PROSITE logo

PROSITE entry PS52031


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] GG_LECTIN
Accession [info] PS52031
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 08-NOV-2023 CREATED;
08-NOV-2023 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC52031
Associated ProRule [info] PRU01375

Name and characterization of the entry

Description [info] GG-type lectin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=163;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=163;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3806356; R2=0.0117180; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=864; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=565; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M= -1, 23,-21, 17, -1,-22,  7,-15,-14,  5,-18, -8, 33,-10, -7, -9, -1, -4,-22,-39,-26, -4;
/M: SY='S';  M=  8,  0,-25,  2,  0,-20, -7,  2,-10, -4,-12, -8, -1, -7,  3, -8, 13,  8, -9,-32,-15, -1;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-30,-25,-25, 27,-25,-11, 19,-14, 22,  2,-19,-31,-20,-12,-14, -4, 22, -2, 32,-25;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='A';  M= 10, -3,-24, -2, -2,-13, -7,-13,-11,  4,-10,  1, -2, -7,  9,  7,  1, -2, -7,-28,-17, -1;
/M: SY='F';  M=-21,-26,-37,-29,-28, 55,-29,-18,  0,-11, 21,-12,-20,-30,-17, -6,-12, -9, 12, 14, 44,-27;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='R';  M= -3, -7,-21, -4, 10,-12,-13, -3,-18, 14,-13,  4, -8,  1, 18, 20, -3,-10,-15, -9, -2, 10; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='I';  M= -1,-12,-12,-17,-15,  8,-11,-12, 21,-11, 17, 10, -9,-25,-17,-14, -8,  1, 15,-19,  6,-16; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S';  M= -2, -8,-15, -6,  0, -6,-13, -2, -8,  0, -5, -4, -7, -3, -2,  0,  1, -2, -5,-17, -3, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S';  M=  9, -2,-18, -4, -6, -8, -1,-13,  4, -4, -8, -9, -1,-13,-10,-11, 18, 10,  3,-26,-15,-12; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='G';  M=  4, -3,-22, -5, -3,-16, 20,-16, -8, -1,-10, -4, -4, -7, -1, -2,  0, -8,-13, -8,-15, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='G';  M= 11, -1,-26, -5, -7,-20, 28,-19, -7, -3,-13, -6, -1, -7, -3, -8,  5, -4,-11,-13,-24, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S';  M= 11,  0,-21,  1,  1,-17, -2, -1, -7, -2,-10, -5, -2, -6, -2,-10, 12,  6, -5,-29,-18, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='N';  M= -4,  7, 16, -4, -1,-12,-10,-17, -7,  0,-11, -2, 22,-15, -6, -6,  1,  0,-12,-33,-26, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='A';  M=  8, -5,-16, -2, -4,-10,-14,-13,  4, -6, -3, -5, -8,-10,  0, -4,  0,  6,  