PROSITE entry PS52113

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52113

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	FV_NP_CT
Accession [info]	PS52113
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	04-NOV-2026 CREATED; 04-NOV-2026 DATA UPDATE; 04-NOV-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52113
Associated ProRule [info]	PRU01457

Name and characterization of the entry

Description [info]

Filovirus nucleoprotein C-terminal (NP-Ct) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=97;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=92;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1436496; R2=0.0150442; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=622; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=290; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M= -8, 24,-22, 23,  8,-28, -7,  1,-26,  4,-29,-19, 25,-13,  8, -1, 12,  0,-24,-36,-18,  8;
/M: SY='S';  M=  6,  7,-16,  1, -2,-20, -4, -8,-18, -8,-26,-18, 16, -2, -3,-10, 23, 13,-15,-36,-20, -3;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-28, -2,  6,-28,-15,  3,-23,  7,-27,-12, -1, 13, 12,  1,  4, -4,-23,-28,-14,  7;
/M: SY='S';  M=  3,  2,-17,  5, 16,-23, -7, -8,-23,  1,-28,-19,  7, -8,  6, -3, 25, 10,-16,-35,-19, 11;
/M: SY='S';  M= 12, -2,-17, -2, 13,-21, -8, -8,-16, -4,-16, -8, -1, -8,  3, -9, 14,  3,-11,-30,-18,  8;
/M: SY='Q';  M=-11,  7,-30, 14, 11,-33,-15,  7,-26, -1,-26,-14,  2, 13, 17, -5,  1, -8,-28,-30,-15, 12;
/M: SY='Q';  M=  2, -8,-20, -9,  0,-19,-14, -9,-10, -3, -6, -3, -5,-15, 10, -4,  5,  0,-10,-26,-12,  5;
/M: SY='I';  M=-10,-20,-25,-22, -6,  3,-31,-19, 17,-19, 15,  7,-18,-19,-13,-18,-16, -9, 10,-20, -3,-11;
/M: SY='D';  M= -9, 28,-28, 41, 34,-34,-13, -2,-33,  3,-24,-24,  9, -6,  8, -7,  1, -9,-27,-34,-20, 21;
/M: SY='E';  M= -8,  5,-25,  8, 33,-28,-20, -2,-23,  5,-18,-13,  0, -5, 22,  0,  5,  5,-23,-28,-15, 28;
/M: SY='M';  M=-10,-13,-20,-21,-13, -7,-20, -4,  1,  0,  4, 28,-11,-18,  0,  9, -9,  3,  1,-22, -5, -8;
/M: SY='Y';  M= -3,-18,-25,-20,-18, 18,-23, 10, -2,-10, -2, -2,-18,-25,-10,-12,-13, -8, -8, 18, 56,-18;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  5,-21,-21, 17,-24, 15,-18, -4, -1,-18, 24, 34, -8,-11,-23,-16,  3, 11;
/M: SY='H';  M=-18,  2,-30,  5, 15,-22,-20, 76,-30, -5,-20, -5,  8,-15, 12,  0, -8,-18,-30,-30, 10, 10;
/M: SY='I';  M=  5,-25,-23,-33,-23, -3,-28,-25, 29,-25, 19, 13,-20,-20,-18,-25,-15, -8, 18,-20, -5,-23;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-22,-30,-22, 32,-30,-10, 10,-25, 28, 10,-25,-30,-22,-18,-25,-10,  3, -1, 27,-22;
/M: SY='E';  M=-12,  3,-30,  8, 33,-29,-20, -1,-29, 22,-22,-14,  0, -7, 20, 22, -4,-10,-26,-25,-15, 26;
/M: SY='T';  M= -1, -7,-12,-14,-11, -6,-20,-19, -4,-15,  3, -4, -6,-15,-11,-12, 10, 32,  1,-29, -9,-11;
/M: SY='Q';  M= -5,  2,-25,  5, 25,-33,-15,  3,-22,  5,-22,-10,  2, -8, 36,  3, 10, -3,-25,-27,-15, 30;
/M: SY='G';  M= -2,-12,-32,-10,-15,-30, 48,-20,-35,-18,-30,-20, -5,  7,-18,-20, -2,-18,-30,-22,-30,-18;
/M: SY='P';  M=  2, -1,-30,  7,  2,-30,-13,-15,-22, -8,-25,-20, -8, 42, -8,-18, -3, -8,-23,-30,-25, -5;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-35,-28, 68,-30,-10,  0,-25,  8,  0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 42,-28;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M=  4, 15,-18, 20, 17,-23, -7, -5,-21,  0,-16,-16,  4, -5,  2, -8,  2, -5,-15,-23,-15,  9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 38, -8, -8,-15, -8,-15,  0,-15, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8,-15,  8,  0,  0,-15,-15, -8; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='I';  M= -7,-23,-23,-32,-25, -2,-34,-28, 33,-24, 12, 12,-16,-19,-19,-24, -9,  6, 25,-23, -3,-25;
/M: SY='N';  M=-10, 19,-20,  5, -6,-11, -9,  1, -8, -9, -6, -8, 33,-23, -6, -6, -2, -3,-18,-34,-14, -6;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-18,-13,-30,-10, -1, 15,-28, 15, -7, -5, -5, -5,-15,-23, -3, -8,-15,-10,-15, 15, 56, -5;
/M: SY='H';  M=-20,  5,-30, 10, -2, -8,-21, 48,-22, -8,-16, -7,  2,-21,  1, -6,-11,-14,-23,-12, 31, -4;
/M: SY='M';  M=-10, -2,-22,-11, -8,-11,-16, -2, -2,  5, -1, 19,  3,-19,  0,  1,-11, -8, -7,-25, -7, -4;
/M: SY='M';  M= -8,-10,-20,-18, -8,-12,-20, -2,  3, -5,  3, 29,-10,-15, 12, -5, -5,  4, -2,-22, -5,  2;
/M: SY='Q';  M= -4,  0,-21, -3,  4,-24,-18, -9,-20, 13,-21, -9,  1,-10, 14,  7,  8, 14,-14,-26,-11,  9;
/M: SY='D';  M=-11, 25,-28, 29, 13,-31, 10, -2,-33, -3,-28,-23, 21,-13, -1, -8,  2,-10,-30,-33,-22,  6;
/M: SY='E';  M=-15, -7,-35, -2, 24,-18,-20, -7,-28,  8,-20,-18,-10,-12,  8, 12,-12,-15,-28, 16, -5, 16;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -5,-23,-21,-26,-18,-10,-31,-20, 24,-16,  6, 11,-20,-22, -5,-16,-11, -5, 25,-25, -7,-13;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-19,-21,-16, -9,-24,-19,  6, -6, -2,  0,-11,-19,-11,  2, -3,  8, 12,-24, -9,-16;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-18,-38,-30, 61,-30,-22,  7,-28, 10,  2,-22,-30,-38,-20,-18, -8, 12,  0, 20,-30;
/M: SY='S';  M=  5, -7,-10,-10,-10,-13,-12,-17, -5,-12,-15,-10, -2,-15,-10,-12, 23, 22,  7,-35,-15,-10;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,  2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='N';  M= -5, 16,-22, 15, 11,-26, -8, -3,-26, 10,-29,-19, 20,-11,  5,  3, 12,  1,-22,-34,-18,  8;
/M: SY='D';  M=-12, 30,-25, 34, 11,-31, -9, -1,-31, 11,-30,-22, 24,-12,  2,  2,  4, -4,-25,-35,-18,  7;
/M: SY='G';  M= -2,  2,-28, -3,-15,-28, 53,-13,-35,-15,-30,-20, 14,-20,-15,-15,  2,-15,-30,-25,-28,-15;
/M: SY='R';  M=-15, -2,-30, -2,  5,-25,-20, 19,-30, 31,-25, -8,  2,-15, 10, 32,-10,-12,-22,-22, -3,  5;
/M: SY='E';  M=-10, 17,-25, 25, 33,-28,-18, -5,-28,  3,-20,-20,  5, -5,  8, -5,  5,  5,-23,-32,-18, 21;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 10,  0,-15,  2,  0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22;
/M: SY='T';  M= -3,-14,-15,-20,-17, -3,-26,-22,  8,-18, 10,  3,-13,-18,-16,-16,  0, 24, 11,-27, -7,-17;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-15, 36,-28, 41, 15,-35,-10,  5,-30,  2,-28,-20, 25,-12, 14, -3,  2, -8,-30,-35,-18, 15;
/M: SY='D';  M= -5, 24,-20, 34, 10,-30, -5, -5,-30, -5,-30,-25, 15,-10,  0,-10, 21,  5,-20,-40,-20,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='E';  M=-10,  0,-28,  8, 41,-20,-22, -5,-18,  0, -3,-10, -7, -7, 10, -5, -7,-10,-20,-28,-15, 25;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-30,  9, 19,-33, 12, -4,-32, -1,-24,-16,  2,-10, 14, -5,  0,-13,-30,-25,-21, 17;
/M: SY='E';  M=  6, -6,-18, -8,  8,-13,-18,-14, -9, -9,  2, -6, -9,-12, -4,-12,  0,  7, -6,-25,-13,  2;
/M: SY='Y';  M=-18, -6,-25,-13,-15, 25,-22, 16, -8,-12, -7, -5,  3,-27,-13, -9,-12, -9,-15,  2, 37,-15;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='W';  M=-18,-28,-45,-25, -8,  0,-20,-23,-22,-13,-20,-20,-30,-23,-10,-15,-30,-25,-30,106, 18, -5;
/M: SY='L';  M= -5,-13,-20,-11,  4, -7,-20,-13, -2,-15, 14,  1,-13,-18, -5,-13, -6, -3, -5,-27,-10, -1;
/M: SY='T';  M=  1,-10,-17,-12,-12,-13,  5,-17,-13,-17, -6, -8, -4,-17,-12,-15,  9, 10, -8,-28,-15,-12;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-30,  1, 26,-23,-25,-10,-11, 10,-13, -8, -5, -7,  8,  0, -7,-10,-13,-25,-13, 16;
/M: SY='K';  M= -8,  2,-25,  2, 17,-25,-20,-10,-25, 26,-23,-12,  0, -8,  8, 13,  0,  5,-18,-25,-12, 12;
/M: SY='E';  M=  5, 12,-23, 10, 28,-25,-10, -2,-23,  3,-20,-18, 12, -7,  8, -5,  5, -5,-23,-30,-20, 18;
/M: SY='A';  M= 13,-12,-20,-16, -4,-18,-14,-10, -7, -5,  1,  0,-11,-16,  7, -2, -4, -6, -7,-20,-12,  1;
/M: SY='M';  M= -8,-21,-20,-23,-15, -4,-26,-16, 10, -4, 15, 18,-21,-23,-11, -6,-18, -8, 12,-22, -5,-13;
/M: SY='E';  M= -9, 14,-22, 14, 16,-21,-15, -4,-14, -1,-17,-14, 13,-14,  0, -6,  1, -5,-11,-34,-18,  8;
/M: SY='E';  M=  4,  3,-25,  6, 32,-28,-15, -7,-25, 14,-20,-15, -2, -5, 11,  2,  0, -8,-21,-25,-18, 21;
/M: SY='E';  M=-14, 10,-30, 20, 33,-17,-20,  5,-25,  3,-17,-17, -1, -9,  9, -4, -5,-10,-25,-17,  4, 20;
/M: SY='N';  M=-10, 13,-25,  1, -2,-20,-15,  0, -3, -5,-16, -5, 26,-18, 10, -5,  0, -5,-16,-30,-13,  2;
/M: SY='R';  M=-15, -3,-25, -8, -5,-13,-18, -2,-16,  8, -6, -5,  7,-22,  0, 31,-10, -8,-15,-25,-10, -5;
/M: SY='F';  M=-13,-18,-25,-21,-16, 21,-25,-11, -7,-16, -7, -7,-15,  4,-19,-15, -8,  4, -9, -5, 17,-18;
/M: SY='I';  M= -7,-13,-20,-21,-22, -4,-26,-19, 23,-19,  8,  7, -5,-25,-19,-18,-10, -4, 20,-28, -8,-22;
/M: SY='T';  M=  3, -5,-12, -8, -8, -9,-13,-12, -9,-11,-16,-12, -1,-14, -7,-11, 22, 23, -1,-28, -5, -8;
/M: SY='L';  M=  5,-23,-20,-30,-20, -1,-23,-18, 19,-21, 23, 20,-21,-21,-14,-20,-16, -8, 12,-20, -5,-18;
/M: SY='D';  M=-16, 25,-29, 30, 10,-30,-14, 23,-33, 10,-28,-17, 17,-14,  5,  3, -4,-11,-28,-33, -8,  6;
/M: SY='E';  M= -8, 12,-29, 16, 25,-30, 10, -5,-33, -1,-25,-21,  9, -9,  4, -7,  1,-12,-30,-29,-23, 14;
/M: SY='Q';  M= -8, -7,-23,-10,  3,-21,-22, -5, -8, -5, -1,  2, -7,-15, 24, -2, -2,  4,-13,-22, -8, 13;
/M: SY='Q';  M= -8, -2,-30, -2, 10,-38,  2,  3,-25,  3,-22, -5,  0,-12, 41,  3,  0,-12,-30,-20,-15, 26;
/M: SY='F';  M= -1,-18,-20,-25,-13, 27,-20,-13, -7,-15, -2, -2,-13,-20, -9,-13, -8, -8, -7, -5,  8, -8;
/M: SY='Y';  M=-17,  2,-28,  8,  8,  2,-23,  2,-15, -7, -6,-10, -7,-18, -5,-10,-11,-10,-16, -9, 17,  1;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='P';  M=  4,-18,-33,-12, -2,-28,-15,-20,-18,-10,-25,-18,-18, 66,-10,-20, -5, -8,-23,-28,-28,-10;
/M: SY='D';  M=-10,  9,-20, 18, -6,-19,-20,-15, -4,-10, -9, -9, -6,-20,-15,-15, -5, -5, 11,-35,-15,-11;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='S';  M=  4, 12,-13,  6,  0,-20,  0, -4,-20, -7,-30,-20, 25,-13,  0, -7, 31, 14,-16,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M= -1,-15,-23,-19,-12,  6,-19, 15,-11,-17, -4, -3,-10, -9,-12,-14,-10,-11,-11,-17,  5,-13;
/M: SY='R';  M=-17,  8,-30, 13,  8,-28,-18, -3,-32, 30,-26,-15,  5,-14,  8, 37, -8,-10,-22,-25,-12,  6;
/M: SY='E';  M=-12, 28,-27, 31, 33,-29,-12,  3,-29,  5,-25,-22, 22, -8, 10, -2,  3, -7,-30,-35,-20, 22;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='F';  M=-20,-23,-25,-28,-20, 44,-28, -5, -7,-11,  0, -2,-15,-28,-21,  4,-18,-10, -7,  8, 32,-20;
/M: SY='M';  M=-12,-20,-22,-23,-15,  0,-25, 15,  8,-19, 24, 27,-17,-25, -7,-12,-22,-12,  0,-22,  5,-12;
/M: SY='A';  M= 21,-20,-12,-27,-20,  9,-15,-22,  2,-17,  0, -3,-17,-20,-22,-20, -2, -2, 12,-15, -6,-20;
/M: SY='I';  M=  6,-25,-21,-32,-23, -2,-27,-25, 26,-24, 19, 12,-21,-21,-19,-24,-14, -7, 20,-21, -6,-23;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-22,-32,-22,  5,-30,-18, 27,-25, 35, 30,-25,-25,-15,-20,-25,-10, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M=-10, 19,-25, 10, 10,-30,-10, 10,-20,  5,-25,-10, 29,-15, 31,  5,  5, -5,-30,-30,-15, 21;
/M: SY='H';  M=-15,  2,-25, -2, -5,-13,-18, 49,-15,-12, -5,  0, 12,-22,  0, -5,-10,-13,-20,-30,  5, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2026_04 which contains 576'073 sequence entries.

Total number of hits	12 in 12 different sequences
Number of true positive hits	12 in 12 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Filovirus NP-Ct
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

12 sequences

NCAP_EBOG4  (Q9QCE9), NCAP_EBORE  (Q91DE1), NCAP_EBORR  (Q8JPY1),

NCAP_EBOSB  (Q9QP77), NCAP_EBOSU  (Q5XX08), NCAP_EBOZ5  (O72142), 
NCAP_EBOZM  (P18272), NCAP_MABVA  (Q1PD53), NCAP_MABVM  (P27588), 
NCAP_MABVO  (Q6UY69), NCAP_MABVP  (P35263), NCAP_MABVR  (Q1PDD0)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

15 PDB

pdb_00004qaz; pdb_00004qb0; pdb_00004w2o; pdb_00004w2q; pdb_00005w2b; pdb_00006app; pdb_00006ehl; pdb_00006ehm; pdb_00006u51; pdb_00006u52; pdb_00006u54; pdb_00006u55; pdb_00008usn; pdb_00008ust; pdb_00008y9j
» more