 |
|
| Entry: PS51426 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ABL |
| Accession [info] | PS51426 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2009 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 03-AUG-2022 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51426 |
| Associated ProRule [info] | PRU00751 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | ABL domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=101; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=96; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5114830; R2=0.0103807; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14721.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=674; H_SCORE=14721; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=481; H_SCORE=14721; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= 17, -3,-23, -3, 6,-18, -6,-10,-10, 0,-17,-10, -3, -7, 20, 1, 19, 12,-11,-29,-22, 6; /M: SY='G'; M= 3, -2,-33,-10,-14,-28, 47,-24,-10, -8,-17,-15, 0, -7, -1,-14, 2, -5,-23, -4,-23, -9; /M: SY='K'; M= -1, -1,-23, -8, -2, -9,-11,-17, -3, 14,-11, 10, 10, -7, 0, 6, -1, -2, -5,-29,-13, -4; /M: SY='R'; M= -3,-14, -3,-16,-10, -9,-21,-21, -1, -1, -5, 2, -9,-14, 1, 15, -5, -4, 6,-21, -9, -8; /M: SY='C'; M=-22,-18,115,-29, 1,-18,-32,-39, -1,-27, 9, -9,-10,-30,-20,-22,-18,-14, -6,-22,-39, -6; /M: SY='W'; M=-36,-40, -8,-41,-17, 21, -4,-42,-10,-19, -5,-21,-44,-32,-16, -8,-23,-35,-11,115, 29,-18; /M: SY='L'; M= -8,-12, -3,-15,-13, 17,-18,-12, 27,-20, 37, 18,-17,-30,-20,-22,-18, 0, 15,-22, 23,-13; /M: SY='A'; M= 20, 5,-26, 12, -1,-22, -5,-17,-12, 1,-12, -3, 0, -9, 5, 0, 12, 7, 0,-39,-25, -2; /M: SY='I'; M= 5,-20,-20,-30,-30, 5,-20,-25, 50,-20, 15, 5,-10,-35,-25,-20,-10, 5, 45,-30, 0,-30; /M: SY='R'; M= -8,-17,-22, -8, -3,-12,-18,-10,-28, 15,-21, 1,-17, 2, 23, 61, -8,-24,-14, -6, -3, 2; /M: SY='N'; M= 0, 40,-10, 10,-10,-10, 0,-10, 0, 0,-20, 0, 80,-30,-10,-20, 0, 10,-20,-70,-40,-10; /M: SY='A'; M= 16, -3,-18, -4, -5, -5, -9,-15, 5, -8, 6, 8, -6,-16, -4,-15, 6, 12, 7,-37,-11, -6; /M: SY='Y'; M= -7,-15,-35, -6, -9, 2,-15, -8,-14, -1, -2, -7,-19,-13, 4, 18, 2, -5, 0, 2, 19, -9; /M: SY='L'; M= -7,-12, -3,-13,-10, 14,-20, -5, 18,-14, 37, 26,-17,-32,-18,-17,-20, 0, 8,-22, 24,-10; /M: SY='C'; M= -7, -5, 41, -3, 36,-36,-10,-17,-25, 3, -9,-14, -8, -3, 4,-14, -5,-20,-28, -9,-31, 27; /M: SY='Q'; M= 9, -5,-17, -2, 13,-21,-11, -7,-17, 5,-17, -9, -7, -4, 25, 13, 10, 0,-15,-20,-17, 14; /M: SY='F'; M=-29,-30,-43,-33,-31, 70,-30,-17, -4,-10, 24,-16,-23,-31,-21, -6,-14,-16, 10, 27, 56,-31; /M: SY='L'; M= -6,-13, -5,-15,-15, 16,-21,-14, 27,-20, 33, 16,-18,-32,-22,-19,-17, 2, 20,-23, 23,-15; /M: SY='Z'; M= 0, -6, -2, -2, 28,-20,-20, -3,-13, 3, 1, -2,-13, -4, 27, 0, -9, -8,-19,-13, -3, 30; /M: SY='R'; M= 3, -1,-20, 6, -8,-15,-16,-15,-13, -2, -3, 0, -6,-11, 7, 13, 0, 2, -1,-27, -4, -4; /M: SY='Y'; M=-12,-14,-20,-14,-14, 27,-18,-11, 4,-12, 21, -1,-17,-25,-17,-13, -4, 0, 5, -6, 28,-16; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 30,-10; /M: SY='Q'; M= 8, -9,-24, -9, -4,-16, -1,-14, -7, -3,-14, -8, -9,-12, 18, 13, 2, -2, -7,-16,-13, 1; /M: SY='Y'; M=-25,-22,-40, -9, -4, 2,-26, 19,-19, -3, 7, -3,-27, -9, 5, 17,-14,-18, -6, 15, 40, -3; /M: SY='H'; M= -4,-15,-31,-18, -9, 1,-21, 31, -4,-11, -6, -3, -9,-12, -2, -5, 2, -3, -5,-28, 0, -9; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='L'; M= 3,-12,-12,-16,-13, 5,-17,-11, 23,-12, 24, 20,-12,-29,-15,-16,-13, 2, 17,-28, 7,-13; /M: SY='H'; M= -5,-13,-30,-16,-12,-15,-26, 48, 0,-17, 2, 11, -7, -5, -7,-17, -2, 8, -1,-43, 2, -9; /M: SY='V'; M= 5,-12, 12,-20,-17,-10,-22,-28, 17,-17, 5, -1, -5,-23,-14,-20, -2, 13, 21,-36,-17,-16; /M: SY='Q'; M= 4,-13,-17,-13, -9, -7,-23,-14, 4, -9, 0, 0,-13,-17, 15, 10, -7, 6, 7,-21, 3, -1; /M: SY='R'; M= -6, -3,-15, 5, -8, -8,-18,-13,-11, -4, 4, 2,-11,-15, 3, 17, -7, -6, -2,-20, 7, -5; /M: SY='Y'; M=-37,-30,-55,-17,-23, 42,-30, -5, -8,-10, 28,-12,-35,-23,-13, -2,-18,-12, 10, 43, 80,-23; /M: SY='C'; M= 0, 2, 17, -4, 14,-25,-17,-14,-14, -1,-11,-10, 9, -8, 9,-11, 5, 6,-17,-31,-26, 12; /M: SY='G'; M= 0, 13,-18, 14, 12,-34, 23,-16,-20, 3,-15,-16, 8, -6, -4,-15, 0,-15,-27,-14,-25, 7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M= 7, -5,-11, -4, 25,-31,-20, -3,-20, 4,-13, -8, -7, 3, 48, 7, -2, 3,-23,-17,-13, 34; /M: SY='Q'; M= 9, 1,-13, -4, 16,-24,-13, -7, -6, 2,-11, -3, 7, -8, 28, -1, -3, -2,-14,-28,-22, 20; /M: SY='T'; M= 2,-12,-19,-13,-14,-10,-21,-14, 8,-10, 2, -7,-13, 10,-12,-18, -2, 18, 10,-35, 0,-14; /M: SY='S'; M= 11, -2,-16, -1, 10,-20, -9, -9,-12, 2,-15,-11, -2, -4, 12, -7, 20, 14,-11,-29,-19, 8; /M: SY='P'; M= -3,-13,-25,-12, 5,-15, 0, -7,-19, 5,-15,-24,-16, 39, -3,-12, -5, -9,-24,-16,-16, -1; /M: SY='D'; M= 2, 24,-10, 26, 17,-28, -8, -9,-19, 6,-15,-13, 25,-11, -1,-13, 6, -2,-21,-39,-24, 10; /M: SY='D'; M= 0, 42,-24, 77, 18,-48,-12,-17,-38, 3,-10,-27, 7, -7, -5,-10, 0,-12,-22,-35,-12, 8; /M: SY='I'; M= 2,-22,-22,-32,-29, 19,-23,-20, 34,-12, 16, 8,-10,-37,-24,-14,-12, 1, 33,-23, 5,-29; /M: SY='I'; M= -6,-18,-14,-28,-21, 21,-18,-13, 29,-13, 28, 16, -9,-33,-20,-19,-15, -3, 19,-20, 12,-21; /M: SY='I'; M= 0,-20,-20,-40,-30, 0,-10,-20, 60,-20, 20, 10, 0,-30,-20,-30,-10, 0, 40,-30,-10,-30; /M: SY='C'; M= -2, -8, 37,-14, -6,-17,-21,-27, -5,-14, -5,-12, -2,-16,-12,-19, 11, 16, -1,-33,-26, -9; /M: SY='D'; M= 0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40, 0,-10,-30, 10,-10,-10,-10, 0,-10,-20,-40,-10, 0; /M: SY='Y'; M=-18, -4,-36, 10, -1, 0,-24, 15,-21, -5, 6,-11,-13,-11, -7, -7, -9,-15,-10, -5, 24, -5; /M: SY='P'; M= 2, -3,-27, 7, 0,-30,-13, -8,-15, 0,-15,-23,-14, 42, -5,-13, -3, 7,-12,-36,-15, -6; /M: SY='D'; M= 5, 2,-14, 10, 10,-19,-14,-11,-10, -1, -6,-12, -7,-11, 5, -5, 6, 2, -7,-24, -8, 7; /M: SY='Q'; M= 11, -7, 13, -7, 14,-25,-15,-16,-14, -3,-13, -8, -6, -8, 24, 0, 2, 0,-14,-26,-30, 16; /M: SY='L'; M= -5,-11,-16, -9, 4, -7,-20, 4, 0, -2, 5, 4,-16, 4, -9,-10,-11, -4, -5,-25, 4, 0; /M: SY='D'; M= 2, 12,-20, 21, 8,-26,-11,-15,-12, 5, -7, -9, 2, -6, -5,-12, 6, 0, -8,-30,-13, 2; /M: SY='W'; M=-12,-11,-23,-16, -9,-11, 12,-21, -7, -7,-16,-18, -8, -3,-11,-13, -4,-10,-18, 25, -7,-13; /M: SY='P'; M= 0,-12,-26, -8, 4,-27, -1, -4,-22, 3,-23,-21,-15, 29, 20, 12, 0, -4,-27,-16,-16, 5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='I'; M= 7, -7,-20,-10,-15, -4, 8,-20, 12,-11, 2, 0, -9,-20,-15,-12, -4, -1, 10,-17, -6,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='R'; M=-18,-20, 10,-13, -8, -3,-25,-15,-18, -5, 0, -2,-21,-18, 8, 35,-15,-21, -6, 1, 8, -5; /M: SY='A'; M= 35, -2,-28, -2, 3,-22, -3,-17, -3, 0,-12, 7, -2, -8, 22, -3, 7, 8, 3,-43,-35, 7; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-33,-23,-19, 16,-20, -5, -3,-13, 4, -6,-21,-20,-12,-10, -8, -5, 5, 17, 23,-17; /M: SY='I'; M= 2,-20,-20,-35,-30, 2,-15,-22, 55,-20, 18, 8, -5,-32,-22,-25,-10, 2, 42,-30, -5,-30; /M: SY='C'; M= -1,-12, 14,-12, 3,-18,-25,-19, -7, -6, -6, -6,-11,-14, 11, 7, -6, -2, -1,-20,-13, 6; /M: SY='F'; M=-10,-21,-18,-33,-25, 43,-22,-16, 18,-11, 26, 8,-10,-35,-23,-15,-14, -8, 14,-11, 18,-25; /M: SY='C'; M= -8,-10, 19, -9, -1, -8,-15,-18,-12, -9, -6,-18, -9,-17,-12,-11, 15, 5, -9,-14,-11, -9; /M: SY='N'; M= -1, -2,-16, -8, -4,-18, -3,-14, -5, 0, -9, -3, 7,-11, 4, 3, -1, -4, -7,-23,-16, -1; /M: SY='E'; M= -1, -1,-19, 11, 17,-30,-18, 16,-26, 5,-12, -3, -8, 0, 13, 12, -3,-17,-19,-24,-13, 15; /M: SY='H'; M=-27,-23,-53,-17, -7,-10,-30, 94,-17,-17, 3, 10,-20, 0, -3, -7,-13,-17,-17,-17, 30, -7; /M: SY='I'; M= -3,-14,-20,-35,-29, 16,-12,-20, 42,-16, 15, 4, 8,-32,-20,-25, -9, -2, 27,-28, -7,-29; /M: SY='G'; M= 0, 0,-31, -7, -6,-32, 63,-25,-13, -5,-18,-18, -2, -7,-13,-18, 0,-20,-30, 7,-28, -8; /M: SY='P'; M= -2,-13,-20,-14, -6,-13, -9, -6, 5, -5, -5,-13,-13, 21,-11,-16, 3, 6, -5,-28,-10,-12; /M: SY='P'; M= 13,-11,-30, -5, 5,-31, -5, -4,-16, 5,-21,-17,-16, 56, 5,-10, -1, 5,-17,-39,-29, 0; /M: SY='Z'; M= 0, -5, -8, -2, 25,-18,-18, -6,-13, 8, -2, 2,-11, -2, 23, 2, -8, -8,-19,-14, -3, 26; /M: SY='E'; M= 2, -2, -7, 4, 42,-29,-17, -6,-25, 23,-15, -1, -7, 8, 23, 2, -2,-14,-27,-13,-15, 36; /M: SY='I'; M= 2,-14,-21,-24,-19, -4,-15,-20, 28, -7, 6, 8, -3,-19,-10,-11, -4, 4, 23,-29, -7,-18; /M: SY='R'; M= 8, -9,-22, -5, -5,-12, -9,-12,-17, 5,-18, -4, -9,-10, 13, 31, 10, -5, -5,-21,-16, -3; /M: SY='P'; M= -5,-11,-12, -1, 33,-40,-15, 5,-30, 15,-21,-26,-21, 64, 9,-10, -5, -9,-35,-21,-20, 23; /M: SY='G'; M= 6, 13,-29, -2,-14,-22, 42,-22, -5, -5,-18, -9, 26,-17,-12,-18, 2, -6,-21,-25,-35,-14; /M: SY='Y'; M=-21, -9,-33, -3, 4, -1,-22, 16,-14, -2, 7, -5, -8,-11, -1, -7,-10,-10,-10, 2, 29, 1; /M: SY='W'; M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10, 0,-30,-50,-30,200, 50,-10; /M: SY='L'; M= -4,-12,-15,-12,-12, 5,-21, 8, 14,-17, 16, 9,-15,-23,-18,-15, -7, 2, 11,-28, 13,-13; /M: SY='H'; M=-15,-16, 7,-17, 1,-15,-27, 44, -8,-19, 6, 9,-13,-10, 0,-10,-15,-11,-16,-31, -3, 2; /M: SY='S'; M= 7, 6,-21, 0, -4,-13, 10,-13, -8, -1,-20,-17, 13,-13,-11,-13, 29, 13,-14,-31,-24,-11; /M: SY='T'; M= 7, -8,-22,-12,-18,-16,-21,-18, 5, -9, -2, -6, -3, 7, -7,-22, 8, 33, 12,-42, -7,-13; /M: SY='S'; M= 5,-10,-37, -3, -7, -1,-10,-11, -6, -3, 0, -5,-13,-13, -2, -7, 8, 6, 4,-11, 8, -9; /M: SY='T'; M= 3, -8,-29,-13, -8, -1,-17, 4, -8, 0, -5, 3, 0, -5, -4,-12, 8, 9, -3,-34, -8, -8; /M: SY='L'; M= 0,-12,-15, -9, -5, -3,-15, -8, 5, -9, 11, 0,-20, 10,-11,-15,-12, 3, 0,-28, 4, -8; /M: SY='H'; M= -8, -4,-30,-11, -4,-19, -5, 48, -9,-12, -7, 7, 6, -7, 2,-10, -8, -9,-22,-35, -8, -1; /M: SY='E'; M= -3, 13,-10, 31, 37,-42,-18, 11,-32, 9,-10,-12, -4, 4, 8,-10, -1,-17,-27,-24,-14, 28; /M: SY='L'; M= -8,-12, -3,-15,-13, 17,-18,-12, 26,-20, 37, 18,-17,-30,-20,-22,-18, 0, 15,-22, 24,-13; /M: SY='P'; M= -2,-17,-25,-15, -5,-21,-11, -4, -1, -1,-14,-22,-19, 44,-10,-13, -2, 5, -8,-30,-14,-11; /M: SY='A'; M= 8, -1,-24, 5, 0,-14,-12,-16, -4, 2, -4, -1, -9, 4, -7, -8, -4, 1, 0,-33,-10, -4; /M: SY='L'; M= -5,-13, -7,-18,-13, 10,-18, -7, 25,-14, 33, 25,-13,-32,-18,-19,-18, 0, 14,-23, 17,-13; /M: SY='I'; M= -7,-13, -7,-20,-17, 13,-17,-13, 33,-20, 33, 17,-13,-30,-20,-23,-17, 0, 20,-23, 17,-17; /M: SY='D'; M= 8, 12,-10, 16, 15,-22,-11,-11,-11, 2, -3, -1, 7,-11, 2,-13, -1, -3,-10,-35,-18, 11; /M: SY='R'; M=-16,-22,-27,-13, -3, -4,-16,-14,-24, 4,-12, -5,-26,-10, 23, 38,-13,-22,-15, 33, 18, 4; /M: SY='I'; M= -5,-15,-10,-26,-20, 10,-15,-15, 41,-20, 30, 15,-10,-30,-20,-25,-15, 0, 26,-25, 9,-20; /M: SY='Y'; M=-24,-24,-40,-15,-15, 12,-22, -3, 2,-10, 19, -8,-29, 0,-11, -9,-17, -5, 6, 13, 46,-17; /M: SY='R'; M= -1,-12,-17, -7, -2, -9,-15, -8,-16, 1,-11, -4,-13,-11, 21, 34, 1, -8,-11,-12, -3, 3; /M: SY='H'; M= -2,-11,-29,-18,-12,-20, 0, 9, 4,-10, -7, -6, -4, 9, -9,-20, 3, 5, -5,-31,-14,-13; /M: SY='E'; M= 2, 12,-11, 17, 28,-30,-14, -8,-24, 14,-15, -6, 9, -1, 16, -2, -2, -9,-25,-26,-18, 25; /M: SY='H'; M= 0,-12,-19,-13, 2,-12,-19, 21, -4, -6, 4, 12,-10,-14, 16, 1, -8, -1,-12,-24, 1, 7; /M: SY='E'; M= 1, -1,-15, 9, 29,-36,-16, 18,-25, 7,-13, -9,-10, 20, 9,-10, -2,-11,-24,-28,-19, 22; /M: SY='T'; M= 9, 0,-21, 4,-11,-10,-13,-19, 3, -8, -7,-12, -3,-18,-15,-13, 17, 18, 10,-34, -8,-15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 4 in 4 different sequences |
| Number of true positive hits | 4 in 4 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | ABL |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
4 sequences
RCSC_ECOLI (P0DMC5 ), RCSC_ECOLX (P0DMC6 ), RCSC_SALTI (Q56128 ), RCSC_SALTY (P58662 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
2AYX; 2AYY |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission