PROSITE entry PS51316
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ODV |
| Accession [info] | PS51316 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51316 |
| Associated ProRule [info] | PRU00647 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Olduvai (ODV) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=92; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=92; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0973206; R2=0.0065733; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1203; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=473; N_SCORE=6.2; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-68; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='E'; M=-108,-128, -88, 97,-129, -39,-102,-130, 65,-125,-117,-101,-107, -84, 27,-104,-108,-124,-125,-117; /M: SY='N'; M=-112,-122, 39,-100,-119,-111, 35, 29, 4,-116, -10, 95,-119, -98, 51,-101, -34,-111,-135,-112; /M: SY='H'; M=-112,-129, 58, 60,-126,-119, 71,-131, 28,-124,-115, -96,-113, 24, 59,-105,-109,-126, 21,-108; /M: SY='K'; M=-106, -3, -20, 6,-122,-100, 21,-126, 66,-125,-115, 49,-115, -92, 50, 49,-100,-122, 41,-111; /M: SY='D'; M=-109,-126, 109, -54,-127, 26,-102,-131,-103,-130,-126, -17,-115,-102, -14, 17,-104,-127,-136, 0; /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50; /M: SY='Q'; M= -60,-128, 44, 68,-126,-119, 11,-123, 41, -17,-111, -98,-111, 76, 10,-103,-108,-121,-126,-112; /M: SY='E'; M=-107,-125, -87, 104,-124,-124,-105,-113, 40, -76,-113,-105,-107, -87, -96,-106,-106, 29,-127,-118; /M: SY='E'; M= 27,-123, 40, 81,-128, 32,-107,-121, -2,-121,-117,-101,-110, -3,-104,-100,-107, -8,-128,-119; /M: SY='E'; M=-107,-127, -85, 107,-125, -44,-104, -39, -1, -54,-113,-105,-106, 17, -99,-105,-107, 5,-127,-118; /M: SY='E'; M= 7,-125, -87, 100,-129,-119,-103,-128, 64,-124,-117,-102,-106, -85, -90,-103,-106,-121,-125,-118; /M: SY='D'; M=-106,-124, 88, 46,-124, 40,-109,-108,-106,-117,-115, -96,-115,-103,-113,-104,-106, 46,-136,-118; /M: SY='Q'; M=-108,-128, -27, -86,-125,-117, -99,-115, 50, 12,-102, -99,-115, 121, -87,-101,-108,-118,-120,-108; /M: SY='E'; M=-105,-123, 10, 74,-129, 49,-103,-131, 30,-128,-120, 61,-111, -93,-101, -16, -90,-126,-129,-120; /M: SY='P'; M= -13,-126,-111,-104,-127,-110,-114,-118,-109, -49,-115,-110, 113,-109,-118, 54, 8,-118,-128,-123; /M: SY='P'; M=-104,-121,-117,-111,-111,-117,-116, -94,-113, 14,-101,-114, 89,-112,-119, 46, 3, 50,-126, -9; /M: SY='C'; M= 62, 115, -27,-112,-122, -28,-117,-120,-113,-118,-114,-105,-121,-111,-118, 56, -98,-109,-133,-121; /M: SY='P'; M= -26,-135,-116,-105,-126,-116,-117,-115,-112, -2,-111,-121, 128,-114,-123,-111,-107,-120,-126,-127; /M: SY='R'; M=-115,-131,-111, -99,-123,-125,-100,-130, -71,-122,-111,-104,-123, -87, 124,-109,-113,-124,-123,-110; /I: I=-26; MD=-65; /M: SY='L'; M=-128,-131,-145,-137,-102,-147,-130, -94,-139, 84, -90,-144, -68,-132,-136, -69,-124,-101,-133,-115; D=-26; /I: I=-26; MD=-65; B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='S'; M=-106,-127,-114,-119,-135,-112,-118,-136,-118,-140,-132, 38,-127,-111,-123, 95, -99,-130,-144, -40; D=-26; /I: I=-26; MI=-65; MD=-65; IM=-65; DM=-65; /M: SY='R'; M=-123,-142,-123, -29,-138, 3,-115,-140, -93,-134, 11,-116,-134, 15, 94, -25,-125,-136,-137,-125; D=-26; /I: I=-26; DM=-65; /M: SY='E'; M=-106,-125, -73, 105,-126, 0,-104,-117, -58,-118, -37, 26,-107, -88,-103,-103,-106, 17,-129,-119; /M: SY='L'; M=-111,-117,-130,-122, -93,-131,-117, -78,-108, 81, 52,-128, 3,-117, -55,-121,-107, 43,-122,-103; /M: SY='Q'; M=-110,-124,-115, -98,-109,-122,-103, -97,-102, 55, 65,-111, 20, 106,-102,-108,-109,-103,-120,-105; /M: SY='E'; M= -40,-127, 53, 84,-129, -36,-103,-129, 62,-125, -35, -97,-108, -88, 1,-104, -85,-123,-128,-117; /M: SY='V'; M= 54,-116,-105, 57,-117,-113,-115, -96, 4,-107,-105,-109, -48,-101,-108, 11, -32, 59,-128,-115; /M: SY='E'; M=-107,-125, -1, 96,-125,-122,-105,-116, 60,-118,-114,-102,-108, -87, -92,-105,-106, 22,-127,-117; /M: SY='E'; M=-106,-127, -85, 106,-128, 10,-104,-124, 26,-122,-117,-103,-106, -86, -97,-104,-108, -11,-127,-120; /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='P'; M= -86,-130,-106, 14,-125,-116, 12, 2, 50,-121,-112, -14, 98, 9, -7, -11,-105,-117,-124, -40; /M: SY='E'; M=-107,-128, -80, 117,-131, -83,-101,-132, 1,-124,-120,-104,-103, -82, -97,-104,-108,-124,-127,-121; /M: SY='V'; M= -43,-114, -38, -35, -49,-130,-130, -11,-120, -88, -16,-123,-125,-122,-122,-113, -99, 105,-134,-109; /M: SY='P'; M=-114,-125,-123,-113, -56,-125,-117, -94,-118, 72, -90,-126, 99,-116,-123,-118, -72,-101,-122,-111; /M: SY='Q'; M= -60,-131, -93, 72,-135,-104, -97,-125, -88,-102,-109,-100,-110, 122, -91, -98,-109,-124,-122,-112; /M: SY='D'; M= -7,-127, 117, 34,-134,-112,-102,-132,-101,-130,-128, -86,-113, -99,-109,-102,-105,-127,-145,-118; /M: SY='S'; M= -90,-112,-103,-103,-122, -98,-106,-121, 4, -77,-117, -92, -52, -96,-105, 113, -85,-114,-129,-114; /M: SY='L'; M=-114,-118,-132,-123, -89,-132,-118, -81,-124, 93, -79,-131,-131, -31,-122,-124,-112, -15, 75, -98; /M: SY='D'; M=-112,-128, 110, 65,-133, -54,-101,-133, -98,-130,-127, -9,-111, -95,-107,-103,-105,-128,-142, -84; /M: SY='E'; M= -28,-127, -95, 83,-125, -3,-104, -82, -84,-120,-114,-104,-112, -88, 83,-104, -25, -16,-126,-116; /M: SY='C'; M=-108, 141,-125,-123, -30, 2,-123, -11, -29,-112,-112,-113,-132,-122, 8, -87,-109, -18, 35, -10; /M: SY='Y'; M= 47, 27, -30,-112, -16,-102, -95,-108,-111,-106,-103,-112,-124, 12,-111, 1,-106, -58, -91, 115; /M: SY='S'; M= -99,-116,-116,-115, -71,-112,-115, 49,-114, 34, -96,-107,-118,-107,-117, 86, -94, -1, 23,-107; /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='T'; M= -29,-109,-105,-108,-115,-114,-115, -95,-105,-111,-108, -95,-107,-109,-113, -25, 121, -98,-135,-113; /M: SY='P'; M=-113, 92,-117,-110,-115,-119, 22,-115,-114, -6,-110,-117, 110, -63,-122,-111, -30,-117,-124, 27; /M: SY='S'; M= -16,-112,-105,-105, -11, -98,-107,-120,-105,-123,-117, -94, -16, -98,-110, 112, -85,-113,-127,-111; /M: SY='N'; M=-101,-117, -75, -38,-115, 27,-106, 28, -74, -75, 44, 79,-117,-104,-112, 54, -15, 3,-130,-114; /M: SY='Y'; M=-104, 73,-112,-112, -29,-112, 45,-113,-111, -16,-106,-105, 38,-106,-113, 73, -99,-112,-109, 83; /M: SY='H'; M=-115, -12,-113,-110, 32,-123, 115,-106,-111, 43, -95,-107, 50,-107, -22,-111, -4,-110,-124, -32; /M: SY='E'; M= -7,-125, 47, 85,-130, 49, 14,-130, -99,-126,-120, -42,-109, -14,-107, -63,-108, -74,-129,-119; /M: SY='P'; M= -40,-123,-121,-110,-105,-122,-113, -92,-113, 61, 45,-120, 78, 41, -69, -28,-107, 3,-123,-109; /M: SY='P'; M=-107, 62,-112,-109, -84,-115, 37,-114,-109, -23,-108,-107, 84,-109, -43, 40, 45,-113,-119, 54; /M: SY='D'; M= 13,-126, 111, -1, -1,-111, -13,-127,-102,-125,-123, -41, -19,-102, -24,-102,-105,-123,-137, -63; /M: SY='S'; M= -93, 25,-107,-107, -82,-101,-108,-114,-107, -10, 25, -97, 4,-100,-111, 107, -87,-110,-129,-112; /M: SY='C'; M=-112, 100, -89,-114, 37, -15, 80, -74, -58,-113,-109, 69, -17,-110,-112, -35,-106,-117, -86, 52; /M: SY='Q'; M=-108,-131,-105, -78,-127,-116, 4,-120, -37, -26,-104,-100,-116, 127, 20, -28,-110,-122, 54,-105; /M: SY='P'; M=-108,-132,-110,-102,-129,-112, 54,-123,-105,-128,-115,-109, 116, -16, -4, 42,-102,-124,-129,-119; /M: SY='Y'; M= -41,-129, -30,-111, -81,-122, 95, -30, -10,-106,-100,-108, -2,-104,-105,-110,-112,-113, -91, 120; /M: SY='R'; M= -37,-123,-108,-104,-123, 32,-105,-128, -9,-125,-115, 5,-118, -94, 92, 53,-104,-122, 29,-112; /M: SY='S'; M= -94,-114, -35,-103,-121, -65,-104,-120, 19,-122, 25, 46,-113, -96,-103, 102, -88,-115,-130,-114; /M: SY='T'; M= 40, -20, -33,-110,-113,-111,-116, -14,-109, -26,-104, -21, -43,-109,-115, 21, 86, 19,-131,-113; /M: SY='F'; M= -19, 8,-119, -87, 95,-121,-112,-102, 51, -10,-101, -59,-123, -16, -30, 12,-107, -11,-104, -85; /M: SY='Y'; M=-115,-126, -22,-118, 39,-126, 50, 56, -35, -96, -95,-114,-125,-111,-113, -13,-109, -95, -92, 109; /M: SY='S'; M= 10, -10,-111,-111,-111,-109,-114, -18,-110, 8,-102,-102,-114,-107,-114, 75, 64, 20,-130,-112; /M: SY='F'; M=-114,-118,-128,-122, 88,-127, -1, -89,-122, 67, -87,-121,-129, -10,-119, 8,-109, -38,-105, -85; /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; /M: SY='E'; M=-108,-128, 36, 110,-129,-106,-102,-127, -50, -52,-118,-102,-105, -16,-100,-104,-108, -51,-129,-119; /M: SY='E'; M=-108,-129, 30, 103,-132,-121,-100,-130, -6,-124,-118,-100,-106, 60, -27,-103,-108,-125,-128,-118; /M: SY='Q'; M=-110,-128, 64, -4,-124, -95, -24, -31, 38, 2, -13, -96,-115, 101, -93,-103,-108,-116,-126,-110; /M: SY='H'; M=-111, -73, -24, 32,-116,-119, 93,-122, 41, -28,-106, -19,-115, 69, 32, -88, -28,-121,-123, 20; /M: SY='V'; M= 16,-115,-127,-120, -29,-126,-127, 15, -34, -4, -91,-122,-124,-119, -20,-111,-101, 92,-129,-108; /M: SY='C'; M=-101, 84, 48, -97,-125, 65,-110,-130,-109,-127,-121, 32,-119,-108, -20, 43, -76,-123,-132, -58; /M: SY='S'; M=-103,-115,-118,-116, 59, -32,-111, -98,-115, 48, 35,-109,-121,-110,-116, 75, -26,-101, 10, -95; /M: SY='A'; M= 81,-112, 13,-103,-123,-102, -29,-115,-104,-117,-111,-102, -23, -13, -5, 33, 40,-105,-127,-116; /M: SY='L'; M=-111,-116,-131,-124, -27, -34,-117, -36,-124, 85, 42,-128,-129,-118,-122,-121,-108, 32,-120,-101; /M: SY='D'; M=-104,-126, 106, -90,-116,-117,-106, 40,-106,-110,-111, -76,-117,-106, -17, -31, -96, 15,-134, 10; /M: SY='V'; M=-105,-118, 31, -91,-104, -9,-120, 37, -23, -18, 71,-114,-122,-116,-118,-113,-103, 78,-130,-108; /M: SY='D'; M= 13,-121, 87, 16,-128, 40,-107,-124,-105,-125,-121, -92,-113,-102,-113, 42,-101, -21,-134,-118; /I: I=-11; MD=-28; /M: SY='E'; M=-111,-130,-100, 61,-134, -7, 8,-137,-100,-134,-126, 48,-121, -99, 40, 48,-108,-131,-138,-124; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='H'; M= -54,-144,-127, 34,-132, 8, 49, 44,-130,-120,-119, -46,-136,-125,-135,-128,-127, 12,-149,-128; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='E'; M=-118,-135, 5, 72,-132,-130,-114, -19, 49,-128,-123,-109,-118, -62, 19,-112, 15,-125, 32,-122; D=-11; /I: I=-11; DM=-28; /M: SY='S'; M=-102, 8,-109,-103,-109,-111, -17,-115, 63, -21, 7,-100, -18, -97, -9, 72, -11,-113, 58, 39; /M: SY='S'; M=-102,-119, 34,-106, -19, 23, 44, -73,-109, 7,-107, -66, -38, -65,-112, 66, 21,-111,-117, 52; /M: SY='H'; M=-113,-129,-101, -71,-118,-118, 134,-129, 32,-117,-103, -93,-116, 78, -73,-104,-112,-129,-132, -2; /M: SY='D'; M= -27,-122, 61, 42,-109, 23, 34,-103,-108, 8,-105, -69,-117,-104,-113,-105, -20, 34,-123, 37; /M: SY='E'; M= -32,-123, -97, 77,-119, -23,-109,-105, 53, -24,-107,-107, -3, -13, -26,-106,-105, 42,-126,-115; /M: SY='W'; M=-109, 34,-104, 64, 38, -14,-113, -83, 51,-116,-115,-108,-115, -98, -68, 14,-109, -54, 110, -98; /M: SY='E'; M= -42,-127, -91, 86,-128, -93,-101,-126, 23, -51,-113,-102,-109, 72, 43, -17,-107,-121,-124,-115; /M: SY='D'; M= -27,-125, 94, 1,-123, -99,-103,-114, 28,-113, 70, -94,-115, -98, 35,-106,-106, -9,-134,-113; /M: SY='Q'; M= 64,-120,-110, -73,-126, 48, -42,-119, -41, -56, 8,-103, -7, 85,-106, -95,-107,-113,-122,-116; /M: SY='V'; M=-105, 21, 28, 14,-109, -27,-113, -28, -7, 4,-100, -48,-120,-105, 36, 12,-103, 62,-128, -19; /M: SY='P'; M= 13, -13,-103,-107,-118,-114, 62, 39,-102,-112,-105, 36, 75, -52, 37, 6,-104, -29,-129,-112; /M: SY='S'; M=-103,-118,-116,-114, 40,-115, -7, 64,-113, -49, 11,-106, 8, 2,-116, 68, 21, -51,-120,-101; /M: SY='C'; M= -11, 79,-116, -93,-112, -11, 29, 41, -4, 4, 18, -5, 49,-111,-115, 4, 6, -99,-128,-112; /M: SY='P'; M=-109,-132,-109, -96,-131,-113, 14,-123, 28,-127,-114,-107, 106, 65, -17, 25,-104,-124,-125,-119; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 236 in 20 different sequences |
| Number of true positive hits | 236 in 20 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 64 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Olduvai |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
20 sequences
MYOME_HUMAN (Q5VU43), MYOME_MOUSE (Q80YT7), MYOME_RAT (Q9WUJ3), NBP6L_BOVIN (Q32LC2), NBPF1_HUMAN (Q3BBV0), NBPF3_HUMAN (Q9H094), NBPF4_HUMAN (Q96M43), NBPF5_HUMAN (Q86XG9), NBPF6_HUMAN (Q5VWK0), NBPF7_HUMAN (P0C2Y1), NBPF8_HUMAN (Q3BBV2), NBPF9_HUMAN (P0DPF3), NBPFA_HUMAN (Q6P3W6), NBPFB_HUMAN (Q86T75), NBPFC_HUMAN (Q5TAG4), NBPFE_HUMAN (Q5TI25), NBPFF_HUMAN (Q8N660), NBPFJ_HUMAN (A0A087WUL8), NBPFK_HUMAN (P0DPF2), NBPFP_HUMAN (B4DH59)» more
|