -5, 10, -5, 0,-10,-30,-35,-20, 26; /M: SY='A'; M= 24,-20,-15,-27,-20,-10,-17,-25, 14,-17, 2, 2,-17,-17,-17,-22, -2, -2, 19,-22,-13,-20; /M: SY='K'; M= 0, 7,-25, 10, 5,-28,-13, -8,-28, 19,-23,-15, 2,-12, 3, 17, -3, -8,-18,-25,-15, 3; /M: SY='A'; M= 20, -1,-16, -5, 11,-21,-11,-14,-16, -4,-13,-13, -5, -7, -1,-11, 9, 9, -9,-25,-18, 5; /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25, 43,-30,-20, 10,-30, 31, 10,-25,-30,-30,-20,-25,-10, 5, -6, 14,-25; /M: SY='Y'; M=-15, -2,-27, 3, -3, -7,-23, -4,-11, 1, 1, -3, -9,-20, -6, -4,-16,-10,-11,-14, 10, -6; /M: SY='A'; M= 21, -3,-20, -6, 12,-25,-10,-13,-20, 9,-17,-12, -5, -8, 2, -3, 3, -5,-12,-22,-18, 7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='Q'; M=-10, 9,-28, 5, 13,-33,-15, 5,-22, 17,-25, -7, 14,-12, 34, 12, 0, -8,-28,-25,-12, 23; /M: SY='E'; M= 17, 1,-21, 2, 28,-25,-11, -9,-21, 1,-15,-15, -5, -5, 6, -9, 5, -5,-16,-25,-20, 17; /M: SY='R'; M= 1, 8,-23, -1, 0,-22,-10, -4,-23, 17,-23,-13, 16,-15, 3, 19, 0, -5,-19,-26,-15, 0; /M: SY='G'; M= -6, -7,-30, -7,-14,-27, 42, 17,-37,-17,-27,-14, 3,-20,-11,-14, -3,-20,-30,-23,-15,-14; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28, 2,-35,-28, 37,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28; /M: SY='R'; M=-13, -1,-30, 2, 19,-27,-20, -5,-30, 34,-25,-12, 0,-11, 12, 35, -8,-10,-22,-22,-12, 14; /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-35,-28, 22,-33,-25, 27,-28, 23, 13,-25,-27,-27,-23,-20, -8, 22,-15, 5,-28; /M: SY='F'; M=-18, -1,-25, 1, 3, 25,-23,-10,-17,-13, -7,-12, -6,-18,-16,-13,-10,-10,-14,-11, 6, -4; /M: SY='A'; M= 17,-21,-13,-29,-21, 15,-16,-22, 3,-19, 1, -2,-18,-21,-24,-20, -4, -3, 12,-13, -2,-21; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 10,-30,-20, 5,-25, 20,-20, -5, 0,-15, 36, 39, -5,-10,-25,-20,-10, 21; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10, 0,-13, 10, 42,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='P'; M= 4,-18,-33,-12, -2,-28,-15,-20,-18,-10,-25,-18,-18, 66,-10,-20, -5, -8,-23,-28,-28,-10; /M: SY='B'; M= -6, 25,-19, 24, 4,-24, -7, -4,-24, -5,-26,-21, 23,-12, -2, -8, 16, 13,-19,-38,-18, 1; /M: SY='D'; M=-17, 38,-30, 55, 32,-37,-13, 0,-37, 3,-27,-27, 14, -7, 6, -7, 0,-10,-30,-37,-20, 19; /M: SY='K'; M= 0, 0,-20, 0, 5,-25,-10,-10,-25, 21,-30,-15, 5,-10, 5, 11, 14, 4,-15,-30,-15, 5; /M: SY='R'; M=-15,-11,-33, -8, 2,-25,-20, -9,-27, 23,-25,-13, -6, 16, 4, 33,-10,-10,-23,-23,-16, -1; /M: SY='V'; M= 10,-25,-12,-28,-23, -2,-23,-25, 18,-20, 15, 8,-25,-25,-23,-20,-10, -2, 29,-25,-10,-23; /M: SY='N'; M= -6, 20,-21, 20, 9,-29, -7, 2,-24, -1,-28,-17, 22,-12, 14, -3, 15, 2,-24,-35,-18, 12; /M: SY='M'; M= -8,-25,-18,-30,-22, 3,-25,-13, 22,-18, 27, 37,-25,-25,-13,-15,-21, -8, 19,-22, -2,-17; /M: SY='D'; M=-15, 18,-25, 25, 2,-22,-15, 0,-13, -5, -7, 11, 2,-15, 0,-10, -9,-10,-12,-31,-11, 1; /M: SY='E'; M=-12, 13,-32, 25, 38,-32,-18, -4,-30, 3,-25,-22, 0, 17, 9, -7, -2,-10,-30,-32,-22, 22; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20, 0,-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='K'; M= 3, -2,-26, -4, 8,-30,-16, -7,-23, 28,-23, -8, -2,-10, 18, 14, -3, -8,-18,-20,-12, 13; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='H'; M= 4, -1,-18, -8,-10,-15,-13, 21, -9,-10,-13, -4, 7,-20, -6,-10, -1, -6, -4,-30, -5,-10; /M: SY='K'; M=-11,-11,-27,-14, -9, 4, -4,-15,-23, 10,-18, -9, -6,-18,-12, 4,-11,-12,-16,-11, -2, -9; /M: SY='N'; M=-12, 25,-20, 7, -6, 2, -6, 4,-16, -6,-21,-16, 43,-22, -9, -4, 4, -2,-24,-29, -9, -6; /M: SY='E'; M=-10, 13,-25, 9, 24,-20,-14, 3,-16, 3,-14, -3, 14,-10, 10, -2, -1, -7,-21,-31,-16, 17; /M: SY='L'; M= 3, -9,-18,-16,-13, -4,-16,-13, 4,-19, 18, 4, -4,-23,-13,-15,-12, -5, -2,-25, -9,-13; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PTS EIIB type-4 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
PTFB_BACSU (P26380), PTNAB_ECO57 (P69799), PTNAB_ECOL6 (P69798), PTNAB_ECOLI (P69797), PTNAB_SHIFL (P69800), PTNAB_STRP6 (Q5XAF5), PTPB1_ECOLI (P42909), PTPB2_ECOLI (P42904), PTRB_KLEPN (P37081), PTRB_LACCA (Q9RGG4), Y801_STRP6 (Q5XCC7)» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
1BLE; 1NRZ; 1VSQ; 2JZH; 2JZN; 2JZO |