PROSITE entry PS51394
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | PFU |
Accession [info] | PS51394 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JUL-2008 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51394 |
Associated ProRule [info] | PRU00727 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | PFU domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=100; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=95; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7570901; R2=0.0263138; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=181; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=105; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -1,-19,-15,-19,-11,-17,-22,-17, -2,-12, -2, 2,-17,-10, 1,-13, -5, -2, 2,-26,-17, -8; /M: SY='W'; M=-21,-26,-20,-30,-21, 14,-27, -8,-11,-24,-14,-13,-26,-33,-19,-25,-18,-20,-17, 38, 24,-22; /M: SY='S'; M= 0, -4,-17, -7, -3,-17,-12, -2,-18, 0,-22,-15, 3,-15, -3, -6, 11, 0,-15,-26,-10, -4; /M: M= -4,-21,-16,-23,-12,-10,-23,-11, -7,-10, -7, -5,-18,-13, -5,-12,-10,-10, -4,-14, -2,-11; /M: SY='S'; M= 5, -4,-18, -5, -3,-23, 0,-13,-20, -4,-24,-16, 0,-15, -5, -9, 10, -1,-16,-31,-21, -4; /M: SY='E'; M=-11, 2,-30, 4, 16,-21,-19, 1,-25, 5,-24,-15, 2,-15, 13, 2, 0, -4,-22,-24, -9, 14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='N'; M= -4, 0,-22, -4, 0,-21, -3, -4,-20, 1,-23,-14, 7,-14, 1, -1, 2, -6,-16,-25,-14, 0; D=-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='R'; M= -1, -3,-19, -9, -1,-20,-13, -6,-15, 8,-17,-10, 3,-13, 3, 9, 0, -3,-11,-24,-15, 0; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='W'; M=-25,-28,-21,-34,-21, 0,-28,-18,-17,-24,-16,-15,-30,-33,-12,-24,-22,-19,-24, 60, 8,-21; /M: SY='E'; M=-12, -9,-27, -9, 5,-15,-26, -3, -7, -3,-11, -4, -7,-20, 5, -4, -9,-11, -8,-22, -9, 4; /M: SY='K'; M=-13,-14,-24,-21, -5,-10,-26,-13,-12, 13, -8, -6,-13,-20, 1, 5,-10,-11,-10,-21,-11, -5; /M: SY='I'; M= -8,-29, -3,-30,-29, -5,-36,-27, 26,-27, 10, 3,-29,-20,-27,-30,-18, -9, 22,-21, -8,-27; /M: SY='G'; M= -2, -9,-29, -9,-13,-28, 41,-19,-33,-12,-35,-25,-10,-18,-15,-16, -2,-17,-24,-30,-27,-13; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M= -8, 13,-25, 20, 8,-26,-13,-11,-16, -7,-24,-17, 5,-15, -2,-13, 4, 2,-15,-35,-21, 4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='V'; M= -3,-23,-13,-24,-21, -6,-25,-17, 14,-14, 2, 2,-20,-19,-15,-17,-13, -3, 19,-20, -1,-16; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='V'; M= -4,-16,-13,-14,-16,-13,-23,-22, 10,-16, -1, -2,-16,-12,-15,-21, -6, 2, 11,-27,-14,-14; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -4, 3,-27, 7, 4,-29, 8,-12,-28, -1,-31,-23, -3, -6, -3,-10, 2,-10,-23,-32,-24, 1; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 6, -2,-17, 1, 2,-21, 8, -9,-21, -5,-25,-16, -2,-11, 1, -8, 10, -4,-16,-25,-19, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='T'; M= 0,-15,-17,-18,-10,-20,-21,-19, -5, 0,-11, -9,-12, -7, -8, -5, -2, 6, 0,-29,-18, -9; /M: SY='G'; M= -4, -9,-26,-12,-14,-25, 23,-15,-26,-13,-26,-19, -5,-20, -9,-10, 0,-13,-21,-29,-24,-13; /M: SY='A'; M= 15,-13,-13,-15, -7,-23, -6,-16,-15, 0,-21,-13,-10, -6, -5, -7, 5, 0, -6,-31,-20, -6; /M: SY='T'; M= -6, -2,-18, -8, -5,-15,-16, -8,-16, -3,-18,-11, 8,-16, 0, -7, 10, 11,-14,-27,-15, -4; /M: SY='K'; M= -6, 5,-28, 2, 8,-28,-11, 1,-28, 11,-30,-19, 5,-14, 9, 7, 4, -8,-23,-32,-19, 7; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-27, -5, 6,-24,-16, 1,-23, 10,-20,-13, 0,-15, 11, 9, -1, -6,-20,-27,-16, 6; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='K'; M= -9, -2,-24, -7, 1,-16,-11, -5,-23, 13,-23,-14, 0,-14, 6, 1, 0, -5,-17,-21,-10, 2; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='R'; M= -4, -9,-18,-12, -4,-10,-16, 0,-14, 0,-15,-10, -4,-15, 1, 2, 2, -2,-12,-18, -5, -3; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='G'; M= 1,-11,-16,-12, -9,-13, 3,-15,-11, -7,-15,-11,-11,-14,-10,-11, -2, -4, -6,-21,-14, -9; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='K'; M=-11, 5,-29, 4, 11,-26,-19, -8,-23, 21,-26,-17, -2,-13, 8, 3, -3, -9,-16,-30,-16, 9; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='V'; M= -6,-11,-18,-11, -7,-16,-23,-13, -1, -6, -7, -5,-11,-17, -5,-13, -5, 2, 3,-28,-13, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='Y'; M=-14,-18,-19,-21,-15, 3,-24, -4, -4,-17, -4, -4,-12,-25,-11,-16,-12, -6, -5,-13, 7,-14; /M: SY='Y'; M=-12,-19,-21,-22,-12, 14,-23, 4, -9,-16,-12, -9,-15,-21,-13,-18, -8,-12,-11, -7, 18,-12; /M: SY='E'; M= -1, 6,-27, 7, 15,-28, -9, -4,-26, 6,-30,-19, 3,-13, 6, -2, 3, -8,-22,-33,-20, 11; /M: SY='G'; M= 2, -7,-26, -5, -9,-28, 29,-16,-28,-14,-31,-21,-10,-17, -9,-16, 0,-14,-20,-31,-26, -9; /M: SY='K'; M= -8, 0,-30, -3, 6,-29, -4,-12,-27, 20,-29,-19, -4,-14, 5, 3, -2,-11,-19,-31,-22, 6; /M: SY='E'; M= -5, 1,-29, 6, 21,-25,-17, -3,-25, 6,-26,-16, -3, -8, 13, -3, 2, -4,-21,-27,-15, 18; /M: SY='Y'; M=-20,-29,-21,-32,-20, 27,-29, 9,-12,-17,-12,-11,-22,-31,-19,-19,-20,-20,-13, 24, 52,-20; /M: SY='D'; M=-19, 37,-39, 54, 19,-39,-11,-10,-30, -5,-39,-29, 9,-19, 1,-17, 0,-10,-29,-48,-29, 10; /M: SY='Y'; M=-11,-25,-19,-25,-16, 16,-26, 8, -5,-18, -9, -7,-19,-26,-16,-19,-16,-14, -4, 1, 36,-15; /M: SY='V'; M= -2,-23, 0,-23,-25,-14,-21,-27, 10,-22, 1, -1,-26,-22,-20,-27,-14, -6, 14,-28,-15,-21; /M: SY='F'; M=-19,-31,-18,-39,-30, 50,-32,-13, 5,-30, 5, 3,-31,-38,-29,-29,-21,-18, -5, 5, 23,-30; /M: SY='D'; M= -8, 17,-27, 27, 8,-31, -3,-11,-26, -7,-33,-23, 7,-16, 0,-15, 11, 2,-23,-39,-26, 3; /M: SY='V'; M= -6,-30,-12,-32,-30, 3,-32,-27, 28,-24, 11, 8,-30,-26,-24,-30,-20, -6, 30,-21, -4,-24; /M: SY='D'; M=-16, 25,-34, 35, 14,-33,-14, -8,-23, -7,-32,-22, 12,-18, 0,-15, 0, -3,-22,-43,-25, 8; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='I'; M= -7,-22,-12,-22,-24, -2,-31,-24, 24,-23, 9, 5,-24,-24,-22,-26,-15, -3, 22,-21, -8,-22; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= -8, 9,-35, 14, 20,-31, 4, -6,-32, -2,-34,-23, 4,-15, 6, -8, 3,-11,-29,-33,-24, 14; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='D'; M=-15, 20,-28, 23, 8,-26,-12, -5,-21, -2,-25,-17, 14,-16, 0, -8, 0, -6,-21,-34,-20, 4; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='G'; M= -2, -7,-21, -5,-13,-22, 22,-17,-21,-15,-24,-19, -7,-17,-14,-17, 3, -8,-17,-27,-22,-14; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='G'; M= -6, -4,-27, -3, -3,-25, 14,-15,-24, -3,-26,-19, -8,-17, -7,-10, -3,-13,-19,-28,-22, -4; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M=-11,-14,-28,-18, -7,-17,-18, -4,-24, -6,-21,-17,-11, 13, 1, -4, -7, -6,-19,-25,-13, -5; /M: SY='M'; M= -9,-13,-21,-14, -9,-13,-24,-17, -7, -7, -8, 1,-12, -8, -5,-13, -6, -1, -4,-26,-14,-10; /M: SY='L'; M=-15,-23,-18,-26,-14, -9,-31,-18, -1, -1, 7, 1,-21,-22, -9, -5,-16, -6, -2,-21, -7,-14; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -9, -4,-24,-10, 1,-24,-20,-10,-17, 18,-21,-14, -1, -4, 4, 3, 0, -7,-12,-28,-18, 2; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-19,-38,-12,-38,-28, 2,-38,-25, 18,-28, 33, 20,-36,-30,-19,-21,-28,-11, 10,-17, -4,-28; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M=-11,-17,-27,-17, -6,-27,-20,-11,-25, -9,-25,-24,-17, 52, -8,-17,-10,-11,-18,-28,-13, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-19,-31,-19,-33,-24, 32,-31, 5, -2,-24, -1, -1,-24,-32,-22,-23,-21,-18, -6, 11, 47,-24; /M: SY='N'; M=-20, 30,-30, 10, 0,-30,-10, 10,-30, 0,-40,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -3,-18,-21,-19, -8,-14,-23,-12, -2, -3, -9, -6,-16,-18, -6, -3,-11, -4, 3,-24, -5, -6; /M: SY='G'; M= -7, 9,-28, 7, -4,-30, 17,-10,-32, -6,-37,-25, 12,-18, -7,-11, 8, -7,-27,-35,-26, -6; /M: SY='D'; M=-14, 21,-35, 34, 23,-34,-15, -6,-27, -3,-31,-21, 5,-15, 11,-10, 1, -2,-25,-39,-25, 17; /M: SY='N'; M=-12, 24,-27, 20, 5,-30, -7, -1,-27, -3,-37,-23, 34,-17, 0, -8, 16, 0,-27,-40,-23, 3; /M: SY='P'; M= -9,-22,-25,-22,-15,-26,-23,-21,-15,-14,-19,-20,-21, 48,-14,-22,-11, -6, -9,-33,-22,-14; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-23,-22,-11, 11,-26, 7,-12,-15,-12, -5,-13,-27, -7,-16,-15,-16,-13, 5, 24,-10; /M: SY='E'; M=-12, -1,-25, 2, 4,-16,-22,-12,-11,-10,-12, -8, -6,-20, -2,-13, -7, -4,-11,-29,-15, 1; /M: SY='A'; M= 19,-20, -5,-20,-15,-17,-13,-23, 2,-13, -9, -5,-18,-13,-13,-15, 2, 11, 10,-29,-17,-13; /M: SY='A'; M= 36,-21, -1,-21,-12,-19, -3,-21, -6,-11,-17, -8,-21,-11,-11,-12, 7, 0, 4,-30,-19,-11; /M: SY='Q'; M=-10, 7,-31, 11, 20,-28,-16, 1,-28, 7,-27,-14, 2,-13, 26, 3, 4, -8,-24,-28,-18, 20; /M: SY='R'; M=-10, 5,-30, -3, 5,-27,-15, 4,-28, 16,-29,-19, 13,-15, 11, 17, 5, -6,-25,-31,-18, 5; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-29, 56,-30, -8, -1,-29, -1, -1,-30,-39,-29,-29,-20,-20,-11, 14, 32,-29; /M: SY='I'; M= -9,-33, 10,-35,-32, -6,-36,-30, 23,-28, 18, 7,-33,-28,-25,-29,-21, -8, 18,-22,-12,-30; /M: SY='E'; M= -6, -2,-26, -2, 10,-22,-18, 4,-19, 1,-20,-13, -2,-15, 9, -1, 0, -8,-17,-27,-14, 9; /M: SY='R'; M= -7, 0,-35, -2, 15,-30,-18, -4,-29, 21,-26,-20, 0,-14, 11, 25, -2, -9,-26,-31,-21, 12; /M: SY='H'; M=-18, 9,-32, 1, 11,-18,-18, 41,-29, -3,-32,-20, 19,-18, 9, -1, -3,-13,-29,-26, 2, 8; /M: SY='N'; M= -6, 7,-28, 4, 7,-29, -1, -4,-29, 6,-32,-19, 10,-14, 9, -1, 6, -7,-24,-32,-22, 7; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M=-17,-37,-11,-37,-29, 1,-38,-27, 22,-28, 31, 16,-36,-29,-21,-22,-27,-10, 15,-19, -5,-28; /M: SY='P'; M= -3, -5,-25, -4, 1,-32,-12,-13,-26, -4,-30,-24, -4, 26, -3,-10, 7, -4,-21,-36,-25, -1; /M: SY='Q'; M= -9,-14,-24,-15, -3,-21,-26,-12, -7, -4, -9, -3,-14, -3, 7, -6, -9, -6, -4,-27,-18, 0; /M: SY='S'; M= 1, -5,-20, -7, -3,-19, -6, -7,-21, 2,-24,-15, -2,-15, -2, -2, 10, -1,-17,-28,-16, -4; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-20,-26,-19, 19,-27, 11, -7,-19, -8, -6,-14,-28,-16,-19,-14,-14, -8, -1, 33,-18; /M: SY='L'; M=-14,-26,-17,-28,-19, -8,-34,-22, 13,-13, 15, 9,-25,-25,-11,-10,-19,-10, 8,-22,-13,-18; /M: SY='E'; M=-14, 14,-36, 20, 21,-35,-16, -5,-30, 3,-33,-23, 5, 1, 11, -7, -1, -9,-27,-37,-25, 17; /M: SY='Q'; M= -7, 1,-30, 2, 21,-28,-17, 2,-28, 12,-25,-11, 2,-11, 34, 9, 5, -7,-23,-25,-20, 24; /M: SY='I'; M= -8,-31,-10,-31,-30, -3,-37,-30, 35,-27, 18, 11,-31,-27,-26,-29,-21, -7, 32,-23,-10,-27; /M: SY='A'; M= 11,-18,-13,-18, -8,-18,-16,-17, -3, -8, -9, -4,-17,-15, -2, -8, -2, -3, 3,-28,-17, -5; /M: SY='N'; M= -6, 9,-27, 6, 7,-29, -7, -3,-27, 1,-30,-16, 13,-15, 10, -1, 4, -3,-22,-33,-22, 7; /M: SY='F'; M=-15,-30,-18,-38,-28, 45,-28,-13, 1,-28, 3, 6,-29,-36,-25,-27,-18,-17, -6, 2, 20,-28; /M: SY='I'; M=-12,-33,-10,-33,-30, -1,-39,-30, 34,-29, 24, 13,-33,-29,-27,-27,-23, -9, 26,-21,-10,-29; /M: SY='M'; M=-10,-17,-20,-20,-12,-12,-27,-17, 3, -6, 1, 9,-12,-23, -7, -8,-10, -7, 2,-25,-14,-12; /M: SY='Q'; M= -4, -4,-26, -7, 7,-27,-18, -4,-24, 14,-20, -9, -3,-13, 21, 11, -1, -8,-17,-27,-20, 10; /M: SY='N'; M=-18, 23,-31, 9, 8,-29,-13, 13,-30, 1,-37,-19, 45,-18, 8, 1, 7, -3,-29,-36,-18, 7; /M: SY='T'; M= -3,-22, 3,-23,-21,-10,-25,-20, 3,-18, -2, 0,-16,-20,-15,-22, -4, 10, 7,-23, -9,-19; /M: SY='N'; M= -9, 10,-29, 8, 11,-30,-11, -5,-28, 9,-32,-20, 12, -7, 8, -1, 6, -6,-24,-34,-22, 9; /M: SY='P'; M= -6,-15,-26,-17,-14,-22, 7,-16,-25,-10,-27,-22,-14, 10,-13,-17, -4,-12,-18,-27,-17,-13; /M: SY='Q'; M= -7, -7,-22, -8, -2,-22,-16, -7,-14, -5,-14, -9, -7,-12, 2, -8, -5, -6,-11,-29,-17, -2; /M: M=-11, -5,-21, -5, -6,-16,-20, -8,-10,-11, -9, -4, -1,-21, 0,-12, -4, -6,-10,-27,-11, -6; /M: SY='I'; M= -8,-17,-15,-21,-17,-13,-20,-19, 1,-14, 1, -1,-12,-22,-14,-13, -8, -3, -1,-26,-16,-17; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-25, -4, 1,-25, -4, -8,-24, 1,-23,-12, 2,-15, 8, 0, 5, -3,-20,-29,-21, 2; /M: SY='Q'; M= -5, -8,-23,-13, -3,-17,-13, -8,-18, -1,-16, -7, -2,-18, 3, 1, -2, -4,-15,-25,-15, -2; /M: SY='Q'; M= -6, -9,-21,-13, -7,-20,-17,-10, -9, -7,-11, -5, -2,-15, 3, -4, -3, -6, -7,-28,-18, -5; /M: SY='N'; M= -5, -1,-21, -8, -6,-16, -7, -7,-22, -4,-26,-16, 9,-12, -3, -9, 9, 2,-18,-27,-15, -5; /M: SY='S'; M= 3, -3,-21, -7, -4,-20, -4,-11,-22, -3,-28,-18, -1, -8, -6, -9, 4, -7,-17,-30,-18, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | PFU |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
DOA1_YEAST (P36037), LUB1_SCHPO (O94289), PLAP_HUMAN (Q9Y263), PLAP_MOUSE (P27612), PLAP_RAT(P54319), PLAP_XENLA (Q6GM65), UFD3_CAEEL (G5EES6)» more
|
PDB [Detailed view] |
7 PDB
2K89; 2K8A; 2K8B; 2K8C; 3L3F; 3PSP; 3PST |