PROSITE entry PS51121
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NTA |
| Accession [info] | PS51121 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2005 CREATED;
27-MAR-2024 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51121 |
| Associated ProRule [info] | PRU00443 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NtA (N-terminal agrin) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.7146934; R2=0.0087665; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1223; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=938; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M=-25,-19,123,-25, 5,-23,-35,-40,-19,-22, -1,-13,-13,-26,-11, -2,-18,-20,-16,-16,-42, -1; /M: SY='P'; M= -6,-18,-28,-13, 6,-32,-11, 5,-18, 11,-20,-21,-22, 74, -3, -9,-10, -1,-27,-29,-17, -3; /M: SY='E'; M= 1, 1, -1, 7, 31,-28,-17, -6,-14, 8, -3, -7, -6, -1, 7,-14, 2, -7,-15,-19,-13, 24; /M: SY='R'; M= -6,-12,-19, -7,-12, -9,-17,-13, -9, 0, -6, 0,-12,-14, 11, 37, -6,-15, 0,-14, -1, -7; /M: SY='E'; M= 7, 1,-10, 7, 22,-18,-14, -9,-16, 5, -5, -7, -6, -5, 12, -7, 2, -6,-14,-21,-14, 18; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='L'; M= -9,-14,-10,-20,-16, 15,-19, -3, 27,-20, 30, 15,-14,-28,-19,-21,-16, -2, 15,-23, 17,-16; /M: SY='Q'; M= 0, -9,-17, -6, 21,-25,-19, 9,-20, 6,-13, -3,-12, 10, 34, 11, -8, -8,-25,-17, -8, 25; /M: SY='R'; M= -2,-12,-14, -4, 11,-19,-17, -6,-26, 9,-18, -6,-14, -4, 31, 41, -1,-16,-17, -8, -8, 16; /M: SY='R'; M= -9,-18,-17,-13,-12, -4,-19,-11,-14, 3, -7, 4,-18,-15, 18, 54,-12,-23, -2, -6, 4, -4; /M: SY='E'; M= 5, -5, -7, -3, 29,-19,-16, -7,-14, 14, -5, 1, -6, -3, 8, -9, -1,-12,-14,-18,-17, 22; /M: SY='E'; M= 1, 2, 0, 1, 28,-24,-17, -3,-10, 10, -3, 1, 5, -8, 5,-12, -4, -9,-15,-24,-17, 23; /M: SY='E'; M= 1, 5, -2, 11, 29,-25,-14, -5,-18, 7, -6, -8, -1, -4, 8,-10, 3, -7,-20,-22,-14, 23; /M: SY='A'; M= 29, 7,-25, 2, -2,-17, 0,-17, -2, 0,-13, 4, 13,-13, 4,-12, 13, 12, 2,-50,-37, -3; /M: SY='N'; M= 1, 32,-16, 29, 4,-24, -6,-12,-15, 3,-17,-10, 41,-17, -3,-12, 2, 2,-21,-49,-26, 1; /M: SY='V'; M= 6,-20,-20,-24,-30, 14,-26,-27, 40,-19, 14, 2,-16,-38,-28,-14,-10, 6, 44,-27, 9,-30; /M: SY='I'; M= 7,-20,-20,-27,-30, 7,-23,-27, 47,-20, 13, 3,-13,-37,-27,-17,-10, 7, 47,-30, 3,-30; /M: SY='F'; M= -6,-14,-10,-18,-16, 31,-21,-16, 16,-16, 29, 10,-16,-31,-20,-16,-15, -2, 13,-18, 22,-16; /M: SY='T'; M= 12, -1,-21,-11,-18,-18,-16,-19, 4, -9, -1, 0, 8, -4, -1,-27, 18, 41, 11,-47,-13,-11; /M: SY='G'; M= 3, 0,-39, -9,-19,-29, 74,-29, -9, -9,-19,-18, 0,-10,-18,-19, 1,-18,-27, 6,-31,-19; /M: SY='T'; M= 0, -8,-25,-13,-16, -8,-21,-14, 3,-11, 8, 0, -3, -8, 3,-19, 5, 28, 9,-26, 9, -9; /M: SY='V'; M= 8,-17,-20,-22,-28, 3,-25,-27, 37,-18, 10, 2,-12,-32,-23,-17, -5, 15, 42,-33, 3,-27; /M: SY='E'; M= 0, 2, -2, 11, 31,-29,-17, -6,-22, 9, -6, -8, -7, 0, 10, -6, 3, -8,-19,-18,-12, 26; /M: SY='E'; M= 6, -3, -9, 2, 30,-30, -7, -9,-22, 14,-13, -4, -8, 2, 19, 3, 0,-14,-21,-15,-21, 27; /M: SY='I'; M= 3,-16,-20,-33,-28, -3,-13,-21, 48,-18, 16, 7, 0,-25,-17,-29, -5, 10, 35,-34, -9,-26; /M: SY='M'; M= -9,-20,-31,-18,-11, -2,-22, 18, -1, 2, 16, 23,-15,-24, -7, 2,-13, -5, -1, -8, 21,-11; /M: SY='N'; M= -4, 13,-21, 2, -1,-11, -8, -9,-11, 8,-17, -1, 32, -7, 4, 0, -4, 0,-19,-37,-16, -1; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='V'; M= 2,-17,-16,-15,-17, 5,-17,-23, 16,-12, 3, 0,-19,-26,-14, -1, -9, -1, 23, -2, 8,-16; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='D'; M= 1, 27,-19, 49, 3,-27, -8,-14,-19, -2, -5,-17, 4, -9, -8, -6, -1, -5, -7,-25, -5, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='P'; M= -3, -4,-26, 3, 6,-30, -6, 0,-23, 6,-25,-31,-10, 56, -4,-11, 5, 5,-29,-34,-21, -4; /M: SY='V'; M= 2,-12,-20,-13,-15, 0,-22,-12, 17,-10, 1, -1, -8,-26,-14, -4, -5, 2, 21,-26, 2,-16; /M: SY='H'; M= -4, -7,-29,-10, 0,-20,-19, 48,-12,-10, -9, 4, -1, -3, 11, -6, 2, 1,-19,-38, -7, 3; /M: SY='H'; M=-18,-15,-43, -7, -5,-16,-25, 65,-21,-10, -6, 4,-15, -2, 2, 8, -7,-17,-17,-21, 14, -4; /M: SY='T'; M= 10, -5,-22,-13,-17,-17,-17,-18, 6, -9, -1, -2, 2, 3, -4,-24, 11, 34, 12,-45,-12,-12; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-37,-27,-54, -8,-13, 24,-29, 0,-12, -7, 27,-10,-37,-17, -7, -1,-18,-11, 7, 45, 81,-14; /M: SY='S'; M= 7, -2,-19, -3, -7, -7, -7,-13, -3, -2,-15,-13, 2,-16, -9, -2, 24, 13, -1,-30,-15,-12; /M: SY='C'; M= 0,-12, 69,-19, 1,-24,-17,-35, -5,-17, -3, -6, -5,-22, -9,-17, -7, -7, -4,-31,-47, -3; /M: SY='K'; M= 0, 0,-24, -9, 2, -2,-12,-18, -6, 16,-11, 8, 11, -6, 1, -2, -1, -1,-10,-27,-11, 0; /M: SY='V'; M= 5,-22,-22,-25,-32, 24,-30,-30, 34,-18, 12, -3,-18,-40,-30,-10,-10, 5, 44,-24, 13,-32; /M: SY='R'; M=-10,-19,-20,-14, -9, -4,-16,-17,-13, 5,-10, 2,-20,-14, 10, 40,-11,-21, -3, 9, 5, -5; /M: SY='I'; M= 3,-19,-20,-21,-22, 1,-22,-20, 31,-15, 8, -3,-18,-14,-23,-14,-11, 6, 30,-29, 4,-23; /M: SY='W'; M=-26,-31,-21,-27,-10, 9, -6,-29,-15, -6, -9,-13,-37,-13, -5, 8,-18,-28,-14, 76, 23,-10; /M: SY='R'; M= -8,-14,-19, -8, -9,-10,-17,-10,-26, 8,-20, -2,-11,-11, 24, 65, -5,-23,-11, -8, -5, -2; /M: SY='Y'; M=-15,-19,-37,-14,-23, 11,-22,-14, 19,-14, 20, -3,-20,-26,-17,-12,-13, -3, 25, 3, 36,-24; /M: SY='L'; M=-12,-14, -8,-14,-13, 25,-22, -9, 15,-16, 37, 17,-20,-30,-19,-17,-19, -2, 9,-12, 33,-13; /M: SY='K'; M= -2, -4,-32, -4, 17,-15,-14, 8,-20, 27,-18, 18, -2, 9, 6, 8, -2,-11,-22,-24, -8, 11; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='K'; M= -1, -2,-23, 3, 22,-20,-13,-13,-24, 28,-19, 5, -6, 14, 11, 12, -2,-12,-23,-18,-11, 16; /M: SY='D'; M= -2, 20,-21, 44, 14,-37,-13,-12,-33, 6,-14,-21, -2, 2, 3, 5, 1,-12,-21,-26,-12, 8; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -8,-14,-25,-21,-15, -4,-17, 12, 17,-13, 8, 8, -3,-18, -3, -7,-11, -6, 7,-25, 3,-12; /M: SY='V'; M= 3,-15,-13,-15,-21, 12,-24,-22, 29,-18, 17, 5,-18,-34,-25,-13, -9, 8, 31,-27, 14,-22; /M: SY='T'; M= 8, -4,-15, -9, -6,-14,-16,-15, 4, -8, 4, 3, -1, -8, 3,-19, 7, 22, 5,-36, -8, -2; /M: SY='H'; M=-10, 1,-28, 9, 16,-34,-21, 61,-25, -4,-11, 2, 0, 3, 4, -7, -5,-16,-27,-38,-10, 12; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= 1, 1, -9, 9, 27,-29,-13, 9,-21, 7,-11, -9, -7, 11, 7, -8, 3, -9,-20,-21,-15, 20; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M= -9,-16,-24,-19,-15, 1,-13, 3, 17,-10, 9, 3, -9,-15, -7, -7, -7, -5, 13, -9, 10,-15; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -2, -7, -7, -7, -1, 3,-15, -8, 6, -6, 12, 8,-12,-15, 3, -3,-11, 0, 1,-14, 11, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -4, -7, -9, -7, -3, 2,-12, 6, 3,-10, 11, 6,-10,-13, -4, -9, -3, 2, -2,-18, 9, -3; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M= 2, 18,-18, 33, 1,-24, -9,-10,-15, -1, -1, -7, 4,-11, -7, -9, 2, 2, -7,-28, -5, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='G'; M= -1, 1, -6, -7, -7,-18, 29,-17, -7, -6,-12,-11, 4, -9, -4, -9, -2, -9,-18, -3,-21, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='G'; M= -1, -3,-26, -9,-11,-19, 35, -1, -6, -5, -9, -4, -1, -7,-11,-11, -2,-12,-17, -2,-16,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='N'; M= -2, 12,-19, -1, -4,-12, -2, 1, -7, 0,-14, 1, 29,-16, -1, -5, 0, 0,-18,-40,-20, -4; /M: SY='K'; M= -8, -7,-32,-10, 1, 2,-15, -2,-10, 15, -8, 10, 0, -5, -4, 5, -5,-11,-11,-17, 2, -3; /M: SY='V'; M= 3,-20,-22,-21,-28, 11,-26,-24, 37,-19, 16, 2,-19,-36,-26,-13,-12, 6, 42,-22, 15,-28; /M: SY='I'; M= 5,-10,-19,-17,-20, -2,-19,-20, 28,-13, 2, -2, 0,-22,-15,-13, -8, 7, 24,-35, -6,-20; /M: SY='I'; M= 1,-20,-20,-34,-28, 1,-14,-21, 50,-18, 15, 8, -5,-30,-18,-18,-10, -1, 38,-28, -6,-28; /M: SY='G'; M= 4, 9,-30, 11, -7,-28, 24,-20,-15, -5,-15,-18, 3, -8, -6,-14, 11, 2,-18,-18,-20, -8; /M: SY='G'; M= -2, 12,-14, -5,-14,-23, 44,-25, -7, -8,-18,-13, 26,-18,-17,-20, -2,-10,-26,-19,-36,-15; /M: SY='F'; M=-17,-26,-24,-43,-34, 78,-27,-26, 8,-12, 23,-11,-11,-38,-28,-13,-12,-15, 13, 2, 27,-34; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='G'; M= -1, -1,-33, -9,-17,-23, 64,-26, -7,-10,-13,-15, -2,-11,-18,-18, -2,-17,-24, 7,-22,-17; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='D'; M= 1, 33,-22, 53, 8,-36, -2,-15,-27, 1,-12,-21, 13, -9, -7,-11, 3, -6,-19,-32,-15, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -5,-10,-25, -6, 6,-29, -9, 2,-21, 9,-23,-24,-12, 66, -1,-10, -3, 5,-28,-31,-18, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='L'; M= 0, -6,-10, -8, 1, -7,-20,-10, 1, -7, 11, 6, -9,-11, 10, -9, -6, 10, -3,-24, 6, 7; /M: SY='I'; M= -5,-20,-20,-28,-15, -6,-10,-13, 25, -7, 8, 5,-12, -6,-14,-18,-13, -4, 11,-12, -3,-17; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='D'; M= -3, 14,-30, 36, 9,-25,-15,-13,-27, 5, -6,-13, -5, -7, 5, 3, -4,-10,-14,-17, 3, 5; /M: SY='N'; M= 6, 14,-18, 3, 2,-18, -5, 3, -8, 1,-17, -4, 30, -6, -2,-14, 7, 6,-17,-50,-30, -1; /M: SY='Q'; M= 3, 3,-18, 3, 14,-28,-17, 6,-20, 1,-17, -7, 6, -5, 41, 16, -7, -5,-26,-24,-14, 23; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='V'; M= 6,-15,-15,-16,-24, 9,-25,-24, 31,-18, 14, 3,-16,-32,-24,-12, -9, 10, 36,-27, 11,-23; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='S'; M= 0, -5,-21, -4, 2, -8, -9, 2,-12, 6,-13, -1, -5, -5, -1, 7, 13, 0,-11,-22, -8, -3; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='Q'; M= 10, -3,-14, -3, 8,-25,-17,-12,-12, 2, -7, -2, -1, 0, 15, -7, 8, 15, -5,-32,-16, 12; /M: SY='G'; M= 0, 1,-33, -7,-13,-25, 50,-22,-12, -3,-21,-17, 4, -2,-13,-12, 2,-12,-27, -6,-27,-14; /M: SY='D'; M= 0, 41,-22, 71, 17,-45,-11,-16,-35, 3,-11,-25, 12, -8, -5,-11, 0,-10,-22,-37,-14, 7; /M: SY='T'; M= 8, -4,-18,-11,-20,-11,-20,-20, 8,-12, 3, 0, 2,-10, -7,-24, 13, 37, 16,-43, -4,-13; /M: SY='R'; M=-16,-20,-29,-11,-10, -4,-11,-14,-24, 6,-12, -3,-23,-11, 14, 48,-11,-26,-11, 21, 15, -5; /M: SY='I'; M= 0,-20,-20,-40,-30, 0,-10,-20, 60,-20, 20, 10, 0,-30,-20,-30,-10, 0, 40,-30,-10,-30; /M: SY='F'; M=-19,-26,-10,-42,-31, 77,-29,-28, 2,-13, 22,-14,-12,-38,-28,-12,-12,-17, 8, 3, 23,-32; /M: SY='F'; M= -9,-22,-25,-35,-29, 66,-24,-25, 4,-10, 15,-12,-10,-34,-24,-11, -5,-10, 11, -4, 18,-30; /M: SY='V'; M= 2,-16,-12,-16,-22, 14,-26,-22, 32,-20, 22, 8,-20,-36,-26,-14,-14, 6, 34,-26, 18,-22; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='N'; M= 2, 22,-14, 8, -7,-15, -7,-11, -7, -1,-14, -3, 41,-17, 3, -7, 2, 10,-13,-48,-24, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='P'; M= -5,-12,-23,-13, -4,-23,-10, -2, -8, 2,-15,-18, -9, 45, -1, -6, -6, 2,-15,-30,-16, -7; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='A'; M= 16, -4,-23, -6, -7, -5,-10,-17, 4, -6, 0, 2, -3,-14, 3,-10, 2, 7, 8,-33,-14, -5; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='P'; M= -1, -6,-17, -3, 3,-19, -4, 1,-13, 4,-16,-17, -7, 43, 0, -7, -1, 2,-18,-23,-15, -1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='R'; M= -6, -2,-24, 2, -1,-21,-15, 6,-24, 5,-20, -7, 1, 8, 16, 27, -7,-13,-21,-26,-12, 2; /M: SY='N'; M= 4, 24,-25, 14,-10,-24, 26,-19, -9, -3,-18,-10, 35,-18,-12,-18, 1, -3,-21,-36,-32,-11; /M: SY='E'; M= -6, -9,-13, -1, 22,-21,-19, 5,-25, 12,-11, -4,-13, 1, 15, 17, -2,-18,-19, -8, -4, 19; /M: SY='F'; M=-12,-16,-10,-20,-16, 35,-22,-13, 11,-15, 30, 6,-18,-22,-21,-17,-17, -5, 6,-13, 26,-17; /M: SY='M'; M= 2,-13,-23,-17,-11,-11,-10, 1, 0, 5, 8, 21, -6,-24, -8, -2, -4, 4, -2,-19, 0,-11; /M: SY='L'; M= 1, -7, -8, -7, -8, 8,-15,-12, 13,-14, 23, 13,-13,-23,-13,-18, -7, 7, 8,-28, 11, -8; /M: SY='N'; M= -2, 28,-17, 12, -5,-15, -5, 0, -9, 3,-18, 1, 53,-20, -5, -8, -1, 1,-20,-56,-29, -6; /M: SY='S'; M= -1,-10,-29,-10,-10, 14,-10,-13, -8, -3, -4,-16, -8,-17,-12, -8, 20, 8, -2,-12, 4,-16; /M: SY='S'; M= 6, 5,-22, 9, -2,-19, -5,-12, -9, -2,-14,-19, 0, -1, -9,-13, 23, 14, -8,-33,-17, -9; /M: SY='L'; M= -7, -7,-12, -3, -6, -3,-10, -7, 3, -9, 18, 6,-16, -4,-15,-16,-15, -2, -5,-22, 10, -8; /M: SY='I'; M= 5,-19,-18,-30,-20, -5,-18, -4, 32, -3, 20, 30, -5,-36,-17,-14,-15, 1, 22,-29, -3,-20; /M: SY='R'; M=-12,-20,-26,-13, -8, -2,-19, -8,-25, 9,-14, -8,-21, 8, 15, 46,-10,-21,-12, -2, 5, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='I'; M= 1,-21,-23,-28,-29, 8,-22,-23, 44,-19, 16, 3,-13,-34,-24,-18,-11, 4, 42,-23, 9,-29; /M: SY='T'; M= 2, 0, -8, -8,-13,-14,-17,-18, -4, -9, -3, -6, 10, -8, -5,-23, 15, 31, 1,-39,-11,-10; /M: SY='L'; M= -7,-10, -3, -8, -5, 10,-19,-10, 11,-13, 25, 12,-18,-24,-12, -9,-13, -2, 6,-19, 19, -6; /M: SY='R'; M= -1, -8,-20, -4, 3,-18,-12, -8,-22, 10,-20, -6, -6, 10, 14, 28, -2,-12,-16,-21,-15, 3; /M: SY='N'; M= 1, 36,-12, 13,-10,-11, -3,-12, 0, -2,-17, -2, 66,-29,-12,-18, -1, 9,-14,-64,-34,-11; /M: SY='L'; M= -4,-11, -9,-15, -7, 13,-17,-14, 16,-10, 23, 12,-12,-23,-14,-17,-12, -3, 9,-20, 11, -8; /M: SY='E'; M= -2, 0, -3, 12, 39,-33,-18, -5,-30, 18,-13, -7, -9, 5, 18, 9, -2,-20,-25,-12,-15, 33; /M: SY='E'; M= 3, -6, -9, -2, 23,-25,-10, -5,-17, 11, -7, 2, -9, -4, 16, 5, -4,-13,-18,-14,-14, 22; /M: SY='V'; M= 8,-17,-20,-20,-23, 1,-22,-23, 32,-16, 9, 1,-14,-22,-21,-15, -8, 9, 34,-32, 1,-23; /M: SY='E'; M= -2, -3, -5, 3, 23,-15,-13, -8,-13, 5, 2, -4, -9, -9, 0,-12, -6,-14,-14,-13, -6, 17; /M: SY='H'; M= 0, -6,-32, -2, 1,-22,-18, 43,-16, -7, -9, 4, -5, -1, 3, -5, 1, -6,-14,-39,-11, 1; /M: SY='C'; M= 2,-12, 56,-20, 1,-22,-20,-31, -1,-16, -2, -4, -5,-21, -1,-14, -7, -5, -2,-31,-41, -1; /M: SY='I'; M= 6,-14,-18,-18,-21, 4,-18,-21, 30,-15, 7, -1,-11,-30,-22,-15, 2, 10, 30,-29, 0,-23; /M: SY='E'; M= 2, -2, 4, 1, 30,-28, -7,-13,-21, 14,-13, -5, -5, 1, 5, -8, 3,-12,-22,-16,-24, 22; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M= -3,-10,-10, -6, -7, -3,-11, -7, -8, 2, -7, 0,-10, -8, 9, 32, -5,-11, 1, -3, 1, -3; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='K'; M= 0, 0,-11, 1, 14, -8, -6, -8,-11, 18, -9, 7, -1, 5, 2, 3, 0, -6,-11, -9, -6, 9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='L'; M= -1, -6, -6, -6, -2, 3,-12, -7, 6, -6, 10, 6, -9,-12, -1, -3, -8, 0, 3,-11, 9, -1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='A'; M= 12, -2, 3, -3, 1,-11, -4,-12, -3, -3, -6, -1, -1, -7, 0, -6, 6, 4, 0,-22,-21, -1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='D'; M= -5, 14,-22, 32, 15,-27, -7,-20,-29, 9,-15,-15, -6, -5, -4, -4, 2,-12,-21, -1, -5, 6; /M: SY='K'; M= 1, -5,-27, -3, 16,-14,-13,-14,-21, 28,-20, 11, -5, 5, 21, 23, -3,-10,-21,-15, -9, 15; /M: SY='P'; M= 4, -9,-22, -5, 10,-31,-10, -2,-19, 6,-19,-21,-14, 49, 3,-13, 5, 8,-21,-33,-21, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NtA |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
AGRIN_CHICK (P31696), AGRIN_HUMAN (O00468)
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
1JB3; 1JC7; 1PXU; 3I70; 8S9P |