PROSITE entry PS51127
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BIG1 |
| Accession [info] | PS51127 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUN-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51127 |
| Associated ProRule [info] | PRU00445 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Big-1 (bacterial Ig-like domain 1) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=103; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=103; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4456511; R2=0.0206623; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=245; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=32; N_SCORE=4.1; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: B1=*; E1=*; MM=*; II=*; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=-85; E0=*; BM=-1; BD=-42; /M: SY='Q'; M= -2,-30,-16, 9,-33, -3, 13, 7, 4,-30,-21,-13,-28, 18,-14, 1, 0, 14,-33,-26; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M= 12,-18,-41, -1,-17,-35,-23, 14,-31, 9,-10,-30,-35,-28,-30, -2, 9, 16,-22,-19; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-17,-31, 10, 2,-34,-27,-13,-32, -9, -8,-22, 3,-28, 8,-14, 7, 24, 4,-33,-26; M0=-9; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='L'; M= -5,-24,-50,-44, 15,-42,-31, 17,-40, 25,-11,-39,-42,-35,-38, -5,-26,-15,-28,-25; M0=-20; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='Q'; M= 9,-30,-16, 1,-32,-27,-13, -1, 3, -7,-21, 3,-28, 18,-14, 15, 1, -1,-32,-26; M0=-6; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 19,-25,-20,-14,-26,-28,-15, -2, 2,-25,-17, 6, 1, 7,-17,-18, 9, 14,-29,-23; M0=-8; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='S'; M= 6,-27, 15,-15,-29, -1,-17, -2,-14,-27,-19,-17, 1,-13,-18, 17, 14, -1,-31,-26; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='K'; M= 0,-32, 1, 1,-35, -5,-13,-32, 22, -7,-22, 5, 10, -9,-14, 12,-16,-28,-33,-27; M0=-8; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='D'; M= 6,-32, 20,-13, 4, 6,-17,-34,-13,-34,-25, 18,-30,-13,-18, -1, 15,-30,-36,-30; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='E'; M=-17,-32, 11, 12,-35, 9,-13,-32, -9, -6,-23, 11, -2, 8,-14, 7, 9,-28,-33,-27; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M= 17,-27,-55,-50, 2,-49,-41, 26,-47,-23,-20,-46,-49,-45,-47,-41, 1, 19,-39,-35; M0=-25; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M= -1,-17,-40,-34,-17,-34,-23, 21, -1, 4, -9,-30, -1,-27,-29, -3, 15, 14,-22,-19; M0=-10; /I: MM=-1; MI=-93; MD=-41; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 31,-28,-48,-47,-49, 7,-42,-46,-44,-49,-40,-37,-39,-41, 5, 1,-26, 0,-52,-50; M0=-26; /I: MM=-1; MI=-92; MD=-39; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6; /M: SY='N'; M=-32,-47, 28,-17, 8,-33,-28,-51,-30,-51,-44, 29,-39,-25,-38,-30, 12,-46,-50,-40; M0=-26; /I: MM=0; MI=-91; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-8; DD=-12; /M: SY='N'; M= -1,-46,-14, 3,-50, 26,-25,-48, 4,-47,-39, 26,-37,-21,-29,-28,-30,-43,-49,-41; M0=-21; /I: MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6; /M: SY='N'; M=-16,-30,-15, 4,-33, -2,-13,-31, 3, -6,-21, 17,-27, 8, 2,-15, 15, 15,-32,-26; M0=-7; /I: MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6; /M: SY='D'; M= 7,-35, 28, 11,-39, -4,-17,-36,-14,-36, 13,-15,-31,-13,-20,-20, 15,-32,-38,-31; M0=-14; /I: MM=-44; MI=-38; MD=-2; IM=-10; II=-10; DM=-4; DD=-22; /M: SY='V'; M=-14,-13,-33,-32,-16,-27,-27, 7,-30, -8, -7,-28,-30,-29,-29,-22,-15, 34,-26,-22; M0=-17; /I: MM=0; MI=-68; MD=-78; IM=-9; II=-11; DM=-42; DD=-1; /M: SY='G'; M=-20,-22,-27,-29,-37, 37,-29,-41,-33,-41,-36,-27,-28,-31,-32,-22,-24,-33,-32,-36; M0=-26; /I: MM=0; MI=-68; MD=-78; IM=-9; II=-11; DM=-30; DD=-2; /M: SY='R'; M= -8,-21, -4, 18,-26,-16, -4,-23, 2,-22,-13, -3,-18, 1, 20, 13, -8,-18,-24,-17; M0=-7; /I: MM=0; MI=-73; MD=-83; IM=-9; II=-11; DM=-1; DD=-47; /M: SY='A'; M= 20,-22,-24, -2,-22,-30,-17, 2,-17, 2, 10,-20, 9, 6,-20, 5, 2,-17,-26,-21; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M= -3,-20,-29,-23,-20, -2,-19, 17,-21,-19,-12, 3,-32, 5,-23, 6, 17, 9,-24, 8; M0=-8; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-25,-34,-28,-22,-37,-35,-22,-35,-14,-36,-28,-24,-36, 8, 2, -1, 33,-32,-37, 18; M0=-19; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='L'; M=-38,-34,-62,-56,-24,-56,-45, 13,-53, 23, 23,-53,-53,-46,-50,-48,-37, 13,-38, 17; M0=-30; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-17,-32, 4, 1,-35,-27,-14,-33, 9,-32,-23,-13,-28, 15,-15, 7, 26,-28,-34, 7; M0=-12; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 25,-19,-45,-38, 12,-37,-26, 5,-34, -2,-11,-33,-37,-31,-33, -3,-20, 15,-25,-21; M0=-16; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-17,-31,-16, 10,-33,-27,-14, 0, 3, -7,-22, 5,-28, 8,-14,-16, 29,-26,-33,-26; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M=-40,-35,-66,-63,-32,-62,-59,-10,-62, 11,-19,-61,-59,-57,-61,-57,-40, 35,-49,-47; M0=-39; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='K'; M= 9,-30,-16, 3,-33,-27,-13,-30, 20, -6, 10,-13,-28, 14, 2,-16, 7, -1,-32,-26; M0=-8; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='D'; M=-39,-59, 39,-18,-61,-36,-31,-61, 9,-59,-54, 3,-42,-28,-43,-35,-40,-55,-61,-50; M0=-34; /I: MM=-2; MI=-93; MD=-31; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= -1,-30, 4, 11, 1, 6,-12, -3, 5,-30,-21, 7, 0, 7,-13,-14, 15,-26,-32,-25; M0=-6; /I: MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-3; DD=-26; /M: SY='N'; M=-17,-32, 1, 13, 0, 5,-14,-33, 3,-32,-23, 20,-28, -9,-15, 11,-17,-28,-34, 16; M0=-10; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='G'; M=-35,-48, 12,-20,-60, 31,-32,-59,-37,-59,-52, 3,-42,-29,-46, 13,-37,-52,-60,-51; M0=-30; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M=-20,-35, 3,-12,-38,-29, 11,-35, 15,-35,-26, 32,-30,-12,-17,-19, -1, 7,-36,-30; M0=-15; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='P'; M= 6,-32,-28, -2,-44, 9,-33,-41,-34, 3,-36,-29, 34,-31,-38,-27,-28,-36,-47,-42; M0=-19; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M=-37,-32,-63,-58,-30,-59,-52, 24,-56, 15,-18,-56,-56, 14,-55,-52,-37, 21,-45,-43; M0=-32; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 25,-35,-16, 3,-39,-29,-17,-36, 3,-36,-27, 17, 12,-12,-18, -1,-20,-32,-38,-31; M0=-14; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M=-38,-59, 22, 1,-60, 23,-30,-60,-34,-58,-52, 25,-42, 7,-44,-34,-39,-54,-60,-49; M0=-30; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='Q'; M= 7,-26,-19, 0,-27,-28, 13, -2, 9, 1,-17,-16,-29, 22,-17,-18, -1, 12,-29,-24; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='E'; M= -3,-32,-15, 21,-35,-27,-13,-32, 5,-32, 10, 13, 14, -9,-14,-16, 14,-28,-33,-27; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M=-35,-31,-62,-60,-39, -5,-59, 6,-59,-27,-26,-55,-56,-58,-60,-49,-35, 37,-55,-50; M0=-36; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= -1,-25,-22,-16,-26,-29,-17,-22,-15,-24,-17, 2,-30, 7,-19, 6, 29, 5,-29, 7; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='F'; M=-50,-43,-72,-67, 41,-70,-49, 9,-65, 8,-13,-65,-61,-52,-59,-64,-48,-26,-37,-33; M0=-41; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= 7,-31, 3,-15,-36,-29,-18,-33,-15, -6,-25, 12,-31,-14,-20, 19, 22,-29,-37,-30; M0=-12; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M= 0,-17,-42,-36,-17,-34,-23, 3,-32, 8, 12,-31,-35,-28,-30, -4, 17, 20,-22, 10; M0=-13; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='P'; M= -3,-30,-16,-10,-33, -1,-13,-30, 4, -7,-21, 11, 17, 8,-14, 6, 9, 6,-32,-26; M0=-6; /I: MM=-2; MI=-93; MD=-33; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M= -2,-30,-14, 10,-33,-25,-12,-30, -8, 2,-21, 17, 3, 7,-13, 16, 4,-26,-32,-25; M0=-8; /I: MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-5; /M: SY='G'; M= 2,-34, 21,-28,-56, 28,-37,-54,-41,-56,-47,-29,-39,-35,-46, 10,-30,-43,-57,-52; M0=-27; /I: MM=-4; MI=-92; MD=-22; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-5; /M: SY='V'; M= 8,-26, 7, -7,-29,-23,-10,-26, 7,-26,-18,-10, 4, -6,-12, 10, 5, 17,-29,-22; M0=-7; /I: MM=-4; MI=-88; MD=-22; IM=-9; II=-11; DM=-13; DD=-8; /M: SY='A'; M= 24,-27,-19,-15,-38, 5,-19,-36, 5,-36,-27, 10,-29,-15,-20, 16,-18,-29,-38,-32; M0=-14; /I: MM=0; MI=-87; MD=-98; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-4; /M: SY='A'; M= 20,-26,-15, 6,-30,-24,-13,-27, -9,-28,-19, 9,-26, -8,-14, 9, 13, 1,-30,-24; M0=-9; /I: MM=-1; MI=-88; MD=-36; IM=-9; II=-11; DM=-29; DD=-2; /M: SY='W'; M=-13,-26,-11, 6,-29, 9, -9,-26, 8, 5,-17, 15,-23, -5,-10, 10,-12,-22, 25,-22; M0=-6; /I: MM=-1; MI=-87; MD=-35; IM=-9; II=-11; DM=-31; DD=-2; /M: SY='F'; M= 3,-12,-37,-30, 31,-29,-18, -7,-26, 2, -4,-25,-30,-23,-25,-20, 7, 9,-16, 15; M0=-12; /I: MM=-2; MI=-86; MD=-33; IM=-9; II=-11; DM=-33; DD=-2; /M: SY='T'; M=-13,-26,-12, -8,-31,-22,-11,-29, 9,-29,-20, 12, 10, -7,-12, 6, 27,-24,-31,-24; M0=-10; /I: MM=-2; MI=-84; MD=-32; IM=-9; II=-11; DM=-10; DD=-10; /M: SY='L'; M=-28,-26,-51,-46,-19,-44,-35, 8,-42, 28, -8,-42, 7,-37,-40,-36, 7,-13,-30,-29; M0=-22; /I: MM=-1; MI=-88; MD=-36; IM=-9; II=-11; DM=-18; DD=-5; /M: SY='S'; M=-15,-26,-16, 4,-31, 9,-14,-27,-11, -1,-20,-14, 12,-10,-16, 22, 4,-24,-31,-25; M0=-8; /I: MM=0; MI=-88; MD=-99; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20; /M: SY='N'; M=-32,-49, 13,-16,-52,-33,-26,-51,-27,-50,-42, 32, 1, 20,-34, 12,-32,-46,-52,-42; M0=-24; /I: MM=-3; MI=-38; MD=-32; IM=-19; II=-4; DM=-4; DD=-22; /M: SY='N'; M= -1,-30,-14, 5,-33, 10,-12,-31, 10,-30, 12, 18, 4, 9,-13, 8,-15,-26,-32,-25; M0=-8; /I: MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-9; DD=-11; /M: SY='G'; M= 8,-19,-34,-29,-20, 23,-22, 1,-26, -3,-12, 19,-34,-24,-27, -2,-18, 1,-24,-21; M0=-10; /I: MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-21; /M: SY='T'; M=-21,-22,-37,-31,-24,-35,-26, 10, 7,-22,-16,-30,-37,-27,-29, 16, 26, 9,-29,-25; M0=-15; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 22,-22,-24, 12, 6, -4,-18, 2, -1,-21,-13,-20,-31,-16,-21, -3,-17, -1,-26, 8; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M=-19,-18,-39,-33,-18,-35,-23, 17, 16, -1, 13, 10,-35,-27,-29,-25, 16, 9,-23,-19; M0=-13; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-34,-47, 