PROSITE entry PS51783
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PH_BEACH |
| Accession [info] | PS51783 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2015 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51783 |
| Associated ProRule [info] | PRU01119 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | BEACH-type PH domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=112; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8899282; R2=0.0089896; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16223.0937500; R2=6.5016427; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=958; H_SCORE=22452; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=513; H_SCORE=19558; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-19; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='E'; M=-12,-43, 14, 47,-29,-42, 8,-38, 7,-17,-25, 15,-10, 18, 4, 23,-11,-16,-76, 0; /M: SY='P'; M=-14,-17, 3, 28, 1,-23, 13,-17, -2, 10,-14,-13, 39, 9,-10, 0, -7, -8,-76,-32; /M: SY='G'; M= -9,-32, 21, 15,-58, 40, 18,-49, 16,-46,-66, 21,-27,-16, -6, 18, 8,-30,-78,-12; /M: SY='D'; M=-33,-28, 59, 59,-40, 7,-26,-34, 4,-38,-43, -4,-36, 14,-16, 3,-14,-62,-82,-68; /M: SY='K'; M=-20,-27,-19, 11,-35,-29, -3,-17, 37,-20, 12, -4, 11, 28, 17, 11, 13, -2,-39,-43; /M: SY='I'; M=-22,-39,-58,-20, -7,-42,-36, 65,-44, 3,-19,-26, 7,-21,-60,-17, -4, 43,-77,-59; /M: SY='Q'; M=-24,-23, -4, 6,-28,-48, 3, 8, -1, 18,-21, 6,-34, 29, 0, 3, -1, 27,-31,-23; /M: SY='F'; M= -6, -2,-15, -6, 35,-29, 22, -3,-24, 26, 8,-17,-74, 0, 0, -8,-14,-10, 20, 21; /M: SY='S'; M=-11, -4, 2, 20,-39,-46, -9, 13, -7,-31, 8,-11,-25, 6, -6, 41, 23, 13,-80,-48; /M: SY='W'; M= -5, 54,-61,-14, 31,-53, 11, -8,-40, -3, -1,-33,-44,-22,-46,-18, 26, 17, 77, 28; /M: SY='N'; M=-14,-29, 3, 13,-50,-63, 7,-53, 9,-41,-65, 62, 43, 4, 26, 11, 5,-53,-16,-38; /M: SY='C'; M= 36,116,-75,-49,-66,-26,-47, -9,-58,-23,-40,-66,-63,-71,-75,-16,-12, 29,-87,-71; /M: SY='Q'; M= -2,-23, 10, 30,-38,-37, 0,-20, -6,-35,-11, -3,-48, 44, 6, 32, 7, 5,-36,-31; /M: SY='M'; M=-52,-40,-70,-19,-21,-48,-21, 4, -1, 37, 54,-31,-32, 14, 52,-24,-52,-20, 41,-12; /M: SY='I'; M=-45,-29,-81,-77,-52,-84,-81, 72,-38, -3,-40,-56,-59,-43,-59,-44,-37, 70,-79,-42; /M: SY='T'; M= 9, 13,-32,-20,-37,-41,-12, -6, -4, -8, 5,-13,-53,-10, -4, 23, 53, 11, -1,-12; /M: SY='P'; M=-12,-51,-27,-27,-52, 47, -4,-42,-45,-15,-33,-34, 87,-11,-39, -9,-37,-41,-77,-54; /M: SY='M'; M=-29,-36,-28, -8, -8, -6,-13,-11, 0, 51, 54,-47,-47,-12,-21,-12,-14, -6,-40,-35; /M: SY='D'; M=-20, -6, 43, 14,-31, 11, 2, -8, -3,-19,-13,-13,-54,-18, 19, -5,-11, 19,-31, -8; /M: SY='V'; M= 15,-19,-46, 13,-32,-39,-65, 17, 13,-13,-31, -5, 3,-14, 7, 