PROSITE entry PS51672

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ACT_LIKE
Accession [info]	PS51672
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2013 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51671
Associated ProRule [info]	PRU01008

Name and characterization of the entry

Description [info]

ACT-like domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2555554; R2=0.0258224; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M=  9,-15,-18,-17, -4,-19,-15, -4,-12, -4,-15, -6,-12,-17, -2,  5, -3, -7, -9,-27,-14, -5;
/M: SY='F';  M=-15,-31,-14,-34,-26, 18,-32,-17,  7,-25, 12,  5,-28,-29,-22,-23,-19, -5,  3, -9, 10,-25;
/M: SY='F';  M=-17,-32,-16,-36,-28, 20,-27,-18,  7,-28, 14,  5,-31,-32,-24,-24,-22,-15,  0, -8,  8,-28;
/M: SY='R';  M=  2,-13,-24,-16, -5,-24, -8,-12,-15,  0,-18,-14, -9,-17, -2, 11, -3, -6,-11,-30,-19, -4;
/M: SY='V';  M= -8,-24,-14,-25,-19,  0,-29,-22, 11,-19,  6,  3,-23,-23,-17,-22,-14,  3, 12,-21, -6,-16;
/M:         M=-14, -3,-28, -4,  0, -6,-22, -4,-15, -8,-17,-13, -2,-23, -6, -5, -7, -7,-16,-20, -2, -3;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-17,-35,-28, 30,-33,-18, 14,-28, 10, 15,-28,-35,-24,-28,-20,-15,  6, -5, 10,-28;
/M: SY='P';  M=-11,-23,-25,-23,-15,-23,-25,-16,-15,-15,-19,-20,-22, 46,-15,-22,-13,-11,-10,-28,-13,-15;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-37, 11, 33,-31,-11, -3,-31,  5,-30,-20, -3, -3, 17, -3, -1,-11,-28,-30,-22, 27;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-35, -7, 13,-29,-18,  0,-29, 18,-23,-16,  1,-15, 21, 31, -2, -8,-26,-28,-20, 13;
/M: SY='P';  M= -5,-14,-27,-17, -4,-35,-18,-17,-28,  7,-29,-25,-14, 46, -4, -8, -5, -9,-18,-36,-26, -4;
/M: SY='G';  M=  4,-11,-27,-11,-19,-29, 54,-20,-37,-19,-38,-28,-11,-19,-19,-19,  1,-18,-27,-30,-29,-19;
/M: SY='A';  M= 17, -9,  3, -8, -8,-22, -6,-17,-15, -9,-23,-16, -8,-13, -8,-14, 16,  6,-10,-31,-21, -9;
/M: SY='L';  M=-19,-36,-14,-39,-29, 16,-36,-23, 13,-29, 26, 20,-34,-33,-20,-23,-26,-13,  5,-12,  1,-29;
/M: SY='K';  M=-13,-13,-23,-19, -5,-17,-24, -2,-14, 10, -8, -8,-10,-18,  0,  7, -8,-10,-14,-26,-11, -5;
/M: SY='T';  M=  7, -7,-18, -8,  5,-24,-14,-13,-19,  6,-21,-14, -6,-11,  1,  2,  5, 10,-11,-30,-20,  4;
/M: SY='F';  M=-19,-31,-19,-39,-29, 45,-31,-14,  4,-29,  8, 10,-30,-37,-25,-27,-21,-17, -5,  2, 20,-29;
/M: SY='L';  M= -5,-34,  0,-35,-27, -6,-31,-28, 13,-25, 21, 10,-34,-25,-19,-21,-20, -7, 10,-23,-13,-26;
/M: SY='D';  M= -4,  8,-29,  9,  9,-30,  2, -6,-29,  0,-33,-20,  8,-15,  4, -6,  3, -9,-24,-34,-23,  7;
/M: SY='T';  M= -2,-16,-16,-16,-13,-17,-22,-20, -3,-12, -1, -4,-16,-19,-10, -6, -7,  6, -1,-29,-17,-13;
/M: SY='L';  M=-12,-29,  2,-33,-29, -2,-33,-25, 14,-26, 15,  6,-26,-28,-22,-25,-20, -8, 10,-21, -9,-27;
/M:         M= -7,-17,-10,-21,-20, -5, -5, -9,-10,-20,-12,-11,-14,-24,-17,-20, -3,-11,-11,-20, -8,-20;
/M: SY='G';  M=  2,-13,-25,-15,-10,-29,  8,-15,-28, -6,-28,-23, -9,  2, -8,  1,  1, -5,-21,-32,-25,-10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M= -8,  3,-19,  6,  1,-16, -5, -4,-16, -4,-17,-14, -2, -2, -3, -4, -3, -7,-14,-19, -8, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='N';  M= -4,  4,-15,  2,  5,-13, -1,  6,-15, -1,-18,-11,  8, -8,  2, -3,  5, -4,-15,-16, -8,  4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='W';  M= -5,-23,-17,-24,-17,-10,-22,-20, -6,-17, -8, -4,-24,-25,-12,-16,-14,-12, -6,  4, -7,-17;
/M: SY='N';  M= -8, 19,-23, 11,  2,-27, -6,  0,-26, -1,-36,-21, 34,-16,  0, -6, 21,  3,-26,-37,-21,  1;
/M: SY='I';  M=-10,-31,-11,-32,-30,  5,-37,-28, 31,-28, 17, 10,-31,-29,-27,-29,-21, -9, 26,-19, -5,-28;
/M: SY='T';  M=  6,-15,  5,-17,-15,-19,-18,-21, -7,-13,-11,-10, -9,-14,-13,-16,  7, 27,  0,-29,-19,-14;
/M: SY='E';  M=-16,-10,-28, -5,  4,-10,-26, -5,-12, -9, -8, -9,-13,-22, -3, -6,-13,-12,-15,-19,  1,  0;
/M: SY='F';  M=-15,-30, -8,-37,-30, 38,-31,-13,  5,-28,  1, -1,-29,-35,-28,-30,-19,-16, -2,  2, 21,-29;
/M: SY='N';  M=-12,  6,-29, -1,  6,-27,-17,  7,-26,  4,-26,-15, 19,-16, 11, 11,  2,  4,-23,-31,-17,  7;
/M: SY='Y';  M=-20,-30,-20,-30,-20, 30,-30, 20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-10, 20, 70,-20;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-35,-17, -6,-27,-10, -5,-24,  7,-20,-18,  0,-21,  1, 34, -8,-11,-24,-30,-20, -6;
/M: SY='K';  M=-14, -4,-26, -9, -3, -1,-20, -3,-20,  3,-21,-12, -2,-22,  1, -6, -3,-11,-18,-16,  0, -2;
/M: SY='Q';  M= -1, -5,-20, -7,  3,-24,-16,  1,-22,  1,-19,-10,  1,-12, 18,  5,  7,  9,-15,-26,-17,  6;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-25, -5, -9,-28, 25,-14,-31, -9,-33,-25, -4,-17, -9, -6,  7,-10,-25,-32,-26,-10;
/M: SY='D';  M=-11, 17,-32, 23, 20,-29,-14,  4,-27, -3,-32,-22,  9,-15,  6, -8,  1, -5,-25,-36,-19, 14;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-18, -5,  0,-14,-12, -5,-11,  7, -8, -8, -3,-11,  2, 14, -5, -5,-11,-17,-11, -1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-32, -4,  2,-27,-13,-11,-20, 10,-22,-18, -5,-18,  0, 11, -6,-11,-18,-31,-21,  0;
/M: SY='S';  M=  1, -5,-18, -7, -3,-18,-10, -9,-13, -8,-20,-13,  1,-16, -7,-11,  4,  1, -9,-27,-12, -4;
/M: SY='G';  M=  5,-17,-19,-18,-17,-20, 15,-20,-19,-16,-23,-18,-15,-20,-16,-13, -2, -8,-14,-19,-20,-17;
/M:         M=-10,-20,-15,-25,-16,-19,-25,-16,-10,-11, -8,-11,-15, -6,-10, -2,-13,-10,-11,-21,-16,-16;
/M: SY='V';  M=  1,-29,-10,-29,-26,-11,-27,-28, 19,-20,  8,  6,-29,-14,-19,-25,-16, -3, 24,-28,-13,-20;
/M: SY='L';  M=-17,-36,-12,-38,-29,  9,-37,-26, 18,-28, 29, 19,-35,-31,-20,-23,-26,-11, 10,-16, -4,-28;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-13,-27,-24, -2,-23,-21, 14,-22,  4,  8,-24,-24,-19,-24,-14, -4, 16,-20, -4,-22;
/M: SY='G';  M=  1,-19,-19,-20,-19,-20, 12,-21,-14,-17,-13,-12,-17,-21,-16,-13, -6, -9,-11,-27,-22,-19;
/M: SY='F';  M= -3,-19,-15,-21,-17,  3,-22,-18,  2,-12, -5, -3,-20,-23,-16,-18, -8, -8,  2,-20, -5,-16;
/M: SY='D';  M= -2, -1,-22,  3,  3,-19,-14,-11,-17, -6,-19,-13, -6,-17,  2, -7,  3, -6,-16,-30,-18,  1;
/M: SY='F';  M=-11,-21,-19,-21,-14,  2,-27,-19,  2,-20,  2,  0,-25,-19,-15,-21,-16,-10,  0,-20, -5,-15;
/M: SY='P';  M= -6, -1,-27,  5, -4,-31, -1,-17,-25,-13,-27,-23, -9,  8, -9,-18, -2, -9,-20,-38,-27, -7;
/M: SY='D';  M= -8,  3,-17,  7,  3,-25,-16,-11,-23, -8,-26,-20, -5,-19,  1,-10,  0, -6,-22,-20,-19,  0;
/M: SY='K';  M=  3, -5,-23, -7,  6,-25, -8, -4,-24,  8,-26,-18, -3,-13,  3,  5,  5, -3,-19,-29,-18,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E';  M=  1,  1,-14,  4, 13,-14, -8, -4,-12,  1,-14, -9, -1, -6,  4, -3,  5,  3,-11,-17,-11, 10; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E';  M= -9, -1,-24,  3,  5,-16,-17, -5,-12, -3,-16,-12, -5,-15, -1, -3, -6, -3,-10,-23, -7,  3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L';  M=-12,-24,-20,-27,-17, -6,-29,-13,  4,-11,  8,  5,-19,-25,-10,  3,-18,-10, -1,-17, -4,-17; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D';  M=-13, 14,-32, 21, 13,-32,-16,-10,-22, -2,-29,-21,  4, -9,  1,-11, -1, -2,-19,-39,-24,  9;
/M: SY='E';  M=  7, -5,-20, -2, 11,-24,-14,-11,-16,  2,-21,-12, -9,-13,  6, -5,  2, -6,-11,-30,-20,  9;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-20,-35,-25, 27,-31,-15,  5,-23,  9, 13,-27,-34,-19,-18,-21,-15, -2, -6,  9,-25;
/M: SY='I';  M=-12,-20,-21,-22,-11,-16,-30,-20,  2, -5,  1, -4,-20, -8,-10, -7,-15,-10,  0,-26,-16,-12;
/M: SY='S';  M=  2,  0,-22, -1,  7,-26, -1, -8,-25,  2,-29,-18,  3,-12,  4, -5, 11, -1,-20,-30,-21,  6;
/M: SY='R';  M= -1,-12,-25,-16, -1,-22,-17, -6,-19,  7,-14,  0, -6,-17, 14, 17, -2, -7,-15,-26,-18,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-34,-10,-34,-27, -3,-34,-28, 22,-26, 25, 19,-33,-27,-19,-22,-22, -8, 16,-22,-11,-26;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-18, 24,-35, 27, 15,-31,-14,  8,-30,  1,-36,-24, 19,-18,  5, -6,  1, -9,-29,-39,-19,  9;
/M: SY='D';  M= -1, -1,-25,  4,  3,-22,  4, -9,-25, -9,-29,-21, -5,-16, -6,-13,  3, -6,-20,-28,-14,  0;
/M:         M= -7,-17,-20,-17,-11, -9, -6,-18, -9,-16, -7, -7,-16,-21,-12,-17, -4, -9,-10,-23,-14,-11;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-29, -4,-15,-29, 39,-17,-33,-18,-33,-25, -5,-21,-16,-18, -2,-17,-27,-32,-28,-16;
/M: SY='Y';  M=-15,-27,-22,-28,-18, 11,-28,  5, -8,-16, -8, -5,-19,-17,-15,-15,-18,-15, -5,  1, 37,-17;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-29, -4,  6,-23,-19, -8,-24,  3,-24,-18, -5,  2,  6,  1, -1, -2,-20,-29,-18,  5;
/M: SY='Y';  M= -5,-25, -6,-27,-20,  1,-23,-10, -5,-18,-11,-10,-20,-24,-16,-22, -7, -6, -3,  4, 14,-19;
/M:         M=-10,-13,-10,-14,  0,-12,-27, -9, -7, -8, -9, -8,-16,-21, -5,-14,-11,-11, -9,-23,-10, -2;
/M: SY='B';  M=-17, 15,-30, 15,  6,-27,-18, -7,-19, -1,-25,-16, 14,-20, -2, -8, -2, -7,-19,-37,-21,  2;
/M: SY='L';  M=-17,-17,-21,-13,-12,-11,-29,-21,  1,-20,  5, -2,-23,-12,-14,-20,-17,-11, -4,-27,-14,-14;
/M: SY='S';  M= -1, -4,-16, -6, -5,-19,-13, -2,-14, -5,-20,-12,  6,-13,  2, -9, 13, 11, -9,-29,-14, -2;
/M: SY='H';  M=-12,  6,-30,  8,  4,-23, -5, 10,-29, -9,-33,-24,  5,-11, -2,-12,  0,-12,-26,-29, -8,  1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_04 which contains 571'864 sequence entries.

Total number of hits	49 in 35 different sequences
Number of true positive hits	49 in 35 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	ACT-like
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

35 sequences

ILVA_BACSU  (P37946), ILVA_BURM1  (P53607), ILVA_CORGL  (Q04513),

ILVA_ECOLI  (P04968), ILVA_HAEIN  (P46493), ILVA_HALH5  (Q9KC63), 
ILVA_LACLA  (Q02145), ILVA_MYCBO  (P66898), ILVA_MYCLE  (Q9X7F1), 
ILVA_MYCTO  (P9WG94), ILVA_MYCTU  (P9WG95), ILVA_PASMU  (Q9CKJ2), 
ILVA_SALTY  (P20506), ILVA_STAA3  (Q2FF63), ILVA_STAA8  (Q2FWJ9), 
ILVA_STAAB  (Q2YUE8), ILVA_STAAC  (Q5HEE0), ILVA_STAAM  (Q99SJ1), 
ILVA_STAAN  (Q7A4H2), ILVA_STAAR  (Q3V7T5), ILVA_STAAS  (Q3V7T4), 
ILVA_STAAW  (Q8NVI8), ILVA_STAEQ  (Q5HMF5), ILVA_STAES  (Q8CNK9), 
ILVA_STAHJ  (Q4L7U4), ILVA_STAS1  (Q49Z16), TD1_SOLLC   (A0FKE6), 
TD2_SOLLC   (P25306), TD_NICAT(Q9AXU4), TD_SOLTU(P31212), 
THD1_ARATH  (Q9ZSS6), THD1_CICAR  (Q39469), THDH_BLAAD  (O42615), 
THDH_SCHPO  (O94634), THDH_YEAST  (P00927)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

1TDJ