PROSITE entry PS51183
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | JMJN |
Accession [info] | PS51183 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-FEB-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 03-MAY-2023 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51183 |
Associated ProRule [info] | PRU00537 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | JmjN domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0609195; R2=0.0138589; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2398.1782227; R2=1.2883356; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=465; H_SCORE=2997; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; H_SCORE=2812; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -2,-21, -8,-30,-25, -6,-30,-25, 26,-24, 7, 8,-13,-22,-20,-25,-12, -7, 20,-26, -9,-25; /M: SY='P'; M= -9,-21,-34,-14, -4,-22,-22,-19,-10,-13,-14,-10,-21, 56, -9,-18,-12, -9,-17,-28,-23,-10; /M: SY='V'; M= -1,-17,-15,-20,-14, -7,-24,-20, 9,-10, 1, 5,-16,-20,-14, -8, -3, 7, 20,-27,-10,-15; /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-37,-29, 46,-32,-23, 15,-28, 16, 7,-23,-28,-33,-22,-19, -8, 14, -5, 15,-29; /M: SY='R'; M=-12, -4,-26, -7, 1, -9,-22, -3,-10, 5, -9, -6, 0,-18, 0, 8, -8, -3,-12,-16, 5, -2; /M: SY='P'; M= -9,-20,-34,-14, -4,-21,-22,-20,-12,-14,-14,-12,-20, 61,-12,-19,-11, -5,-21,-28,-23,-12; /M: SY='T'; M= 3, -1,-15, -7, -4,-17,-15, -7,-17, 0,-18,-11, 2,-11, -3, -4, 15, 25, -7,-29,-10, -4; /M: SY='M'; M= -8,-13,-30,-14, -2,-12,-14,-10,-10, 1,-10, 4,-13,-11, -2, -5,-14,-13,-12, 1, -1, -2; /M: SY='E'; M= -5, 1,-27, 3, 24,-27,-17, -3,-23, 17,-20, -8, -1, -8, 18, 11, -1, -7,-21,-25,-14, 20; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 23, 54,-31,-19, 1,-30, 9,-21,-19, 2, -1, 21, 0, 0,-10,-30,-30,-19, 38; /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-38,-28, 67,-29,-18, 4,-28, 15, 7,-21,-29,-35,-19,-21,-10, 2, 5, 25,-27; /M: SY='K'; M= -1, -1,-23, 0, 4,-24,-16, -6,-19, 5,-20,-11, -2, -2, 2, 1, 3, 2,-12,-28,-14, 2; /M: SY='D'; M=-17, 42,-27, 49, 13,-33, -8, 3,-34, 3,-29,-26, 29,-14, 1, 0, 2, -7,-29,-38,-19, 6; /M: SY='P'; M=-11,-21,-31,-19,-11, 1,-15,-18,-13,-16,-15, -8,-17, 37,-18,-19,-11, -8,-18,-18,-12,-16; /M: SY='L'; M= -9,-21,-25,-23,-11, -2,-27,-13, 14,-18, 17, 15,-19,-15, -7,-16,-16, -8, 4,-19, 0,-11; /M: SY='D'; M= -4, 1,-24, 3, 2,-21, -3, -8,-19, -1,-17,-12, 0,-14, 0, -6, 2, -5,-16,-24,-10, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25, 53,-30, 2, 0,-19, 5, 0,-20,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 21, 57,-25; /M: SY='I'; M=-12,-28,-19,-37,-28, 9,-37,-24, 34,-28, 16, 14,-21,-24,-21,-27,-20,-10, 20,-15, 8,-28; /M: SY='E'; M= -4, 6,-25, 12, 30,-27,-14, -5,-27, 11,-23,-18, 3, -6, 11, 5, 6, -3,-22,-30,-18, 20; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M= -5, -9,-24, -9, 1,-17,-19, -5,-14, 9, -9, -4, -5,-16, 1, 10, -5, -5,-10,-24, -9, -1; /M: SY='I'; M= -9,-26,-24,-30,-22, 5,-34,-19, 29,-22, 16, 12,-22,-24,-18,-21,-18, -8, 22,-14, 10,-23; /M: SY='E'; M= -8, 10,-24, 9, 15,-24,-14, -3,-25, 10,-22,-16, 11,-12, 6, 15, 4, 1,-21,-29,-16, 9; /M: SY='Q'; M= -9, 1,-29, 5, 7,-26,-17, -1,-23, 10,-23,-12, -1, -1, 15, 9, -2, -7,-23,-22, -8, 10; /M: SY='M'; M=-10,-14,-24,-19,-12, -2,-20,-10, 2, -9, 6, 7,-10,-21, -5, -6,-12, -5, -3,-17, 1,-10; /M: SY='G'; M= 20,-11,-21,-15,-17,-25, 37,-21,-25,-16,-20,-15, -5,-17,-17,-20, 3,-11,-14,-21,-25,-17; /M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -7, 7,-18,-14, -4,-13, 2,-10, -3, -6,-14, 1, 1, -4, -7,-10,-25,-12, 3; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='K'; M= -9, -4,-27, -3, 7,-25,-19,-11,-23, 31,-24,-10, -3, -8, 5, 22, -5, -7,-14,-24,-12, 5; /M: SY='Y'; M= -4,-11,-22,-14,-14, 13,-18, 6, -7,-11, -9, -7, -7,-23, -9,-11, -1, -2, -9, 3, 37,-14; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M= 5,-23, -7,-31,-23, -6,-25,-22, 20,-21, 10, 14,-19,-21,-16,-23,-12, -7, 16,-24, -8,-21; /M: SY='C'; M= 1,-24, 33,-30,-27, -9,-27,-28, 5,-24, 1, -1,-23,-30,-26,-24,-10, -5, 18,-34,-17,-27; /M: SY='K'; M=-12, -3,-23, -4, 6,-27,-20, -9,-30, 42,-27,-10, -1,-14, 8, 36,-10,-10,-20,-21,-11, 6; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-34,-29, 1,-34,-29, 36,-25, 18, 15,-26,-26,-25,-24,-16, -5, 39,-25, -5,-29; /M: SY='I'; M= -7,-26,-22,-31,-24, -4,-33,-26, 30,-15, 9, 11,-21,-23,-19,-14,-15, -6, 30,-24, -5,-24; /M: SY='P'; M= -7,-20,-36,-14, -4,-26,-21,-19,-13, -9,-23,-15,-18, 65, -9,-14,-10, -9,-22,-28,-25,-11; /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13, -3,-27,-22,-21,-13,-12,-25,-16,-20, 80,-11,-21,-11,-10,-24,-29,-27,-12; /M: SY='P'; M= 0, -2,-25, 2, 6,-25,-13,-13,-18, -3,-23,-17, -3, 21, -4,-11, 3, -3,-16,-31,-22, -1; /M: SY='D'; M= -3, 11,-23, 14, 9,-20, 4, -8,-27, -7,-23,-20, 9,-12, -4,-11, 7, -5,-21,-29,-18, 3; /M: SY='W'; M=-12,-34,-37,-37,-28, 20,-21,-27,-11,-21,-11,-13,-32,-28,-24,-20,-29,-21,-15, 92, 22,-22; /M: SY='K'; M=-10, 0,-16, 0, 1,-22,-18, -9,-21, 13,-15, -9, 0,-16, 3, 12, -4, -3,-15,-27,-12, 1; /M: SY='P'; M=-10,-10,-21, -7, 2,-27,-19,-15,-21, 0,-26,-15, -9, 43, -5,-10, -8, -9,-25,-30,-24, -5; /M: SY='P'; M=-12,-14,-33, -9, 5,-17,-22,-12,-19, 0,-18,-12,-13, 33, -1, -1,-10,-10,-23,-23,-16, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
PROMOTED_BY | PS51184 |
Numerical results [info]
Total number of hits | 56 in 56 different sequences |
Number of true positive hits | 56 in 56 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | JmjN |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]