12, 6, 30,-78,-39; /M: SY='V'; M=-17, 25,-57,-37, -8,-44, -3, 29,-13, 2, 6, 11,-53,-17, 3, -4, 13, 29, 7, 23; /M: SY='P'; M= -3,-80, 4, 49,-42,-59, 15,-39, 15,-38,-41,-28, 67, 16, 17,-29,-35,-44,-31,-24; /M: SY='G'; M=-44, -6,-53,-42,-80, 97,-70,-41,-40,-82,-73,-51,-68,-65,-74,-12,-65,-59,-74,-59; /M: SY='R'; M=-49, -4, -8, 11,-40,-49, 0, 23, 1, 11, 9,-14,-70, -1, 34,-21, 30, 14,-35,-30; /M: SY='L'; M=-54,-25,-62,-60, 39,-60,-70, 21,-60, 68, 27,-58,-81,-72,-57,-61,-61, 15, -8,-48; /M: SY='I'; M=-22,-12,-32, -1,-21,-62,-26, 42,-30, 31, 0,-33,-51, 7,-10, 23, -6, 0,-31, 6; /M: SY='I'; M=-48,-72,-82,-77, 18,-84,-57, 63,-63, 47, 22,-60,-78,-42,-37,-51,-42, 36,-71,-41; /M: SY='T'; M=-28, 38,-20,-45,-16, 51,-31,-58,-50,-61,-12,-14,-25,-37,-33, 10, 70,-39,-79,-27; /M: SY='K'; M= -4,-54, 28, 17,-62,-44, 3,-55, 38,-47,-41, 34, 3, 24, 7, 23, 17,-62,-82,-66; /M: SY='T'; M=-16, -6, 11, 22,-18,-43, 18,-51, 21,-18,-26, 23,-56, 9, 7, 26, 36,-34,-12,-25; /M: SY='H'; M=-19, 32,-16, 19, -9,-24, 72,-47,-15,-48,-21, 30,-50,-32, 24, 27,-16,-47,-11, 27; /M: SY='L'; M=-27,-11,-61,-77, 27,-59,-41, 48,-76, 58, 2,-77,-79,-56,-76,-61,-38, 28,-71,-51; /M: SY='Y'; M=-39,-25,-68,-59, 5,-67, 39,-15,-63,-14, -3,-15,-61,-25,-27, -5,-23,-10, 3,108; /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51; /M: SY='F'; M=-56,-45,-66,-63,111,-82,-44,-18,-76, -6,-31,-75,-84,-82,-65,-59,-45,-21, -5, 24; /M: SY='Q'; M=-36,-47, 4, 31, 16,-43, -1, 21,-23,-23, 7,-28,-69, 50,-18,-15, 12, 11, -8, 21; /M: SY='P'; M= 11,-32, 0, -6,-31,-15,-13, 0,-24,-17, -6,-40, 63, 15,-23, 16,-29, 11,-13,-24; /M: SY='D'; M=-23,-24, 61, 9,-14,-18,-11,-22,-22, -1,-17, 20,-24,-14, -7, 19, 11,-48,-79, 2; /M: SY='N'; M=-20, 5, 23, 39,-24,-12, 2,-19, 0,-54,-65, 40, 14, 2, 2, 15, -9,-42,-45, 4; /M: SY='D'; M= -8,-48, 44, 16,-24, -5, 4,-21,-16,-27,-31, 28,-17, -2,-24, 29, 10,-23,-78, 8; /M: SY='N'; M=-25,-24, 23, 16, -5, 21, 0, 3, -6,-28,-26, 27,-52, 13,-15, 12, -5,-15,-75, 8; /M: SY='P'; M=-18,-14, 30, 37,-75,-11,-17,-22,-12,-34,-32, 10, 46, 14,-25, 22, 2,-18,-83,-69; /I: I=-6; MD=-15; /M: SY='V'; M=-11,-77, -2, 13,-51,-30,-20, 20,-10,-19,-17, -4, -9,-39,-18, 13, 4, 23,-86,-69; D=-6; /I: I=-6; MD=-15; /M: SY='F'; M=-32, -9,-21,-24, 11,-37, -2, 7,-50,-16,-35, 6,-29,-34,-23, -1, 0, 7,-85, -7; D=-6; /I: I=-6; MD=-15; /M: SY='E'; M=-23, 2, 18, 24,-27,-27,-39,-49, 18,-54,-53, 7,-20,-19, -6,-22,-30,-31,-45,-79; D=-6; /I: I=-6; MD=-15; /M: SY='K'; M= -9,-91,-21,-14,-19,-49,-12,-14, 20,-37,-52,-12,-55,-26, 8,-11,-32,-22, 5,-77; D=-6; /I: I=-6; MD=-15; /M: SY='W'; M=-61,-48,-26,-11,-76,-25, -6,-38,-18,-29,-27, 0,-45,-20,-35,-18,-59,-33, 22,-59; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='I'; M=-17,-92,-37,-62,-34,-51,-39, 22,-31,-14, 1,-21,-56,-22,-33,-10,-25, 0,-20,-79; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='D'; M=-53,-35, 26,-29,-36,-11,-23,-56,-34,-73,-63, 14,-21, 6,-23, 18,-11,-39,-99,-34; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='P'; M=-12,-49, -3,-33,-53, -1,-52,-45, 0,-77,-39,-11, 23,-10,-32, 13, 9,-38,-46,-46; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='K'; M=-50,-51, -6, 9,-36,-29,-16,-47, 18,-47, -6, -3,-14, 9, 11, 1, -4,-47,-93,-78; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='V'; M= -6,-21,-36,-29,-26,-43,-53, 5,-31, 4,-15, -9,-18, 0,-41,-14,-17, 13,-46,-23; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='L'; M=-35,-87, -1, -3,-16,-27,-30, 7,-12, 13,-24,-22,-24, -5,-20,-12,-37,-14, 7,-44; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='A'; M= 11,-28,-25,-10,-30, 4,-37,-23, 1,-29,-72, -3, 2, -1,-20, 9,-34,-24,-20,-55; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='Y'; M=-29,-19, 10, 5,-46,-49, 24,-21, 4,-11,-46,-21,-15, -9,-18, 2,-21,-54,-35, 38; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='S'; M=-26, 12, -5,-28,-32, -4,-72, -7,-20,-12, 11, 1, -5,-21,-27, 20, 14,-13,-45,-36; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='E'; M=-32,-52, 28, 38,-62,-14,-35,-49, 18,-42,-40,-15, -3, 21,-11, 24,-23,-33,-86,-45; D=-6; /I: I=-6; DM=-15; /M: SY='G'; M=-18,-48, 10,-19,-43, 36, 30,-27, 17,-44,-44, 25, 28, 19, -3, 4, -9,-33,-33,-20; /M: SY='P'; M= 13,-51,-14, -4,-27,-34, 15, 10, 10, 12,-13,-22, 41, 11,-23, -1, -6, -1,-77,-39; /M: SY='H'; M=-27,-10, -7, 6,-22,-21, 64, 0,-20,-25,-11, -9, -4,-13, -5, 21, 7, 22,-24, 5; /M: SY='G'; M=-31, -1,-15, -8, 15, 24, 4, -3, 13, -1, -1, -1,-48, -3, -4, 6,-10, 2, -8, 3; /M: SY='K'; M=-49,-11, -1, 9,-41,-45, 6,-56, 57,-30,-33, -4,-33, 29, 44, 9, 0,-37,-28,-33; /I: I=-17; MD=-44; /M: SY='K'; M=-53,-14,-20,-11, 5,-26,-15,-23, 6,-30,-77,-33,-45,-10, 0, -6,-29,-27, -2,-50; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-44; IM=0; DM=-44; /M: SY='R'; M=-54,-32,-90,-27,-51,-70,-13,-32, -3,-62,-88,-29,-99,-41, 26, -9,-19,-28,-33,-59; D=-17; /I: I=-17; DM=-44; /M: SY='W'; M=-61,-23,-59,-65, 31,-67,-29, 20,-71, -5,-58,-84,-51,-50,-35,-76,-75,-45,154, 25; /M: SY='P'; M= 1,-75, 6, -2,-27,-39, -3,-57, 26, -9,-32, 16, 61,-10, -1, 25,-12,-32,-78,-40; /M: SY='Y'; M=-56,-45,-78,-74, 32,-81, 12, 29,-41, 52, 9,-41,-62,-67,-33,-35,-44,-11, 39, 59; /M: SY='S'; M= -4,-26, 26, 32,-41,-19, 20,-61, 16,-55,-50, 12,-46, 6, 0, 49, 11,-49,-81,-32; /M: SY='D'; M=-42,-76, 66, 44,-78,-34, 12,-48, 15,-75,-27, 8,-64, 36,-23, 30, -9,-73,-84,-30; /M: SY='I'; M=-62,-24,-83,-79,-48,-67,-78, 77,-76, 39, 14,-76,-77,-73,-78,-52,-16, 40,-76,-57; /M: SY='R'; M= -1,-29,-42,-21,-43,-47, 24, -4, 40,-28,-28,-27,-69, -4, 55, -6, 19, 12,-29,-33; /M: SY='E'; M= 28,-35,-14, 55, -7, -9, 34,-52,-16,-41,-45,-28,-66, 31, 9, 13,-36,-52,-11, 2; /M: SY='V'; M=-36,-32,-81,-63, -3,-83,-78, 65,-73, 13, 3,-60,-76,-34,-52,-30,-32, 65,-76,-41; /M: SY='H'; M=-41,-75,-36,-16, 37,-72, 89,-11,-60, 0,-24,-35,-73, 4,-14, 13, -9,-16, 4, 55; /M: SY='K'; M=-35,-75,-42,-29, -4,-28,-10,-50, 61, 1,-59, 0, 1,-10, 35, 21,-26,-45, 39,-15; /M: SY='R'; M=-53,-37,-64,-53,-72,-66,-22,-47, 4,-37, -3,-57,-74,-43,107,-60,-13,-58,-75,-35; /M: SY='R'; M=-46,-35,-56,-37,-61,-64,-42,-54, -4,-36,-34,-33, 12, 0,101,-28,-19,-72, 18,-37; /M: SY='Y'; M=-56,-36,-61,-74, 71,-77, 35,-41,-59,-43,-52,-27,-82,-66,-66,-47,-53,-61, 47,108; /M: SY='L'; M=-35,-29,-69,-19,-39,-33,-62,-13,-43, 67, 29, 15,-48, 27, -3,-27,-44,-31,-74,-57; /M: SY='L'; M=-46, -9,-80,-74, 24,-59, 27,-38,-74, 79, 23,-52,-82,-47,-57,-42,-63,-44,-69,-21; /M: SY='R'; M=-63,-52,-34,-26,-63,-54,-34,-54, 26,-53,-30,-21,-51, 70, 87,-43,-30,-32,-75,-62; /M: SY='D'; M=-48,-52, 68, 11,-59,-48, 39,-76,-15,-56,-68, 33, 48, 18, 24,-44,-52,-52,-15, 10; /M: SY='T'; M=-37, 26,-63,-52,-62,-68,-67, 21,-30,-13,-41, 30,-70,-10,-38, 36, 48, 44,-41,-64; /M: SY='A'; M= 85,-40,-67,-63,-76, 40,-69,-69,-64,-59,-63,-59,-46,-60,-69, -7,-27,-49,-76,-72; /M: SY='L'; M=-55,-14,-83,-77, -2,-85,-72, 50,-76, 67, 28,-48,-80,-71,-55,-60,-36, 13,-72,-53; /M: SY='E'; M=-60,-81,-25,109,-51,-59,-54,-82,-22,-63,-71,-57,-56,-25,-51,-57,-45,-64,-79,-49; /M: SY='I'; M=-50,-43,-84,-79, 24,-85,-75, 72,-76, 41, 17,-50,-78,-43,-77,-72,-59, 31,-70,-18; /M: SY='F'; M=-61,-35,-84,-80,108,-54,-17,-11,-68, -6,-30,-74,-83,-64,-47,-48,-54,-29, 7, 30; /M: SY='F'; M=-49, 15,-23,-74, 81,-78,-31,-18,-72, 34, 51,-62,-60,-72,-72,-11, 8,-16, 5, -7; /M: SY='T'; M= 16,-46, 10, 3,-40,-41,-20, -4, 17, -9, -4, 16,-43, -2, -8, 20, 30, -3,-78,-17; /M: SY='D'; M=-50,-54, 84, 4,-79,-41, -1,-52,-23,-63,-52, 62,-67,-10,-11, 17,-10,-59,-92,-49; /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='G'; M=-33, -9,-55,-36,-75, 67, 4,-58, 0,-47,-25, 14,-61, 17, 42, -6,-30,-53,-76,-21; D=-12; /I: I=-12; DM=-30; /M: SY='R'; M= -8,-41,-25,-12,-48,-30,-30,-42, 29,-53,-31, 1, 4, 15, 48, 29, 33,-33, 14,-16; /M: SY='S'; M= -7,-12,-18,-31,-54,-56, -6,-69,-43,-62,-66, 59, 15,-53,-62, 67, 49,-47,-84,-33; /M: SY='Y'; M=-27, 13,-66,-43, 42,-67, 8, 26,-44, 17,-18,-38,-79,-38,-31,-28,-43, 30,-29, 70; /M: SY='F'; M=-53,-71,-83,-78, 84,-54,-63,-29,-75, 52, 48,-58,-82,-74,-73,-44,-64,-38,-52, 37; /M: SY='F'; M=-56,-14,-83,-78, 71,-49,-70, 30,-76, 53, 4,-59,-53,-75,-63,-55,-45, 9,-60, -3; /M: SY='N'; M= 28,-48, 10,-37,-21,-60, -9, -1,-24,-56,-30, 60,-46,-57,-43, 28, 27, 20,-22,-49; /M: SY='F'; M=-49, 19,-85,-81,110,-52,-68,-36,-77, 7,-21,-75,-52,-84,-54,-72,-38,-26,-24,-14; /I: I=-24; MD=-60; /M: SY='P'; M=-13,-35, 15, 12,-41,-16, 1,-28, -3,-37,-30,-14, 36, 11, 15, -7,-34,-47,-44, 4; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60; /M: SY='S'; M=-17,-39, 47,-13,-75,-35, 21,-73,-15,-53,-46, 48, -8, 1,-35, 56, 22,-49,-18,-49; /M: SY='Q'; M=-23,-23,-14, 12,-45,-32, 8,-35, 35,-45,-23, 8, 28, 49, 12, 20, 12,-22,-78,-50; /M: SY='K'; M= 0,-29, 10, 18,-50, -9, 0,-54, 48,-49,-37, 12,-28, 37, 17, 10, 2,-35,-78,-35; /M: SY='D'; M= -1,-43, 51, 32,-61,-25,-60, -7,-24,-17,-37,-10,-55, 23,-20,-10, 29, 9,-25,-10; /M: SY='R'; M=-18, 19,-66,-55,-39,-53,-19,-47, -4,-35,-13,-47,-75, 2, 97,-34,-50, 1,-75,-17; /M: SY='D'; M=-56,-76, 68, 25,-75,-43, 3,-45, 20,-42,-29, 54,-37, 21, -2,-12,-27,-33,-85,-18; /M: SY='K'; M= 9,-50, 30, 34,-75,-41, 12,-44, 34,-36,-41, 22,-13, 22, 23, 4,-12,-54,-80,-37; /M: SY='V'; M= 18,-12,-60,-75, 41,-77,-75, 36,-72, 12, 9,-48,-77,-73,-37,-64,-47, 63,-72,-52; /M: SY='Y'; M=-36,-10,-37,-55, 51,-20, 40, -2,-59, 8,-11,-56,-78,-54,-47,-19,-24, 14,-11, 81; /M: SY='Q'; M=-25,-36, 3, 5,-24,-31, 29,-70, 29,-27,-36, 26,-23, 36, 31, 32, -1,-38,-15,-36; /M: SY='K'; M= 25, -6,-35,-42,-31,-42, 5,-23, 40, 1, 2,-13,-59, 15, 16, -1, -9, -3, 10, 19; /M: SY='L'; M=-58,-71,-84,-77, 13,-85,-41, 52,-76, 68, 27,-78,-57,-59,-56,-52,-41, -6,-14,-51; /M: SY='M'; M= -5, 13,-41, -9,-17,-42,-48, 14, 11, 15, 21,-20, 12, 6,-10, 8, 0, 19,-75,-10; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 34 in 34 different sequences |
| Number of true positive hits | 34 in 34 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | BEACH-type PH |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
34 sequences
BCHA1_ARATH (F4HZB2), BCHA2_ARATH (F4JHT3), BCHB_ARATH (F4I9T0), BCHC1_ARATH (F4JD14), BCHC2_ARATH (F4IG73), BPH1_SCHPO (Q7LKZ7), BPH1_YEAST (P25356), FAN_HUMAN (Q92636), FAN_MOUSE (O35242), LRBA_HUMAN (P50851), LRBA_MOUSE (Q9ESE1), LVSA_DICDI (Q55DM1), LVSB_DICDI (Q86JF2), LVSC_DICDI (Q54U63), LVSD_DICDI (Q55AV3), LVSE_DICDI (Q54RQ8), LVSF_DICDI (Q54PP7), LYST_BOVIN (Q9TTK4), LYST_DROME (Q9W060), LYST_HUMAN (Q99698), LYST_MOUSE (P97412), NBEA_CAEBR (A8XSV3), NBEA_CAEEL (Q19317), NBEA_DROME (Q9W4E2), NBEA_HUMAN (Q8NFP9), NBEA_MOUSE (Q9EPN1), NBEL1_HUMAN (Q6ZS30), NBEL2_DANRE (E7FAW3), NBEL2_HUMAN (Q6ZNJ1), NBEL2_MOUSE (Q6ZQA0), WDFY3_HUMAN (Q8IZQ1), WDFY3_MOUSE (Q6VNB8), WDFY4_HUMAN (Q6ZS81), WDFY4_MOUSE (E9Q2M9)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
1MI1; 1T77 |