Home  |  Contact
Entry: PS51867

General information about the entry

Entry name [info] ZF_RING_GID
Accession [info] PS51867
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 10-OCT-2018 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51867
Associated ProRule [info] PRU01215

Name and characterization of the entry

Description [info] Gid-type RING finger profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1323950; R2=0.0181620; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2458.9399414; R2=3.3099999; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=379; H_SCORE=3713; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=241; H_SCORE=3257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-20,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-30,-20, 80,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -5,-31,-10,-31,-30, -6,-34,-30, 33,-24, 15, 11,-31,-24,-24,-29,-21, -4, 35,-26,-10,-24;
/M: SY='C';  M= -1,-27, 58,-33,-32,-17,-27,-27, -7,-25, -6,-14,-25,-27,-24,-32, -5, -7, -9,-22,-18,-32;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-19, -1,  3,-24, -9, -8,-23, 10,-28,-19,  8,-12,  5,  3, 21,  5,-20,-31,-20,  3;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='P';  M= -4, -8,-17, -8,  0,-19,-15, -8,-13, -1,-14,-12, -6,  7, -2, -4, -2,  4, -8,-23,-14, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E';  M= -5,  5,-15,  8, 18,-20,-13, -4,-18,  1,-20,-14,  3,-10,  5, -5,  4,  0,-17,-23,-15, 13; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L';  M=-14,-27, -9,-29,-22, 11,-28,-18, 12,-22, 21, 11,-27,-24,-17,-17,-20, -9,  4, -9,  0,-22; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='N';  M= -8,  7,-19, -3, -3,-13,-10,  2,-18,  1,-22,-12, 21,-15, -3,  1,  2, -3,-17,-22, -8, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E';  M= -4,  0,-22,  1, 11,-24,-12, -8,-21,  9,-22,-17, -3,  7,  4, -2,  1, -6,-16,-25,-17,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L';  M=-13,-28, -7,-28,-22,  0,-30,-22, 17,-22, 27, 13,-28,-22,-16,-16,-21, -7, 10,-15, -7,-22; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='A';  M= 22,-11, -4,-11, -7,-15,  3,-14,-10, -7,-17,-10,-10, -8, -7, -8, 10,  2, -4,-22,-15, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='Q';  M= -8, -3,-25, -4, 12,-20,-16, -1,-19, 12,-14, -9, -2,-11, 17, 15, -4, -7,-17,-20,-14, 12; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='N';  M= -9,  0,-15, -7, -8,-14,-14, -4, -6, -6,-10, -5, 11,-15, -6, -6, -1, -2, -7,-23,-12, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='L';  M= -7,-24,-10,-25,-20, -5,-25,-20, 15,-16, 16, 12,-23,-18,-12,-14,-17, -4, 15,-18, -8,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='P';  M= -7,-13, -6,-13,-10,-23,-16,-13,-18,-11,-19,-20,-14, 32,-10,-17, -7, -8,-14,-24,-16,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='Y';  M= -9,-17,-14,-19,-12, 16,-18,  5, -8, -9, -9, -8,-13,-20,-12,-12, -8,-11, -8,  4, 29,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='A';  M= 16,-16, -4,-17,-11,-10, -9,-11,  0,-11, -6, -3,-16,-12,-10,-10,  0, -3,  3,-20,-11,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='H';  M= -8,  0,-16, -5, -1, -9,-10, 33,-17, -5,-19,-13,  7,-11,  4, -2,  2, -4,-17,-16,  5, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='H';  M= -9, -2,-22, -6, -1,-15,  1, 27,-24, -4,-23,-14,  2,-13,  7, -2, -4,-13,-20,-17, -2,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-23, -1, 10,-21,-22,-12,-10, -3,-13, -9, -8,-15,  4, -8, -1,  0, -9,-28,-18,  7;
/M: SY='Q';  M= -8, -7,-26, -9,  5,-24,-17, -6,-18,  9,-16, -6, -7,-14, 20,  3, -3, -9,-12,-25,-19,  9;
/M: SY='S';  M=  3,-10,-12,-11, -7,-17,-12,-15,-11, -6,-13, -4, -1,-14, -3, -8, 17, 14, -9,-28,-18, -7;
/M: SY='S';  M= -8,  0,-21,  0, -1,-19,-15,  3,-18, -6,-21,-14,  5,-16,  2, -6,  8,  3,-17,-27,-10, -1;
/M: SY='I';  M=-10,-13,-18, -9, -8,-15,-26,-21,  3,-16,  2, -1,-17,-21,-10,-18,-10,  0,  2,-29,-16, -9;
/M: SY='E';  M=-15,  9,-32, 11, 15,-10,-18, -4,-22, -4,-26,-17,  3,-21,  0,-11, -2,-10,-24,-26,-10,  9;
/M: SY='N';  M=-14, 22,-30, 10,  8,-29,-11,  9,-29,  0,-36,-19, 40,-17,  6, -1,  8, -3,-28,-37,-19,  7;
/M: SY='P';  M=-15, 10,-26, 12,  0,-37,-15,-11,-29, -9,-34,-27,  5, 19, -6,-17, -3, -8,-25,-42,-27, -3;
/M: SY='P';  M=-11,-22,-28,-22,-12,-35,-22,-21,-24,-12,-21,-24,-22, 67,-11,-20,-12,-10,-16,-38,-28,-12;
/M: SY='M';  M= -8,-29,-15,-29,-24,  1,-32,-21, 19,-21, 12, 20,-26,-26,-13,-24,-19, -8, 20,-19, -3,-20;
/M: SY='M';  M= -5,-24,-16,-26,-17,-10,-27,-22,  7, -8,  7, 19,-21,-22, -7,-14,-13, -6,  9,-25,-13,-15;
/M: SY='L';  M=-19,-38,-12,-39,-29,  4,-38,-28, 18,-29, 35, 23,-37,-31,-18,-21,-28,-11,  9,-18, -7,-29;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-24,-19,-11,-33,-18,-20,-22,-10,-25,-24,-18, 55,-10,-19, -4, -7,-13,-37,-26,-10;
/M: SY='N';  M=-14, 13,  2, -3,-10,-27,-15, -1,-24, -8,-32,-20, 34,-22, -8,-11,  6, -2,-24,-34,-20,-10;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-30, -7,-16,-29, 48,-13,-38,-17,-39,-29, -7,-20,-16,-17,  1,-18,-30,-30,-27,-16;
/M: SY='H';  M=-16,  0,-32,-11, -3,-17,-19, 26,-27,  2,-26,-19, 15,-21,  4, 19, -6,-12,-27,-23,  2, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-10,-30,-30, -6,-34,-30, 34,-24, 14, 10,-30,-24,-24,-30,-20, -4, 36,-26,-10,-24;
/M: SY='Y';  M=-18,-31,-17,-31,-23, 24,-33,  5,  2,-23,  0, -4,-24,-30,-22,-22,-21,-17, -1,  9, 47,-23;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-19, -1, -9,-28, 20,-17,-28,-13,-33,-25, -6,-11,-11,-19,  6,-10,-23,-33,-26,-10;
/M: SY='K';  M= -5,-12,-23,-17, -4,-14,-20, -8,-16,  9,-16,-10, -8,-18,  2,  8, -2, -5,-13,-21, -9, -3;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-28, 11, 15,-30,-14, -3,-27,  9,-29,-17,  3,-13, 14,  0,  2, -8,-21,-33,-21, 13;
/M: SY='K';  M=  5, -7,-21,-12,  1,-25,-12,-10,-23, 16,-24,-17, -2,-12,  4, 15,  8,  0,-17,-30,-20,  1;
/M: SY='L';  M=-19,-39,-10,-39,-30,  0,-40,-30, 21,-30, 39, 19,-39,-30,-21,-21,-29,-10, 11,-20,-10,-30;
/M:         M=-15, -4,-24, -6, -5,-20,-24,-13, -9, -2, -8, -5, -2,-21, -5, -6, -8, -6,-10,-31,-18, -6;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-28,  4, 16,-28,-13, -6,-26, 14,-29,-19,  3,-12, 10,  6,  8, -5,-23,-32,-21, 13;
/M: SY='M';  M=-16,-33,-17,-34,-24,  5,-33,-17,  7,-24, 14, 18,-29,-23,-15,-22,-23,-13,  3, -6,  5,-24;
/M: SY='S';  M= 12, -7,-12,-11, -6,-16, -6,-12,-15, -5,-23,-14,  1,-14, -6, -6, 17,  3,-12,-28,-17, -6;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-31, -2, 14,-28,-17,  1,-28, 21,-28,-17,  5,-13, 15, 14,  0, -9,-23,-30,-18, 13;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-27, -3,  2,-27, -9, -8,-27, 18,-30,-20,  7,-14,  0,  3,  2, -4,-20,-31,-18,  1;
/M:         M= -7,-10,-19,-11,-14,-15, -4,-14,-12,-15,-12, -7, -6,-21,-12,-16, -2, -7,-10,-27,-13,-14;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G';  M= -4, -8,-22,-12, -9,-22,  5,-15,-21,  1,-21,-13, -4,-16, -6, -5,  2, -6,-15,-27,-20, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='K';  M= -6, -8, -9,-10, -5,-15,-17,-13, -8,  4, -8, -7, -7,-13, -2, -5, -1,  0, -6,-21,-14, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M:         M= -1,-10,-16,-10, -1,-17,-14,-10, -9, -3,-10, -6, -8, -1,  0, -2, -2, -1, -6,-21,-14, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-17,  0, 10,-17, -6, -2,-18,  8,-20,-13,  2, -8,  4,  0,  5, -4,-15,-20,-12,  8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-13, -9, -9,-12,  4, -8,-12, -9,-12, -9, -2, -7, -8, -9, -2, -4, -9,-17,-10, -9; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='Q';  M= -7, -4,-14, -7,  4,-12,-14, -3,-16,  7,-13, -8, -4,-11, 10,  3, -3, -5,-13,-11, -9,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I';  M= -9,-32,-12,-33,-30,  5,-34,-27, 25,-25, 15, 10,-32,-27,-24,-28,-22, -7, 25,-20, -3,-25;
/M: SY='K';  M= -9,-11,-25,-17, -3,-22,-24,-14,-13, 21,-13, -6, -8,-16,  1, 10, -7, -6, -7,-28,-17, -2;
/M: SY='D';  M=-12, 12, 11, 21, -4,-32,-18,-18,-22,-18,-28,-26, -6,-24,-12,-28, -4,-10,-22,-38,-26,-10;
/M: SY='P';  M=-11,-22,-28,-22,-12,-35,-22,-21,-24,-12,-21,-24,-22, 67,-11,-20,-12,-10,-16,-38,-28,-12;
/M: SY='Y';  M=-11,-25,-18,-26,-19,  1,-29, -7,  2,-14, -1, -4,-18,-24,-15, -8,-15, -4,  3,-11, 13,-17;
/M: SY='T';  M=  0, -7, 12, -6,-12,-23,-18,-20,-14,-14,-17,-17, -6,-17,-12,-19,  7, 18,-10,-31,-22,-14;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS50089

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 39 in 39 different sequences
Number of true positive hits 39 in 39 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] RING-Gid-type
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
39 sequences

FYV10_ASHGO (Q75AZ2    ), FYV10_ASPCL (A1C9R2    ), FYV10_ASPFU (Q4WTQ4    ), 
FYV10_ASPNC (A2R9P6    ), FYV10_ASPTN (Q0CA25    ), FYV10_CANAL (Q5A4G9    ), 
FYV10_CANGA (Q6FTG6    ), FYV10_CHAGB (Q2H991    ), FYV10_COCIM (Q1DTI6    ), 
FYV10_DEBHA (Q6BYF0    ), FYV10_EMENI (Q5AS80    ), FYV10_KLULA (Q6CP05    ), 
FYV10_MAGO7 (A4RK04    ), FYV10_NEOFI (A1CZJ5    ), FYV10_NEUCR (Q7S2X0    ), 
FYV10_PHANO (Q0TYW1    ), FYV10_PICST (A3LPW2    ), FYV10_SCHPO (Q9URU9    ), 
FYV10_YARLI (Q6C435    ), FYV10_YEAST (P40492    ), MAEA_ARATH  (Q9M2V9    ), 
MAEA_BOVIN  (Q3MHJ2    ), MAEA_CHICK  (Q5F398    ), MAEA_DANRE  (Q7SXR3    ), 
MAEA_HUMAN  (Q7L5Y9    ), MAEA_MACFA  (Q4R9A8    ), MAEA_MOUSE  (Q4VC33    ), 
MAEA_PONAB  (Q5R532    ), MAEA_RAT    (Q5RKJ1    ), MAEA_XENLA  (Q6GR10    ), 
RMD5A_HUMAN (Q9H871    ), RMD5A_MOUSE (Q80YQ8    ), RMD5A_XENLA (Q6GLP4    ), 
RMD5A_XENTR (Q640V2    ), RMD5B_HUMAN (Q96G75    ), RMD5B_MOUSE (Q91YQ7    ), 
RMD5_ARATH  (Q9T075    ), RMD5_YEAST  (Q12508    ), YB83_SCHPO  (O59668    )
» more


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission