Home  |  Contact
Entry: PS51766

General information about the entry

Entry name [info] DOCKERIN
Accession [info] PS51766
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JUN-2015 CREATED;
01-JUN-2015 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51766
Associated ProRule [info] PRU01102

Name and characterization of the entry

Description [info] Dockerin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5402966; R2=0.0211013; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-21,-12, -9,-23,-19,-17,-12,-10,-17,-15,-11, 14, -9,-16, -4, -7,-10,-32,-20,-10;
/M: SY='T';  M= -6, -8,-21, -7, -3,-20,-19,-15, -8, -4,-12, -5, -8,-14, -2,-11, -3,  1, -4,-30,-18, -3;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-14,-29,-23,  3,-31,-21, 16,-21,  9, 11,-25,-26,-17,-23,-16, -5, 15,-18, -3,-21;
/M: SY='I';  M=-12,-27,-16,-30,-21, -7,-31,-24,  7,-14,  3,  1,-27,-25,-15,-19,-19, -8,  7, -2, -7,-18;
/M: SY='Y';  M=-11,-29,-15,-31,-21, 11,-28,  0, -3,-19, -3, -4,-24,-27,-17,-19,-18,-15, -3,  6, 30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20,  0,-20,  0,-10,-30,-50,-30, 10;
/M: SY='V';  M= -2,-30, -5,-31,-28, -7,-30,-27, 22,-22, 11, 11,-29,-23,-20,-27,-18, -4, 26,-25, -8,-23;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='N';  M=-16, 21,-27, 10, -2,-28,-13,  1,-21, -4,-32,-17, 39,-19, -3, -7,  5,  2,-19,-39,-20, -2;
/M: SY='G';  M= -5, -3,-18, -6, -8,-22, 11,-10,-28, -9,-30,-20, -1,-19, -4,-12,  2,-11,-23,-27,-19, -8;
/M: SY='D';  M=-20, 39,-39, 57, 19,-39,-10, -9,-30, -9,-40,-29, 13,-20,  0,-19,  1, -9,-30,-49,-29,  9;
/M: SY='G';  M= -4, -3,-29, -8,-14,-27, 37,-14,-35,-10,-37,-26,  2,-19,-14,-13,  2,-15,-28,-30,-25,-14;
/M: SY='S';  M=  2,  0,-20, -7, -3,-25, -5, -8,-22,  5,-27,-16,  9,-14,  0,  0, 10,  0,-16,-32,-20, -2;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 33,-24, 15, 10,-30,-24,-23,-30,-20, -4, 35,-26,-10,-24;
/M: SY='N';  M=-19, 30,-33, 18,  4,-32,-11,  5,-30, -1,-39,-22, 46,-20,  1,  0,  7, -3,-30,-41,-22,  2;
/M: SY='S';  M=  4,-15, -9,-15,-12,-13,-14,-18, -3,-12, -7, -3,-10,-17, -8,-15, 12,  1, -4,-26,-16,-12;
/M: SY='T';  M= -6, -8,-15, -8, -8,-18,-21,-17, -5,-11, -8, -7, -2,-17, -9,-13,  3, 16, -3,-30,-18, -8;
/M: SY='D';  M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20,  0,-20,  0,-10,-30,-50,-30, 10;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-12,-31,-24,  8,-27,-16, 10,-22,  4,  2,-28,-25,-20,-23,-16, -9, 11,-12,  9,-22;
/M: SY='V';  M=  6,-23,-10,-23,-19,-13,-15,-24,  4,-18,  0,  3,-21,-19,-15,-18, -6,  4,  9,-27,-16,-18;
/M: SY='M';  M= -7,-23,-19,-22,-10, -4,-23,-16, -1,-16,  1,  3,-23,-23,-10,-15,-14,-10, -2,-16, -4,-11;
/M: SY='L';  M=-14,-34,-12,-34,-28, -1,-37,-28, 24,-27, 28, 25,-32,-29,-19,-24,-24, -9, 18,-21,-10,-27;
/M: SY='K';  M= -8, -8,-21,-16,  0,-25,-21,-11,-21, 26,-20,-12, -5,-16,  4, 16, -3, -9,-16,-28,-19,  0;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-36, -9,  7,-31,-19, -2,-30, 26,-24,-18,  1,-16, 16, 37, -5,-10,-26,-30,-21,  7;
/M: SY='Y';  M=-11,-28,-11,-30,-22, 19,-26,  4, -6,-21, -9, -9,-22,-28,-20,-22,-15,-16, -7,  9, 37,-21;
/M: SY='I';  M=-14,-34,-12,-36,-30,  9,-36,-26, 23,-28, 22, 12,-34,-30,-24,-26,-24,-10, 17,-16, -3,-28;
/M: SY='L';  M=-12,-25,-14,-28,-23, -8,-26,-23,  8,-21, 15,  9,-21,-26,-16,-17,-18, -8,  3,-24,-14,-22;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-26,-10, -5,-28,  6,-12,-28,  7,-29,-21,  2,-15, -4,  4,  2, -3,-21,-31,-23, -5;
/M: SY='S';  M= -2,-11,-19,-14, -8,-19,-15,-14,-10, -5,-13, -5, -5,-11, -5, -7,  2,  0, -8,-29,-18, -8;
/M: SY='I';  M= -6,-14,-16,-16,-16,-15,-22,-20,  6,-14, -5, -5,-11,-16,-16,-18, -6, -2,  5,-28,-16,-16;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N';  M= -2,  2,-23,  0,  3,-25, -3, -5,-24,  2,-27,-18,  5,-10, -1, -3,  5, -2,-19,-30,-19,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D';  M= -9, 12,-21, 19, 12,-17, -9, -2,-17, -3,-21,-15,  4,-11,  1, -8,  2, -4,-16,-22, -9,  7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='F';  M= -7,-18,-11,-19,-15,  3,-16,-11,  0,-14,  0, -2,-16,-16,-13,-14, -8, -4, -1,-10,  2,-15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -2,  0,-20,  2,  8,-23, -6, -8,-20, -2,-23,-17, -1,  6,  1, -8,  6, -1,-17,-26,-18,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='T';  M= -4, -7,-14, -8, -9,-10,-14, -6, -4,-10,-11, -8, -2,-16,-10,-12, -1,  1, -3,-19, -4,-10; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='N';  M= -7,  9,-22,  9, -2,-23,  6, -6,-22, -7,-27,-18, 11, -8, -5,-10,  3, -4,-19,-28,-19, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='M';  M= -9,-23,-17,-24,-15,-11,-29,-20,  6, -7,  8, 12,-21,-20, -4,-12,-15, -5,  9,-24,-13,-12; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K';  M=  1, -8,-20, -8,  0,-22,-17,-15,-13,  7,-18,-11,-12,-15, -1, -5, -4, -7, -8,-25,-17,  0;
/M: SY='A';  M= 10, -1,-17, -6, -1,-25, -3, -9,-19, -5,-27,-15,  7,-14, -4, -5,  6, -3,-14,-33,-20, -2;
/M: SY='A';  M= 19,-23, -8,-23,-16,-17,  2,-22, -9,-16,-10, -7,-23,-16,-14,-14, -1, -6, -3,-28,-20,-16;
/M: SY='D';  M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20,  0,-20,  0,-10,-30,-50,-30, 10;
/M: SY='V';  M= -6,-32,-10,-32,-29, -7,-33,-29, 26,-23, 17, 13,-31,-23,-20,-27,-21, -1, 30,-27,-10,-23;
/M: SY='N';  M=-19, 26,-23, 18,  1,-30,-12,  2,-28, -6,-37,-22, 38,-21, -3, -9,  5, -4,-28,-39,-19, -1;
/M: SY='R';  M= -2,-11,-28,-12, -5,-25,  2,-13,-23, -1,-21,-13, -9,-18, -3,  6, -5,-11,-19,-29,-21, -5;
/M: SY='D';  M=-19, 33,-36, 40, 13,-35,-10,  2,-30, -7,-39,-26, 23,-20,  1,-13,  3, -7,-30,-45,-23,  6;
/M: SY='G';  M= -3, -5,-30, -7,-15,-30, 49,-16,-39,-17,-40,-29, -2,-20,-16,-17,  1,-17,-30,-31,-29,-16;
/M: SY='S';  M=  2, -3,-21, -8,  0,-24,-12, -8,-19,  7,-23,-12,  6,-14,  3,  5,  8, -1,-15,-31,-19,  0;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-10,-31,-29, -1,-36,-29, 32,-26, 16, 10,-30,-27,-25,-29,-20, -6, 29,-22, -8,-26;
/M: SY='N';  M=-15, 23,-28, 14,  3,-30,-11,  1,-27,  1,-35,-20, 39,-18,  0, -4, 10,  4,-25,-39,-22,  1;
/M: SY='S';  M=  3, -8,-13, -6, -3,-17,-11,-14,-10, -7,-15, -8, -4,-15, -4,-13, 17,  2,-11,-28,-18, -4;
/M: SY='T';  M= -9, -5,-19, -4, -5,-13,-21,-14, -8,-12,-12, -9, -3,-18, -6,-14,  0, 12, -7,-27,-14, -6;
/M: SY='D';  M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20,  0,-20,  0,-10,-30,-50,-30, 10;
/M: SY='I';  M= -4,-31, -7,-32,-25,  4,-29,-21, 11,-24, 11, 10,-29,-27,-19,-23,-17, -9,  9,-16, -1,-24;
/M: SY='A';  M= 10,-20,-10,-21,-16,-13,-15,-19,  0,-14, -5,  6,-15,-18,-10,-16, -2,  3,  6,-27,-14,-14;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-12,-29,-25,  1,-32,-20, 18,-24, 11,  6,-26,-27,-21,-24,-15, -8, 13,-12,  1,-24;
/M: SY='L';  M=-12,-35,-12,-35,-28, -3,-36,-28, 23,-26, 27, 23,-33,-27,-18,-24,-25, -7, 20,-23,-10,-26;
/M: SY='K';  M= -7, -4,-28,-12,  3,-25,-19,  0,-24, 23,-24,-16,  0,-14,  9, 18, -1, -9,-19,-28,-16,  4;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-36,-10,  6,-31,-19, -3,-30, 27,-24,-19,  1,-16, 14, 37, -5,-10,-26,-30,-21,  7;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-22,-27,-16, 20,-28, 28,-15,-16,-15,-13,-15,-28,-13,-16,-18,-20,-15, 15, 55,-16;
/M: SY='L';  M=-14,-34,-13,-36,-29,  9,-35,-25, 19,-27, 23, 17,-34,-30,-21,-25,-24,-10, 14,-16, -3,-27;
/M: SY='L';  M=-17,-28,-14,-30,-25, -6,-30,-24, 13,-25, 22, 12,-23,-28,-18,-19,-21, -9,  5,-23,-12,-25;
/M: SY='R';  M= -2, -8,-29,-14, -4,-28,  4, -7,-30, 13,-29,-21, -5,-16, -1, 15, -2,-12,-23,-30,-21, -4;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='M';  M=  1,-19,-13,-20,-13,-12,-20,-20,  3,-11, -1,  6,-15,-19, -9,-14, -5,  0,  5,-26,-15,-13; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='I';  M= -6,-25,-11,-25,-24, -6,-32,-26, 26,-23,  9,  3,-23,-19,-23,-26,-11, -6, 20,-23,-12,-23; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='S';  M=  0,  2,-19,  4,  4,-18, -7, -9,-20, -2,-26,-18,  4,-13, -1, -8, 20,  6,-20,-29,-17,  2; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E';  M= -9,  3,-30,  5, 16,-27,-18, -8,-23, 15,-23,-16, -1,-13,  9,  4,  1, -6,-20,-30,-20, 13; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-19,-34,-16,-38,-28, 28,-34,-13,  8,-28, 15,  6,-32,-34,-24,-24,-24,-16,  0, -2, 20,-28;
/M: SY='P';  M=-10,-15,-31,-14, -8,-40,-16,-19,-30,-10,-31,-30,-17, 69,-10,-20, -9,-10,-21,-40,-30, -9;
/M: SY='V';  M=  0,-17,-17,-17,-10,-11,-18, -8, -2,-10,-11, -6,-16,-18, -8,-15, -6, -7,  2,-21, -3, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 31 in 31 different sequences
Number of true positive hits 31 in 31 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Dockerin
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
31 sequences

CELE_HUNT2  (P10477    ), CELK_HUNT2  (A3DCH1    ), CELK_HUNTH  (P0C2S1    ), 
CESA_RUMFL  (Q9RLB8    ), CIPA_HUNT2  (Q06851    ), CIPB_HUNTH  (Q01866    ), 
GUB_HUNT2   (A3DBX3    ), GUB_HUNTH   (Q84C00    ), GUN2_RUMJO  (P37701    ), 
GUNA_HUNT2  (A3DC29    ), GUNA_RUMCH  (P17901    ), GUNB_CLOC7  (P28621    ), 
GUNB_HUNT2  (P04956    ), GUNC_RUMCH  (P37699    ), GUND_HUNT2  (A3DDN1    ), 
GUND_HUNTH  (P0C2S4    ), GUND_RUMCH  (P25472    ), GUNF_HUNT2  (P26224    ), 
GUNF_RUMCH  (P37698    ), GUNG_HUNT2  (Q05332    ), GUNG_RUMCH  (P37700    ), 
GUNH_HUNT2  (P16218    ), GUNS_HUNT2  (A3DH67    ), GUNS_HUNTH  (P0C2S5    ), 
GUNX_HUNTH  (P15329    ), NAGH_CLOPE  (P26831    ), XG74_HUNT2  (A3DFA0    ), 
XG74_HUNTH  (Q70DK5    ), XYND_RUMFL  (Q53317    ), XYNY_HUNTH  (P51584    ), 
XYNZ_HUNT2  (P10478    )
» more

PDB
[Detailed view]
16 PDB

1CLC; 1DAQ; 1DAV; 1OHZ; 2B59; 2CCL; 2JNK; 2MTE; 2OZN; 2VN5; 2VN6; 3KCP; 4CJ0; 4CJ1; 4FL4; 5G5D
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission