PROSITE entry PS52060
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52060
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | VERL_REP |
| Accession [info] | PS52060 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
28-JAN-2026 CREATED;
28-JAN-2026 DATA UPDATE; 28-JAN-2026 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52060 |
| Associated ProRule [info] | PRU01405 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Egg vitelline envelope receptor for lysin (VERL) repeat profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8855017; R2=0.0168506; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=601; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-18, 13,-30, 20, 9,-29,-17, -2,-33, 24,-26,-17, 7,-14, 7, 34, -7,-10,-23,-27,-13, 6; /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-29,-21, 14,-30,-10, 17,-27, 31, 14,-23,-28,-20,-19,-24,-10, 10,-18, 5,-21; /M: SY='T'; M= -6, -6,-18,-17,-15, -6,-23,-16, 8,-15, 3, 7, -2,-16,-10,-14, 1, 18, 5,-27, -7,-14; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='D'; M= 2, 8,-15, 11, 2,-20, 5, -7,-20, 1,-17,-13, 4, -8, -3, -5, 3, -4,-13,-19,-13, -1; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='W'; M=-10,-18,-21,-19,-13, 2,-15, 0, -1,-13, 7, 7,-16,-17, -8,-10,-19,-12, -6, 23, 9,-10; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='B'; M=-10, 29,-16, 28, 6,-19, -3, 4,-19, 0,-20,-16, 28,-10, 0, -3, 4, -3,-20,-26,-13, 3; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='L'; M= -7,-23,-20,-24,-17, -3,-29,-22, 14, -8, 17, 10,-22,-24,-16, -9,-19, -7, 17,-23, -5,-17; /M: SY='V'; M= -9,-12,-19,-19,-22, 12,-24,-12, 11,-16, 0, 1, -5,-27,-21,-15, -9, -4, 13,-17, 7,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='S'; M= 5, 9,-13, 9, 2,-22, -1, -7,-22, -8,-30,-21, 16,-11, 0, -9, 33, 15,-14,-40,-20, 1; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='D'; M=-13, 25,-24, 34, 16,-32,-11, 3,-26, 3,-21,-15, 10, -8, 19, -2, 0, -8,-24,-26,-13, 18; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='D'; M=-14, 39,-23, 48, 13,-29, -6, 2,-29, 0,-24,-23, 23,-10, 0, -6, 2, -6,-24,-32,-16, 6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='K'; M= -9, -5,-23, -5, 8, -8,-20,-10,-11, 14,-12, -5, -5,-10, 1, 5, -8, -8,-10,-15, -4, 5; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='N'; M= -2, 22,-17, 21, 5,-25, -2, -3,-25, -5,-30,-22, 25,-12, 0, -8, 23, 8,-20,-40,-20, 2; /M: SY='I'; M=-10,-14,-28,-17, -3,-11,-29,-18, 6, 5, 0, 4,-11,-15, -5, -2,-15,-10, 1,-20, -5, -6; /M: SY='P'; M= -9,-10,-32, -6, 9,-29,-12, -7,-18, -4,-16, -8,-10, 19, 17, -7, -7,-11,-25,-24,-18, 11; /M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17, 5, -2,-25,-20, -8; /M: SY='T'; M= -6, -6,-21, -9, -1,-15,-23,-15, -9, 6,-11, -6, -5,-13, -3, 6, 1, 14, -2,-26,-10, -3; /M: SY='F'; M=-12,-30,-18,-34,-26, 38,-30,-22, 13,-28, 25, 9,-26,-30,-31,-20,-22, -8, 13, -9, 11,-26; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M=-13,-26,-28,-33,-25, 11,-35,-11, 28,-26, 17, 14,-18,-23,-18,-23,-20,-11, 15,-13, 13,-25; /M: SY='S'; M= 0, 5,-17, 2, -1,-16, -6, -3,-19, -1,-27,-17, 15,-14, 0, -3, 21, 9,-15,-30, -7, -1; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-18,-14,-27,-15, -3, 21,-26, 3,-11, -4, -5, -6,-12,-22, -8, 4,-14,-10,-13, 4, 32, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M=-12, -2,-32, 7, 3,-25,-20,-13,-19, 0,-14,-13, -9, 24, -6, -8,-12,-10,-20,-28,-18, -3; /M: SY='V'; M= -3,-22,-15,-22,-22, 3,-24,-14, 13,-16, 0, 2,-20,-26,-20,-16, -3, 2, 24,-18, 9,-22; /M: SY='T'; M= 4, -6,-10,-13,-13,-10,-18,-21, -4,-12, -9, -7, -5,-14,-13,-12, 16, 34, 8,-31,-12,-13; /M: SY='F'; M=-12,-20,-22,-23,-17, 28,-24,-11, -4,-11, -5, -4,-15,-18,-20,-11, -9, -5, -2, -3, 20,-18; /M: SY='K'; M=-11, -8,-28, -8, 3,-21,-22, -9,-17, 25, -9, -2, -7,-16, 8, 20,-14,-10,-14,-20, -8, 5; /M: SY='G'; M= -1, 10,-15, 6, -8,-26, 21,-11,-29,-11,-26,-19, 15,-18,-11,-14, 5, -5,-23,-30,-23,-10; /M: SY='H'; M=-11,-13, 4,-15,-11,-16,-25, 25,-12,-15, -9, 0, -9,-25, -2,-10,-10,-11, -5,-32, -2, -8; /M: SY='A'; M= 19,-15,-10,-21,-18,-10,-16,-24, 5,-14, -2, -2,-15,-18,-18,-18, 5, 12, 19,-26,-14,-18; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-35,-29, 1,-35,-29, 38,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 35,-24, -4,-29; /M: SY='K'; M= -8, -5,-23, -6, 7, -9,-22,-13,-16, 13,-15, -8, -6,-13, -2, 5, -3, 3, -8,-21, -7, 3; /M: SY='D'; M=-16, 24,-28, 27, 6,-20,-13, 4,-26, 8,-24,-18, 18,-16, 0, 0, -3, -8,-24,-23, 1, 2; /M: SY='M'; M= -4,-16,-17,-23,-17, -5,-20,-12, 13,-13, 5, 24,-13,-18, -7,-13, -2, 5, 12,-26, -6,-13; /M: SY='Q'; M= -6, 4,-25, 7, 21,-34,-15, 3,-23, 5,-23, -9, 3, -9, 37, 3, 9, -3,-25,-27,-14, 29; /M: SY='I'; M= -7,-24,-23,-32,-23, -1,-30,-21, 31,-23, 17, 22,-18,-20,-14,-22,-13, -6, 20,-23, -3,-21; /M: SY='F'; M= 0,-11,-20,-21,-18, 21,-20,-17, 2,-19, -1, -3, -4,-21,-21,-19, -8, -6, 0,-13, 3,-19; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M= 5, -9,-20,-11, -3,-17,-15,-14,-12, 8, -7, -5, -7,-15, -3, 1, -1, -2, -7,-24,-12, -3; /M: SY='N'; M= -8, 28,-22, 13, -5,-22, 16, 3,-25, -5,-30,-20, 46,-20, -5, -5, 8, -5,-30,-35,-22, -5; /M: SY='G'; M= 4, -6,-21, -6,-11,-26, 40,-16,-31,-16,-30,-20, 4,-16,-11,-16, 17, -3,-21,-29,-26,-11; /M: SY='W'; M=-10,-21,-27,-25,-20, 1,-22,-24, -8,-18, -2, -8,-21,-21,-16,-16,-12, 8, -9, 40, 7,-16; /M: SY='M'; M= -6,-24,-17,-29,-25, 5,-14,-16, 14,-17, 9, 24,-21,-25,-19,-16,-14, -7, 20,-20, -4,-21; /M: SY='P'; M=-11, -6,-34, -1, 6,-31,-21, -8,-14, -4,-20, -9, -8, 28, 16, -9, -6,-10,-23,-26,-18, 9; /M: SY='M'; M= -7,-17,-20,-26,-18, -3,-22, -9, 18,-14, 11, 35,-14,-18, -5,-14, -8, 1, 10,-23, -3,-13; /M: SY='T'; M= -5, -2,-17, -8,-11,-11,-23,-17, 1,-13, -3, 1, -4,-13,-10,-14, 5, 24, 3,-28, -8,-11; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M=-15, 0,-27, 4, 10,-23,-17, 11,-26, 11,-20,-11, 1, -3, 11, 24, -6,-10,-23,-23, -9, 7; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='G'; M= -7, 1,-30, 5, 4,-30, 26,-11,-36, 1,-27,-19, 2,-14, -4, -1, -2,-15,-28,-24,-23, -1; /M: SY='R'; M=-13, 3,-24, 1, -2, -9,-14, 2,-24, 5,-20,-13, 9,-18, -1, 21, 2, -4,-18,-25, -7, -3; /M: SY='G'; M= -1, -6,-24, -8,-14,-24, 34, -5,-30,-16,-25,-16, 2,-17,-12,-15, 7, -1,-22,-25,-19,-14; /M: SY='F'; M=-15,-30,-25,-40,-30, 39,-35,-25, 26,-30, 15, 10,-20,-25,-30,-25,-20,-10, 15, -5, 15,-30; /M: SY='N'; M= -5, 14,-22, 1, -9, -8,-11, 4, -7, -7,-16,-10, 27,-21, -5, -8, 1, -3,-15,-22, 2, -9; /M: SY='M'; M= -8,-19,-23,-26,-21, -7, -1, -7, 9,-14, 8, 38,-15,-20, -7,-14,-15,-12, 2,-20, -7,-14; /M: SY='I'; M= -8,-24,-23,-30,-21, 1,-28,-19, 27,-24, 23, 23,-19,-22,-14,-21,-16, -6, 15,-22, -2,-19; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-12,-11,-21,-11, -3,-10,-17, -5,-13, 13, -3, -2, -6,-16, 2, 32,-12, -8, -9,-15, -6, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= 10,-24,-21,-33,-24, -6,-27,-27, 29,-23, 10, 10,-18,-18,-18,-26,-10, -6, 23,-21, -7,-24; /M: SY='H'; M=-18,-10,-29,-11, -6, 3,-24, 43,-15, -9,-10, 0, -5,-22, 8, -4,-12,-14,-20, -5, 34, -2; /M: SY='Y'; M=-18,-17,-27,-18,-17, 20,-28, 30, -4,-13, -3, 1,-14,-28,-10,-10,-17,-11, -8, 8, 52,-17; /M: SY='P'; M= -8,-16,-34,-10, -2,-26,-20,-20,-18,-10,-26,-18,-16, 71,-10,-18, -4, 2,-24,-30,-26,-10; /M: SY='Q'; M= -9, 5,-26, 9, 17,-31,-15, 2,-26, 9,-23,-12, 4,-11, 27, 14, 6, -4,-24,-27,-14, 21; /M: SY='N'; M= 2, 13,-16, 0, -7,-17, 1, -8,-18, -7,-20,-15, 22,-15, -7, -8, 13, 17,-15,-32,-17, -7; /M: SY='Y'; M=-12, -6,-28, -5, 6, -8,-22, 7,-16, 7,-15, -7, -6,-16, 12, 2, -5, -7,-18, -5, 22, 7; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= -4,-19,-16,-24,-20, -2,-28,-24, 17,-20, 12, 6,-17,-21,-19,-18, -4, 15, 19,-26, -6,-20; /M: SY='S'; M= -1, -8,-18, -7, 2,-16,-16,-11, -8, -5, -7, -6, -6,-15, 2, -6, 7, 3, -4,-30,-13, 2; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='V'; M= -6, 2,-14, 4, -7,-13,-15,-11, -1, -3, -8, -5, -2,-16,-10, -7, -4, -3, 8,-25,-11, -8; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='V'; M= -2, -2,-12, 2, -8,-12,-13,-13, 0,-10, -8, -6, -6,-15,-11,-11, 4, 2, 11,-27,-12, -9; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M= -8,-17,-29,-13, -6,-17,-19,-17, -2,-12,-13, -8,-15, 48,-10,-17,-10, -8,-11,-21,-17,-12; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='G'; M= -2, 6,-25, 0,-11,-26, 40,-10,-31,-13,-30,-20, 20,-19,-11,-13, 8, -9,-28,-29,-26,-11; /M: SY='A'; M= 19,-11,-19,-16, -6,-19,-10,-14,-10, 4,-11, 3,-11, -3, -3, -6, -2, -5, -6,-21,-15, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='V'; M= -7,-28,-19,-30,-28, 7,-32,-18, 27,-20, 10, 10,-26,-28,-23,-20,-14, -4, 32,-14, 13,-28; /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28, 65,-28,-16, 4,-26, 12, 12,-20,-28,-32,-18,-20,-10, 2, 4, 24,-26; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-15, -2,-27, 2, -2,-13,-13, -6,-23, 7,-17,-13, -4,-15, 0, 21,-12,-12,-19, 14, -2, -2; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 6, -9,-25,-11,-18,-26, 51,-20,-33,-18,-25,-18, -1,-18,-18,-19, 4, -9,-23,-21,-26,-18; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-28,-21,-20, 18,-30, 16, 6,-13, 1, 3,-18,-28,-12,-12,-18,-10, 0, 11, 54,-20; /M: SY='S'; M= 4, -7,-14, -7, -5,-17,-11,-15,-10, -1,-21,-11, -1,-15, -5, -5, 19, 10, 2,-34,-16, -5; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='V'; M= 0,-23, -8,-23,-23, 0,-23,-23, 23,-15, 8, 8,-23,-23,-23,-15, -8, 0, 38,-23, -8,-23; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='P'; M= -8, -4,-27, -2, 0,-21,-11,-10,-15, -6,-23,-15, 0, 48, -6,-11, -4, -6,-23,-25,-21, -6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='T'; M= -2, -2,-15, -6, -6,-15, 2,-13,-17, 2,-15,-10, 0,-10, -6, -2, 6, 13,-10,-19,-12, -6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='N'; M= -4, 11,-19, 3, 4,-24,-10, -1,-18, -1,-23,-12, 18,-13, 16, -1, 15, 12,-19,-32,-15, 10; /M: SY='D'; M=-14, 40,-26, 57, 16,-36, -8, -2,-36, -2,-30,-28, 18,-10, 0,-10, 8, -4,-26,-40,-20, 8; /M: SY='S'; M= 5, -2,-11, -7, -5,-15, -9,-12,-12,-10,-18, -8, 3,-11, -3,-10, 27, 26, -5,-35,-15, -4; /M: SY='I'; M= -7,-23,-22,-28,-20, -4,-31,-22, 25,-21, 16, 12,-19,-22,-12,-19,-13, -1, 20,-23, -4,-18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -5, -8,-17, -5, 11,-11,-19, -9, 0, -4, -2, 3,-12,-12, -2, -7, -6, -5, 5,-23,-11, 5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='M'; M=-10,-15,-23,-20,-10, -8,-22, -7, 4, 6, 9, 29,-15,-19, -1, 1,-19,-10, 0,-20, -3, -5; /M: SY='Y'; M=-19,-10,-29,-13,-15, 18,-25, 28, -6, -9, -6, -2, -7,-28, -7, -8,-15,-10,-15, 15, 61,-15; /M: SY='T'; M= -5, 3,-17, -9,-12,-10,-19,-14, 1,-12, -8, -6, 11,-15,-10,-12, 8, 23, -1,-30,-10,-12; /M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29, 1,-30,-29, 29,-21, 15, 11,-30,-30,-29,-20,-12, -1, 45,-29, -9,-29; /M: SY='T'; M= -1, -5,-15, -9, -9, -4,-15, -7,-11,-10,-15,-11, -1,-15, -6,-10, 18, 25, -6,-20, 7, -9; /M: SY='V'; M= 5,-26,-12,-30,-26, 15,-24,-26, 15,-20, 6, 4,-24,-26,-28,-20, -8, -2, 29,-19, -3,-26; /M: SY='A'; M= 15,-13,-16,-17, -8,-13,-11,-14, -9, -7, -2, -5, -9,-17, -7, -1, 2, 0, -3,-24,-13, -8; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-22, 6,-29,-18, 25,-25, 36, 26,-27,-27,-17,-19,-25, -9, 17,-21, -1,-20; /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-12, 5, -7,-26,-13, -1, -5, 18, 5,-17,-19, -5, -6,-19,-10, -5,-22, -7, 0; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='S'; M= 11, 6,-12, 1, -1,-20, 0, -7,-19, -8,-28,-19, 17,-12, -1, -9, 31, 14,-13,-38,-20, -1; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 60, 28,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 16, -8, 4, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 16; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M= -8, -6,-24, -8, -1,-21,-20,-14,-20, 12,-21,-12, -4, 8, -1, 13, 1, 13,-14,-26,-14, -3; /M: SY='P'; M= 3,-20,-28,-17, -8,-20,-18,-21, -7,-13,-12,-10,-20, 43,-14,-20, -8, -7,-10,-27,-22,-14; /M: SY='T'; M= -1, -3, 7,-13,-13,-11,-21,-21,-13,-13,-11,-11, -3,-14,-13,-13, 16, 42, -1,-33,-13,-13; /M: SY='Y'; M=-14, -4,-28, -6,-14, 4, -2, 8,-14,-10,-13, -9, -1,-25,-10,-11,-10,-11,-19, 4, 34,-15; /M: SY='E'; M= 0, -7,-21, -4, 16,-15,-19,-12, -8, -7, -1, -6,-11,-13, -1,-10, -3, -4, -5,-28,-14, 8; /M: SY='S'; M= 3, 2,-18, 4, 15,-24, -7, -8,-23, 1,-28,-19, 6, -5, 6, -3, 24, 9,-16,-35,-19, 10; /M: SY='L'; M= -8,-29, -2,-32,-26, 2,-32,-26, 22,-28, 26, 13,-26,-29,-23,-24,-21, -8, 21,-26, -6,-26; /M: SY='E'; M=-11, 4,-30, 10, 33,-29, -8, 20,-30, 2,-21,-14, 2, -8, 17, -2, -2,-13,-30,-28,-12, 24; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M=-16,-17,-28,-18,-16, 14,-26, 5, 0,-14, 5, 0,-16,-14,-11,-13,-19, -9,-10, 6, 40,-17; /M: SY='V'; M= -4,-26,-16,-27,-24, -4,-26,-22, 21,-16, 7, 17,-26,-12,-21,-18,-12, -4, 31,-28,-10,-23; /M: SY='P'; M= -1, -7,-21, -8, -4,-19,-16,-18,-16,-10,-21,-16, -5, 25, -8,-14, 14, 22,-13,-32,-19, -8; /M: SY='K'; M= -5, -2,-27, -2, 2,-29, 2,-12,-31, 27,-30,-13, 1,-12, 2, 14, -1, -8,-21,-23,-16, 2; /M: SY='S'; M= 4, -1,-13, -3, -2,-18, -7,-11,-19, -5,-24,-17, 7,-11, -1, 0, 29, 23, -9,-35,-17, -2; /M: SY='P'; M= -8, -7,-29, -6, 6,-30,-20, -7,-18, -1,-21, -9, -7, 25, 20, -5, 1, 3,-23,-26,-17, 12; /M: SY='A'; M= 27, -7,-11,-13,-11,-16,-10,-20, -6,-11, -8, -8, -9,-13,-12,-17, 8, 10, 6,-25,-16,-12; /M: SY='S'; M= 22, -3,-10, -8, -4,-19, -2,-14,-16,-10,-21,-16, 2,-10, -4,-13, 28, 17, -6,-32,-19, -4; /M: SY='P'; M=-10, 6,-31, 3, 0,-25,-11, -4,-20, -6,-30,-19, 15, 39, -5,-11, -1, -6,-30,-34,-24, -5; /M: SY='A'; M= 19, -4,-14,-12, -6,-19,-11,-18,-14, 3,-14,-10, -4,-10, -6, -5, 9, 15, -4,-23,-14, -6; /M: SY='P'; M= -5,-15,-26,-12, -6,-17,-19,-19,-11,-14,-11,-11,-14, 34,-10,-17, -1, 7,-14,-30,-19,-10; /M: SY='E'; M= -8, 4,-27, 10, 37,-26,-20, -7,-24, 3,-19,-18, -3, 9, 10, -5, 3, 3,-23,-30,-19, 23; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 22 in 1 sequence |
| Number of true positive hits | 22 in 1 sequence |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 22 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | REPEAT |
| Feature description [info] | VERL |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
1 sequence
VERL_HALRU (Q8WR62)
|
| PDB [Detailed view] |
7 PDB
pdb_00005ii4; pdb_00005ii5; pdb_00005iia; pdb_00005iib; pdb_00005iic; pdb_00005mr2; pdb_00005mr3 |