PROSITE logo

PROSITE entry PS51867


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] ZF_RING_GID
Accession [info] PS51867
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 10-OCT-2018 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51867
Associated ProRule [info] PRU01215

Name and characterization of the entry

Description [info] Gid-type RING finger profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1323950; R2=0.0181620; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2458.9399414; R2=3.3099999; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=379; H_SCORE=3713; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=241; H_SCORE=3257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -5,-31,-10,-31,-30, -6,-34,-30, 33,-24, 15, 11,-31,-24,-24,-29,-21, -4, 35,-26,-10,-24;
/M: SY='C';  M= -1,-27, 58,-33,-32,-17,-27,-27, -7,-25, -6,-14,-25,-27,-24,-32, -5, -7, -9,-22,-18,-32;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-19, -1,  3,-24, -9, -8,-23, 10,-28,-19,  8,-12,  5,  3, 21,  5,-20,-31,-20,  3;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='P';  M= -4, -8,-17, -8,  0,-19,-15, -8,-13, -1,-14,-12, -6,  7, -2, -4, -2,  4, -8,-23,-14, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E';  M= -5,  5,-15,  8, 18,-20,-13, -4,-18,  1,-20,-14,  3,-10,  5, -5,  4,  0,-17,-23,-15, 13; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L';  M=-14,-27, -9,-29,-22, 11,-28,-18, 12,-22, 21, 11,-27,-24,-17,-17,-20, -9,  4, -9,  0,-22; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='N';  M= -8,  7,-19, -3, -3,-13,-10,  2,-18,  1,-22,-12, 21,-15, -3,  1,  2, -3,-17,-22, -8, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E';  M= -4,  0,-22,  1, 11,-24,-12, -8,-21,  9,-22,-17, -3,  7,  4, -2,  1, -6,-16,-25,-17,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L';  M=-13,-28, -7,-28,-22,  0,-30,-22, 17,-22, 27, 13,-28,-22,-16,-16,-21, -7, 10,-15, -7,-22; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='A';  M= 22,-11, -4,-11, -7,-15,  3,-14,-10, -7,-17,-10,-10, -8, -7, -8, 10,  2, -4,-22,-15, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='Q';  M= -8, -3,-25, -4, 12,-20,-16, -1,-19, 12,-14, -9, -2,-11, 17, 15, -4, -7,-17,-20,-14, 12; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='N';  M= -9,  0,-15, -7, -8,-14,-14, -4, -6, -6,-10, -5, 11,-15, -6, -6, -1, -2, -7,-23,-12, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='L';  M= -7,-24,-10,-25,-20, -5,-25,-20, 15,-16, 16, 12,-23,-18,-12,-14,-17, -4, 15,-18, -8,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='P';  M= -7,-13, -6,-13,-10,-23,-16,-13,-18,-11,-19,-20,-14, 32,-10,-17, -7, -8,-14,-24,-16,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='Y';  M= -9,-17,-14,-19,-12, 16,-18,  5, -8, -9, -9, -8,-13,-20,-12,-12, -8,-11, -8,  4, 29,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='A';  M= 16,-16, -4,-17,-11,-10, -9,-11,  0,-11, -6, -3,-16,-12,-10,-10,  0, -3,  3,-20,-11,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='H';  M= -8,  0,-16, -5, -1, -9,-10, 33,-17, -5,-19,-13,  7,-11,  4, -2,  2, -4,-17,-16,  5, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='H';  M= -9, -2,-22, -6, -1,-15,  1, 27,-24, -4,-23,-14,  2,-13,  7, -2, -4,-13,-20,-17, -2,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-23, -1, 10,-21,-22,-12,-10, -3,-13, -9, -8,-15,  4, -8, -1,  0, -9,-28,-18,  7;
/M: SY='Q';  M= -8, -7,-26, -9,  5,-24,-17, -6,-18,  9,-16, -6, -7,-14, 20,  3, -3, -9,-12,-25,-19,  9;
/M: SY='S';  M=  3,-10,-12,-11, -7,-17,-12,-15,-11, -6,-13, -4, -1,-14, -3, -8, 17, 14, -9,-28,-18, -7;
/M: SY='S';  M= -8,  0,-21,  0, -1,-19,-15,  3,-18, -6,-21,-14,  5,-16,  2, -6,  8,  3,-17,-27,-10, -1;
/M: SY='I';  M=-10,-13,-18, -9, -8,-15,-26,-21,  3,-16,  2, -1,-17,-21,-10,-18,-10,  0,  2,-29,-16, -9;
/M: SY='E';  M=-15,  9,-32, 11, 15,-10,-18, -4,-22, -4,-26,-17,  3,-21,  0,-11, -2,-10,-24,-26,-10,  9;
/M: SY='N';  M=-14, 22,-30, 10,  8,-29,-11,  9,-29,  0,-36,-19, 40,-17,  6, -1,  8, -3,-28,-37,-19,  7;
/M: SY='P';  M=-15, 10,-26, 12,  0,-37,-15,-11,-29, -9,-34,-27,  5, 19, -6,-17, -3, -8,-25,-42,-27, -3;
/M: SY='P';  M=-11,-22,-28,-22,-12,-35,-22,-21,-24,-12,-21,-24,-22, 67,-11,-20,-12,-10,-16,-38,-28,-12;
/M: SY='M';  M= -8,-29,-15,-29,-24,  1,-32,-21, 19,-21, 12, 20,-26,-26,-13,-24,-19, -8, 20,-19, -3,-20;
/M: SY='M';  M= -5,-24,-16,-26,-17,-10,-27,-22,  7, -8,  7, 19,-21,-22, -7,-14,-13, -6,  9,-25,-13,-15;
/M: SY='L';  M=-19,-38,-12,-39,-29,  4,-38,-28, 18,-29, 35, 23,-37,-31,-18,-21,-28,-11,  9,-18, -7,-29;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-24,-19,-11,-33,-18,-20,-22,-10,-25,-24,-18, 55,-10,-19, -4, -7,-13,-37,-26,-10;
/M: SY='N';  M=-14, 13,  2, -3,-10,-27,-15, -1,-24, -8,-32,-20, 34,-22, -8,-11,  6, -2,-24,-34,-20,-10;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-30, -7,-16,-29, 48,-13,-38,-17,-39,-29, -7,-20,-16,-17,  1,-18,-30,-30,-27,-16;
/M: SY='H';  M=-16,  0,-32,-11, -3,-17,-19, 26,-27,  2,-26,-19, 15,-21,  4, 19, -6,-12,-27,-23,  2, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24;
/M: SY='Y';  M=-18,-31,-17,-31,-23, 24,-33,  5,  2,-23,  0, -4,-24,-30,-22,-22,-21,-17, -1,  9, 47,-23;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-19, -1, -9,-28, 20,-17,-28,-13,-33,-25, -6,-11,-11,-19,  6,-10,-23,-33,-26,-10;
/M: SY='K';  M= -5,-12,-23,-17, -4,-14,-20, -8,-16,  9,-16,-10, -8,-18,  2,  8, -2, -5,-13,-21, -9, -3;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-28, 11, 15,-30,-14, -3,-27,  9,-29,-17,  3,-13, 14,  0,  2, -8,-21,-33,-21, 13;
/M: SY='K';  M=  5, -7,-21,-12,  1,-25,-12,-10,-23, 16,-24,-17, -2,-12,  4, 15,  8,  0,-17,-30,-20,  1;
/M: SY='L';  M=-19,-39,-10,-39,-30,  0,-40,-30, 21,-30, 39, 19,-39,-30,-21,-21,-29,-10, 11,-20,-10,-30;
/M:         M=-15, -4,-24, -6, -5,-20,-24,-13, -9, -2, -8, -5, -2,-21, -5, -6, -8, -6,-10,-31,-18, -6;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-28,  4, 16,-28,-13, -6,-26, 14,-29,-19,  3,-12, 10,  6,  8, -5,-23,-32,-21, 13;
/M: SY='M';  M=-16,-33,-17,-34,-24,  5,-33,-17,  7,-24, 14, 18,-29,-23,-15,-22,-23,-13,  3, -6,  5,-24;
/M: SY='S';  M= 12, -7,-12,-11, -6,-16, -6,-12,-15, -5,-23,-14,  1,-14, -6, -6, 17,  3,-12,-28,-17, -6;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-31, -2, 14,-28,-17,  1,-28, 21,-28,-17,  5,-13, 15, 14,  0, -9,-23,-30,-18, 13;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-27, -3,  2,-27, -9, -8,-27, 18,-30,-20,  7,-14,  0,  3,  2, -4,-20,-31,-18,  1;
/M:         M= -7,-10,-19,-11,-14,-15, -4,-14,-12,-15,-12, -7, -6,-21,-12,-16, -2, -7,-10,-27,-13,-14;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G';  M= -4, -8,-22,-12, -9,-22,  5,-15,-21,  1,-21,-13, -4,-16, -6, -5,  2, -6,-15,-27,-20, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='K';  M= -6, -8, -9,-10, -5,-15,-17,-13, -8,  4, -8, -7, -7,-13, -2, -5, -1,  0, -6,-21,-14, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M:         M= -1,-10,-16,-10, -1,-17,-14,-10, -9, -3,-10, -6, -8, -1,  0, -2, -2, -1, -6,-21,-14, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-17,  0, 10,-17, -6, -2,-18,  8,-20,-13,  2, -8,  4,  0,  5, -4,-15,-20,-12,  8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-13, -9, -9,-12,  4, -8,-12, -9,-12, -9, -2, -7, -8, -9, -2, -4, -9,-17,-10, -9; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='Q';  M= -7, -4,-14, -7,  4,-12,-14, -3,-16,  7,-13, -8, -4,-11, 10,  3, -3, -5,-13,-11, -9,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I';  M= -9,-32,-12,-33,-30,  5,-34,-27, 25,-25, 15, 10,-32,-27,-24,-28,-22, -7, 25,-20, -3,-25;
/M: SY='K';  M= -9,-11,-25,-17, -3,-22,-24,-14,-13, 21,-13, -6, -8,-16,  1, 10, -7, -6, -7,-28,-17, -2;
/M: SY='D';  M=-12, 12, 11, 21, -4,-32,-18,-18,-22,-18,-28,-26, -6,-24,-12,-28, -4,-10,-22,-38,-26,-10;
/M: SY='P';  M=-11,-22,-28,-22,-12,-35,-22,-21,-24,-12,-21,-24,-22, 67,-11,-20,-12,-10,-16,-38,-28,-12;
/M: SY='Y';  M=-11,-25,-18,-26,-19,  1,-29, -7,  2,-14, -1, -4,-18,-24,-15, -8,-15, -4,  3,-11, 13,-17;
/M: SY='T';  M=  0, -7, 12, -6,-12,-23,-18,-20,-14,-14,-17,-17, -6,-17,-12,-19,  7, 18,-10,-31,-22,-14;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS50089

