PROSITE entry PS51115
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | LAMININ_IVA |
| Accession [info] | PS51115 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51115 |
| Associated ProRule [info] | PRU00458 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Laminin IV type A domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=176; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=171; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6271324; R2=0.0219473; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9164.0683594; R2=4.5468087; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; H_SCORE=10901; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; H_SCORE=10178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-26, -6, -1,-20,-10, -5,-12, -3,-14, -3, -3, -9, 4, -3, -3, -5,-12,-25,-12, 1; /M: SY='D'; M=-10, 10,-24, 14, 2,-20, -9, -5,-19, -7,-13,-10, 4,-13, -2, -7, 0, -2,-16,-29,-12, 0; /M: SY='M'; M= -6, -8,-23,-10, -9,-10,-14,-11, -4, -7, -3, 3, -7,-11, -9, -8,-10, -7, -4,-22, -9,-10; /M: SY='E'; M= -7, 2,-26, 3, 7,-19,-12, -4,-20, -3,-17,-13, 1, -9, 2, -3, -2, -7,-18,-18,-12, 4; /M: SY='G'; M= -5, -4,-27, -2, -5,-25, 16,-13,-26, -9,-23,-16, -2, -2, -9,-12, 0, -8,-20,-25,-20, -8; /M: SY='W'; M=-16,-34,-34,-36,-27, 24,-26,-26, -2,-23, -1, -6,-31,-28,-25,-20,-29,-19, -7, 67, 20,-22; /M: SY='T'; M= -5, -9,-23,-12, -5,-13,-19, -3,-12, 0,-13, -6, -6,-17, -1, 0, -3, 1, -8,-11, -2, -4; /M: SY='L'; M= -2,-19,-21,-21,-14, -8,-15,-18, 5,-16, 12, 6,-16,-21,-10,-12,-11, -4, 4,-22, -9,-13; /M: SY='T'; M= 0, -8,-16,-11, -6,-12,-19,-15, -2, -8, -5, -1, -8,-16, -6, -8, 4, 12, 5,-28,-11, -7; /M: SY='N'; M= -4, 17,-22, 16, 6,-25, -5, -1,-23, -1,-25,-17, 18,-12, 5, -5, 10, 1,-22,-31,-15, 5; /M: SY='L'; M= -4,-11,-21,-11,-11,-11,-18,-14, 0,-10, 3, 1,-10,-18,-10, -4, -7, -4, 3,-26,-11,-12; /M: SY='E'; M= -5, 5,-26, 6, 7,-24, -5, -7,-21, 0,-19,-13, 2,-10, 3, -4, 1, -3,-19,-25,-13, 5; /M: SY='G'; M= -4, -7,-24, -7, -9,-20, 12,-12,-19, -8,-16, -6, -4,-18, -6, -4, -1, -9,-11,-24,-17, -8; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='S'; M= -3, -3,-17, -4, -2,-17,-10,-10,-14, -2,-17,-11, 1, -3, -1, 2, 9, 9, -9,-26,-14, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= -5, -6,-26, -5, 4,-21,-16, -7,-16, 2,-17, -9, -4, 2, 4, 1, -1, -3,-15,-26,-14, 2; /M: M= -1, -6,-21, -7, -1,-14,-19, -7, -6, -7, -8, -4, -6,-14, -2, -6, -2, -2, -1,-26,-10, -2; /M: SY='P'; M= -6, -4,-29, 1, 2,-25,-14,-15,-18, -6,-23,-16, -6, 28, -6,-12, 0, -1,-18,-31,-22, -5; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='V'; M= -2,-16,-19,-17,-13, -7,-17,-16, 4,-13, 1, 0,-14,-16,-12,-14, -7, -4, 8,-20, -7,-13; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='E'; M= -5, 0,-23, 2, 13,-22,-17, -2,-14, 0,-15, -8, -2, -4, 11, -4, 1, -3,-14,-26,-12, 12; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='W'; M= -9,-18,-29,-18,-11, -2,-14,-14,-10,-13, -5, -5,-16, -9,-10,-12,-14,-11,-13, 6, 1,-10; /M: SY='N'; M= -3, 2,-22, 2, -1,-20, -4, -2,-19, -5,-20,-13, 6,-12, -2, -5, 6, -3,-14,-30,-15, -2; /M: SY='S'; M= -1, -2,-22, -3, 4,-20,-15, -8,-15, -4,-18,-11, -1, 4, 1, -8, 6, 4,-13,-29,-15, 2; /M: SY='N'; M= -5, 7,-21, 5, 3,-20, -7, 1,-21, -4,-20,-14, 11,-10, -1, -4, 8, 5,-18,-31,-13, 0; /M: SY='S'; M= -7, 3,-24, 3, -2,-23, -3, -5,-22, -5,-21,-14, 5, -6, 0, -2, 6, 1,-19,-28,-15, -2; /M: SY='Q'; M= -7, -7,-20,-10, -4,-15,-14, -6, -9, -5, -4, 0, -4,-17, 1, -2, -9, -8,-10,-24,-10, -3; /M: SY='E'; M= -3, -4,-21, -4, 2,-16,-13, -8,-11, -4,-10, -4, -3,-15, 1, -5, 1, -2, -8,-27,-12, 1; /M: SY='I'; M= -4,-28,-21,-32,-24, 6,-30,-22, 27,-25, 24, 16,-24,-25,-20,-22,-19, -8, 20,-18, 1,-24; /M: SY='S'; M= 2, 2,-18, 2, -5,-17, -6,-13,-13,-10,-12,-10, -1,-16, -8,-12, 6, 2, -5,-30,-15, -6; /M: SY='F'; M= -7,-18,-22,-22,-18, 16,-21,-13, 1,-17, 4, 0,-14,-16,-19,-15,-12, -6, 0,-11, 8,-18; /M: SY='S'; M= -2, 1,-21, 0, 3,-22, -8, -9,-17, -2,-19,-12, 4,-12, 5, -1, 10, 7,-14,-29,-15, 4; /M: SY='S'; M= 3, -1,-19, -3, -2,-14, -8, -5,-14, -8,-10, -8, 2,-15, -5, -8, 4, 1,-11,-28,-12, -4; /M: M= -9, -5,-23, -6, -3, -2,-18, -7,-13, -9, -9, -8, -4,-10, -6, -6, -3, -1,-11,-21, -4, -5; /M: SY='E'; M= -7, 4,-27, 9, 18,-27, -4, 1,-28, 1,-22,-15, 2, -4, 7, 0, 2, -8,-24,-29,-18, 11; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='H'; M= -6, -4,-20, -8, -6, -6,-16, 2, -5, -7, -8, -1, 0,-11, -2, -7, -4, -4, -7,-18, 0, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='R'; M= -7,-10,-19,-11, -4, -5,-16, -2, -8, -4, -5, -2, -6, -9, 1, 3, -4, -4, -8,-17, -4, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='D'; M= -3, 0,-15, 1, 0,-10, -9, -7, -7, -4, -4, -5, -1, -6, -3, -5, -3, -4, -7,-17, -8, -2; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='A'; M= 2, -8,-14, -9, -4, -9, -8, -8, -7, -5, -6, -5, -5, -8, -4, -1, 1, 0, -4,-17, -7, -5; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='E'; M= -4, 5,-22, 7, 13,-22, -7, 5,-22, -2,-18,-13, 3, -2, 4, -3, 3, -4,-20,-26,-13, 7; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='P'; M= 0, -7,-22, -5, -2,-20,-12,-13,-15, -7,-18,-12, -6, 18, -6,-12, 5, 5,-12,-28,-18, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='Y'; M= -7,-22,-22,-24,-20, 13,-24,-11, 6,-16, 5, 1,-19,-21,-18,-14,-15, -7, 5, 3, 18,-19; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='Y'; M=-18,-21,-28,-21,-18, 29,-29, 10, -1,-12, -1, -1,-20,-28,-13,-12,-18, -9, -7, 25, 61,-18; /M: SY='W'; M=-14,-33,-36,-36,-27, 24,-22,-25,-10,-22, -7,-11,-30,-28,-23,-20,-28,-20,-16, 83, 23,-21; /M: SY='Q'; M= 0,-11,-22,-12, -5,-20,-14,-13,-10, 0,-13, -6, -8, -6, 1, 1, 0, -2, -6,-26,-14, -3; /M: SY='L'; M= 14,-20,-17,-24,-15, -7,-17,-20, 5,-18, 15, 5,-20,-14,-14,-17,-11, -6, 5,-21,-11,-15; /M: SY='P'; M= -8,-18,-36,-10, -2,-27,-15,-19,-19,-11,-27,-18,-17, 72,-10,-19, -6, -8,-27,-30,-28,-10; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='E'; M= -2, 4,-24, 6, 13,-22,-15, -5,-19, 1,-16,-13, 0, -4, 6, -5, 2, -3,-17,-25,-11, 9; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='Q'; M= -3, -5,-23, -5, 2,-22,-11, -5,-16, 5,-18, -8, -2, -7, 10, 4, 2, -2,-14,-23,-11, 5; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='F'; M=-16,-24,-20,-30,-24, 48,-27, -8, 4,-21, 9, 4,-19,-27,-26,-15,-18, -8, 2, 9, 34,-23; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='L'; M= -9,-20,-20,-21,-11, 0,-22,-14, 7,-17, 27, 11,-20,-23, -9,-11,-20, -6, 1,-19, -2,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='G'; M= -1, -6,-26, -7,-16,-26, 57,-14,-35,-17,-27,-18, 4,-18,-16,-16, 0,-17,-27,-20,-26,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='B'; M=-14, 37,-24, 37, 8,-29, -8, 3,-26, 1,-27,-22, 33,-16, 1, -4, 3, -5,-25,-38,-19, 4; /M: SY='Q'; M=-11, -5,-28, -6, 6,-24,-20, 2,-19, 19,-15, -2, -3,-14, 20, 19, -7, -9,-19,-21, -6, 12; /M: SY='L'; M= -7,-23,-18,-24,-18, 1,-26,-20, 12,-16, 16, 8,-20,-25,-16, -8,-12, 0, 15,-24, -5,-18; /M: SY='T'; M= 0, -5,-17, -8, -8,-10,-14,-12, -9, -9, -8, -6, -3,-12, -8, -9, 7, 12, -5,-25, -7, -8; /M: SY='S'; M= 20, -4,-12, -7, -5,-19, 3,-13,-17,-11,-23,-16, 2,-11, -5,-14, 26, 11, -8,-30,-17, -5; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-29,-20,-21, 26,-20, 12, -3,-12, -2, -2,-18,-29,-13,-12,-18,-11, -9, 22, 63,-21; /M: SY='G'; M= -2, -5,-29, -7,-18,-25, 56,-14,-35,-17,-28,-19, 5,-21,-17,-17, 0,-17,-29,-19,-22,-18; /M: SY='G'; M= -2,-10,-28,-10,-11,-27, 36,-13,-30,-12,-21,-13, -2,-19, -4, -8, -1,-14,-24,-21,-22, -8; /M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -4, -1, -5,-19, -4,-15, 1,-13, -9, 0,-12, -2, 0, -4, -2,-14,-18, 1, -2; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-20, 10,-29,-17, 18,-27, 40, 19,-27,-29,-18,-19,-25, -9, 9,-17, 4,-19; /M: SY='R'; M= -9, -5,-23, -8, -2,-16,-19, 4,-17, 8,-16, -7, 0,-16, 3, 15, 0, 3,-12,-23, -2, -1; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-23,-28,-22, 41,-27, -2, 1,-19, 7, 1,-19,-28,-22,-15,-17, -8, -3, 12, 44,-22; /M: SY='T'; M= -3, 2,-20, -1, 2,-19,-15,-12,-18, 5,-17,-11, 1, -9, -1, -1, 6, 14,-11,-27,-12, 0; /M: SY='I'; M= -6,-27,-19,-30,-23, 8,-29,-22, 22,-24, 20, 13,-23,-26,-21,-20,-16, -5, 21,-20, 0,-23; /M: SY='R'; M= -8, -8,-23, -9, -4, -8,-18, -1,-15, 1,-14, -8, -4,-17, 0, 7, -1, -1,-12,-13, 1, -3; /M: SY='Y'; M=-10,-17,-24,-20,-15, 14,-19, -5, -2,-15, -3, -3,-14,-24,-14,-13,-11, -7, -2, 3, 21,-15; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='E'; M= -6, 4,-22, 8, 10,-17,-17, -6,-16, -2,-15,-12, -1, -7, -1, -4, 2, 1,-11,-26,-10, 4; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='P'; M= -1, -7,-21, -7, -7,-17, 0,-13,-13, -8,-12, -9, -4, 3, -8, -7, -2, -4,-12,-22,-16, -9; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='G'; M= -2, -6,-19, -9, -8,-18, 10, -7,-22,-10,-16,-11, -1,-18, -5, -7, 0, -6,-17,-24,-15, -7; /M: SY='D'; M=-10, 5,-28, 11, 3,-26, 4, -6,-27, -3,-24,-17, 2, -6, -5, -2, -2,-10,-21,-27,-17, -3; /M: SY='R'; M= -4, -5,-22, -7, -1,-19, -3, -7,-21, 3,-18, -8, 0,-15, 2, 10, 4, 2,-15,-24,-12, -1; /M: SY='D'; M= -6, 0,-26, 2, -1,-25, 1, -7,-22, -5,-22,-13, 1, 1, -4, -7, 0, -6,-18,-29,-19, -4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='L'; M= -5,-16,-21,-16,-12, -6,-16,-14, 2,-16, 9, 4,-15,-13,-10,-13,-10, -3, -1,-21, -5,-12; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: M= -5, -6,-13, -7, 0, -2,-12, -1, -3, -6, -2, 0, -4, -6, -3, -6, -3, -2, -4,-14, -3, -2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= -4, -6,-23, -5, -4,-17, -6, -9,-16, -8,-20,-12, -1, 0, -3, -9, 7, 0,-14,-26,-12, -5; /M: SY='E'; M= -2, -1,-23, 0, 1,-21,-11, -3,-16, 1,-16,-10, -2,-13, -1, 0, -2, -6,-10,-26,-11, -1; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='P'; M= -3,-10,-30, -4, 6,-25,-16,-11,-18, -4,-22,-15,-12, 41, -1,-12, -5, -8,-23,-25,-19, 0; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M=-14, 28,-20, 39, 12,-29,-11, -1,-27, -1,-19,-17, 11,-11, 4, -7, -1, -8,-21,-31,-15, 8; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-31,-28, 2,-32,-27, 31,-23, 17, 13,-28,-28,-27,-21,-15, -3, 40,-25, -5,-28; /M: SY='I'; M= -7,-22,-23,-27,-18, -6,-30,-21, 23,-17, 11, 11,-17,-21,-10,-14,-12, -4, 18,-23, -5,-16; /M: SY='L'; M= -9,-27,-24,-30,-21, 4,-27,-23, 23,-27, 31, 15,-24,-25,-19,-22,-23,-10, 13,-20, -2,-21; /M: SY='E'; M= -9, -2,-25, -1, 12,-20,-18, -3,-17, 5,-15, -7, -3,-12, 9, 4, -2, -2,-13,-25,-10, 10; /M: SY='G'; M= 0, -7,-28, -8,-16,-28, 55,-11,-37,-16,-29,-18, 3,-19,-16,-16, 1,-17,-28,-22,-25,-16; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='N'; M= 4, 10,-20, 2, -2,-22, 8, -1,-22, -3,-23,-15, 19,-15, -2, -4, 6, -4,-20,-27,-18, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='G'; M= -6, 9,-24, 7, -4,-25, 16, -1,-27, -6,-22,-15, 14,-16, -2, -5, 2, -8,-24,-27,-18, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='M'; M= -6,-12,-18,-15,-10, -3,-16,-10, 3, -7, 6, 7, -9,-13, -7, -5,-10, -5, 0,-15, -2,-10; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='R'; M= -1, -6,-15, -7, -1,-12,-11, -6, -9, 4, -8, -4, -3,-10, 3, 10, 0, 0, -6,-16, -8, 0; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='L'; M= -8,-24,-20,-28,-20, 3,-28,-17, 25,-23, 27, 19,-21,-22,-15,-19,-20, -8, 17,-19, -1,-19; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='S'; M= -1, -4,-15, -6, -3,-13,-14, -5, -6, -7,-10, -5, -1,-12, -3, -6, 8, 8, -2,-27, -9, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='Y'; M= -7,-15,-19,-18,-13, 0,-22, 5, 3,-15, 5, 4,-11,-20, -9,-10, -9, -2, 2,-17, 7,-13; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='R'; M= -8,-10,-25, -9, -3,-14,-18, 5,-16, 3,-16, -8, -6, -2, -1, 7, -4, -5,-14,-17, 0, -5; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='M'; M= -5,-14,-23,-16, -7, -6,-20, 0, 1,-13, 3, 5,-12,-16, -6,-12, -9, -6, -2,-19, 2, -8; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='R'; M= -8, -8,-25, -8, -2,-10,-20, -6,-11, -1,-11, -6, -7, -9, -3, 2, -4, -3,-10,-18, -4, -4; /M: SY='A'; M= 13, -6,-20, -8, 4,-21, -7,-12,-15, -6,-14,-11, -4,-10, 2, -9, 6, -1,-12,-19,-15, 3; /M: SY='E'; M=-10, -3,-28, 2, 9,-22,-20, -8,-16, -4,-15,-11, -7, 9, 6, -9, -3, -3,-18,-22,-11, 6; /M: M= -3, -9,-25,-11, -7, -8, 0, -8,-18,-12,-17,-12, -4, -1,-10,-11, 0, -5,-17,-21,-10, -9; /I: I=-4; MD=-21; /M: M= -9,-10,-24,-12, -7,-11,-16, -4, -7, -8, -5, -4, -4, -7, -4, -4, -7, -5,-10,-15, -6, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='P'; M= -7, -7,-27, -2, 3,-21,-11, -8,-18, -6,-21,-15, -8, 33, -3,-11, -2, -5,-20,-23,-15, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='M'; M= -8, -8,-19,-10, -7, -5,-13, 0, -5, -7, -4, 1, -5, -3, -2, -5, -7, -4, -8,-14, 0, -6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= -7, -4,-21, -2, -1,-15, -9, -4,-13, -4,-12, -9, -3, 7, -2, -2, -3, -5,-13,-20,-11, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='E'; M= -4, -1,-14, 1, 3,-16,-12,-11,-10, -8,-11,-10, -3, 2, -5,-10, 2, 2, -9,-25,-14, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='R'; M=-12, 5,-28, 6, 8,-22, -4, 4,-26, 3,-21,-14, 8,-11, 5, 10, -2, -9,-25,-24,-11, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='H'; M=-11, -2,-26, -1, 8,-22,-15, 13,-20, 1,-15, -6, 0,-14, 13, 6, -2, -5,-19,-25, -5, 8; /M: SY='E'; M= -3, -3,-22, -2, 4,-21,-11,-10,-16, -5,-16,-11, -3, -2, -1, -8, 3, 2,-11,-29,-16, 0; /M: SY='R'; M=-11, -6,-24,-10, -5, -7,-18, 1, -8, -1, -9, -3, -1,-20, -3, 2, -7, -7, -7,-20, 1, -5; /M: SY='E'; M= -7, -1,-23, -2, 5,-16,-18, -7,-14, -2,-13,-10, -1, -9, 1, -1, 1, 5,-10,-26,-10, 2; /M: SY='Y'; M=-10,-19,-22,-23,-20, 9,-22,-10, 9,-15, 2, 5,-14,-26,-15,-12,-12, -7, 10,-12, 11,-19; /M: SY='T'; M= -1,-11,-19,-14, -7,-15,-20,-16, -2, -5, -7, -3, -9,-10, -4, -7, 2, 7, 3,-27,-12, -6; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='F'; M=-10,-22,-17,-27,-20, 14,-28,-15, 13,-20, 12, 8,-17,-24,-20,-15,-15, -5, 12,-17, 3,-20; D=-3; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='R'; M=-12, -7,-26, -6, 5,-20,-18, -5,-21, 19,-17, -8, -3, -8, 9, 32, -7, -7,-16,-21,-11, 4; D=-3; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='L'; M= -8,-16,-17,-17, -6, 5,-22,-10, 8,-15, 14, 8,-15,-17,-11,-12,-13, -6, 5,-16, 0, -9; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -7, -5,-18, -6, 1, -5,-13, -6, -7, -3, -7, -5, -3,-10, -4, -3, -5, -5, -7,-11, -4, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='E'; M=-11, 0,-28, 3, 16,-14,-14, 6,-22, -4,-16,-13, -1, -7, 2, -5, -5, -9,-23,-15, -5, 8; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='E'; M= -6, 1,-25, 0, 10,-18,-10, -4,-21, 1,-18,-13, 2,-13, 5, 3, 0, -4,-20,-18,-10, 7; /M: SY='H'; M= -8, -4,-25, -8, -5, -2,-12, 8,-18, -8,-14, -9, 2,-20, -5, -5, -7, -9,-18, -6, 3, -6; /M: SY='W'; M=-11,-13,-30,-13, -8, -3,-18,-12,-17, -7,-15,-12,-13,-11, -8, -5,-11, -6,-17, 17, 4, -8; /M: SY='B'; M=-11, 7,-26, 7, 3,-22, -9, 3,-19, -1,-18,-11, 7,-16, 6, 2, 0, -6,-18,-26, -8, 3; /M: SY='H'; M=-10, -4,-24, -4, 2, -9,-18, 10,-20, 0,-16,-10, -1,-13, 1, 7, -1, -2,-17,-20, 2, 0; /M: SY='E'; M= -4, -4,-25, -2, 3,-20, -8, -4,-18, -6,-19,-13, -2, 1, -2, -7, 3, -3,-16,-27,-13, -1; /M: SY='S'; M= -1, 2,-23, 3, -4,-18,-12, -8,-19, -9,-20,-16, -1,-11, -7,-13, 4, 2,-14, -6, -9, -5; /M: SY='G'; M= -6, -6,-28, -5, -1,-24, 15, -2,-30, -2,-25,-15, 1,-10, -2, 4, 0,-11,-25,-23,-16, -3; /M: SY='P'; M= -6, -6,-26, -4, 0,-20,-15, -9,-16, 2,-17,-10, -4, 5, 2, 3, -4, -6,-15,-25,-14, -1; /M: SY='P'; M= 1, -9,-26, -7, 2,-25,-15,-13,-18, -5,-23,-15, -8, 31, -2,-10, 4, 2,-18,-29,-21, -2; /M: SY='V'; M= 7,-22,-15,-25,-20, -6,-22,-22, 14,-16, 9, 5,-19,-23,-18,-14, -8, -3, 21,-25,-10,-19; /M: SY='T'; M= -3, 6,-17, 4, 2,-20,-13,-11,-19, -3,-21,-16, 7, -6, 0, -3, 17, 22,-12,-33,-15, 0; /M: SY='R'; M=-14, -7,-29, -6, 5,-20,-17, 1,-28, 21,-20,-11, -1,-13, 8, 43, -6, -8,-20,-21, -9, 3; /M: SY='E'; M= -4, 0,-24, 2, 17,-10,-16, -8,-19, 0,-11,-12, -3,-12, 0, -4, -2, -7,-16,-23,-11, 9; /M: SY='D'; M=-14, 11,-28, 17, 15,-23,-15, 15,-23, -3,-17, -8, 4,-13, 11, -5, -5,-11,-23,-27, -6, 12; /M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-33,-24, 36,-29,-17, 11,-26, 24, 14,-23,-27,-25,-18,-21, -6, 6, -7, 13,-23; /M: SY='M'; M= -9,-21,-21,-26,-16, -2,-24, -9, 15,-14, 22, 34,-20,-22, -3,-10,-19, -7, 8,-21, -2,-10; /M: SY='M'; M= -4,-11,-20,-15,-10,-12,-15, -9, -2, -3, -2, 13, -9,-17, -2, -1, -3, 0, 0,-25, -9, -7; /M: SY='V'; M= 9,-23,-16,-26,-20, -6,-22,-25, 15,-19, 10, 5,-22,-16,-20,-21, -8, -1, 20,-24,-11,-21; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-28,-18, 7,-28,-18, 16,-26, 43, 17,-27,-29,-17,-14,-26, -9, 7,-21, -1,-18; /M: SY='A'; M= 13, -5,-17, -9, -4,-17, -9, -6,-13, -6,-13, -9, -3,-14, 1, -6, 9, 3, -8,-24,-10, -2; /M: SY='N'; M=-10, 29,-23, 26, 7,-25, -3, 3,-26, -1,-26,-20, 31,-15, 0, -2, 7, -3,-26,-37,-19, 3; /M: SY='L'; M= -9,-27,-22,-30,-21, 2,-31,-22, 24,-23, 29, 15,-24,-26,-17,-16,-21, -7, 18,-22, -3,-20; /M: SY='D'; M= -9, 10,-24, 14, 12,-24,-16, 3,-23, 0,-16,-13, 4,-11, 5, -3, 2, 4,-18,-30,-11, 8; /M: SY='A'; M= 6, -3,-20, -6, -3,-17, -8, 5,-14, -7,-15, -9, 0,-15, -3, -7, 3, -3,-10,-24, -6, -4; /M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-36,-27, 7,-35,-27, 36,-28, 25, 17,-24,-25,-23,-25,-21, -8, 26,-20, 0,-27; /M: SY='L'; M=-12,-20,-23,-22,-14, 5,-26,-11, 3, -9, 17, 9,-18,-24, -9, -2,-18, -7, -1,-14, 7,-12; /M: SY='I'; M= -9,-28,-27,-35,-27, -1,-31,-27, 37,-26, 18, 16,-20,-22,-20,-24,-19,-10, 24,-21, -3,-27; /M: SY='R'; M=-14, -9,-29,-10, 1,-21,-20, -3,-25, 25,-17, -7, -3,-18, 12, 47,-10,-10,-19,-16, -9, 4; /M: SY='A'; M= 25,-10,-16,-17,-13,-19, 8,-13,-13,-13,-12, -8, -7,-14,-11,-18, 6, -1, -6,-22,-17,-13; /M: SY='T'; M= -1, -6,-15,-12,-10, -5,-16,-16, -8,-12, -9, -7, -2,-11,-10,-10, 12, 22, -2,-27, -9,-10; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='Y'; M=-16,-18,-27,-19,-18, 25,-24, 13, -4,-10, -2, -2,-16,-24,-11, -8,-16, -8,-10, 19, 58,-18; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='N'; M= -4, 0,-16, -4, -6, -7, -2, 0,-13, -7,-13, -8, 6,-14, -4, -6, 2, -2,-11,-12, -5, -5; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='S'; M= 0, 0,-21, 0, 3,-24, -1,-10,-22, -5,-23,-15, 3, -4, 4, -7, 12, 8,-18,-29,-19, 3; /M: SY='Q'; M= -4, -1,-23, -1, 2,-19,-14, -1,-14, -4,-13, -6, -2,-11, 3, -6, 0, -2,-11,-25, -8, 2; /M: SY='Q'; M= -7, -6,-22, -7, 1,-18,-17, -6,-16, 2,-14, -4, -5, -6, 8, 5, -2, -2,-15,-22, -8, 3; /M: SY='A'; M= 4, -7,-20, -9, -6,-18, -1,-12,-14, -7,-10, -6, -4,-16, -2, -5, 4, -1,-10,-26,-15, -5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='E'; M= 1, 0,-21, 0, 12,-22,-15, -8,-13, -2,-14,-10, -2, -7, 7, -6, 4, 0,-11,-24,-14, 9; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='S'; M= 8,-11,-14,-14,-11,-10, -4,-18, -6,-14, -9, -8, -7,-16,-13,-15, 10, 9, 3,-26,-14,-12; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M= -6, -7,-23,-10, -9,-11, -8, -4,-12, -4,-13, -8, -1,-19, -5, 4, 0, -2, -9,-21, -3, -9; /M: SY='L'; M= -9,-27,-23,-29,-18, 3,-28,-22, 23,-27, 34, 16,-24,-25,-18,-21,-24,-10, 12,-21, -2,-19; /M: SY='S'; M= -1, 1,-16, 2, 1,-17,-11, -9,-15, -7,-17,-13, 2,-15, -2, -7, 11, 3, -9,-30,-13, -1; /M: SY='D'; M= -7, 16,-25, 19, 11,-27, -1, -3,-27, -1,-25,-19, 14,-13, 2, -4, 5, -5,-23,-31,-18, 6; /M: SY='V'; M= -1,-29,-16,-32,-28, 2,-31,-28, 31,-23, 16, 12,-26,-26,-26,-23,-14, -4, 37,-25, -6,-28; /M: SY='S'; M= 1, 2,-18, 0, 2,-18, -7, -4,-17, -7,-18,-12, 5,-14, -1, -6, 13, 7,-11,-31,-13, 0; /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-26,-13, 5,-27,-15, 15,-21, 33, 23,-25,-25,-12,-16,-24,-10, 7,-17, -1,-13; /M: SY='D'; M= -6, 14,-25, 21, 17,-24,-10, -6,-24, -3,-19,-18, 4,-10, 2, -9, 3, -2,-19,-29,-15, 9; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='T'; M= 4,-12,-13,-15,-13, -9,-16,-18, 4,-14, -6, -3, -8,-16,-12,-14, 9, 12, 11,-28,-10,-13; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='A'; M= 35, -8,-11,-15, -9,-19, 5,-18,-12,-10,-12,-11, -7, -8, -9,-17, 10, 2, -4,-20,-19, -9; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='S'; M= -4,-11,-20,-12, -8,-14,-13, -7, -8, -8,-12, -6, -8,-17, -7, -3, 1, 1, 0,-22, -8, -9; /M: SY='P'; M= -9, -5,-31, 1, 2,-27,-13,-11,-23, -3,-26,-18, -7, 35, -5, -7, -2, -4,-23,-30,-22, -4; /M: SY='S'; M= 0, 0,-23, 0, 1,-20, 4, -2,-23, -5,-20,-14, 3,-15, -2, -5, 5, -3,-18,-23,-10, -2; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='A'; M= 4, -6,-21, -7, -4,-18, -3,-11,-17, -8,-15,-12, -4, 2, -7, -9, 3, 0,-13,-24,-16, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='T'; M= 0, 0,-16, -1, -1,-16, -9,-12,-13, -2,-13,-10, -1, -6, -3, -6, 6, 10, -8,-23,-12, -2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='G'; M= -4, -5,-26, -5, -9,-23, 18,-10,-24,-11,-17,-13, -1,-12, -9, -8, -1, -9,-20,-25,-19, -9; /M: M= 0,-10,-24,-10, -4,-18, -9, -8,-14, -5,-11, -8, -8, -2, -6, -5, -4, -5,-12,-24,-13, -7; /M: SY='P'; M= -4,-12,-27,-11, -5,-21,-15, -7,-12, -7,-17, -9, -9, 16, -4, -8, -2, -3,-13,-28,-15, -7; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='A'; M= 34,-10,-11,-17, -8,-17, -4,-17, -8, -9, -8, -8, -9,-11, -8,-15, 9, 2, 0,-21,-17, -8; D=-3; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='S'; M= 6, -8,-16,-10, -7,-11,-10, -8,-10,-10, -9, -8, -5,-10, -7,-10, 7, 7, -6,-20, -7, -8; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='W'; M= -5, -8,-29, -7, 2,-13, -9,-14,-17,-10,-12,-13,-10,-14, -5,-13, -8,-10,-18, 8, -7, -1; /M: SY='V'; M= -3,-28,-14,-29,-26, -1,-30,-27, 29,-20, 12, 14,-27,-27,-25,-20,-12, -3, 41,-28, -8,-26; /M: SY='E'; M=-10, 8,-30, 18, 57,-28,-20, -1,-28, 8,-17,-18, -1, -1, 18, -1, -1,-10,-28,-30,-19, 38; /M: SY='Q'; M=-10, -4,-25, -4, 7,-21,-21, 3,-12, 3,-10, -2, -2,-15, 14, 5, -4, -5,-12,-25, -9, 10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 35 in 25 different sequences |
| Number of true positive hits | 35 in 25 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Laminin IV type A |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
25 sequences
EPI1_CAEEL (Q21313), LAM2_CAEEL (Q18823), LAM3_CAEEL (G5ECE3), LAMA1_HUMAN (P25391), LAMA1_MOUSE (P19137), LAMA2_HUMAN (P24043), LAMA2_MOUSE (Q60675), LAMA3_HUMAN (Q16787), LAMA3_MOUSE (Q61789), LAMA5_HUMAN (O15230), LAMA5_MOUSE (Q61001), LAMA_DROME (Q00174), LAMC1_DANRE (Q1LVF0), LAMC1_DROME (P15215), LAMC1_HUMAN (P11047), LAMC1_MOUSE (P02468), LAMC1_XENTR (A0JP86), LAMC2_HORSE (Q8HZI9), LAMC2_HUMAN (Q13753), LAMC2_MOUSE (Q61092), LAMC3_HUMAN (Q9Y6N6), LAMC3_MOUSE (Q9R0B6), PGBM_HUMAN (P98160), PGBM_MOUSE (Q05793), UNC52_CAEEL (Q06561)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
4YEP; 4YEQ |