PROSITE entry PS51106
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PTS_EIIC_TYPE_4 |
| Accession [info] | PS51106 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51103 |
| Associated ProRule [info] | PRU00429 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PTS_EIIC type-4 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=234; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=229; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3729787; R2=0.0154812; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=26215.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1785; H_SCORE=26215; N_SCORE=30.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=267; H_SCORE=26215; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-37,-28, 2,-36,-26, 41,-27, 24, 23,-22,-22,-19,-26,-21, -9, 27,-21, -1,-27; /M: SY='S'; M= 6, -5,-13, -8, -5,-16,-11,-13,-10,-10,-15,-10, 0,-13, -1,-10, 21, 20, -3,-32,-15, -3; /M: SY='I'; M= 0,-23,-24,-28,-20, -2,-22,-23, 9,-21, 8, 2,-20,-21,-16,-21,-12, -4, 3, 7, -1,-18; /M: SY='L'; M=-11,-27,-25,-29,-21, 9,-21,-21, 9,-24, 19, 7,-24,-27,-17,-19,-22,-12, 3, 3, 3,-18; /M: SY='Q'; M= -8, -2,-27, -6, 8,-29,-20, 1, -7, 0,-15, 0, 2,-13, 35, 0, 1, -6,-17,-24,-10, 20; /M: SY='I'; M= 9,-20,-23,-28,-21,-11, -7,-22, 14,-20, 3, 8,-14,-17,-15,-23, -8, -9, 9,-20,-11,-20; /M: SY='I'; M= 8,-24,-19,-30,-21, -3,-24,-24, 21,-23, 20, 10,-21,-21,-18,-23,-13, -6, 17,-21, -7,-21; /M: SY='L'; M= -8,-27,-21,-29,-20, 6,-29,-21, 22,-28, 38, 17,-25,-27,-18,-21,-23, -7, 12,-22, -2,-20; /M: SY='I'; M= -8,-31,-23,-33,-26, 5,-32,-26, 26,-26, 25, 14,-28,-27,-23,-23,-23, -9, 21, -6, 0,-25; /M: SY='V'; M= 4,-20, -6,-25,-23, 2, -4,-23, -4,-21, -2, -4,-16,-24,-24,-20, -6, -4, 6,-21,-10,-23; /M: SY='L'; M= 7,-25,-19,-29,-20, -1,-24,-23, 19,-24, 24, 11,-23,-23,-18,-22,-15, -6, 15,-21, -6,-20; /M: SY='V'; M= 0,-26,-21,-30,-24, 12,-25,-18, 11,-20, 9, 4,-24,-26,-22,-19,-15, -7, 13, 2, 11,-23; /M: SY='A'; M= 24,-13,-12,-21,-15,-12,-14,-23, 3,-14, -4, -4,-12,-14,-14,-19, 6, 11, 11,-24,-14,-15; /M: SY='F'; M= 2,-20, 9,-28,-23, 12,-16,-18, -6,-20, -3, -1,-17,-26,-23,-20, -9, -8, 0,-15, 1,-22; /M: SY='I'; M= -8,-25,-13,-30,-24, 8,-29,-19, 19,-24, 15, 12,-21,-25,-20,-21,-14, -5, 16,-19, 3,-23; /M: SY='A'; M= 14,-12, -4,-17,-11,-17, -6,-17,-12,-10,-10, -8, -9,-18, -8, -8, 4, 0, -3,-26,-17,-10; /M: SY='W'; M= -3,-17,-28,-19,-14,-10, 4,-17,-11,-16,-14,-10,-13,-20,-14,-18, -7,-11,-10, 11, -2,-14; /M: SY='L'; M= -7,-16,-21,-18,-15, -3,-23,-14, 13,-20, 19, 17,-16,-21,-11,-17,-12, -5, 6,-25, -5,-14; /M: SY='D'; M=-12, 16,-30, 24, 8,-32, 10, -7,-34, -3,-28,-23, 10, -2, -4, -5, -1,-12,-29,-31,-23, 1; /M: SY='G'; M= -2, -9,-26,-10, -5,-19, 15,-11,-20,-11,-18,-10, -3,-16, 2,-11, 1,-11,-19,-20,-16, -1; /M: SY='L'; M=-10,-26,-26,-31,-24, 6,-22,-24, 17,-27, 18, 9,-21,-24,-21,-23,-20, -8, 8, -4, 1,-23; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='L'; M= -1,-15,-20,-20,-14, -6,-14,-16, 5,-20, 14, 5,-11,-21,-10,-16, -9, -3, 0,-24, -9,-13; /M: SY='B'; M= -8, 3,-24, 3, -4,-14, -1,-13,-14,-13,-13,-11, 3,-16,-10,-15, 0, -3,-12,-27,-13, -7; /M: SY='Q'; M= -4, -7,-24,-10, -1,-16,-13, -6, -5, -8, -3, -1, -4,-18, 7, -9, -7, -8,-10,-20, -6, 2; /M: SY='F'; M=-12,-20,-23,-25,-17, 24,-29,-12, 8,-20, 7, 2,-16,-22,-18,-17,-12, -2, 3, -5, 20,-18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='T'; M= -4, -9,-18,-12, -7, -8, -6,-11,-10,-12, -4, -4, -6,-16, -1, -9, 2, 5, -9,-20, -8, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-12,-21,-23,-23,-16, 9,-18,-16, -3,-15, 12, 2,-17,-16,-17, -3,-16, -6, -5,-16, -2,-17; /M: SY='H'; M=-14, -3,-24,-10,-13, 13, -8, 15,-16,-14,-13, -8, 8,-24,-13,-10, -5, -9,-18,-12, 15,-13; /M: SY='R'; M= -8, -9,-25,-12, -3,-14,-17, -7,-20, 6,-17,-10, -4,-16, 8, 21, 0, 2,-16, -8, -6, 1; /M: SY='P'; M= 0,-18,-35,-12, -2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18, 73,-10,-20, -7, -8,-25,-28,-28,-10; /M: SY='L'; M= -7,-30,-19,-32,-24, 6,-32,-24, 27,-27, 34, 17,-28,-28,-23,-22,-23, -7, 24,-23, -3,-24; /M: SY='V'; M= -7,-27,-20,-33,-28, 9,-24,-25, 25,-24, 11, 14,-22,-25,-25,-22,-15, -7, 26,-19, -2,-27; /M: SY='A'; M= 15,-11,-15,-19,-15,-13, -6,-20, -3,-14, -6, -1, -9,-14,-13,-17, 5, 11, 4,-24,-14,-14; /M: SY='G'; M= 2,-12, 13,-15,-20,-26, 31,-22,-33,-21,-26,-19, -5,-24,-20,-22, 2,-12,-20,-30,-28,-20; /M: SY='L'; M= -3,-16,-15,-22,-16, 5,-23,-18, 4,-19, 16, 7,-15,-20,-15,-15, -5, 15, 4,-21, -3,-15; /M: SY='L'; M= -9,-30,-16,-32,-26, 23,-30,-24, 19,-26, 26, 12,-28,-30,-28,-20,-20, -6, 22,-17, 3,-26; /M: SY='V'; M= 8,-20, 1,-26,-22, -8,-24,-26, 11,-19, 1, 1,-18,-22,-21,-21, -2, 5, 21,-28,-13,-22; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M= 6,-25,-18,-29,-20, 0,-24,-22, 18,-24, 27, 12,-24,-24,-18,-21,-17, -7, 14,-21, -6,-20; /M: SY='I'; M= 0,-28,-20,-34,-28, -2,-32,-29, 36,-24, 13, 13,-23,-23,-23,-25,-13, -5, 35,-24, -6,-28; /M: SY='L'; M= -9,-23,-19,-28,-19, 4,-25,-12, 17,-20, 33, 32,-23,-24,-11,-15,-21, -4, 9,-21, -1,-15; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 57, 15,-35, -7, 3,-35, 0,-30,-27, 30,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-33,-27, 2,-32,-24, 34,-24, 22, 22,-25,-25,-21,-22,-18, -7, 30,-23, -3,-25; /M: SY='P'; M= -9, -5,-29, -4, 3,-27,-19, -9,-20, 12,-23,-11, -2, 14, 8, 7, -4, -3,-19,-26,-16, 4; /M: SY='T'; M= 6, -6,-14,-13, -8,-14,-18,-17, -8, -4, -8, -6, -6,-13, -4, -7, 9, 24, 0,-26,-11, -6; /M: SY='G'; M= 13,-10,-25,-13,-17,-27, 51,-20,-32,-17,-25,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-15,-22,-20,-27,-17; /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23, 5,-31,-19, 29,-26, 36, 27,-25,-25,-16,-21,-25,-10, 16,-20, 0,-21; /M: SY='I'; M= -4,-24,-21,-33,-25, -2,-31,-23, 32,-22, 14, 21,-20,-20,-17,-22,-13, -2, 26,-23, -4,-24; /M: SY='I'; M= -8,-26, -6,-34,-27, 5,-34,-27, 25,-27, 13, 10,-21,-25,-24,-25,-15, -3, 22,-23, -3,-27; /M: SY='G'; M= 4, -9,-26,-11,-18,-27, 55,-20,-35,-18,-26,-18, -1,-18,-18,-19, 3,-12,-25,-21,-27,-18; /M: SY='G'; M= 20,-12,-20,-16,-17,-23, 30,-21,-20,-16,-17,-13, -7,-17,-17,-20, 3,-10, -9,-21,-24,-17; /M: SY='T'; M= 10, -7,-12,-14,-10,-10,-14,-18, -6,-13, -3, -6, -6,-13,-10,-14, 13, 24, 0,-28,-12,-10; /M: SY='L'; M= -5,-23,-20,-28,-19, 5,-26,-14, 16,-22, 28, 21,-22,-24,-14,-18,-19, -4, 9,-17, 3,-17; /M: SY='Q'; M=-10, 3,-30, 5, 30,-37,-20, 7,-23, 10,-20, -5, 0, -7, 50, 7, 0,-10,-30,-23,-13, 40; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='I'; M= 3,-22,-18,-30,-22, -4,-24,-19, 23,-18, 11, 22,-19,-20,-14,-19,-10, -2, 21,-23, -6,-20; /M: SY='Y'; M= 1,-16,-18,-20,-17, 11,-21, -5, -1,-13, -4, -4,-14,-22,-14,-14, -2, 5, 1, -3, 25,-17; /M: SY='L'; M= -5,-26,-21,-31,-21, 3,-27,-16, 23,-23, 31, 28,-24,-24,-14,-19,-22, -9, 13,-20, -2,-18; /M: SY='G'; M= 10,-10,-26,-12,-18,-28, 55,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='V'; M= -8,-27,-21,-29,-26, 9,-26,-24, 13,-21, 10, 3,-25,-29,-25,-19,-19, -8, 17, 8, 2,-24; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='V'; M= 9,-18,-17,-25,-20, -2, -9,-20, 5,-17, 1, 7,-15,-20,-17,-18, -4, -2, 11,-20, -9,-19; /M: SY='T'; M= 6, 2,-18, -5, -7,-19, -3,-14,-17, -9,-20,-15, 7, 3, -8,-12, 12, 14,-14,-30,-19, -8; /M: SY='P'; M= -2,-22,-29,-25,-16, -3,-25,-18, 9,-18, -3, -1,-18, 12,-15,-22,-12, -8, 0,-14, 1,-19; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-35,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-25,-20,-28,-18; /M: SY='A'; M= 24, -7,-10,-14,-10,-15, -8,-19, -8,-11,-12,-10, -5,-12,-10,-15, 17, 18, 2,-27,-16,-10; /M: SY='V'; M= -1,-13,-14,-16,-12,-12,-20,-15, 5,-11, -5, 4,-11,-19, -4,-11, 6, 10, 13,-29,-11, -8; /M: SY='P'; M= 4,-17,-27,-16, -8,-21,-18,-20, -5,-10,-16,-10,-14, 29,-11,-17, -2, -4, -7,-27,-20,-12; /M: SY='P'; M= 4,-17,-31,-13, -4,-25,-15,-20,-13,-11,-23,-15,-15, 54,-10,-20, -2, -5,-18,-28,-25,-10; /M: SY='D'; M=-15, 37,-28, 45, 26,-33,-10, 2,-33, 3,-27,-25, 24,-10, 5, -5, 2, -8,-30,-37,-20, 15; /M: SY='P'; M= 9,-18,-21,-20,-13, -2,-17,-18, -6,-14,-10, -8,-16, 10,-16,-18, -3, -1, -3,-17, -6,-16; /M: SY='V'; M= 6,-13,-17,-18,-15,-11,-11,-18, 1,-11, -4, -3, -8,-20,-13, -8, 0, 0, 8,-26,-13,-15; /M: SY='V'; M= 3,-19,-18,-23,-19, -7,-14,-20, 11,-20, 7, 7,-15,-20,-15,-19, -4, 0, 12,-25,-10,-18; /M: SY='A'; M= 26,-13,-18,-18,-14,-21, 14,-21,-15,-14,-15,-11,-10, -6,-15,-20, 3, -6, -5,-22,-22,-15; /M: SY='S'; M= 15, -5,-15, -9, -9,-20, 12,-17,-20,-12,-21,-15, 1,-12, -9,-15, 19, 12,-10,-28,-20, -9; /M: SY='I'; M= 1,-25,-24,-32,-24, 1,-30,-22, 29,-23, 14, 11,-20,-21,-18,-24,-14, -7, 20,-15, 4,-24; /M: SY='I'; M= -1,-26,-19,-32,-25, -1,-28,-21, 29,-20, 16, 23,-23,-23,-17,-21,-15, -6, 27,-23, -5,-23; /M: SY='G'; M= 21, -8,-18,-13,-13,-23, 28,-19,-23,-14,-20,-15, -3,-14,-13,-18, 9, -2,-13,-23,-23,-13; /M: SY='T'; M= 7,-13,-12,-20,-17, -8,-22,-24, 7,-15, -1, -1,-12,-16,-16,-17, 6, 22, 16,-27,-11,-17; /M: SY='I'; M= -1,-24,-26,-27,-18, -5,-26,-25, 14,-20, -1, 1,-20, 12,-19,-23,-11, -7, 8,-22,-11,-21; /M: SY='I'; M=-10,-28,-22,-33,-26, 15,-32,-19, 26,-25, 23, 18,-24,-27,-22,-21,-21, -8, 20,-14, 8,-25; /M: SY='A'; M= 37,-13,-11,-21,-12,-15, -5,-20, -4,-13, -4, -6,-12,-14,-12,-19, 6, 0, 5,-22,-17,-12; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-35,-27, 3,-32,-25, 31,-25, 20, 19,-26,-25,-20,-23,-21,-10, 23, -8, 0,-25; /M: SY='T'; M= 5,-13,-17,-17,-11,-11,-18,-18, -1, -7, -2, -2,-10,-17,-10, -6, 2, 7, 5,-26,-11,-11; /M: SY='G'; M= 6,-11,-18,-13,-13,-14, 10,-18,-14,-17, -7, -8, -6,-17,-13,-16, 7, 5, -8,-26,-17,-13; /M: SY='G'; M= -5, -6,-29, -9,-15,-25, 35, -7,-26,-12,-24,-13, 4,-19,-13,-13, -3,-16,-22,-23,-20,-15; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='M'; M= -5, -4,-22, -3, 1,-17,-19, -9, -5, -4, -2, 2, -7,-17, 2, -7, -8, -7, -3,-26,-11, 1; /M: SY='S'; M= 6, 2,-22, 3, -1,-27, 5,-12,-24, -3,-24,-16, 1, -5, -2, -9, 9, 0,-17,-28,-20, -2; /M: SY='P'; M= 11,-15,-25,-17, -6,-20,-17,-21, -4,-12,-12, -9,-14, 23,-10,-20, -2, -2, -7,-25,-19,-10; /M: SY='E'; M= -7, 6,-27, 7, 20,-28, 6, -6,-29, 3,-24,-17, 7,-10, 7, -3, 2, -7,-27,-27,-20, 14; /M: SY='A'; M= 9,-14,-15,-19,-13, -4,-17,-15, 0,-13, -1, -2,-13,-18, -9,-14, 1, 7, 5,-19, -3,-11; /M: SY='A'; M= 34,-10,-15,-18,-12,-20, 9,-20,-12,-13,-13,-11, -7,-12,-11,-20, 9, -2, -4,-22,-20,-12; /M: SY='I'; M= -4,-22,-24,-30,-21, -5,-32,-25, 27,-17, 11, 11,-17,-19,-16,-19,-13, -3, 19,-22, -4,-21; /M: SY='A'; M= 34, -9,-14,-16,-11,-22, 15,-19,-18,-12,-17,-13, -6,-12,-11,-19, 11, -2, -8,-22,-22,-11; /M: SY='V'; M= -5,-24,-16,-27,-22, 1,-28,-22, 20,-21, 21, 16,-23,-25,-19,-18,-13, 3, 23,-25, -5,-21; /M: SY='A'; M= 33, -9,-16,-15,-12,-23, 19,-19,-19,-13,-17,-14, -5,-13,-12,-19, 10, -4, -9,-22,-23,-12; /M: SY='I'; M= -6,-27,-19,-32,-26, 8,-32,-26, 27,-24, 17, 12,-23,-25,-24,-22,-14, 0, 27,-22, -2,-26; /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12, -2,-25,-21,-20,-15,-12,-21,-15,-21, 76,-11,-20,-12,-10,-25,-29,-27,-11; /M: SY='V'; M= -7,-30,-16,-33,-28, 21,-31,-26, 23,-25, 18, 10,-27,-29,-30,-21,-17, -5, 29,-18, 2,-28; /M: SY='G'; M= 18, -8,-20,-12,-14,-25, 36,-18,-27,-15,-23,-17, -2,-15,-14,-18, 10, -7,-17,-23,-25,-14; /M: SY='L'; M= -1,-22,-16,-25,-19, 1,-24,-20, 13,-21, 23, 13,-22,-24,-17,-17,-12, 1, 14,-24, -6,-18; /M: SY='L'; M= 1,-26,-19,-29,-19, 3,-26,-21, 18,-26, 36, 15,-25,-25,-18,-21,-22, -8, 10,-20, -4,-19; /M: SY='G'; M= 0,-15,-23,-19,-19, -9, 22,-16,-14,-18, -7, 3, -9,-20,-16,-17, -6, -9,-11,-18,-14,-17; /M: SY='Q'; M= -4, -9,-20,-11, -3,-17,-20,-10, -4, -9, -3, 0, -6,-15, 11, -7, 4, 8, -5,-26, -9, 4; /M: SY='Y'; M=-12,-18,-24,-19,-12, 7,-27, 0, 2,-10, 2, 4,-17,-24, 2, -8,-13, -8, -1, -2, 25, -6; /M: SY='L'; M= -4,-29,-18,-29,-21, 6,-28,-22, 20,-27, 39, 16,-29,-29,-21,-20,-24, -8, 16,-22, -3,-21; /M: SY='T'; M=-11, 2,-20, 3,-10, -2,-23,-13, -5,-13, -7, -8, -5,-18,-14,-14, -2, 8, 1,-22, 1,-12; /M: SY='I'; M= -7,-18,-22,-23,-17, -3,-27,-13, 15,-16, 7, 11,-14,-19, -7,-15, -7, 3, 10,-18, 4,-14; /M: SY='F'; M= -5,-26,-20,-30,-23, 20,-17,-22, 9,-26, 19, 7,-21,-26,-25,-21,-18, -9, 7,-13, 2,-23; /M: SY='V'; M= -2,-19,-20,-24,-18, -2,-17,-20, 4,-12, 1, 1,-14,-21,-16, -4, -7, -1, 9,-20, -7,-18; /M: SY='R'; M=-11,-16,-25,-20,-11, 13,-22, -5,-15, 5, -9, -6,-10,-22, -8, 20,-12, -9,-11, -4, 14,-11; /M: SY='T'; M= -7,-13,-15,-22,-18, 18,-23,-18, -1,-18, -1, 0, -8,-18,-18,-15, 3, 20, 2,-17, 3,-17; /M: SY='I'; M= 14,-19,-20,-29,-20, -8,-21,-22, 19,-19, 6, 11,-15,-15,-13,-23, -6, -3, 14,-21, -8,-19; /M: SY='N'; M= -9, 16,-18, 2, -7, -1, -8, 0,-13, -8,-18,-10, 31,-20, -8, -6, 6, 4,-18,-29, -9, -7; /M: SY='T'; M= 1, -6,-12,-10,-11,-10,-15,-16, -3,-13, -8, -7, -1,-17,-11,-12, 15, 20, 5,-33,-13,-11; /M: SY='F'; M= -1,-23,-20,-28,-21, 20,-15,-19, 0,-22, 6, -1,-19,-17,-24,-19,-13, -8, 