PROSITE entry PS52103

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52103

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PAS_H_NOXA
Accession [info]	PS52103
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	02-SEP-2026 CREATED; 02-SEP-2026 DATA UPDATE; 02-SEP-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52103
Associated ProRule [info]	PRU01447

Name and characterization of the entry

Description [info]

H-NOXA-type PAS domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3971295; R2=0.0185441; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=464; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=222; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M= -3, -2,-13, -1,  5,-19,-12,-10,-20, -3,-17,-13, -2, -9, -1, -7,  6,  6,-15,-27,-11,  2;
/M: SY='N';  M= -9,  0,-23, -3, -6,-13,-13,  0,-10, -7,-10, -4,  3,-17, -5, -5, -2,  1,-10,-25, -4, -7;
/M: SY='L';  M= -7,-23,-11,-25,-18,  5,-25,-18,  9,-24, 18,  6,-21,-21,-18,-19,-13, -4,  7,-22, -2,-19;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-25,  0,  0,-14,-17,-11,-18,  1,-17,-13, -1, -5, -5,  0, -2,  0,-14,-18,-10, -3;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-22,-31,-23,  2,-30,-26, 24,-24, 14,  9,-24,-10,-22,-23,-16, -7, 21,-22, -6,-25;
/M: SY='S';  M= -5,  4,-24,  6,  4,-26, -4, -3,-24, -7,-26,-18,  5,  7,  1,-10, 11,  3,-22,-33,-19,  1;
/M: SY='T';  M=  5,-11,-18,-14, -4,-11,-18,-18, -3,-13,  1, -4,-11, -7, -9,-15,  1,  9, -1,-27,-13, -7;
/M: SY='S';  M= -3,  6,-20,  4,  9,-20,-13, -1,-21,  1,-21,-14,  8,-11,  5,  0, 12,  9,-16,-29,-11,  6;
/M: SY='V';  M=  3, -5,-17, -4, -6,-13,-17,-17, -2,-13, -2, -5, -8,-17,-11,-15,  2,  3,  5,-30,-13, -9;
/M: SY='F';  M=-16,-27,-19,-35,-26, 53,-28,-17,  5,-26, 16, 11,-20,-27,-30,-18,-19, -6,  3, -1, 19,-25;
/M: SY='C';  M= -9,  7, 10,  6, -6,-14,-16,-12,-21,-12,-15,-15,  3,-22,-13,-14, -2, -5,-15,-34,-15, -9;
/M: SY='R';  M=-15,  8,-29, 12, 15,-27,-18, 11,-28, 16,-21,-12,  6,-13, 11, 17, -6,-11,-24,-27, -9, 11;
/M: SY='L';  M= 10,-21,-18,-28,-19, -4,-21,-22, 16,-21, 17, 11,-19,-20,-16,-21,-11, -3, 13,-21, -8,-18;
/M: SY='F';  M=-17,-29,-11,-37,-28, 60,-29,-19,  2,-29, 14,  5,-21,-30,-34,-20,-21,-10,  1,  1, 21,-27;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-26,-35,-26, 46,-27,-13,  1,-23,  8,  6,-24,-29,-25,-17,-24,-13, -4, 29, 32,-23;
/M: SY='H';  M=-18, -3,-23, -5, -4,-16,-22, 78,-24,-12,-17,  0,  5,-21,  5, -4,-10,-15,-24,-27, 19, -4;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-20,-35,-27, 15,-31,-25, 28,-25, 17, 14,-23,-25,-25,-23,-17, -7, 25,-17,  2,-27;
/M: SY='V';  M=  3,-23, -2,-28,-22, -7,-25,-23, 16,-19,  7, 10,-22,-24,-17,-20,-10, -5, 22,-27,-11,-20;
/M: SY='F';  M=-14,-29,-18,-35,-27, 50,-30,-21,  8,-28, 18,  5,-23,-29,-33,-20,-19, -6,  9, -4, 16,-27;
/M: SY='D';  M=-15, 40,-28, 51, 12,-35,  1, -1,-36, -3,-30,-27, 24,-13, -2, -9,  3, -8,-29,-38,-21,  5;
/M: SY='K';  M=  0, -3,-26, -4,  7,-25,-14, -4,-24, 13,-23,-13,  0,  4,  3, 12, -1, -6,-20,-25,-16,  3;
/M: SY='D';  M= -3, 20,-23, 24, 10,-29, -6, -5,-28,  2,-25,-19, 13,-11,  3, -3,  6, -2,-21,-32,-18,  6;
/M: SY='M';  M= -8,-21,-15,-25,-20, -4, -6,-13,  3,-19, 17, 22,-19,-25,-12,-13,-19,-12,  0,-21, -8,-16;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-24, -8,  3,-14,-21, -1,-13,  5,-13, -6, -2,-17,  3, 15, -4, -4, -8,-25, -8,  1;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-22,-35,-29,  1,-35,-29, 40,-26, 19, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 35,-24, -4,-29;
/M: SY='V';  M= -8,-15,-22,-17, -6,-10,-26,-16,  3, -5,  3,  2,-13,-19, -5,  0, -8,  1,  6,-24, -8, -7;
/M: SY='Q';  M= -2, -2,-21, -4,  3,-24,-12, 15,-17, -4,-17, -3,  4,-14, 19, -3,  8, -2,-18,-28, -8, 10;
/M: SY='V';  M=  5,-19,  3,-27,-20,  1,-21,-19,  3,-20,  2,  1,-16,-23,-18,-21, -6, -3,  6,-21, -4,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M= -6,  2,-27,  1,  6,-24,-16, -9,-14,  1,-20,-12,  5,  8,  1, -6, -1, -5,-16,-30,-18,  2;
/M: SY='S';  M= -1, -4,-20, -7, -8,-13,  5, -6,-20, -9,-19,-13,  2,-16, -9,-10,  8,  5,-13,-24, -9, -9;
/M: SY='L';  M= -6,-29,-22,-33,-23,  8,-31,-23, 26,-29, 35, 17,-25,-25,-20,-23,-24, -9, 15,-19,  0,-23;
/M: SY='Q';  M= -5,-12,-23,-14, -3,-12,-21, -5, -7,  1, -1,  4,-11,-18,  6,  6, -9, -5, -7,-17, -1,  0;
/M: SY='R';  M=-12,  1,-27, -2,  3,-22,-12, -5,-23, 22,-21,-10,  7,-17,  4, 26, -7, -8,-18,-24,-13,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-19,-22,-21,-13, -3,-28,-10,  9,-14, 13,  7,-17,-23,-10, -6,-14, -3,  7,-21,  0,-13;
/M: SY='F';  M=-11,-25,-21,-29,-23, 21,-27,-14, 11,-21, 14, 13,-22,-26,-20,-17,-17, -5,  8, -2, 14,-21;
/M: SY='P';  M= -2,-10,-31, -9, -5,-26, -2,-16,-20, -6,-25,-16, -5, 34, -9,-12, -5, -9,-23,-27,-24,-10;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-16,  3,  5,-19,  0, -5,-19, -4,-12,-10,  4,-13,  3, -3, -2, -6,-18,-23,-14,  4; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E';  M=  1, -1,-20, -2,  2,-16,-14,-11, -7, -3, -6, -6, -2, -8, -3, -8, -3, -5, -8,-23,-12, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='L';  M= -7,-14,-18,-18,-11, -1,-21,-13,  6,-15, 12,  7,-12,-12, -7,-12,-10,  0,  1,-19, -4, -9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Q';  M= -9, -7,-24, -8, -1,-17,-12,  1,-14,  4,-14, -4, -3, -9,  9,  4, -5, -7,-13,-18, -6,  3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K';  M= -6, -9,-25, -9, -4,-21,  2,-12,-17,  5,-12, -5, -6, -9,  1,  0, -8,-11,-15,-18,-13, -2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='G';  M= -4,  2,-17,  2,  0,-17,  8, -7,-17,  1,-15, -9,  2, -9, -1, -3,  0, -5,-13,-16,-12,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A';  M=  6,-10,-12,-13, -6,-10, -9,-16,-11, -8, -6, -7, -9, -9, -9,-11,  0,  1, -7,-22,-12, -7; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K';  M= -8, -2,-27, -1,  2,-23,-16, -4,-22, 14,-19,-10,  0, -3,  1, 14, -5, -7,-18,-26,-12,  0;
/M: SY='L';  M= -6,-28,-21,-33,-24, 10,-31,-23, 26,-27, 28, 18,-24,-25,-21,-22,-21, -8, 18,-18,  1,-24;
/M: SY='T';  M= -5, -4,-21, -6, -2,-14, -2,-11,-12,-12, -3, -1, -4,-16, -6,-12,  0,  1,-10,-27,-14, -4;
/M: SY='D';  M= -9, 18,-26, 25, 23,-32,-14, -2,-29,  7,-24,-18,  7, -8, 14,  2,  4, -4,-24,-31,-17, 18;
/M: SY='L';  M=-10,-25,-15,-27,-23,  9,-29,-12, 11,-19, 13,  6,-23,-28,-20,-14,-17, -6, 13, -8, 11,-22;
/M: SY='F';  M=-17,-29,-19,-38,-28, 63,-29,-20,  5,-28, 16,  6,-22,-29,-35,-19,-21, -9,  5,  2, 22,-28;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-25, 15, 20,-27,-15,  2,-26,  6,-21,-15,  4, -9, 11,  2,  4, -2,-22,-30,-14, 15;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-14,-31,-24,  2,-31,-25, 26,-27, 25, 14,-24,-26,-21,-23,-18, -6, 22,-25, -5,-24;
/M: SY='V';  M= -8,-13,-12,-17,-12,-12,-24,-14,  3, -6, -1,  4, -9,-22, -4, -2, -9, -3,  5,-27,-10, -9;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-28, -8,  1,-21,-19, 10,-28, 21,-20, -9,  1,-19, 11, 52, -6, -7,-20,-22, -7,  2;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M= -9, -6,-14, -9, -2,-11,-19, -6,-16,  4,-14, -8, -2,-18,  1,  6, -2, -2,-11,-24, -8, -1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -6,-18,-22,-23,-18, -8,-24,-23, 20,-15,  3,  6,-13,-21,-17,-17,-10, -4, 20,-25, -9,-19;
/M:         M= -7, -2,-24, -1, -1,-20,-17, -9,-13, -2,-11, -8, -2, -2,  0,  0, -4, -3,-13,-28,-14, -2;
/M: SY='F';  M= -9,-19,-21,-27,-20, 17,-26,-17, 11,-21, 14, 10,-14,-22,-17,-17,-13, -1,  5,-15,  4,-18;
/M: SY='D';  M= -8, 18,-21, 21,  6,-26,-13, -7,-25,  3,-24,-18, 11,-11,  2, -1, 11, 11,-17,-33,-15,  4;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-26,-34,-25, 36,-28,-19,  7,-24,  7,  1,-22,-19,-26,-21,-20,-11,  0, 13, 21,-25;
/M: SY='E';  M= -6,  7,-27, 13, 29,-30,-16,  1,-27,  6,-23,-16,  1,  1, 15,  1,  3, -7,-25,-29,-17, 21;
/M: SY='N';  M= -3,  5,-22,  3,  5,-23, -1, -3,-22, -4,-20,-14,  7,-13,  1, -5,  7,  2,-17,-30,-16,  3;
/M: SY='I';  M= -5,-29,-24,-35,-26,  1,-34,-27, 36,-28, 24, 17,-23,-23,-20,-26,-19, -8, 25,-21, -2,-26;
/M: SY='L';  M= -5,-21, -5,-25,-17, -3,-24,-16,  7,-14, 18, 17,-21,-25,-13,-13,-17, -8,  6,-25, -7,-15;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-23, -2, -1,-20,-10, -7,-16,  4,-15, -8,  2,-16,  5, -1,  0, -2,-13,-23, -9,  2;
/M: SY='H';  M= -7, -9,-23,-15, -9,  2,-19, 10,-12, -2, -9,  1, -3,-20, -3,  3, -8, -6,-11,-13,  9, -7;
/M: SY='V';  M= -9,-13,-23,-14,-10,-11,-25,-16,  2, -5,  2,  1,-12,-15, -6, -2, -9, -1,  3,-25, -8, -9;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='N';  M= -8, 23,-21, 12, -3,-21,  5,  0,-24, -1,-27,-19, 35,-18, -3,  2,  8,  2,-25,-34,-19, -3;
/M: SY='T';  M=  0,  3, -8, -1, -7,-17,-15,-11,-10, -9,-12, -4,  1,-16, -5,-11,  7, 10, -4,-32,-14, -6;
/M: SY='L';  M= -7,-20,-25,-20,-10,-12,-25,-16,  2, -7,  4,  3,-17, -6, -5, -2,-14, -8,  1,-23,-10, -9;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-18,-36,-28, 52,-30,-22,  9,-28, 18,  6,-24,-30,-34,-20,-20, -8, 11, -3, 17,-28;
/M: SY='V';  M= -7,-20,-21,-21,-10, -7,-28,-11, 16,-15, 10, 12,-19,-22, -9,-15,-13, -7, 17,-26, -6,-11;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-33,-24, 22,-31,-22, 20,-29, 37, 16,-27,-29,-24,-21,-26, -9, 12,-15,  5,-24;
/M: SY='R';  M=-10, -6,-20, -5, 10,-22,-19, -5,-19, 10,-16, -7, -3,-14, 11, 20, -2, -6,-15,-26,-13,  9;
/M: SY='V';  M= -4,-18,-16,-20,-16,  4,-21,-18,  3,-18,  3, -1,-15,-15,-17,-16,  0,  7,  8,-22, -2,-17;
/M: SY='R';  M=-12, -9,-25, -9, -4,-11,-22,-12,-13, 15,-10, -4, -7,-18, -3, 18,-10, -8, -6,-21, -7, -5;
/M: SY='D';  M= -4,  6,-25,  8,  1,-25, -5,  7,-26, -1,-20,-11,  3,-10, -1, -1, -1, -5,-19,-28,-12, -1;
/M: SY='E';  M= -9, -2,-30, -1, 10,-23, -8, -4,-23, -2,-21,-15,  0,  7,  3, -7, -3, -7,-25,-19,-15,  6;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-19,-11,-12,-12,  2, -8, -8,-13, -8, -3, -8,-10,-11,-14, -4, -8, -5,-11, -9,-12; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M:         M= -6, -3,-16, -4, -1, -8,-15,  0, -5, -5, -2,  0, -3,-14, -1, -5, -4, -2, -5,-18, -2, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='S';  M= -4, -1,-17, -1,  2,-16, -8, -8,-12,  1,-15,-10,  1, -5, -1,  2,  4,  1, -9,-23,-12, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='Q';  M= -4, -1,-16, -2,  1,-17,-12, -4, -9,  6,-12, -4,  0,-11,  8,  7, -1, -3, -5,-18, -9,  4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='E';  M= -1, -5,-17, -5,  6,-10,-14, -4, -9,  0, -7, -5, -5, -2, -1, -4, -3, -3, -9,-16, -7,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='B';  M= -3,  9,-17,  9,  6,-18, -9,  1,-16,  7,-15,-10,  6, -9,  1,  4, -1, -5,-12,-20, -9,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='E';  M= -1, -4,-16, -3,  6,-13, -8, -5,-10,  1, -9, -4, -4, -9,  3, -2,  1, -3, -8,-16, -6,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='N';  M= -4, 10,-16,  9,  7,-18, -3, -1,-14, -2,-17,-11, 12, -9,  6, -4,  7, -1,-15,-23,-12,  6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='B';  M=  0,  2, -8,  1, -2,-13, -5, -7, -8, -3, -7, -5,  0, -9, -1, -6, -2, -5, -7,-15, -9, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-10,  1,  5, -8, -9, -5, -5, -3, -3, -2, -3, -6, -1, -5,  1,  1, -3,-15, -7,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='A';  M=  2, -7,-11, -8, -1, -7, -6, -8, -1, -6,  2,  0, -7, -8, -2, -7, -4, -4,  0,-12, -7, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='P';  M=-10, -1,-20,  3,  4,-25,-16, -9,-23, 11,-24,-14, -3, 14,  3,  7, -5, -7,-20,-24,-16,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M:         M= -7, -4,-11, -7,-11, -1,-16, -4, -5,-11, -8, -4, -1,-13,-11,-11, -1,  0, -2,-21, -2,-11; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-18,-28,-20,  5,-27,-18, 21,-23, 31, 21,-24,-24,-17,-18,-20, -4, 15,-21, -2,-19; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='K';  M= -9, -4,-24, -3,  6,-16,-21, -9,-14,  8, -8, -6, -6,-15,  2,  6, -5,  0,-10,-23, -6,  3;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-31,-21, 12,-29,-18, 20,-27, 41, 23,-28,-28,-19,-19,-27,-10, 12,-18,  2,-20;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20,  0,-29, 39,-26, -9,  1,-13, 13, 37, -9,-11,-21,-21, -8,  9;
/M: SY='G';  M=  7,-10,-27,-11,-19,-29, 60,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-17,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='Q';  M= -8, -4,-27, -2, 16,-32,-20,  1,-15,  4,-17, -3, -5, -5, 37,  2,  0, -7,-19,-24,-13, 26;
/M: SY='M';  M= -9,-24,-19,-32,-24, 10,-25,-11, 22,-17, 19, 38,-23,-24,-13,-15,-19, -8, 18,-18,  2,-18;
/M: SY='M';  M= -1,-17,-20,-23,-14, -1,-23,-10,  8,-14,  3,  9,-13,-18,-12,-12, -7, -1,  9,-21, -3,-14;
/M: SY='Y';  M=-11,-22,-29,-22,-16, 13,-24, -2, -5,-14, -7, -3,-20,  3,-15,-15,-16,-10,-10,  7, 24,-18;
/M: SY='M';  M=-10,-15,-17,-23,-18, -4,-25, -6, 15,-18, 15, 22,-10,-23, -8,-15,-16, -9,  6,-25, -3,-14;
/M: SY='P';  M= -3,  2,-28,  7, 14,-28,-15, -9,-22,  3,-23,-16, -2, 15,  4, -6, -1, -6,-20,-29,-20,  8;
/M: SY='E';  M= -1, 10,-24, 14, 20,-28, -7, -5,-26,  1,-22,-18,  6, -9,  8, -3,  7, -2,-22,-30,-19, 14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  1, -6,-21, -5, -6,-18, 10,-15,-21,-10,-20,-15, -3,-15, -8,-12,  7, -3,-14,-12,-15, -7; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -6, 12,-24, 13, 16,-27, -7, -2,-26,  8,-23,-16, 11,-10,  9,  6,  2, -6,-23,-28,-17, 12; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='S';  M=  0,-12, -9,-15,-14, -8,-11, -6, -6,-13,-10, -2, -8,-20,-10,-13,  6,  6,  1,-24, -2,-13;
/M: SY='I';  M=-11,-28,-25,-33,-25,  8,-27,-21, 26,-27, 25, 17,-22,-25,-20,-23,-22,-11, 14,-15,  5,-24;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-15,-30,-24,  5,-30,-22, 24,-26, 25, 15,-20,-27,-20,-21,-20, -8, 17,-23, -3,-23;
/M: SY='F';  M=-17,-24,-21,-32,-25, 54,-28,-14,  2,-26, 14,  2,-16,-29,-30,-18,-20, -9, -1,  3, 26,-25;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='L';  M= -7,-23,-17,-25,-21,  3,-26,-18, 20,-21, 26, 18,-21,-26,-18,-17,-19, -6, 18,-23, -4,-20; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -1,-14, 18,-17,-21,-22, 25,-22,-29,-22,-19,-16, -8,-25,-21,-22, -4,-14,-18,-28,-26,-21; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='S';  M=  5, -7,-12, -9, -8, -8,-10,-15, -9,-14,-18,-12,  1,-14, -8,-13, 25, 17,  0,-33,-13, -8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-23,-15, -7,-12,-21,-20,-14,-14,-20,-14,-19, 54,-15,-19,-11, -9,-19,-24,-19,-14; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:         M= -3,-13,-10,-17,-18, -8,  0,-11,-14,-17,-13,-10, -6,-24,-17,-16, -5, -9, -8, -8, -6,-17;
/M: SY='V';  M= -3,-28,-18,-32,-26,  1,-30,-25, 29,-23, 21, 18,-26,-26,-22,-21,-17, -5, 30,-24, -5,-25;
/M: SY='D';  M= -9,  6,-23,  8,  2,-20,-11,  1,-22, -4,-19,-12,  3, -9,  1, -4,  6,  7,-17,-27, -8,  0;
/M: SY='T';  M= -3,  1,-17, -2, -6,-16,-11, -8,-12, -7,-14,-10,  4,-16, -7, -5,  9, 11, -5,-32,-13, -7;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-22,-26,-20, -1,-22,-22, 14,-22, 23, 10,-23,-20,-19,-15,-19, -7, 11,-23, -7,-21;
/M: SY='E';  M=-13, 17,-28, 25, 30,-30,-16, -2,-29,  6,-23,-20,  7, -3, 11,  3,  1, -4,-26,-32,-18, 20;
/M: SY='E';  M=  3, 11,-23, 16, 23,-28, -8, -7,-26,  0,-21,-19,  3, -7,  6, -8,  7, -2,-20,-30,-19, 15;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-18,-31,-24,  9,-29,-20, 23,-24, 31, 23,-27,-28,-20,-19,-22, -7, 21,-21, -1,-22;
/M: SY='M';  M=  0,-11,-22,-15, -4, -5,-20, -5, -4, -7, -3,  2,-10,-15, -2,-10, -5, -1, -5,-16,  2, -4;
/M: SY='K';  M= -4,  3,-27,  3,  7,-28,  0, -8,-27,  9,-24,-14,  3, -8,  6,  3,  0, -5,-22,-25,-17,  6;
/M: SY='R';  M=-12,-16,-16,-18,-11, -2,-23, -6, -7, -4,  0,  2,-11,-23, -3, 10, -9, -4, -7,-16,  4, -9;
/M: SY='G';  M= -4,  2,-29,  1, -7,-30, 42,-13,-36, -7,-29,-20,  8,-17,-11,-10,  0,-15,-29,-24,-25, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-30,-19, 23,-28, 44, 24,-28,-28,-18,-20,-28,-10, 12,-20,  0,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2026_03 which contains 575'748 sequence entries.

Total number of hits	27 in 27 different sequences
Number of true positive hits	27 in 27 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PAS H-NOXA-type
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

27 sequences

GCY31_CAEEL (Q86C56), GCY32_CAEEL (Q6DNF7), GCY33_CAEEL (P90895),

GCY34_CAEEL (P92006), GCY35_CAEEL (O02298), GCY36_CAEEL (Q6DNF4), 
GCY37_CAEEL (Q6DNF3), GCY8E_DROME (Q8INF0), GCYA1_BOVIN (P19687), 
GCYA1_CANLF (Q4ZHS0), GCYA1_HUMAN (Q02108), GCYA1_MOUSE (Q9ERL9), 
GCYA1_RAT   (P19686), GCYA2_HUMAN (P33402), GCYA2_MOUSE (F8VQK3), 
GCYA2_RAT   (Q9WVI4), GCYB1_BOVIN (P16068), GCYB1_CANLF (Q4ZHR9), 
GCYB1_HUMAN (Q02153), GCYB1_MOUSE (O54865), GCYB1_RAT   (P20595), 
GCYB2_HUMAN (O75343), GCYB2_MOUSE (Q8BXH3), GCYB2_RAT   (P22717), 
GCYDA_DROME (Q9VEU6), GCYDB_DROME (Q9VEU5), GCYH_DROME  (Q07093)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

10 PDB

pdb_00006jt0; pdb_00006jt1; pdb_00006jt2; pdb_00007d9r; pdb_00007d9s; pdb_00007d9t; pdb_00007d9u; pdb_00008hbe; pdb_00008hbf; pdb_00008hbh