PROSITE entry PS51116
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | LAMININ_IVB |
| Accession [info] | PS51116 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51115 |
| Associated ProRule [info] | PRU00462 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Laminin IV type A domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=214; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=209; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2350960; R2=0.0123001; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-10547.4619141; R2=43.4835434; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=510; H_SCORE=11629; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=347; H_SCORE=4541; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M=-18,-23, -5,-30,-21, 34,-27,-16,-10,-14, 2, -3,-16,-29,-24, 3,-17,-10, -6, -8, 9,-21; /M: SY='A'; M= 13,-20,-22,-26,-17,-12,-21,-24, 13,-18, -1, 1,-16, 0,-15,-23, -5, -3, 10,-23,-13,-19; /M: SY='P'; M= -5, -6,-25, -5, -7, -8,-18,-11,-13,-12,-16,-12, -7, 16,-14,-16, -4, -3,-12,-25,-12,-11; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-29,-21, 6,-30,-22, 22,-27, 37, 16,-26,-27,-20,-20,-22, -3, 15,-22, -2,-21; /M: SY='D'; M=-13, 23,-24, 28, 5,-23,-15, -6,-21, -2,-12,-15, 12,-15, -4, -7, -3, -1,-18,-33,-14, 0; /M: SY='H'; M=-19, -7,-30, -7, -4, -7,-21, 63,-25, -9,-17, -3, 2,-11, 1, 2,-11,-17,-25,-24, 14, -5; /M: SY='Y'; M=-17,-15,-28,-13, -3, 11,-27, 8, -5, -6, 2, -2,-16,-23, -4, -2,-17,-10,-12, 6, 40, -7; /M: SY='V'; M= -5,-19,-19,-25,-19, -4,-29,-24, 18,-15, 11, 7,-17,-20,-17,-15, -8, 8, 19,-25, -6,-19; /M: SY='Y'; M=-19,-21,-32,-21,-18, 16,-27, 14, -7,-10, -2, -2,-19,-28, -9, -4,-22,-14,-14, 34, 51,-16; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 18, 56,-31,-20, 1,-29, 10,-20,-18, 0, -1, 24, 1, 0,-10,-30,-29,-19, 40; /M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-19,-10,-19, -2,-20,-10,-10,-10,-10, -9,-10,-10,-19, 11, 5, 0,-21,-19,-10; /M: SY='E'; M=-11, 8,-30, 17, 54,-29,-20, 0,-30, 12,-20,-19, 0, -2, 19, 6, -1,-10,-29,-29,-19, 36; /M: SY='E'; M= -8, -3,-24, 1, 7, -9,-16, -7,-13, -3,-12,-10, -7,-16, -5, -3, -4, -7, -7,-20, -2, 0; /M: SY='A'; M= 30,-12,-15,-18,-10,-19, -8,-19, -9, -7,-11, -9,-11, -3,-10,-11, 5, 1, 0,-22,-19,-11; /M: SY='N'; M= -9, 9,-21, 6, 0,-21,-12, 1,-21, 5,-22,-14, 15,-16, 3, 12, 7, 5,-16,-32,-13, 0; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='L'; M= -7, -9,-16,-11, -2, 1,-19, -5, -4,-11, 5, 0, -8,-14, -3, -8, -4, 5, -5,-16, -1, -2; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -4,-14,-12,-16,-19,-18, 25,-20,-23,-19,-10,-10, -8,-23,-18,-15, -5, -8,-16,-24,-21,-19; /M: SY='Q'; M=-10, -8,-30, -7, 6,-29,-20, 3,-15, 2,-19, -5, -4, 6, 24, 6, -2, -8,-21,-24,-12, 13; /M: SY='G'; M= 1, -8,-24,-11,-15,-22, 26,-16,-20,-15,-21,-11, -1,-10,-15,-17, 2, -9,-14,-26,-23,-15; /M: SY='L'; M= -8,-21, 0,-21,-13, -2,-23,-17, 3,-21, 14, 3,-22,-27,-17,-18,-17, -9, 5,-23, -3,-16; /M: SY='S'; M= 6, -4,-18, -3, 1,-22, -5,-13,-14, -5,-17,-11, -3,-13, -1, -9, 10, 2, -5,-29,-17, 0; /M: SY='V'; M= 1,-23,-19,-24,-19,-10,-26,-25, 14,-10, -1, 3,-22, -8,-19,-15, -9, -4, 23,-27,-12,-20; /M: SY='V'; M= -4,-20,-14,-23,-22, 0,-26,-22, 17,-20, 15, 7,-18,-27,-22,-17,-10, 4, 25,-28, -8,-22; /M: SY='E'; M= -8, -7,-28, -3, 13,-23, -1,-10,-21, -2,-13,-11, -7, -9, 2, 0, -5,-11,-17,-25,-18, 6; /M: SY='R'; M=-14, -1,-26, -2, 8,-21,-15, 0,-28, 19,-22,-14, 7,-16, 9, 44, 0, -5,-21,-26,-14, 5; /M: SY='E'; M=-11, -7,-17, -5, 14,-19,-21, -9,-18, -5,-10,-10,-10,-10, 8, -8,-11,-12,-22, -6,-10, 12; /M: SY='R'; M= -9,-14,-24,-14, -9,-12,-21, -7,-10, -3,-11, -7,-10, 0, -7, 6, -3, 2, -5,-23, -5,-11; /M: SY='T'; M= 3,-14,-20,-19,-12, -1,-19,-13, -4,-16, -4, -5,-11, 0,-14,-17, -1, 6, -4,-22, -7,-14; /M: SY='N'; M= -4, 4,-25, -2, -1,-25, -3, -3,-14, -4,-19, -8, 12,-11, 11, -5, 1, -7,-18,-27,-17, 5; /M: SY='D'; M= -7, 14,-28, 21, 5,-32, 1, -6,-30, -1,-25,-19, 5, -6, 4, -3, 1, -7,-24,-29,-19, 4; /M: SY='R'; M=-13, -1,-27, 2, 17,-24,-17, 18,-28, 10,-21,-11, 3,-13, 16, 23, 0, -8,-24,-27, -8, 14; /M: SY='T'; M= -6, -1,-23, 0, 5,-20,-18,-13,-13, -5,-14,-11, -3, 3, 0, -9, 5, 9,-12,-30,-15, 1; /M: SY='P'; M= 10,-15,-28,-15, -4,-25,-15,-17,-10, -9,-17,-10,-14, 33, -2,-17, -3, -7,-14,-24,-21, -5; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='T'; M= 2, 5,-12, 2, -3,-17,-11,-14,-17, -9,-20,-16, 6,-10, -5,-10, 26, 33, -7,-35,-15, -4; /M: SY='W'; M=-20,-37,-42,-40,-30, 28,-23,-27,-15,-23,-12,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-22,115, 30,-23; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -6,-16,-29,-13, -1,-18,-22,-19, -4,-13,-10, -8,-16, 30, -9,-18, -7, -4,-10,-28,-19, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='V'; M= 18,-20,-12,-25,-21, -8,-19,-25, 13,-16, 2, 2,-19,-20,-20,-20, -1, 4, 25,-25,-13,-21; /M: SY='R'; M=-17, -4,-28, -6, 2,-21,-18, 1,-25, 21,-18, -8, 5,-19, 14, 50, -8, -9,-21,-22,-11, 4; /M: SY='V'; M= 6,-26,-12,-28,-25, -2,-25,-25, 21,-19, 14, 11,-26,-26,-23,-19,-11, -2, 33,-26, -9,-24; /M: SY='P'; M= -7,-14,-28,-10, 0,-22,-19,-11,-12, -5,-14, -7,-11, 19, 6, -3, -3, -5,-15,-27,-17, 0; /M: SY='E'; M=-11, 10,-31, 21, 48,-31,-19, -3,-30, 6,-22,-21, -1, 11, 14, -4, -1,-10,-30,-31,-21, 30; /M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -7,-18,-29, 63,-17,-38,-18,-30,-20, 6,-20,-18,-18, 1,-18,-30,-22,-29,-18; /M: SY='A'; M= 17, -4,-16, -9, -1,-23, 0,-13,-18, -7,-17,-12, -2,-11, 3,-11, 13, 7,-11,-25,-18, 1; /M: M= -8,-14,-26,-16, -7, -7, -5,-16, -5,-15, -8, -6,-11,-18,-12,-16, -7, -6, -5, -8, -3,-11; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-31,-23, 7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 19,-22, -2,-23; /M: SY='E'; M= -9, -1,-24, 1, 20,-21,-21, -7,-21, 12,-16,-12, -3,-10, 7, 15, 0, 2,-14,-27,-14, 12; /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 71,-30,-21, 3,-29, 10, 1,-21,-30,-39,-20,-19, -9, 6, 5, 25,-30; /M: SY='T'; M= 0, -3,-19,-10, -8, -8,-15, -7,-10,-12, -7, -7, 2, -8, -7,-11, 3, 