PROSITE entry PS51701
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | 6_CYS |
| Accession [info] | PS51701 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51701 |
| Associated ProRule [info] | PRU01038 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | 6-Cysteine (6-Cys) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=140; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1320771; R2=0.0094659; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13623.5410156; R2=6.6217141; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=779; H_SCORE=18782; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=568; H_SCORE=17385; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-75; I=-75; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -3, -4,-22, -8, 1, -5,-11,-12, -3, 9, -6, 3, 2, -7, -6, -4, -2, -5, -6,-22, -7, -3; /M: SY='I'; M= 1, -9,-19,-17,-10, -5,-14,-16, 19, -5, 6, 5, -1,-17,-11,-16, -4, 2, 14,-27, -6,-12; /M: SY='Y'; M=-13, -8,-32, -3, -1, -1,-18, 9,-13, 3, 0, 1, -8, -7, -4, -2, -7, -9,-10,-11, 15, -4; /M: SY='G'; M= 0, -8,-30,-16,-19,-10, 27,-22, 7,-10, -2, -6, -5,-17,-18,-18, -2, -6, -3, -8,-10,-19; /M: SY='C'; M=-26,-18,145,-28, 8,-27,-37,-45,-15,-27, 1,-17,-10,-27,-19,-20,-19,-17,-16,-21,-52, -1; /M: SY='D'; M= 1, 33,-26, 54, 6,-36, -5,-15,-27, 1,-12,-20, 13, -9, -8,-11, 3, -5,-18,-38,-15, -1; /M: SY='F'; M=-19,-25,-33,-37,-32, 70,-27,-18, 0,-10, 18,-14,-11,-33,-23,-10,-10,-13, 9, 6, 32,-32; /I: I=-4; MD=-6; /M: SY='S'; M= 2, 3,-14, 4, -2,-10, -3, -9, -4, -1, -5, -5, 3, -7, -2, -6, 5, 4, -3,-17, -6, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='N'; M= 3, 6,-18, -1, -4,-11,-11,-11, -5, 1, -7, -1, 16,-11, -4,-13, 7, 11, -6,-38,-14, -5; /M: SY='K'; M= 2, 9,-21, 9, 9,-22, -1,-12,-15, 10,-15, -4, 10, -3, -1, -6, 4, -3,-18,-28,-19, 4; /M: SY='E'; M= 0, 2,-16, 1, 7,-15,-11, -8, -8, 7, -9, 2, 5, -7, 0, -4, -2, -4,-11,-28,-12, 4; /M: SY='S'; M= -1, -3,-24, -3, -2, -8, -6,-11, -2, 0, -3, -3, -3,-10, -7,-10, 1, -1, -4,-20, -3, -6; /M: SY='S'; M= 1, 0,-22, 0, 2,-11,-10, -9,-10, 4, -9, -4, 0, -5, -2, -5, 5, 2, -9,-25, -8, -1; /M: SY='I'; M= -4, -8,-16,-12, -8, 0,-17, -1, 2, -6, 2, 2, -2,-14,-10,-12, -4, -1, 1,-27, -2,-10; /M: SY='L'; M= -3, -3,-17, -6, -5, -3,-11,-12, 1, -4, 2, -1, 1,-16, -8,-12, -3, 1, -2,-23, -1, -6; /M: SY='F'; M= -5,-14,-23,-24,-19, 26,-18,-17, 8, -8, 9, -6, -6,-19,-15,-13, -5, -4, 8,-17, 6,-20; /M: SY='S'; M= -2, -1,-14, -1, 2,-15,-12, -9, -7, -1, -3, -7, -2, -2, -6,-14, 4, 4, -8,-26, -8, -2; /M: SY='N'; M= -3, 1,-19, -1, 0, -8,-14,-10, -7, 1, -4, -3, 4, -7, -3, -8, 0, 2, -8,-25, -4, -2; /M: SY='N'; M= -1, 6,-18, -2, -4,-14, -6, -9, 0, -1, -9, -5, 16, -9, -6,-13, 0, 2, -8,-34,-17, -6; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='I'; M= -3, -2,-16, -5, -4, -8,-14,-10, 2, -1, 0, 1, 2,-13, -8,-11, -4, -1, -1,-25, -4, -6; D=-12; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='D'; M= 1, 6,-18, 7, 2,-16, -9,-11, -4, 3, -4, 1, 6,-11, -3, -8, -2, -2, -6,-28,-10, -1; D=-12; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='N'; M= 0, 1,-16, 0, -1,-11, -9, -9, -5, 1, -6, -4, 4, -3, -3, -8, 0, 3, -8,-25, -9, -3; D=-12; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='N'; M= 2, 4,-17, 1, 1,-12, -5, -9, -4, 4, -7, 1, 7, -8, -5, -8, 2, 1, -7,-25,-11, -2; D=-12; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='D'; M= 2, 6,-16, 11, 3,-16, -3,-12,-10, 4, -8, -5, 0, -3, -3, -3, 1, -3, -8,-19, -9, 0; D=-12; /I: I=-12; MD=-17; /M: SY='D'; M= -2, 2,-14, 3, -1, -7, -8, -7, -2, -1, 0, -3, 3, -9, -1, -5, -2, 0, -3,-15, 0, -2; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='N'; M= 3, 8,-17, 3, 2,-17, -9,-11, -4, 3, -9, -1, 14,-13, -4,-10, 1, 0, -6,-36,-18, 0; /M: SY='K'; M= -4, -6,-24, -8, -2, -5,-16,-12, 1, 2, 0, 1, -3,-11, -3, -6, -4, -2, 1,-18, 2, -4; /M: SY='I'; M= -1, -7,-20,-11, -5,-10,-14, -5, 6, -5, -1, -2, -2,-11, -7,-13, 0, 1, 3,-26, -7, -7; /M: SY='C'; M=-27,-18,144,-28, 7,-28,-37,-38,-16,-28, 0,-16, -7,-28,-18,-20,-18,-18,-18,-24,-54, -2; /M: SY='N'; M= 0, 0,-16, -2, 1,-10,-15,-12, -6, 2, -7, -5, 5, -9, -4, -8, 4, 5, -4,-27, -8, -1; /M: SY='I'; M= 0,-18,-21,-26,-24, 7,-19,-20, 38,-15, 16, 7,-10,-31,-20,-18,-10, 3, 33,-24, 6,-24; /M: SY='H'; M= -4, 4,-24, 7, 4,-18,-15, 9,-15, 2, -9, -2, 4, -7, 2, -2, -2, -6,-14,-28, -7, 2; /M: SY='I'; M= 3,-10,-22,-14,-13, 6,-13,-14, 13,-10, 9, 3, -6,-17,-12,-15, -4, 3, 11,-26, 1,-14; /M: SY='K'; M= -3, 1,-23, 1, 5,-12,-10,-11,-12, 8, -9, -3, 2, -5, -2, -5, 1, -2,-12,-18, -5, 1; /I: I=-17; MD=-23; /M: SY='E'; M= 4, 2,-14, 2, 7,-12, -2, -8, -9, 6, -9, -2, 3, -4, 1, -4, 5, -2,-10,-18,-13, 3; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= -6, -8,-16, -8, -3, -5, -9, -2, -8, 1, -6,-10, -6, 18, -3, -2, -6, -3,-10,-14, -3, -5; D=-17; /I: I=-17; DM=-23; /M: SY='N'; M= -6, 2,-21, -9,-12, 3, 5,-16, -3, -4, -5, -4, 14,-22,-12,-12, -5, -6,-12,-13, -8,-13; /M: SY='D'; M= 3, 20,-21, 33, 12,-30,-11,-10,-21, 7,-11,-10, 7, -7, -3, -8, 4, -4,-15,-34,-15, 5; /M: SY='I'; M= -3,-14,-24,-18,-14, 5,-18,-15, 14, -4, 10, 5,-10,-17,-12,-11, -6, 2, 13,-18, 8,-15; /M: SY='I'; M= 0,-18,-18,-28,-26, 20,-17,-23, 31,-17, 16, 2, -9,-33,-23,-18, -9, 0, 28,-22, 5,-26; /M: SY='G'; M= 3, -3,-31,-10,-12,-20, 33,-22, -4, -5,-11, -8, -1,-10, -9,-14, 2, -6,-13, -9,-19,-11; /M: SY='F'; M= -6,-19,-19,-31,-27, 30,-20,-20, 28,-15, 21, 3, -8,-33,-23,-19,-11, -5, 23,-17, 10,-27; /M: SY='M'; M= 1, -3,-22, -9, -3, -4,-13,-13, 3, 7, -4, 9, 6,-14, -5, -5, -3, 0, 0,-28, -7, -5; /M: SY='C'; M=-27,-20,132,-28, 4,-19,-36,-43,-14,-26, 4,-16,-11,-29,-19,-18,-18,-17,-14,-16,-42, -4; /M: SY='P'; M= -7,-13,-27, -6, 7,-33, -5, 3,-23, 6,-23,-31,-20, 72, -1,-10, -6, -1,-31,-26,-18, 0; /I: I=-21; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='N'; M= 0, -2,-25, -6, -4, -8,-10, -8, -5, 3, -8, -2, 5, -5, -6, -9, 5, 5, -6,-28, -9, -7; /M: SY='N'; M= 0, 11,-22, 6, 0,-16, 3,-13,-12, 5,-14, -6, 18,-10, -4, -7, 2, -2,-17,-29,-18, -3; /M: SY='K'; M= -4, -4,-25, -4, -3, -3,-15,-11, -6, 4, -1, 1, 0,-11, -4, -6, -1, 0, -3,-19, 2, -5; /M: SY='N'; M= 0, 1,-19, -4, -3, -7, -8,-12, -1, 1, -3, 0, 7,-12, -7,-12, 1, 3, -4,-29, -8, -6; /M: SY='K'; M= -1, 0,-19, -1, 0, -9, -9,-11, -5, 1, -3, -2, 1, -6, -6,-11, 0, 1, -8,-25, -6, -3; /I: I=-2; MD=-2; /M: SY='Y'; M= -3, -3,-15, -2, -4, -3, -7, -1, -1, -2, 0, -2, -2, -6, -4, -5, 0, 0, -1, -9, 2, -5; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='N'; M= -2, 2,-13, 1, -1, -6, -5, 1, -6, 1, -4, -1, 4, -4, 0, -2, -2, -2, -7,-13, -3, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='I'; M= -1, -4,-11, -8, -6, 4, -9, -8, 5, -3, 3, 0, 0,-13, -6, -6, -1, 1, 4,-13, 0, -7; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='K'; M= -1, -3,-11, -6, 1, 0,-10, -9, -1, 2, -1, -2, 0, -8, -2, -4, 0, -1, -1,-12, -2, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='Y'; M= -5,-10,-14,-10,-11, 6,-13, -6, 12, -8, 13, 5, -9,-16,-10, -9, -8, 1, 11, -8, 14,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='E'; M= -3, -1,-18, 0, 3, -9,-14, -1, -6, 2, -2, 1, 0, -7, 0, -4, -3, -2, -6,-18, 0, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='P'; M= -8,-14,-26, -5, 7,-34, -8, 6,-24, 8,-24,-32,-22, 84, -1, -9, -8, 0,-32,-27,-17, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='N'; M= 1, 4,-20, 4, 3,-16,-10, -6,-11, 4,-10, -6, 5, 3, -3, -8, 3, 1,-12,-31,-14, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-2; /M: SY='N'; M= -2, 10,-22, 8, 0,-14, -4,-11,-11, 2, -9, -6, 14, -9, -4,-10, 1, 0,-14,-29,-10, -2; /M: SY='C'; M=-21,-17,108,-26, 1,-18,-31,-37, -8,-23, 4,-11, -8,-29,-19,-19,-16,-14, -9,-21,-40, -6; /M: SY='F'; M=-15,-23,-29,-36,-29, 70,-26,-25, -3, -6, 14,-15,-10,-27,-23,-10, -8,-14, 5, 2, 22,-30; /M: SY='D'; M= -1, 5,-21, 11, 11,-18,-13, -1,-18, 5,-10, -7, 1, -5, 1, -5, 4, -3,-15,-25, -8, 6; /M: SY='N'; M= -1, 4,-23, 5, 5,-15,-14, -4,-14, 5,-11, -4, 6, -8, 4, -2, 3, 0,-13,-27, -8, 3; /M: SY='V'; M= 8,-13,-21,-18,-21, 0,-21,-19, 28,-13, 7, 5, -8,-29,-19,-14, -5, 10, 30,-33, -1,-21; /I: I=-4; MD=-5; /M: SY='Y'; M=-13,-17,-29,-16,-17, 15,-17, -8, 8,-12, 17, 0,-16,-21,-12,-10,-10, -2, 10, 0, 29,-17; D=-4; /I: I=-4; MD=-5; /M: SY='Y'; M= -6,-10,-20,-12,-12, 4,-11, -8, 9, -7, 8, 0, -6,-13, -9, -9, -5, 1, 8, -9, 11,-12; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='D'; M= -2, 4,-13, 5, 3, -8, -6, -7, -8, 5, -5, -1, 4, -4, -3, -3, -1, -2, -8,-12, -4, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='E'; M= -2, 1,-12, 0, 4, -9, -9, -4, -7, 3, -4, -3, 3, -5, 0, -5, 0, -1, -7,-16, -5, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='N'; M= -1, 5,-14, 1, -3, -3, -5,-11, -3, 0, -2, -2, 9,-13, -5, -7, -1, -1, -6,-21, -6, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='K'; M= -1, 2,-16, 2, 3,-11,-10, -7, -5, 6, -4, 2, 2, -5, -4, -5, -2, -2, -6,-20, -5, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='E'; M= -1, -2,-13, -4, 2,-11, -8, -8, -3, 1, -3, -3, 0, 0, -3,-10, -1, 1, -6,-20, -8, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='K'; M= 3, 1,-15, 0, 3,-11,-11, -8, -4, 4, -6, 1, 4, -8, -1, -5, 2, 2, -5,-25, -9, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='N'; M= -1, 11,-18, 9, 8,-17, -5, -8,-13, 9,-13, -2, 15, -5, -2, -6, 1, -4,-17,-28,-15, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-5; /M: SY='I'; M= -1, -3,-17, -8,-11, 0,-13,-14, 12, -9, 9, 3, 0,-19,-12,-16, -4, 3, 7,-29, -1,-12; /M: SY='N'; M= 2, 10,-16, 10, 8,-20, -9,-10,-13, 4,-11, -7, 12, -9, 3, -8, 4, 2,-14,-31,-16, 6; /M: SY='E'; M= -1, 9,-19, 9, 10,-20, -9, -6,-15, 9,-11, -2, 10, -5, 1, -6, -1, -5,-17,-29,-14, 6; /M: SY='I'; M= -1,-11,-17,-16,-13, 3,-17,-16, 22,-10, 14, 7, -9,-21,-15,-16, -8, 2, 17,-25, 5,-14; /M: SY='L'; M= -6,-13,-15,-17,-14, 13,-20,-12, 18,-12, 20, 9,-12,-25,-17,-15,-12, -1, 14,-19, 14,-15; /M: SY='P'; M= -6, -2,-23, 3, 9,-20,-12, -3,-17, 7,-11,-11, -6, 21, 1, -5, -5, -5,-19,-23, -7, 4; /M: SY='G'; M= -2, -2,-21, -9,-11, -7, 10,-15, 3, -7, 2, 0, 2,-18,-11,-15, -5, -4, -7,-18, -8,-11; /M: SY='A'; M= 8, -2,-20, -3, -4, -8,-12,-15, 1, -2, -2, 0, 0,-15, -6,-10, 5, 8, 4,-31, -9, -6; /M: SY='N'; M= 1, 5,-19, 4, -2,-13,-11,-16, 0, 0, -4, -2, 7,-15, -5, -9, -1, 0, -1,-31,-10, -4; /M: SY='I'; M= -5,-17,-24,-24,-20, 9,-17,-15, 23,-12, 14, 3,-10,-21,-14,-16, -9, 2, 18,-17, 10,-20; /I: I=-9; MD=-13; /M: SY='L'; M= -4, -6,-15,-12,-13, 9,-12,-11, 9, -8, 10, 2, -1,-18,-13,-13, -4, 3, 6,-19, 6,-14; D=-9; /I: I=-9; MD=-13; /M: SY='P'; M= 0, -4,-15, -2, 7,-18,-10, -3,-11, 5,-11, -8, -4, 14, 5, -2, -2, -2,-13,-20,-11, 4; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='N'; M= 2, 3,-17, 0, -3,-10, -4,-13, -3, 0, -5, -2, 8,-10, -4, -9, 2, 3, -5,-25,-11, -4; D=-9; /I: I=-9; DM=-13; /M: SY='I'; M= 1,-10,-23,-15,-13, 5,-16,-13, 11, -6, 7, 5, -4,-19,-10,-11, -4, 3, 11,-24, 3,-13; /M: SY='N'; M= 0, 7,-11, 6, 1,-17, -9,-13, -5, -1, -5, -5, 11,-13, -6,-12, 0, 0, -8,-33,-15, -3; /M: SY='L'; M= -5, -7,-23, -9, -6, -3,-12, -9, 3, -1, 4, 2, -4,-15, -9, -9, -6, -5, 1,-17, 3, -8; /M: SY='Y'; M= -7, 1,-27, 2, -1, -6,-15, -3, -9, 2, -2, -1, 2,-10, -6, -7, -2, -3, -8,-20, 4, -4; /M: SY='N'; M= -3, 5,-19, 2, -2, -8,-10,-10, -4, 0, -2, -1, 9,-14, -6, -9, -4, -2, -7,-28, -6, -5; /M: SY='N'; M= -3, 9,-24, 9, -2,-12, -9, -8,-11, 0, -8, -8, 12,-11, -7,-12, 4, 3,-11,-29, -7, -6; /M: SY='N'; M= -1, 0,-24, -3, -6, -6, -8,-12, -8, 2, -7, -3, 5,-12, -2, -2, 0, -2, -7,-24, -8, -7; /I: I=-15; MD=-21; /M: SY='N'; M= -2, 1,-22, -4, -5, -5,-12, -8, -4, 1, -4, 0, 8,-10, -4, -8, -2, 2, -6,-28, -6, -6; D=-15; /I: I=-15; MD=-21; /M: SY='D'; M= -2, 7,-21, 10, 5,-14, -8, -8,-14, 6, -9, -3, 7, -7, 0, -2, -2, -6,-13,-22, -8, 2; D=-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='N'; M= -4, -2,-22, -4, -7, -1,-12,-10, -2, 0, 1, 0, 2,-13, -7, -6, -3, -1, -2,-20, 2, -9; D=-15; /I: I=-15; DM=-21; /M: SY='G'; M= -3, -2,-27, -4, -8, -7, 4,-15, -6, 0, -5, -5, 1,-12, -9,-10, 1, -1, -8,-13, -2, -9; D=-15; /I: I=-15; DM=-21; /M: SY='I'; M= 0, -8,-22,-11, -8, -6,-14, -8, 5, -6, 2, -2, -5,-11, -7,-13, 0, 5, 4,-24, -1, -9; /M: SY='F'; M= 0, -9,-25,-12,-12, 5,-14,-11, 1, -5, 1, -2, -5,-17, -7, -5, 3, 2, 4,-21, 1,-12; /M: SY='Y'; M=-10,-15,-30,-12,-12, 8,-18,-11, 2, -7, 11, -3,-15,-17, -6, -6, -4, 0, 7, -2, 23,-12; /M: SY='F'; M= -7,-17,-20,-25,-22, 36,-20,-18, 13,-12, 21, 1,-12,-30,-20,-14, -9, -4, 13,-12, 18,-22; /M: SY='F'; M= -5,-15,-25,-20,-12, 7,-12,-11, 3, -4, 2, 0,-10,-16, -3, 0, -6, -7, 3,-10, 4,-11; /M: SY='I'; M= -1,-16,-18,-26,-23, 8,-14,-19, 35,-16, 18, 8, -7,-29,-20,-21, -9, 2, 27,-25, 3,-23; /M: SY='P'; M= -6,-15,-27, -9, 4,-30,-11, 4,-20, 5,-21,-29,-22, 74, -2,-12, -5, 4,-26,-31,-16, -3; /M: SY='P'; M= -4, -8,-25, -6, 3,-22, -8, 0,-16, 4,-15,-19,-10, 40, -1,-10, -4, 0,-22,-27,-13, -2; /M: SY='Y'; M=-10, -7,-32, -3, -9, 4,-17, -9, -4, -3, 5, -4, -9,-15,-10, -7, -2, 0, 2, -8, 19,-12; /M: SY='I'; M= -1,-15,-23,-23,-23, 12,-19,-17, 25,-12, 11, 2, -6,-28,-20,-15, -7, 2, 23,-23, 5,-23; /M: SY='K'; M= -2, 0,-23, 2, 4,-15,-10, -5,-11, 6, -8, -2, 0, -1, -2, -4, -1, -3,-12,-25, -7, 0; /M: SY='K'; M= 0, 4,-20, 5, 10,-18,-12, -8,-15, 12,-11, 1, 5, -3, 4, -1, 1, -3,-15,-27,-12, 7; /I: I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='D'; M= 2, 21,-21, 31, 8,-28,-10, -9,-19, 2,-11,-12, 13, -8, -2,-11, 4, -1,-15,-37,-16, 3; /I: I=-19; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='I'; M= -1,-13,-21,-17,-10, 0,-15,-13, 13, -4, 9, 8, -8,-16, -8,-10, -7, 0, 9,-20, 3,-10; /M: SY='H'; M= -1, -1,-22, -4, 0,-14,-13, 6, -8, -1, -6, -1, 5, -6, -2,-11, 4, 4,-10,-32, -9, -1; /M: SY='F'; M=-13,-25,-24,-42,-34, 62,-24,-25, 19,-14, 22, -7, -9,-36,-26,-16,-11,-12, 19, -5, 19,-34; /M: SY='S'; M= -3, -9,-24,-10, -4, 2,-15, -8, -4, -1, 0, -5, -6,-14, -5, -7, 5, 2, -2,-15, 4, -7; /M: SY='C'; M=-23,-20,113,-30, -1,-11,-34,-41, -5,-26, 7,-12,-10,-31,-21,-19,-18,-15, -7,-19,-37, -8; /M: SY='I'; M= -1, -8,-21,-12, -5, -2,-12,-11, 2, -1, 0, 0, -3,-14, -4, -9, 1, 2, 1,-21, -2, -6; /M: SY='C'; M=-28,-21,146,-32, 5,-18,-38,-47,-16,-28, 2,-19,-10,-30,-20,-19,-19,-19,-16,-18,-51, -4; /M: SY='D'; M= -2, 11,-22, 13, -2,-16,-11,-13, -8, 0, -6, -7, 13,-14, -4, -9, -1, 1, -7,-30, -7, -4; /M: SY='N'; M= -2, 12,-21, 3, -6, -9, -6, -9, -4, 0, -8, 0, 26,-19, -7,-10, -1, 2,-10,-36,-13, -8; /M: SY='D'; M= 1, 5,-22, 7, 3,-17, -7,-12,-13, 5,-12, -8, 3, -3, -4, -6, 7, 3,-12,-27,-12, -2; /M: SY='K'; M= -1, 4,-22, 7, 7,-17, -7,-11,-13, 8, -8, -1, 1, -4, 1, -4, -2, -4,-14,-22, -7, 4; /M: SY='K'; M= 2, 3,-23, 2, 1,-18, -5,-16,-10, 6,-10, -4, 4, -2, -3,-10, 6, 6,-10,-27,-12, -1; /M: SY='K'; M= 1, 1,-19, -3, 0,-12,-11,-13, -3, 4, -5, 1, 4, -7, -2, -9, 1, 4, -6,-29,-10, -2; /I: I=-10; MD=-14; /M: SY='K'; M= -2, -1,-18, -2, -1, -8, -6, -8, -4, 3, -4, 0, 2, -9, -5, -5, 0, -2, -5,-14, -4, -3; D=-10; /I: I=-10; MD=-14; /M: SY='K'; M= 0, 1,-16, 2, 3,-10, -4, -7, -7, 5, -6, -1, 2, -4, -3, -5, 1, -2, -7,-15, -6, 0; D=-10; /I: I=-10; MD=-14; /M: SY='N'; M= 1, 2,-12, -4, -4, -7, -5, -7, 4, 1, -2, 3, 10,-11, -3, -7, -3, 1, -2,-21, -8, -4; D=-10; /I: I=-10; MD=-14; /M: SY='N'; M= -1, 1,-13, -3, -4, -3, -5, -8, -1, 1, -3, 0, 7, -7, -3, -4, -1, 2, -2,-16, -4, -4; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='G'; M= 0, -4,-20, -9,-11, -9, 20,-13, 1, -6, -4, -6, -2, -9,-11,-12, 0, -4, -6, -5, -9,-11; D=-10; /I: I=-10; DM=-14; /M: SY='N'; M= 1, 2,-24, -4, -9, -9, -3,-18, 4, -1, -5, -1, 9,-16, -7,-10, -1, 2, -1,-27,-10,-10; /M: SY='I'; M= 1, -7,-20,-12, -9, -1,-15,-17, 6, 0, 0, 3, -2,-12, -9, -7, -3, 3, 6,-27, -4,-10; /M: SY='G'; M= 3, -3,-31, -8,-10,-18, 23,-13, -5, -4,-10, -5, -1, -8, -9,-12, -1, -7,-13,-15,-17,-11; /M: SY='I'; M= 0,-11,-20,-17,-14, -2,-16,-14, 17, -8, 10, 5, -6,-18,-11,-16, -2, 7, 15,-26, 1,-14; /M: SY='I'; M= 2,-15,-21,-21,-20, 3,-14,-15, 27,-11, 16, 11, -8,-30,-18,-15,-11, 1, 22,-23, 4,-21; /M: SY='K'; M= -6, -2,-25, -2, 8, -8,-16, 2,-15, 10, -8, 2, 0, -5, 1, 1, -2, -7,-14,-18, 0, 4; /M: SY='I'; M= 2,-15,-19,-25,-21, 3,-15,-18, 35,-15, 14, 7, -6,-28,-18,-19, -9, 2, 28,-27, -1,-21; /M: SY='H'; M= -2, -2,-24, -4, -1, -7,-14, 6, -6, -2, -6, -2, 3,-10, -5, -9, 0, -2, -8,-29, -6, -4; /M: SY='I'; M= -4,-17,-21,-24,-21, 14,-19,-18, 26,-13, 16, 3,-11,-27,-19,-15, -9, 0, 23,-18, 10,-22; /M: SY='K'; M= 2, 5,-18, 5, 9,-17, -9, -9,-15, 10,-15, -6, 7, 1, 0, -4, 7, 1,-16,-30,-17, 4; /M: SY='K'; M= 2, 1,-25, 1, 10,-17, -9,-10,-16, 17,-17, 1, 3, 6, 4, 2, 3, -2,-17,-27,-15, 5; /M: SY='N'; M= -2, 5,-22, 3, -1,-12, -6,-10,-11, 2, -9, -4, 10,-10, 0, -3, 0, -2,-13,-25, -9, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 81 in 21 different sequences |
| Number of true positive hits | 81 in 21 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 14 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | 6-Cys |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
21 sequences
P230P_PLAF7 (O96175), P230P_PLAFO (W7K265), P230_PLAF7 (P68874), P230_PLAFO (P68875), P4548_PLABA (Q4YSU6), P4548_PLAF7 (Q8I6T1), PF12P_PLABA (Q4Z5T0), PF12P_PLAF7 (C6KSX1), PF12_PLAF7 (C6KSX0), PF12_PLAFA (P19259), PF36P_PLABA (Q4Z4D2), PF36P_PLAF7 (Q8I1Y4), PF36P_PLAYO (Q7K5V2), PF36_PLABA (Q4Z4D1), PF36_PLAF7 (Q8I1Y5), PF36_PLAYO (Q7RPW4), PF38_PLAF7 (Q8I423), PF41_PLAF7 (Q8I1Y0), PF92_PLAF7 (Q8ID66), PFS47_PLABA (Q9BMP8), PFS47_PLAF7 (Q8IDN0)» more
|
| PDB [Detailed view] |
38 PDB
2LOE; 2YMO; 4YS4; 6E62; 6E63; 6H5N; 6OHG; 7JUM; 7KJ7; 7KJH; 7KJI; 7S7Q; 7S7R; 7U9E; 7U9W; 7UA2; 7UA8; 7UBS; 7UC8; 7UCQ; 7UFW; 7UI1; 7UNB; 7USR; 7USS; 7UST; 7USV; 7UVH; 7UVI; 7UVO; 7UVQ; 7UVS; 7UXL; 7ZWF; 7ZWI; 7ZWM; 7ZXF; 7ZXG » more |