Home  |  Contact
Entry: PS51276

General information about the entry

Entry name [info] PEPTIDASE_C56_PFPI
Accession [info] PS51276
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51276
Associated ProRule [info] PRU00608

Name and characterization of the entry

Description [info] PfpI endopeptidase domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=167;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=167;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1337969; R2=0.0157499; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11890.5410156; R2=19.6446648; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2354; H_SCORE=58134; N_SCORE=39.2; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; H_SCORE=17352; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-40; I=-40; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M= -7, -6,-23, -7,  2,-23,-17, -8,-22, 25,-20, -7, -4,-13,  4, 22, -7, -8,-14,-23,-11,  2;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-26, -6,  2,-23,-19, -8,-23, 28,-21, -9, -1,-15,  6, 33, -6, -6,-14,-22,-11,  2;
/M: SY='V';  M= -1,-28,-18,-33,-27,  1,-31,-28, 32,-23, 15, 13,-24,-25,-24,-23,-14, -5, 34,-24, -6,-27;
/M: SY='A';  M= 18,-20,-16,-26,-17, -3,-15,-22,  8,-20, 14,  4,-19,-20,-17,-21, -9, -5,  8,-19, -9,-17;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-22,-35,-27,  9,-32,-25, 32,-25, 18, 17,-22,-23,-22,-24,-17, -7, 25,-18,  0,-26;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-20,-32,-23,  8,-31,-23, 25,-27, 33, 17,-26,-26,-21,-22,-22, -6, 18,-20, -1,-23;
/M: SY='A';  M= 16,-13,-10,-20,-15,-10,-16,-21,  3,-16,  1, -2,-12,-17,-14,-18,  3,  9,  9,-26,-13,-15;
/M: SY='G';  M=  4,  6,-21,  4,  1,-24,  7,-12,-24, -8,-21,-17,  5, -8, -6,-12,  7,  4,-18,-28,-20, -3;
/M: SY='D';  M=-13, 27,-27, 35, 13,-28,-12,  2,-30,  0,-25,-22, 14, -9,  2, -6,  1, -6,-26,-30,-14,  7;
/M: SY='G';  M= -1,-12,-26,-12,-10,-15, 24,-10,-22,-15,-13,-10, -6,-19,-13,-14, -5,-14,-18,-18,-12,-12;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-18,-32,-27, 37,-25,-19,  8,-23,  7,  3,-20,-27,-30,-19,-13, -4, 12, -5, 15,-26;
/M: SY='E';  M=-10, 11,-30, 21, 56,-31,-20,  1,-30, 10,-20,-19,  1, -1, 22,  0,  0,-10,-30,-30,-19, 39;
/M: SY='D';  M=-13, 22,-28, 32, 27,-33,-15,  2,-30,  5,-23,-19,  8, -8, 15, -1,  0, -9,-27,-32,-17, 20;
/M: SY='V';  M= -2,-17,-19,-18,-16, -3,-22,-12,  7,-17,  6,  3,-15,-18,-14,-15, -6, -1,  8,-21,  0,-16;
/M: SY='E';  M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19,  0,-31,  9,-21,-21,  1, -1, 19, -1,  0,-10,-30,-31,-20, 38;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-19,-29,-22, 18,-29,-19, 15,-26, 30, 12,-24,-27,-22,-19,-20, -3, 10,-14,  7,-22;
/M: SY='L';  M= -7,-19,-22,-23,-16,  2,-24,-17,  4,-16,  5,  5,-17,-21,-12,-14, -9,  4,  3,  0,  3,-14;
/M: SY='Y';  M= -7,-12,-24,-12, -7, -1,-19,  0, -5, -6, -8, -4,-12,-21, -6, -7, -6, -5, -3, -7, 20, -9;
/M: SY='P';  M= -8,-20,-37,-11, -2,-28,-20,-20,-17,-10,-27,-18,-20, 80,-11,-20, -9, -8,-25,-30,-28,-11;
/M: SY='Y';  M=-12,-18,-22,-20,-14,  4,-25, -8, -4, -4,  2,  1,-17,-25,-10,  2,-16, -8, -3, -1, 14,-13;
/M: SY='Y';  M=-15,  2,-28,  3,  4,-12,-21,  7,-15,  3,-12, -6,  0,-17,  7,  3, -9,-10,-18,-15,  8,  4;
/M: SY='R';  M=  5,-10,-22,-13, -5,-16,-12, -8,-18,  9,-12, -6, -6,-17,  0, 24, -5, -7,-11,-19,-10, -5;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-16,-32,-23, 19,-30,-21, 17,-29, 38, 16,-28,-30,-24,-20,-26, -9, 12,-17,  3,-23;
/M: SY='R';  M=-12, -3,-29, -1, 17,-26,-21, -2,-23, 21,-18, -8, -3,-12, 20, 25, -7,-10,-20,-23,-12, 17;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-27, 14, 34,-28,-17, -3,-25,  8,-18,-15,  1, -6, 15,  0,  0, -8,-23,-28,-17, 24;
/M: SY='A';  M= 20, -6,-19, -8,  9,-21,-11,-13,-14, -1,-13,-11, -9,-10,  0, -9,  2, -5, -7,-20,-15,  4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-26,-10,-20,-30, 68,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-21,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 10,-17,-18,-22,-17,  3,-11, -3, -7,-16, -5, -5,-13,-20,-15,-17, -7, -9, -5, -3,  8,-16;
/M: SY='E';  M= -6, 10,-24, 12, 25,-25,-15,  3,-25,  4,-21,-16,  7, -8, 10,  1,  5,  2,-22,-30,-15, 17;
/M: SY='V';  M= -1,-24,-13,-25,-24, -4,-27,-27, 19,-18,  4,  4,-24,-17,-25,-18, -5,  6, 34,-30,-12,-25;
/M: SY='T';  M= -6, -3,-19, -2, -7,-12,-22, -7, -3,-11, -4, -3, -7,-18,-10,-12, -2,  6,  5,-29, -7, -9;
/M: SY='V';  M= -2,-26,-17,-29,-24,  1,-29,-21, 24,-23, 16, 11,-23,-25,-22,-20,-13, -3, 28,-25, -5,-24;
/M: SY='V';  M= 17,-22,-16,-28,-21, -7,-20,-24, 18,-19,  7,  5,-19,-19,-18,-22, -6, -3, 21,-21, -9,-21;
/M: SY='A';  M= 17, -6, -8,-11, -9,-22, 13,-17,-22,-13,-21,-16, -2,-14,-10,-16, 15,  4,-12,-28,-22, -9;
/M: SY='P';  M= -5,-14,-30,-11, -5,-18,-19,-18,-13, -8,-17,-12,-13, 38,-10,-13, -5, -2,-17,-27,-19,-10;
/M: SY='E';  M= -7,  5,-26,  9, 21,-27, -6, -4,-29,  9,-24,-17,  4, -9,  7,  5,  3, -4,-23,-28,-17, 14;
/M: SY='K';  M=  3, -6,-25, -7, -2,-24, -5,-14,-21,  9,-18,-11, -5, -3, -2,  2, -3, -4,-15,-23,-16, -2;
/M: SY='G';  M= -5,  4,-28,  5, -1,-29, 20,-10,-33,  4,-27,-18,  7,-15, -4,  3, -1,-12,-25,-25,-21, -3;
/I:         I=-10; MD=-25;
/M: SY='K';  M=  0, -4,-15, -4,  4,-14,-10, -6,-11,  8,-10, -5, -3, -5,  4,  7, -1, -3, -8,-14, -8,  3; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -3, -3,-18, -4,  7,-16,-18,-11,-10, -1,-12, -8, -4, -4,  2, -4,  6, 12, -6,-25,-12,  4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-25;
/M: SY='Y';  M=-11,-24,-20,-28,-24, 14,-31,-11, 17,-19,  9,  7,-21,-26,-19,-17,-16, -5, 13, -5, 25,-24;
/M: SY='R';  M= -6, -5,-23, -8,  1,-22,-19, -9,-15, 11,-15, -4, -3,-13, 11, 12,  0,  4,-11,-23,-10,  5;
/M: SY='G';  M=  6, -5,-24, -6, -3,-26, 31,-16,-30,-12,-23,-18, -1,-14, -9,-15,  6, -6,-22,-24,-24, -6;
/M: SY='K';  M=-10,-15,-27,-16, -8, -7,-22,-14,-11, 13,-12, -1,-14,-19, -6,  6,-14,-10, -6,  2,  2, -6;
/M: SY='H';  M=-12,  3,-27,  2,  5,-21,-17, 13,-23, 11,-20, -8,  7, -9,  8, 12, -4, -8,-22,-25, -5,  5;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-29, -9,-14,-27, 43, -4,-32,-15,-25,-13,  0,-19,-11,-14, -1,-17,-26,-22,-20,-13;
/M: SY='Y';  M=-14, -1,-26,  1, -5, -6,-21,  9,-11, -7, -7, -4, -6,-17, -6, -7, -9, -5,-10,-15, 13, -7;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -4, -5,-23, -6, -2,-20,-13,-13,-19,  4,-19,-12, -3,  2, -2,  2,  3,  8,-15,-23,-14, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-15,-30,-25, 17,-27,-18, 13,-22, 12,  7,-23,-27,-25,-19,-15, -5, 18,-10,  8,-24;
/M: SY='T';  M= -5,  3,-23,  3,  5,-24,-17,-10,-20,  6,-20,-13,  0, -1,  3,  3,  3,  8,-14,-28,-15,  3;
/M: SY='V';  M=  8,-19,-14,-20,-14,-12,-19,-22,  4,-16, -3, -3,-18, -2,-16,-19, -2,  0, 10,-28,-16,-16;
/M: SY='D';  M=-16, 36,-27, 48, 17,-33,-12,  1,-32,  0,-25,-23, 18,-11,  3, -7,  1, -4,-26,-37,-17, 10;
/M: SY='A';  M=  5,-16,-20,-21,-13, -7,-17,-14,  1, -9,  4,  3,-14,-19,-11,-10, -8, -4,  3,-21, -6,-13;
/M: SY='S';  M= 13, -5,-14, -9, -7,-15, -6,-15,-14, -9,-16,-13, -1, -8, -8,-11, 15, 14, -6,-27,-14, -8;
/M: SY='F';  M= -6,-27,-20,-32,-24, 24,-28,-21, 16,-25, 19, 10,-22,-25,-24,-21,-17, -6, 13,-11,  8,-24;
/M: SY='D';  M=  2, 16,-22, 20,  8,-28, -7, -7,-27,  2,-24,-19,  8,-11,  1, -2,  8, -2,-19,-31,-18,  4;
/M: SY='D';  M=-12, 23,-29, 35, 34,-33,-14,  1,-32,  5,-24,-22,  8, -6, 11, -4,  0, -8,-28,-33,-18, 23;
/M: SY='V';  M= 12,-24,-12,-28,-23, -4,-22,-26, 18,-19,  9,  7,-24,-24,-22,-20, -7, -2, 30,-26,-11,-23;
/M: SY='D';  M= -8, 14,-25, 16,  6,-27,-13, -4,-25, 13,-26,-16, 12,-10,  4,  7,  2, -3,-20,-29,-13,  5;
/M: SY='P';  M= 11,-16,-22,-17, -8,-17,-15,-18, -6,-12,-14,-10,-15, 21,-12,-19, -1, -2, -4,-26,-19,-12;
/I:         I=-11; MD=-29;
