PROSITE entry PS51994

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	BCOV_NSP3E_G2M
Accession [info]	PS51994
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	25-MAY-2022 CREATED; 25-MAY-2022 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51994
Associated ProRule [info]	PRU01338

Name and characterization of the entry

Description [info]

Betacoronavirus Nsp3e group 2-specific marker (G2M) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1119833; R2=0.0212145; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=207; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M=-11, -3,-36,  7, 13,-33,-19,-11,-24, -3,-27,-19, -9, 51,  4,-12, -6,-10,-30,-30,-25,  6;
/M: SY='V';  M= -3, -5,-16, -4, -8,-16,-20,-16, -1,-10, -9, -4, -8,-18, -5,-11,  5,  8, 11,-31,-13, -7;
/M: SY='S';  M= -1,  2,-20,  0,  4,-23,  1, -7,-18, -6,-22,-14,  9,-14,  4, -7, 13,  1,-14,-32,-19,  4;
/M: SY='P';  M= -6,  0,-29,  0,  3,-26,  8,-12,-26, -8,-26,-19,  4, 15, -6,-12,  1, -4,-26,-29,-24, -3;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-27, 16, 25,-26,-17, -6,-20,  0,-20,-17,  4,  3,  3, -7, -1, -7,-18,-33,-20, 14;
/M: SY='V';  M= -3,-17,-16,-21,-17, -9,-27,-21, 14,-14,  1,  4,-16,-20,-10,-14, -1, 11, 21,-27, -9,-14;
/M: SY='V';  M=  0,-19,-13,-19,-17, -9,-20,-20,  7,-11, -6, -1,-14,-23,-16, -6,  5,  5, 23,-32,-13,-17;
/M: SY='E';  M= -1, 10,-24, 14, 30,-28,-16, -4,-24,  3,-18,-16,  1, -5, 14, -4,  4, -1,-22,-29,-17, 22;
/M: SY='E';  M= -3,  7,-20,  8, 22,-22,-12, -5,-18, -1,-21,-16,  9,-10,  5, -5, 11,  1,-14,-34,-19, 13;
/M: SY='P';  M=-10, -2,-29,  8, -2,-25,-20,-17,-13,-10,-20,-15,-11, 30,-12,-17, -7, -7, -9,-33,-22, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I';  M=  3,-13,-13,-19,-13, -3,-15,-12, 16,-12,  7, 13,-10,-10, -7,-13, -7, -4, 10,-12, -3,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M=  4,  7,-18,  9,  9,-24,-10,-10,-23,  3,-23,-17,  4, -9,  1, -4, 14, 10,-14,-32,-17,  5;
/M: SY='V';  M= -5,-10,-19,-13, -7, -9,-22,-16,  9,-14,  1,  0, -6,-20,-12,-15, -3, -2, 10,-30,-11,-10;
/M: SY='Q';  M= -7, -3,-29, -1, 12,-33,-17, -3,-23, 17,-26, -8, -2,  4, 27,  9,  1, -6,-24,-24,-14, 19;
/M: SY='A';  M=  7,-11,-23,-15, -4,-19,-18,-14, -5,  6, -5,  0,-10,-14,  2, -2, -7, -7, -5,-20,-10, -2;
/M: SY='E';  M=  0, -3,-28,  3, 25,-27,-15,-10,-23, -1,-23,-19, -6, 25,  4,-10,  4, -5,-24,-30,-23, 13;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='M';  M= -5,  0,-12, -2, -6, -6,-12, -7,  3, -7,  0,  5, -3, -8, -4, -8, -3,  3,  2,-15, -4, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I';  M= -7,-25,-24,-29,-18, -4,-34,-26, 33,-22, 12, 12,-20,-20,-18,-23,-14, -7, 28,-24, -6,-21;
/M: SY='I';  M= -7,-25,-26,-28,-20, -8,-32,-26, 24,-14,  3,  7,-20, -4,-17,-18,-15, -7, 20,-24, -9,-22;
/M: SY='K';  M=-10, -2,-28,  1, 20,-24,-22, -9,-22, 26,-15, -8, -5,-10,  8, 13,-10,-10,-18,-23,-11, 14;
/M: SY='C';  M=-10,-24, 41,-28,-26, -1,-30,-19, -4,-26,  6, -2,-24,-34,-24,-23,-17, -9,  3,-27, -2,-26;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='K';  M= -4,  0,-18,  0,  5,-19,-11, -7,-19, 25,-20, -8,  1, -7,  5, 15,  0, -2,-12,-16, -8,  5; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G';  M= -3,  0,-30,  3,-13,-32, 57,-17,-40,-17,-30,-22,  3,-18,-17,-18,  0,-18,-30,-23,-28,-15;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 27, 14,-30,-30,-26,-20,-19, -4, 33,-26, -6,-26;
/M: SY='K';  M=-11,  4,-29,  1,  7,-27,-17, -6,-29, 41,-29,-11,  8,-13,  9, 31, -7, -9,-21,-23,-11,  7;
/M: SY='K';  M=  1, -2,-24, -5,  4,-25,-17,-13,-24, 31,-24,-10, -2,-10,  4, 16, -2,  2,-14,-22,-12,  4;
/M: SY='P';  M= -5,-11,-26,-10, -5,-21,-20,-20,-15,-10,-21,-15,-11, 45,-10,-15,  4, 17,-16,-30,-21,-10;
/M: SY='F';  M=-12,-22,-19,-26,-14, 28,-27,-16,  6,-18,  7,  9,-19,-23,-21,-15,-14, -7, 10,-12,  7,-15;
/M: SY='V';  M= -4,-18,-18,-18,-14,-12,-26,-22,  6,  8, -6,  2,-18,-22,-14,  0,-10, -4, 22,-26,-10,-14;
/M: SY='V';  M= -6,-22,-20,-23,-17, -7,-29,-23, 15, -4,  7,  7,-20,-23,-16, -8,-14, -6, 22,-24, -7,-17;
/M: SY='D';  M=-11, 22,-28, 29, 26,-31,  1, -2,-33,  1,-26,-23, 15, -9,  5, -6,  2,-10,-30,-33,-22, 16;
/M: SY='G';  M= -8, 21,-27, 21, -3,-30, 27, -6,-34, -9,-30,-23, 23,-17, -9,-11,  3,-11,-30,-31,-24, -6;
/M: SY='T';  M=  6,-13,-13,-16,-15, -5,-16,-14,  1,-13, -8, -5,-10,-19,-13,-14,  9, 12, 11,-23, -1,-15;
/M: SY='V';  M=  0,-17,-16,-22,-19, -7,-23,-23, 16,-19, -1,  2,-11,-18,-16,-19,  5, 10, 20,-30,-10,-19;
/M: SY='F';  M=-13,-28,-23,-34,-27, 28,-33,-18, 21,-26, 18, 10,-23,-27,-25,-21,-20, -9, 15, -5, 19,-27;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-13,-25,-23, -5,-28,-27, 20, -8,  3,  7,-25,-27,-23,-12,-10, -2, 38,-28,-10,-23;
/M: SY='N';  M= -2, 14,-25,  5, -1,-23, -6, -3,-19, -4,-27,-19, 25, 17, -4, -9,  4, -3,-26,-34,-23, -4;
/M: SY='D';  M=-12, 32,-27, 46, 10,-35,  4, -5,-37, -5,-30,-27, 15,-12, -3,-12,  7, -7,-27,-37,-22,  4;
/M: SY='D';  M=-14, 24,-31, 34, 17,-33,-13, -4,-30, -1,-29,-24, 13, 17,  0,-10, -1, -8,-30,-36,-23,  7;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-21,  3, 12,-23,-15, -5,-21,  7,-21,-13,  9,-10, 11,  2, 10, 11,-18,-30,-14, 11;
/M: SY='G';  M=  4, -6,-22, -6,-12,-26, 42,-16,-32,-16,-30,-20,  4,-16,-12,-16, 16, -4,-22,-28,-26,-12;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-14,  5, 16,-14, -9, 14,-15,  0,-13, -8,  3, -4,  7, -1,  4, -3,-14,-18, -5, 11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -4,-22,-17,-28,-23, -1,-30,-26, 24,-22, 14,  9,-20,-22,-21,-20, -8,  8, 25,-26, -6,-23;
/M: SY='K';  M=-10, -1,-28, -3,  3,-22,-19,-10,-19, 23,-18, -8,  2, -2,  1, 11,-10, -9,-18,-24,-12,  1;
/M: SY='V';  M= -4,-27,  7,-29,-29,  1,-30,-23, 16,-20,  4,  4,-27,-32,-27,-20,-11, -3, 32,-25,  0,-29;
/M: SY='V';  M= -3,-25,-14,-28,-25,  0,-30,-27, 25,-21, 14, 10,-24,-25,-24,-20,-10,  5, 33,-27, -7,-25;
/M: SY='K';  M=-11,  9,-30, 13, 20,-33,-19, -4,-30, 31,-27,-13,  3, -9, 18, 17, -6,-10,-24,-24,-13, 19;
/M: SY='S';  M= -2,  1,-19,  2, 15,-15,-13, -4,-19, -4,-20,-16,  1, -9,  4, -7, 17, 11,-15,-26, -6,  9;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-16, -5, -8,-22, 19,-15,-25,-13,-27,-18,  5,-13, -8,-13, 24, 12,-15,-32,-22, -8;
/M: SY='I';  M=-12,-21,-27,-25,-17, -4,-31, -3, 18,-16, 16, 13,-15,-22,-11,-14,-20,-12,  8,-22,  2,-17;
/M: SY='E';  M= -6, -2,-19,  3,  7,-16,-23,-15, -4, -7, -8, -8, -9,-15, -8,-11, -1,  3,  7,-31,-14,  0;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 34, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 26,-24, -4,-24;
/M: SY='Y';  M=-17,-16,-31,-17,-10, -2,-23, 16,-11, -2, -8,  6,-13,-22,  7,  5,-17,-14,-16, 15, 25, -4;
/M: SY='D';  M=  8, 17,-18, 19,  2,-25,-10,-12,-22, -6,-18,-18,  5,-10, -6,-13,  9, 10,-12,-31,-17, -2;
/M: SY='M';  M= -2,-23,-18,-30,-20, 12,-21,-12, 12,-19, 22, 28,-21,-23,-13,-16,-18, -8,  7,-15,  1,-16;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-32,-25,-23, 34,-29,  8, -3,-14, -2, -3,-23,-30,-15,-13,-23,-13,-12, 45, 66,-21;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 26, 14,-30,-30,-26,-20,-18, -4, 34,-26, -6,-26;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-22, 22, 21,-25,-17, -8,-25, -1,-19,-19,  6, -7,  2, -7,  8, 14,-18,-33,-16, 12;
/M: SY='G';  M= -6, -3,-30, -5,-11,-27, 34,-12,-33, -8,-29,-19,  7, -6,-11, -3, -1,-14,-29,-25,-25,-12;
/M: SY='C';  M= -7, -7, 38,-15,-17,-17,-23,-20,-16,-10,-16,-12, -4,-27,-17,-13, -2,  3, -3,-38,-20,-17;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-11,  1,-28,  5,  7,-28,-15, -5,-27, 13,-26,-15,  1,  3, 10, 19,  1, -5,-23,-28,-16,  6;
/M: SY='Y';  M=-13,-26, -3,-31,-26, 19,-32,-14, 11,-24, 11,  5,-23,-30,-23,-20,-19, -9,  9, -8, 20,-26;
/M: SY='V';  M= -3,-25,-16,-29,-27, -2,-31,-28, 29,-21,  9,  9,-22,-24,-24,-21, -8,  6, 36,-27, -7,-27;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-15,-32,-28,  2,-32,-28, 32,-23, 18, 13,-28,-28,-27,-22,-15, -3, 40,-27, -7,-28;
/M: SY='W';  M=-14,-25,-31,-25,-15, -1,-24,-18, -6, -6,  8,  0,-23,-25,-11,  1,-26,-15,-10, 24,  5,-12;
/M: SY='K';  M= -6, -4,-22, -7, -1,-21,-21,-15,-17, 24,-19, -7, -4,-13, -1, 13, -2,  8, -5,-24,-10, -1;
/M: SY='A';  M= 22, -1,-20, -1,  6,-26, -8,-14,-18, -6,-17,-16, -6,  8, -4,-16,  4, -4,-13,-26,-22,  0;
/M: SY='N';  M= -7, 34,-18, 17,  0,-20,  0,  7,-20, -2,-30,-20, 52,-18,  0, -2, 15,  3,-27,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M= -2,  5,-23,  5, 20,-22,-15, 10,-18, -1,-16,-12,  5,-11,  5, -5,  0, -7,-15,-30,-13, 12;
/M: SY='L';  M=-11,-31,-24,-31,-21, 10,-29,-21, 14,-29, 40, 14,-31,-30,-20,-20,-31,-13,  4,  5,  4,-20;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M= -3,-10,-23,-12, -3,-17,-16, -9,-17, 12,-10, -6, -5,-17,  1, 25, -4, -5,-11,-23,-11, -3;
/M: SY='L';  M= 10,-23,-15,-27,-18, -2,-19,-19, 12,-20, 21, 14,-23,-23,-16,-19,-13, -5, 13,-22, -8,-17;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-16,-31,-26, 16,-30,-24, 21,-26, 28, 13,-29,-30,-27,-20,-20, -6, 25,-20,  0,-26;
/M: SY='N';  M= -8, 12,-26,  4, -5,-25, 17, -4,-29,  4,-29,-17, 25,-19, -4,  7,  2, -9,-27,-28,-21, -5;
/M: SY='L';  M= -3,-22,-17,-24,-18, -1,-24,-20, 15,-23, 19,  8,-18,-23,-16,-19, -7, -1, 13,-27, -7,-18;
/M: SY='P';  M=-14,-10,-34, -6,  2,-26,-20, 18,-26,  6,-26,-11, -5, 26,  2,  8,-10,-13,-27,-27,-10, -2;
/M: SY='T';  M=  0, -5,-10,-13,-13, -8,-22,-22, -4,-12, -7, -7, -5,-13,-13,-12, 15, 42,  8,-30,-10,-13;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-16,-28,-25, -3,-28,-27, 28,-22,  7,  8,-21,-24,-22,-22, -5,  0, 35,-28, -8,-25;
/M: SY='R';  M= -6,  5,-27,  9, 18,-26,-15, -3,-28, 13,-20,-16,  1,-11,  8, 23, -2, -8,-21,-26,-16, 11;
/M: SY='E';  M= -3,  3,-21,  4, 17,-24,-14, -9,-24, 13,-24,-15,  3, -7,  6,  4, 12,  8,-16,-30,-15, 12;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='Y';  M= -7,-10,-12,-11,-10, 16,-12,  1, -3, -8, -3, -3, -7,-14, -8, -7, -2, -1, -4,  3, 22,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='I';  M= -4,-17,-13,-20,-15,  2,-20,-15, 21,-15, 15, 10,-14,-14,-12,-14,-11, -4, 16,-12, -1,-15; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='R';  M=-10, -3,-17, -3,  1,-12,-11, 14,-17, 13,-12, -4,  2,-10,  6, 23, -6, -7,-13,-13, -1,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='Y';  M=-12,-11,-23,-10, -1, -1,-17, 12, -9, -9, -1, -2,-11,-16, -2, -7,-14,-11,-13, 11, 15, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-19,-10,-13,-16, 24,-14,-13,-14,-15, -9, -1,-13,-11,-14,  3, -7,-10,-18,-16,-13; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='M';  M= -7,-12,-20,-16, -9, -9,-20,-12,  9,  5,  0, 11, -9,-12, -3, -1,-12, -7,  4,-14, -3, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G';  M=  6,-10,-28,-10,-11,-28, 34,-19,-31, -8,-27,-17, -5, -1,-13,-13, -1,-14,-24,-21,-26,-13;
/M: SY='D';  M=  0,  0,-22,  6, -4,-22,-17,-16,-10, -3,-15,-11, -8, -3,-11,-11, -4, -5,  0,-30,-17, -8;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-24,-37,-29, 13,-36,-27, 35,-28, 21, 16,-23,-24,-24,-26,-20, -8, 26,-17,  3,-29;
/M: SY='N';  M= -6, 11,-17,  0, -8, -8,-11,  0, -9, -7,-18,-12, 21,-20, -7, -7,  9,  8,-10,-27, -2, -8;
/M: SY='V';  M=  8,-18,-13,-22,-19, -8,-20,-24, 13,-17, -1,  1,-15,-20,-18,-18,  4,  8, 23,-29,-12,-19;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-24,-25,-21, -3,-29,-20, 15,-17, -1,  2,-24,  3,-20,-20,-13, -6, 17,-19,  0,-23;
/M: SY='A';  M= 23,-13,-20,-18, -8,-20,-11,-20, -7, -4,-12, -8,-12,  5, -8,-14,  0, -4, -4,-22,-18,-10;
/M: SY='A';  M= 21, -6,-22, -9, -7,-19, -7,-18,-18, -3,-17,-14,-10,-13, -8,-12, -2, -8,-12,  6,-10, -6;
/M: SY='T';  M=  2,-12,-13,-14,-11, -8,-15,-17, -1,-17,  0, -4, -8,-18,-11,-14, 12, 14,  5,-32,-12,-11;
/M: SY='R';  M=-10,-14,-27,-14, -9,-17,  2,-12,-20,  4, -6, -5, -8,-21, -6, 15,-12,-13,-15,-20,-13, -9;
/M: SY='I';  M= -4,-10,  0,-16,-15, -8,-19,-16,  2,-20,  2, -2, -3,-23,-13,-17, -1,  0, -1,-32,-12,-15;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-21,-24,-16,  0,-28,-20, 13,-15, 25, 11,-20,-23,-14,-13,-18, -1,  7,-22, -3,-16;
/M: SY='T';  M=  2, -9,-18,-16,-10,-13,-20,-16, -7, -2, -8, -6, -5,-14, -6,  6,  5, 17, -1,-24,-10,-10;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='R';  M=-12,  9,-22, 14,  5,-22,-11, -1,-26, 11,-21,-15,  7,-13,  4, 26,  1, -4,-18,-25,-12,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='V';  M= -7,-18,-18,-20,-14, -5,-24,-17, 10, -3,  6,  6,-15,-20,-11,  2,-12, -6, 14,-20, -6,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='K';  M= -4, -8,-16,-10, -6,-14,-19,-15, -5, 13,-11, -3, -8,-14, -6,  5, -4,  4,  6,-21, -8, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='W';  M=-11,-16,-30,-18,-11, -6,-17,-18,-18,  4,-18,-12,-16,-16, -7, -1,-16, -7,-18, 50,  8, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='L';  M= -7,-20,-17,-23,-16, 11,-22,-17, 12,-22, 20,  8,-16,-20,-16,-17,-11, -4,  7,-16,  1,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='L';  M=-11,-25,-17,-28,-19, 28,-25,-17, 11,-25, 31, 11,-22,-25,-22,-17,-22, -8,  6, -8,  8,-19; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-17,-28,-21, 15,-26,-19, 20,-24, 27, 13,-22,-24,-21,-18,-20, -7, 15,-14,  2,-21; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='Y';  M= -9,-14,-24,-14,-14, -2,  6, -4,-13, -9, -4, -4,-10,-21,-10, -3,-11,-11,-13, -4, 10,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A';  M= 11,-15,  4,-19,-17,-11, -1,-19, -6,-17, -1, -4,-14,-19,-17,-18, -4, -6,  2,-22,-15,-17; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='F';  M= -7,-17,-14,-21,-15, 28,-17,-14, -2,-20,  4, -2,-10,-20,-19,-14, -2,  0, -1,-10,  7,-15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='S';  M=  1,-10,-12,-11,-11, -2,  2,-14, -9,-14,-14, -9, -3,-15,-13,-13, 12,  4, -1,-23,-10,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='W';  M=-14,-25,-30,-27,-21, 13,-26,-11, -1,-18,  7, -1,-25,-27,-16,-16,-22, -6, -8, 39, 30,-18;
/M: SY='F';  M=-13,-27,-23,-32,-24, 20,-31,-21, 17,-19, 13,  8,-20,-26,-23, -9,-18, -8, 15,-13,  5,-24;
/M: SY='K';  M=  1, -1,-24, -3,  4,-26,-14,  3,-26, 24,-26,-10,  1,-11,  6, 12,  1, -5,-17,-24, -9,  4;
/M: SY='F';  M=-11,-19,-26,-20, -6,  6,-27,-16,  2,-14, -3, -1,-16, -2, -8,-14,-11, -8, -1,-17, -3, -7;
/M: SY='F';  M=-12,-10,-19,-18,-15, 25,-19,-12,-11,-11, -8, -8,  0,-22,-17, -1, -1,  4, -8,-14,  5,-15;
/M: SY='A';  M= 16, -4,-16,-12, -7,-15,-11,-14, -9, -3, -6, -6, -1,-15, -7, -8,  2,  3, -5,-24,-14, -7;
/M: SY='D';  M= -7, 19,-21, 24,  2,-27,  2,-10,-29, -8,-24,-21, 10,-12, -6,-12, 12, 10,-19,-34,-19, -2;
/M: SY='N';  M= -1,  4,-21, -3, -1,-22,-13, -4,-14,  8,-18, -8, 10,-17,  7,  9,  0, -4,-11,-27,-14,  2;
/M: SY='T';  M=  2,  6,-19,  3,  0,-22,-15,-14,-20,  8,-19,-13,  1,-10, -3, -1,  7, 16,-10,-27,-13, -1;
/M: SY='V';  M=  1,-27,-15,-33,-27, 19,-26,-26, 18,-23,  8,  5,-23,-25,-28,-21,-11, -4, 25,-16,  1,-27;
/M: SY='I';  M= -8,-16,-22,-26,-23,  6,-29,-22, 22,-21,  6,  6, -7,-22,-20,-20, -9,  1, 16,-22, -2,-23;
/M: SY='Y';  M= -5,-15,-21,-18,-15,  5,-23, -2, -3, -5, -5, -3,-14,-23,-10,  0, -6,  3,  0, -3, 25,-15;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,  2,-10, -8,-10, 23, 45, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,  2,-10, -8,-10, 23, 45, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='E';  M=  7, 14,-21,  9, 21,-24, -8, -2,-21,  1,-20,-17, 17, -9,  5, -6,  6, -4,-22,-30,-20, 13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	42 in 42 different sequences
Number of true positive hits	42 in 42 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	G2M
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

42 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9), R1AB_BCHK3  (P0C6W2),

R1AB_BCHK4  (P0C6W3), R1AB_BCHK5  (P0C6W4), R1AB_BCHK9  (P0C6W5), 
R1AB_BCRP3  (P0C6W6), R1AB_CVBEN  (P0C6W7), R1AB_CVBLU  (P0C6W8), 
R1AB_CVBM   (P0C6W9), R1AB_CVBQ   (P0C6X0), R1AB_CVHN1  (P0C6X2), 
R1AB_CVHN2  (P0C6X3), R1AB_CVHN5  (P0C6X4), R1AB_CVHOC  (P0C6X6), 
R1AB_CVM2   (P0C6X8), R1AB_CVMA5  (P0C6X9), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), 
R1AB_MERS1  (K9N7C7), R1AB_SARS   (P0C6X7), R1AB_SARS2  (P0DTD1), 
R1A_BC133   (P0C6F7), R1A_BC279   (P0C6F5), R1A_BCHK3   (P0C6F8), 
R1A_BCHK4   (P0C6T4), R1A_BCHK5   (P0C6T5), R1A_BCHK9   (P0C6T6), 
R1A_BCRP3   (P0C6T7), R1A_CVBEN   (P0C6T8), R1A_CVBLU   (P0C6T9), 
R1A_CVBM(P0C6U0), R1A_CVBQ(P0C6U1), R1A_CVHN1   (P0C6U3), 
R1A_CVHN2   (P0C6U4), R1A_CVHN5   (P0C6U5), R1A_CVHOC   (P0C6U7), 
R1A_CVM2(P0C6U9), R1A_CVMA5   (P0C6V0), R1A_CVMJH   (P0C6V1), 
R1A_MERS1   (K9N638), R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2   (P0DTC1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

7T9W