8,-23, -5, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='D';  M=  2,  0,-15,  6, -1,-10,-11,-12, -3,  1, -4, -3, -6, -5, -4,  0, -2, -2,  1,-18, -4, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-22, -5, -4,-14, 11, -3, -9, -3,-11,-12, -6,  6, -3, -7,  6,  1,-14, -8, -8, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -3, -3,-20,  0,  1, -1, -9, -9, -9,  8, -4,  0, -4,  3, -3, -1,  0, -1, -6, -9,  3, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  4, -9,-13,-18,-15, -2,-10,-10, 25, -8, 10, 10,  1,-20,-11,-14, -5,  4, 18,-24, -6,-15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='C';  M= -8, -6, 49, -6,  7,-16,-17,-22,-12, -6, -3, -6, -5,-12, -6, -5, -6, -9,-10,-15,-24,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='V';  M= -1, -8,-15,-10,-16, 11,-17,-16,  9, -9,  8, -4, -7,-14,-14,-12, -4,  5, 12,-19,  7,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E';  M=  4,  1,-15,  5, 12,-24, -6,  2,-15,  3,-12,-10, -2, 10,  9, -6,  2, -1,-17,-23,-16, 10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D';  M= -1, 11,-21, 16, -4,-15,  6,-17,-13, -1,-10,-12,  5,-12, -7, -6,  1, -7,-12,-11,-10, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M= -1, -3,-15,-10, -5, -8,-11,-10,  7, -1, -2,  1,  6, -7, -4, -9, -2,  2,  3,-23, -8, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  3,-11,-18,-17,-12, -6, -9,-11, 15, -3,  5,  9, -5,-13, -9, -9, -4,  2, 10,-23, -6,-12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='L';  M= -4,-11,-13,-13,-11, 11,-17,-12, 14,-12, 18,  5,-13,-22,-13,-14, -7,  2, 12,-15, 15,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  2, -5,-16,-12,-16,  5,-13,-12, 14, -5,  8,  9,  3,-29,-17,-10, -9,  1, 11,-25, -1,-17; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G';  M=  1, 11,-20, 11,  2,-21, 14,-15,-12,  2,-13,-11,  9, -8, -7,-11,  5, -5,-17,-19,-19, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G';  M=  3, -4,-21, -5, -6, -6,  6,-16, -4, -2, -7, -9, -5, -8, -8, -6,  2, -5, -5,-13,-11, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='Q';  M=  5, -2,-15, -2,  2,-16,-11,-12, -5,  0, -8, -5, -1, -7,  9, -2,  3,  7, -4,-22, -9,  4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D';  M= -2,  0,-19,  7,  3,-12,-16,-13,-11,  3,  0,  2, -8,-10,  3,  6, -5, -6, -6,-20,  2,  2;
/M: SY='N';  M= -5,  6,-22,  0,-10,  2, -5,-15, -7, -2, -5, -5, 14,-21, -6, -3, -4, -5, -9,-24, -5,-10;
/M: SY='N';  M=  1, 16,-18, 12, -1,-22, -3,-10,-12,  0,-15,-13, 22,  2, -7,-16,  6,  8,-18,-43,-22, -5;
/M: SY='F';  M=  1,-14,-16,-22,-17, 17,-18,-23,  9,-11,  3, -7, -8,-26,-10, -9, -2,  1, 11,-13,  1,-16;
/M: SY='G';  M=  2, -4,-34, -8,-13,-21, 43,-21,-12, -5,-17,-15, -4,-10, -7, -4,  5,-11,-20,  0,-20,-13;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='R';  M=  0, -7,-21, -2, -8,-12,-14,-14,-16,  6,-15,  0, -5,-13, 14, 41, -4,-15, -5,-19,-10, -4;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20,  0,-10,-20,-20,  0,-20,-30, 10,-30,-20;
/M: SY='I';  M= -2,-16,-13,-27,-22, 12,-16,-18, 39,-19, 26, 12, -9,-31,-20,-23,-13,  0, 27,-25,  7,-22;
/M: SY='N';  M= -2, 21,-14,  1, -9,-10, -8,  4,  2, -6,-10,  4, 48,-23, -5,-17, -3,  7,-14,-56,-24, -7;
/M: SY='I';  M=  3,-14, -8,-20,-19,  9,-19,-21, 28,-17, 18,  8,-12,-30,-19,-18,-10,  3, 25,-28,  3,-19;
/M: SY='V';  M= 11,-13,-24,-15,-13, -2,-15,-13, 11, -6,  1,  7, -9,-19, -3,  1, -4, -2, 16,-30, -9,-12;
/M: SY='I';  M=  5,-15,-18,-19,-19,  1,-23,-14, 29,-15, 13,  7,-12,-28,-19,-16, -8,  8, 29,-31,  4,-19;
/M: SY='I';  M=  0,-18,-16,-26,-26, 17,-21,-22, 37,-19, 21,  6,-13,-34,-24,-18,-12,  2, 33,-24, 10,-26;
/M: SY='D';  M=  1, 38,-20, 48,  2,-32, -7,-15,-21,  0,-13,-16, 32,-15, -8,-15,  3,  3,-17,-49,-21, -3;
/M: SY='P';  M=  0,-10,-32, -9, -1,-28, 17,-10,-15, -1,-18,-20,-14, 27,  3, -8, -5, -7,-24,-11,-17, -2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M=  2,  3,  2,  5,  6,-18,-13,-19,-12,  3,-10, -5,  1, -8, -6, -9,  7,  3, -8,-28,-18,  0; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='T';  M=  8,  2,-19, -7,-14,-11,-14,-17, -3, -6, -5, -4, 12, -8, -1,-19, 17, 31,  2,-43,-13, -9;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-34, -9,-13,-25, 52,-25, -7, -6,-15,-14, -4, -6,-15,-17, -1,-14,-20, -2,-24,-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=  4, -2,-23,  1,  9,-21,-14, -1,-16,  9,-14,  1, -3,  3,  9,  5,  1, -3,-13,-28,-13,  7;
/M: SY='V';  M=  5,-16,-16,-19,-23,  9,-24,-23, 34,-19, 17,  6,-16,-34,-24,-15,-10,  8, 36,-29, 10,-23;
/M: SY='I';  M=  3,-12,-18,-18,-18, -2,-20,-10, 22,-12, 12, 10, -7,-23,-15,-18, -4, 13, 20,-33,  2,-17;
/M: SY='D';  M=  8, 10,-19, 18, 18,-29,-10, -6,-19,  9,-11, -2,  2, -4,  3, -8,  3, -6,-14,-31,-19, 12;
/M: SY='T';  M=  4,  1,-23, -4,  1,-14,-12, -3, -8,  5,-10,  3,  8, -7,  1, -8,  8, 10, -9,-34,-12, -1;
/M: SY='K';  M=  3,  1,-22,  3,  4,-12,-10,-16,-15, 11,-11,  2,  0, -6,  3,  7,  2, -5,-10,-25,-12,  2;
/M: SY='T';  M=  1, -9,-20, -8, -9, -9,-19, -1, -3, -4, -1,  4, -7,-14, -6, -3,  2,  6,  2,-27, -2, -9;
/M: SY='F';  M=-21,-28,-34,-42,-35, 84,-29,-22, -2,-10, 19,-18,-13,-35,-26, -9, -9,-17,  8, 12, 35,-36;
/M: SY='D';  M=  0, 29,-28, 55,  4,-33,-10,-16,-29,  0, -9,-22,  5, -8, -7, -5,  3, -5,-15,-33, -8, -3;
/M: SY='M';  M=  3, -9,-20,-19,-18,  2,-15,-10,  7, -2,  9, 13,  2,-25,-13,-14, -1, 12,  6,-30, -3,-16;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='Y';  M=-19,-20,-35,-11,-11,  9,-15,  0, -8, -9,  8, -7,-25,-14, -6, -4, -8, -6,  1, 29, 37,-11; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='F';  M= -2, -2, -9, -3, -2,  1, -7, -5, -3, -1, -2, -5,  0, -6, -4, -2,  1,  0, -3,-11,  0, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='P';  M=  2,  1,-21,  3,  2,-21, -1, -8,-15,  4,-14, -9, -1,  7,  6,  0,  3,  0,-16,-21,-14,  2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G';  M=  6,  8,-28,  9, -5,-25, 15,-13,-10, -4,-10, -7,  4, -9, -8,-15,  2, -1,-12,-26,-19, -7;
/M: SY='D';  M=  3, 15,-16, 23, 11,-29,-13, -7,-13,  0, -7,-10,  8, -9, -2,-15,  2, -2,-10,-35,-16,  6;
/M: SY='S';  M=  6, -4,-23, -1,-11, -7,-10,-18,  1, -7, -8,-15, -7,-10,-15,-12, 13, 12,  6,-29, -8,-16;
/M: SY='E';  M=  2,  1,-19,  4,  9,-19, -4,-10,-14,  5,-11, -3, -1, -9,  1, -4, -1, -8,-14,-14,-13,  5;
/M: SY='P';  M=  7, -8,-27, -5, -1,-22, -5, -3,-15,  3,-13, -2, -9, 10, 10,  8, -3, -4,-12,-27,-17,  0;
/M: SY='F';  M= -8,-17,-12,-24,-15, 30,-22, -9, 12, -8, 28, 16,-13,-33,-19,-14,-16, -6,  7,-14, 19,-16;
/M: SY='I';  M=  2,-14,-17,-18,-10, -4,-17,-15, 11, -6,  4,  3, -8,-19,  1, -2, -6,  0, 10,-21, -3, -7;
/M: SY='E';  M=  2,  5,-14,  6, 12,-16,-12,-12,-15,  7, -9, -7,  4, -5,  2,-10,  9,  4,-14,-27,-13,  8;
/M: SY='F';  M=-30,-32,-38,-34,-29, 64,-25,-22, -7,-11, 19,-17,-28,-32,-21, -6,-16,-20,  5, 46, 52,-29;
/M: SY='L';  M= -4,-14,-10,-18,-16, 15,-20,-15, 26,-15, 28, 15,-15,-31,-21,-17,-16,  1, 19,-23, 17,-16;
/M: SY='N';  M=  4,  9,-21,  1, -2,-15, -2,-13, -9,  6,-13,  3, 20,-13,  1, -2,  2,  2,-14,-35,-20, -3;
/M: SY='A';  M= 13, -2,-22, -3,  1,-15, -4,-13, -7,  3, -9, -2, -2, -5, -2,-11, 13, 10, -5,-32,-19, -2;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M=  2,-16,-18,-23,-20,  4,-17,-18, 35,-17, 19,  9,-10,-28,-14,-19,-10,  3, 28,-26,  4,-19;
/M: SY='P';  M=  2,-10,-26, -4, 11,-32,-11,  4,-21, 10,-19,-14,-15, 51,  5, -7, -4,  0,-24,-32,-20,  6;
/M: SY='P';  M=  4,  7,-28, 16,  5,-32, -4, -4,-20,  3,-16,-16, -1, 21, -2,-12,  3,  2,-19,-36,-20, -1;
/M: SY='G';  M=  0, 10,-27,  1,-11,-21, 29,-20,-12,  0,-19, -9, 18,-14, -6, -2,  0,-11,-21,-20,-26,-11;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='R';  M= -2, -8,-23, -6, -8, -3,-12,-11,-14,  2,-11, -7, -5,-10,  3, 15, 11,  2, -6,-16, -2, -8; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -1,-18,-16,-32,-26,  5,-14,-19, 51,-20, 22, 11, -6,-31,-21,-26,-12,  1, 36,-28, -1,-26;
/M: SY='V';  M=  4,-18,-16,-22,-26, 14,-25,-25, 37,-20, 18,  5,-17,-37,-27,-15,-12,  6, 39,-26, 12,-26;
/M: SY='L';  M=  5,-11, -3,-15,-11,  9,-16,-20, 12,-13, 14,  7,-10,-26,-13,-15, -7,  1, 12,-28, -3,-12;
/M: SY='I';  M=  0,-17, -6,-25,-18,  7,-21,-12, 24,-10, 21, 19,-10,-34,-19,-15,-14, -1, 18,-25,  2,-18;
/M: SY='A';  M= 21, -8,-26, -9,-11, -8,-10,-19, 11, -6,  0,  7, -6,-19, -5,-12,  4, 10, 18,-37,-16,-11;
/M: SY='T';  M= 10, -3,-20, -6,-11,-11,-11,-16,  1, -6, -9,-10,  1,-11, -9,-17, 26, 29,  5,-37,-12,-13;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-35,-14,-12, 14,-14,  4,-11, -2,  2, -3, -9,-15, -7,  3, -6,-11, -7, -3, 19,-13;
/M: SY='D';  M=  0, 30,-32, 48, -2,-40, 21,-23,-27, -4,-13,-24,  9,-10,-13,-15,  1,-10,-22,-24,-18, -8;
/M: SY='D';  M=  3, 12,-14, 28, 25,-33,-13,-11,-28, 11,-13,-11, -3, -1, 10,  2,  2,-11,-20,-23,-16, 19;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='G';  M=  3, -9,-22,-11, -9,-11,  8,-11,  0, -4, -5, -7, -9,  6,-10,-12, -3, -2, -6,-17,-11,-11; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='A';  M= 11, -2,-18, -2, -4, -8,  3,-11, -1, -2, -6, -3, -3, -8, -2, -7,  9,  5,  1,-18,-13, -6; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='T';  M=  1, -1, -9, -5, -4, -2, -9, -9, -3,  0, -1,  0,  3, -4, -1, -5,  4,  8, -1,-17, -3, -2; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N';  M= -4,  5,-21, -1,  2, -8, -9,  5, -9,  8,-11,  6, 15, -7,  0, -1, -2, -3,-14,-27, -8,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L';  M=  0,-14,-14,-19,-16, 13,-18,-12, 19,-10, 20, 13,-11,-30,-19,-14, -8,  2, 15,-23,  9,-17;
/M: SY='N';  M=  2,  8,-22,  4, -3, -9, -9,-14,-10,  4,-11, -7, 14, -3, -7,-12,  8,  9,-11,-37,-15, -7;
/M: SY='D';  M=  4, 13,-19, 24, 14,-32,-12, -9,-24,  5,-15,-14,  5,  2, 15,  4, -2, -7,-21,-31,-18, 13;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  4,  6,-15,  5, 11,-27, -9, -9,-12,  6,-10, -3,  9, -1,  6,-11,  0,  2,-15,-32,-19, 10;
/M: SY='V';  M= 10,-12,-23,-17,-14,  3,-10,-22, 14, -9,  3,  1, -9,-22,-10,-14,  1,  4, 15,-19, -8,-15;
/M: SY='R';  M=  2, -3,-23,  0, -3,-15,-14,-15,-12,  7,-12,  0, -2, -8, 10, 19,  0, -4, -5,-23, -9, -1;
/M: SY='Q';  M=  5, -1,-21,  3,  5,-21,-15, -6,-16,  7,-12,  1, -1, -7, 15, 12,  0, -3,-11,-26,-12,  7;
/M: SY='Y';  M=-10,-21,-19,-21,-16, 13,-13,-21, 12,-15, 14,  1,-24,-28,-15,-12,-14, -8, 11, 18, 21,-16;
/M: SY='F';  M= -9,-21,-19,-33,-23, 37,-22,-11, 16,-11, 23,  7,-10,-33,-17,-13,-14, -8, 11,-12, 16,-22;
/M: SY='R';  M=  4, -2,-19,  5,  6,-18,-14,-12,-17,  5,-10, -5, -6, -7,  8,  9,  5, -3, -7,-21, -9,  5;
/M: SY='E';  M=  9,  0,-19,  2, 12,-21, -7,-13,-14,  9,-13, -2, -3,  0,  9, -1,  4, -1,-12,-25,-18, 10;
/M: SY='L';  M= -5,-13,-14,-15,-13, 15,-18,-10, 16,-13, 29, 17,-16,-28,-15,-16,-15, -1, 11,-18, 20,-13;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20,  0,-10,-20,-20,  0,-20,-30, 10,-30,-20;
/M: SY='S';  M= 11, -2,-20, -3, -3, -9, -3,-12, -3, -3,-12,-12, -1,-12, -9,-12, 30, 18, -3,-32,-18,-10;
/M: SY='S';  M=  9, -1,-22,  1,  0,-15,-11,-15, -8,  3,-13, -5, -2,-10,  5,  2, 11,  7, -3,-29,-14, -1;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A';  M=  6, -3,-23, -3,  2, -9, -6, -5, -5,  4, -6,  3, -2, -9, -4, -6,  5,  1, -5,-23, -9, -2; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='I';  M=  3,-12,-21,-20,-14, -6, -4,-13, 17, -8,  2, -4, -5,  0,-10,-18, -1,  3,  9,-26,-12,-15; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='D';  M=  2,  8,-24, 19,  3,-23, -6,-13,-18,  4,-10,-10, -2,  4,  0, -3,  2, -1,-14,-27,-11,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='D';  M=  1,  5,-24,  6,  0,-20, -2,  5,-13, -2,-12, -5,  5, -9,  2, -1,  3, -4,-15,-28,-14, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='L';  M= -8,-12, -9,-12,-11, 11,-14,-13, 11,-14, 24, 11,-18,-28,-13,-11,-17, -5,  5, -8, 19,-10;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-28, -4, -3,-15, 11,-16,-11,  4, -7,  0, -6, -9, -2, -1, -2, -8,-14, -9, -7, -4;
/M: SY='F';  M=-16,-17,-29,-21,-20, 33,-19,-17, -4, -8,  7,-14,-12,-17,-16, -7, -8, -9,  1,  6, 22,-22;
/M: SY='R';  M= -6,-14,-23, -8, -5,-11,-12,-13,-26, 13,-20,  1,-14, -7, 20, 57, -4,-22,-13, -5, -5,  0;
/M: SY='D';  M=  0,  9,-28, 18, -2,-17, -4,-10,-14, -4, -8,-15,  0,-13, -7, -9,  4, -3,-10,-22, -5, -6;
/M: SY='S';  M= 13,  4,-22,  3,  0,-16, -3,-12,-10,  1,-17,-13,  5, -5, -3,-10, 25, 16, -9,-37,-23, -6;
/M: SY='W';  M=-28,-34,-31,-26,-15, 10, -8,-27,-10,-13,  1,-11,-43,-26,-10, -4,-20,-22, -4, 92, 42,-14;
/M: SY='V';  M= 15,-11,-25,-12,-15,  5,-14,-21, 14, -9,  2,  1,-10,-24,-11,-11,  3,  7, 21,-31, -7,-16;
/M: SY='F';  M=-10,-22,-30,-32,-27, 58,-23,-22,  4,-10, 18, -8,-13,-31,-19,-11, -9,-11, 11,  0, 24,-27;
/M: SY='I';  M=  4,-19,-13,-26,-26,  9,-22,-26, 38,-19, 15,  4,-13,-35,-24,-17,-10,  4, 38,-28,  3,-26;
/M: SY='G';  M=  1, -5,-35,-11,-17,-12, 37,-23, -4, -9, -8,-12, -4,-13,-15,-17,  3, -7,-13, -2,-13,-17;
/M: SY='F';  M=  5, -7,-27,-12,-13,  8, -2,-20, -4, -5, -6,-10, -3,-20, -1, -2,  0, -5, -2,-16, -8,-11;
/M: SY='K';  M= -2, -6,-18, -7,  3, -8,-13,-17, -9, 14, -9,  7, -4, -3, -3,  3,  4, -1, -8,-20, -6, -1;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  0,  8,-28,  3,-11,-24, 40,-20,-11, -3,-16,-14, 10, -5,-13,-15,  1, -8,-22,-11,-23,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M=  3, -4,-22,-14,-15, -9,  7,-17,  9, -9,  0, -1,  3,-18,-10,-17,  3,  5,  0,-24,-12,-14;
/M: SY='G';  M= -3, -8,-23,-14, -7, -1,  4,-16, -4,  2, -5, -3, -3, -8, -6, -5, -4, -9,-10,-13, -8, -8;
/M: SY='K';  M=  7, -3,-24, -5, -2,-11, -6,-17, -6,  8,-11,  4, -1, -4, -2,  2,  2,  1, -5,-28,-14, -4;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-25,-11, -2,-11, -7, -9, -7,  6, -7, -3,-13, 16, -5, -1, -5, -4,-11,-18, -4, -6;
/M: SY='S';  M=  7, -3,-18, -8, -1, -9, -3,-12, -1, -1, -9, -8,  1,-14, -8,-13, 17,  8, -3,-27,-17, -7;
/M: SY='C';  M=-14,-18, 17,-16,  8,-23,-16, -7,-18, -6,-12,-15,-20, 15, -4,-12, -9,-11,-21,  1,-16,  2;
/M: SY='F';  M= -2,-14,-24,-21,-13, 11,-21,-10,  8, -5,  6,  0, -5,-20, -8,-11, -5, -1,  9,-20,  4,-12;
/M: SY='E';  M=  1, -4, -9,  1, 30,-28,-13,  2,-19, 10, -8, -3, -9,  8, 13, -7, -2, -9,-22,-18,-14, 26;
/M: SY='Q';  M= -5, -2,-21,  1, -2, -8,-10,-11,-11, -2, -2, -5, -4,-15,  5,  0, -4, -4,-11, -8,  3,  0;
/M: SY='H';  M= -5,-11,-26,-14, -5,  5,-21, 19, -6, -5, -1,  0, -5,-14, -7, -7, -2, -7, -6,-25,  0, -7;
/M: SY='T';  M=  7, -2,-21, -7,-13,-10,-10,-18,  7, -5, -3,  1,  3,-17, -8,-10,  4, 11,  9,-35,-12,-13;
/M: SY='K';  M=  0, -3,-22, -6,  7,-17,  0, -8, -8, 10,-11,  0,  0,  3, -4, -9,  3, -4,-14,-23,-15,  2;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-26, -1, -9, -7, -6, -1, -6, -4, -5, -5, 12, -5,-10,-14, -5,  0,-11,-31, -6,-10;
/M: SY='H';  M= -1,  3,-22,  3,  1,-18,-10, 11, -7, -5, -4,  0,  3, -9, -3,-13,  2,  1,-11,-34, -9, -1;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-12, -4,  6,-18,  1,-15,-10,  5,-12, -6,  4, -4, -5,-11,  3, -4,-15,-20,-17,  1;
/M: SY='H';  M=  2,  2,-24,  6,  7,-28, -6, 11,-18, -2,-14, -7,  0, -3, 11, -3,  4, -2,-19,-28,-15,  8;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G';  M=  0,  4,-19,  4,  0,-15,  5,-15,-10,  2,-12, -6,  3, -8,  1, -2,  1, -5,-13, -7,-11, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='S';  M=  1, -3,-17, -3, -8, -8,  2,-13, -1, -6, -2, -6, -4, -9, -7,-12,  6,  6, -1, -8, -3, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='A';  M=  2, -3,-16, -4, -4, -3,-11, -9, -2, -1, -1, -1,  0,-11,  0, -4,  0,  2,  1,-17, -3, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='Q';  M=  6, -4,-17, -3,  4,-13, -7, -6,-10,  4,-12, -7, -6,  6,  9,  2,  8,  5,-11,-20,-11,  3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='T';  M= 10, -4,-25,-11,-13,-12, -4,-22,  7, -4, -5,  1,  1,-12, -8,-13,  6, 13,  9,-32,-14,-12;
/M: SY='N';  M= -4, -2,-20,-10, -9, -3,-15, -6,  3, -5, -1,  1,  8,-10, -2, -8, -7,  3, -3,-31, -3, -8;
/M: SY='L';  M= -1,-11,-15,-13, -9,  8,-18,-16, 12, -6, 14, 11,-12,-21, -8, -6,-10,  0, 10,-22,  9, -9;
/M: SY='Y';  M=-14, -7,-15,  5, 16, -7,-21, -8,-20,  4,  3,-12,-16, -7,  0, -6, -4,-12,-12,  4, 17,  9;
/M: SY='A';  M=  2, -8,-21, -7, -1, -8,-13,-16,  0,  0, -4, -5, -8,-13, -1, -4,  1, -1,  2,-18, -4, -3;
/M: SY='I';  M= -3,-10, -5,-13,-14,  0, -1,-28,  5,-13,  1,-11,-10,-25,-21,-14, -8, -8,  5,-12, -7,-17;
/M: SY='W';  M=-27,-33,-26,-37,-24, 42,-14,-31, -1,-16,  9,-15,-33,-33,-20, -8,-18,-24,  2, 68, 38,-24;
/M: SY='P';  M= -4,  8,-29, 28,  9,-41,-10, -4,-30,  4,-20,-32,-11, 48, -1, -9, -4, -3,-28,-33,-15,  1;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=  6,  1, -9,  7, 23,-23,-12, -8,-15,  7, -7, -6, -5,  2,  6,-10,  4, -4,-15,-25,-16, 17;
/M: SY='D';  M=  3, 12,-24, 24,  3,-26, -5, -9,-13, -4, -7,-13, -1,-12, -3, -9,  3, -3, -9,-28,-10, -1;
/M: SY='I';  M=  3,-14,-17,-20,-19,  4,-12,-17, 30,-15, 19, 11,-11,-29,-18,-19,-11,  2, 24,-25,  4,-19;
/M: SY='E';  M=  1, -1,-17,  3, 21,-32, 10, -4,-21,  5,-14,-13, -7,  3,  7,-10,  1,-14,-26,-10,-19, 17;
/M: SY='M';  M=  6,-10,-17,-13,  0,-13,-12, -7,  9,  0,  6, 12, -7,-17, -5,-13, -6, -2,  6,-25, -9, -2;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-11, -9,  1,-11,-14,-16,-11, -3, -1, -8, -8, -7, -1,-16,  4,  7, -5, -9, -1,  1;
/M: SY='G';  M=  2,  2,-34, -7,-13,-28, 62,-26,-10, -7,-19,-17,  3,-10,-15,-18,  2,-15,-27,  0,-30,-14;
/M: SY='C';  M=-20,-19, 58,-25, -6, -1,-27,-32, -8,-18,  7,-14,-12,-24,-16,-16,-12, -9, -4, -9,-14,-10;
/M: SY='P';  M= -4,-17,-27,-17, -6,-21, -9,  3, -2, -2,-12,-13,-16, 29, -3, -5, -5, -2, -9,-26,-13, -9;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-19, -6,  6,-22,-15, -7,-19,  4,-15,-17,-21, 25,  8, 11, -8,-12,-17, -6, -6,  5;
/M: SY='R';  M=  2, -4,-23,  1,  1,-17, -9,-12,-17,  8,-11,  1, -7, -6, 11, 20, -2, -9,-10,-19,-10,  2;
/M: SY='K';  M=  3, -3,-25, -6, -4,-10, -8,-18, -3,  7, -6,  4,  0, -8, -5, -7,  3,  3, -2,-25,-10, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 30 in 25 different sequences
Number of true positive hits 30 in 25 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Bacteriophages, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] GG-type lectin
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
25 sequences

CEIP2_DANRE (A3KPQ7), CEIP2_HUMAN (Q9UHN6), CEIP2_MOUSE (Q5FWI3), 
CEMIP_HUMAN (Q8WUJ3), CEMIP_MOUSE (Q8BI06), FAM3A_HUMAN (P98173), 
FAM3A_MOUSE (Q9D8T0), FAM3A_PONAB (Q5R5C3), FAM3B_HUMAN (P58499), 
FAM3B_MOUSE (Q9D309), FAM3C_BOVIN (A5PKI3), FAM3C_DANRE (Q7ZYY4), 
FAM3C_HUMAN (Q92520), FAM3C_MOUSE (Q91VU0), FAM3C_RAT   (Q810F4), 
FAM3C_XENLA (Q6GQC1), FAM3C_XENTR (B0BLS9), FAM3D_HUMAN (Q96BQ1), 
FAM3D_MOUSE (P97805), FIB35_BPT4  (P03742), PMGT1_BOVIN (Q5EAB6), 
PMGT1_HUMAN (Q8WZA1), PMGT1_MOUSE (Q91X88), PMGT1_PONAB (Q5RCB9), 
PMGT1_RAT   (Q5XIN7)
» more

PDB
[Detailed view]
17 PDB

2YOP; 2YOQ; 5GGF; 5GGG; 5GGI; 5GGJ; 5GGK; 5GGL; 5GGN; 5GGO; 5GGP; 5LC2; 5LC3; 5LC4; 5XFC; 7ECQ; 8C6I
» more