/M: SY='D';  M=  0, 16,-22, 19, 16,-28, -5, -5,-27,  1,-24,-19, 10, -9,  4, -5,  8, -3,-21,-32,-19, 10; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-15, 32,-28, 45, 26,-34,-13,  0,-34,  4,-26,-24, 14, -8,  6, -3,  1, -7,-28,-35,-19, 16; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-19,-25,-22,-29,-24, 48,-30,  0,  1,-19,  6,  1,-21,-30,-23,-15,-20,-10, -4, 17, 53,-24;
/M: SY='D';  M=-14, 40,-28, 55, 17,-36,-10,  0,-34, -1,-27,-26, 17,-10,  1,-10,  1, -9,-27,-37,-19,  9;
/M: SY='A';  M= 25,-13,-14,-18,-15,-19, 16,-20,-15,-16,-10,-10,-10,-16,-15,-20,  2, -7, -7,-21,-21,-15;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-19,-31,-24,  6,-31,-24, 26,-28, 37, 18,-29,-29,-22,-21,-24, -8, 22,-22, -2,-24;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-15,-32,-28, 11,-30,-26, 26,-24, 18, 12,-27,-28,-27,-21,-16, -4, 33,-22, -2,-27;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-34,-26,  6,-34,-26, 34,-28, 29, 17,-26,-26,-23,-24,-22, -8, 26,-21, -1,-26;
/M: SY='P';  M= -6,-19,-36,-11, -1,-28,-19,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 76,-10,-19, -7, -7,-26,-29,-28,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=-11,-15,-23,-19,-13,  4,-23, -6, -9, -5, -5, -3,-11,-21, -7,  6, -8,  1, -5, -4,  7,-11;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 19, 10,-11, -2, -5,-20,  1, -7,-16, -7,-21,-16, 19,-15, -5,-11, 14,  2,-14,-31,-20, -5;
/M: SY='P';  M=  1,-18,-33,-12, -3,-27,-15,-20,-18,-10,-26,-18,-17, 65,-10,-20, -5, -8,-22,-28,-28,-10;
/M: SY='D';  M=-17, 39,-30, 56, 29,-37,-11,  0,-37,  2,-27,-27, 15, -8,  5, -8,  0,-10,-30,-37,-20, 17;
/M: SY='Y';  M=-11, -9,-26,-11, -4, -4,-20,  7,-14,  4, -9, -4, -5,-20, -1,  8,-10, -8,-14,-11, 12, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-21,-32,-23,  6,-31,-21, 27,-28, 39, 22,-27,-27,-19,-21,-26, -9, 17,-21, -1,-22;
/M: SY='R';  M=-19,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 29,-20,-10,  0,-20, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M= -9,-14,-23,-18,-12,-10,-18,-11, -2, -5,  1,  3, -9,-21, -3,  5, -9, -2, -2,-18, -5, -9;
/M: SY='D';  M=-15, 28,-24, 33,  9,-23,-11,  9,-28, -3,-25,-20, 20,-15,  1, -7,  2, -6,-25,-30, -5,  4;
/M: SY='P';  M= -4,  2,-29,  7, 14,-28,-16, -9,-21,  1,-22,-15, -3, 20,  2, -8, -3, -7,-21,-29,-21,  7;
/M: SY='E';  M= -8,  9,-27, 13, 15,-28,-11, -1,-27, 11,-22,-14,  5,-11,  9, 11, -1, -8,-22,-28,-15, 11;
/M: SY='A';  M= 18,-19,-13,-25,-19, -3,-14,-21,  5,-16,  2,  2,-18,-20,-18,-19, -2,  0, 15,-20, -9,-18;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-22,-25,-17, -6,-27,-18, 18,-16, 14, 12,-19,-23, -8,-11,-16, -8, 15,-23, -6,-14;
/M: SY='E';  M=  2,  7,-23,  7, 12,-26,-12, -3,-24,  8,-21,-15,  6,-11,  7,  6,  4, -2,-19,-27,-16,  9;
/M: SY='F';  M=-13,-30,-22,-37,-27, 38,-32,-22, 17,-30, 24, 11,-23,-27,-29,-22,-23,-10, 10, -7, 13,-27;
/M: SY='V';  M=  7,-24,-12,-28,-25, -4,-25,-27, 22,-19,  6,  6,-23,-24,-24,-20, -5,  4, 35,-27,-10,-25;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-29, -6,  4,-26,-17,  1,-27, 27,-22, -8, -1,-15, 15, 39, -7,-10,-20,-21,-10,  7;
/M: SY='D';  M= -3, 12,-25, 16, 14,-26,-13,  8,-26,  3,-21,-15,  5,-11,  8, -4,  2, -6,-21,-27, -8, 10;
/M: SY='F';  M= -9,-25,-19,-34,-25, 43,-25,-14,  6,-23, 10, 13,-19,-25,-26,-18,-16, -9,  6, -4, 15,-23;
/M: SY='F';  M= -1, -5,-19, -8,-12,  9,-17, -8, -8,-14, -5, -4, -6,-20,-16,-15, -5, -4, -4,-15,  3,-13;
/M: SY='D';  M= -5, 11,-25, 14, 14,-27,-10, -2,-26,  6,-22,-16,  7,-11,  5,  2,  2, -3,-20,-29,-15,  9;
/M: SY='A';  M=  9,  0,-20, -2,  7,-23,-11, -5,-17, -2,-15,-10,  1,-11,  9, -6,  6, -1,-15,-22,-14,  8;
/M: SY='G';  M= -5,  6,-28,  5, -5,-29, 31, -6,-34, -5,-28,-18, 11,-17, -5, -8,  0,-14,-28,-26,-22, -5;
/M: SY='K';  M=-10, -1,-29, -2,  7,-28,-20,-10,-27, 44,-27, -8, -1,-11,  8, 28, -9, -8,-17,-21,-10,  8;
/M: SY='P';  M= -9,-21,-35,-15, -6,-21,-23,-21,-10,-14,-16,-12,-20, 58,-12,-20,-11, -6,-18,-24,-22,-13;
/M: SY='V';  M= -5,-29,-19,-34,-29,  1,-34,-29, 36,-25, 17, 14,-25,-26,-25,-24,-15, -4, 37,-25, -5,-29;
/M: SY='A';  M= 37,-12,-10,-20,-13,-13,  4,-20,-13,-13,-11,-11,-10,-13,-14,-20,  7, -3, -4,-19,-17,-13;
/M: SY='A';  M= 33, -8,-12,-15, -7,-20, -3,-15,-11, -9,-13,-10, -6,-11, -6,-16, 12,  5, -2,-24,-18, -7;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-25,-37,-29,  1,-37,-29, 44,-28, 20, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='G';  M= 14,-10,-24,-13,-17,-27, 50,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20,  3,-14,-21,-20,-27,-17;
/M: SY='P';  M= -2,-18,-33,-12, -5,-27, -7,-20,-18,-12,-25,-16,-16, 54,-11,-19, -6, -9,-21,-28,-27,-11;
/M: SY='W';  M=-15,-25,-40,-25,-11, -6,-21,-16,-15,-11,-11, -9,-26,-23,  5,-10,-26,-21,-25, 72, 13,  0;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-19,-30,-24,  1,-30,-25, 27,-23, 20, 14,-24,-23,-21,-21,-15, -2, 27,-25, -5,-24;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-29,-20, 10,-27,-19, 16,-28, 42, 18,-28,-24,-20,-20,-28,-10,  7,-19, -1,-20;
/M: SY='I';  M=  6,-24,-18,-32,-25, -5,-28,-27, 28,-23,  9,  9,-19,-20,-19,-25, -9, -3, 25,-23, -8,-25;
/M: SY='S';  M=  4, 11,-18, 12, 11,-23, -6, -5,-23, -4,-24,-19, 11,-10,  2, -8, 18,  6,-17,-34,-17,  7;
/M: SY='A';  M= 40, -9,-10,-18,-10,-18, -3,-19,-10,-11,-10,-10, -8,-11,-10,-18, 13,  6,  0,-23,-19,-10;
/M: SY='G';  M= -7,  7,-27, 11, -5,-31, 31,-11,-36, -7,-28,-19,  7,-17, -9, -9, -1,-15,-28,-26,-24, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-22,-19,-24,-18, -2,-27,-21, 19,-18, 18, 11,-21,-24,-17,-15,-16, -6, 20,-24, -7,-19;
/M: SY='V';  M=  1,-27,-15,-29,-24,  1,-27,-25, 24,-23, 21, 12,-26,-26,-23,-21,-14, -4, 29,-25, -7,-24;
/M: SY='K';  M= -9,  2,-28,  3, 12,-27,-17, -5,-28, 29,-25,-13,  3,-12, 11, 29, -4, -8,-21,-24,-13, 10;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-30, -1,-15,-31, 59,-17,-39,-17,-30,-21,  5,-19,-17,-18,  0,-18,-30,-23,-29,-16;
/M: SY='R';  M=-16, -8,-30, -9,  1,-19,-21, -3,-25, 31,-20, -8, -2,-18,  8, 49,-11,-10,-18,-17, -4,  1;
/M: SY='R';  M= -9,  0,-24, -2,  6,-23,-18, -8,-24, 22,-21,-11,  2,-12,  7, 24,  0,  5,-16,-24,-12,  5;
/M: SY='L';  M=  1,-24, -9,-29,-22, -2,-22,-20, 15,-21, 18, 17,-22,-24,-17,-19,-15, -6, 15,-24, -8,-20;
/M: SY='T';  M=  4, -1, -7,-11,-10,-11,-18,-20,-11,-11,-11,-10, -1,-11,-10,-11, 19, 43,  0,-30,-12,-10;
/M: SY='S';  M= 16, -5, -4, -8, -7,-21,  6,-15,-21,-13,-24,-17,  1,-11, -7,-15, 23,  8,-10,-33,-22, -7;
/M: SY='Y';  M=-16,-25,-27,-27,-24, 24,-27, -4, -3,-16, -4, -5,-24,-29,-18,-15,-20,-10, -7, 43, 46,-21;
/M: SY='P';  M= -9,-15,-31,-14, -6,-12,-21,-11,-10, -9,-16,-10,-11, 25,-10,-13, -8, -6,-16,-18,-11,-10;
/M: SY='S';  M= 14, -5,-17, -8, -6,-20,  8,-11,-20,-10,-21,-15,  1,-11, -7,-13, 16,  5,-12,-28,-18, -7;
/M: SY='I';  M= -8,-29, -8,-34,-27,  1,-34,-27, 29,-28, 22, 14,-24,-27,-23,-26,-20, -8, 23,-25, -5,-27;
/M: SY='R';  M= -8, -7,-27, -9,  2,-24,-18, -6,-23, 26,-20, -7, -2,-15, 10, 36, -7, -8,-16,-20,-11,  4;
/M: SY='D';  M= -9, 10,-25, 17,  2,-23,-17, -9,-20, -4,-17,-15,  0,  2, -5, -9, -1,  1,-14,-31,-15, -2;
/M: SY='D';  M=-18, 42,-30, 60, 25,-38,-12, -1,-37,  1,-28,-28, 16, -9,  2, -9,  0,-10,-28,-38,-20, 14;
/M: SY='L';  M= -7,-29,-15,-31,-25,  4,-30,-23, 25,-24, 29, 20,-28,-28,-22,-20,-21, -7, 25,-24, -4,-24;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-26, -6, 13,-19,-22,-11, -5,  1, -9, -5, -7,-11,  5, -1, -4, -5, -6,-26,-12,  7;
/M: SY='N';  M= -3, 26,-19, 10, -3,-18, -4,  2,-14, -4,-20,-14, 40,-19, -2, -5,  6, -1,-21,-35,-18, -3;
/M: SY='A';  M= 47,-10, -7,-19,-10,-20, -1,-20,-11,-11,-11,-11, -9,-11,-10,-20, 11,  1, -1,-22,-20,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 31,-11,-14,-17,-14,-23, 22,-20,-19,-14,-16,-13, -7,-14,-14,-20,  6, -7, -9,-21,-23,-14;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-24,  1,  6,-19,-18, -1,-14,  1,-13, -8,  6,-14,  4,  2,  0,  1,-14,-28,-11,  3;
/M: SY='W';  M=-17,-32,-37,-33,-27, 20,-25,-15, -6,-18, -8, -9,-31,-30,-20,-17,-29,-19,-12, 82, 39,-22;
/M: SY='V';  M= -3,-19,-16,-20,-14, -6,-26,-15, 13,-14,  3,  4,-19,-23,-14,-13, -6,  0, 22,-26, -6,-15;
/M: SY='D';  M=-17, 43,-29, 59, 20,-37, -8, -1,-37,  0,-29,-28, 19,-10,  1, -9,  2, -8,-29,-39,-20, 10;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-26,  6, 27,-27,-15, -4,-23, 10,-20,-14,  1, -7, 14,  6,  2, -7,-21,-27,-16, 19;
/M: SY='E';  M=  0, -2,-28,  3, 19,-28,-12,-10,-22, -1,-21,-16, -6, 17,  6, -9,  0, -7,-21,-28,-21, 11;
/M: SY='V';  M=  0,-27, -5,-29,-27, -1,-28,-28, 23,-21, 12,  8,-27,-29,-27,-20,-10,  0, 38,-29,-10,-27;
/M: SY='V';  M= -2,-21,-15,-22,-21, -2,-27,-16, 18,-17,  5,  8,-21,-25,-21,-17, -9, -3, 30,-27, -7,-21;
/I:         I=-10; MD=-27;
/M: SY='V';  M= -5,-18,-18,-19,-15, -9,-27,-20, 14,-10,  2,  4,-17,-22,-13, -7, -8, -2, 22,-26,-10,-15; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-17, 42,-28, 59, 19,-38,-10, -1,-37,  0,-29,-28, 17, -8,  1, -9,  3, -7,-28,-39,-20, 10;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-28, -4,-11,-28, 41,-11,-34,-10,-27,-18,  5,-18,-10,-10,  0,-16,-27,-20,-23,-11;
/M: SY='N';  M= -9, 21,-24, 10, -1,-23,  4, 11,-24, -3,-27,-16, 35,-14,  3, -2,  5, -4,-29,-33,-17,  0;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-23,-32,-23, 13,-31,-21, 20,-27, 30, 14,-27,-28,-21,-20,-25,-10, 13, -6,  6,-22;
/M: SY='I';  M= -5,-29,-21,-35,-29,  0,-35,-30, 39,-25, 16, 15,-24,-24,-24,-25,-15, -4, 38,-25, -5,-29;
/M: SY='T';  M=  1, -1,-11, -9, -9, -8,-15,-17,-12,-11,-14,-12,  2,-11, -9,-10, 21, 38, -4,-27,-10, -9;
/M: SY='S';  M= 13, -3, -9, -4, -4,-21,  7,-13,-21,-12,-27,-19,  6,-12, -4,-13, 30, 12,-11,-35,-21, -4;
/M: SY='R';  M=-17, -9,-29, -9,  1,-22,-20,  1,-27, 23,-20, -9, -1,-14, 12, 53, -7, -8,-19,-22,-10,  2;
/M: SY='N';  M= -4,  2,-19, -2, -4,-16,-10, -6,-17,  2,-17,-10,  5,-17, -4,  1,  0,  1,-12,-25, -9, -4;
/M: SY='P';  M=-12,-23,-40,-15, -6,-20,-21,-19,-17,-11,-26,-18,-23, 64,-12,-19,-15,-12,-27, -3,-14,-12;
/M: SY='D';  M= -7, 13,-28, 19,  6,-30,  2, -7,-30,  1,-27,-20,  7, -3,  0, -4,  1, -8,-25,-29,-19,  2;
/M: SY='D';  M=-16, 41,-25, 57, 17,-36,-11, -1,-36, -1,-28,-27, 17,-11,  0,-10,  2, -8,-27,-37,-17,  8;
/M: SY='L';  M=-11,-23,-23,-26,-19,  3,-29, -7, 18,-25, 31, 19,-19,-26,-15,-18,-23,-10,  9,-22,  1,-18;
/M: SY='P';  M= -7,-12,-34, -5,  1,-24,-12,-16,-19, -9,-23,-16,-13, 48, -9,-17, -7,-10,-24,-27,-23, -7;
/M: SY='A';  M= 20, -4,-18, -7, -1,-14,-10,-13,-13, -7,-11,-11, -7,-10, -7,-13,  2, -4, -6,-20,-11, -5;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-24,-36,-26, 62,-29,-17, -1,-26,  8,  0,-22,-29,-33,-19,-22,-12, -4, 21, 30,-26;
/M: SY='M';  M= -6, -8, -2,-16,-18, -9,-16,-12,  3,-15, -4,  6, -2,-23,-13,-15, -5, -3,  4,-30,-11,-16;
/M: SY='R';  M= -1,  1,-24,  0,  2,-25,-10, -7,-26, 15,-23,-13,  2,-12,  4, 20,  1, -4,-17,-25,-15,  2;
/M: SY='A';  M= 20, -6,-19, -9,  5,-22, -9,-14,-16,  1,-13,-10, -7, -7,  0, -7,  3, -3, -9,-23,-17,  2;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-24,-36,-26, 19,-32,-24, 26,-28, 21, 13,-22,-25,-24,-24,-20, -9, 16,-10,  6,-26;
/M: SY='I';  M= -6,-25,-21,-29,-23,  5,-30,-24, 25,-22, 19, 13,-22,-24,-21,-21,-17, -6, 22,-21, -2,-23;
/M: SY='E';  M= -6,  9,-27, 13, 22,-30,-14, -4,-28, 15,-24,-15,  4, -8, 14,  9,  0, -7,-23,-27,-16, 17;
/M: SY='E';  M=  1,-10,-23,-11,  3,-13,-19, -1, -9, -4,  0, -1,-10,-16,  1, -3, -8, -7, -9,-21, -5,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-19,-31,-22, 14,-29,-20, 20,-27, 37, 19,-27,-28,-22,-20,-25, -9, 14,-18,  2,-22;
/M: SY='S';  M=  2,  0,-22,  0,  5,-25,  1,-10,-24,  4,-22,-14,  2,-12,  1,  1,  6, -2,-17,-27,-18,  3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51273

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 22 in 21 different sequences
Number of true positive hits 22 in 21 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 7
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 75.86 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PfpI endopeptidase
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
21 sequences

DEGLY_PYRAB (Q9V1F8    ), DEGLY_PYRFU (Q51732    ), DEGLY_PYRHO (O59413    ), 
DEGLY_THEKO (Q5JGM7    ), DJ1D_ARATH  (Q9M8R4    ), GS18_BACSU  (P80876    ), 
Y1084_STAHJ (Q4L7I2    ), Y1281_ARCFU (O28987    ), Y1413_STAEQ (Q5HN59    ), 
Y1560_STAES (Q8CRV8    ), Y1625_STAS1 (Q49WT1    ), Y1692_STAAN (P0A0K1    ), 
Y1797_STAAS (Q6G859    ), Y1815_STAAW (P0A0K2    ), Y1875_STAAM (P0A0K0    ), 
Y1933_STAAC (Q5HEP9    ), Y1965_STAAR (Q6GFI2    ), Y2013_STAA8 (P0A0K3    ), 
Y918_STAS1  (Q49YS0    ), YHBO_ECOLI  (P45470    ), YRAA_BACSU  (O06006    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
7 sequences

DJ1A_ARATH  (Q9FPF0    ), DJ1B_ARATH  (Q9MAH3    ), DJ1C_ARATH  (Q8VY09    ), 
DJ1E_ARATH  (Q9ZV19    ), DJ1F_ARATH  (Q9M1G8    ), YDEA_BACSU  (P96658    ), 
YOAZ_BACSU  (O34947    )
» more

PDB
[Detailed view]
14 PDB

1G2I; 1OI4; 3UK7; 4OFW; 4OGG; 4Y0N; 4Y1E; 4Y1F; 4Y1G; 4Y1R; 6F2F; 6F2H; 6HF6; 6Q3T
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission