PROSITE logo

PROSITE entry PS51110


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] SAP_A
Accession [info] PS51110
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-APR-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51110
Associated ProRule [info] PRU00414

Name and characterization of the entry

Description [info] Saposin A-type domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2327433; R2=0.0107069; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=586; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=371; N_SCORE=6.2; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='W';  M=-15,-30,-45,-25,-15,-10,-20,-25,-20,-15,-25,-20,-30, 30,-15,-20,-25,-20,-30, 59,  0,-15;
/M: SY='T';  M=  0,-15,-10,-20,-20, -5,-25,-25, 10,-15,  0,  0,-15,-20,-20,-15,  5, 25, 25,-30,-10,-20;
/M: SY='T';  M= -5, -9,-17,-14, -7,-10,-23,-14, -3,-12,  6,  1, -9,-16,  1, -9,  1, 20, -3,-25, -7, -3;
/M: SY='S';  M= -2,  3,-23,  7, -3,-21,  5,-12,-27,-11,-28,-22,  3,-15, -6,-13, 14,  0,-20, -8,-14, -4;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-21, -6,  0,-21,-11,-10,-14,-10,-17,-11, -3,  8,  4,-10, 14,  5,-14,-32,-18,  1;
/M: SY='K';  M=-10,-15,-25,-15, -5,-10,-25,-15, -5, 10, 10,  5,-15,-20, -5,  5,-20,-10, -5,-20, -5, -5;
/M: SY='A';  M= 20,  4,-16,  2,  5,-22, -9,-14,-18, -6,-15,-15, -2, -9, -4,-14,  9,  7, -9,-27,-18,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='A';  M= 35, -7,-10,-14, -8,-19, -3,-18,-12,-10,-14,-12, -4,-10, -8,-17, 18, 11, -2,-26,-19, -8;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-30, -3,  7,-34, -2, -1,-27, 13,-24, -7,  0,-13, 29, 16, -3,-12,-27,-20,-14, 17;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M= -3,-13,-30, -7,  0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10, 55, -7,-17,  7,  0,-23,-33,-27, -7;
/M: SY='E';  M= 11,  3,-23,  6, 36,-27,-13, -7,-23,  3,-17,-17, -3, -3, 10, -7,  3, -7,-20,-27,-20, 23;
/M: SY='F';  M=-10,-30,-15,-35,-30, 40,-30,-25, 15,-25, 10,  5,-25,-30,-35,-20,-15, -5, 25,-10, 10,-30;
/M: SY='W';  M=-18,-38,-44,-38,-28, 10,-22,-28,-12,-22, -6,-12,-38,-30,-20,-20,-38,-26,-22,115, 24,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q';  M=-12, -2,-30, -2, 16,-36,-20,  8,-22, 14,-20, -2,  0,-12, 50, 22, -2,-10,-28,-20,-10, 32;
/M: SY='S';  M=  1, 16,-16, 17,  4,-24, -2, -5,-24, -7,-30,-22, 19,-11,  0, -9, 28, 11,-17,-40,-20,  2;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='E';  M=-12,  3,-30,  8, 33,-28,-20, -3,-30, 27,-23,-15,  0, -7, 15, 21, -5,-10,-25,-25,-15, 23;
/M: SY='Q';  M= -5,  0,-20, -5,  5,-25,-20, -5,-15,  0,-15, -5,  0,-10, 25,  0, 10, 20,-15,-25,-10, 15;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L';  M= -2,-21,-15,-21,-16, -1,-21,-19, 10,-22, 18,  6,-18,-24,-16,-17, -5,  1, 12,-28, -8,-16;
/M: SY='Q';  M=-13, 17,-30, 24, 20,-40,-17,  7,-27,  7,-23,-10,  7,-10, 39,  3,  0,-10,-30,-27,-13, 30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M=-10,-10,-30,-10,-10,-25, 25,-10,-35,  5,-25,-15,  0,-20, -5, 25, -5,-15,-25,-20,-20,-10;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L';  M= -5,-30,-15,-30,-25,  5,-30,-25, 25,-25, 30, 15,-30,-30,-25,-20,-20, -5, 30,-25, -5,-25;
/M: SY='G';  M= -5, -5,-30, -5, -5,-30, 25,-15,-35, 15,-30,-15,  0,-15, -5,  5, -5,-15,-25,-20,-20, -5;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-19,-24,-19, -6, -8,-26, -9,  6,-16, 25, 13,-19,-23,  9, -9,-19,-10, -4,-20, -4,  2;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='E';  M= -9,  7,-24,  5, 24,-19,-17, -1,-15,  1,-12, -2,  5, -9,  9, -3,  0,  0,-18,-30,-14, 16;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='G';  M=  2,  1,-21, -2,-10,-25, 35,-12,-30,-14,-30,-20, 12,-16,-10,-14, 16, -3,-23,-30,-25,-10;
/M: SY='H';  M=-15,  0,-30,  0,  5,-25,-20, 45,-30, 20,-25, -5,  5,-15, 10, 15,-10,-15,-25,-25,  5,  5;
/M: SY='P';  M= -5,-25,-25,-20,-15,-15,-25,-25,  5,-15,-10, -5,-25, 30,-20,-20,-10, -5, 10,-30,-20,-20;
/M: SY='G';  M=  8, -7,-20,-12,-15,-21, 28,-20,-25,-15,-20,-15, -2,-15,-15,-17,  9,  7,-15,-23,-21,-15;
/M: SY='A';  M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23,  2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20,  4,  0, 15,-23,-17,-16;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 21 in 14 different sequences
Number of true positive hits 20 in 13 different sequences
Number of 'unknown' hits 1
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Saposin A-type
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
13 sequences

PSPB_BOVIN  (P15781), PSPB_CANLF  (P17129), PSPB_HUMAN  (P07988), 
PSPB_MOUSE  (P50405), PSPB_RABIT  (P15285), PSPB_RAT(P22355), 
SAPL1_HUMAN (Q6NUJ1), SAPL1_MOUSE (Q8C1C1), SAP_BOVIN   (P26779), 
SAP_CHICK   (O13035), SAP_HUMAN   (P07602), SAP_MOUSE   (Q61207), 
SAP_RAT (P10960)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences
1 sequence

GILT_CARAU  (E7E2N8)