2, -9, 5,-22; /M: SY='F'; M=-15,-25,-24,-32,-25, 37,-27,-20, 6,-26, 12, 2,-18,-28,-28,-19,-21,-11, 2, 10, 14,-24; /M: SY='M'; M= 2,-13,-20,-17, -8,-17,-11,-10, -2, -8, -3, 8,-12,-17, 6, -9, -3, -3, 0,-23,-11, -1; /M: SY='H'; M=-14, 0,-27, -1, 1,-21,-19, 62,-28, 1,-22, -4, 7,-17, 8, 4, -4, -9,-24,-29, 9, 1; /M: SY='W'; M= -4,-20,-31,-23,-14, -3,-20,-13,-10, 0,-12, -7,-18,-21, -8, 0,-17,-13,-12, 31, 15,-12; /M: SY='A'; M= 21,-11,-15,-18,-13,-16, -1,-20, -5,-14,-10, -8, -7,-14,-12,-19, 10, 5, 3,-25,-17,-13; /M: SY='D'; M=-18, 31,-32, 46, 13,-33,-13, -3,-35, 3,-28,-25, 10,-12, 3, -6, -5,-12,-29,-15,-13, 9; /M: SY='R'; M=-13, -1,-28, -2, 6,-26,-17, -2,-27, 30,-25,-10, 6,-15, 14, 39, -4, -7,-21,-23,-11, 8; /M: SY='A'; M= 18,-15, -4,-22,-16, -8,-14,-16, -1,-15, 2, 1,-13,-20,-14,-18, -4, -4, 3,-20, -7,-15; /M: SY='A'; M= 23,-20,-14,-26,-19, -9,-16,-24, 12,-17, 5, 2,-19,-19,-18,-21, -3, -2, 19,-23,-13,-19; /M: SY='E'; M= -2, 8,-27, 13, 34,-29,-16, 5,-27, 8,-20,-15, 1, -6, 15, -1, 0, -9,-25,-28,-15, 24; /M: SY='E'; M= -8, 12,-26, 16, 34,-29,-15, -1,-27, 10,-24,-18, 8, -6, 16, 2, 6, -5,-26,-31,-18, 25; /M: SY='G'; M= 2,-13,-24,-16,-14,-18, 18,-16,-19, -8, -8, -4, -8,-19,-11, -5, -7,-13,-14,-20,-17,-13; /M: SY='N'; M= -9, 28,-23, 19, 10,-24, -6, 3,-24, 9,-29,-19, 36,-15, 4, 4, 7, -2,-27,-36,-18, 7; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-24,-17,-16, 15,-25,-10, 2,-18, 1, -2,-13,-15,-16,-17, -9, -2, -3, -8, 18,-17; /M: SY='K'; M= 4, 0,-21, -5, -1,-23, -7,-12,-22, 15,-22,-12, 4,-12, -1, 9, 4, 4,-14,-24,-15, -1; /M: SY='G'; M= 5, -8,-25,-10, -6,-26, 14,-14,-29, 10,-23,-13, -2,-15, -4, 10, -2,-11,-19,-20,-19, -6; /M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-36,-28, 15,-33,-25, 31,-26, 19, 17,-23,-25,-24,-23,-19, -8, 26,-17, 3,-27; /M: SY='E'; M= -1, 5,-21, 5, 11,-17,-14, -5,-17, -1,-18,-14, 3,-12, 0, -6, 7, 3,-13,-25, -7, 5; /M: SY='R'; M=-10,-18,-26,-20,-13, -5,-14,-12,-15, 3, -8, -6,-12,-23, -8, 23,-13,-11, -8, -4, -5,-12; /M: SY='V'; M= 5,-14, -6,-22,-19, -9,-21,-21, 11,-19, 1, 1, -8,-22,-17,-20, -3, -2, 12,-29,-12,-19; /M: SY='N'; M= -7, 5,-23, -1, -8, -5,-15, 11,-10,-12,-13, -8, 12,-19, -8,-11, -1, -6,-12,-26, -2, -9; /M: SY='W'; M=-13,-24,-30,-27,-24, 9,-27,-13, 9,-18, 1, 0,-20,-27,-17,-18,-21,-12, 2, 32, 24,-22; /M: SY='L'; M= -7,-20,-23,-23,-18, 3,-12,-17, 0,-20, 5, 2,-15,-22,-15,-17, -9, -3, -3, -3, 2,-17; /M: SY='T'; M= 5,-12,-18,-16,-14, -9, 0,-15,-10,-16, -3, -6, -9,-18,-13,-16, 2, 7, -6,-19, -6,-14; /M: SY='P'; M= -4,-22,-27,-24,-15, -7,-24,-15, 8,-17, 5, 9,-21, 11,-12,-19,-15, -9, -1,-19, -4,-16; /M: SY='F'; M= -8,-24,-22,-30,-22, 21,-26,-22, 6,-24, 14, 3,-21,-24,-22,-19,-16, -1, 2, 5, 8,-21; /M: SY='I'; M= -3,-26,-25,-29,-20, -6,-29,-25, 22,-23, 11, 8,-22, 0,-19,-24,-16, -8, 15,-24, -9,-22; /M: SY='W'; M= -5,-22,-28,-25,-15, -1,-20,-18, -4,-15, -7, -5,-19,-21, -5,-14,-12,-10, -8, 27, 4, -8; /M: SY='A'; M= 14, -6,-16,-12,-10,-18, 5, -3,-16,-12,-15, -7, -2,-14, -7,-14, 10, 5, -9,-26,-14, -9; /M: SY='L'; M= -8,-27,-21,-31,-23, 10,-29,-21, 24,-26, 25, 17,-22,-25,-19,-21,-18, -7, 16,-20, 0,-22; /M: SY='A'; M= 5,-12,-18,-15, -9,-14,-15,-15, -6, -2,-10, -6, -6,-16, -6, 2, 5, 1, 1,-27,-13, -9; /M: SY='F'; M=-14,-23,-25,-25,-20, 15,-20,-11, 1,-13, 7, 3,-17,-26,-17, -1,-17,-10, 1, -7, 13,-20; /M: SY='F'; M= 10,-18,-16,-25,-19, 11,-10,-19, -1,-19, -2, -1,-13,-19,-19,-19, -1, -3, 4,-15, -4,-18; /M: SY='V'; M= -8,-29,-19,-35,-29, 16,-32,-25, 29,-24, 14, 16,-24,-26,-26,-22,-16, -6, 30,-18, 2,-28; /M: SY='P'; M=-10,-24,-36,-21,-11,-19,-27,-24, 5,-17,-12, -6,-20, 51,-14,-24,-14,-10, -9,-26,-19,-17; /M: SY='A'; M= 11,-19,-18,-22,-17,-12,-10,-23, 4,-17, -2, -2,-17, -8,-17,-20, -2, -3, 10,-26,-16,-18; /M: SY='F'; M= -2,-21,-15,-27,-23, 17,-17,-23, 4,-21, 5, 0,-17,-24,-26,-18, -6, 4, 12,-16, 0,-23; /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24, 20,-32,-22, 23,-30, 36, 16,-26,-28,-24,-22,-26,-10, 13,-15, 5,-24; /M: SY='V'; M= 1,-24, -6,-30,-25, 7,-18,-23, 9,-23, 7, 5,-20,-25,-24,-21,-11, -7, 14,-20, -5,-24; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -7,-24, 0,-26,-21, 7,-27,-21, 10,-24, 23, 8,-23,-27,-22,-19,-17, -2, 12,-22, -4,-21; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='A'; M= 10,-12,-18,-17,-12, -4,-15, -7, -5, -4, -7, -1,-11,-18, -8,-10, -1, 0, -1,-10, 10,-11; /M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-32,-25, 27,-24,-18, 12,-27, 23, 9,-23,-28,-26,-20,-22,-10, 8, -8, 12,-25; /M: SY='G'; M= 4,-10,-28,-10,-15,-28, 49,-19,-34,-17,-28,-19, -2, -8,-16,-19, 3,-14,-26,-23,-28,-16; /M: SY='A'; M= 19, -5,-17,-11, 0,-23, -5,-12,-17, -3,-14,-10, -5,-11, 3, -5, 7, 4,-10,-22,-17, 1; /M: SY='P'; M= -3, -3,-29, 3, 6,-30, -1,-12,-25, -7,-27,-19, -4, 24, 0,-13, 3, -7,-25,-30,-24, 1; /M: SY='V'; M= 6,-18,-17,-21,-13, -4,-12,-20, 4,-17, 3, 0,-15,-20,-16,-18, -4, -4, 9,-23,-10,-15; /M: SY='V'; M= -4,-28,-17,-30,-28, -1,-24,-26, 27,-22, 13, 15,-25,-27,-24,-21,-14, -5, 34,-26, -8,-27; /M: SY='Q'; M= -4, 12,-24, 10, 10,-31,-14, 1,-21, 6,-22,-10, 11,-12, 24, 2, 4, -1,-23,-27,-14, 17; /M: SY='A'; M= 10, 0,-19, -4, -4,-15,-10, -1,-16, -4,-12,-10, 2,-15, -5, -5, 2, -4,-11,-25,-10, -5; /M: SY='I'; M= -5,-27,-21,-34,-25, 14,-29,-23, 24,-25, 20, 16,-22,-24,-22,-22,-18, -8, 19,-16, 2,-24; /M: SY='L'; M= -7,-21,-19,-24,-19, -1,-27,-20, 17,-15, 19, 10,-18,-26,-18,-14,-17, -6, 18,-25, -6,-19; /M: SY='N'; M= -8, 14,-25, 12, 8,-26, -3, 5,-28, 10,-28,-17, 19,-13, 3, 4, 4, -5,-25,-31,-15, 5; /M: SY='A'; M= 24,-15,-15,-21,-12,-11,-12,-21, -3,-13, -3, -6,-16,-16,-13,-18, -1, 0, 4, -9,-12,-12; /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-35,-25, 4,-33,-21, 34,-26, 31, 27,-24,-24,-16,-23,-24,-10, 19,-20, 0,-23; /M: SY='P'; M=-10,-13,-38, -5, 6,-29,-19,-16,-21, -7,-29,-20,-13, 74, -6,-17, -8, -9,-30,-31,-28, -4; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='S'; M= 5, 0,-20, -5, 2,-21, -4,-12,-15, -4,-17,-11, 3,-11, 0, -8, 8, 5,-12,-27,-16, 1; /M: SY='W'; M=-13,-34,-37,-35,-28, 5,-22,-28, -3,-20,-11,-10,-32,-27,-20,-20,-26,-18, -7, 82, 15,-21; /M: SY='L'; M= -6,-29,-18,-28,-22, 1,-29,-24, 20,-23, 24, 11,-29,-16,-23,-20,-19, -6, 23,-25, -8,-23; /M: SY='M'; M= -7,-11,-20,-21,-17, -6,-17,-13, 10,-15, 7, 19, -7,-18, -9,-14, -7, 5, 5,-24, -6,-14; /M: SY='H'; M=-12, 16,-25, 11, 1,-23, -6, 37,-27, 0,-26,-12, 26,-18, 4, 1, 1, -9,-27,-33, -5, 1; /M: SY='G'; M= 4,-11,-24,-13,-19,-24, 44,-21,-27,-18,-22,-15, -4,-19,-19,-19, 2, -9,-16,-22,-25,-19; /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 21,-29,-18, 17,-28, 40, 20,-27,-29,-21,-19,-27,-10, 8,-15, 5,-21; /M: SY='S'; M= -5, -2,-18, -4, 4, -8,-16,-11,-14, -2,-16,-12, 2,-14, -4, -2, 8, 8, -8,-27,-10, 0; /M: SY='V'; M= 6,-24,-13,-28,-25, -4,-26,-27, 23,-19, 6, 6,-22,-23,-23,-21, -5, 4, 33,-27,-10,-25; /M: SY='A'; M= 30,-16,-12,-22,-17,-15, -2,-23, -1,-14, -6, -5,-15,-17,-17,-20, 3, -2, 12,-23,-18,-17; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 8, -9,-25,-10,-16,-27, 52,-19,-33,-17,-27,-19, 0,-17,-16,-19, 6,-13,-23,-22,-27,-16; /M: SY='M'; M= -7,-22,-22,-28,-21, -3,-17,-15, 18,-20, 16, 25,-18,-22,-12,-18,-14, -8, 11,-22, -5,-18; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-23, 7,-31,-21, 26,-28, 39, 22,-28,-28,-20,-21,-26, -9, 17,-21, -1,-22; /M: SY='P'; M= -3,-20,-31,-15, -6,-23,-20,-20,-11, -9,-20,-13,-19, 51,-12,-14, -8, -7,-12,-28,-24,-13; /M: SY='A'; M= 27,-17, 4,-25,-18, -8,-12,-23, -3,-16, -5, -6,-16,-19,-19,-21, 1, -2, 10,-23,-15,-18; /M: SY='V'; M= -3,-29,-15,-32,-28, 1,-31,-27, 32,-22, 16, 17,-27,-27,-25,-21,-14, -3, 40,-27, -7,-28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-15,-28,-27,-36,-28, 30,-35,-18, 26,-26, 13, 10,-20,-25,-24,-23,-20,-10, 13, -2, 24,-28; /M: SY='A'; M= 42,-10,-13,-18,-12,-22, 12,-20,-15,-12,-13,-12, -8,-12,-12,-20, 8, -3, -5,-20,-22,-12; /M: SY='M'; M= -9,-24,-23,-32,-23, 1,-29,-17, 29,-21, 22, 31,-20,-21,-12,-19,-18, -4, 17,-21, -1,-19; /M: SY='L'; M= -6,-25,-17,-27,-21, 4,-29,-23, 19,-25, 29, 13,-24,-26,-20,-19,-16, 3, 17,-24, -4,-21; /M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-32,-23, 6,-30,-19, 26,-26, 36, 26,-26,-26,-18,-20,-25, -9, 18,-21, -1,-21; /M: SY='R'; M= -8, 1,-25, -4, -1,-17,-14, -1,-23, 17,-22,-12, 9,-17, 4, 28, -1, -5,-18,-21, -5, -1; /M: SY='V'; M= -9,-23,-19,-25,-21, 8,-27, -9, 14,-14, 6, 15,-22,-26,-11,-13,-14, -6, 18,-12, 13,-16; /M: SY='M'; M=-10,-25,-23,-33,-23, 2,-28,-13, 29,-20, 26, 40,-22,-22,-10,-18,-22,-10, 16,-20, 0,-18; /M: SY='P'; M= 1,-19,-25,-18,-13,-11, -3,-19,-12,-13,-11, -9,-15, 10,-16,-12, -7, -9, -9,-21,-17,-16; /M: SY='R'; M= -2, -7,-21, -9, 4,-17,-20,-13, -9, 3,-12, -7, -6,-14, -2, 6, 1, 4, -2,-26,-13, 0; /M: SY='K'; M= -7, -2,-28, -4, 3,-26, -9, -8,-29, 31,-26,-11, 2,-14, 5, 30, -6, -9,-20,-21,-13, 3; /M: SY='D'; M= -4, 11,-24, 15, 11,-25,-14, -4,-24, 8,-22,-15, 3,-11, 6, 0, 3, -1,-19,-24, -8, 8; /M: SY='Y'; M=-13,-25,-21,-27,-22, 21,-29, -3, 11,-20, 17, 11,-23,-29,-19,-16,-20, -9, 9, -6, 23,-22; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='W'; M=-13,-28,-27,-33,-25, 18,-26,-21, 7,-22, 10, 10,-26,-26,-20,-18,-23, -9, 1, 26, 11,-21; /M: SY='P'; M= 1,-21,-29,-18,-12,-20,-15,-23, -3,-15,-14, -9,-19, 35,-15,-21, -8, -8, -5,-27,-22,-17; /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-28,-22, 45,-29, -2, -2,-19, 1, -2,-20,-16,-23,-15,-19,-10, -8, 15, 46,-23; /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-33,-26, 45,-30,-15, 8,-26, 20, 7,-24,-30,-29,-18,-22, -9, 6, 1, 26,-26; /M: SY='F'; M= -9,-27,-23,-35,-26, 31,-30,-19, 17,-26, 17, 8,-21,-25,-25,-22,-19, -9, 9, -5, 16,-26; /M: SY='L'; M= 1,-26,-20,-31,-22, 1,-27,-22, 23,-24, 26, 17,-24,-24,-18,-22,-18, -7, 18,-21, -4,-21; /M: SY='G'; M= 9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-35,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-25,-20,-28,-18; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27, 67,-30, -9, 0,-25, 7, 0,-20,-30,-32,-17,-20,-10, -3, 15, 43,-27; /M: SY='V'; M= 3,-21,-14,-27,-22, 10,-24,-24, 12,-20, 7, 3,-19,-22,-23,-19, -6, 5, 19,-19, -3,-22; /M: SY='L'; M= -6,-24, -5,-30,-23, 14,-27,-20, 9,-24, 19, 11,-23,-27,-23,-19,-16, -3, 11,-20, -1,-22; /M: SY='A'; M= 30,-11,-11,-17,-11,-15, -6,-19, -6,-12, -7, -8, -9,-13,-11,-18, 11, 6, 3,-25,-17,-11; /M: SY='A'; M= 26,-11, -4,-20,-15,-16, -3,-20, -6,-15, -6, -7, -8,-17,-14,-20, 1, -4, -2,-24,-18,-15; /M: SY='Y'; M=-12,-23,-24,-26,-22, 17,-29, -7, 15,-19, 7, 5,-18,-25,-17,-17,-13, -6, 8, -1, 30,-22; /M: SY='L'; M= -7,-23,-19,-26,-20, 7,-19,-21, 10,-25, 21, 8,-19,-25,-20,-19,-13, -2, 7,-21, -3,-20; /M: SY='K'; M= 1, 1,-26, -1, 7,-29, 1, -7,-26, 13,-24,-12, 4,-12, 11, 5, -1, -9,-22,-23,-17, 9; /M: SY='L'; M= -5,-20,-19,-21,-16, -1,-18,-19, 4,-19, 8, 2,-18,-14,-14,-16, -8, -2, 6,-23, -8,-15; /M: SY='P'; M= -8, -8,-24,-13,-11, -5,-20,-15, -1,-16, -4, -5, -1, 4,-13,-16, -5, 0, -8,-26,-11,-13; /M: SY='L'; M=-11,-11,-22,-16, -9, 5,-23,-13, 2,-17, 9, 3, -6,-14,-13,-14,-12, -3, -4,-22, -4,-11; /M: SY='I'; M= -5,-23,-18,-26,-20, -3,-27,-20, 21,-20, 15, 14,-20,-23,-13,-17,-11, -1, 20,-25, -6,-17; /M: SY='A'; M= 12, -5,-16,-12,-12,-14, 0,-15, -9,-14, -7, -8, 0,-18,-12,-15, 5, 3, -4,-27,-16,-12; /M: SY='L'; M= -2,-23, -4,-26,-19, -5,-24,-19, 10,-21, 12, 12,-21,-16,-16,-20,-12, -6, 9,-27,-10,-19; /M: SY='A'; M= 16,-14,-17,-17,-14,-18, 9,-19,-10,-15, -9, -7,-11,-18,-12,-17, 2, -5, -1,-23,-19,-13; /M: SY='V'; M= 7,-20,-14,-25,-20, -5,-21,-22, 15,-18, 8, 9,-19,-21,-18,-18, -4, 3, 22,-26,-10,-19; /M: SY='I'; M= -1,-25,-22,-30,-24, 4,-29,-18, 24,-22, 14, 10,-22,-23,-18,-22,-15, -7, 19,-13, 10,-24; /M: SY='G'; M= 8,-14,-22,-15,-16,-18, 26,-19,-18,-19, -8, -9, -8,-19,-16,-19, -1,-10,-13,-22,-20,-16; /M: SY='V'; M= -4,-21,-18,-25,-22, -2,-21,-24, 16,-22, 14, 7,-19,-23,-20,-19, -9, 6, 17,-25, -7,-22; /M: SY='A'; M= 12,-20,-16,-25,-19, -1,-12,-22, 6,-20, 5, 1,-17,-20,-19,-20, -5, -4, 11,-20, -9,-19; /M: SY='F'; M= -4,-22,-22,-27,-23, 9, -1,-20, 1,-23, 8, 6,-17,-24,-22,-20,-14,-11, 1,-15, -4,-22; /M: SY='A'; M= 31,-13,-13,-21,-14,-10, -1,-21, -8,-13, -8, -8,-11,-14,-15,-19, 6, 2, 2,-19,-15,-14; /M: SY='I'; M= -3,-26,-20,-30,-23, 10,-28,-20, 20,-23, 17, 9,-22,-25,-21,-21,-14, -5, 18,-16, 4,-23; /M: SY='I'; M= 1,-23,-22,-28,-17, -4,-28,-24, 25,-22, 16, 10,-20,-20,-17,-22,-14, -7, 19,-22, -6,-19; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PTS EIIC type-4 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
PTFC_BACSU (P26381), PTNC_ECO57 (P69803), PTNC_ECOL6 (P69802), PTNC_ECOLI (P69801), PTNC_SHIFL (P69804), PTPC1_ECOLI (P42910), PTPC2_ECOLI (P42905), PTRC_KLEPN (P37082), PTRC_LACCA (Q9RGG3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
6K1H; 7DYR |