Home  |  Contact
Entry: PS51701

General information about the entry

Entry name [info] 6_CYS
Accession [info] PS51701
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51701
Associated ProRule [info] PRU01038

Name and characterization of the entry

Description [info] 6-Cysteine (6-Cys) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=140;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1320771; R2=0.0094659; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13623.5410156; R2=6.6217141; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=779; H_SCORE=18782; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=568; H_SCORE=17385; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-75; I=-75; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M= -3, -4,-22, -8,  1, -5,-11,-12, -3,  9, -6,  3,  2, -7, -6, -4, -2, -5, -6,-22, -7, -3;
/M: SY='I';  M=  1, -9,-19,-17,-10, -5,-14,-16, 19, -5,  6,  5, -1,-17,-11,-16, -4,  2, 14,-27, -6,-12;
/M: SY='Y';  M=-13, -8,-32, -3, -1, -1,-18,  9,-13,  3,  0,  1, -8, -7, -4, -2, -7, -9,-10,-11, 15, -4;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-30,-16,-19,-10, 27,-22,  7,-10, -2, -6, -5,-17,-18,-18, -2, -6, -3, -8,-10,-19;
/M: SY='C';  M=-26,-18,145,-28,  8,-27,-37,-45,-15,-27,  1,-17,-10,-27,-19,-20,-19,-17,-16,-21,-52, -1;
/M: SY='D';  M=  1, 33,-26, 54,  6,-36, -5,-15,-27,  1,-12,-20, 13, -9, -8,-11,  3, -5,-18,-38,-15, -1;
/M: SY='F';  M=-19,-25,-33,-37,-32, 70,-27,-18,  0,-10, 18,-14,-11,-33,-23,-10,-10,-13,  9,  6, 32,-32;
/I:         I=-4; MD=-6;
/M: SY='S';  M=  2,  3,-14,  4, -2,-10, -3, -9, -4, -1, -5, -5,  3, -7, -2, -6,  5,  4, -3,-17, -6, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='N';  M=  3,  6,-18, -1, -4,-11,-11,-11, -5,  1, -7, -1, 16,-11, -4,-13,  7, 11, -6,-38,-14, -5;
/M: SY='K';  M=  2,  9,-21,  9,  9,-22, -1,-12,-15, 10,-15, -4, 10, -3, -1, -6,  4, -3,-18,-28,-19,  4;
/M: SY='E';  M=  0,  2,-16,  1,  7,-15,-11, -8, -8,  7, -9,  2,  5, -7,  0, -4, -2, -4,-11,-28,-12,  4;
/M: SY='S';  M= -1, -3,-24, -3, -2, -8, -6,-11, -2,  0, -3, -3, -3,-10, -7,-10,  1, -1, -4,-20, -3, -6;
/M: SY='S';  M=  1,  0,-22,  0,  2,-11,-10, -9,-10,  4, -9, -4,  0, -5, -2, -5,  5,  2, -9,-25, -8, -1;
/M: SY='I';  M= -4, -8,-16,-12, -8,  0,-17, -1,  2, -6,  2,  2, -2,-14,-10,-12, -4, -1,  1,-27, -2,-10;
/M: SY='L';  M= -3, -3,-17, -6, -5, -3,-11,-12,  1, -4,  2, -1,  1,-16, -8,-12, -3,  1, -2,-23, -1, -6;
/M: SY='F';  M= -5,-14,-23,-24,-19, 26,-18,-17,  8, -8,  9, -6, -6,-19,-15,-13, -5, -4,  8,-17,  6,-20;
/M: SY='S';  M= -2, -1,-14, -1,  2,-15,-12, -9, -7, -1, -3, -7, -2, -2, -6,-14,  4,  4, -8,-26, -8, -2;
/M: SY='N';  M= -3,  1,-19, -1,  0, -8,-14,-10, -7,  1, -4, -3,  4, -7, -3, -8,  0,  2, -8,-25, -4, -2;
/M: SY='N';  M= -1,  6,-18, -2, -4,-14, -6, -9,  0, -1, -9, -5, 16, -9, -6,-13,  0,  2, -8,-34,-17, -6;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='I';  M= -3, -2,-16, -5, -4, -8,-14,-10,  2, -1,  0,  1,  2,-13, -8,-11, -4, -1, -1,-25, -4, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='D';  M=  1,  6,-18,  7,  2,-16, -9,-11, -4,  3, -4,  1,  6,-11, -3, -8, -2, -2, -6,-28,-10, -1; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='N';  M=  0,  1,-16,  0, -1,-11, -9, -9, -5,  1, -6, -4,  4, -3, -3, -8,  0,  3, -8,-25, -9, -3; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='N';  M=  2,  4,-17,  1,  1,-12, -5, -9, -4,  4, -7,  1,  7, -8, -5, -8,  2,  1, -7,-25,-11, -2; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='D';  M=  2,  6,-16, 11,  3,-16, -3,-12,-10,  4, -8, -5,  0, -3, -3, -3,  1, -3, -8,-19, -9,  0; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-17;
/M: SY='D';  M= -2,  2,-14,  3, -1, -7, -8, -7, -2, -1,  0, -3,  3, -9, -1, -5, -2,  0, -3,-15,  0, -2; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N';  M=  3,  8,-17,  3,  2,-17, -9,-11, -4,  3, -9, -1, 14,-13, -4,-10,  1,  0, -6,-36,-18,  0;
/M: SY='K';  M= -4, -6,-24, -8, -2, -5,-16,-12,  1,  2,  0,  1, -3,-11, -3, -6, -4, -2,  1,-18,  2, -4;
/M: SY='I';  M= -1, -7,-20,-11, -5,-10,-14, -5,  6, -5, -1, -2, -2,-11, -7,-13,  0,  1,  3,-26, -7, -7;
/M: SY='C';  M=-27,-18,144,-28,  7,-28,-37,-38,-16,-28,  0,-16, -7,-28,-18,-20,-18,-18,-18,-24,-54, -2;
/M: SY='N';  M=  0,  0,-16, -2,  1,-10,-15,-12, -6,  2, -7, -5,  5, -9, -4, -8,  4,  5, -4,-27, -8, -1;
/M: SY='I';  M=  0,-18,-21,-26,-24,  7,-19,-20, 38,-15, 16,  7,-10,-31,-20,-18,-10,  3, 33,-24,  6,-24;
/M: SY='H';  M= -4,  4,-24,  7,  4,-18,-15,  9,-15,  2, -9, -2,  4, -7,  2, -2, -2, -6,-14,-28, -7,  2;
/M: SY='I';  M=  3,-10,-22,-14,-13,  6,-13,-14, 13,-10,  9,  3, -6,-17,-12,-15, -4,  3, 11,-26,  1,-14;
/M: SY='K';  M= -3,  1,-23,  1,  5,-12,-10,-11,-12,  8, -9, -3,  2, -5, -2, -5,  1, -2,-12,-18, -5,  1;
/I:         I=-17; MD=-23;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-14,  2,  7,-12, -2, -8, -9,  6, -9, -2,  3, -4,  1, -4,  5, -2,-10,-18,-13,  3; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-16, -8, -3, -5, -9, -2, -8,  1, -6,-10, -6, 18, -3, -2, -6, -3,-10,-14, -3, -5; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-23;
/M: SY='N';  M= -6,  2,-21, -9,-12,  3,  5,-16, -3, -4, -5, -4, 14,-22,-12,-12, -5, -6,-12,-13, -8,-13;
/M: SY='D';  M=  3, 20,-21, 33, 12,-30,-11,-10,-21,  7,-11,-10,  7, -7, -3, -8,  4, -4,-15,-34,-15,  5;
/M: SY='I';  M= -3,-14,-24,-18,-14,  5,-18,-15, 14, -4, 10,  5,-10,-17,-12,-11, -6,  2, 13,-18,  8,-15;
/M: SY='I';  M=  0,-18,-18,-28,-26, 20,-17,-23, 31,-17, 16,  2, -9,-33,-23,-18, -9,  0, 28,-22,  5,-26;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-31,-10,-12,-20, 33,-22, -4, -5,-11, -8, -1,-10, -9,-14,  2, -6,-13, -9,-19,-11;
/M: SY='F';  M= -6,-19,-19,-31,-27, 30,-20,-20, 28,-15, 21,  3, -8,-33,-23,-19,-11, -5, 23,-17, 10,-27;
/M: SY='M';  M=  1, -3,-22, -9, -3, -4,-13,-13,  3,  7, -4,  9,  6,-14, -5, -5, -3,  0,  0,-28, -7, -5;
/M: SY='C';  M=-27,-20,132,-28,  4,-19,-36,-43,-14,-26,  4,-16,-11,-29,-19,-18,-18,-17,-14,-16,-42, -4;
/M: SY='P';  M= -7,-13,-27, -6,  7,-33, -5,  3,-23,  6,-23,-31,-20, 72, -1,-10, -6, -1,-31,-26,-18,  0;
/I:         I=-21; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N';  M=  0, -2,-25, -6, -4, -8,-10, -8, -5,  3, -8, -2,  5, -5, -6, -9,  5,  5, -6,-28, -9, -7;
/M: SY='N';  M=  0, 11,-22,  6,  0,-16,  3,-13,-12,  5,-14, -6, 18,-10, -4, -7,  2, -2,-17,-29,-18, -3;
/M: SY='K';  M= -4, -4,-25, -4, -3, -3,-15,-11, -6,  4, -1,  1,  0,-11, -4, -6, -1,  0, -3,-19,  2, -5;
/M: SY='N';  M=  0,  1,-19, -4, -3, -7, -8,-12, -1,  1, -3,  0,  7,-12, -7,-12,  1,  3, -4,-29, -8, -6;
/M: SY='K';  M= -1,  0,-19, -1,  0, -9, -9,-11, -5,  1, -3, -2,  1, -6, -6,-11,  0,  1, -8,-25, -6, -3;
/I:         I=-2; MD=-2;
/M: SY='Y';  M= -3, -3,-15, -2, -4, -3, -7, -1, -1, -2,  0, -2, -2, -6, -4, -5,  0,  0, -1, -9,  2, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='N';  M= -2,  2,-13,  1, -1, -6, -5,  1, -6,  1, -4, -1,  4, -4,  0, -2, -2, -2, -7,-13, -3, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='I';  M= -1, -4,-11, -8, -6,  4, -9, -8,  5, -3,  3,  0,  0,-13, -6, -6, -1,  1,  4,-13,  0, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='K';  M= -1, -3,-11, -6,  1,  0,-10, -9, -1,  2, -1, -2,  0, -8, -2, -4,  0, -1, -1,-12, -2, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='Y';  M= -5,-10,-14,-10,-11,  6,-13, -6, 12, -8, 13,  5, -9,-16,-10, -9, -8,  1, 11, -8, 14,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-18,  0,  3, -9,-14, -1, -6,  2, -2,  1,  0, -7,  0, -4, -3, -2, -6,-18,  0,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='P';  M= -8,-14,-26, -5,  7,-34, -8,  6,-24,  8,-24,-32,-22, 84, -1, -9, -8,  0,-32,-27,-17, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='N';  M=  1,  4,-20,  4,  3,-16,-10, -6,-11,  4,-10, -6,  5,  3, -3, -8,  3,  1,-12,-31,-14, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-2;
/M: SY='N';  M= -2, 10,-22,  8,  0,-14, -4,-11,-11,  2, -9, -6, 14, -9, -4,-10,  1,  0,-14,-29,-10, -2;
/M: SY='C';  M=-21,-17,108,-26,  1,-18,-31,-37, -8,-23,  4,-11, -8,-29,-19,-19,-16,-14, -9,-21,-40, -6;
/M: SY='F';  M=-15,-23,-29,-36,-29, 70,-26,-25, -3, -6, 14,-15,-10,-27,-23,-10, -8,-14,  5,  2, 22,-30;
/M: SY='D';  M= -1,  5,-21, 11, 11,-18,-13, -1,-18,  5,-10, -7,  1, -5,  1, -5,  4, -3,-15,-25, -8,  6;
/M: SY='N';  M= -1,  4,-23,  5,  5,-15,-14, -4,-14,  5,-11, -4,  6, -8,  4, -2,  3,  0,-13,-27, -8,  3;
/M: SY='V';  M=  8,-13,-21,-18,-21,  0,-21,-19, 28,-13,  7,  5, -8,-29,-19,-14, -5, 10, 30,-33, -1,-21;
/I:         I=-4; MD=-5;
/M: SY='Y';  M=-13,-17,-29,-16,-17, 15,-17, -8,  8,-12, 17,  0,-16,-21,-12,-10,-10, -2, 10,  0, 29,-17; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-5;
/M: SY='Y';  M= -6,-10,-20,-12,-12,  4,-11, -8,  9, -7,  8,  0, -6,-13, -9, -9, -5,  1,  8, -9, 11,-12; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='D';  M= -2,  4,-13,  5,  3, -8, -6, -7, -8,  5, -5, -1,  4, -4, -3, -3, -1, -2, -8,-12, -4,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='E';  M= -2,  1,-12,  0,  4, -9, -9, -4, -7,  3, -4, -3,  3, -5,  0, -5,  0, -1, -7,-16, -5,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='N';  M= -1,  5,-14,  1, -3, -3, -5,-11, -3,  0, -2, -2,  9,-13, -5, -7, -1, -1, -6,-21, -6, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='K';  M= -1,  2,-16,  2,  3,-11,-10, -7, -5,  6, -4,  2,  2, -5, -4, -5, -2, -2, -6,-20, -5,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='E';  M= -1, -2,-13, -4,  2,-11, -8, -8, -3,  1, -3, -3,  0,  0, -3,-10, -1,  1, -6,-20, -8,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='K';  M=  3,  1,-15,  0,  3,-11,-11, -8, -4,  4, -6,  1,  4, -8, -1, -5,  2,  2, -5,-25, -9,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='N';  M= -1, 11,-18,  9,  8,-17, -5, -8,-13,  9,-13, -2, 15, -5, -2, -6,  1, -4,-17,-28,-15,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-5;
/M: SY='I';  M= -1, -3,-17, -8,-11,  0,-13,-14, 12, -9,  9,  3,  0,-19,-12,-16, -4,  3,  7,-29, -1,-12;
/M: SY='N';  M=  2, 10,-16, 10,  8,-20, -9,-10,-13,  4,-11, -7, 12, -9,  3, -8,  4,  2,-14,-31,-16,  6;
/M: SY='E';  M= -1,  9,-19,  9, 10,-20, -9, -6,-15,  9,-11, -2, 10, -5,  1, -6, -1, -5,-17,-29,-14,  6;
/M: SY='I';  M= -1,-11,-17,-16,-13,  3,-17,-16, 22,-10, 14,  7, -9,-21,-15,-16, -8,  2, 17,-25,  5,-14;
/M: SY='L';  M= -6,-13,-15,-17,-14, 13,-20,-12, 18,-12, 20,  9,-12,-25,-17,-15,-12, -1, 14,-19, 14,-15;
/M: SY='P';  M= -6, -2,-23,  3,  9,-20,-12, -3,-17,  7,-11,-11, -6, 21,  1, -5, -5, -5,-19,-23, -7,  4;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-21, -9,-11, -7, 10,-15,  3, -7,  2,  0,  2,-18,-11,-15, -5, -4, -7,-18, -8,-11;
/M: SY='A';  M=  8, -2,-20, -3, -4, -8,-12,-15,  1, -2, -2,  0,  0,-15, -6,-10,  5,  8,  4,-31, -9, -6;
/M: SY='N';  M=  1,  5,-19,  4, -2,-13,-11,-16,  0,  0, -4, -2,  7,-15, -5, -9, -1,  0, -1,-31,-10, -4;
/M: SY='I';  M= -5,-17,-24,-24,-20,  9,-17,-15, 23,-12, 14,  3,-10,-21,-14,-16, -9,  2, 18,-17, 10,-20;
/I:         I=-9; MD=-13;
/M: SY='L';  M= -4, -6,-15,-12,-13,  9,-12,-11,  9, -8, 10,  2, -1,-18,-13,-13, -4,  3,  6,-19,  6,-14; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-13;
/M: SY='P';  M=  0, -4,-15, -2,  7,-18,-10, -3,-11,  5,-11, -8, -4, 14,  5, -2, -2, -2,-13,-20,-11,  4; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='N';  M=  2,  3,-17,  0, -3,-10, -4,-13, -3,  0, -5, -2,  8,-10, -4, -9,  2,  3, -5,-25,-11, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-13;
/M: SY='I';  M=  1,-10,-23,-15,-13,  5,-16,-13, 11, -6,  7,  5, -4,-19,-10,-11, -4,  3, 11,-24,  3,-13;
/M: SY='N';  M=  0,  7,-11,  6,  1,-17, -9,-13, -5, -1, -5, -5, 11,-13, -6,-12,  0,  0, -8,-33,-15, -3;
/M: SY='L';  M= -5, -7,-23, -9, -6, -3,-12, -9,  3, -1,  4,  2, -4,-15, -9, -9, -6, -5,  1,-17,  3, -8;
/M: SY='Y';  M= -7,  1,-27,  2, -1, -6,-15, -3, -9,  2, -2, -1,  2,-10, -6, -7, -2, -3, -8,-20,  4, -4;
/M: SY='N';  M= -3,  5,-19,  2, -2, -8,-10,-10, -4,  0, -2, -1,  9,-14, -6, -9, -4, -2, -7,-28, -6, -5;
/M: SY='N';  M= -3,  9,-24,  9, -2,-12, -9, -8,-11,  0, -8, -8, 12,-11, -7,-12,  4,  3,-11,-29, -7, -6;
/M: SY='N';  M= -1,  0,-24, -3, -6, -6, -8,-12, -8,  2, -7, -3,  5,-12, -2, -2,  0, -2, -7,-24, -8, -7;
/I:         I=-15; MD=-21;
/M: SY='N';  M= -2,  1,-22, -4, -5, -5,-12, -8, -4,  1, -4,  0,  8,-10, -4, -8, -2,  2, -6,-28, -6, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MD=-21;
/M: SY='D';  M= -2,  7,-21, 10,  5,-14, -8, -8,-14,  6, -9, -3,  7, -7,  0, -2, -2, -6,-13,-22, -8,  2; D=-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='N';  M= -4, -2,-22, -4, -7, -1,-12,-10, -2,  0,  1,  0,  2,-13, -7, -6, -3, -1, -2,-20,  2, -9; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-21;
/M: SY='G';  M= -3, -2,-27, -4, -8, -7,  4,-15, -6,  0, -5, -5,  1,-12, -9,-10,  1, -1, -8,-13, -2, -9; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-21;
/M: SY='I';  M=  0, -8,-22,-11, -8, -6,-14, -8,  5, -6,  2, -2, -5,-11, -7,-13,  0,  5,  4,-24, -1, -9;
/M: SY='F';  M=  0, -9,-25,-12,-12,  5,-14,-11,  1, -5,  1, -2, -5,-17, -7, -5,  3,  2,  4,-21,  1,-12;
/M: SY='Y';  M=-10,-15,-30,-12,-12,  8,-18,-11,  2, -7, 11, -3,-15,-17, -6, -6, -4,  0,  7, -2, 23,-12;
/M: SY='F';  M= -7,-17,-20,-25,-22, 36,-20,-18, 13,-12, 21,  1,-12,-30,-20,-14, -9, -4, 13,-12, 18,-22;
/M: SY='F';  M= -5,-15,-25,-20,-12,  7,-12,-11,  3, -4,  2,  0,-10,-16, -3,  0, -6, -7,  3,-10,  4,-11;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-18,-26,-23,  8,-14,-19, 35,-16, 18,  8, -7,-29,-20,-21, -9,  2, 27,-25,  3,-23;
/M: SY='P';  M= -6,-15,-27, -9,  4,-30,-11,  4,-20,  5,-21,-29,-22, 74, -2,-12, -5,  4,-26,-31,-16, -3;
/M: SY='P';  M= -4, -8,-25, -6,  3,-22, -8,  0,-16,  4,-15,-19,-10, 40, -1,-10, -4,  0,-22,-27,-13, -2;
/M: SY='Y';  M=-10, -7,-32, -3, -9,  4,-17, -9, -4, -3,  5, -4, -9,-15,-10, -7, -2,  0,  2, -8, 19,-12;
/M: SY='I';  M= -1,-15,-23,-23,-23, 12,-19,-17, 25,-12, 11,  2, -6,-28,-20,-15, -7,  2, 23,-23,  5,-23;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-23,  2,  4,-15,-10, -5,-11,  6, -8, -2,  0, -1, -2, -4, -1, -3,-12,-25, -7,  0;
/M: SY='K';  M=  0,  4,-20,  5, 10,-18,-12, -8,-15, 12,-11,  1,  5, -3,  4, -1,  1, -3,-15,-27,-12,  7;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D';  M=  2, 21,-21, 31,  8,-28,-10, -9,-19,  2,-11,-12, 13, -8, -2,-11,  4, -1,-15,-37,-16,  3;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -1,-13,-21,-17,-10,  0,-15,-13, 13, -4,  9,  8, -8,-16, -8,-10, -7,  0,  9,-20,  3,-10;
/M: SY='H';  M= -1, -1,-22, -4,  0,-14,-13,  6, -8, -1, -6, -1,  5, -6, -2,-11,  4,  4,-10,-32, -9, -1;
/M: SY='F';  M=-13,-25,-24,-42,-34, 62,-24,-25, 19,-14, 22, -7, -9,-36,-26,-16,-11,-12, 19, -5, 19,-34;
/M: SY='S';  M= -3, -9,-24,-10, -4,  2,-15, -8, -4, -1,  0, -5, -6,-14, -5, -7,  5,  2, -2,-15,  4, -7;
/M: SY='C';  M=-23,-20,113,-30, -1,-11,-34,-41, -5,-26,  7,-12,-10,-31,-21,-19,-18,-15, -7,-19,-37, -8;
/M: SY='I';  M= -1, -8,-21,-12, -5, -2,-12,-11,  2, -1,  0,  0, -3,-14, -4, -9,  1,  2,  1,-21, -2, -6;
/M: SY='C';  M=-28,-21,146,-32,  5,-18,-38,-47,-16,-28,  2,-19,-10,-30,-20,-19,-19,-19,-16,-18,-51, -4;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-22, 13, -2,-16,-11,-13, -8,  0, -6, -7, 13,-14, -4, -9, -1,  1, -7,-30, -7, -4;
/M: SY='N';  M= -2, 12,-21,  3, -6, -9, -6, -9, -4,  0, -8,  0, 26,-19, -7,-10, -1,  2,-10,-36,-13, -8;
/M: SY='D';  M=  1,  5,-22,  7,  3,-17, -7,-12,-13,  5,-12, -8,  3, -3, -4, -6,  7,  3,-12,-27,-12, -2;
/M: SY='K';  M= -1,  4,-22,  7,  7,-17, -7,-11,-13,  8, -8, -1,  1, -4,  1, -4, -2, -4,-14,-22, -7,  4;
/M: SY='K';  M=  2,  3,-23,  2,  1,-18, -5,-16,-10,  6,-10, -4,  4, -2, -3,-10,  6,  6,-10,-27,-12, -1;
/M: SY='K';  M=  1,  1,-19, -3,  0,-12,-11,-13, -3,  4, -5,  1,  4, -7, -2, -9,  1,  4, -6,-29,-10, -2;
/I:         I=-10; MD=-14;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-18, -2, -1, -8, -6, -8, -4,  3, -4,  0,  2, -9, -5, -5,  0, -2, -5,-14, -4, -3; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-14;
/M: SY='K';  M=  0,  1,-16,  2,  3,-10, -4, -7, -7,  5, -6, -1,  2, -4, -3, -5,  1, -2, -7,-15, -6,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-14;
/M: SY='N';  M=  1,  2,-12, -4, -4, -7, -5, -7,  4,  1, -2,  3, 10,-11, -3, -7, -3,  1, -2,-21, -8, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-14;
/M: SY='N';  M= -1,  1,-13, -3, -4, -3, -5, -8, -1,  1, -3,  0,  7, -7, -3, -4, -1,  2, -2,-16, -4, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-20, -9,-11, -9, 20,-13,  1, -6, -4, -6, -2, -9,-11,-12,  0, -4, -6, -5, -9,-11; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-14;
/M: SY='N';  M=  1,  2,-24, -4, -9, -9, -3,-18,  4, -1, -5, -1,  9,-16, -7,-10, -1,  2, -1,-27,-10,-10;
/M: SY='I';  M=  1, -7,-20,-12, -9, -1,-15,-17,  6,  0,  0,  3, -2,-12, -9, -7, -3,  3,  6,-27, -4,-10;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-31, -8,-10,-18, 23,-13, -5, -4,-10, -5, -1, -8, -9,-12, -1, -7,-13,-15,-17,-11;
/M: SY='I';  M=  0,-11,-20,-17,-14, -2,-16,-14, 17, -8, 10,  5, -6,-18,-11,-16, -2,  7, 15,-26,  1,-14;
/M: SY='I';  M=  2,-15,-21,-21,-20,  3,-14,-15, 27,-11, 16, 11, -8,-30,-18,-15,-11,  1, 22,-23,  4,-21;
/M: SY='K';  M= -6, -2,-25, -2,  8, -8,-16,  2,-15, 10, -8,  2,  0, -5,  1,  1, -2, -7,-14,-18,  0,  4;
/M: SY='I';  M=  2,-15,-19,-25,-21,  3,-15,-18, 35,-15, 14,  7, -6,-28,-18,-19, -9,  2, 28,-27, -1,-21;
/M: SY='H';  M= -2, -2,-24, -4, -1, -7,-14,  6, -6, -2, -6, -2,  3,-10, -5, -9,  0, -2, -8,-29, -6, -4;
/M: SY='I';  M= -4,-17,-21,-24,-21, 14,-19,-18, 26,-13, 16,  3,-11,-27,-19,-15, -9,  0, 23,-18, 10,-22;
/M: SY='K';  M=  2,  5,-18,  5,  9,-17, -9, -9,-15, 10,-15, -6,  7,  1,  0, -4,  7,  1,-16,-30,-17,  4;
/M: SY='K';  M=  2,  1,-25,  1, 10,-17, -9,-10,-16, 17,-17,  1,  3,  6,  4,  2,  3, -2,-17,-27,-15,  5;
/M: SY='N';  M= -2,  5,-22,  3, -1,-12, -6,-10,-11,  2, -9, -4, 10,-10,  0, -3,  0, -2,-13,-25, -9, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 71 in 20 different sequences
Number of true positive hits 71 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 14
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] 6-Cys
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
20 sequences

P230P_PLAF7 (O96175    ), P230_PLAF7  (P68874    ), P230_PLAFO  (P68875    ), 
P4548_PLABA (Q4YSU6    ), P4548_PLAF7 (Q8I6T1    ), PF12P_PLABA (Q4Z5T0    ), 
PF12P_PLAF7 (C6KSX1    ), PF12_PLAF7  (C6KSX0    ), PF12_PLAFA  (P19259    ), 
PF36P_PLABA (Q4Z4D2    ), PF36P_PLAF7 (Q8I1Y4    ), PF36P_PLAYO (Q7K5V2    ), 
PF36_PLABA  (Q4Z4D1    ), PF36_PLAF7  (Q8I1Y5    ), PF36_PLAYO  (Q7RPW4    ), 
PF38_PLAF7  (Q8I423    ), PF41_PLAF7  (Q8I1Y0    ), PF92_PLAF7  (Q8ID66    ), 
PFS47_PLABA (Q9BMP8    ), PFS47_PLAF7 (Q8IDN0    )
» more

PDB
[Detailed view]
6 PDB

2LOE; 2YMO; 4YS4; 6E62; 6E63; 6H5N

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission