PROSITE entry PS51916
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | DEUBAD |
Accession [info] | PS51916 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
22-APR-2020 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51916 |
Associated ProRule [info] | PRU01264 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | DEUBAD (DEUBiquitinase ADaptor) domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=112; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7036135; R2=0.0060760; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15208.1884766; R2=8.6523972; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1366; H_SCORE=27027; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=790; H_SCORE=22044; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='P'; M= 1,-43,-13,-12,-30, -3, 7,-24,-21,-29,-18,-25, 80, 11, -2, 5, -7,-21,-41,-27; /M: SY='Q'; M= 3,-38, 22, 4,-16, 0, 2,-18, 4,-19,-12, 8, 8, 38, 4, 1, 0,-22,-39, -2; /M: SY='S'; M= 14,-34, 19, 18,-35, 17, -7,-35, -1,-39,-32, 7,-11, 6, -5, 41,-11,-26,-44,-31; /M: SY='P'; M= 4,-38,-24,-16,-15, -5,-30, 8, -8, 18, 0,-23, 44, 12, 2,-13,-10, 6,-39,-27; /M: SY='C'; M= -1, 28, -1, -5, 4,-11,-20, 3,-10, 21, -7,-15, -9, -3, 0, -4, -3, -5,-34, 10; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='P'; M= 4, 24, 25, 5,-26,-26, -6,-19, -9,-25,-25, 1, 41, 23,-15, 2, -3, 11,-46,-31; /M: SY='N'; M= -1,-20, 14, -6,-19, 8, 11,-18, -1, -8,-17, 28, 17, 3,-14, 16, -5,-16,-40, 0; /M: SY='V'; M= 1,-18,-15,-12, -3,-23,-24, 30,-27, 2, -7,-23, 24,-17,-34, -4, 7, 35,-41,-19; /M: SY='D'; M=-12,-37, 61, 6,-39, -2,-11,-10,-15,-26,-31, 38,-24,-10,-17, 17, -3,-17,-53,-32; /M: SY='L'; M=-28,-33,-48,-40, 29,-48,-31, 11,-40, 64, 21,-45,-46,-29,-38,-39,-26, -2,-30,-11; /M: SY='S'; M= 12,-33,-16, -7,-21, 3,-12,-31, 22,-27,-27, 21,-17, 4, 15, 29, 15,-14,-13,-28; /M: SY='D'; M= 7,-38, 60, 37,-44, -8, -7,-41, 0,-37,-35, 5,-23, 3,-11, 10, -4,-31,-50,-33; /M: SY='V'; M= 3,-19,-44,-39, 4,-30,-41, 44,-37, 19, 4,-37,-31,-36,-39,-16,-12, 47,-40,-20; /M: SY='L'; M=-29,-34,-48,-42, 22,-49,-36, 37,-41, 54, 18,-43,-44,-36,-40,-38,-21, 18,-33,-13; /M: SY='N'; M= -3, 9, 2,-19,-37,-20, -6,-26, 6,-37,-29, 50,-18,-11, -6, 39, 37,-28,-50,-31; /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; /M: SY='P'; M= 3,-39,-30,-10, 11,-18,-27, -8, -1, -1, 5,-17, 62, -5, -9, -1, -7, -9,-34, -1; /M: SY='E'; M= -8,-40, 45, 55,-36,-30, 14,-38, -4,-39,-34, -4, -4, 18, -6, 13, -4,-37,-47,-31; /M: SY='T'; M= 19,-29,-13, -9,-25,-18,-11, -6,-12,-16,-21, 30,-30, -8,-19, 9, 44, 14,-47,-29; /M: SY='W'; M=-16,-39,-51,-41, 38,-43,-42, 16,-38, 28, 9,-45,-43,-37,-39,-36,-19, 21,105, -3; /M: SY='N'; M= 5,-35, 7, 6,-27,-10, 0, -3, -5,-19, 6, 30,-31, 28, 6, 17, 0,-10, 10,-26; /M: SY='P'; M= -2, -9, 10, 16,-38,-17, -5,-24, -2,-21, 3, 6, 54, 1, -6, 22, -2,-23,-45,-32; /M: SY='L'; M=-20, 32,-42,-32, 1,-44, 8, 24,-36, 46, 9,-36,-42,-18,-36,-20, -7, 19,-37, 0; /M: SY='L'; M=-13,-34,-39,-19, 7,-35,-31, 7,-30, 50, 15,-29, 23,-24,-35,-12,-14, 7,-36,-19; /I: I=-22; MD=-55; /M: SY='T'; M= 4,-38, 3, -8,-28,-16,-18,-37, -7,-31,-34, 19,-28, -8, 5, 21, 29,-23,-52,-35; D=-22; /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55; /M: SY='P'; M=-17,-30, 26, 32,-49,-24,-19,-41, 8,-39,-39,-13, 56, -8,-13,-15,-23,-43,-50,-33; D=-22; /I: I=-22; DM=-55; /M: SY='E'; M= 0,-39, 40, 46,-35,-13, 10,-36, 6,-29,-32, 10, -7, 16,-11, 10, -8,-35,-46,-31; /M: SY='E'; M=-11, 11, 4, 30, 2,-37, 17, 5,-19, 6, 1, 5,-34, 12,-20,-20,-16, 16,-35, 18; /M: SY='Q'; M= -4,-13,-24, 5,-36,-31,-13,-16, 20,-12, 4,-20,-17, 55, 46,-12,-23, 0,-39,-26; /M: SY='Q'; M= 6,-39, 13, 33,-18,-26, 11,-33, 14,-17,-18, 0,-23, 42, 13, 2,-11,-25,-38, 0; /M: SY='R'; M= 4,-40, -8, 17,-18,-24, 33,-32, 20,-30,-18, -4,-31, 43, 44, -1,-13,-33,-39,-16; /M: SY='L'; M=-26,-33,-47,-40, -5,-49,-33, 19,-41, 68, 10,-38,-46,-34,-39,-39,-25, 5,-35,-17; /M: SY='M'; M= 11,-17,-34,-16, 13,-31,-28, 14,-10, 25, 41,-22,-36, 10,-21, -2, 1, 5,-35,-14; /M: SY='P'; M= 4,-14, -8, 5,-43,-28,-23,-34, 22,-31,-13, -3, 64, 34, 0, 2, -4,-27,-41,-34; /M: SY='H'; M=-25,-37,-27,-31, 47,-40, 70,-15,-21, 28, 3,-17,-41,-20,-23,-25,-15,-20,-22, 43; /M: SY='L'; M=-27,-32,-48,-40, 4,-49,-32, 9,-41, 69, 15,-46,-47,-34,-38,-40,-26, -1,-34,-16; /M: SY='P'; M=-25,-55,-30,-19,-49,-31,-33,-37,-26,-43,-33,-36,111,-30,-39,-27,-22,-41,-42,-46; /M: SY='P'; M= -7,-40, 30, 36,-44,-24, -6,-38, -2,-36,-32, 7, 48, 21,-14, 13, 7,-31,-46,-34; /M: SY='G'; M= -8, 9, 6, 12, 16, 25,-18, 2,-25, -4, 14, -2,-26, -5,-17,-10, -4, 6,-37,-15; /M: SY='D'; M= -5,-29, 50, 20,-38, -9, 14,-21,-17,-16,-28, -7, 37, 4,-27, 0, 2,-17,-48,-22; /M: SY='P'; M= -6,-24, 5, 23,-39,-13, 4,-26, 0,-28,-21, -3, 33, 30, 22, 6, 6,-19, 1,-30; /I: I=-20; MD=-51; /M: SY='N'; M=-17,-34, 1,-10,-40,-50,-20, -8,-32, -7,-34, 5, -7,-19,-46,-27,-14, -9,-63,-45; D=-20; /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51; /M: SY='E'; M= -9,-55, 6, 19,-53,-19,-15,-45,-18,-37,-32,-16, 14,-11,-24,-15,-28,-34,-58,-23; D=-20; /I: I=-20; DM=-51; /M: SY='N'; M=-11,-48, 11, 12,-52,-13, -3,-49, 4,-45,-41, 18, 9, 5, -9, -1, 3,-45,-56,-42; D=-20; /I: I=-20; DM=-51; /M: SY='T'; M= -8,-19, 1,-16, 5,-31,-30,-23, 11,-10,-19,-13, 3, 12,-20, 10, 28,-14,-15,-14; D=-20; /I: I=-20; DM=-51; /M: SY='P'; M= 8,-19,-12, 21,-26,-25,-25,-14, -7, -7,-15, 0, 46, 23, -6, 6, -2, -6,-41,-23; /M: SY='E'; M= -6,-25, 27, 46,-40,-17, -2,-35, 8,-20,-21, -3,-11, 28, 11, -4, 2,-22,-44,-23; /M: SY='E'; M= -3,-20, 18, 31,-34,-19,-14,-14,-14,-10, -1, 10, -8, 12,-13, 14, 29, -5,-46,-30; /M: SY='L'; M=-25,-33,-43,-38, -2,-37,-34, 30,-36, 48, 21,-31,-20,-32,-25,-10, -8, 26,-38,-19; /M: SY='R'; M=-14,-13, -4, 16,-36,-24, 5,-19, 26,-14, 2, 4, -9, 29, 40, 4, -6,-24,-41,-27; /M: SY='E'; M= 9, -9, 12, 40,-39,-18, -6,-36, 1,-28, -5, -4,-15, 24, 3, 24, 12,-30,-43,-24; /M: SY='T'; M= 3,-17,-33,-31, -2,-36, 2, 6,-30, 33, 26, -7,-35,-22,-32, -6, 37, 12,-41,-20; /M: SY='F'; M=-22,-33,-47,-41, 50,-47,-24, 24,-38, 43, 7,-41,-45,-38,-23,-35,-21, 27,-27, -7; /M: SY='R'; M=-10,-36, 5, 6,-38,-11, 20,-24, 2,-29,-18, 31,-31, 28, 34, 24, 12,-28,-45,-27; /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84; /M: SY='S'; M= -2, -3, 6,-19,-38, -8,-18,-36,-18,-36,-32, 51,-22,-14,-24, 61, 13,-31,-50,-32; /M: SY='P'; M= -7,-45,-18, 17, 16,-31, -7,-16,-23,-27,-18,-10, 84, -7,-31, -5,-21,-27,-36,-20; /M: SY='Q'; M=-17,-23,-14, 2, 17,-31, 31,-26, 5,-29,-14, 13, 2, 78, -3,-13,-20,-34,-33, -6; /M: SY='F'; M=-38,-35,-50,-46, 97,-46,-30, -9,-41, 3,-13,-40,-49,-50,-39,-37,-31,-17, 23, 29; /M: SY='Q'; M= -2,-40,-18, -8,-39, 19, -2,-25, 20,-26,-25, -1,-14, 49, 36, -7, 1,-24,-14,-20; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='Q'; M= -9,-39, 7, 17,-44,-26, 20,-39, -2,-37,-26, 27,-29, 71, 7, 21, -3,-33,-43,-27; /M: SY='P'; M= 46,-21, -4,-19,-42, -5,-27,-33,-22,-36,-28, 9, 50, 8,-29, 15, 4,-23,-43,-36; /M: SY='L'; M= -1, 35,-46,-39, 5,-44,-36, 22,-39, 46, 19,-41,-43,-35,-38,-32,-19, 29,-37,-12; /M: SY='Q'; M= 8,-20, 14, 11,-37, -7, 4,-33, 6,-15,-12, 16,-30, 29, 17, 25, -2,-22,-44,-28; /M: SY='S'; M= -3,-20, -6, 3,-21,-25,-14, -7, 4,-10, 26,-17,-30, 19, 6, 33, 19, -9,-16, 1; /M: SY='F'; M=-30,-37,-51,-44, 82,-45,-33, -7,-40, 25,-10,-43,-48,-44,-38,-38,-31,-13, 78, 22; /M: SY='Q'; M=-13,-12, 7, -9, -1, 12, 9,-36, -5,-31,-20, -4,-31, 40, 4, 38, 13,-32, 4, -5; /M: SY='H'; M= 6,-36, 9, 25,-34,-21, 38,-31, 5,-23, -6, 16,-29, 26, 4, 17, 6,-23,-42, 1; /M: SY='A'; M= 53,-30,-10,-16,-33,-14, -7,-25, -4, -1, -8, -3,-32, 1, 19, -6,-14,-12,-40,-29; /M: SY='L'; M=-30,-33,-48,-41, 14,-49,-33, 17,-41, 67, 11,-46,-47,-35,-39,-40,-26, 2,-33,-14; /M: SY='Q'; M= 8, 10,-19, 9,-41,-17, 12,-38, 18,-30,-20, 4,-31, 56, 33, 17,-19,-30,-41,-27; /M: SY='S'; M= 2,-31, 23, 20,-39, 4,-23,-35,-18,-36,-12, 8,-26, -5,-25, 47, 35,-28,-47,-31; /M: SY='G'; M= -9,-40,-22,-37,-46, 85,-33,-53,-32,-49,-38,-10,-22,-23,-39, -9,-30,-46,-37,-41; /I: I=-42; MD=-106; /M: SY='Q'; M=-13,-42, 1, 22,-18,-26, 25,-15, -6, -3, -8, 9,-34, 57, -5,-14,-16,-14,-42,-17; D=-42; /I: I=-42; MD=-106; /M: SY='F'; M=-17, 17,-47,-42, 47,-24, -7, -7,-41, 43, 14,-41,-48,-38,-39,-27,-25,-14,-25, 21; D=-42; /I: I=-42; MI=-106; IM=-106; DM=-106; /M: SY='G'; M= 8,-37, 28, -5,-42, 42, 14,-40,-18,-36,-31, 17,-17, 11, 4, 3, 9,-29,-45,-32; /M: SY='P'; M=-11,-45,-16,-14,-39,-10,-20,-19,-21,-15, -3, -3, 91,-14,-23,-10, -9,-24,-43,-38; /M: SY='D'; M=-16,-36, 35, 24,-26,-31,-26, 0,-12, 19, -6,-18,-23, -4,-13, 9,-14, 20,-45,-27; /M: SY='W'; M=-17,-20,-43,-38, 14,-41,-34, 31,-35, 28, 45,-13,-40,-24,-36,-12,-10, 28, 52,-14; /M: SY='Q'; M= 16,-20,-20, -2,-32,-20, -9,-15, -1, 0, -7, -5,-20, 37, 10, 27, 3, 1,-41,-27; /M: SY='Q'; M= -7,-23,-19, 16,-40, 4, 10,-29, 7,-10,-22, -7,-22, 69, 12, 9,-17,-23,-39,-26; /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106; /M: SY='F'; M= -4,-34,-32,-29, 61,-40,-15, -4,-23, 28, 27,-34,-42, -6,-22,-18,-17, -5, 12, 24; /M: SY='G'; M= 1,-39, 0, -1,-42, 53, -5,-44, 14,-38,-32, 13,-23, -8, 28, -7,-21,-35, -9,-33; /M: SY='L'; M=-10,-10,-33, -1, -2,-41,-16, 12, -9, 41, 22,-16,-29, 17, -6,-25,-19, 8,-36,-13; /M: SY='P'; M= -4, -3, 29, 23,-31, 19, -7,-30,-11,-10,-28, 13, 36, 1,-23, 3,-17,-25,-45,-33; /M: SY='P'; M= 11, 17, 15, 18,-25,-28, -2, -5,-14, -5, 4,-14, 39, -7, -7, 1, -7, -4,-43,-21; /M: SY='E'; M= -3, -8, 27, 36,-19, -2,-20,-35, 4,-24, 8, 4,-13, -7, 20, 15, -9,-29,-41,-11; /M: SY='A'; M= 32, -4,-25, 4, -6,-11,-26,-14, 31,-19, -3, -2,-32,-12, 12,-10, -8, 3,-36, -8; /M: SY='A'; M= 19,-22, -3, -2, 4, 9,-17, 0,-12,-11,-13,-12,-18,-13, -1, 9, 1, 17,-37, -6; /I: I=-25; MD=-63; /M: SY='Q'; M= 7,-40, -2, 16,-29,-18,-25,-32, 11, -5, -7, 0,-34, 30, 9, 3, 4,-25,-44,-23; D=-25; /I: I=-25; MD=-63; /M: SY='A'; M= 31,-42,-24,-12,-21,-25,-32,-39, 9,-22,-32,-23,-18, -6, 18, -7,-15,-33,-43, -3; D=-25; /I: I=-25; MD=-63; /M: SY='A'; M= 29,-27,-21,-30,-52,-25,-25,-42, 11,-42,-29,-15,-24,-14, 26,-26,-14,-39,-54,-44; D=-25; /I: I=-25; MD=-63; /M: SY='N'; M=-13,-54,-13, -2,-30,-24,-26,-37,-17,-13,-27, 18,-51, 3, -4,-26,-29,-35,-54,-11; D=-25; /I: I=-25; MD=-63; /M: SY='Y'; M=-21,-60,-39,-27,-43,-47, 16,-52, -6,-39,-44,-28,-43,-10,-14,-12,-10,-40,-52, 21; D=-25; /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63; /M: SY='G'; M=-12,-44,-12,-31, -6, 50, 24,-43,-31,-35,-25, -2,-41,-32,-39, 9,-30,-27,-42, 1; D=-25; /I: I=-25; DM=-63; /M: SY='D'; M=-14,-38, 42, 3,-13, 16, 2,-36, 14,-24,-22, 20,-31, 7, 7, 17,-10,-24,-16,-19; /M: SY='V'; M=-13,-20,-39,-19, 12,-36,-20, 24,-31, 31, 29,-34,-39, 7,-22, -9,-10, 34,-36,-11; /M: SY='E'; M= -9,-25, 38, 42,-37,-25,-12,-18, 13,-10,-25, 4,-29, 24, 13,-13,-14,-12,-44,-23; /M: SY='A'; M= 29,-11, 5, 10,-24, -8,-16,-34, 4,-22,-27, -3, 25, 12, 13, 14, -3,-26,-11,-30; /M: SY='F'; M=-27,-39,-44,-39, 77,-41, 1,-11,-25, -5,-12,-36,-45,-37,-16,-20,-21,-16, 76, 52; /M: SY='H'; M= 9,-11,-33,-22, -3,-32, 33, -2, 21, 28, -5,-27,-37, -8,-12,-19,-12, 11, 6, 9; /M: SY='K'; M= -5,-10, 5, 25,-22,-30, 12,-28, 27,-25,-26, 12,-22, 17, 27, 8, 5,-18,-40, -8; /M: SY='A'; M= 43,-17, -4, 7,-40, -9, 1,-35, 21,-31,-18, -5,-21, 12, 9, 16,-13,-24,-41,-31; /M: SY='M'; M=-22,-22,-39,-14, 7,-44, 11, 32,-16, 40, 45,-18,-30,-28,-32,-33,-20, 5, 23, -5; /M: SY='Q'; M= -3,-37,-17, 27, 26,-28,-24, 0, -8, 1, -8,-25,-32, 42,-17,-10, 3, 9, -7, 1; /M: SY='E'; M= -5,-40, 14, 52,-42,-21, -4,-27, 31,-34,-30, 7,-18, 19, 13, -4, -4,-30,-43,-31; /M: SY='Q'; M= 5,-21, 11, 28,-37,-11, 0,-33, 2,-20, -3, 7, 0, 37, -4, 20, 0,-24, 1,-20; /M: SY='V'; M= 11,-34, -6, 11, 16,-20,-18, 9,-15, 11,-11,-19,-27,-15,-29, 7, -6, 20,-11, 8; /M: SY='W'; M=-10,-39, 3, 1,-18, -8, -9,-11, 18, -8,-10, 7,-14, 3, -2, 6, 6,-12, 76, 4; /M: SY='G'; M= -6,-38, 15, 13,-38, 27, -8,-17, 17,-17,-26, 10,-17, 21, -1, 12, -5,-17,-42,-31; /M: SY='Q'; M= -4,-16, -5, 20,-33, -7, -7, -8, 15, -6, 2, 7, -8, 28, -5, 16, 0,-17, 7,-20; /M: SY='R'; M= -1,-22, 2, 11,-32, -7, 1,-40, 41,-37,-15, -9,-22, 21, 42, 7, -4,-35,-16,-27; /M: SY='Q'; M=-10,-39, 26, 27,-29, 0, -4,-24, 12,-11,-26, 7,-10, 32, 0, 10, -2,-24,-13,-28; /M: SY='E'; M= -6, -2, 12, 22,-31, -2,-12,-33, 20,-23,-21, 7, 6, 11, 20, 11, 6,-14,-43,-30; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 27 in 27 different sequences |
Number of true positive hits | 27 in 27 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | DEUBAD |
Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
27 sequences
ADM1A_XENLA (Q6GN67), ADM1B_XENLA (Q7ZXD6), ADRM1_BOVIN (A1L5A6), ADRM1_CAEEL (Q09289), ADRM1_CHICK (Q98SH3), ADRM1_DANRE (Q6NZ09), ADRM1_DICDI (Q556N5), ADRM1_DROME (Q7K2G1), ADRM1_HUMAN (Q16186), ADRM1_MOUSE (Q9JKV1), ADRM1_RAT (Q9JMB5), ADRM1_XENTR (Q6P877), ASXL1_HUMAN (Q8IXJ9), ASXL1_MOUSE (P59598), ASXL2_CHICK (Q5ZM88), ASXL2_HUMAN (Q76L83), ASXL2_MOUSE (Q8BZ32), ASXL3_HUMAN (Q9C0F0), ASXL3_MOUSE (Q8C4A5), ASX_DROME (Q9V727), GAT26_ARATH (Q8W4H1), GAT27_ARATH (Q5PP38), NFRKB_HUMAN (Q6P4R8), NFRKB_MOUSE (Q6PIJ4), NFRKB_XENTR (Q6P4L9), RP13A_SCHPO (Q9Y7Y6), RPN13_ARATH (O48726)» more
|
PDB [Detailed view] |
15 PDB
2KQZ; 2KR0; 2L5V; 2MKZ; 4UEL; 4UEM; 4UF5; 4UF6; 4WLP; 4WLQ; 4WLR; 6CGA; 6HGC; 8H1T; 8SVF » more |