PROSITE entry PS51230
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | EB1_C |
| Accession [info] | PS51230 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51230 |
| Associated ProRule [info] | PRU00576 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | EB1-C terminal (EB1-C) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6025920; R2=0.0113639; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4159.9306641; R2=4.2143826; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=519; H_SCORE=6347; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=343; H_SCORE=5605; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -2, -2,-24, -4, 4,-19,-10, -4,-14, -7,-14, -9, 1, 0, -1, -9, 1, 0,-15,-28,-15, 0; /M: SY='L'; M= -2,-13,-20,-14, -9, -6,-10,-15, -2,-16, 9, 0,-11,-21,-11,-13, -9, -7, -2,-24,-10,-10; /M: SY='N'; M= 3, 9,-22, 7, 10,-25, -6, -6,-21, 0,-23,-17, 12, -4, 2, -6, 8, -2,-19,-31,-20, 5; /M: SY='E'; M= 3, 4,-22, 2, 7,-21, -7, -9,-15, -3,-14,-12, 5,-13, -1, -8, 2, -4,-13,-28,-17, 3; /M: SY='B'; M= 1, 4,-21, 1, 2,-19,-12, -8,-14, -2,-10, -7, 4,-12, 1, -6, 0, -1,-13,-27,-14, 1; /M: SY='D'; M=-11, 16,-25, 17, 9,-22,-13, -3,-26, 8,-25,-18, 14, -8, 3, 6, 3, -3,-23,-30,-15, 5; /M: SY='Q'; M= 1, 5,-22, 4, 5,-23,-13, 3,-16, -4,-15, -9, 5,-13, 8, -7, 4, -1,-15,-28,-12, 5; /M: SY='E'; M= -5, 6,-23, 7, 18,-25,-17, -5,-17, 2,-17,-12, 3, -7, 12, -3, 2, -1,-15,-29,-16, 15; /M: SY='I'; M= -6,-17,-21,-23,-18, -5,-27,-20, 18,-14, 9, 9,-12,-21,-14,-14,-10, -2, 15,-25, -6,-18; /M: SY='E'; M= -4, 1,-26, 2, 13,-25,-12, -7,-19, 2,-19,-12, 2, -2, 8, -1, 2, -5,-19,-28,-17, 9; /M: SY='E'; M= 3, 1,-23, 1, 10,-19,-15, -5,-16, 4,-14,-11, -1,-11, 1, -4, 0, -4,-14,-23, -9, 5; /M: SY='L'; M= -9,-24,-21,-25,-16, 0,-27,-15, 12,-19, 26, 15,-23,-19,-11,-12,-20, -6, 7,-21, -2,-14; /M: SY='Q'; M= -5, 2,-21, -3, 2,-20,-17, -7,-10, 2,-15, -4, 5,-13, 8, -2, 5, 6,-10,-28,-12, 4; /M: SY='E'; M= 2, 6,-20, 5, 12,-25,-11, -2,-23, 3,-22,-15, 6,-10, 8, -1, 11, 4,-17,-30,-15, 9; /M: SY='E'; M= -8, 1,-26, 3, 20,-26,-18, -2,-19, 8,-17, -9, 2,-10, 20, 5, 1, -5,-20,-27,-14, 20; /M: SY='M'; M= -6,-21,-17,-26,-18, -2,-25,-14, 14,-16, 17, 20,-20,-18,-13,-15,-18, -8, 9,-21, -2,-17; /M: SY='S'; M= -1, -1,-20, -3, 3,-18,-16, 0,-13, -3,-14, -8, 1,-12, 4, -6, 7, 6,-10,-27, -8, 3; /M: SY='D'; M=-11, 22,-26, 28, 25,-31,-14, 0,-28, 5,-24,-19, 13, -9, 12, -2, 4, -3,-25,-33,-18, 19; /M: SY='L'; M= -9,-20,-22,-22,-12, 9,-24,-13, 4,-19, 14, 6,-19,-23,-13,-15,-14, -6, 0, -6, 7,-12; /M: SY='E'; M= -6, 5,-25, 6, 13,-26,-15, -5,-21, 12,-20,-12, 5,-11, 11, 7, 1, -5,-19,-27,-14, 11; /M: SY='I'; M= -1,-12,-21,-15, -6,-10,-22,-17, 7,-16, 5, 1, -9,-17, -8,-16, -3, 0, 4,-26,-10, -8; /M: SY='T'; M= -3, -8,-22,-11, -1,-12,-20, -6, -7, 0, -5, 0, -7,-15, 0, -4, -3, 1, -6,-21, -3, -2; /M: SY='I'; M= 0,-14,-21,-21,-16, -8,-22,-18, 12, -9, 0, 5, -8,-19,-11, -9, -6, -4, 10,-24, -8,-15; /M: SY='E'; M= -9, 12,-27, 19, 31,-29,-17, -2,-28, 10,-22,-16, 3, -6, 16, 1, 1, -6,-25,-28,-16, 24; /M: SY='G'; M= -3, -1,-25, 1, -3,-22, 6, -8,-20, -8,-17,-12, 0,-15, -7, -8, 1, -6,-15,-27,-16, -6; /M: SY='L'; M= -6,-27,-21,-30,-22, 6,-29,-18, 23,-24, 30, 19,-25,-26,-18,-20,-22, -8, 16,-17, 4,-21; /M: SY='E'; M=-10, 0,-28, 5, 30,-22,-22, -5,-15, 5, -7, -5, -6, -8, 11, -2, -7,-10,-17,-26,-13, 20; /M: SY='K'; M= -7, -1,-17, -1, 6,-19,-18,-11,-23, 18,-22,-12, -2,-13, 1, 10, -2, -4,-13,-25,-12, 4; /M: SY='E'; M= -6, 10,-27, 18, 49,-29,-18, -3,-28, 7,-19,-19, 0, -2, 15, -3, 2, -6,-26,-30,-19, 32; /M: SY='R'; M=-17, -8,-29, -8, 1,-21,-19, -2,-29, 29,-22,-11, 1,-18, 9, 61, -7, -8,-19,-21,-11, 1; /M: SY='D'; M=-16, 41,-27, 50, 19,-33, -9, 2,-32, 1,-27,-23, 25,-11, 2, -7, 1, -8,-29,-38,-19, 10; /M: SY='F'; M=-19,-25,-21,-34,-21, 65,-29,-17, -3,-25, 6, -1,-17,-27,-29,-17,-17,-10, -4, 5, 24,-21; /M: SY='Y'; M=-19,-21,-20,-22,-21, 25,-31, 13, 1,-13, 0, 0,-20,-30,-12,-13,-19,-10, -7, 22, 68,-21; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -6, 0,-23, 7, 0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27; /M: SY='N'; M= 0, 12,-18, 6, -1,-22, 6, -5,-21, -6,-26,-18, 21,-16, -3, -6, 15, 2,-18,-35,-21, -2; /M: SY='K'; M=-11, -2,-29, -2, 8,-28,-20, -9,-27, 45,-26, -6, -1,-11, 9, 30,-11,-10,-18,-20, -9, 8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 22,-30, 48, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 11,-20, 0,-21; /M: SY='R'; M=-17, -9,-29, -9, 2,-22,-21, -1,-26, 26,-17, -7, -2,-18, 14, 53,-10,-10,-19,-20, -9, 5; /M: SY='D'; M= -8, 17,-24, 21, 12,-21,-13, -4,-24, -2,-17,-16, 9,-13, 2, -3, 1, -4,-20,-30,-14, 7; /M: SY='I'; M= -5,-29,-24,-36,-28, 0,-35,-28, 40,-27, 20, 16,-23,-23,-21,-26,-18, -7, 30,-22, -3,-28; /M: SY='E'; M=-12, 16,-30, 28, 54,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 3, -2, 17, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 35; /M: SY='I'; M=-10,-18,-26,-20,-17, -8,-19,-14, 12,-19, 10, 7,-14,-22,-11,-14,-16,-11, 6,-22, -6,-16; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22, 11,-31,-21, 24,-29, 40, 21,-27,-28,-20,-21,-27,-10, 14,-19, 1,-22; /M: SY='C'; M= -5,-23, 34,-29,-26, -6,-27,-23, 2,-23, 4, 5,-23,-31,-23,-22,-12, -5, 13,-32,-12,-25; /M: SY='Q'; M=-13, 13,-29, 16, 21,-35,-17, 18,-26, 5,-22, -9, 9,-11, 35, 3, -1,-11,-30,-27,-10, 27; /M: SY='D'; M=-11, 19,-25, 22, 21,-27,-14, 4,-25, 0,-20,-16, 13,-10, 11, -4, 4, -2,-24,-33,-15, 16; /M: SY='H'; M= -3, -9,-23,-12, -7,-13,-19, 6, -7, -9, -6, 0, -6, -8, -4, -7, -5, -2, -7,-24, -3, -8; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='E'; M= -6, -3,-20, -3, 11,-14,-18, -8, -7, -1, -4, -4, -3,-10, 4, -4, -2, 0, -9,-22,-10, 7; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='N'; M= -5, 5,-14, 2, 3,-11,-10, -3, -5, -5, -6, -5, 9,-12, 1, -5, 0, -2, -8,-21, -9, 2; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='P'; M= -4, 0,-19, 1, -1,-17, 3, -9,-17, -4,-16,-12, 2, 4, -5, -7, 2, -3,-15,-21,-15, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='N'; M= -7, 3,-21, 0, -2,-18, -8, -6,-13, 1,-12, -4, 5,-12, 1, -3, 0, -3,-13,-27,-13, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='E'; M= -5, 7,-16, 9, 13,-23,-15, -8,-17, -5,-19,-15, 6,-10, 5, -8, 10, 5,-15,-34,-17, 8; /M: M= -6, -2,-23, -1, -2,-16,-14, -3, -7,-11, -4, -2, -5,-13, -6,-13, -6, -5, -5,-28,-10, -5; /M: SY='B'; M= -5, 5,-20, 4, -2,-14,-15, -9,-11, -7, -9, -9, 4,-18, -5, -7, 1, 0, -7,-30,-12, -3; /M: SY='E'; M=-11, -1,-31, 5, 15,-26,-21, -9,-14, -3,-17,-10, -5, 15, 6, -8, -5, -9,-18,-29,-18, 8; /M: SY='L'; M=-11,-21,-21,-23,-18, 15,-28,-19, 13,-24, 22, 9,-20,-25,-20,-19,-18, -7, 9,-18, 2,-19; /M: SY='V'; M= -5,-25, 7,-29,-23, -4,-28,-24, 13,-20, 13, 10,-24,-28,-21,-19,-16, -7, 17,-28,-10,-23; /M: SY='K'; M= -7, 5,-25, 2, 7,-21, -6, -6,-24, 13,-25,-13, 10,-13, 5, 6, 2, -4,-20,-26,-14, 6; /M: SY='R'; M= -9, 0,-28, 2, 7,-23,-13, -1,-27, 17,-21,-12, 0,-14, 8, 25, -4, -9,-21,-21, -8, 6; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29, 1,-37,-29, 43,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 32,-22, -2,-29; /M: SY='Q'; M= -9, -6,-26, -6, 5,-21,-21, 2,-14, 10,-12, -1, -5,-15, 17, 6, -6, -7,-15,-20, -2, 10; /M: SY='E'; M= 3, 6,-23, 8, 15,-27,-12, -7,-23, 6,-20,-14, 1, -9, 9, -1, 4, 0,-18,-27,-16, 12; /M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30, 0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-30,-20, 22,-29, 47, 22,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 11,-20, 0,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='A'; M= 14, 4,-17, 0, 5,-24, -6, -9,-20, 2,-22,-15, 7,-10, 4, -5, 14, 2,-14,-29,-18, 4; /M: SY='T'; M= 4, -1,-12, -7, -4,-14,-15,-16,-14, -7,-15,-12, 1,-10, -6, -6, 20, 35, -4,-31,-13, -5; /M: SY='E'; M=-11, 7,-27, 8, 20,-22,-19, -1,-14, 0,-15, -8, 5, -6, 11, -5, -2, -6,-19,-27,-11, 14; /M: SY='D'; M= -8, 18,-27, 26, 24,-30, -8, -4,-27, 0,-22,-19, 7, -9, 5, -7, 0, -9,-22,-32,-20, 14; /M: SY='G'; M= -5, 0,-28, 1, 10,-28, 16, -9,-28, -3,-23,-15, 3,-12, 4, -7, 0,-10,-26,-24,-21, 7; /M: SY='F'; M=-13, -4,-24, -3, 2, 7,-23, -7,-10,-10, -8, -8, -7,-17, -5,-11, -6, -6,-10,-14, 5, -1; /M: SY='E'; M= -5, -8,-25, -5, 9,-13,-18,-13, -6, -9, -6, -7, -9, -7, -3,-13, -4, -6, -7,-26,-13, 2; /M: M= -2, -9,-22,-10, -6,-17, -8, -6, -8,-12,-10, -6, -5, -9, -7,-13, 0, -3, -5,-28,-13, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 26 in 26 different sequences |
| Number of true positive hits | 26 in 26 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | EB1 C-terminal |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
26 sequences
BIM1_YEAST (P40013), EB1A_ARATH (Q7XJ60), EB1B_ARATH (Q9FJJ5), EB1C_ARATH (Q9FGQ6), EB1_DICDI (Q8WQ86), EB1_GIAIC (E2RU10), MAL3_SCHPO (Q10113), MARE1_BOVIN (Q3ZBD9), MARE1_CHICK (Q5ZLC7), MARE1_COTCO (Q6V291), MARE1_COTJA (Q66T82), MARE1_HUMAN (Q15691), MARE1_MOUSE (Q61166), MARE1_PONAB (Q5R7Z5), MARE1_RAT (Q66HR2), MARE1_XENTR (Q6P848), MARE2_BOVIN (Q3SZP2), MARE2_CHICK (Q5ZKK1), MARE2_HUMAN (Q15555), MARE2_MOUSE (Q8R001), MARE2_PONAB (Q5R4I6), MARE2_RAT (Q3B8Q0), MARE2_XENLA (Q7ZXP1), MARE3_HUMAN (Q9UPY8), MARE3_MOUSE (Q6PER3), MARE3_RAT (Q5XIT1)» more
|
| PDB [Detailed view] |
33 PDB
1TXQ; 1WU9; 1YIB; 1YIG; 2HKQ; 2HL5; 2R8U; 3GJO; 3MTU; 3MUD; 3TQ7; 4E61; 4XA1; 4XA3; 4XA6; 5JV3; 5JVM; 5JVP; 5JVR; 5JVS; 5JVU; 5JX1; 5M97; 5M9E; 5WLQ; 6EVI; 6EVQ; 6PF2; 6PFP; 6YF5; 6YSH; 7OLG; 7SJ9 » more |