PROSITE entry PS51495
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GLUE |
| Accession [info] | PS51495 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2011 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51495 |
| Associated ProRule [info] | PRU00828 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | GLUE domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=198; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=193; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6033959; R2=0.0142529; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14202.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=449; H_SCORE=14202; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; H_SCORE=14202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-11; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='V'; M= -1,-25,-39,-28,-21,-12,-22,-28, 24,-21, 22, 25,-18,-17,-20,-25,-13, -3, 27,-61,-30,-18; /M: SY='D'; M= 4, 25,-56, 31, 30,-61, 0, -1,-25, 2,-39,-27, 19, -9, 17,-13, 3, -1,-20,-73,-45, 24; /M: SY='L'; M= -7,-17,-46,-22,-21,-19,-23,-16, 6,-11, 8, 8,-14,-14,-12, -9,-11, 0, 5,-35,-31,-15; /M: SY='T'; M= -2,-11,-34,-14,-21,-10,-15,-17, 1,-14,-11, -7, -7,-14,-19,-19, 4, 18, -4,-45, -7,-20; /M: SY='T'; M= 7, -3,-35, -5, -3,-43, -2,-15, -9, -6,-22,-11, -1, 8, -5,-10, 7, 11, -4,-61,-41, -5; /M: SY='S'; M= 0, -4,-19,-14,-15,-31, -6,-14,-24,-12,-33,-25, -2, -1,-18, -9, 9, 4,-19,-10,-24,-18; /M: SY='G'; M= 1, -9,-38,-12,-11,-32, 14,-23, -9,-20,-17,-14, -7,-14,-19,-31, 0, 2, -4,-60,-35,-15; /M: SY='R'; M=-14, -4,-48, -9, -6,-44,-29, 13,-17, 20,-25, -6, 1, -5, 13, 32, -8, -7,-22,-15,-42, 5; /M: SY='P'; M= 10, -8,-40,-14, -7,-55, -3,-11,-24,-18,-28,-26, -7, 48, -1, -6, 7, 0,-16,-70,-55, -7; /M: SY='V'; M= -8,-24,-39,-28,-23, -6,-24,-22, 14,-27, 14, 9,-18,-22,-23,-27,-15, -6, 15,-46,-20,-21; /M: SY='L'; M=-22,-34,-57,-42,-35, 25,-47,-20, 8,-38, 41, 20,-30,-34,-23,-39,-34,-21, 6,-22, 4,-29; /M: SY='Q'; M= -8, -2,-46, -5, -2,-30,-22, -1,-14, -5,-13, -9, -1,-12, 3, -5,-10, -7,-13,-35,-29, 1; /M: SY='P'; M= 2, 5,-47, 3, 7,-52, -9, -3,-20, -5,-29,-20, 4, 20, 7, -4, 4, 0,-16,-64,-46, 5; /I: I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M= 3, 25,-47, 29, 24,-56, 10, -3,-25, -1,-43,-30, 20,-11, 9,-17, 6, 2,-21,-66,-41, 15; D=-26; /I: I=-26; DM=-27; /M: SY='E'; M= 0, 30,-70, 40, 50,-70, 0, 0,-30, 0,-40,-30, 20,-10, 30,-20, 0,-10,-20,-90,-50, 40; /M: SY='V'; M= -4, -7,-40, -7, -4,-37,-16,-10, 4, -6, -8, 1, -3,-13, -4,-10, -4, 2, 8,-60,-34, -2; /M: SY='L'; M= -9, -4,-58, -4, -1,-20,-22,-14, 3,-17, 4, 0, -6,-22, -3,-25,-15, -8, 1,-55,-28, -2; /M: SY='L'; M=-10,-32,-28,-37,-31, -6,-32,-29, 24,-33, 26, 17,-27,-24,-28,-31,-19, -7, 26,-52,-22,-28; /M: SY='F'; M=-22,-32,-33,-41,-39, 25,-37,-16, 2,-36, 4, -3,-23,-35,-33,-31,-22,-19, -8,-23, 18,-36; /M: SY='V'; M= -8,-21,-40,-22,-14,-19,-26,-15, 19,-15, 14, 17,-14,-17, -9,-15,-15, -5, 20,-55,-32,-10; /M: SY='Q'; M= -9, 3,-63, 7, 12,-46,-21, 5,-15, 5,-13, -4, 3,-11, 21, 0,-11, -7,-17,-53,-43, 16; /M: SY='D'; M= -1, 20,-51, 23, 22,-59, -4, 5,-26, 2,-40,-28, 17, -5, 17, -5, 2, -1,-24,-62,-45, 19; /M: SY='N'; M= 0, 12,-44, 11, 8,-51, 8, 3,-24, 5,-41,-24, 13, -7, 4, -2, 5, 0,-22,-51,-41, 5; /M: SY='V'; M= -2,-30,-22,-30,-22,-15,-22,-30, 43,-28, 20, 20,-20,-22,-30,-28,-12, 0, 48,-77,-28,-22; /M: SY='G'; M= 2, 8,-47, 9, 8,-62, 26,-14,-28, -2,-48,-33, 8,-11, -4,-15, 4, -2,-24,-64,-56, 2; /M: SY='L'; M=-15,-36,-54,-43,-35, 12,-41,-30, 31,-34, 52, 33,-33,-28,-24,-34,-31,-13, 29,-38,-22,-28; /M: SY='Y'; M=-31,-24,-16,-30,-29, 36,-47, 1,-22,-36,-25,-29,-10,-47,-31,-38,-23,-25,-28,-24, 70,-30; /M: SY='E'; M=-11, 7,-55, 9, 10,-25,-19, 7,-21,-14,-26,-23, 7,-21, 8,-18, -9,-11,-24,-54,-15, 10; /I: I=-15; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='G'; M= 8, 6,-42, 7, 7,-58, 41,-20,-28,-14,-46,-35, 5, -8, -9,-31, 8, 1,-20,-75,-54, -2; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='K'; M= -2, 9,-46, 9, 9,-54, 0, -6,-22, 11,-36,-17, 9, -2, 6, 2, 4, 0,-21,-52,-44, 6; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='N'; M= -5, 0,-36, -2, 0,-24,-16, 1,-12, -8,-18,-13, 2, -9, 1, -9, -4, -4,-11,-41,-17, 0; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='K'; M=-14, 3,-56, 3, 3,-58,-15, -2,-20, 37,-35, -2, 8,-12, 11, 28, -2, -3,-25,-34,-45, 5; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='I'; M= -4,-15,-28,-18,-16, 2,-17,-14, 10,-17, 9, 5,-12,-13,-14,-17,-10, -4, 6,-28,-11,-14; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='T'; M= -2, -5,-34, -9, -9,-25,-14, -7, -5,-12,-12,-10, -3, 0, -6,-10, -2, 3, -5,-43,-26, -8; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='K'; M= -1, 10,-45, 10, 7,-44, -7, 7,-18, 13,-31,-12, 13, -4, 8, 9, 3, 0,-18,-43,-32, 7; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='F'; M=-24,-25,-42,-32,-31, 24,-40, 5, -3,-25, 1, -3,-14,-30,-17,-13,-23,-21,-15,-14, 19,-22; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='Q'; M= -5, 11,-53, 17, 20,-51,-11, 8,-19, 9,-25,-12, 11, -7, 22, 3, -3, -4,-19,-55,-41, 21; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='B'; M= 3, 13,-37, 13, 9,-40, -2, 2,-14, 5,-29,-15, 13, -5, 4, -2, 7, 6,-12,-47,-29, 5; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='G'; M= 7, -1,-36, -1, 0,-51, 45,-24,-23,-17,-39,-31, -1, -9,-15,-32, 7, 0,-14,-70,-51, -7; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='R'; M= -8, -7,-38, -9, -9,-29,-19, -1, -8, 2,-14, -6, -3, -9, 0, 5, -5, 0, -9,-30,-26, -3; D=-9; /I: I=-9; MD=-9; /M: SY='V'; M= -3,-25,-29,-29,-24, -5,-23,-24, 17,-30, 17, 9,-21,-18,-23,-28,-14, -6, 18,-48,-18,-21; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='Y'; M=-20,-27,-25,-33,-31, 23,-36, -9, 3,-27, 1, -3,-16,-33,-27,-26,-19,-13, -4,-26, 27,-29; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='L'; M=-14,-34,-57,-42,-33, 8,-40,-27, 19,-35, 53, 31,-33,-21,-19,-34,-30,-15, 21,-31,-22,-26; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='T'; M= 10, 1,-26, 0, -8,-38, 1,-18, -2, -1,-21,-11, 1, 1, -9,-10, 18, 34, -1,-54,-29, -9; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='T'; M= 5, 5,-26, 2, -2,-35, -1,-10, -8, 3,-25, -8, 7, -2, -6, -6, 12, 17, -5,-45,-28, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='H'; M=-14, 6,-47, 3, 4,-37,-23, 43,-25, 8,-28,-16, 13, -8, 25, 21, -7,-12,-27,-35,-22, 17; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='R'; M=-19, -8,-38,-18,-18,-45,-37, 22,-19, 35,-37,-10, 1, -1, 10, 63, -9,-10,-28, 16,-44, 1; D=-9; /I: I=-9; DM=-9; /M: SY='I'; M=-13,-34,-45,-38,-33, 12,-37,-30, 43,-28, 40, 28,-28,-29,-26,-28,-27, -8, 33,-45,-21,-29; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='I'; M=-16,-36,-12,-40,-39, 6,-35,-29, 30,-35, 11, 7,-28,-32,-36,-29,-19,-11, 21,-52, -8,-37; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='W'; M=-50,-48,-47,-62,-66, 34,-65,-16,-33,-43,-12,-32,-34,-60,-51,-16,-29,-42,-48, 75, 42,-56; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='I'; M= -4,-23,-27,-26,-21,-13,-19,-22, 25,-20, 8, 10,-16,-18,-23,-18,-11, -2, 25,-53,-26,-19; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='D'; M= 0, 30,-52, 35, 27,-59, -3, 4,-26, 2,-43,-32, 24, -9, 15,-10, 2, 0,-26,-65,-43, 20; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='E'; M= 2, 12,-38, 12, 13,-50, -3, 0,-22, 5,-32,-18, 11, 4, 11, -2, 5, 3,-18,-50,-39, 10; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='N'; M= -1, -1,-40, -1, -1,-31, -3,-11, -9, -3,-18, -9, 1,-11, -4,-11, 0, 1, -9,-47,-28, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='D'; M= -3, 9,-43, 10, 8,-32, -9, -3,-15, -2,-27,-17, 9,-13, 2, -8, 0, 0,-17,-45,-24, 5; D=-1; /I: I=-1; MD=-1; /M: SY='P'; M= 6, -4,-29, -9, -6,-37, -3, -5,-16,-13,-21,-19, -3, 30, -2, -4, 6, 1,-11,-50,-37, -6; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-1; IM=0; DM=-1; /M: SY='D'; M= 3, 8,-42, 9, 8,-48, -7, 0,-17, 5,-31,-18, 9, -3, 7, 3, 4, 4,-15,-49,-38, 9; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M= -5, 5,-41, 2, 4,-53, -4, -3,-21, 18,-37,-14, 7, -4, 6, 13, 4, 2,-20,-37,-43, 4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: M= -6, -4,-21, -7, -8,-24,-17, 0,-11,-14,-22,-16, -1,-14, -9,-12, -3, -6,-10,-45,-12, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 1, -9, -7,-17,-16,-26, -6,-15,-17,-21,-28,-21, -7, 3,-19,-19, 5, 2,-12,-42,-18,-20; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='V'; M= -6,-24,-22,-28,-24,-12,-22,-23, 14,-23, 5, 6,-18,-20,-24,-22,-12, -6, 15,-51,-20,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 13, 1,-16, -2, -3,-38, 9,-16,-13, -9,-27,-18, 1, 3,-10,-13, 10, 9, -7,-49,-32, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M=-12,-32,-41,-35,-31, 9,-34,-28, 40,-27, 36, 26,-26,-27,-25,-27,-25, -7, 32,-45,-20,-27; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= -1, 6,-46, 3, 7,-48,-10, 2,-23, -7,-26,-21, 4, 15, 9, -5, 1, -4,-18,-58,-41, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-19,-35,-59,-44,-36, 19,-46,-22, 17,-36, 55, 30,-33,-29,-19,-34,-35,-18, 15,-21,-12,-27; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= 2, 11,-29, 7, 5,-46, -2, -1,-20, 9,-36,-17, 12, -2, 2, 2, 8, 7,-17,-39,-34, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='D'; M= -2, 13,-48, 16, 13,-43,-10, -3,-18, -5,-26,-20, 10,-13, 8,-13, -4, -1,-17,-55,-34, 11; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -5,-28,-28,-29,-23, -7,-24,-28, 40,-25, 22, 19,-20,-22,-26,-25,-14, 0, 39,-62,-24,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= 1, 0,-41, 3, 4,-34,-11,-10, 4, -6,-14, -8, 2,-11, 0,-11, -4, 2, 1,-61,-35, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='H'; M= -8, -1,-37, -5, -4,-27,-18, 9,-18, 0,-29,-18, 4,-10, 1, 6, -4, -7,-20,-29,-19, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='V'; M= -3,-24,-24,-27,-22, -3,-21,-22, 20,-26, 8, 8,-16,-20,-26,-26,-11, -3, 21,-55,-11,-21; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= -4, 13,-49, 15, 18,-43, -8, 2,-22, 1,-32,-20, 11,-10, 12, -8, -1, -5,-20,-55,-30, 15; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='Y'; M=-15,-13,-38,-18,-15, -3,-26, -1,-11,-18,-14,-11, -6,-19,-12,-16,-11,-12,-15,-35, 4,-14; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='H'; M=-10, -5,-27, -8, -6,-16,-20, 5,-13,-11,-22,-16, 1,-16, -5,-12, -5, -4,-12,-40, 0, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 9, 3,-34, 2, 3,-42, 1, -8,-13, -7,-23,-14, 4, 3, 0,-11, 5, 5, -7,-58,-37, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='G'; M= 1, -2,-41, -4, -3,-46, 5,-12,-17, 5,-28,-13, 1, -5, -4, -2, 3, 3,-15,-45,-43, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='F'; M=-15,-26,-36,-32,-32, 19,-20,-16, -5,-32,-12,-12,-16,-26,-32,-29,-13,-14,-15,-30, 14,-31; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-12,-28,-45,-34,-30, 10,-28,-25, 16,-25, 23, 21,-22,-25,-23,-27,-19,-10, 12,-36,-13,-26; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='R'; M=-11,-12,-40,-17,-17,-23,-13, -7,-13, 0,-27,-13, -4,-13,-12, 3, -5, -6,-19,-29,-22,-14; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='R'; M= -4, 1,-29, -5, -5,-44,-12, 4,-19, 18,-35,-12, 7, 0, 2, 22, 4, 3,-19,-21,-36, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 9, 7,-10, 0, -1,-41, 12,-12,-18, 0,-37,-19, 8, 6,-10,-11, 17, 17,-10,-37,-33, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 12, -2,-32, -8, -5,-48, 1,-11,-21,-13,-28,-24, -2, 36, -4, -7, 11, 7,-13,-60,-45, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M=-17, -2,-53, -6, -6,-59,-23, 0,-19, 47,-38, 2, 6,-11, 8, 44, -2, -2,-27,-19,-46, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -9,-27,-37,-31,-27, 5,-29,-25, 33,-24, 30, 21,-22,-23,-22,-24,-20, -4, 26,-41,-20,-24; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -3,-13,-28,-16,-16,-24,-17,-14, 15, -1, -7, 3, -7,-10,-12, 2, -3, 6, 10,-41,-30,-12; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-15,-32,-46,-39,-33, 16,-37,-24, 20,-31, 37, 24,-27,-27,-23,-31,-25,-12, 17,-31, -8,-27; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='H'; M=-13,-10,-37,-14,-13,-13,-25, 5, -6, -6,-15, -7, -3,-17, -5, 0, -9, -7,-11,-31,-10, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-12,-30,-51,-38,-30, 7,-35,-24, 16,-30, 40, 24,-28,-17,-18,-28,-25,-12, 15,-32,-20,-24; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= -5, 5,-45, 4, 5,-44, -8, 2,-17, 4,-26,-14, 7, -7, 6, 0, -2, -4,-16,-48,-36, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 0, -3,-36, -7, -4,-40,-11, -4,-12, -2,-20,-10, 0, 16, 0, 3, 3, 1, -9,-49,-37, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 2, -6,-28,-10, -7,-26, -4, -7, -9,-15,-14,-13, -4, 6, -8,-13, 1, -1, -5,-47,-23, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= 1, 5,-35, 5, 7,-43, -1, -4,-17, 6,-25,-12, 5, 3, 7, -1, 5, 5,-14,-45,-35, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 4, 3,-26, 0, 0,-38, 0, -6,-15, 4,-27,-13, 4, 5, -1, 2, 7, 6,-12,-35,-32, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= -2, 3,-31, 0, 1,-33, -3, 0,-15, 2,-22,-13, 4, -1, 2, 2, 1, -1,-13,-31,-29, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= 0, 10,-33, 10, 11,-41, -3, 0,-17, 7,-26,-13, 9, 1, 9, 0, 4, 2,-15,-40,-31, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: M= -1, 0,-36, -1, 0,-26, -5, -7, -7, -7,-10, -7, 0, -4, -1,-10, -2, -2, -5,-39,-27, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 3, 0,-16, -3, -1,-25, -3, -4, -7, 1,-15, -7, 1, 5, -1, 1, 4, 5, -5,-24,-22, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 1, -2,-18, -4, -5,-21, 0, -9, -9, -7,-16,-13, -1, -1, -7, -7, 3, 2, -8,-20,-20, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 1, -1,-21, -2, -2,-22, -6, -4, -6, 0,-10, -4, 0, 0, 1, -2, 3, 9, -5,-26,-21, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='W'; M=-36,-32,-48,-43,-48, 4,-42,-17,-28,-23, -9,-25,-26,-37,-33, 6,-16,-30,-40, 84, -2,-38; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -1, -8,-21, -8,-10,-15, -9,-13, 7, -9, -3, -2, -5,-10,-11,-10, -1, 5, 6,-29,-17, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-11,-19, 45,-23,-27,-34,-16,-18,-16,-31,-35,-29,-19,-16,-29,-20, 2,-12,-10,-48, -6,-28; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 0, -2,-25, -4, -4,-30, -9, -1,-10, 5,-17, -8, 0, 10, 3, 10, 3, 5,-10,-25,-27, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -9,-20,-23,-22,-21, 3,-21,-18, 24,-15, 12, 9,-15,-19,-19,-11,-13, -5, 16,-20,-12,-19; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-14,-22, 55,-27,-33,-33,-19,-19,-17,-33,-38,-31,-22,-19,-34,-20, 1,-14,-11,-48, -3,-34; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 0, -2,-20, -5, -5,-21, 2, -9, -7, 1,-13, 0, 0, -4, -5, -5, 3, 3, -4,-27,-22, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='F'; M=-11,-24,-22,-27,-26, 26,-23,-12, 6,-29, 5, -1,-15,-23,-25,-24,-14,-12, 0,-19, 20,-23; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 1, -3,-14, -5, -5,-21, 2, -6, -3, -4,-14, -8, 0, -3, -7, -6, 3, 5, -1,-29,-20, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= 1, 14,-26, 13, 9,-25, 0, 9,-12, 4,-23,-12, 14, 0, 4, 0, 6, 1,-11,-30,-15, 4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= -2, 4,-31, 5, 8,-27, -8, 0, -9, -4,-12,-10, 3, -3, 6, -6, -2, -3, -6,-37,-23, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= -1, -6,-22, -6, -3,-24, -3, -6, 0, -4, -9, -3, -3, -5, -3, -5, -1, 2, 2,-35,-25, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 0, 5,-27, 5, 7,-34, -4, 0,-15, 3,-21,-11, 5, 8, 7, 1, 3, 1,-13,-33,-27, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='G'; M= 2, -3,-20, -5, -4,-23, 16,-14,-10, -8,-15, -9, -2, -5, -9,-17, 2, 1, -6,-33,-25, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= -1, 6,-26, 6, 7,-25, -1, -4,-10, -1,-13, -8, 4, -6, 2, -8, 0, -1, -7,-30,-21, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-15,-24, 55,-29,-34,-31,-21,-18,-15,-32,-35,-29,-24,-19,-33,-16, 0,-15,-11,-42, -2,-33; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='V'; M= 0, -7,-15, -9, -7,-16, 0,-11, 2, -8, -6, -2, -5, -6,-10,-10, -2, 0, 5,-28,-20, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='M'; M= -2, -1,-28, -3, -3,-12, -9, -4, -2, -2, 0, 4, 0, -7, -2, -6, -4, -2, -1,-24,-14, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-15,-23, 54,-28,-32,-31,-20,-18,-16,-33,-34,-29,-23,-19,-31,-19, 0,-15,-11,-46, -2,-32; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='G'; M= 5, 0,-21, 0, 0,-31, 31,-16,-16,-10,-26,-21, 0, -5,-10,-21, 5, 0,-10,-42,-31, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -2,-14,-12,-14,-12, -5,-11,-15, 22,-12, 8, 9, -9,-11,-15,-13, -6, 1, 21,-35,-14,-12; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 6, 2,-21, 2, 3,-28, -2, -5, -8, -5,-15,-10, 2, 4, 1, -5, 2, 2, -4,-35,-25, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='D'; M= -1, 9,-30, 10, 9,-35, -3, -1,-14, 8,-22,-11, 9, -2, 7, 1, 2, 1,-14,-34,-27, 7; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='D'; M= 3, 9,-27, 11, 9,-32, -1, -2,-11, 2,-19,-12, 7, -3, 6, -5, 3, 5,-10,-37,-25, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M= -2, 1,-26, 1, 1,-24, -7, -2,-10, 3,-16, -8, 2, -1, 3, 1, 0, 0,-11,-26,-20, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 8, 4,-15, 3, 3,-25, 6, -8, -8, -4,-17,-11, 3, 2, -3, -9, 7, 8, -4,-32,-20, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='S'; M= 3, 3,-15, 1, 0,-24, 4, -5, -8, -1,-18,-10, 4, -1, -4, -5, 5, 5, -5,-27,-20, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='V'; M= -3, -4,-22, -6, -5,-10, -3, -3, 0,-11, -5, -4, -2,-10, -7,-12, -3, -4, 1,-29,-11, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 4, -3,-21, -4, -3,-19, -5, -6, -3, -2, -7, -3, -2, -1, -2, -2, -1, 1, -2,-26,-20, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21, 0,-16,-11,-48, 0,-37; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 5, -5,-21,-10, -5,-31, -5, -6,-14,-10,-15,-15, -5, 33, -1, -1, 6, 2,-10,-37,-30, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='A'; M= 9, 0,-19, -1, 0,-23, -2, -4, -7, -3,-13, -9, 1, 4, 0, 0, 2, 2, -5,-27,-23, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21, 0,-16,-11,-48, 0,-37; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 5, 0,-16, 0, -5,-21, 0,-11, 0, 0,-11, -5, 0, 0, -5, -5, 11, 21, 0,-32,-16, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='F'; M=-21,-32,-32,-37,-37, 53,-32,-11, 5,-37, 11, 0,-21,-32,-32,-26,-21,-21,-11, 0, 37,-32; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M= -5,-12,-30,-14,-11, -3,-18,-11, 7,-14, 18, 10,-12,-12, -6,-15,-13, -6, 7,-23,-15, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= 0, 16,-26, 16, 11,-21, 0, 11,-11, 5,-21,-11, 16, -5, 5, 0, 5, 0,-11,-26,-11, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='H'; M= -9, 3,-16, -3, -3, -8,-14, 31,-15, -7,-16,-15, 8, -6, 8, 5, -4, -8,-14,-15, 3, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 6, -4,-17, -8, -4,-27, -3, -7,-10,-10,-13,-12, -4, 25, -3, -4, 5, 2, -5,-35,-27, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= -1, 3,-17, 0, 1,-19, -5, 1, -9, -3,-11, -6, 3, -1, 3, -5, 1, 2, -7,-20,-16, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M= -9,-19,-32,-23,-18, 5,-23,-16, 13,-12, 28, 25,-16,-15,-10,-15,-16, -7, 13,-20,-13,-14; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='R'; M= -6, -5,-23, -8, -7,-18,-12, 1, -4, 6, -9, 1, -1, -6, -1, 10, -5, -4, -5,-12,-20, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= 4, 10,-21, 10, 6,-21, 2, 3, -8, 1,-18,-10, 10, -2, 1, -3, 6, 4, -7,-28,-14, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21, 0,-16,-11,-48, 0,-37; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= 0, 16,-37, 21, 26,-37, 0, 0,-16, 0,-21,-16, 11, -5, 16,-11, 0, -5,-11,-48,-26, 21; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -8,-17,-25,-20,-17, 5,-20,-16, 22, -8, 19, 21,-13,-16,-12,-11,-13, -4, 16,-26,-12,-14; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='C'; M=-16,-26, 64,-32,-37,-32,-21,-21,-16,-37,-37,-32,-26,-21,-37,-21, 0,-16,-11,-48, 0,-37; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='G'; M= 6, 4,-20, 4, 3,-29, 19,-10,-13, -7,-23,-17, 4, -3, -5,-15, 5, 2, -9,-37,-26, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 2, -1,-19, -2, -6,-14, -1, -5, -4, -6,-11, -8, 0, -4, -6, -8, 4, 9, -4,-28,-11, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 0, -4,-23, -9, -5,-30,-10, 1,-15, -1,-17,-12, -3, 24, 4, 10, 2, -2,-12,-25,-30, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-11,-21,-37,-26,-21, 11,-26,-16, 11,-21, 37, 21,-21,-16,-11,-21,-21,-11, 11,-11,-11,-16; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= -2, -5,-26, -7, -5,-23,-11, -2, -7, -1, -9, -5, -3, 11, 2, 3, -2, -2, -7,-26,-24, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= 0, 7,-19, 6, 3,-24, -4, 4,-11, 6,-21,-10, 8, -1, 3, 6, 3, 1,-10,-18,-18, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='M'; M= -1, -5,-24, -7, -6,-15, -9, -4, -2, -4, -2, 2, -3, -2, -2, -4, -2, -1, 0,-27,-16, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= 1, 6,-15, 6, 4,-31, -2, -5,-13, -3,-23,-16, 5, 0, 0, -6, 3, 1,-11,-35,-23, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= 2, -5,-25, -9, -6,-24, -5,-10, -7,-11, -7, -8, -5, 12, -4,-10, 0, 1, -4,-36,-27, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='G'; M= 5, -1,-25, -2, -2,-33, 8,-12,-11, -6,-21,-15, 0, 7, -5,-10, 5, 4, -8,-43,-31, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='P'; M= -3,-10,-30,-15,-12,-25,-10,-13,-14,-15,-12,-15, -9, 3,-11, -8, -1, -5,-11,-17,-27,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: M= -6,-11,-38,-14, -8,-13,-14,-13, -5,-21, -3, -6, -9, -9,-10,-22, -8, -8, -3,-43,-17, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= -5, 1,-35, 1, -1,-30, -5, -4,-16, 2,-27,-14, 4,-11, -2, -5, 0, 1,-18,-38,-22, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 2, 6,-22, 1, -1,-34, -1, 6,-17, -4,-28,-20, 7, 5, 1, -4, 9, 10,-13,-40,-25, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='B'; M= 3, 8,-28, 5, 7,-43, 2, -3,-19, 2,-32,-18, 8, 3, 3, -4, 8, 6,-13,-43,-33, 4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M= -2, 6,-43, 5, 3,-50, -5, 0,-19, 13,-35,-16, 9, -6, 5, 11, 3, 1,-20,-42,-41, 4; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='N'; M= -5, 0,-39, -1, -1,-25,-14, -3,-12, -9,-19,-14, 2,-13, -2,-11, -3, -3,-12,-38,-19, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='E'; M= -1, 6,-37, 8, 10,-51, -6, -4,-17, -5,-30,-21, 5, -1, 7, -9, 2, 1,-14,-62,-41, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='Y'; M=-15,-19,-32,-24,-23, 9,-28, -3, -2,-27, -5, -7,-10,-25,-19,-23,-13, -9, -6,-35, 11,-19; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='I'; M= -9,-31,-30,-32,-28, 5,-28,-28, 44,-27, 24, 20,-22,-27,-29,-26,-18, -4, 36,-57,-18,-27; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M=-12, 1,-53, 1, 1,-56,-18, 1,-18, 33,-32, -2, 7, -8, 13, 28, 0, 3,-23,-34,-44, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='L'; M=-18,-37,-58,-45,-37, 20,-44,-28, 25,-36, 55, 32,-34,-30,-23,-35,-34,-16, 21,-26,-15,-30; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='T'; M= 6, 1, -8, -6, -5,-36, 4,-12, -9, -4,-28,-13, 3, 3,-12,-10, 12, 13, -1,-37,-31,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='F'; M=-34,-52,-45,-61,-62, 75,-49,-21, 7,-62, 11, -4,-36,-52,-54,-45,-33,-34,-17,-11, 53,-54; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='R'; M=-17, -7,-42,-15,-15,-49,-33, 17,-20, 34,-37, -9, 2, 1, 10, 56, -7, -8,-28, 3,-45, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-1; /M: SY='K'; M= -5, 6,-55, 6, 7,-57, 4, -8,-22, 15,-37,-13, 9,-13, 4, 1, 1, -3,-21,-59,-47, 5; /M: SY='G'; M= 7, 2,-33, -1, -1,-51, 29,-14,-25,-10,-42,-29, 4, -1,-10,-20, 10, 5,-17,-62,-46, -6; /M: SY='G'; M= 6, 7,-47, 9, 7,-58, 34,-22,-26,-12,-42,-32, 5,-13, -9,-30, 5, 0,-20,-74,-54, -1; /M: SY='E'; M= -3, 6,-47, 7, 8,-40, 0, -4,-18,-13,-30,-24, 6,-10, 1,-20, -2, -5,-16,-63,-34, 5; /M: SY='K'; M= -5, 3,-45, 4, 4,-48,-12, -9, -7, 9,-25, -7, 6, -9, 3, 0, 0, 4, -9,-57,-41, 2; /M: SY='E'; M= 1, 5,-52, 6, 10,-45, -7,-13,-12,-10,-18,-14, 2, -4, 3,-18, -3, -3, -7,-67,-43, 6; /M: SY='F'; M=-33,-53,-55,-62,-62, 83,-54,-20, 7,-63, 17, -1,-36,-53,-53,-47,-35,-34,-17, -7, 58,-53; /I: I=-17; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='Y'; M=-26,-29,-35,-39,-37, 25,-43, -5,-10,-32, 1, -7,-18,-36,-27,-26,-23,-20,-16, -8, 29,-32; /M: SY='E'; M= -1, 14,-49, 16, 17,-58, -6, 0,-23, 10,-37,-19, 13, -2, 14, 2, 4, 2,-21,-56,-45, 14; /M: SY='K'; M= -1, -3,-44, -7, -7,-46,-11, -5,-15, 14,-27, -8, 2, -5, 0, 14, 1, 2,-16,-38,-41, -2; /M: SY='L'; M=-15,-34,-53,-42,-34, 12,-41,-27, 21,-34, 47, 28,-31,-27,-22,-35,-29,-12, 20,-31,-16,-28; /M: SY='K'; M= -9, 2,-42, 1, 2,-50,-15, -5,-20, 8,-31,-13, 4,-12, 3, 3, 0, -3,-19,-42,-38, 1; /M: SY='E'; M= 3, 13,-40, 13, 15,-54, 4, -3,-24, 3,-39,-23, 12, -3, 7, -7, 7, 2,-17,-57,-41, 10; /M: M= -1, -9,-20,-10, -8,-33,-11,-13, -6,-22,-20,-16, -7,-13,-13,-22, -1, -2, -1,-66,-24, -9; /M: SY='L'; M=-17,-34,-54,-41,-35, 6,-40,-29, 26,-23, 41, 35,-29,-29,-22,-25,-26,-11, 22,-33,-23,-28; /M: SY='D'; M= -2, 9,-52, 13, 12,-54, -2, -4,-17, 7,-33,-17, 9, -9, 9, -2, 2, 3,-17,-61,-45, 11; /M: SY='Z'; M= -2, 9,-52, 12, 13,-55, -6, 3,-20, 6,-31,-18, 9, -7, 14, 1, -1, -1,-19,-57,-47, 15; /M: SY='R'; M=-14, -8,-52,-13,-12,-47,-25, -6,-13, 24,-27, -3, -1,-10, 0, 26, -5, -5,-20,-22,-43, -6; /M: SY='K'; M= 0, -5,-49, -6, -2,-45,-12,-12, -9, 3,-16, -4, -2, -5, 0, -1, -2, 0, -7,-54,-43, 0; /M: SY='W'; M=-42,-38,-70,-52,-58,-15,-53,-20,-42,-27,-20,-35,-31,-41,-37, 11,-17,-35,-53, 92,-19,-45; /M: SY='E'; M= 1, 14,-58, 19, 24,-53, -4, -4,-20, -6,-24,-18, 9, -8, 16,-17, -2, -3,-15,-70,-44, 20; /M: M= -9, -8,-54,-10, -9,-27,-22, -6, -7, -4, -7, -3, -5,-15, -1, -4,-11, -6,-10,-37,-33, -4; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-45, -4, 0,-34,-16, -4,-14, -2,-16, -6, 1, -9, 2, -9, -4, -3,-11,-47,-28, 0; /M: SY='S'; M= -3, 0,-42, -3, -1,-38, -3,-13,-18, -4,-29,-17, 1, -7, -6,-13, 2, 2,-17,-53,-30, -5; /M: SY='R'; M= -5, -4,-31, -9, -9,-33,-16, 4,-11, 2,-26,-12, 2, -8, -4, 8, -1, -1,-10,-34,-26, -5; /M: SY='S'; M= 0, -4,-31, -9, -7,-37, -2,-12,-15, -1,-28,-11, 0, 2, -8, -5, 5, 4,-13,-43,-35,-10; /M: SY='N'; M= -1, 1,-43, -1, 1,-28,-12, -2,-19,-14,-24,-19, 3, 0, -1,-15, -1, -4,-17,-51,-22, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | GLUE N-terminal |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | GLUE C-terminal |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
VPS36_ARATH (Q9FF81), VPS36_BOVIN (A5PK00), VPS36_DANRE (Q7ZVK4), VPS36_DICDI (Q54T18), VPS36_DROME (Q9VU87), VPS36_HUMAN (Q86VN1), VPS36_MOUSE (Q91XD6), VPS36_RAT (P0C0A2), VPS36_SCHPO (O43038), VPS36_XENLA (Q6DDF4), VPS36_YEAST (Q06696)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1W7P; 2CAY; 2DX5; 2HTH |