Home  |  Contact
Entry: PS51426

General information about the entry

Entry name [info] ABL
Accession [info] PS51426
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2009 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51426
Associated ProRule [info] PRU00751

Name and characterization of the entry

Description [info] ABL domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=101;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=96;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5114830; R2=0.0103807; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14721.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=674; H_SCORE=14721; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=481; H_SCORE=14721; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q';  M= 17, -3,-23, -3,  6,-18, -6,-10,-10,  0,-17,-10, -3, -7, 20,  1, 19, 12,-11,-29,-22,  6;
/M: SY='G';  M=  3, -2,-33,-10,-14,-28, 47,-24,-10, -8,-17,-15,  0, -7, -1,-14,  2, -5,-23, -4,-23, -9;
/M: SY='K';  M= -1, -1,-23, -8, -2, -9,-11,-17, -3, 14,-11, 10, 10, -7,  0,  6, -1, -2, -5,-29,-13, -4;
/M: SY='R';  M= -3,-14, -3,-16,-10, -9,-21,-21, -1, -1, -5,  2, -9,-14,  1, 15, -5, -4,  6,-21, -9, -8;
/M: SY='C';  M=-22,-18,115,-29,  1,-18,-32,-39, -1,-27,  9, -9,-10,-30,-20,-22,-18,-14, -6,-22,-39, -6;
/M: SY='W';  M=-36,-40, -8,-41,-17, 21, -4,-42,-10,-19, -5,-21,-44,-32,-16, -8,-23,-35,-11,115, 29,-18;
/M: SY='L';  M= -8,-12, -3,-15,-13, 17,-18,-12, 27,-20, 37, 18,-17,-30,-20,-22,-18,  0, 15,-22, 23,-13;
/M: SY='A';  M= 20,  5,-26, 12, -1,-22, -5,-17,-12,  1,-12, -3,  0, -9,  5,  0, 12,  7,  0,-39,-25, -2;
/M: SY='I';  M=  5,-20,-20,-30,-30,  5,-20,-25, 50,-20, 15,  5,-10,-35,-25,-20,-10,  5, 45,-30,  0,-30;
/M: SY='R';  M= -8,-17,-22, -8, -3,-12,-18,-10,-28, 15,-21,  1,-17,  2, 23, 61, -8,-24,-14, -6, -3,  2;
/M: SY='N';  M=  0, 40,-10, 10,-10,-10,  0,-10,  0,  0,-20,  0, 80,-30,-10,-20,  0, 10,-20,-70,-40,-10;
/M: SY='A';  M= 16, -3,-18, -4, -5, -5, -9,-15,  5, -8,  6,  8, -6,-16, -4,-15,  6, 12,  7,-37,-11, -6;
/M: SY='Y';  M= -7,-15,-35, -6, -9,  2,-15, -8,-14, -1, -2, -7,-19,-13,  4, 18,  2, -5,  0,  2, 19, -9;
/M: SY='L';  M= -7,-12, -3,-13,-10, 14,-20, -5, 18,-14, 37, 26,-17,-32,-18,-17,-20,  0,  8,-22, 24,-10;
/M: SY='C';  M= -7, -5, 41, -3, 36,-36,-10,-17,-25,  3, -9,-14, -8, -3,  4,-14, -5,-20,-28, -9,-31, 27;
/M: SY='Q';  M=  9, -5,-17, -2, 13,-21,-11, -7,-17,  5,-17, -9, -7, -4, 25, 13, 10,  0,-15,-20,-17, 14;
/M: SY='F';  M=-29,-30,-43,-33,-31, 70,-30,-17, -4,-10, 24,-16,-23,-31,-21, -6,-14,-16, 10, 27, 56,-31;
/M: SY='L';  M= -6,-13, -5,-15,-15, 16,-21,-14, 27,-20, 33, 16,-18,-32,-22,-19,-17,  2, 20,-23, 23,-15;
/M: SY='Z';  M=  0, -6, -2, -2, 28,-20,-20, -3,-13,  3,  1, -2,-13, -4, 27,  0, -9, -8,-19,-13, -3, 30;
/M: SY='R';  M=  3, -1,-20,  6, -8,-15,-16,-15,-13, -2, -3,  0, -6,-11,  7, 13,  0,  2, -1,-27, -4, -4;
/M: SY='Y';  M=-12,-14,-20,-14,-14, 27,-18,-11,  4,-12, 21, -1,-17,-25,-17,-13, -4,  0,  5, -6, 28,-16;
/M: SY='L';  M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='Q';  M=  8, -9,-24, -9, -4,-16, -1,-14, -7, -3,-14, -8, -9,-12, 18, 13,  2, -2, -7,-16,-13,  1;
/M: SY='Y';  M=-25,-22,-40, -9, -4,  2,-26, 19,-19, -3,  7, -3,-27, -9,  5, 17,-14,-18, -6, 15, 40, -3;
/M: SY='H';  M= -4,-15,-31,-18, -9,  1,-21, 31, -4,-11, -6, -3, -9,-12, -2, -5,  2, -3, -5,-28,  0, -9;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20,  0,-10,-20,-20,  0,-20,-30, 10,-30,-20;
/M: SY='L';  M=  3,-12,-12,-16,-13,  5,-17,-11, 23,-12, 24, 20,-12,-29,-15,-16,-13,  2, 17,-28,  7,-13;
/M: SY='H';  M= -5,-13,-30,-16,-12,-15,-26, 48,  0,-17,  2, 11, -7, -5, -7,-17, -2,  8, -1,-43,  2, -9;
/M: SY='V';  M=  5,-12, 12,-20,-17,-10,-22,-28, 17,-17,  5, -1, -5,-23,-14,-20, -2, 13, 21,-36,-17,-16;
/M: SY='Q';  M=  4,-13,-17,-13, -9, -7,-23,-14,  4, -9,  0,  0,-13,-17, 15, 10, -7,  6,  7,-21,  3, -1;
/M: SY='R';  M= -6, -3,-15,  5, -8, -8,-18,-13,-11, -4,  4,  2,-11,-15,  3, 17, -7, -6, -2,-20,  7, -5;
/M: SY='Y';  M=-37,-30,-55,-17,-23, 42,-30, -5, -8,-10, 28,-12,-35,-23,-13, -2,-18,-12, 10, 43, 80,-23;
/M: SY='C';  M=  0,  2, 17, -4, 14,-25,-17,-14,-14, -1,-11,-10,  9, -8,  9,-11,  5,  6,-17,-31,-26, 12;
/M: SY='G';  M=  0, 13,-18, 14, 12,-34, 23,-16,-20,  3,-15,-16,  8, -6, -4,-15,  0,-15,-27,-14,-25,  7;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q';  M=  7, -5,-11, -4, 25,-31,-20, -3,-20,  4,-13, -8, -7,  3, 48,  7, -2,  3,-23,-17,-13, 34;
/M: SY='Q';  M=  9,  1,-13, -4, 16,-24,-13, -7, -6,  2,-11, -3,  7, -8, 28, -1, -3, -2,-14,-28,-22, 20;
/M: SY='T';  M=  2,-12,-19,-13,-14,-10,-21,-14,  8,-10,  2, -7,-13, 10,-12,-18, -2, 18, 10,-35,  0,-14;
/M: SY='S';  M= 11, -2,-16, -1, 10,-20, -9, -9,-12,  2,-15,-11, -2, -4, 12, -7, 20, 14,-11,-29,-19,  8;
/M: SY='P';  M= -3,-13,-25,-12,  5,-15,  0, -7,-19,  5,-15,-24,-16, 39, -3,-12, -5, -9,-24,-16,-16, -1;
/M: SY='D';  M=  2, 24,-10, 26, 17,-28, -8, -9,-19,  6,-15,-13, 25,-11, -1,-13,  6, -2,-21,-39,-24, 10;
/M: SY='D';  M=  0, 42,-24, 77, 18,-48,-12,-17,-38,  3,-10,-27,  7, -7, -5,-10,  0,-12,-22,-35,-12,  8;
/M: SY='I';  M=  2,-22,-22,-32,-29, 19,-23,-20, 34,-12, 16,  8,-10,-37,-24,-14,-12,  1, 33,-23,  5,-29;
/M: SY='I';  M= -6,-18,-14,-28,-21, 21,-18,-13, 29,-13, 28, 16, -9,-33,-20,-19,-15, -3, 19,-20, 12,-21;
/M: SY='I';  M=  0,-20,-20,-40,-30,  0,-10,-20, 60,-20, 20, 10,  0,-30,-20,-30,-10,  0, 40,-30,-10,-30;
/M: SY='C';  M= -2, -8, 37,-14, -6,-17,-21,-27, -5,-14, -5,-12, -2,-16,-12,-19, 11, 16, -1,-33,-26, -9;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-18, -4,-36, 10, -1,  0,-24, 15,-21, -5,  6,-11,-13,-11, -7, -7, -9,-15,-10, -5, 24, -5;
/M: SY='P';  M=  2, -3,-27,  7,  0,-30,-13, -8,-15,  0,-15,-23,-14, 42, -5,-13, -3,  7,-12,-36,-15, -6;
/M: SY='D';  M=  5,  2,-14, 10, 10,-19,-14,-11,-10, -1, -6,-12, -7,-11,  5, -5,  6,  2, -7,-24, -8,  7;
/M: SY='Q';  M= 11, -7, 13, -7, 14,-25,-15,-16,-14, -3,-13, -8, -6, -8, 24,  0,  2,  0,-14,-26,-30, 16;
/M: SY='L';  M= -5,-11,-16, -9,  4, -7,-20,  4,  0, -2,  5,  4,-16,  4, -9,-10,-11, -4, -5,-25,  4,  0;
/M: SY='D';  M=  2, 12,-20, 21,  8,-26,-11,-15,-12,  5, -7, -9,  2, -6, -5,-12,  6,  0, -8,-30,-13,  2;
/M: SY='W';  M=-12,-11,-23,-16, -9,-11, 12,-21, -7, -7,-16,-18, -8, -3,-11,-13, -4,-10,-18, 25, -7,-13;
/M: SY='P';  M=  0,-12,-26, -8,  4,-27, -1, -4,-22,  3,-23,-21,-15, 29, 20, 12,  0, -4,-27,-16,-16,  5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I';  M=  7, -7,-20,-10,-15, -4,  8,-20, 12,-11,  2,  0, -9,-20,-15,-12, -4, -1, 10,-17, -6,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-18,-20, 10,-13, -8, -3,-25,-15,-18, -5,  0, -2,-21,-18,  8, 35,-15,-21, -6,  1,  8, -5;
/M: SY='A';  M= 35, -2,-28, -2,  3,-22, -3,-17, -3,  0,-12,  7, -2, -8, 22, -3,  7,  8,  3,-43,-35,  7;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-33,-23,-19, 16,-20, -5, -3,-13,  4, -6,-21,-20,-12,-10, -8, -5,  5, 17, 23,-17;
/M: SY='I';  M=  2,-20,-20,-35,-30,  2,-15,-22, 55,-20, 18,  8, -5,-32,-22,-25,-10,  2, 42,-30, -5,-30;
/M: SY='C';  M= -1,-12, 14,-12,  3,-18,-25,-19, -7, -6, -6, -6,-11,-14, 11,  7, -6, -2, -1,-20,-13,  6;
/M: SY='F';  M=-10,-21,-18,-33,-25, 43,-22,-16, 18,-11, 26,  8,-10,-35,-23,-15,-14, -8, 14,-11, 18,-25;
/M: SY='C';  M= -8,-10, 19, -9, -1, -8,-15,-18,-12, -9, -6,-18, -9,-17,-12,-11, 15,  5, -9,-14,-11, -9;
/M: SY='N';  M= -1, -2,-16, -8, -4,-18, -3,-14, -5,  0, -9, -3,  7,-11,  4,  3, -1, -4, -7,-23,-16, -1;
/M: SY='E';  M= -1, -1,-19, 11, 17,-30,-18, 16,-26,  5,-12, -3, -8,  0, 13, 12, -3,-17,-19,-24,-13, 15;
/M: SY='H';  M=-27,-23,-53,-17, -7,-10,-30, 94,-17,-17,  3, 10,-20,  0, -3, -7,-13,-17,-17,-17, 30, -7;
/M: SY='I';  M= -3,-14,-20,-35,-29, 16,-12,-20, 42,-16, 15,  4,  8,-32,-20,-25, -9, -2, 27,-28, -7,-29;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-31, -7, -6,-32, 63,-25,-13, -5,-18,-18, -2, -7,-13,-18,  0,-20,-30,  7,-28, -8;
/M: SY='P';  M= -2,-13,-20,-14, -6,-13, -9, -6,  5, -5, -5,-13,-13, 21,-11,-16,  3,  6, -5,-28,-10,-12;
/M: SY='P';  M= 13,-11,-30, -5,  5,-31, -5, -4,-16,  5,-21,-17,-16, 56,  5,-10, -1,  5,-17,-39,-29,  0;
/M: SY='Z';  M=  0, -5, -8, -2, 25,-18,-18, -6,-13,  8, -2,  2,-11, -2, 23,  2, -8, -8,-19,-14, -3, 26;
/M: SY='E';  M=  2, -2, -7,  4, 42,-29,-17, -6,-25, 23,-15, -1, -7,  8, 23,  2, -2,-14,-27,-13,-15, 36;
/M: SY='I';  M=  2,-14,-21,-24,-19, -4,-15,-20, 28, -7,  6,  8, -3,-19,-10,-11, -4,  4, 23,-29, -7,-18;
/M: SY='R';  M=  8, -9,-22, -5, -5,-12, -9,-12,-17,  5,-18, -4, -9,-10, 13, 31, 10, -5, -5,-21,-16, -3;
/M: SY='P';  M= -5,-11,-12, -1, 33,-40,-15,  5,-30, 15,-21,-26,-21, 64,  9,-10, -5, -9,-35,-21,-20, 23;
/M: SY='G';  M=  6, 13,-29, -2,-14,-22, 42,-22, -5, -5,-18, -9, 26,-17,-12,-18,  2, -6,-21,-25,-35,-14;
/M: SY='Y';  M=-21, -9,-33, -3,  4, -1,-22, 16,-14, -2,  7, -5, -8,-11, -1, -7,-10,-10,-10,  2, 29,  1;
/M: SY='W';  M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10,  0,-30,-50,-30,200, 50,-10;
/M: SY='L';  M= -4,-12,-15,-12,-12,  5,-21,  8, 14,-17, 16,  9,-15,-23,-18,-15, -7,  2, 11,-28, 13,-13;
/M: SY='H';  M=-15,-16,  7,-17,  1,-15,-27, 44, -8,-19,  6,  9,-13,-10,  0,-10,-15,-11,-16,-31, -3,  2;
/M: SY='S';  M=  7,  6,-21,  0, -4,-13, 10,-13, -8, -1,-20,-17, 13,-13,-11,-13, 29, 13,-14,-31,-24,-11;
/M: SY='T';  M=  7, -8,-22,-12,-18,-16,-21,-18,  5, -9, -2, -6, -3,  7, -7,-22,  8, 33, 12,-42, -7,-13;
/M: SY='S';  M=  5,-10,-37, -3, -7, -1,-10,-11, -6, -3,  0, -5,-13,-13, -2, -7,  8,  6,  4,-11,  8, -9;
/M: SY='T';  M=  3, -8,-29,-13, -8, -1,-17,  4, -8,  0, -5,  3,  0, -5, -4,-12,  8,  9, -3,-34, -8, -8;
/M: SY='L';  M=  0,-12,-15, -9, -5, -3,-15, -8,  5, -9, 11,  0,-20, 10,-11,-15,-12,  3,  0,-28,  4, -8;
/M: SY='H';  M= -8, -4,-30,-11, -4,-19, -5, 48, -9,-12, -7,  7,  6, -7,  2,-10, -8, -9,-22,-35, -8, -1;
/M: SY='E';  M= -3, 13,-10, 31, 37,-42,-18, 11,-32,  9,-10,-12, -4,  4,  8,-10, -1,-17,-27,-24,-14, 28;
/M: SY='L';  M= -8,-12, -3,-15,-13, 17,-18,-12, 26,-20, 37, 18,-17,-30,-20,-22,-18,  0, 15,-22, 24,-13;
/M: SY='P';  M= -2,-17,-25,-15, -5,-21,-11, -4, -1, -1,-14,-22,-19, 44,-10,-13, -2,  5, -8,-30,-14,-11;
/M: SY='A';  M=  8, -1,-24,  5,  0,-14,-12,-16, -4,  2, -4, -1, -9,  4, -7, -8, -4,  1,  0,-33,-10, -4;
/M: SY='L';  M= -5,-13, -7,-18,-13, 10,-18, -7, 25,-14, 33, 25,-13,-32,-18,-19,-18,  0, 14,-23, 17,-13;
/M: SY='I';  M= -7,-13, -7,-20,-17, 13,-17,-13, 33,-20, 33, 17,-13,-30,-20,-23,-17,  0, 20,-23, 17,-17;
/M: SY='D';  M=  8, 12,-10, 16, 15,-22,-11,-11,-11,  2, -3, -1,  7,-11,  2,-13, -1, -3,-10,-35,-18, 11;
/M: SY='R';  M=-16,-22,-27,-13, -3, -4,-16,-14,-24,  4,-12, -5,-26,-10, 23, 38,-13,-22,-15, 33, 18,  4;
/M: SY='I';  M= -5,-15,-10,-26,-20, 10,-15,-15, 41,-20, 30, 15,-10,-30,-20,-25,-15,  0, 26,-25,  9,-20;
/M: SY='Y';  M=-24,-24,-40,-15,-15, 12,-22, -3,  2,-10, 19, -8,-29,  0,-11, -9,-17, -5,  6, 13, 46,-17;
/M: SY='R';  M= -1,-12,-17, -7, -2, -9,-15, -8,-16,  1,-11, -4,-13,-11, 21, 34,  1, -8,-11,-12, -3,  3;
/M: SY='H';  M= -2,-11,-29,-18,-12,-20,  0,  9,  4,-10, -7, -6, -4,  9, -9,-20,  3,  5, -5,-31,-14,-13;
/M: SY='E';  M=  2, 12,-11, 17, 28,-30,-14, -8,-24, 14,-15, -6,  9, -1, 16, -2, -2, -9,-25,-26,-18, 25;
/M: SY='H';  M=  0,-12,-19,-13,  2,-12,-19, 21, -4, -6,  4, 12,-10,-14, 16,  1, -8, -1,-12,-24,  1,  7;
/M: SY='E';  M=  1, -1,-15,  9, 29,-36,-16, 18,-25,  7,-13, -9,-10, 20,  9,-10, -2,-11,-24,-28,-19, 22;
/M: SY='T';  M=  9,  0,-21,  4,-11,-10,-13,-19,  3, -8, -7,-12, -3,-18,-15,-13, 17, 18, 10,-34, -8,-15;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 4 in 4 different sequences
Number of true positive hits 4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] ABL
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
4 sequences

RCSC_ECOLI  (P0DMC5    ), RCSC_ECOLX  (P0DMC6    ), RCSC_SALTI  (Q56128    ), 
RCSC_SALTY  (P58662    )
» more

PDB
[Detailed view]
2 PDB

2AYX; 2AYY

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission