 |
|
| Entry: PS51437 |
General information about the entry
| Entry name [info] | CG_1 |
| Accession [info] | PS51437 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2009 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 16-JAN-2019 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51437 |
| Associated ProRule [info] | PRU00767 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CG-1 DNA-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=129; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0244696; R2=0.0096673; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=27042.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=929; H_SCORE=27042; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=463; H_SCORE=27042; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-23; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='R'; M= 8,-51,-48, -2, 26,-54,-44, 33,-10,-21, 3,-45, -9,-37, 41,-39,-11, 31,-48, 0; /M: SY='C'; M= 10, 62, 21, 9,-50,-26, 24,-40,-28,-18,-38, 22, -9, 34,-23, 10,-33, 12,-63,-44; /M: SY='Q'; M=-37,-57, 8, 44,-58,-47, 38,-51, -8,-51,-42,-31, 48, 62, -6, 1, 14,-25,-59,-43; /M: SY='L'; M=-25,-49,-43, 31,-30,-15,-11, 22,-44, 52, 32,-46,-50,-37,-46, 5,-36, -6,-53,-36; /M: SY='F'; M=-42,-50, 2,-11, 53, -6, 29,-13,-48, 42,-22,-45,-56,-45,-48,-10,-39, 12,-42, 9; /M: SY='P'; M=-20,-59,-14, 34,-50,-46,-37,-28, 21,-25,-41,-38, 77, 36,-33, 3,-35,-48,-50, 13; /M: SY='E'; M=-39, 39,-24, 69,-54,-51,-36,-51, 10,-21,-43, -7, 35,-22, 28,-23, -2,-30,-58,-49; /M: SY='A'; M= 51,-46, 7, 24, 11,-22, 28,-41,-36,-24,-38, 2,-45, -1,-41, 5, 0, -7,-54,-38; /M: SY='Q'; M=-21, 30,-40,-28,-14,-13, 14, -5, 38,-46,-38,-33, 12, 55, 53,-35,-40,-45,-50,-11; /M: SY='H'; M=-17,-50, 12,-34,-45, 4, 57,-22,-20, 4,-35, 19,-48, 1, 22, 33, 1, -5,-61,-38; /M: SY='R'; M= 3,-55,-43,-32,-48,-51,-35,-43, 31,-13, 20,-36,-51,-23, 86,-38,-39, -6,-53,-40; /M: SY='W'; M=-27,-73,-67,-50,-24,-51, 24,-53,-38,-49,-48,-60,-56,-42, 28,-53,-59,-62,161,-10; /M: SY='N'; M=-20, 25,-36, 2, -7,-47,-36,-29,-36, 44, 17, 59,-53,-36, 3,-20, 3,-32,-56,-38; /M: SY='R'; M=-35,-50, -2,-30,-51,-47,-36,-47, 26,-48,-41,-27,-44, 2, 64, 18, 59,-26,-59,-42; /M: SY='P'; M=-42,-58,-31, 6,-57,-43,-36,-52, 25,-40,-45, 53, 85,-31, 12,-33, -1,-53,-59,-52; /M: SY='E'; M= 21,-50,-24, 57,-55,-41,-36,-48, -9,-39,-44, 36, 36,-26,-36, 10, 21,-27,-60,-49; /M: SY='E'; M=-37,-56,-16, 90,-48,-55,-33,-43, 1,-45,-43,-37,-38,-17,-31,-36,-37, 17,-53, 14; /M: SY='I'; M=-38,-51,-55, -2,-30,-65,-59, 77,-51, 0,-17,-52,-51,-49,-55,-46,-10, 49,-56,-37; /M: SY='C'; M= 38, 74,-47,-44,-38, -4, 34,-37,-11, 16,-32,-39,-51,-41,-44, -4, 6,-15,-53, 16; /M: SY='A'; M= 42,-48, -5, 32, 6,-22,-18,-46, 4,-19,-40, 16, 5, 1,-36, 18,-32,-41,-50, -3; /M: SY='I'; M=-42, 19,-52, 9, -7,-63,-47, 74,-49, -9, 31,-51,-52,-45,-51,-47,-37, 16,-43, 43; /M: SY='L'; M=-17,-47,-62,-54, 16,-61,-47, 15,-55, 74, 17,-59,-60,-49,-53,-52,-40,-17,-47,-29; /M: SY='Q'; M= 4, 39,-47,-36,-41,-49,-44, 42,-14, 10,-27,-41, 14, 58, -9, 4,-36,-25, 29,-39; /M: SY='N'; M= 0, -2, -3,-36,-52, 10,-31,-49,-29,-51, 11, 80,-47,-31, 7, 20, 28,-46,-65,-47; /M: SY='H'; M= -4,-53, -6,-42, 60,-52, 64,-32,-39,-31,-30,-40,-55, -5, 10,-41,-40, 16,-32, 64; /M: SY='E'; M= 14,-54, 41, 44,-55,-12, 4, 5, -3,-48,-42, 29,-43, 35, -6,-30,-16,-42,-60,-45; /M: SY='K'; M= 9,-50,-40,-33, 2, 7,-40, -9, 55, -5,-37,-16,-46,-28, 27, 26,-33,-39,-50,-39; /I: I=-8; MD=-19; /M: SY='H'; M=-68,-83, 30, -3,-69,-21, 83,-85,-59,-75,-65,-47,-71,-52,-60,-60,-67,-84,-86, 6; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='D'; M=-56,-77, 23,-36,-83, 16,-61,-84, -6,-83,-75,-48,-69,-21, 1, 21,-56,-79,-83,-71; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='F'; M= -8,-57,-37, 44, 65,-15, 39,-47,-41,-20,-41, 14,-53,-13,-45,-42,-45,-47,-45,-25; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='W'; M=-46, 38,-45, 14,-44,-53, 6,-23, -7,-40,-47, 0,-10, 31,-13,-21, 9,-53,115,-33; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='Q'; M=-46,-57,-60,-49, 12,-65,-51, 42,-50, 39,-21,-55,-10, 45,-51,-50,-43, 14,-53,-36; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='T'; M= 1,-48,-37, -5,-55,-41, 5,-52,-35,-54,-48, 12,-46,-34, 5, 53, 56,-44,-67,-48; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='C'; M=-21, 57,-46,-39,-55,-14, 5,-42, 32,-49,-43, -4, 34, 23,-37,-22, 5, 19,-65,-50; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='E'; M= 21,-57, 6, 66,-63,-49,-40,-57, 9,-55,-49,-36,-43, 34,-33,-23, 1,-36,-62,-52; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='P'; M= -3,-60,-49,-41,-59,-47,-50,-44,-41,-54,-47,-47, 88,-43, 2, 24,-10, 9,-63,-56; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='P'; M= -6,-61,-46,-36,-61,-12,-48,-49, 40,-57,-48,-43, 78,-38, -6, 3,-38, -5,-60,-55; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='T'; M=-42,-55,-10,-36,-55,-49, 45,-45,-14,-35,-42, 29, 35, 37,-41,-30, 54, -6,-68,-45; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='R'; M=-47,-62,-45,-35,-51, -7,-37,-58, 37,-25,-44,-38,-55,-27, 81,-41,-14,-54,-53, 7; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='P'; M=-49,-73,-50,-39, -7,-52,-52,-55,-46,-63,-52,-56,113,-50,-58,-47,-42,-60,-59,-59; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='Q'; M=-19, 38,-45,-34,-55,-35,-44,-30, 23, -8,-40,-40, 37, 60,-35,-21, 23,-22,-60,-49; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='S'; M=-19,-47,-32,-40,-57, 17,-37,-57,-37,-61,-52, 51,-47,-32,-43, 77,-22,-51,-65,-50; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='G'; M=-29,-57,-45,-55,-63, 90,-51,-70,-50,-67,-56,-31,-49,-47,-57, 7,-46,-64,-55,-58; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='S'; M= 8,-43,-36,-36,-53,-31,-40,-50,-18,-53,-47,-25,-42,-30,-40, 85, 31,-42,-61,-46; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='W'; M=-43,-52,-62,-51,-26,-62,-49, 33,-51, 52, 50,-56,-57, 17,-50,-51,-41, 14, 66,-31; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='F'; M=-47,-51,-66,-61, 83,-64,-53, 42,-57, 20,-21,-57,-61,-60,-56,-53,-41, 20,-34,-13; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='L'; M=-45,-47,-63,-55,-19,-64,-47, 16,-56, 79, 11,-61,-61,-49,-53,-55,-41,-15,-49,-31; /M: SY='Y'; M=-51,-55,-56,-56, 83,-58,-27, -9,-49,-24,-27,-52,-62,-50,-47,-48,-44,-34,-12, 98; /M: SY='N'; M=-39,-50, 66,-24,-58,-33,-27,-57,-30,-61,-52, 86, 18,-30,-38, 19,-27,-56,-73,-49; /M: SY='R'; M=-44,-60,-40,-28,-54,-54,-31,-60, 32,-53,-42,-33,-52,-18,102,-38,-42,-54,-53,-41; /M: SY='K'; M=-42,-56,-37,-23,-52,-50,-35,-52, 84,-12,-39,-30,-45,-19, 58,-37,-38,-49,-51,-41; /M: SY='V'; M=-25,-48, 10,-35,-41,-53,-46,-11, 55,-29, 32,-38,-48,-35,-27,-38, -8, 62,-59,-40; /M: SY='V'; M=-38,-45,-53,-52, 13,-57,-49, -7,-50, 48,-16, 24,-59,-49,-51,-45,-33, 61,-55,-33; /M: SY='R'; M= -4,-57,-39,-27,-54,-50,-33,-58, 51,-53,-42,-32,-49,-19, 91,-36,-27,-51,-53,-42; /I: I=-30; MD=-77; /M: SY='Y'; M=-66,-73,-60,-67, 41,-66,-44,-55,-59,-52,-51, 35,-76,-59,-60,-58,-58,-60, 63, 73; D=-30; /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77; /M: SY='F'; M=-52,-53,-58,-57, 93,-59,-30,-30,-51,-23,-28,-53,-63,-53,-48,-49,-44,-35,-12, 89; /M: SY='R'; M=-42,-59,-40,-29,-54,-52,-31,-60, 20,-53,-42,-33,-51,-18,101, -1,-40,-53,-54,-41; /M: SY='K'; M=-41,-54,-30,-23,-56,-45,-32,-57, 85,-56,-44, 42,-44,-19, 39,-33,-34,-53,-54,-44; /M: SY='D'; M=-46,-59,110, -9,-66,-42,-31,-64,-33,-62,-62,-13,-45,-32,-41,-33,-35,-61,-81,-48; /M: SY='G'; M=-27,-55,-42,-54,-61, 96,-49,-69,-48,-64,-53,-28,-46,-45,-55,-27,-46,-62,-52,-56; /M: SY='H'; M=-48,-59,-39,-40,-15,-52,111,-47,-39,-38,-30,-32,-54,-31,-35,-40,-45,-50,-29, 95; /M: SY='C'; M=-18, 78,-30, 8,-46,-41,-35, 2,-35, 4,-36, 70,-52, 2,-26, 16,-30,-38,-64,-46; /M: SY='W'; M=-53,-79,-81,-58,-18,-52,-81,-51,-50,-49,-52,-74,-57,-50,-54,-60,-66,-66,172, -5; /M: SY='K'; M=-42,-58,-36,-23,-56,-50,-33,-58, 77,-54,-43,-29,-46, 8, 74,-36,-39,-53,-51,-42; /M: SY='K'; M=-41,-55,-33,-20,-57,-48,-35,-57, 97,-56,-44,-26,-41,-17, 24,-35,-36,-53,-50,-43; /M: SY='K'; M=-42,-57,-36,-23,-56,-50,-33,-58, 80,-55,-43,-29,-45,-18, 73,-36,-38,-53,-51,-42; /M: SY='K'; M=-40,-54,-33,-21,-56,-47,-36,-55, 93,-55,-43, -6,-41,-19, 19,-33, 9,-50,-52,-43; /M: SY='D'; M=-45,-56,103,-12,-64,-40,-29,-62,-32,-62,-59, 45,-46,-31,-40,-31,-33,-60,-80,-49; /M: SY='G'; M=-28,-55,-42,-52,-60, 93,-47,-68,-43,-63,-52,-28,-46,-43, 0,-28,-46,-61,-52,-55; /M: SY='K'; M=-42,-56,-35,-21,-56,-49,-34,-58, 88,-55,-43,-28,-44,-17, 58,-36,-37,-53,-51,-42; /M: SY='T'; M=-11,-40,-35,-36,-47,-45,-44,-38,-34,-42,-37,-25,-38, 19,-41,-14, 99,-30,-64,-43; /M: SY='T'; M=-33,-44,-46,-48,-36,-54,-52, 40,-44,-24,-25, 14,-48,-47,-50,-31, 60, 58,-63,-40; /M: SY='R'; M= 11,-56,-39,-28,-56, 14,-35,-58, 44,-53,-42,-32,-48, 24, 77,-33,-40,-51,-52,-43; /M: SY='E'; M=-38,-59, -9,102,-61,-54,-31,-63,-19,-54,-51,-35,-33,-12,-29,-35,-38,-55,-58,-51; /M: SY='D'; M= 66,-46, 73,-24,-58,-33,-40,-50,-37,-51,-47,-27,-44,-35,-43,-24, -8,-40,-63,-49; /M: SY='H'; M=-47,-59,-31,-31,-46,-49,139,-64,-36,-46,-32,-20,-48,-25,-30,-37,-46,-63,-81,-15; /M: SY='M'; M=-39,-54,-23, 80,-44,-54,-32,-35,-28, -2, 87,-40,-39,-20,-34,-40,-38,-37,-55,-40; /M: SY='K'; M=-42,-56,-33,-24,-55,-48, 36,-58, 74,-54,-42, 18,-46,-19, 66,-35,-38,-54,-54,-40; /M: SY='L'; M=-45,-47,-62,-54,-18,-64,-46,-10,-56, 83, -6,-62,-62,-49,-53,-55,-41,-17,-49,-31; /I: I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39; /M: SY='K'; M=-40,-55,-33,-19,-57,-48,-36,-57,100,-56,-44,-26,-41,-17, -1,-35,-35,-53,-50,-43; /M: SY='V'; M= 4,-45,-59,-53,-33,-57,-61, 38,-51,-18,-21,-53,-54,-52,-54,-17,-29, 80,-62,-40; /M: SY='Q'; M=-31,-56, 15,-30,-62, 69, -8,-62,-34,-57,-46,-26,-45, 73,-37, 8,-40,-58,-54,-47; /M: SY='N'; M=-29,-47,-29,-42,-55, 60,-36,-56,-36,-58,-49, 66,-45,-35,-44, 33, 25,-52,-61,-50; /M: SY='V'; M=-14,-48,-18, 21,-37,-55, 33, 24,-42,-23, 48,-42,-48,-39,-45,-37, 22, 57,-62,-37; /M: SY='E'; M=-40,-60, 62, 84,-63,-50,-32,-62,-24,-57,-53,-28, 20,-18,-34,-35,-37,-56,-64,-51; /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57; /M: SY='C'; M= 19, 48,-42,-42,-44,-11, 34,-29,-33,-20, -9, 28,-51,-37, 31,-32, 14, 37,-63,-41; /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; /M: SY='L'; M=-41,-51,-57,-51,-27,-59,-15, 49,-52, 54,-15,-53, 30,-47,-53, -3,-36, 11,-53,-36; /M: SY='H'; M=-41,-52, 27,-32,-39,-40, 92,-49,-34, -7,-36, 65,-50,-29,-36, 15,-33,-51,-60, 31; /M: SY='C'; M= -1,112,-54,-52,-45, 4,-55, 15,-46,-38,-37,-45, 12,-51, 1,-39,-37, 22,-65,-51; /M: SY='Y'; M=-42, 53,-50,-49,-10,-15,-27,-28, 2,-32,-30,-47,-59,-41,-40,-42,-39, 26,-20,102; /M: SY='Y'; M=-48,-57,-50,-51, -1,-57,-19,-30,-42, 20,-23,-51,-61,-39, -3,-46,-43,-35,-12,114; /M: SY='A'; M= 66,-42,-50,-44,-45, 0,-52, 9,-45,-33,-32,-43,-48,-43,-49,-27, -7, 43,-57,-45; /M: SY='H'; M=-46,-58,-34,-33, 9,-13,130,-60,-34,-45,-33,-23,-49,-27, 12,-37,-46,-60,-69,-16; /M: SY='G'; M= 5,-51,-38, -6,-45, 66,-38,-56,-39,-54,-46,-30,-45, 17,-44, 39,-34,-51,-45, 34; /M: SY='E'; M= 14,-53, 20, 71,-53, -3,-35,-49,-28, 0,-41,-33,-40, 31,-35, -2,-36,-45,-57,-47; /M: SY='D'; M=-31,-54, 51, 17,-52,-32,-33, 29, 10,-43,-39, 49,-45, 46,-32,-31, -1,-36,-62,-44; /M: SY='N'; M=-37,-47, 37, 5,-45,-40,-32,-21,-34,-15,-37, 78,-50,-33,-40, -3,-12, 33,-67,-24; /M: SY='P'; M=-19,-62,-37, 27,-60,-45,-43,-32,-33,-57,-46,-43,101,-34, 4, 6,-12,-51,-57,-55; /M: SY='T'; M= -8, 25,-29, 4,-45,-40,-35,-45,-10,-48,-42, 56, 5,-33,-38, 14, 65,-40,-58, 13; /M: SY='F'; M=-51,-52,-61,-55,103,-58,-46,-29,-53, -5,-30,-54, 47,-61,-54,-50,-43,-34,-24, -4; /M: SY='Q'; M=-39,-57, 7, 3, 10, -4, 69,-45,-27,-43,-36,-29,-46, 83, -2,-31, -4, -4,-54,-31; /M: SY='R'; M=-45,-61, 24,-27,-55,-53,-31,-61, -5,-54,-44,-32, 3,-20,100,-38,-42,-55,-56,-42; /M: SY='R'; M=-14, 24,-41,-33,-52,-51,-34,-50,-10,-50,-41, 9, 10,-24, 93,-37,-40, -7,-57,-43; /M: SY='C'; M=-35,110,-50,-47,-44,-11,-51, 15, -3,-43,-41,-38,-55,-43, 2, 31, -6,-36, 57,-44; /M: SY='Y'; M= -8,-55,-50,-49, 33,-53,-21,-32, -7, -9, 25,-48,-58,-39,-39,-43,-42,-36,-13,108; /M: SY='W'; M= -9,-65,-63,-54,-27, 28,-65,-50,-48,-21,-47,-54,-53,-46,-52, 1,-52,-57,153,-16; /M: SY='M'; M=-12, 26,-59,-51,-28,-57,-43,-12,-45, 44, 85,-52,-55,-43, 2,-47,-37, 34,-55,-34; /M: SY='L'; M=-41,-49,-55,-49,-27, -7,-47, 8, -5, 65,-15,-51, 16,-44,-47,-10,-38, -1,-51,-36; /M: SY='D'; M= -8,-57, 71, 34,-57,-43,-34,-57, 4,-56,-50, 1, 7, 40,-33, -4,-21,-54, 57,-43; /M: SY='P'; M=-38,-56,-34, 23,-50, -3,-39, 17, 27,-18, 6, 27, 63, -9,-35, 4,-34,-38,-56,-47; /M: SY='D'; M= 21,-53, 52, 19, -1,-33,-14,-46,-33,-48,-45,-31, 31,-15, 6, 8, -5, -7, 45,-40; /I: I=-26; MD=-65; /M: SY='Y'; M=-14,-65,-61, -4, 0,-69,-47, -3,-55, 30,-33,-63,-68,-20,-22,-57,-54,-40,-45, 56; D=-26; /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='E'; M=-10, 23, 16, 61,-61,-59,-47,-57,-41,-18, 28,-45,-52,-34,-48, -9,-29,-54,-71,-57; D=-26; /I: I=-26; DM=-65; /M: SY='H'; M= -6, 39, 24,-34,-43,-19, 99,-50,-35, 1,-35, 2,-51,-32, 10, -5,-40,-49, 52,-28; /M: SY='I'; M=-19,-54,-55,-54,-32,-11, 32, 84,-47,-18,-19,-45,-50,-46, -8,-43, 5, -6,-54,-35; /M: SY='V'; M= -2,-44, 0,-47,-35,-53,-55, -5,-48, 0,-24,-47,-54,-48,-51, 11,-28, 79,-64,-40; /M: SY='L'; M=-41,-46,-54,-48, 37,-55,-44,-19, -6, 64,-15,-48,-56,-44,-45, 14, 6,-24,-45,-27; /M: SY='V'; M=-32,-45, -4,-47, 4,-57,-55, -5, -5, 0,-23,-48,-55,-48,-47, -3,-29, 79,-60,-36; /M: SY='H'; M= -8,-56,-31, 3,-48,-47,126,-59,-32,-47,-34,-23,-46, 2, 3,-33, 3,-56,-73,-21; /M: SY='Y'; M=-46,-60,-47,-44, -6,-52,-20,-39,-35,-36,-31,-45,-57, 17, 19, -3,-42,-43, 58,110; /M: SY='R'; M= -7,-52,-44, -3,-38,-53,-38,-34,-22, 39,-27,-41, 3,-30, 68,-37, 24,-34,-54,-39; /M: SY='N'; M=-40,-55, 39, 51,-55, -3, 22,-58, 4,-56,-48, 59,-43, 26,-31,-30,-10,-56, 46,-43; /M: SY='V'; M= -3,-44,-48, -4,-36,-55,-54, 19,-45, -5,-24,-45,-49,-46,-49,-34, 46, 67,-62,-41; /M: SY='K'; M= -1,-55,-35, 5,-57, 9, -3,-48, 54,-51,-42,-32, 45, 42,-23, 2,-20, -9,-54,-46; /M: SY='E'; M= -1,-51,-30, 56,-41, 16,-39,-43,-11, 8,-37,-36,-42,-29,-38, -4, 32,-41, 47, 12; /M: SY='N'; M= 10,-50, 9, 18,-49, 22,-40, 5,-20,-32,-39, 34, 8,-33, -9, 16,-15, 11,-59,-47; /M: SY='N'; M=-19,-52, 7, 23,-35,-28, -1,-45, -4,-21,-41, 42, 27, -5, 33, 26,-31, -6,-58,-21; /M: SY='Q'; M= 6,-52, 24, 14,-49, -7, -3, 5, 11,-10,-23,-21, 15, 34,-20, 6, 14,-23,-57,-43; /M: SY='S'; M=-20, 10,-39, -4, -7,-14,-39, 3,-34, 3, 31, 7, 12,-33, 15, 52, 0,-34,-55,-39; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DNA_BIND |
| Feature description [info] | CG-1 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
CBT_ORYSJ (Q7XHR2 ), CMTA1_ARATH (Q9FY74 ), CMTA1_HUMAN (Q9Y6Y1 ), CMTA1_MOUSE (A2A891 ), CMTA2_ARATH (Q6NPP4 ), CMTA2_HUMAN (O94983 ), CMTA2_MOUSE (Q80Y50 ), CMTA3_ARATH (Q8GSA7 ), CMTA4_ARATH (Q9FYG2 ), CMTA5_ARATH (O23463 ), CMTA6_ARATH (Q9LSP8 )» more
|
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission