PROSITE entry PS51675
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SAM_MT_TRM10 |
| Accession [info] | PS51675 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2013 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51604 |
| Associated ProRule [info] | PRU01012 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SAM-dependent methyltransferase TRM10-type domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=194; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=189; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1505980; R2=0.0157091; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7164.3945312; R2=16.4282875; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=405; H_SCORE=13818; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=277; H_SCORE=11715; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= -5, -5,-24, -7, 6,-20,-20, -9,-13, 5,-13, -3, -5, -5, 8, 4, 0, 5,-12,-25,-12, 6; /M: SY='K'; M= -7, -3,-28, -5, -1,-16, -1,-10,-24, 5,-23,-13, 2, -2, -3, 2, -5,-10,-22,-21,-14, -2; /M: SY='R'; M=-12, 1,-28, 1, 8,-21,-16, -5,-27, 16,-23,-15, 3,-14, 6, 24, -2, -4,-21,-13,-11, 6; /M: SY='R'; M=-11, -6,-28, -5, 9,-24,-22, -7,-18, 23,-18, -6, -4,-14, 11, 25, -8, -9,-12,-22,-11, 9; /M: SY='L'; M= -7,-13,-26,-16,-10,-12, -6, -9, -5,-11, 3, 0, -8,-21, -9, -5,-12,-11, -7,-22, -9,-12; /M: SY='R'; M= 1,-15,-23,-17,-11, -9, -9,-16,-14, -6,-11, -9,-11, -2,-11, 2, -5, -4, -9,-20,-13,-13; /M: SY='E'; M= -6, 4,-28, 7, 14,-29,-16, -4,-23, 10,-20,-12, 1, 1, 13, 6, -3, -8,-23,-26,-16, 13; /M: SY='A'; M= 13, -6,-20, -9, 0,-25, -2,-12,-19, 5,-19,-10, -4,-12, 3, 0, 5, -4,-11,-23,-17, 1; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='M'; M= -5,-19,-18,-24,-20, -5,-20,-18, 14,-13, 8, 18,-18,-21,-14,-13, -9, 2, 17,-24, -7,-17; /M: SY='Q'; M=-11, 9,-27, 10, 10,-29,-14, 12,-25, 4,-26,-13, 11, 0, 15, 3, 2, -6,-27,-30,-13, 11; /M: SY='S'; M= -3, -9,-16,-11,-11, 1,-16,-16, -3,-17, -6, -7, -4,-18,-13,-15, 9, 7, 1,-27, -7,-12; /M: SY='G'; M= -2, -9,-30, -8,-11,-24, 20, -6,-29,-14,-26,-17, -5, 0,-12,-16, -2,-11,-25,-12,-17,-12; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= -9,-22,-32,-20,-11,-16,-22,-20, 3,-17, -3, -1,-20, 26,-10,-20,-14,-10, -6,-25,-16,-13; /M: SY='R'; M= -9, -6,-26, -5, 2,-20,-13, -6,-24, 15,-23,-13, -1, -6, 3, 20, 1, -2,-18,-21, -8, 1; /M: SY='I'; M=-10,-28,-22,-34,-25, 9,-31,-21, 29,-25, 28, 25,-24,-25,-19,-21,-22, -9, 20,-19, 1,-23; /M: SY='V'; M= 4,-26, -8,-32,-27, -5,-29,-28, 27,-23, 8, 8,-23,-24,-23,-24,-10, -4, 31,-26, -9,-27; /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-36,-26, 14,-34,-24, 32,-29, 29, 19,-23,-25,-22,-24,-23,-10, 18,-16, 4,-26; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='C'; M=-10,-25, 42,-31,-26, -5,-30,-24, 0,-28, 13, 5,-24,-33,-23,-25,-19,-10, 3,-34,-14,-25; /M: SY='G'; M= 4, -2,-22, -1, 1,-23, 12, -8,-25, -8,-23,-16, 1,-13, 1,-11, 10, -4,-20,-23,-14, 1; /M: SY='F'; M=-18,-24,-24,-29,-23, 43,-29, 3, 1,-21, 9, 6,-19,-29,-22,-15,-20,-11, -4, 8, 40,-22; /M: SY='D'; M=-15, 17,-27, 27, 9,-16,-17, -9,-24, -6,-18,-19, 2,-14, -7,-11, -5, -7,-17,-17, -9, 2; /M: SY='D'; M=-13, 25,-28, 31, 31,-31,-13, 7,-30, 3,-25,-21, 16, -8, 12, -3, 3, -8,-29,-34,-17, 21; /M: SY='L'; M=-14,-17,-25,-18, -8, 8,-26, 6, -1,-13, 14, 8,-16,-23, -9, -9,-20,-11, -6,-12, 14, -9; /M: SY='M'; M=-11,-20,-21,-28,-18, 0,-21, 6, 16,-12, 20, 51,-19,-21, -1,-10,-20,-11, 7,-21, 2,-10; /M: SY='N'; M= -7, 15,-19, 5, 0,-20,-11, -1,-17, 3,-22,-13, 25,-16, 5, 4, 9, 8,-17,-32,-15, 2; /M: SY='D'; M=-13, 16,-29, 22, 22,-30,-16, -1,-28, 13,-21,-15, 8,-10, 14, 8, -3, -9,-25,-29,-15, 18; /M: SY='K'; M=-12, -1,-30, 0, 14,-28,-20, -6,-29, 39,-26,-11, 0,-11, 14, 35, -8,-10,-22,-21,-11, 13; /M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 4, -2, 16, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 33; /M: SY='I'; M= -4,-17,-25,-22,-13,-10,-26,-19, 10, -4, 3, 5,-12,-17, -8, -5,-10, -6, 6,-22, -6,-13; /M: SY='S'; M= 0,-10,-20,-11, -6,-18, -4,-16, -6, -8,-12, -6, -7,-17, -7,-11, 1, -2, 1,-27,-16, -7; /M: SY='K'; M= -4, 2,-22, 2, 8,-20,-12, -5,-23, 14,-26,-15, 7,-12, 5, 9, 11, 2,-17,-26, -9, 6; /M: SY='L'; M= -4,-22,-10,-26,-19, 1,-26,-20, 11,-24, 26, 12,-21,-24,-17,-19,-15, 2, 8,-24, -5,-18; /M: SY='A'; M= 8,-14, 0,-17,-16,-16, 3,-14,-13,-18,-10, -8,-10,-21,-16,-18, 2, -4, -3,-29,-18,-16; /M: SY='N'; M= -3, 1,-22, -3, -1,-20, -8, -6,-15, 2,-12, -7, 8,-16, 6, 0, 1, -4,-16,-27,-13, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='I'; M= -7,-28,-10,-32,-26, 1,-31,-24, 27,-25, 22, 18,-26,-27,-22,-22,-19, -7, 27,-25, -5,-25; /M: SY='T'; M= -8, 1,-22, -2, -4,-18, -9, -8,-14, -6, -8, -3, 1,-16, 2, -3, 0, 6,-13,-26,-12, -1; /M: SY='R'; M=-17,-12,-28,-12, 0,-10,-23, 2,-16, 11, -6, 0, -8,-20, 8, 32,-13,-10,-15,-13, 5, 0; /M: SY='C'; M= 1,-13, 32,-18,-16,-14,-18,-21,-13,-20,-11,-11, -9,-23,-15,-20, 7, 6, -4,-38,-19,-16; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-28,-20,-14, 21,-30, 10, 3,-14, 6, 3,-18,-26,-11,-13,-19,-10, -6, 10, 49,-16; /M: SY='S'; M= 12, -4,-15, -5, -6,-22, 15,-14,-23,-12,-26,-18, 5,-12, -6,-14, 26, 10,-13,-32,-22, -6; /M: SY='E'; M= 5, -9,-22, -9, 9,-15,-17,-14, -9, -8, -8, -9,-11,-13, -3,-13, -1, -5, -6,-13,-12, 3; /M: SY='N'; M=-10, 25,-22, 9, -4,-16, -8, 2,-10, -3,-18,-12, 41,-20, -3, -3, 3, -2,-20,-35,-16, -4; /M: SY='R'; M=-18, -7,-28,-10, -1,-12,-20, -3,-26, 26,-19,-10, 1,-19, 4, 50,-10, -9,-19,-18, -7, -1; /M: SY='R'; M=-11, 2,-25, 1, 2,-22,-16, 0,-24, 19,-21, -8, 5,-14, 5, 23, -1, -1,-17,-26,-10, 2; /M: SY='A'; M= 21, -4,-14,-13,-10, -5, -6,-11,-11,-11,-13,-11, 2,-15,-10,-14, 9, 1, -7,-19, -7,-10; /M: SY='D'; M= -8, 0,-23, 2, -1,-10,-19,-13,-11, -4, -4, -7, -5,-11, -9, -7, -9, -5, -8,-25,-10, -5; /M: SY='H'; M=-10, -5,-27, -4, -1, -9,-18, 10,-21, -3,-17,-11, -4,-17, 1, -1, -4, -5,-19, -1, 8, -1; /M: SY='P'; M=-12, -4,-34, 3, 0,-24,-11,-13,-25, -5,-27,-19, -5, 40, -8, -7, -7,-10,-27,-28,-22, -7; /M: SY='F'; M= -4,-20,-18,-25,-23, 20, -3,-21, -6,-22, -4, -5,-13,-24,-27,-19, -5, -4, 3,-13, -1,-23; /M: SY='H'; M=-13, 11,-27, 11, 11,-23,-15, 12,-21, 0,-21,-13, 12,-16, 8, 0, -3, -9,-21,-20, -9, 8; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-23, 10,-32,-23, 25,-29, 37, 17,-25,-26,-21,-22,-24, -7, 14,-19, 1,-23; /M: SY='Y'; M= -9, -3,-24, -4, -9, -2,-22, 9,-10, -8, -9, -6, -5,-19, -8, -9, -6, 0, -8,-12, 18,-10; /M: SY='V'; M= -7,-28,-18,-33,-27, 22,-30,-22, 21,-24, 15, 9,-24,-28,-27,-21,-16, -6, 23,-13, 9,-27; /M: SY='T'; M= 1, -8, 8,-14,-15,-12,-19,-14, -7,-15,-11, -9, -5,-20,-15,-15, 9, 17, 4,-34,-14,-15; /M: SY='N'; M= -4, 8,-23, 1, -8,-20, 13, -8,-24,-10,-28,-19, 19,-12, -7,-10, 10, -1,-24,-19,-18, -7; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='F'; M= -5,-12,-12,-15,-11, 12,-14,-12, 0,-13, 2, -2, -8,-13,-12,-10, -3, 4, 0, 0, 3,-11; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='K'; M= -6, -5,-20, -5, 0,-14, -5, -8,-17, 10,-16, -8, -3, 0, 2, 7, -4, -4,-14,-14, -9, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='A'; M= 3,-15,-18,-21,-15, 3,-14,-10, -3,-15, 0, 1,-10,-19,-13,-11, -2, -1, -1,-19, -3,-14; /M: SY='D'; M=-10, 26,-27, 29, 8,-30, -5, -2,-30, 7,-28,-21, 21, -8, 0, 1, 0, -8,-26,-33,-19, 3; /M: SY='E'; M= -4, -1,-26, 2, 9,-20, 1, -7,-25, 2,-20,-14, -2,-13, 0, -4, 1, -7,-20,-21, -9, 4; /M: SY='R'; M= -5, -9,-24,-10, -1,-11,-18, -3,-16, 6,-15, -8, -4,-10, 0, 12, -6, -8,-11,-21, -8, -2; /M: SY='L'; M=-10,-26, -9,-30,-22, 18,-29,-21, 11,-28, 28, 10,-23,-28,-23,-20,-20, -6, 6,-18, 2,-22; /M: SY='H'; M=-13, -3,-29, -3, 3,-20,-10, 16,-24, 10,-20, -5, 2,-11, 4, 11, -8,-12,-22,-21, -2, 1; /M: SY='Q'; M=-12, 2,-29, 4, 23,-30,-19, 3,-26, 19,-22,-10, 3,-10, 29, 24, -3, -9,-27,-24,-13, 25; /M: SY='E'; M= -4, -5,-25, -6, 5,-16,-15, -9,-14, -2,-12, -7, -4,-15, 0, 2, -3, -6,-14,-10,-10, 2; /M: SY='F'; M=-14,-21,-12,-29,-22, 28,-25,-16, 3,-24, 16, 9,-16,-28,-23,-17,-20,-10, -1, -5, 8,-21; /M: SY='E'; M= -9, 1,-24, 2, 7,-20,-20, 0, -9, -4,-11, -6, 0,-15, 5, -6, -2, -6, -8,-29,-10, 5; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='R'; M= -9, -4,-23, -3, 1,-20,-13,-11,-19, 15,-16, -8, -3,-15, -1, 16, -5, -2,-10,-23,-12, -1; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='Y'; M= -7, -7,-23, -9, -3, -6,-19, -1, -8, 3,-10, -2, -7, -8, -1, -2, -7, -4,-10, -9, 12, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='H'; M=-10, 6,-22, 0, -3,-16,-16, 13, -8, -7, -9, -3, 12,-16, 4, -6, -2, -2,-13,-26, -5, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='E'; M= -9, 7,-26, 11, 16,-21, -7, -6,-24, 1,-20,-16, 2, 3, 3, -5, -1, -6,-23,-24,-16, 9; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='N'; M= -7, 8,-22, 1, -5,-20, 9, -5,-21, 0,-19,-12, 17,-16, -2, 2, 1, -4,-21,-25,-16, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='W'; M=-16,-29,-35,-31,-24, 16,-22,-14, -4,-16, -6, -3,-27,-25,-16,-16,-27,-18,-13, 74, 33,-19; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='E'; M= -8, 3,-22, 4, 5,-19,-18, 3,-13, 2,-14, -8, 1,-11, 0, -3, 0, 1, -9,-26, -7, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='N'; M= -6, 15,-20, 6, -1,-20, 2, -2,-22, 7,-25,-15, 25,-15, -1, 5, 6, 1,-21,-28,-16, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='W'; M=-13,-24,-31,-24,-17, 3,-23,-12, 0,-14, -3, -2,-23,-15, -8,-14,-21,-14, -8, 37, 20,-13; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='N'; M= -7, 2,-20, 0, 1,-16, -9, -2,-16, -1,-10, -8, 4,-14, -2, 0, -1, 1,-14,-25,-10, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='F'; M=-12,-13,-19,-16,-14, 14,-21, -7, 2,-15, 6, 1, -9,-15,-16,-10,-13, -8, 0,-13, 4,-15; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='T'; M= -6, -9, -8,-10, -9, -4,-18,-13, 0,-12, 0, -2,-10, -7, -9,-11, -5, 2, 2,-19, -6, -9; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='H'; M= -7, -6,-20, -6, -1,-12,-10, 4,-11, -2,-13, -6, -3, -1, -1, -1, -2, -3,-11,-16, -2, -3; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='Y'; M= -8, 1,-14, 1, -2, 2, -4, -3,-11, -5, -8, -8, 1,-10, -6, -6, -5, -6,-11, 1, 3, -3; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='L'; M= -7,-19,-17,-22,-18, 9,-17,-19, 5,-20, 10, 2,-16,-15,-20,-16, -9, 3, 5,-17, -2,-19; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='E'; M= -8, 0,-24, 4, 14,-17,-16, -1,-21, -1,-19,-14, -2, 11, 1, -6, 2, -1,-20,-26,-12, 7; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='D'; M= -7, 9,-22, 12, 9,-23, -9, -7,-24, 5,-21,-16, 6, -4, 1, 2, 5, 4,-18,-27,-15, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='D'; M= -7, 12,-24, 19, 10,-28, -5, -7,-27, 5,-26,-19, 6, 2, 1, -3, 5, -3,-21,-29,-18, 5; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='H'; M=-12, -4, -9, -5, 5,-22,-13, 16,-26, 2,-21, -9, -3,-18, 9, -1, -7,-13,-24,-22, -1, 5; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='F'; M= -6,-11,-19,-12, -6, 2,-11,-10, -9, -5,-10, -5, -8, -2, -9, -7, -2, -1, -7,-13, -1, -8; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='E'; M=-10, 3,-22, 8, 10,-12,-20,-11,-13, -9, -4,-10, -5,-14, -5,-11, -3, 0, -9,-28,-11, 3; /M: SY='D'; M= -7, 7,-24, 12, 11,-12,-15, -9,-22, -3,-17,-16, 0, -6, -4, -8, 2, -4,-18,-27,-11, 4; /M: SY='L'; M=-12,-14,-26,-13, 1, -6,-26, -2, -2, -6, 10, 4,-14,-20, -1, -3,-17,-11, -7,-17, 3, -1; /M: SY='F'; M= -5,-12,-22,-18,-14, 8,-10,-16, -7,-17,-10, -8, -4, -7,-15,-16, 0, -2, -8,-18, -5,-14; /M: SY='P'; M= -2, 0,-29, 5, 11,-30, -4,-11,-27, 4,-26,-18, -3, 12, 2, -6, 0, -9,-24,-27,-22, 5; /M: SY='K'; M=-10, -3,-27, -2, 6,-19,-21, -3,-16, 14,-13, -6, -3,-14, 3, 6, -7, -8,-13,-22, -4, 3; /M: SY='D'; M= -2, 16,-23, 20, 14,-29, -4, 1,-27, -2,-25,-19, 11,-10, 6, -7, 10, -3,-23,-33,-18, 10; /M: SY='N'; M= -9, 18,-24, 16, 14,-27,-12, -1,-26, 14,-27,-17, 20,-11, 8, 6, 5, -1,-24,-32,-16, 11; /M: SY='L'; M= -9,-25,-23,-28,-20, 1,-30,-21, 20,-24, 22, 11,-23,-12,-18,-21,-18, -3, 12,-20, -1,-21; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='Y'; M=-18,-22,-29,-23,-21, 25,-31, 11, 7,-14, 6, 4,-21,-29,-12,-13,-21,-10, -4, 21, 65,-21; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='T'; M= -1, 9,-14, 8, -1,-19,-12,-13,-19, -8,-20,-17, 7,-10, -5,-10, 23, 29, -9,-35,-15, -3; /M: SY='P'; M= 14,-11,-12,-11, -5,-23, -8,-17,-18,-11,-24,-17, -7, 21, -8,-17, 12, 3,-14,-32,-24, -8; /M: SY='D'; M=-18, 28,-31, 38, 11,-24,-13, 8,-31, -3,-25,-22, 13,-15, -1, -8, -5,-11,-28,-16, -2, 4; /M: SY='S'; M= 16, -5, -3, -9, -8,-20, 3,-16,-20,-13,-22,-17, 1,-13, -8,-15, 23, 12, -9,-33,-21, -8; /M: SY='D'; M=-14, 16,-31, 27, 19,-32,-15, -4,-31, 5,-26,-22, 4, 10, 4, 4, -1, -8,-27,-33,-20, 9; /M: SY='E'; M=-12, 15,-25, 17, 18,-21,-15, 7,-21, 2,-20,-15, 14,-14, 4, 0, -1, -7,-20,-30,-10, 10; /M: SY='V'; M= 0,-14,-15,-15,-15, -9,-24,-23, 10,-11, -1, 0,-16,-21,-18,-14, -3, 6, 24,-29,-11,-17; /M: SY='L'; M= -3,-27,-20,-30,-20, 4,-27,-20, 21,-26, 36, 20,-25,-25,-17,-21,-23, -9, 12,-20, -2,-20; /M: SY='D'; M= -7, 11,-20, 13, 9,-21,-16,-10,-18, -2,-15,-14, 5,-11, -2, -7, 7, 11,-11,-32,-15, 4; /M: SY='E'; M= -8, 9,-24, 11, 17,-25, -7, -7,-27, 6,-22,-17, 7, -9, 4, 2, 5, 3,-21,-30,-17, 10; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='L'; M=-11,-26,-18,-28,-20, 21,-27,-16, 14,-25, 32, 13,-25,-27,-21,-17,-23, -8, 9,-10, 10,-20; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='D'; M=-12, 16,-25, 21, 20,-27,-13, 0,-28, 11,-22,-17, 10, -9, 10, 13, 0, -7,-23,-28,-15, 14; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='P'; M=-11, 1,-27, 9, 11,-23,-15, 0,-19, -5,-17,-14, -5, 26, -1,-10, -6, -9,-22,-26,-15, 3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='D'; M=-11, 10,-27, 14, -2,-23, 0, 10,-25, -9,-24,-16, 9, -7, -6,-11, -1,-10,-21,-29,-10, -5; /M: SY='K'; M=-10, 3,-16, 1, 3,-21,-18, -3,-20, 13,-16, -7, 4,-15, 1, 5, -5, -4,-16,-28,-11, 2; /M: SY='V'; M= 5,-15,-15,-21,-17, -8,-22,-23, 9,-14, -1, 0,-12,-17,-15,-13, 4, 15, 16,-27,-10,-17; /M: SY='Y'; M=-13,-21,-26,-24,-21, 34,-27, 8, -1,-14, 1, -1,-19,-28,-16,-13,-17, -9, -7, 21, 61,-21; /M: SY='I'; M= -7,-22,-23,-25,-25, -4,-33,-27, 34,-23, 11, 11,-20,-23,-22,-24,-14, -6, 31,-26, -6,-26; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29, 1,-37,-29, 43,-28, 20, 18,-23,-23,-22,-27,-18, -8, 33,-22, -2,-29; /M: SY='G'; M= -1,-12,-30,-13,-21,-27, 59,-21,-31,-21,-25,-16, -2,-20,-20,-21, -2,-19,-24,-20,-27,-21; /M: SY='G'; M= 7, -9,-26,-10,-17,-28, 56,-19,-35,-18,-28,-19, 0,-18,-17,-19, 4,-14,-25,-22,-28,-17; /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-36,-26, 9,-35,-24, 35,-29, 28, 21,-23,-24,-20,-25,-23,-10, 20,-18, 2,-26; /M: SY='V'; M= -1,-29, 3,-30,-30, -2,-30,-30, 24,-21, 7, 7,-29,-31,-30,-21,-10, -1, 44,-32,-12,-30; /M: SY='D'; M=-18, 42,-28, 60, 15,-36,-12, -3,-33, -2,-26,-26, 15,-12, -3,-11, -1, -9,-22,-39,-19, 6; /M: SY='K'; M= -9, 0,-25, -2, 7,-23,-20, 1,-25, 24,-23, -9, 1,-11, 6, 17, -2, 4,-17,-24, -7, 5; /M: SY='N'; M= -5, 11,-21, 1, -8,-19, 14, -2,-18, -8,-21, -6, 24,-19, -5, -8, 7, -4,-20,-32,-19, -7; /M: SY='R'; M=-14, -7,-28,-10, -7,-19, -4, 7,-22, 7,-17, -4, 3,-20, 1, 27, -8,-12,-18,-23, -9, -6; /M: SY='H'; M=-16, -1,-28, -4, 0, -7,-20, 23,-19, 3,-16, -6, 5,-20, 9, 13, -8,-10,-22,-13, 14, 2; /M: SY='K'; M=-10, -4,-30, -3, 10,-26,-21,-11,-24, 34,-21, -8, -5, -3, 6, 18,-11,-10,-18,-22,-11, 7; /M: SY='G'; M= -9, 9,-29, 8, 1,-28, 13, -7,-31, 4,-28,-19, 13, -8, -3, 3, -1,-11,-28,-28,-21, -2; /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-19, -8, -3,-27,-16, 6,-11, 20, 7,-18,-22,-10, -4,-17, -4, 3,-22, -5,-10; /M: SY='C'; M= 8,-11, 47,-19,-17,-18,-17,-23,-20,-19,-17,-16, -9,-23,-17,-21, 8, 9, -6,-38,-22,-17; /M: SY='L'; M=-11,-15,-22,-18,-10, 2,-25, 3, -1,-15, 11, 5,-13,-22, -2,-10,-12, 0, -6,-15, 10, -7; /M: SY='E'; M= 2, 4,-24, 4, 9,-27, -6, -8,-24, 8,-25,-15, 5, -3, 5, 0, 6, -3,-20,-28,-18, 6; /M: SY='K'; M= -7, -4,-28, -5, 6,-27,-18, -7,-27, 36,-25, -9, -1,-13, 11, 35, -7, -9,-19,-20,-11, 7; /M: SY='A'; M= 39,-14,-13,-23,-13,-15, -6,-21, -2,-14, -1, -4,-13,-13,-12,-21, 3, -2, 3,-20,-16,-13; /M: SY='Q'; M= 0, -3,-22, -5, 4,-25, -8, -7,-23, 9,-22,-11, 1,-12, 11, 11, 7, 2,-17,-25,-15, 7; /M: SY='E'; M=-11, 0,-27, 4, 19,-23,-18, -4,-24, 13,-15,-11, -1,-12, 11, 18, -3, -7,-20,-26,-14, 14; /M: SY='L'; M= 0,-13,-21,-14, -3, -9,-18, -2, -4,-10, 6, 4,-12,-18, 1, -7, -7, -6, -7,-21, -3, -2; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= -1, 0,-27, -4,-15,-28, 53,-14,-35,-16,-30,-20, 12,-19,-15,-16, 4,-14,-29,-25,-28,-15; /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-34,-26, 6,-35,-21, 34,-27, 27, 17,-24,-25,-20,-24,-23, -9, 21,-15, 8,-26; /M: SY='R'; M= -6, -3,-25, -5, 2,-24,-15, -6,-24, 20,-23,-12, 3, -8, 7, 27, 1, -2,-18,-24,-14, 3; /M: SY='T'; M= 1,-10,-14,-18,-15, 0,-21,-13, -2,-14, -3, 0, -7,-16,-13,-13, 6, 23, 4,-23, -4,-14; /M: SY='A'; M= 17,-10,-22,-13, -4,-18, -2,-12,-18, -4,-15,-12, -9, -3, -6, -5, 0, -6,-13,-17,-11, -7; /M: SY='R'; M=-18, -9,-18,-10, 0,-22,-21, -3,-29, 26,-21,-10, -2,-20, 10, 54, -9,-10,-20,-22,-12, 1; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-28,-20, 7,-29,-20, 17,-24, 40, 17,-28,-29,-19,-13,-26, -9, 12,-21, -2,-20; /M: SY='P'; M=-10,-16,-38, -8, 2,-30,-20,-18,-22, 1,-30,-18,-16, 71, -6,-11,-10,-10,-28,-28,-26, -6; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20, 0,-27; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -5, 11,-28, 16, -1,-32, 22, 1,-35,-10,-27,-19, 7,-15, -4,-12, 2,-13,-27,-28,-19, -3; /M: SY='E'; M=-10, 10,-26, 13, 19,-28,-15, -2,-28, 14,-24,-16, 7,-10, 14, 14, 3, -3,-23,-29,-15, 16; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-26,-26,-23, 32,-30, 7, 6,-17, 4, 3,-19,-28,-18,-15,-19,-10, 0, 12, 50,-23; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27, 2,-32,-24, 34,-25, 23, 22,-25,-25,-20,-22,-19, -7, 29,-23, -3,-25; /M: SY='K'; M= -7, 0,-27, 1, 4,-28, -3, -8,-22, 12,-22,-10, 1,-14, 9, 5, -4,-10,-17,-24,-15, 7; /M: SY='W'; M=-11,-27,-27,-31,-23, 2,-24,-18, 10,-14, 8, 19,-27,-25,-13,-14,-24,-13, 6, 21, 5,-17; /M: SY='E'; M= -8, 0,-18, -1, 6,-25,-10, -9,-23, 2,-22,-15, 4, 5, 1, -4, -1, -5,-22,-30,-20, 3; /M: SY='S'; M= -3, 6,-22, 10, 0,-26, 2,-11,-22,-10,-24,-17, 5, -7, -2,-12, 13, 2,-16,-33,-19, -2; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='R'; M=-11, -2,-22, -4, 1,-19, -7, 0,-23, 14,-18, -9, 6,-15, 9, 33, -1, -6,-18,-19,-11, 3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='K'; M= -6, -4,-23, -4, 5,-17,-16, -5,-18, 18,-17, -8, -4, -4, 6, 12, -5, -4,-15,-13, -1, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= -2,-16,-12,-19,-19, -2,-21,-19, 18,-16, 7, 6,-13,-21,-18,-15, -6, -1, 23,-24, -8,-19; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='L'; M= -8,-23,-18,-22,-14, 4,-23,-16, 12,-22, 33, 12,-23,-12,-15,-16,-22, -8, 4,-17, -3,-15; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='T'; M= 4, -4,-15,-11, -3, -6,-17,-16,-13, -7,-11,-11, -3,-12, -8, -5, 11, 23, -5,-24, -9, -5; /M: SY='I'; M= -5,-19,-20,-24,-19, -5,-28,-24, 15,-20, 8, 4,-16, -9,-17,-19, -6, 12, 14,-26, -8,-20; /M: SY='N'; M=-10, 33,-20, 19, 0,-18, -4, 7,-20, -2,-27,-19, 46,-19, -1, -2, 9, 2,-26,-35,-13, -1; /M: SY='H'; M=-15, -4,-30, -5, 4,-25,-22, 38,-19, 4,-17, 0, 2,-16, 23, 9, -8,-14,-22,-24, 3, 11; /M: SY='V'; M= -4,-27,-16,-32,-27, 0,-29,-22, 31,-19, 14, 25,-26,-26,-20,-19,-14, -4, 36,-26, -6,-25; /M: SY='F'; M=-12,-23,-20,-30,-25, 31,-29,-20, 15,-25, 15, 7,-16,-27,-27,-20,-17, -7, 12,-12, 8,-25; /M: SY='E'; M=-10, 9,-27, 15, 28,-27,-11, -3,-25, 4,-20,-16, 4, -9, 9, 1, -1, -9,-21,-30,-18, 18; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20, 0,-27; /M: SY='L'; M=-11,-25,-17,-30,-21, 1,-29,-16, 20,-19, 25, 25,-22,-25,-13,-11,-22,-10, 11,-21, -2,-18; /M: SY='L'; M= -6,-20,-11,-20,-11, -1,-25,-18, 7,-21, 23, 7,-20,-24,-15,-17,-13, -2, 7,-26, -7,-13; /M: SY='K'; M=-11, -3,-14, -3, 2,-22,-22,-12,-21, 20,-18, -9, -5,-16, 0, 17, -8, -5,-11,-26,-12, 0; /M: SY='W'; M=-14,-29,-30,-29,-24, 14,-27, -9, 4,-17, 6, 4,-29,-29,-17,-16,-25,-14, -1, 40, 33,-21; /M: SY='M'; M= -8,-17,-21,-22,-13, 7,-23,-14, 0, -3, 10, 12,-16,-21,-11, -4,-16, -6, -1,-15, 1,-11; /M: SY='E'; M= -7, 12,-25, 13, 26,-26,-15, 3,-22, 6,-20,-15, 10,-10, 10, -1, 0, -7,-21,-30,-16, 18; /M: SY='T'; M= -8, -3,-22, -6, -7, -8, -6, -9,-10,-14, 0, -6, -1,-20,-10,-12, -5, 1,-11,-21, -4, -9; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -9, 1,-30, 3, 1,-30, 16, -2,-34, 4,-26,-15, 3,-15, 4, 7, -3,-14,-27,-23,-18, 2; /M: SY='D'; M=-16, 38,-27, 44, 14,-34, -9, 3,-32, 5,-29,-23, 27,-13, 7, -2, 2, -7,-29,-36,-18, 11; /M: SY='W'; M=-14,-33,-43,-33,-24, 4,-16,-26,-20,-18,-22,-20,-31,-26,-16,-18,-25,-21,-26,114, 21,-16; /M: SY='Q'; M= 0, -4,-23, -4, 0,-22, -7,-10,-16, -2,-12, -4, -5, -7, 4, -6, 0, -3,-14,-25,-15, 2; /M: SY='E'; M= -4, 8,-25, 11, 26,-25,-16, -5,-25, 10,-20,-16, 4, -7, 8, 6, 2, 0,-21,-28,-17, 16; /M: SY='A'; M= 39, -6,-14,-13, 3,-22, -4,-16,-14, -6,-12,-12, -8, -8, -4,-16, 8, -2, -6,-22,-20, -1; /M: SY='F'; M= -3,-26,-19,-33,-23, 34,-25,-21, 8,-26, 20, 6,-21,-26,-27,-21,-18, -8, 5, -7, 9,-23; /M: SY='M'; M=-11, -9,-25,-11, 1,-10,-23, 2, -3, -1, -3, 8, -7,-16, 3, -4,-11,-10, -5,-23, -4, 1; /M: SY='E'; M= -3, -3,-23, -7, 2, -9,-17, 0,-10, -5,-13, -8, 1,-14, 0, -7, 1, -2,-12,-21, -1, 0; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='V'; M= -1, -7,-13,-10, -9,-10,-11,-15, 2,-11, -7, -4, -4,-16,-12,-12, 3, 5, 9,-26,-12,-11; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-25, 5,-33,-25, 32,-28, 32, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 25,-22, -2,-25; /M: SY='P'; M= -7,-14,-34, -7, 2,-29,-17,-15,-20, -8,-29,-18,-13, 62, -1,-15, -1, -5,-27,-31,-26, -3; /M: SY='K'; M= -7, -8,-27, -8, 1,-23,-18,-10,-16, 15,-20, -3, -5, 4, 5, 9, -2, -5,-14,-25,-13, 2; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10, 0,-19, 10, 66,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='K'; M= -4, -1,-26, -2, 6,-27,-16, 0,-27, 33,-27,-10, 1,-11, 7, 19, -3, -7,-18,-23, -9, 6; /M: SY='G'; M= -7, -9,-24, -8,-14,-13, 8, -7,-13,-18, -4, -5, -8,-22,-15,-16, -8, -8, -8,-22, -9,-16; /M: SY='A'; M= 1, -6,-22, -7, -9,-16, -9,-14,-11, 0,-13, -8, -7,-17, -9, -3, -3, -3, -2,-22, -9,-10; /M: M= -1,-10,-25,-14,-11,-15, -9,-13, -6, -6,-11, -5, -6, -7, -7,-10, -6, -8, -6,-20, -8,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of true positive hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SAM-dependent MTase TRM10-type |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
33 sequences
MRRP1_DROME (Q7JUX9), TM10A_BOVIN (Q3MHI8), TM10A_DROME (Q9VR56), TM10A_HUMAN (Q8TBZ6), TM10A_MOUSE (Q8C1Z8), TM10A_RAT (Q4KLI2), TM10A_XENTR (Q66JJ4), TM10B_BOVIN (Q08DP1), TM10B_DANRE (Q08BM0), TM10B_HUMAN (Q6PF06), TM10B_MOUSE (Q9D075), TM10B_RAT (Q5RJK3), TM10C_BOVIN (Q2KI45), TM10C_HUMAN (Q7L0Y3), TM10C_MOUSE (Q3UFY8), TM10C_RAT (Q5U2R4), TM10C_XENTR (A4IHS0), TRM10_ASPFU (Q4WXA1), TRM10_CANAL (Q59Q39), TRM10_CANGA (Q6FQB2), TRM10_CRYNB (P0CS11), TRM10_CRYNJ (P0CS10), TRM10_DEBHA (Q6BWG3), TRM10_EMENI (Q5B8X0), TRM10_EREGS (Q75A17), TRM10_GIBZE (Q4I8X0), TRM10_KLULA (Q6CUM6), TRM10_SCHPO (O14214), TRM10_SULAC (Q4J894), TRM10_THEKO (Q5JD38), TRM10_YARLI (Q6C1W9), TRM10_YEAST (Q12400), YQK3_CAEEL (Q09287)» more
|
| PDB [Detailed view] |
14 PDB
4FMW; 4JWF; 4JWG; 4JWH; 4JWJ; 5A7T; 5A7Y; 5A7Z; 5NFJ; 6EMS; 6EMT; 6EMU; 6EMV; 7ONU » more |