5,-21,-59,-35,-33,-59,-38,-59,-52, 4,-42,-31,-46,-33, 38,-51,-60,-51; M0=-34; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='D'; M=-37,-56, 34,-17,-58,-35, 14,-57,-32,-56,-49, 24,-41, 4,-41, -3,-37,-52,-58,-47; M0=-30; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='H'; M= 15,-31,-16, 1,-33, -3, 21, -4, -9,-31,-22, 5,-28, 7,-14, 12, 1, -2,-33,-26; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M= -3,-46, 18, 1,-48,-33,-24,-47,-23,-46,-38, 32,-36, 15,-29, 6,-29,-42,-48,-39; M0=-21; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='G'; M=-65,-58,-68,-72,-74, 39,-65,-83,-74,-78,-76,-69,-63,-72,-69,-68,-68,-77,-62,-74; M0=-64; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='I'; M=-18,-21,-26, -2,-21,-31,-18, 18, 12, 4,-13, 4,-32,-18, 2,-21, 2, 12,-25, 7; M0=-7; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 33,-36,-57,-55, 9,-50,-26, -1,-51,-29,-27,-44,-51,-43,-47,-42,-39,-29,-20, 12; M0=-30; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-17,-31,-15, 1,-35,-26, 10, -2, 14,-32,-22, 5,-27, 15, 1, 6, 17,-28,-33, 7; M0=-9; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M= 18,-26,-53,-48, 14,-47,-39, 17,-45,-22,-19,-44,-47,-42,-44,-39, 1, 23,-36,-33; M0=-24; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= 4,-31, 3,-16,-40,-29,-20,-37,-16,-37,-28,-19, 2,-15, 4, 12, 29,-32,-39,-33; M0=-15; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='L'; M=-28, 17,-52,-46, 7,-45,-33, 5,-42, 27,-11,-41,-44,-37,-40,-36,-28, 2,-29, 10; M0=-23; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= -3,-30,-30,-25,-40,-32,-25,-37, 21,-38,-30,-25,-35,-22,-23, 6, 29,-32, 22,-36; M0=-19; /I: MM=-32; MI=-93; MD=-2; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='P'; M=-12,-14,-16,-18,-25,-15,-17,-25,-18,-26,-21,-16, 39,-18,-19,-14,-15,-21,-23,-23; M0=-16; /I: MM=-14; MI=-7; MD=-72; IM=-1; II=-35; DM=0; DD=-49; /M: SY='G'; M= 9,-30,-47,-49,-56, 24,-46,-54,-51,-56,-47, 2, 4,-46,-50, 22,-28,-42,-58,-57; M0=-29; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= -1,-20, 0,-21, 3,-31,-19,-16, -1, -5,-12,-22,-32,-18,-22, -2, 29, 8,-25,-20; M0=-9; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='K'; M= -3,-31,-16, 4,-34,-27,-13,-31, 24, -8, 11,-13,-28, 8,-14, -1, 17,-27,-33,-26; M0=-10; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 13,-27, 0,-13, 1,-28,-15,-25,-12, 3,-18, 3, 9, 7,-16, 6, 9, -3,-30,-24; M0=-5; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='G'; M=-51,-54,-39, 0,-70, 37,-51,-74,-56,-72,-67,-46,-55,-51,-59,-51,-54,-67,-62,-66; M0=-48; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= 6,-31, 10, 1,-34,-27,-13,-32, 3,-31,-22,-13,-27, 7,-14, 0, 20, 14,-33,-26; M0=-10; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='H'; M= -1,-30, 2,-10,-33,-27, 25,-30, 2,-30,-21, 13,-28, -9,-14, 5, 0, 12,-33, 20; M0=-9; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-19,-17,-39,-33,-17,-34,-22, 3,-30, -3, 13,-29, -2, 5, 0,-25, 28, 13,-22,-19; M0=-12; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M=-39,-33,-65,-61, 7,-63,-58, 13,-60, 6,-19,-59,-59,-56,-59,-56,-38, 33,-49,-46; M0=-36; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-20,-33,-18, 9,-36,-29,-16,-33, 4,-33, 11,-16,-31,-12,-16, 12, 30,-29,-36,-29; M0=-15; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='A'; M= 31,-31,-59,-57,-37,-44,-51,-12,-55, -6,-26,-48,-49,-52,-54,-38,-33, 