PROSITE entry PS51276
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PEPTIDASE_C56_PFPI |
| Accession [info] | PS51276 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51276 |
| Associated ProRule [info] | PRU00608 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PfpI endopeptidase domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=167; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=167; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1337969; R2=0.0157499; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11890.5410156; R2=19.6446648; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2354; H_SCORE=58134; N_SCORE=39.2; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; H_SCORE=17352; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-40; I=-40; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -7, -6,-23, -7, 2,-23,-17, -8,-22, 25,-20, -7, -4,-13, 4, 22, -7, -8,-14,-23,-11, 2; /M: SY='R'; M=-10, -4,-26, -6, 2,-23,-19, -8,-23, 28,-21, -9, -1,-15, 6, 33, -6, -6,-14,-22,-11, 2; /M: SY='V'; M= -1,-28,-18,-33,-27, 1,-31,-28, 32,-23, 15, 13,-24,-25,-24,-23,-14, -5, 34,-24, -6,-27; /M: SY='A'; M= 18,-20,-16,-26,-17, -3,-15,-22, 8,-20, 14, 4,-19,-20,-17,-21, -9, -5, 8,-19, -9,-17; /M: SY='I'; M= -6,-28,-22,-35,-27, 9,-32,-25, 32,-25, 18, 17,-22,-23,-22,-24,-17, -7, 25,-18, 0,-26; /M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-32,-23, 8,-31,-23, 25,-27, 33, 17,-26,-26,-21,-22,-22, -6, 18,-20, -1,-23; /M: SY='A'; M= 16,-13,-10,-20,-15,-10,-16,-21, 3,-16, 1, -2,-12,-17,-14,-18, 3, 9, 9,-26,-13,-15; /M: SY='G'; M= 4, 6,-21, 4, 1,-24, 7,-12,-24, -8,-21,-17, 5, -8, -6,-12, 7, 4,-18,-28,-20, -3; /M: SY='D'; M=-13, 27,-27, 35, 13,-28,-12, 2,-30, 0,-25,-22, 14, -9, 2, -6, 1, -6,-26,-30,-14, 7; /M: SY='G'; M= -1,-12,-26,-12,-10,-15, 24,-10,-22,-15,-13,-10, -6,-19,-13,-14, -5,-14,-18,-18,-12,-12; /M: SY='F'; M=-11,-26,-18,-32,-27, 37,-25,-19, 8,-23, 7, 3,-20,-27,-30,-19,-13, -4, 12, -5, 15,-26; /M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 21, 56,-31,-20, 1,-30, 10,-20,-19, 1, -1, 22, 0, 0,-10,-30,-30,-19, 39; /M: SY='D'; M=-13, 22,-28, 32, 27,-33,-15, 2,-30, 5,-23,-19, 8, -8, 15, -1, 0, -9,-27,-32,-17, 20; /M: SY='V'; M= -2,-17,-19,-18,-16, -3,-22,-12, 7,-17, 6, 3,-15,-18,-14,-15, -6, -1, 8,-21, 0,-16; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19, 0,-31, 9,-21,-21, 1, -1, 19, -1, 0,-10,-30,-31,-20, 38; /M: SY='L'; M= -9,-26,-19,-29,-22, 18,-29,-19, 15,-26, 30, 12,-24,-27,-22,-19,-20, -3, 10,-14, 7,-22; /M: SY='L'; M= -7,-19,-22,-23,-16, 2,-24,-17, 4,-16, 5, 5,-17,-21,-12,-14, -9, 4, 3, 0, 3,-14; /M: SY='Y'; M= -7,-12,-24,-12, -7, -1,-19, 0, -5, -6, -8, -4,-12,-21, -6, -7, -6, -5, -3, -7, 20, -9; /M: SY='P'; M= -8,-20,-37,-11, -2,-28,-20,-20,-17,-10,-27,-18,-20, 80,-11,-20, -9, -8,-25,-30,-28,-11; /M: SY='Y'; M=-12,-18,-22,-20,-14, 4,-25, -8, -4, -4, 2, 1,-17,-25,-10, 2,-16, -8, -3, -1, 14,-13; /M: SY='Y'; M=-15, 2,-28, 3, 4,-12,-21, 7,-15, 3,-12, -6, 0,-17, 7, 3, -9,-10,-18,-15, 8, 4; /M: SY='R'; M= 5,-10,-22,-13, -5,-16,-12, -8,-18, 9,-12, -6, -6,-17, 0, 24, -5, -7,-11,-19,-10, -5; /M: SY='L'; M=-11,-30,-16,-32,-23, 19,-30,-21, 17,-29, 38, 16,-28,-30,-24,-20,-26, -9, 12,-17, 3,-23; /M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -1, 17,-26,-21, -2,-23, 21,-18, -8, -3,-12, 20, 25, -7,-10,-20,-23,-12, 17; /M: SY='E'; M= -6, 8,-27, 14, 34,-28,-17, -3,-25, 8,-18,-15, 1, -6, 15, 0, 0, -8,-23,-28,-17, 24; /M: SY='A'; M= 20, -6,-19, -8, 9,-21,-11,-13,-14, -1,-13,-11, -9,-10, 0, -9, 2, -5, -7,-20,-15, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-26,-10,-20,-30, 68,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-21,-30,-20; /M: SY='A'; M= 10,-17,-18,-22,-17, 3,-11, -3, -7,-16, -5, -5,-13,-20,-15,-17, -7, -9, -5, -3, 8,-16; /M: SY='E'; M= -6, 10,-24, 12, 25,-25,-15, 3,-25, 4,-21,-16, 7, -8, 10, 1, 5, 2,-22,-30,-15, 17; /M: SY='V'; M= -1,-24,-13,-25,-24, -4,-27,-27, 19,-18, 4, 4,-24,-17,-25,-18, -5, 6, 34,-30,-12,-25; /M: SY='T'; M= -6, -3,-19, -2, -7,-12,-22, -7, -3,-11, -4, -3, -7,-18,-10,-12, -2, 6, 5,-29, -7, -9; /M: SY='V'; M= -2,-26,-17,-29,-24, 1,-29,-21, 24,-23, 16, 11,-23,-25,-22,-20,-13, -3, 28,-25, -5,-24; /M: SY='V'; M= 17,-22,-16,-28,-21, -7,-20,-24, 18,-19, 7, 5,-19,-19,-18,-22, -6, -3, 21,-21, -9,-21; /M: SY='A'; M= 17, -6, -8,-11, -9,-22, 13,-17,-22,-13,-21,-16, -2,-14,-10,-16, 15, 4,-12,-28,-22, -9; /M: SY='P'; M= -5,-14,-30,-11, -5,-18,-19,-18,-13, -8,-17,-12,-13, 38,-10,-13, -5, -2,-17,-27,-19,-10; /M: SY='E'; M= -7, 5,-26, 9, 21,-27, -6, -4,-29, 9,-24,-17, 4, -9, 7, 5, 3, -4,-23,-28,-17, 14; /M: SY='K'; M= 3, -6,-25, -7, -2,-24, -5,-14,-21, 9,-18,-11, -5, -3, -2, 2, -3, -4,-15,-23,-16, -2; /M: SY='G'; M= -5, 4,-28, 5, -1,-29, 20,-10,-33, 4,-27,-18, 7,-15, -4, 3, -1,-12,-25,-25,-21, -3; /I: I=-10; MD=-25; /M: SY='K'; M= 0, -4,-15, -4, 4,-14,-10, -6,-11, 8,-10, -5, -3, -5, 4, 7, -1, -3, -8,-14, -8, 3; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='T'; M= -3, -3,-18, -4, 7,-16,-18,-11,-10, -1,-12, -8, -4, -4, 2, -4, 6, 12, -6,-25,-12, 4; D=-10; /I: I=-10; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-11,-24,-20,-28,-24, 14,-31,-11, 17,-19, 9, 7,-21,-26,-19,-17,-16, -5, 13, -5, 25,-24; /M: SY='R'; M= -6, -5,-23, -8, 1,-22,-19, -9,-15, 11,-15, -4, -3,-13, 11, 12, 0, 4,-11,-23,-10, 5; /M: SY='G'; M= 6, -5,-24, -6, -3,-26, 31,-16,-30,-12,-23,-18, -1,-14, -9,-15, 6, -6,-22,-24,-24, -6; /M: SY='K'; M=-10,-15,-27,-16, -8, -7,-22,-14,-11, 13,-12, -1,-14,-19, -6, 6,-14,-10, -6, 2, 2, -6; /M: SY='H'; M=-12, 3,-27, 2, 5,-21,-17, 13,-23, 11,-20, -8, 7, -9, 8, 12, -4, -8,-22,-25, -5, 5; /M: SY='G'; M= -3, -9,-29, -9,-14,-27, 43, -4,-32,-15,-25,-13, 0,-19,-11,-14, -1,-17,-26,-22,-20,-13; /M: SY='Y'; M=-14, -1,-26, 1, -5, -6,-21, 9,-11, -7, -7, -4, -6,-17, -6, -7, -9, -5,-10,-15, 13, -7; /I: I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='T'; M= -4, -5,-23, -6, -2,-20,-13,-13,-19, 4,-19,-12, -3, 2, -2, 2, 3, 8,-15,-23,-14, -3; /M: SY='V'; M= -4,-26,-15,-30,-25, 17,-27,-18, 13,-22, 12, 7,-23,-27,-25,-19,-15, -5, 18,-10, 8,-24; /M: SY='T'; M= -5, 3,-23, 3, 5,-24,-17,-10,-20, 6,-20,-13, 0, -1, 3, 3, 3, 8,-14,-28,-15, 3; /M: SY='V'; M= 8,-19,-14,-20,-14,-12,-19,-22, 4,-16, -3, -3,-18, -2,-16,-19, -2, 0, 10,-28,-16,-16; /M: SY='D'; M=-16, 36,-27, 48, 17,-33,-12, 1,-32, 0,-25,-23, 18,-11, 3, -7, 1, -4,-26,-37,-17, 10; /M: SY='A'; M= 5,-16,-20,-21,-13, -7,-17,-14, 1, -9, 4, 3,-14,-19,-11,-10, -8, -4, 3,-21, -6,-13; /M: SY='S'; M= 13, -5,-14, -9, -7,-15, -6,-15,-14, -9,-16,-13, -1, -8, -8,-11, 15, 14, -6,-27,-14, -8; /M: SY='F'; M= -6,-27,-20,-32,-24, 24,-28,-21, 16,-25, 19, 10,-22,-25,-24,-21,-17, -6, 13,-11, 8,-24; /M: SY='D'; M= 2, 16,-22, 20, 8,-28, -7, -7,-27, 2,-24,-19, 8,-11, 1, -2, 8, -2,-19,-31,-18, 4; /M: SY='D'; M=-12, 23,-29, 35, 34,-33,-14, 1,-32, 5,-24,-22, 8, -6, 11, -4, 0, -8,-28,-33,-18, 23; /M: SY='V'; M= 12,-24,-12,-28,-23, -4,-22,-26, 18,-19, 9, 7,-24,-24,-22,-20, -7, -2, 30,-26,-11,-23; /M: SY='D'; M= -8, 14,-25, 16, 6,-27,-13, -4,-25, 13,-26,-16, 12,-10, 4, 7, 2, -3,-20,-29,-13, 5; /M: SY='P'; M= 11,-16,-22,-17, -8,-17,-15,-18, -6,-12,-14,-10,-15, 21,-12,-19, -1, -2, -4,-26,-19,-12; /I: I=-11; MD=-29; /M: SY='D'; M= 0, 16,-22, 19, 16,-28, -5, -5,-27, 1,-24,-19, 10, -9, 4, -5, 8, -3,-21,-32,-19, 10; D=-11; /I: I=-11; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='D'; M=-15, 32,-28, 45, 26,-34,-13, 0,-34, 4,-26,-24, 14, -8, 6, -3, 1, -7,-28,-35,-19, 16; D=-11; /I: I=-11; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-19,-25,-22,-29,-24, 48,-30, 0, 1,-19, 6, 1,-21,-30,-23,-15,-20,-10, -4, 17, 53,-24; /M: SY='D'; M=-14, 40,-28, 55, 17,-36,-10, 0,-34, -1,-27,-26, 17,-10, 1,-10, 1, -9,-27,-37,-19, 9; /M: SY='A'; M= 25,-13,-14,-18,-15,-19, 16,-20,-15,-16,-10,-10,-10,-16,-15,-20, 2, -7, -7,-21,-21,-15; /M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-24, 6,-31,-24, 26,-28, 37, 18,-29,-29,-22,-21,-24, -8, 22,-22, -2,-24; /M: SY='V'; M= -4,-29,-15,-32,-28, 11,-30,-26, 26,-24, 18, 12,-27,-28,-27,-21,-16, -4, 33,-22, -2,-27; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26, 6,-34,-26, 34,-28, 29, 17,-26,-26,-23,-24,-22, -8, 26,-21, -1,-26; /M: SY='P'; M= -6,-19,-36,-11, -1,-28,-19,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 76,-10,-19, -7, -7,-26,-29,-28,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-11,-15,-23,-19,-13, 4,-23, -6, -9, -5, -5, -3,-11,-21, -7, 6, -8, 1, -5, -4, 7,-11; /I: I=-12; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='A'; M= 19, 10,-11, -2, -5,-20, 1, -7,-16, -7,-21,-16, 19,-15, -5,-11, 14, 2,-14,-31,-20, -5; /M: SY='P'; M= 1,-18,-33,-12, -3,-27,-15,-20,-18,-10,-26,-18,-17, 65,-10,-20, -5, -8,-22,-28,-28,-10; /M: SY='D'; M=-17, 39,-30, 56, 29,-37,-11, 0,-37, 2,-27,-27, 15, -8, 5, -8, 0,-10,-30,-37,-20, 17; /M: SY='Y'; M=-11, -9,-26,-11, -4, -4,-20, 7,-14, 4, -9, -4, -5,-20, -1, 8,-10, -8,-14,-11, 12, -5; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-23, 6,-31,-21, 27,-28, 39, 22,-27,-27,-19,-21,-26, -9, 17,-21, -1,-22; /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 29,-20,-10, 0,-20, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='R'; M= -9,-14,-23,-18,-12,-10,-18,-11, -2, -5, 1, 3, -9,-21, -3, 5, -9, -2, -2,-18, -5, -9; /M: SY='D'; M=-15, 28,-24, 33, 9,-23,-11, 9,-28, -3,-25,-20, 20,-15, 1, -7, 2, -6,-25,-30, -5, 4; /M: SY='P'; M= -4, 2,-29, 7, 14,-28,-16, -9,-21, 1,-22,-15, -3, 20, 2, -8, -3, -7,-21,-29,-21, 7; /M: SY='E'; M= -8, 9,-27, 13, 15,-28,-11, -1,-27, 11,-22,-14, 5,-11, 9, 11, -1, -8,-22,-28,-15, 11; /M: SY='A'; M= 18,-19,-13,-25,-19, -3,-14,-21, 5,-16, 2, 2,-18,-20,-18,-19, -2, 0, 15,-20, -9,-18; /M: SY='I'; M= -8,-22,-22,-25,-17, -6,-27,-18, 18,-16, 14, 12,-19,-23, -8,-11,-16, -8, 15,-23, -6,-14; /M: SY='E'; M= 2, 7,-23, 7, 12,-26,-12, -3,-24, 8,-21,-15, 6,-11, 7, 6, 4, -2,-19,-27,-16, 9; /M: SY='F'; M=-13,-30,-22,-37,-27, 38,-32,-22, 17,-30, 24, 11,-23,-27,-29,-22,-23,-10, 10, -7, 13,-27; /M: SY='V'; M= 7,-24,-12,-28,-25, -4,-25,-27, 22,-19, 6, 6,-23,-24,-24,-20, -5, 4, 35,-27,-10,-25; /M: SY='R'; M=-11, -6,-29, -6, 4,-26,-17, 1,-27, 27,-22, -8, -1,-15, 15, 39, -7,-10,-20,-21,-10, 7; /M: SY='D'; M= -3, 12,-25, 16, 14,-26,-13, 8,-26, 3,-21,-15, 5,-11, 8, -4, 2, -6,-21,-27, -8, 10; /M: SY='F'; M= -9,-25,-19,-34,-25, 43,-25,-14, 6,-23, 10, 13,-19,-25,-26,-18,-16, -9, 6, -4, 15,-23; /M: SY='F'; M= -1, -5,-19, -8,-12, 9,-17, -8, -8,-14, -5, -4, -6,-20,-16,-15, -5, -4, -4,-15, 3,-13; /M: SY='D'; M= -5, 11,-25, 14, 14,-27,-10, -2,-26, 6,-22,-16, 7,-11, 5, 2, 2, -3,-20,-29,-15, 9; /M: SY='A'; M= 9, 0,-20, -2, 7,-23,-11, -5,-17, -2,-15,-10, 1,-11, 9, -6, 6, -1,-15,-22,-14, 8; /M: SY='G'; M= -5, 6,-28, 5, -5,-29, 31, -6,-34, -5,-28,-18, 11,-17, -5, -8, 0,-14,-28,-26,-22, -5; /M: SY='K'; M=-10, -1,-29, -2, 7,-28,-20,-10,-27, 44,-27, -8, -1,-11, 8, 28, -9, -8,-17,-21,-10, 8; /M: SY='P'; M= -9,-21,-35,-15, -6,-21,-23,-21,-10,-14,-16,-12,-20, 58,-12,-20,-11, -6,-18,-24,-22,-13; /M: SY='V'; M= -5,-29,-19,-34,-29, 1,-34,-29, 36,-25, 17, 14,-25,-26,-25,-24,-15, -4, 37,-25, -5,-29; /M: SY='A'; M= 37,-12,-10,-20,-13,-13, 4,-20,-13,-13,-11,-11,-10,-13,-14,-20, 7, -3, -4,-19,-17,-13; /M: SY='A'; M= 33, -8,-12,-15, -7,-20, -3,-15,-11, -9,-13,-10, -6,-11, -6,-16, 12, 5, -2,-24,-18, -7; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29, 1,-37,-29, 44,-28, 20, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='G'; M= 14,-10,-24,-13,-17,-27, 50,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-14,-21,-20,-27,-17; /M: SY='P'; M= -2,-18,-33,-12, -5,-27, -7,-20,-18,-12,-25,-16,-16, 54,-11,-19, -6, -9,-21,-28,-27,-11; /M: SY='W'; M=-15,-25,-40,-25,-11, -6,-21,-16,-15,-11,-11, -9,-26,-23, 5,-10,-26,-21,-25, 72, 13, 0; /M: SY='I'; M= -4,-27,-19,-30,-24, 1,-30,-25, 27,-23, 20, 14,-24,-23,-21,-21,-15, -2, 27,-25, -5,-24; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-20, 10,-27,-19, 16,-28, 42, 18,-28,-24,-20,-20,-28,-10, 7,-19, -1,-20; /M: SY='I'; M= 6,-24,-18,-32,-25, -5,-28,-27, 28,-23, 9, 9,-19,-20,-19,-25, -9, -3, 25,-23, -8,-25; /M: SY='S'; M= 4, 11,-18, 12, 11,-23, -6, -5,-23, -4,-24,-19, 11,-10, 2, -8, 18, 6,-17,-34,-17, 7; /M: SY='A'; M= 40, -9,-10,-18,-10,-18, -3,-19,-10,-11,-10,-10, -8,-11,-10,-18, 13, 6, 0,-23,-19,-10; /M: SY='G'; M= -7, 7,-27, 11, -5,-31, 31,-11,-36, -7,-28,-19, 7,-17, -9, -9, -1,-15,-28,-26,-24, -7; /M: SY='V'; M= -4,-22,-19,-24,-18, -2,-27,-21, 19,-18, 18, 11,-21,-24,-17,-15,-16, -6, 20,-24, -7,-19; /M: SY='V'; M= 1,-27,-15,-29,-24, 1,-27,-25, 24,-23, 21, 12,-26,-26,-23,-21,-14, -4, 29,-25, -7,-24; /M: SY='K'; M= -9, 2,-28, 3, 12,-27,-17, -5,-28, 29,-25,-13, 3,-12, 11, 29, -4, -8,-21,-24,-13, 10; /M: SY='G'; M= -2, -2,-30, -1,-15,-31, 59,-17,-39,-17,-30,-21, 5,-19,-17,-18, 0,-18,-30,-23,-29,-16; /M: SY='R'; M=-16, -8,-30, -9, 1,-19,-21, -3,-25, 31,-20, -8, -2,-18, 8, 49,-11,-10,-18,-17, -4, 1; /M: SY='R'; M= -9, 0,-24, -2, 6,-23,-18, -8,-24, 22,-21,-11, 2,-12, 7, 24, 0, 5,-16,-24,-12, 5; /M: SY='L'; M= 1,-24, -9,-29,-22, -2,-22,-20, 15,-21, 18, 17,-22,-24,-17,-19,-15, -6, 15,-24, -8,-20; /M: SY='T'; M= 4, -1, -7,-11,-10,-11,-18,-20,-11,-11,-11,-10, -1,-11,-10,-11, 19, 43, 0,-30,-12,-10; /M: SY='S'; M= 16, -5, -4, -8, -7,-21, 6,-15,-21,-13,-24,-17, 1,-11, -7,-15, 23, 8,-10,-33,-22, -7; /M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-27,-24, 24,-27, -4, -3,-16, -4, -5,-24,-29,-18,-15,-20,-10, -7, 43, 46,-21; /M: SY='P'; M= -9,-15,-31,-14, -6,-12,-21,-11,-10, -9,-16,-10,-11, 25,-10,-13, -8, -6,-16,-18,-11,-10; /M: SY='S'; M= 14, -5,-17, -8, -6,-20, 8,-11,-20,-10,-21,-15, 1,-11, -7,-13, 16, 5,-12,-28,-18, -7; /M: SY='I'; M= -8,-29, -8,-34,-27, 1,-34,-27, 29,-28, 22, 14,-24,-27,-23,-26,-20, -8, 23,-25, -5,-27; /M: SY='R'; M= -8, -7,-27, -9, 2,-24,-18, -6,-23, 26,-20, -7, -2,-15, 10, 36, -7, -8,-16,-20,-11, 4; /M: SY='D'; M= -9, 10,-25, 17, 2,-23,-17, -9,-20, -4,-17,-15, 0, 2, -5, -9, -1, 1,-14,-31,-15, -2; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 60, 25,-38,-12, -1,-37, 1,-28,-28, 16, -9, 2, -9, 0,-10,-28,-38,-20, 14; /M: SY='L'; M= -7,-29,-15,-31,-25, 4,-30,-23, 25,-24, 29, 20,-28,-28,-22,-20,-21, -7, 25,-24, -4,-24; /M: SY='E'; M= -7, -7,-26, -6, 13,-19,-22,-11, -5, 1, -9, -5, -7,-11, 5, -1, -4, -5, -6,-26,-12, 7; /M: SY='N'; M= -3, 26,-19, 10, -3,-18, -4, 2,-14, -4,-20,-14, 40,-19, -2, -5, 6, -1,-21,-35,-18, -3; /M: SY='A'; M= 47,-10, -7,-19,-10,-20, -1,-20,-11,-11,-11,-11, -9,-11,-10,-20, 11, 1, -1,-22,-20,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 31,-11,-14,-17,-14,-23, 22,-20,-19,-14,-16,-13, -7,-14,-14,-20, 6, -7, -9,-21,-23,-14; /M: SY='E'; M= -8, 3,-24, 1, 6,-19,-18, -1,-14, 1,-13, -8, 6,-14, 4, 2, 0, 1,-14,-28,-11, 3; /M: SY='W'; M=-17,-32,-37,-33,-27, 20,-25,-15, -6,-18, -8, -9,-31,-30,-20,-17,-29,-19,-12, 82, 39,-22; /M: SY='V'; M= -3,-19,-16,-20,-14, -6,-26,-15, 13,-14, 3, 4,-19,-23,-14,-13, -6, 0, 22,-26, -6,-15; /M: SY='D'; M=-17, 43,-29, 59, 20,-37, -8, -1,-37, 0,-29,-28, 19,-10, 1, -9, 2, -8,-29,-39,-20, 10; /M: SY='E'; M= -4, 3,-26, 6, 27,-27,-15, -4,-23, 10,-20,-14, 1, -7, 14, 6, 2, -7,-21,-27,-16, 19; /M: SY='E'; M= 0, -2,-28, 3, 19,-28,-12,-10,-22, -1,-21,-16, -6, 17, 6, -9, 0, -7,-21,-28,-21, 11; /M: SY='V'; M= 0,-27, -5,-29,-27, -1,-28,-28, 23,-21, 12, 8,-27,-29,-27,-20,-10, 0, 38,-29,-10,-27; /M: SY='V'; M= -2,-21,-15,-22,-21, -2,-27,-16, 18,-17, 5, 8,-21,-25,-21,-17, -9, -3, 30,-27, -7,-21; /I: I=-10; MD=-27; /M: SY='V'; M= -5,-18,-18,-19,-15, -9,-27,-20, 14,-10, 2, 4,-17,-22,-13, -7, -8, -2, 22,-26,-10,-15; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M=-17, 42,-28, 59, 19,-38,-10, -1,-37, 0,-29,-28, 17, -8, 1, -9, 3, -7,-28,-39,-20, 10; /M: SY='G'; M= -1, -3,-28, -4,-11,-28, 41,-11,-34,-10,-27,-18, 5,-18,-10,-10, 0,-16,-27,-20,-23,-11; /M: SY='N'; M= -9, 21,-24, 10, -1,-23, 4, 11,-24, -3,-27,-16, 35,-14, 3, -2, 5, -4,-29,-33,-17, 0; /I: I=-12; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-32,-23, 13,-31,-21, 20,-27, 30, 14,-27,-28,-21,-20,-25,-10, 13, -6, 6,-22; /M: SY='I'; M= -5,-29,-21,-35,-29, 0,-35,-30, 39,-25, 16, 15,-24,-24,-24,-25,-15, -4, 38,-25, -5,-29; /M: SY='T'; M= 1, -1,-11, -9, -9, -8,-15,-17,-12,-11,-14,-12, 2,-11, -9,-10, 21, 38, -4,-27,-10, -9; /M: SY='S'; M= 13, -3, -9, -4, -4,-21, 7,-13,-21,-12,-27,-19, 6,-12, -4,-13, 30, 12,-11,-35,-21, -4; /M: SY='R'; M=-17, -9,-29, -9, 1,-22,-20, 1,-27, 23,-20, -9, -1,-14, 12, 53, -7, -8,-19,-22,-10, 2; /M: SY='N'; M= -4, 2,-19, -2, -4,-16,-10, -6,-17, 2,-17,-10, 5,-17, -4, 1, 0, 1,-12,-25, -9, -4; /M: SY='P'; M=-12,-23,-40,-15, -6,-20,-21,-19,-17,-11,-26,-18,-23, 64,-12,-19,-15,-12,-27, -3,-14,-12; /M: SY='D'; M= -7, 13,-28, 19, 6,-30, 2, -7,-30, 1,-27,-20, 7, -3, 0, -4, 1, -8,-25,-29,-19, 2; /M: SY='D'; M=-16, 41,-25, 57, 17,-36,-11, -1,-36, -1,-28,-27, 17,-11, 0,-10, 2, -8,-27,-37,-17, 8; /M: SY='L'; M=-11,-23,-23,-26,-19, 3,-29, -7, 18,-25, 31, 19,-19,-26,-15,-18,-23,-10, 9,-22, 1,-18; /M: SY='P'; M= -7,-12,-34, -5, 1,-24,-12,-16,-19, -9,-23,-16,-13, 48, -9,-17, -7,-10,-24,-27,-23, -7; /M: SY='A'; M= 20, -4,-18, -7, -1,-14,-10,-13,-13, -7,-11,-11, -7,-10, -7,-13, 2, -4, -6,-20,-11, -5; /M: SY='F'; M=-19,-29,-24,-36,-26, 62,-29,-17, -1,-26, 8, 0,-22,-29,-33,-19,-22,-12, -4, 21, 30,-26; /M: SY='M'; M= -6, -8, -2,-16,-18, -9,-16,-12, 3,-15, -4, 6, -2,-23,-13,-15, -5, -3, 4,-30,-11,-16; /M: SY='R'; M= -1, 1,-24, 0, 2,-25,-10, -7,-26, 15,-23,-13, 2,-12, 4, 20, 1, -4,-17,-25,-15, 2; /M: SY='A'; M= 20, -6,-19, -9, 5,-22, -9,-14,-16, 1,-13,-10, -7, -7, 0, -7, 3, -3, -9,-23,-17, 2; /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-36,-26, 19,-32,-24, 26,-28, 21, 13,-22,-25,-24,-24,-20, -9, 16,-10, 6,-26; /M: SY='I'; M= -6,-25,-21,-29,-23, 5,-30,-24, 25,-22, 19, 13,-22,-24,-21,-21,-17, -6, 22,-21, -2,-23; /M: SY='E'; M= -6, 9,-27, 13, 22,-30,-14, -4,-28, 15,-24,-15, 4, -8, 14, 9, 0, -7,-23,-27,-16, 17; /M: SY='E'; M= 1,-10,-23,-11, 3,-13,-19, -1, -9, -4, 0, -1,-10,-16, 1, -3, -8, -7, -9,-21, -5, 1; /M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-31,-22, 14,-29,-20, 20,-27, 37, 19,-27,-28,-22,-20,-25, -9, 14,-18, 2,-22; /M: SY='S'; M= 2, 0,-22, 0, 5,-25, 1,-10,-24, 4,-22,-14, 2,-12, 1, 1, 6, -2,-17,-27,-18, 3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51273 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 22 in 21 different sequences |
| Number of true positive hits | 22 in 21 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 7 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 75.86 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PfpI endopeptidase |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
21 sequences
DEGLY_PYRAB (Q9V1F8), DEGLY_PYRFU (Q51732), DEGLY_PYRHO (O59413), DEGLY_THEKO (Q5JGM7), DJ1D_ARATH (Q9M8R4), GS18_BACSU (P80876), Y1084_STAHJ (Q4L7I2), Y1281_ARCFU (O28987), Y1413_STAEQ (Q5HN59), Y1560_STAES (Q8CRV8), Y1625_STAS1 (Q49WT1), Y1692_STAAN (P0A0K1), Y1797_STAAS (Q6G859), Y1815_STAAW (P0A0K2), Y1875_STAAM (P0A0K0), Y1933_STAAC (Q5HEP9), Y1965_STAAR (Q6GFI2), Y2013_STAA8 (P0A0K3), Y918_STAS1 (Q49YS0), YHBO_ECOLI (P45470), YRAA_BACSU (O06006)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
7 sequences
DJ1A_ARATH (Q9FPF0), DJ1B_ARATH (Q9MAH3), DJ1C_ARATH (Q8VY09), DJ1E_ARATH (Q9ZV19), DJ1F_ARATH (Q9M1G8), YDEA_BACSU (P96658), YOAZ_BACSU (O34947)» more |
| PDB [Detailed view] |
15 PDB
1G2I; 1OI4; 3UK7; 4OFW; 4OGG; 4Y0N; 4Y1E; 4Y1F; 4Y1G; 4Y1R; 6F2F; 6F2H; 6HF6; 6Q3T; 7QO8 » more |