PROSITE entry PS51175

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CBM6
Accession [info]	PS51175
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2005 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51175
Associated ProRule [info]	PRU00523

Name and characterization of the entry

Description [info]

CBM6 (carbohydrate binding type-6) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=126;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=121;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2486272; R2=0.0034969; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=19097.5859375; R2=6.6874514; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1788; H_SCORE=31055; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1216; H_SCORE=27230; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-17; D=-100; I=-100; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='T';  M=  6,-48,-11,-28,-12,  0,-22, -5,-20,-18,-24, -9,-10,  3,  2, 12, 44, 19, -7, -1;
/M: SY='T';  M=-25,-21,-13,  2,-32, -7,-11, -9, 21,-20, -4,-24,-15,  8, 39,-21, 40,  2,-54,  4;
/M: SY='Y';  M=-32,-53,-19,-50,  1,-58, -6, 44,-39,  6,-23,-22,-55,-25,-30,-33,  3, 28,-12, 74;
/M: SY='E';  M=-39,-60, 23, 79,-62,-33,-12,-60, -2,-50,-47,-23, -9, 58, -4,-23,-30,-56,-58,-48;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='A';  M= 80, -1,-36,-29,-52, -9,-47,-25,-42,-32, 11,-31,-36,-38,-46, -4,-19,-29,-55,-48;
/M: SY='E';  M=-13,-57, -1, 90,-59,-25,-34,-46,-11,-38,-48, -4,-25,  3,-32,-20,-20,-37,-59,-51;
/M: SY='D';  M= -3,-49, 54,  1,  5,-24, -1,-51,-27,-51,-47, 42,-46,-18,-24, 34, 26,-47,-17,  7;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='F';  M= 25,  2,-40,-50, 61, 14, 13,-19,-47,-17, 13,-28,-38,-46,-48,-16,-16,-31,-12, 55;
/M: SY='D';  M= 17, 16, 44, -6,-25, -8, 18,-30, -2,-40,-30, 19,-46, -4,  2, 15, 22,-25,-62,-43;
/M: SY='W';  M= -5,-52, 25, -2,-31,-14,-15, -7,-11, 25,  2, 19,-32,-17,  2,  2, -4,-17, 59,-28;
/M: SY='T';  M=-26,  0,  0,-23, -7, 11,  3,-21,-23,-11, 13,  4,-48, 23,-34, 28, 35, -6,-50, 28;
/M: SY='G';  M=  3,-52, 24,-16,-55, 57,  9,-58, -6,-48,-49, 27,-30,-18,-24, 26,-22,-53,-13,-16;
/M: SY='G';  M= -2,-23, -3,-38,-34, 66,-44,-34,-13,-51,-27,  2,-12,-30,-32, 12, -5,  1,-54, -5;
/M: SY='T';  M= 13,-47,-13,-22,-22,-38,-45, 21,-32,-13,-16,-27,-13,-40,-14, 20, 41, 29,-53, 19;
/I:         I=-11; MD=-29;
/M: SY='T';  M= -8,-54,-18,  1,-23,  1,-30, -1,  0,-18,-29,-11,-32, 12,-16,  1, 27, 14,-57,  6; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-29;
/M: SY='D';  M=  3,-58, 12, -8,-20,-57,-53, 11,-50, 10,-38,  2,-36,-49,-32, -7, -2,  9,-23,-13; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='T';  M=-39,-64,  8,-51,-66,-42,-56,-15,-35,-62,-58, 15,-43, -8,-45, 26, 38,-24,-81,-50; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-29;
/M: SY='N';  M=-41,-64, 22, 25,-64,  9,-46,-35, -8,-38,-37, 26,  2,  9, -9,-28, 10,-41,-71,-57; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-29;
/M: SY='H';  M= -8, -5,  4,-14,-10,-21, 62,-13, -9,-19,-19, 11,-15,-16,-27,-28,  4, 18,  2, -7; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-29;
/M: SY='T';  M= 17,-11, 25, 10,-34,-37,-27,-12,  0,-38,-44,-33, 14,-13,-15, 23, 40,-31, 16,-28; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -1,-52,-22,-13,-28, 64,-30,-37,-24,-26,-32,  1,  4,-11,-13,  8,  9,-25,-54,-25;
/M: SY='Y';  M= 11, 29, 28,-33, 25,-17,-33,-23,-18,-26,-36,-20,-39,-41,-44,-12,  0,-11, -3, 79;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='T';  M=  8,-22, -1,-18,-18,-41,-41,-18, 14,-32,-15, 11,  7, -8,-37, 35, 51, -2,-59,-29;
/M: SY='G';  M= -3,-52, 10, 20,-41, 58,-12,-46,-16,-54,-47,  2,-16,-26,-36, 26,-18, -9,-56,-20;
/M: SY='G';  M= -1,-49,-15,-13,-54, 48,-40,-54, -6,-44,-47, 44, -9,-24, -9, 22, 32,-49, 10,-48;
/M: SY='G';  M=-20,-31,-29,-34,-28, 85,-10,-63,-27,-60,-51,  8,-32,-28,-50,-15,-18,-58,-52,-13;
/M: SY='Y';  M=-38,-24, 10,-22, 45,-35,-33,-15, -5,-16,  2,  0,-54, 21,-17,  0, -9, -1, -3, 65;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='N';  M= 26, 13,-12,-44,-46, 12,-19, -5,-25,-39,-17, 46,-36,-20,-46,-19,-12, 44,-63,-33; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='V';  M=-22,-49, 27,-36,-13,-23,-49, 36,-36, 13, -4, 12,-53,-46,-50,-31,-13, 53,-60,-39;
/M: SY='G';  M=  3,-34,-12,-34,-18, 68,-41,-55,-20,-47,-32, 34,-48,-15, -1,-13,  6,-41,-54,-18;
/M: SY='Y';  M=-21,-26, -8,-47, 42, -2,-19,-38,-44,  0,-33, 23,-18,-16,-45,-11,-27,-36, 67, 78;
/M: SY='N';  M= -5,-50,  8,-18,  0,-13,-43, 42,-42, -9,-30, 43,-38,-10,-47, -8,  4, 20,-19,  1;
/M: SY='N';  M= 20,-50, 23, 30,-50,-10,-15,-50,-19,-50,-22, 41,-44, 27,-28,  4, 32,-40, -9,  5;
/I:         I=-26; MD=-65;
/M: SY='N';  M=  7,-50, 22,  4,-39, -4, -9,-38,-17,-34,-43, 55, 19, -8,-22,  7, 18, -2,-64,-47; D=-26;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='G';  M=-15,-32,-18,-25,-60, 88,-46,-65,-30,-62,-31,  7,-47,-42,-51,-20,-25,-59,-54,-55;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='D';  M= 24,-53, 80, 18,-59,  5,-35,-57,-34,-57,-53, 19,-23,-32,-42,  8,-33,-41,-67,-29;
/M: SY='W';  M=  1,-62,-43,-19,-17, -8,-48,-48,-17,-47,-45,-17,-26,-13,-35,  0, -6,-46,138, 49;
/M: SY='V';  M= 17,-47,-55,-41,-26,-21,-52, 39,-50, 29, 17,-49,-53,-48,-52,-33, 13, 42,-55,-14;
/M: SY='E';  M= 14,-50, 19, 43,-52,-45,-38,-43,  3,-20,-41,-12,-43, 25, 12,  7, 34, -4,-60,-46;
/M: SY='Y';  M=-35,-57,-57,-55, 56,-57,-34,  4,-49, -8,-13,-41,-60,-48,-48,-47,-23,  1, 85, 91;
/I:         I=-22; MD=-57;
/M: SY='N';  M=-39,-72,-11,-31,-22,-34, -5,-57,  8,-44,-61, 14,-31,-51,  1, -4, -1,-58,-72,  0; D=-22;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='N';  M=  7,-53, 31,-16,-59,-11,-43,-41,-12,-56,-50, 47,-41,-28,-25,  2, 42,-17,-71,-53; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-57;
/M: SY='V';  M= -7, -7,-25,-55,-14,-61,-61, 44,-43, -5,-18,-36,-38,-54,-56,-46,-18, 68,-62,-41; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-57;
/M: SY='N';  M=-19,-51, 59, -1,-39,-22,  9,-54,-14,-56,-48, 70,-24,  7,-23,  0, 15,-45,-29,-10;
/M: SY='F';  M=  9,-48,-58,-54, 61,-55,-51, 26,-52,  8,-15,-25,-42,-52,-53,-10,-27, 46,-42,  0;
/M: SY='P';  M= -1,-56,-12, -1,-27, 32,-44,-53,  7,-50,-47,-25, 78,-37,-27, 11,  4,-42,-56,-51;
/M: SY='S';  M= 23,-49,  8, 17,-31, -8, -9,-31, 16,-44,-43, 26,-19, 21, -4, 27, 14,-30,-59,-45;
/I:         I=-28; MD=-71;
/M: SY='A';  M= 38,-55, 24,-29,-64,-14,-50,-57,-23,-60,-55, -1,-17,-43,-23, 30,  8,-32,-70,-57; D=-28;
/I:         I=-28; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71;
/M: SY='G';  M= -1,-56,-30,-51,-63, 86,-50,-67,-46,-64,-54,-24,-13,-30,-27, -7,-45,-60,-55,-57; D=-28;
/I:         I=-28; DM=-71;
/M: SY='T';  M= 28,-49, 26,  5,-48,-33,-37,-29, -9,-30,  5, 18,  5,  1,  7,  6, 32,-21,-57,  1;
/M: SY='Y';  M=-20,-56,-22,-22, -7,-44, 12,-26,  1,-38,-33,  0,-54,-10,-12,  0, -2,-33,-21,102;
/M: SY='T';  M= -2,-49, 12,-17,-40,-13,-19,-31,  7,-31,-41, 29,-33,  9, 24, 23, 48,-20,-13,-44;
/M: SY='F';  M=-20,-48,-63,-57, 53,-61,-53, 32,-54, 34, 27,-56,-42,-54,-54,-41,-37, 47,-45,-24;
/M: SY='T';  M= -6,-49,  4, 27,-14,-23,-21, -6, 21,-45,-41, 10,-43,-25, -5, 30, 38, -9,-57,-13;
/M: SY='Y';  M= 34,-18,-56,-51, 26,-28,-46, 21,-50, 23,-10,-50,-55,-48,-51,-38, -8, 31,-42, 38;
/M: SY='R';  M=-21,-55,-23,-33,-23,-24,  0,-21, -5,-34,-25, -7,-50,  9, 80,  5, 15,-23,-53, -5;
/M: SY='Y';  M=  0,-21,-53,-52, 16,-22,-37,  0,-48,-22, -7,-33,-57,-47,-48,-32, -8, 52,-31, 82;
/M: SY='A';  M= 71, 18,-32,-39,-52, -1,-46,-45,-24,-40,-42,-23,-46,-37,-44, 35,-20,-24, -9,-29;
/M: SY='N';  M= 13,-44,-20,-37,-34,  3,-22,-37,-27,-42,-24, 59,-45,-23,-30, 56, 31,-33,-62,-46;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
/M: SY='G';  M= 11,-30, -5,-10,-65, 21,-31,-39,-29,-60,-11, 16, 10,-19,-54,  6,  4,-28,-71,-60; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-35;
/M: SY='T';  M=  5,-50,-20,  2,-52, 27,-43,-22,-28,-41,  6, 17, -5, -8,-15, 21, 41,-11,-61,-37; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-35;
/M: SY='S';  M=  9,-50, 27,  6,-45, 22,-39,-42, -8,-40,-22, 24,-38,  3,-28, 36, 14,-18,-61,-35; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-35;
/M: SY='G';  M= -8,-52, 20, -9,-36, 50,-20,-52,-19,-41,-23, 25, 19, -3,-43, 14, 22,-36,-57,-19;
/M: SY='G';  M= 27,-51,-28,-39,-55, 55,-43,-39,  4,-32,-44,-16,-24,  5, 26, 12, -6,-34,-55,-49;
/M: SY='S';  M=  2,-48,-19,-29,-46, -8, -4,-17,  8,-30,-28, 33, -4,  0,  8, 36, 32,-13,-56,  8;
/M: SY='I';  M=  1,-27,-56,-51, 12,-30,-49, 43,-33, 24, 24,-20,-55,-46,  7,-37,-22, 37,-51,-10;
/M: SY='E';  M= -6,-52, 43, 54,-57,-19,-35,-54,-15,-53,-48,-15,-30, 30,-18, 26, 30,-39,-61,-33;
/M: SY='I';  M=-25,-49,-62,-56, 10,-63,-54, 49,-45, 48,  9,-44,-58,-52,-54,-50,-26, 43,-52,-32;
/M: SY='R';  M=-26,-54,-10,-19, 14,-49, -4,-27,  2,-10,-22,-36,-51,  0, 58, 24,  2,-23, -7, 46;
/M: SY='V';  M= -7,-48,-34,-46,-16,-58,-53, 42,-45, 42, -1,-52,-37,-49,-53,-12,-15, 47,-56,-36;
/I:         I=-20; MD=-50;
/M: SY='D';  M=-27,-71, 53,-36,-75,  9,-51,-47,-53,-75,-69, 47,-66,-53,-61,-39,-34,-50,-86,-38; D=-20;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
/M: SY='N';  M=-16,-51, 58, -9,-58, 31,-34,-56,-16,-58,-23, 62,-32,-20,-30,  8, 16,-53,-67,-50;
/M: SY='G';  M=-25,-55, -9,-39,-60, 86,-46,-66,-11,-63,-52,  4,-47,-31,-29,-12,-17,-60, -6,-53;
/M: SY='K';  M= -1,-51,-11,  8,-34,-28,-18,-23, 36,-36,-29,  4, 35,  6, -6, 21, 31,-13,-58,-45;
/M: SY='W';  M=-10,-51,-31, -3,-18,-40,-42,  1,  5, 16,-31,  7, 27,-15,-13,  9, 14, 10, 28, 16;
/M: SY='V';  M=  8,-48,-50,-23,-19,-21, -3, 31,-30,  8,-24,-24,-34,  1,-33,-24,  5, 53,-56,-13;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='G';  M= 20,-53,-34,-29,-44, 64,-46,-57, -8,-44,-49,-16,-27, -8,-24, 16,-20,-35,-55,-13; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='T';  M=-22,-47,  7, -1,-51,-33,-23,-36, -7,-37,-23,  5,-11, 31, -4, 30, 65,-10,-15,-44;
/M: SY='V';  M=-10, 14,-36,-23, 20,-37,-50, 29,-38, 28,  0,-36,-18,-37,-51,-14,  9, 38,-18,-12;
/M: SY='T';  M= 16,-50, 17, 11,-23,-42, -3,-26, -9,-33,-41, 25, 26, -6,-26, 16, 30,-14,-19, 18;
/M: SY='V';  M=-34,-26,-61,-55, 52,-62,-52, 25,-29, 30, -7,-55,-59,-36,-52,-48,-26, 55,-45, -1;
/I:         I=-30; MD=-77;
/M: SY='P';  M=  3,-59, -7,-11,-47,  0,-44,-43, -4,-48,-47,-11, 89, -2,-31,  2,  1,-43,-58,-40; D=-30;
/I:         I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
/M: SY='N';  M= 16,-49, -5,-17,-29, 10, -9,-47,-13,-47,-44, 50, 24,  9,-39, 39, -4,-16,-24,-10;
/M: SY='T';  M= -7,-43,-36,-30,-22,-21,-31,-40,-18,-37,-39,  3, -5,  6,-33,  4, 88,-23,-62,-43;
/I:         I=-14; MD=-37;
/M: SY='G';  M= -6,-57,-35,-30,-64, 80,-51,-68,-18,-66,-56,-12,-31,-45,-53, -4,-13,-61,-58,-58; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='G';  M=  1,-57, 28,-43,-64, 54,-46,-65,-45,-65,-57, 15,-32,-11,-52, 30,-13,-59,-65,-38; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-37;
/M: SY='W';  M=-28,-75,-53,-50, -9,-34,-33,-51,-42,-30,-38,-67,-40,-35,-55,-39,-52,-42,155, 11; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-37;
/M: SY='Q';  M= -7,-55, 48, 12,-26,-25,-19,-41,-17,-53,-47, 28,-13, 50,-37, 19, 11,-41,-59,  3; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-37;
/M: SY='T';  M= -8,-48, 20,-12,-34,-16,-16,-16,  4,-43,-41, 26,-13, 16,-29, 24, 57,-14,-61,-30;
/M: SY='W';  M=-28,-66,-65,-44, 39,-34,-50,-41,-49,-39,-41,-44,-59,-49,-51,-41,-53,-21,146, 64;
/M: SY='Q';  M= 10,-52,-13, 25,-50, -4,-36,-26,  0,-42,-20, -1,-44, 57, -1, 14, 22, -9,-10, -1;
/M: SY='T';  M=-11,-48, 20, 23,-32,-46,-16,-22, -2,-39,-41, -3, -6,-21,-39,  9, 68, -9,-12, -2;
/M: SY='V';  M=  8,-48,-30,-35,  3,-29,-15, 10,  0,  4,-20,-27,-37, 13,-29,  2, 22, 43,-54,-12;
/M: SY='T';  M= -7,-48,  1, 17,-34,-28,-40,-14, -1,-43,-14, -1,  1,  1,-19, 41, 52,-17,-59,-17;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
/M: SY='C';  M= 13, 31,-28,  0,-32, 15, 15,  8,-17,-21,-29,-12,-16,-12,-32,-13, 10, 24,-61,-34; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-45;
/M: SY='N';  M=  4,-50, 10, 14,-55,-35, -5,-45, 11,-53,-45, 41, 19, 21,-11, 21, 37,-35, -9,-46; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-45;
/M: SY='V';  M=  5,-47,-60,-54,-20,-59,-58, 43,-53, 26,-19,-55,-25,-52,-55,-34,-33, 65,-57,-28;
/M: SY='Y';  M=-17,-50, 27, -8, -9,-24,-21,-46,-15,-42,-43, 39, 20,-23,-16, 26, 38,-33, -5, 39;
/M: SY='L';  M=-22,-49,-45,-30,-23,  0, -7,  7,-11, 57,  1, -7,-29,-43,-35,-18, -8,  3,-53,-19;
/M: SY='N';  M= 18,-49, 10, -4,-38,-12,-41, -9,  3,-25,-38, 28, 17,  5,-10, 12, 16, 15,-60,-46;
/M: SY='A';  M= 52,-45,-24,-16,-52,-37,-43,-29, 10,-36,-40,-33,  2, 22,-27, 26, 36,-16,-57,-46;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='G';  M=-28,-55,-42,-42,-61, 94,-49,-69,-38,-64,-54,-29,-32,-44,-38,-17,-46,-62,-53,-56;
/M: SY='T';  M= -7,-47, -7,  8,-45,-45,-18,-17, 13,-25,-36, 35,-33,-10, -8, 10, 43, 29,-61,-20;
/M: SY='H';  M=-29,-22,-17,-32,-36,-33,104,-45,-22,-44,-38, 72,-50, 29,-32,-22,-23,-56,-67,  3;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='T';  M=-32,-48, 47,-23,-48,-47, -6,-19,  1,-13,-38, 10,-45,  1,-12,  1, 63,  7,-66,-43;
/M: SY='I';  M=-40,-50,-63,-58,  1,-65,-55, 54,-55, 42,  3,-58,-58,-53,-56,-51,-36, 51,-51, -1;
/M: SY='Y';  M=-19,-55,-30,  8, -4, -6, -3,-44, 23,-43,-24,-36,-49,  0, 52, -6,  4, -5,-40, 56;
/M: SY='L';  M=-17,-49,-63,-57, 43,-62,-49, 35,-55, 53, 14,-57,-59,-52,-54,-51,-39, 25,-43,  4;
/M: SY='V';  M=-12,-50, -3, -3,-24,-16, -7,-21, 13,-20,-34,-28,-49, 12, 12,  9, 18, 38, -4, 20;
/M: SY='F';  M= 26, -3,-50,-48, 61,  0,-43,-22,-35,-10,-26,-20,-39,-35,-22, 21, -3, -1,-38, 26;
/M: SY='T';  M= -6,-49, 18, -7,-38, -2,-41,-16,  9,-21,-19, -5,-22, 17,  6, 22, 41,  5,-60,-44;
/M: SY='G';  M= 22,-50,  1,-31,-54, 61,-44,-55,-22,-55,-48, -8,-14,-12,-40, 27, 14,-37, 18,-29;
/M: SY='G';  M= 19,-50, 15,  0,-38, 50,-41,-55,-24,-56,-48, 15,  7,-21,-44, 30, 18,-48,-58,-50;
/I:         I=-18; MD=-45;
/M: SY='D';  M=-15,-60, 50,-13,-66, 20,-15,-66,-33,-66,-59, 37,-45,-13,-30, 15,  4,-61,-14,-56; D=-18;
/I:         I=-18; MD=-45;
/M: SY='G';  M=-21,-72, -6,-27,-77, 13,-63,-70, -5,-59,-66,-32,-39,  4,-43,  2,  9,-38,-81,-69; D=-18;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
/M: SY='W';  M=-18,-10, -2,-51,-36, 36,-31,-66,-50,-54,-60, -2,-66,-56,-62,-40,-59,-59, 99, 30; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-45;
/M: SY='Q';  M=  5,-33, -6,-28,-17,  6,-21,-45,-24, 16,-40,  5,-60, 34,-49,-34,-27,-23, 30,  0; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-45;
/M: SY='W';  M= 10,-29,-61,-52, 40,-40,-56, 21,-51, -1,  6,-55, 25,-51,-53,-36,-29, 34, 96,-15;
/M: SY='N';  M=-14,-20, 27,-25,-34,-35,-26,-51,-10,-39,-46, 94,-51, -9, -1,-14,-30,-43, 17,  8;
/M: SY='I';  M=-23,-50,-42,-56, 19,-13,-53, 53,-55, 43, 12,-54,-57,-52,-55,-49,-38, 31,-49,-18;
/M: SY='D';  M=-23,-56, 96, -1,-63,-32,-15,-62,-26,-62,-57, 47,-46,-31,-29, -9,-33,-59,-77,-49;
/M: SY='W';  M=-14,-21,-15,-11,-22,-47, 32,-49, 25,-26,-41,  6,-31,  8, -2,  6,-32,-44,113, 44;
/M: SY='W';  M=-39,-52,-64,-58, 56,-63,-53, 45,-41, 34,  1,-57,-59,-54,-54,-52,-40, 30, 56,  3;
/M: SY='R';  M= -6,-52,  8, 23,-49,-21,-39,-12, 19,-26,-39,  4,-45, 21, 26,  7, 24,  4, 13,-26;
/M: SY='F';  M=-27,-50,-64,-59, 74,-63,-52, 37,-56, 33,-19,-57,-60,-57,-55,-51,-40, 31,-37, -6;
/M: SY='T';  M=-14,-24, 12, 16,-30, -1,-25,-23,  8,-46,-42,  1, -9,-15, -9, 32, 45,  2,-29,-28;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	41 in 27 different sequences
Number of true positive hits	41 in 27 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	1
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	97.62 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	window20
Author [info]	V_Lesaux
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CBM6
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

27 sequences

AAGAR_ALTAG (Q9LAP7), AAGAR_THASX (A1IGV8), AGAA_MICTH  (Q6F4N4),

AGAO_MICTH  (Q5KTI5), CFGA_TACTR  (Q27082), CTA1_NIACI  (P94286), 
CTA2_NIACI  (P70873), CTSY_SPOGL  (Q8RQV0), CTSZ_SPOGL  (Q8RQU9), 
EBDG_AMYOR  (Q56F26), ENG1_HALH5  (Q9KG76), GAASE_BIFLL (P0DXE8), 
IMD_ARTGO   (Q44052), MA26A_THET4 (G2Q4H7), MANA_PIRSP  (P55296), 
MANA_RHOM4  (P49425), MANB_PIRSP  (P55297), MANC_PIRSP  (P55298), 
PLH16_FORAG (T2KM09), XY11A_PSEXY (P83513), XYNA1_THEST (Q8GJ44), 
XYNA2_THEST (P33558), XYNB_CELJU  (P23030), XYNC_CELJU  (P23031), 
XYND_BACSU  (Q45071), XYND_PAEPO  (P45796), XYNZ_ACET2  (P10478)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

1 sequence

AAASE_BIFPS (P0DXG1)

PDB
[Detailed view]

34 PDB

1NAE; 1O8P; 1O8S; 1OD3; 1UX7; 1UY1; 1UY2; 1UY3; 1UY4; 1W0N; 1W9S; 1W9T; 1W9W; 2VZO; 2VZP; 2VZQ; 2VZR; 2VZS; 2VZT; 2VZU; 2VZV; 2X05; 2X09; 3C7E; 3C7F; 3C7G; 3C7H; 3C7O; 3WNK; 3WNL; 3WNM; 3WNN; 3WNO; 3WNP
» more