9,-10,-26, -9, -8; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='V'; M= -3,-27,-15,-30,-27, 0,-30,-27, 33,-21, 12, 12,-23,-23,-23,-21,-12, -3, 38,-23, -6,-27; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M= -4, 17,-22, 16, 1,-25, 0, -6,-24, -6,-27,-21, 19, -2, -4,-10, 11, 3,-22,-35,-21, -2; /M: SY='N'; M= -9, 29,-21, 22, 2,-22, -6, 2,-18, -4,-24,-15, 35,-16, -1, -6, 8, -1,-21,-38,-18, 0; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-37,-29, 5,-36,-29, 40,-28, 20, 17,-23,-24,-23,-26,-19, -8, 31,-21, -1,-29; /M: SY='P'; M=-10,-15,-38, -6, 9,-31,-20,-15,-21, -6,-28,-18,-16, 71, 0,-15, -8,-10,-30,-29,-27, 0; /M: SY='R'; M=-10,-15,-24,-18,-10, 5,-23, -6,-10, 5, -8, -3,-11,-21, -4, 12,-11, -8, -6, -8, 11, -8; /M: SY='S'; M= 11, -5,-16, -7, -5,-20, 0,-15,-19,-11,-24,-17, 1, 1, -6,-14, 23, 15,-11,-32,-20, -6; /M: SY='M'; M= -9,-20,-20,-27,-17, -4,-22, -4, 17,-11, 17, 44,-20,-21, 2,-10,-17, -9, 10,-21, -2, -8; /M: SY='D'; M=-14, 26,-30, 37, 26,-34,-14, -2,-33, 8,-27,-23, 12, 0, 6, -3, -1, -9,-29,-34,-20, 16; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 15, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21; /M: SY='D'; M=-15, 35,-26, 42, 11,-27,-12, 1,-29, -2,-25,-23, 20,-13, -1, -8, 2, -1,-25,-32,-10, 5; /M: SY='I'; M= -2,-28,-19,-33,-26, 1,-31,-27, 31,-25, 21, 14,-25,-25,-22,-23,-17, -6, 29,-23, -5,-26; /M: SY='I'; M= 0,-26,-19,-31,-24, 0,-28,-22, 27,-22, 20, 19,-24,-24,-19,-21,-16, -6, 24,-23, -5,-23; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29, 1,-37,-29, 42,-28, 23, 18,-23,-23,-22,-27,-20, -8, 31,-22, -2,-29; /M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9, 0,-20,-20, 12,-30, 25,-20, -9, 1,-20, 10, 61,-10,-11,-21,-21, -6, 0; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-31,-20,-19, 21,-28, 23, -4,-12, -1, -1,-19,-29, -9,-10,-21,-13,-13, 31, 64,-18; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 22, 49,-33,-19, 2,-29, 9,-21,-18, 2, -3, 25, 1, 0,-10,-30,-29,-18, 37; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M= 0,-15,-30,-10, -2,-26,-16,-19,-18,-10,-25,-18,-14, 58, -9,-18, 0, 1,-21,-30,-26, -9; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-28, -2, 16,-32,-21, 4,-19, 8,-15, -3, -2,-11, 41, 13, -1, -5,-24,-22,-10, 28; /M: SY='V'; M= -4,-11,-16,-10,-13, -8,-19,-10, 4,-16, 4, 5,-12,-22,-13,-15, -3, -1, 11,-30, -9,-13; /M: SY='P'; M= -4,-13,-31, -9, -1,-26,-17,-16,-20, -1,-26,-17,-11, 47, -5, -6, -1, -1,-22,-29,-23, -6; /M: SY='D'; M= -3, 4,-25, 9, 7,-20, 6,-12,-24, -8,-18,-16, -2,-14, -8,-13, -1,-10,-16,-26,-18, 0; /M: SY='D'; M=-12, 16,-28, 20, 9,-30, -5, 5,-27, -3,-23,-13, 9, -7, 9, -6, 0, -6,-25,-30,-15, 9; /M: SY='W'; M=-18,-37,-47,-37,-28, 8,-19,-29,-20,-19,-21,-20,-37,-29,-19,-19,-35,-27,-29,137, 27,-19; /M: SY='E'; M= 0, 3,-25, 7, 34,-26,-17, -8,-24, 5,-18,-17, -3, 3, 9, -4, 3, 0,-21,-28,-19, 21; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='N'; M= -3, 11,-20, 7, 14,-22,-11, -2,-17, 4,-19,-12, 15,-11, 8, 0, 4, -1,-17,-28,-15, 11; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= 4,-25,-16,-28,-22, -3,-26,-24, 22,-20, 15, 10,-24,-24,-18,-20,-12, -4, 26,-24, -8,-21; /M: SY='Q'; M=-10,-14,-24,-15, 0, -9,-26,-11, -1, -2, -4, 1,-12,-18, 4, 3, -9, -8, 1,-21, -6, 1; /M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-24, 0,-29,-21, 30,-23, 18, 22,-21,-23,-17,-21,-14, -5, 24,-24, -4,-22; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='T'; M= -4, -4,-17, -8, -9,-12,-21,-16, 0, -8, -6, -2, -5,-13, -6,-10, 5, 18, 4,-27, -9, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='V'; M= -3,-28,-13,-29,-26, 2,-29,-26, 27,-22, 19, 12,-28,-28,-26,-19,-14, -3, 37,-26, -7,-26; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='I'; M= -7,-13,-21,-16, -8,-11,-24,-12, 13,-11, 3, 6, -9,-17, 1,-11, -8, -6, 9,-21, -7, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='R'; M=-17, -9,-26, -9, 0,-18,-17, -1,-25, 23,-18, -9, -1,-10, 7, 54, -9, -9,-18,-18,-10, -1; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='P'; M= -9,-17,-34, -9, 0,-26,-17,-17,-17, -9,-26,-17,-17, 77, -9,-17, -9, -9,-26,-26,-26, -9; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='G'; M= -4, 0,-21, 2, -1,-22, 25, -9,-27, -5,-20,-15, 2,-12, -6, -3, 1,-10,-20,-19,-18, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18; /M: SY='P'; M= -7, -7,-24, -2, 6,-21,-17,-10,-12, -1,-16,-10,-10, 23, 1, -5, -5, -7,-12,-23,-16, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='V'; M= 2,-22,-15,-26,-22, 0,-24,-20, 23,-17, 8, 8,-20,-21,-19,-18, -9, -3, 27,-17, 0,-22; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='D'; M= -8, 16,-23, 23, 13,-26,-10, -5,-24, -2,-23,-20, 8, 9, 0, -8, 6, -1,-21,-31,-18, 6; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='A'; M= 10,-10,-23,-11, -6,-24, 4,-16,-21, -7,-21,-14, -7, 10, -5, -9, 5, -2,-17,-25,-22, -7; /M: SY='S'; M= -4, 3,-22, 7, 10,-23,-12, 6,-19, -7,-23,-15, 5, -5, 3, -9, 14, 2,-16,-35,-13, 5; /M: SY='G'; M= 3, -5,-22, -4, -7,-25, 34,-15,-30,-14,-28,-19, 4,-15,-10,-15, 16, -1,-21,-28,-25, -8; /M: SY='P'; M= -9,-13,-30,-10, -6,-18, -5, -2,-22, -9,-21,-13, -7, 21, -7, -5, -3, -8,-22,-26,-15, -9; /M: SY='C'; M= -9,-16,100,-24,-21,-21,-27,-26,-29,-26,-21,-20,-17,-35,-24,-26, -6, -8,-12,-48,-29,-22; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='G'; M= 12, -4,-22, -5, -8,-24, 23,-16,-22,-13,-19,-14, -2,-14,-11,-17, 4, -9,-15,-22,-22,-10; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M=-13, 22,-25, 19, 12,-24,-10, 22,-25, -1,-25,-16, 27, -7, 5, -2, 1, -7,-28,-34,-12, 7; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='T'; M= 7,-11, -7,-16,-11,-12,-17,-18, -7, -7, -4, -6, -9,-17,-10, -6, 4, 12, 1,-27,-13,-11; /M: SY='I'; M= -4,-20,-11,-25,-18, -9,-27,-13, 10,-20, 3, 5,-16, -9,-15,-20,-10, -2, 8,-27, -8,-19; /M: SY='P'; M= -4,-19,-35,-12, -3,-25,-19,-20,-16,-11,-22,-16,-19, 68,-11,-19, -8, -6,-23,-28,-26,-11; /M: SY='D'; M= 2, 10,-21, 11, 4,-24, -9, -5,-23, 5,-24,-16, 8,-12, 4, 0, 8, -1,-17,-27,-12, 3; /M: SY='D'; M=-15, 34,-26, 46, 11,-28,-12, -2,-31, -3,-25,-24, 13,-12, -2,-10, 4, 0,-23,-33,-10, 4; /M: SY='D'; M=-15, 30,-28, 44, 19,-34,-13, -2,-32, 2,-24,-22, 12,-10, 6, -5, 1, -7,-25,-35,-17, 13; /M: SY='R'; M= -9, -2,-23, -5, 2,-12,-15, -4,-20, 2,-19,-11, 5, -9, 7, 11, 4, 2,-18,-24,-10, 3; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-26, -3, 4,-19,-21, -6, -5, -3, -4, 1, -2,-15, 11, -4, -7, -7,-11,-25,-10, 7; /M: SY='V'; M= -5,-14,-21,-18,-11,-13,-24,-15, 8, -5, -3, 7,-11,-17, -1, -8, -3, 1, 9,-25, -8, -7; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M= 2,-20,-16,-26,-23, 14,-10,-23, -1,-20, -2, -3,-15,-23,-25,-19, -4, 1, 9,-15, -3,-23; /M: SY='S'; M= 5, -7,-14,-12, -8, -7,-11,-12,-12, -7,-14, -6, -1,-14, -6, -3, 15, 15, -5,-27,-10, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='P'; M= -8,-11,-28, -7, -2,-17,-17, 11,-17,-10,-20,-11, -6, 18, -1,-11, 1, -4,-20,-24, -3, -5; /M: SY='P'; M= 3, -8,-30, -2, 5,-28,-14,-16,-20, -7,-25,-19,-11, 48, -6,-17, -1, -6,-23,-29,-26, -3; /M: SY='G'; M= 0, 0,-25, -1, -9,-21, 21, -3,-28, -9,-24,-16, 6,-18, -9, -7, 2,-10,-22,-21,-12,-10; /M: SY='S'; M= 9, -1,-13, -4, 0,-19, -1,-14,-19, -9,-22,-16, 4,-10, -4,-11, 25, 20,-10,-33,-18, -2; /M: SY='R'; M=-18, -9,-28,-10, -1,-19,-20, -2,-28, 27,-19,-10, 0,-19, 8, 63, -7, -5,-18,-21,-10, -1; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-23,-17,-13, 5,-24, 4, 1,-12, -5, -1,-11,-21, -5,-11, -3, 1, -3, -5, 27,-12; /M: SY='V'; M= 5,-25,-15,-29,-24, -2,-25,-23, 23,-20, 15, 15,-24,-24,-20,-20,-12, -4, 29,-24, -8,-23; /M: SY='V'; M= -5,-22,-19,-22,-14, -6,-28,-24, 17,-17, 8, 5,-22,-13,-18,-18,-10, 0, 22,-27,-10,-17; /M: SY='L'; M= 1,-27,-16,-30,-22, 12,-25,-23, 15,-24, 24, 9,-25,-27,-24,-20,-17, -6, 17,-18, -2,-22; /M: SY='P'; M= -9,-12,-32, -5, 1,-24,-19,-14,-15,-10,-15,-12,-13, 40, -2,-15, -7, -7,-21,-29,-21, -3; /M: SY='R'; M=-12, -2,-27, -5, -2,-19,-17, 3,-19, 2,-17,-10, 6, 4, 1, 12, -4, -2,-20,-28,-13, -3; /M: SY='P'; M= -4,-10,-35, -2, 6,-30,-17,-17,-21, -7,-27,-20,-14, 62, -7,-17, -6, -9,-27,-30,-27, -4; /M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30, 0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 18,-30,-20, 18,-30, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10, 9,-16, 4,-21; /M: SY='E'; M= -8, 9,-28, 18, 55,-29,-18, -1,-29, 8,-21,-20, 1, -1, 18, -1, 3, -7,-28,-31,-20, 37; /M: SY='P'; M= 2, -5,-27, -2, 3,-26,-13,-14,-21, 0,-23,-17, -7, 25, -3, -4, 1, -2,-19,-28,-21, -3; /M: SY='G'; M= -2, -3,-30, 0,-15,-31, 60,-18,-40,-18,-30,-21, 2,-19,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-16; /M: SY='V'; M= -6,-13,-20,-17,-12,-11,-25,-17, 7, 0, -1, 5,-11,-21, -8, -4,-10, -4, 12,-25, -9,-11; /M: SY='Q'; M= -4, 9,-20, 6, 5,-26,-12, -2,-17, -2,-22,-11, 12,-13, 16, -3, 12, 5,-16,-32,-15, 10; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='K'; M= -6, 1,-22, 0, 8,-22,-18, -2,-23, 16,-23,-12, 2,-10, 4, 8, 6, 9,-15,-27,-10, 6; /M: SY='I'; M= -9,-30,-19,-34,-27, 17,-32,-25, 26,-27, 25, 14,-26,-28,-26,-22,-20, -7, 25,-18, 2,-27; /M: SY='R'; M=-18, 3,-30, 6, 3,-24,-20, 1,-25, 19,-20,-11, 3,-16, 5, 35, -9,-11,-18,-25,-10, 1; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-25, 5,-33,-25, 32,-28, 31, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 25,-22, -2,-25; /M: SY='E'; M= -7, -2,-23, -2, 8,-13,-18, -1,-17, 4,-17,-10, -2,-12, 8, 0, 5, 6,-15,-17, 5, 7; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 58,-30,-20, 6,-30, 23, 6,-23,-30,-34,-20,-23,-10, 3, 1, 21,-27; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='P'; M= -2, -1,-11, -3, -3, -9, -7, -6, -4, -5,-10, -6, 3, 5, -4, -7, 4, 3, -5,-17,-10, -5; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -8, 0,-27, 2, 18,-29, -9, 0,-25, 11,-22,-10, 1,-10, 25, 13, 1, -8,-24,-23,-14, 21; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M=-10, -6,-18, -6, 0, -9,-14, -1,-14, 17,-10, -4, -3,-12, 3, 26, -8, -6,-10, -9, 1, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='Y'; M=-12, -9,-27,-10, -5,-10,-17, 6,-17, 1,-16, -8, -6, -5, 1, 3, -5, 1,-17,-12, 10, -5; /M: SY='S'; M= -3, -4,-16, -2, -2,-21, 1,-14,-22,-10,-16,-14, -3, -8, -7, -8, 3, -3,-17,-29,-19, -6; /M: SY='S'; M= 3, 0,-23, -3, -3,-26, 10, 0,-24, -9,-26,-15, 8, -6, 2,-10, 11, -3,-22,-29,-19, -2; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -8, 0,-26, 4, 5,-18, 2, -4,-25, -3,-19,-15, 0,-16, -2, 0, 1, -7,-21,-20, -6, 0; /M: SY='D'; M= 0, 8,-21, 10, 10,-24,-13, 4,-20, -4,-19,-13, 5,-12, 3, -8, 7, 1,-14,-31,-13, 6; /M: SY='D'; M=-13, 14,-30, 23, 10,-30,-14, 2,-27, -1,-26,-18, 4, 8, 7, -5, 1, -7,-26,-30,-13, 7; /M: SY='H'; M= -9, -4,-24, -4, -4,-20,-19, 17,-11, -9,-16, -5, -1, -5, 0, -8, -2, -7, -8,-31, -7, -4; /M: SY='P'; M= 0, -5,-28, 1, 20,-28,-15,-11,-22, -2,-24,-18, -7, 30, 5,-11, 3, -5,-24,-30,-23, 10; /M: SY='T'; M= -1, -2,-16, -5, -5,-17, -9, 1,-20, -6,-20,-13, 5,-13, -2, 0, 19, 21,-11,-32,-11, -5; /M: SY='A'; M= 24,-10,-18,-12, -5,-23, -5,-18,-15,-10,-20,-15, -8, 17, -8,-18, 12, 2,-11,-28,-23, -8; /M: SY='Y'; M= -4, -9,-21,-12, -8, 1,-17, 11,-13, -8,-12, -6, -5,-19, -1, -5, 2, 1,-12,-10, 17, -6; /M: SY='I'; M= 3,-18,-18,-25,-20, -7,-24,-24, 19,-20, 2, 4,-13,-17,-16,-21, 1, 8, 19,-26, -9,-20; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 13,-30,-20, 19,-30, 48, 19,-30,-30,-21,-20,-30,-10, 10,-19, 1,-20; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30, 0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='V'; M= 3,-23,-15,-24,-24, -7, -9,-26, 10,-19, 4, 3,-21,-25,-24,-19, -6, -1, 24,-26,-13,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='I'; M= -2,-23,-23,-30,-20, -5,-27,-17, 25,-19, 17, 24,-18,-19, -8,-19,-16, -9, 14,-20, -4,-16; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M=-17, -9,-31, -8, 2,-14,-22, 14,-22, 12,-18, -7, -5, -8, 10, 24,-10,-11,-22,-13, 9, 2; /M: SY='V'; M= -7,-23, 12,-28,-25, -5,-31,-24, 10,-22, -1, 0,-20,-18,-22,-23,-10, -2, 14,-27, -6,-26; /M: SY='E'; M= -7, 7,-24, 8, 16,-23,-15, -5,-21, 9,-17,-13, 6,-11, 7, 3, 3, -3,-19,-30,-15, 12; /M: SY='S'; M= 4, -3,-15, -4, -1,-17,-11,-12, -7,-10,-16, -9, 1,-14, -5,-12, 17, 7, 0,-34,-16, -3; /M: SY='L'; M= -8,-25,-19,-28,-20, 5,-28,-20, 19,-25, 33, 18,-24,-25,-18,-18,-19, 0, 13,-22, -2,-19; /M: SY='E'; M=-14, 11,-33, 23, 25,-32,-17, 4,-30, -1,-26,-21, 1, 22, 4, -9, -4,-11,-30,-33,-19, 12; /M: SY='I'; M=-11,-15,-25,-27,-22, 3,-27,-15, 26,-20, 12, 20, -6,-21,-14,-19,-15, -8, 12,-21, -1,-20; /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29, 74,-29,-18, 2,-28, 11, 5,-20,-29,-37,-19,-20,-10, 1, 8, 28,-28; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='Q'; M= -4, -4, -9, -7, 1,-17,-15, -5, -6, -3, -9, -2, -2, -9, 15, -3, 3, 6, -8,-18, -7, 7; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -4, 4,-22, 8, -7,-24, 36,-11,-30,-11,-22,-17, 4,-13,-11,-13, 0,-13,-22,-19,-20, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='G'; M= -1, 7,-17, 9, -3,-21, 19, -8,-24, -8,-22,-16, 8,-11, -6,-10, 10, -2,-17,-24,-18, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='A'; M= 7,-10,-16,-10, -8,-13, -7, -8, -4,-11, -6, -5,-11, -6,-11,-14, -3, -5, 2,-22,-12,-11; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='A'; M= 8,-17, 8,-21,-15,-15,-19,-14, -6,-12, -5, -4,-15,-23,-11,-10, -5, -5, 5,-28,-14,-14; /M: SY='A'; M= 22, -1,-12, -9, -6,-19, -6,-14,-13, -8,-16,-13, 3,-11, -4,-12, 18, 16, -6,-28,-17, -5; /M: SY='N'; M=-11, 12,-25, 8, 11,-21,-15, 0,-15, 3,-13, -7, 15,-15, 9, 0, -3, -7,-20,-30,-14, 9; /M: SY='Q'; M= -3, -6,-22, -6, 6,-22,-13, -8,-11, -4,-13, -6, -3,-13, 12, -5, 7, 0,-10,-28,-14, 8; /M: SY='R'; M= -3, 0,-25, -1, -2,-19,-14, 15,-24, 6,-18,-10, 3,-17, 2, 19, -4, -9,-18,-21, -2, -3; /M: SY='W'; M=-16,-22,-33,-22,-12, -5,-23, -7,-13, -3, -2, -3,-19,-24, -5, 7,-24,-16,-16, 28, 6, -8; /M: SY='E'; M= -6, 9,-24, 13, 23,-27,-16, -5,-26, 7,-21,-16, 3, -7, 11, 3, 5, 3,-20,-29,-16, 16; /M: SY='E'; M= -7, 8,-21, 8, 20,-22,-18, -7,-19, 0,-15,-11, 3, -7, 8, -5, 8, 15,-16,-30,-14, 14; /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26, 62,-30, -6, 0,-23, 6, 0,-20,-30,-29,-16,-20,-10, -4, 17, 48,-26; /M: SY='Q'; M= -9, 5,-27, 7, 29,-31,-19, 3,-20, 7,-19, -8, 4, -9, 33, 3, 0, -8,-24,-26,-15, 31; /M: SY='R'; M=-16, -6,-28, -8, 1,-19,-20, -2,-23, 22,-14, -7, 1,-19, 10, 46,-10, -9,-18,-22,-10, 2; /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-19,-18, 23,-29, 26, -2,-12, 2, 2,-18,-29, -9,-10,-20,-11,-11, 20, 68,-18; /M: SY='R'; M=-14, 1,-28, -2, 3,-25,-10, 3,-27, 16,-23,-10, 11,-18, 17, 37, -3, -9,-25,-24,-13, 7; /M: SY='C'; M= -9,-21,110,-30,-30,-18,-30,-30,-25,-29,-18,-18,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -5,-48,-28,-30; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='L'; M= -7,-15,-20,-17,-14, -5,-22, 3, 5,-13, 10, 6,-10,-23,-11, -5,-13, -8, 5,-24, -2,-14; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -3, 4,-26, 8, 35,-27,-17, -4,-26, 10,-19,-16, -1, -5, 14, 5, 3, -3,-22,-27,-17, 24; /M: SY='N'; M=-11, 2,-24, -3, -1,-10,-18, 9, -7, -9, -6, -4, 10,-19, -2, -5, -5, -6,-13,-26, -1, -3; /M: SY='S'; M= 12, -6,-14, -8, -7,-13, 5,-11,-18,-12,-22,-16, 2,-14, -7,-13, 22, 8,-10,-26,-11, -7; /M: SY='R'; M= -9,-10,-22, -9, -6,-13,-17, -6, -8, -7, 1, -1, -8,-20, -2, 4, -6, -2, -6,-26, -8, -5; /M: SY='S'; M= 7, -9,-15,-12, -9,-11,-12,-10, -4,-11, -8, -2, -5,-17, -3,-12, 10, 6, 0,-26, -7, -6; /M: SY='V'; M= -3,-14,-20,-15,-16, -6,-22,-15, 8,-14, 2, 5,-15,-11,-16,-16,-10, -5, 12,-24, -6,-17; /M: SY='V'; M= -5,-21,-19,-24,-22, 3, -9,-18, 6,-20, 2, 5,-16,-24,-20,-18, -7, -5, 11,-19, -2,-22; /M: SY='K'; M=-10, -4,-30, -6, 1,-24,-14,-12,-21, 23,-22, -9, -1, -3, 1, 15,-10,-10,-17,-23,-13, 0; /M: SY='T'; M= 0, -1,-19, -4, -3,-16,-17, -9,-10, -8, -9, -7, -3,-13, 3, -9, 6, 13, -8,-23, -5, -1; /M: SY='P'; M= -3,-10,-28, -8, -2,-24,-17,-15,-14, -4,-22,-13, -8, 32, -2,-11, -1, -2,-15,-29,-21, -4; /M: SY='M'; M= -5,-20,-20,-24,-16, 3,-21,-13, 6,-14, 14, 16,-18,-17,-11, -7,-13, -4, 4,-20, -4,-14; /M: SY='P'; M= -3, -1,-23, -3, -5,-18,-14,-15,-18, -9,-22,-17, 0, 13, -8,-13, 7, 13,-16,-18,-15, -7; /M: SY='E'; M=-12, 15,-30, 25, 29,-30, -8, -4,-29, 1,-22,-17, 3, 0, 6, -7, -2,-11,-27,-31,-20, 17; /M: SY='V'; M= 8,-17,-16,-19,-12,-12,-20,-22, 7,-10, -4, -1,-16,-14,-15,-15, -1, 1, 17,-27,-14,-14; /M: SY='C'; M= -9,-21,110,-30,-30,-18,-30,-30,-25,-29,-18,-18,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -5,-48,-28,-30; /M: SY='R'; M= -5, -2,-26, 0, 18,-25,-17, -5,-24, 18,-21,-12, -1,-10, 12, 20, 0, -6,-18,-25,-14, 14; /M: SY='N'; M=-13, 12,-27, 8, 1,-23, -9, -1,-24, 9,-24,-12, 17, -5, 1, 15, -3, -7,-24,-30,-17, -1; /M: SY='L'; M=-13,-27,-25,-29,-22, 13,-32,-11, 21,-25, 31, 15,-25,-28,-17,-19,-25,-10, 9, -7, 21,-22; /M: SY='I'; M=-11,-22,-26,-25,-22, -2,-33,-15, 28,-25, 20, 14,-18,-23,-17,-23,-19,-10, 18,-23, -1,-22; /M: SY='F'; M=-13,-15,-11,-23,-20, 12,-20, -5, -2,-18, -4, -2, -7,-24,-19,-15,-12, -9, -4,-18, 3,-20; /M: SY='S'; M= 6, -4,-14, -5, -3,-19, -6,-13,-14,-11,-25,-16, 4, -1, -3,-12, 29, 17, -8,-37,-19, -4; /M: SY='I'; M= -6,-22,-21,-29,-23, -1,-27,-18, 27,-21, 18, 23,-17,-23,-15,-19,-16, -7, 20,-23, -4,-21; /M: SY='S'; M= 12, -2,-12, -3, -1,-20, -2,-10,-20, -7,-27,-18, 7,-11, 0, -5, 33, 16,-10,-36,-19, -1; /M: SY='A'; M= 33,-14,-11,-22,-14, -9, -8,-21, -4,-13, -6, -7,-12,-15,-15,-19, 6, 2, 7,-20,-14,-14; /M: SY='L'; M= -6,-24,-21,-27,-18, 14,-26,-17, 9,-18, 23, 9,-22,-25,-18,-14,-20, -9, 5,-12, 7,-18; /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-31,-23, 3,-32,-23, 26,-24, 31, 17,-25,-26,-19,-16,-23, -9, 18,-21, -2,-23; /M: SY='H'; M=-16, -2,-27, -4, -4,-11,-19, 63,-20,-11,-12, -1, 6,-21, 3, -4, -8,-13,-22,-23, 19, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of true positive hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Laminin IV type B |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
8 sequences
LAMB1_DROME (P11046), LAMB1_HUMAN (P07942), LAMB1_MOUSE (P02469), LAMB2_HUMAN (P55268), LAMB2_MOUSE (Q61292), LAMB2_RAT (P15800), LAMB4_DANRE (Q8JHV6), LAMB4_HUMAN (A4D0S4)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
5LF2 |