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 39 in 39 different sequences
Number of true positive hits 39 in 39 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] RING-Gid-type
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
39 sequences

FYV10_ASPCL (A1C9R2), FYV10_ASPFU (Q4WTQ4), FYV10_ASPNC (A2R9P6), 
FYV10_ASPTN (Q0CA25), FYV10_CANAL (Q5A4G9), FYV10_CANGA (Q6FTG6), 
FYV10_CHAGB (Q2H991), FYV10_COCIM (Q1DTI6), FYV10_DEBHA (Q6BYF0), 
FYV10_EMENI (Q5AS80), FYV10_EREGS (Q75AZ2), FYV10_KLULA (Q6CP05), 
FYV10_NEOFI (A1CZJ5), FYV10_NEUCR (Q7S2X0), FYV10_PHANO (Q0TYW1), 
FYV10_PICST (A3LPW2), FYV10_PYRO7 (A4RK04), FYV10_SCHPO (Q9URU9), 
FYV10_YARLI (Q6C435), FYV10_YEAST (P40492), MAEA_ARATH  (Q9M2V9), 
MAEA_BOVIN  (Q3MHJ2), MAEA_CHICK  (Q5F398), MAEA_DANRE  (Q7SXR3), 
MAEA_HUMAN  (Q7L5Y9), MAEA_MACFA  (Q4R9A8), MAEA_MOUSE  (Q4VC33), 
MAEA_PONAB  (Q5R532), MAEA_RAT(Q5RKJ1), MAEA_XENLA  (Q6GR10), 
RMD5A_HUMAN (Q9H871), RMD5A_MOUSE (Q80YQ8), RMD5A_XENLA (Q6GLP4), 
RMD5A_XENTR (Q640V2), RMD5B_HUMAN (Q96G75), RMD5B_MOUSE (Q91YQ7), 
RMD5_ARATH  (Q9T075), RMD5_YEAST  (Q12508), YB83_SCHPO  (O59668)
» more

PDB
[Detailed view]
3 PDB

7NS4; 8PJN; 8PMQ