19,-49,-46; M0=-31; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-17,-32, 1, 1,-35,-27,-13,-32, 10,-32,-22,-13,-28, -9, 16, 16, 18, -2,-33,-27; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M=-31,-28,-55,-49, 6,-48,-37, 2,-45, 19, 12,-45,-47,-40,-43,-40, 10, 23,-33,-31; M0=-24; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='E'; M= 10,-31, 11, 14,-35, -5,-13,-32, -9,-32,-22, 3,-27, 6,-14, 6, 8, 7,-33,-27; M0=-8; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M= -2,-41, 4, 2,-44, 18,-20,-41,-18,-41,-32, 29,-34,-16,-24, -2,-25,-37,-43, 9; M0=-16; /I: MM=-1; MI=-93; MD=-43; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='N'; M= -1,-26,-18,-13,-27, 15,-15,-23,-12,-25, 12, 21,-28, 19,-16, -1,-16, -1,-29, 5; M0=-8; /I: MM=-1; MI=-93; MD=-41; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20; /M: SY='G'; M= 11,-31, 4, -9,-34, 17,-13,-31, -8,-31,-22, 12, 3, 6, 2,-15, 2, -2,-33,-26; M0=-8; /I: MM=-9; MI=-92; MD=-11; IM=-9; II=-11; DM=-14; DD=-7; /M: SY='Q'; M= 4,-16,-18,-12, 12, 4,-12,-13,-11,-16, -9,-13,-24, 21,-14, 14,-11, 7,-21,-16; M0=-6; /I: MM=-2; MI=-31; MD=-94; IM=-15; II=-6; DM=-7; DD=-14; /M: SY='S'; M= 7,-22, 3,-13,-23,-27,-14, 4, 2,-21,-14,-15,-28,-11,-16, 17, 9, 14,-26,-21; M0=-7; /I: MM=0; MI=-90; MD=-101; IM=-9; II=-11; DM=-2; DD=-31; /M: SY='S'; M=-18,-24,-21, 2,-25,-29,-16,-21, 2, 3, 12,-18,-30, 5,-18, 21,-17, 15,-28,-23; M0=-9; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='D'; M= -2,-31, 22, 1,-35,-26,-13,-32, 3,-32, 12, 12, 1, 20,-14,-16, 2,-28,-33,-26; M0=-11; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='Q'; M= 10,-31,-16,-11,-34,-27,-14,-31,-10,-31,-22, 11,-28, 20, 3, 11, 17, -5,-33,-26; M0=-10; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='Q'; M= -2,-30,-16,-10, 4,-27, 10,-30, 8, 0,-21, 4, 0, 22, 1, 1,-16, 7,-32,-26; M0=-6; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M= -2,-29, 11, 2, 10,-27,-14, -1,-10,-29,-20,-14, 8, 13,-15, 7, 14, -4,-32,-25; M0=-6; /I: MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M= -6,-31,-62,-58,-35,-59,-54, 13,-56, -2, 13,-55,-56,-54,-57,-52,-35, 33,-49,-45; M0=-33; /I: MM=0; MI=-93; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='T'; M=-16,-30,-15, 10,-33,-26, 11, -1, 3,-30,-21, 17,-27, -8,-14, 0, 23,-26,-32, 9; M0=-10; /I: MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='F'; M=-54,-45,-61, 2, 39,-59,-23,-43,-59, 4,-38,-46,-58,-47,-53,-51,-52,-44, 24, 15; M0=-36; /I: MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14; /M: SY='V'; M=-26,-23,-51,-45, 6,-44,-35, 23,-42,-20,-16,-41,-44, 7,-41,-36, 2, 28,-33,-29; M0=-23; /I: B0=*; E1=-10;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 59 in 10 different sequences |
| Number of true positive hits | 59 in 10 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.33 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 17 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Big-1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
10 sequences
EAEA_HAFAL (P52869), EAE_CITFR (Q07591), EAE_ECO11 (O31000), EAE_ECO27 (P19809), EAE_ECO57 (P43261), INVA_YEREN (P19196), INVA_YERPS (P11922), YEEJ_ECO57 (Q8X8V7), YEEJ_ECOLI (P76347), YEEJ_ECOLU (B7NC15)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
TUBE_LAMBD (P03733) |
| PDB [Detailed view] |
19 PDB
1CWV; 1F00; 1F02; 2L04; 2ZQK; 3NCW; 3NCX; 6P3E; 6TPL; 6TQD; 7T4F; 8IYD; 8IYK; 8IYL; 8K35; 8K36; 8K37; 8KGE; 8XPM » more |