PROSITE entry PS50001
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50001
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | SH2 |
Accession [info] | PS50001 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1995 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50001 |
Associated ProRule [info] | PRU00191 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Src homology 2 (SH2) domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=92; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=87; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3941; R2=0.01483; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=547; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=412; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='W'; M=-16,-34,-40,-35,-25, 9,-21,-24,-17,-19,-16,-17,-34,-25,-18,-19,-33,-25,-25,111, 26,-18; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-26,-29,-24, 41,-30, -2, 7,-20, 6, 2,-19,-28,-22,-16,-19,-10, -1, 14, 48,-24; /M: SY='H'; M=-14,-14,-23,-18,-14, 7,-23, 31, -9,-15, -3, 4, -8,-24, -9,-10,-15,-14,-11, -8, 18,-12; /M: SY='G'; M= -3, -9,-30, -8,-14,-26, 45,-17,-36, -9,-28,-18, -1,-14,-14, -8, -3,-17,-27,-20,-24,-14; /M: SY='K'; M= -8, -1,-25, -2, 0,-10,-16, -5,-19, 6,-18,-11, 1, -7, -3, 1, -4, -6,-16,-21, -6, -2; /M: SY='I'; M= -8,-28,-24,-35,-27, 4,-34,-25, 36,-26, 23, 21,-23,-23,-20,-24,-19, -8, 26,-21, -1,-26; /I: I=-4; MI=0; IM=0; /M: SY='S'; M= 1, 3,-18, 1, 0,-21, -4, -9,-20, -6,-25,-17, 10, -3, 0, -8, 20, 14,-16,-34,-19, 0; /M: SY='R'; M=-16, -9,-30, -9, -1,-23, -8, -5,-31, 26,-23,-11, 0,-18, 6, 51, -9,-11,-21,-18,-12, -1; /M: SY='E'; M= -2, 2,-25, 1, 12,-25,-12, -3,-21, 6,-20,-12, 2,-11, 10, 3, 2, -4,-18,-23,-14, 11; /M: SY='E'; M=-10, 10,-29, 16, 26,-30,-15, 0,-26, 10,-21,-14, 3, -9, 19, 5, -2, -9,-25,-26,-13, 22; /M: SY='A'; M= 36,-11,-11,-17, -7,-18, -6,-20, -6,-10, -9, -8,-11,-12,-10,-18, 8, 1, 4,-23,-18, -9; /M: SY='E'; M=-10, 4,-28, 9, 36,-22,-20, 2,-23, 5,-16,-14, -1, -7, 12, 2, -2, -8,-22,-26,-12, 23; /M: SY='R'; M= -6, 4,-25, 5, 10,-24,-14, -1,-23, 10,-19,-11, 3,-13, 9, 11, 0, -5,-19,-25,-11, 8; /M: SY='L'; M=-10,-23,-23,-25,-15, 1,-27,-12, 13,-19, 28, 17,-22,-25, -8,-12,-22, -9, 4,-18, 2,-12; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 49, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 11,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M= -8, -9,-23,-12, -6,-13,-19, -9, -6, 1, -1, 4, -6,-18, 1, 5, -8, -4, -6,-23, -7, -4; /M: SY='N'; M= -4, 9,-22, 7, 5,-23, -9, -2,-21, 0,-21,-13, 11,-10, 5, -2, 5, -1,-19,-30,-15, 4; /M: SY='K'; M= -8, -5,-27, -4, 3,-22,-12, -9,-19, 7,-20,-11, -2, -1, 2, 5, -3, -5,-16,-24,-13, 1; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; /M: SY='G'; M= -4, -6,-21, -5, -1,-21, 10,-11,-22, -9,-20,-12, -4, 2, -6,-10, -1, -9,-19,-23,-19, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='B'; M=-11, 10,-24, 10, 4,-20,-14, -1,-18, 5,-18,-10, 9, -4, 1, 3, -3, -6,-17,-26,-12, 1; D=-4; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='E'; M= -4, 3,-14, 6, 9,-14, -8, -2,-12, 0,-12, -8, 1, 4, 4, -2, 1, -2,-12,-16, -9, 6; D=-4; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= -1,-11,-27,-11,-20,-29, 66,-20,-39,-20,-30,-20, -1,-21,-20,-20, -1,-20,-30,-17,-29,-20; /M: SY='T'; M= 5, 3,-13, 0, -3,-18,-10,-13,-16, -9,-14,-13, 1,-12, -6,-12, 14, 18, -8,-31,-15, -5; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-22, 8,-30,-21, 23,-28, 43, 21,-29,-29,-20,-20,-27, -9, 15,-21, -1,-21; /M: SY='V'; M= -3,-29,-17,-32,-28, 1,-32,-28, 32,-24, 19, 14,-26,-26,-25,-23,-15, -4, 36,-25, -6,-28; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='E'; M=-12, 4,-29, 10, 23,-15,-20, -6,-22, 1,-15,-14, -3, -2, 6, -5, -6,-10,-22,-23,-11, 15; /M: SY='S'; M= 8, -1,-10, -2, -1,-20, -2,-10,-20, -7,-28,-19, 8,-11, 0, -4, 34, 17,-10,-37,-19, -1; /M: SY='E'; M= -8, 9,-25, 15, 23,-26,-16, -1,-24, 4,-20,-16, 4, -9, 10, 2, 4, -3,-20,-31,-16, 16; /M: SY='S'; M= -2, 1,-18, -2, -1,-21, -6, -6,-22, 1,-24,-15, 8,-10, 1, 2, 16, 13,-15,-31,-15, -1; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; /M: SY='S'; M= -4, 0,-22, -2, 3,-15,-12, -2,-19, 1,-18,-11, 3, -8, 1, -2, 4, 3,-16,-25, -8, 1; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='P'; M= -6,-11,-22,-10, -3,-14,-16,-12, -5, 0, -9, -4,-10, 19, -4, -3, -8, -5, -8,-17,-11, -6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -1, -2,-29, -3,-12,-30, 50,-15,-36,-15,-29,-19, 5,-15,-13,-16, 1,-16,-29,-23,-27,-13; /M: SY='D'; M= 0, 10,-20, 15, 8,-28, 4, -9,-28, -6,-22,-19, 5,-12, -1,-11, 6, -5,-21,-31,-21, 4; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-26,-26,-20, 33,-30, 3, 4,-17, 3, 2,-18,-27,-18,-13,-17, -9, -2, 11, 46,-21; /M: SY='T'; M= 9, -8, -9,-13,-10,-14,-12,-18, -7,-12,-12, -9, -5,-11,-10,-14, 15, 21, 3,-31,-15,-10; /M: SY='L'; M=-10,-29,-18,-32,-24, 10,-32,-23, 24,-27, 33, 16,-26,-28,-22,-20,-24, -9, 16,-20, 0,-24; /M: SY='S'; M= 10, -4, -7, -7, -6,-17, -5,-13,-15,-12,-22,-15, 3,-13, -5,-13, 28, 18, -6,-34,-16, -6; /M: SY='V'; M= -8,-29,-20,-31,-26, 11,-27,-22, 16,-22, 11, 7,-26,-28,-25,-19,-18, -6, 21, 0, 4,-25; /M: SY='R'; M=-11,-16,-25,-17,-10, -7,-22,-10,-10, 7, -7, -3,-11,-21, -5, 18,-11, -8, -5,-10, -2, -9; /M: M= -8, -1,-20, 0, -4, -7,-19, -7,-14, -6,-11, -9, -5,-18, -8, -6, -5, -2, -9,-15, 0, -6; /M: SY='D'; M=-10, 5,-25, 7, 3,-19, -6, -7,-25, 0,-20,-15, 3,-15, 0, -1, -3, -9,-22,-16,-11, 1; /M: SY='G'; M= -4, 7,-25, 11, -3,-25, 13,-11,-27, -9,-23,-18, 4,-16, -8,-10, 3, -7,-18,-25,-19, -5; /I: I=-2; MI=0; IM=0; /M: SY='Q'; M= -8, 2,-23, 1, 4,-22,-13, 0,-17, 4,-16, -9, 4,-15, 5, 4, -2, -6,-15,-28,-12, 4; /M: SY='V'; M= -4,-19,-17,-21,-21, -3,-23,-20, 14,-16, 0, 2,-16,-19,-21,-14, -8, -3, 23,-27, -9,-22; /M: SY='K'; M=-10, -2,-28, -4, 3,-23,-11, -4,-23, 20,-21, -8, 1,-14, 9, 18, -5, -6,-19,-21, -9, 5; /M: SY='H'; M=-18, -2,-29, -2, 2,-18,-20, 78,-26, -8,-16, -1, 6,-19, 8, 1, -9,-17,-26,-29, 14, 1; /M: SY='Y'; M=-15,-24,-14,-29,-24, 26,-30, -9, 3,-20, 2, -1,-21,-23,-22,-18,-18, -8, -1, 8, 31,-24; /M: SY='R'; M=-13, -4,-27, -5, 0,-21,-21, -2,-16, 16,-15, -4, -1,-17, 7, 22, -9, -8,-11,-24, -8, 1; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-37,-29, 4,-37,-29, 41,-27, 19, 17,-22,-23,-22,-26,-19, -8, 30,-20, 0,-29; /M: SY='Q'; M=-12, -3,-21, -5, 4,-19,-20, 3,-16, 8,-13, -2, 1,-17, 12, 12, -8, -9,-17,-23, -7, 7; /M: SY='K'; M= -4, -1,-19, -3, 3,-20,-15, -3,-21, 5,-21,-12, 2, -6, 2, 5, 4, 2,-16,-26,-12, 1; /M: SY='T'; M= -6, -7,-19, -8, -6, -7,-21,-13, -3,-11, 1, -2, -7,-17, -9, -8, -4, 4, -1,-26, -8, -8; /M: SY='D'; M= -5, 11,-24, 17, 14,-29, -3, -7,-27, -3,-21,-17, 3, -4, 3, -9, 1, -6,-23,-29,-19, 8; /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; /M: SY='N'; M= -6, 13,-20, 10, 3,-22, 0, -4,-22, 0,-21,-15, 16,-12, 1, -1, 7, 3,-19,-28,-16, 2; D=-2; /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12; /M: SY='G'; M= -1, -2,-14, -3, -4,-16, 22, -8,-20, -6,-16,-11, 2,-10, -6, -5, 2, -7,-15,-14,-15, -5; D=-2; /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-12; /M: SY='K'; M= -8, -6,-27, -5, -2,-20, -6, -7,-20, 4,-17, -9, -4, -6, -2, 0, -6, -7,-16,-24,-12, -3; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-26,-26,-23, 35,-27, 2, 2,-18, 7, 2,-21,-30,-19,-14,-20,-10, -4, 18, 51,-23; /M: SY='Y'; M= -9,-10,-17,-13,-13, 6,-18, -4, -9, -9, -8, -5, -7,-22,-10, -4, -3, 0, -7,-10, 15,-13; /M: SY='I'; M= -7,-25,-22,-29,-20, 2,-31,-23, 23,-19, 17, 12,-21,-20,-19,-19,-17, -7, 19,-21, -3,-21; /M: SY='S'; M= -2, 1,-23, -1, -1,-20, 0,-11,-23, -3,-22,-16, 3, -9, -3, -5, 6, 4,-18,-20,-13, -3; /M: SY='E'; M= -6, 4,-26, 6, 9,-25, 3, -7,-25, -4,-22,-16, 5, -8, 1, -5, 3, -4,-21,-27,-18, 4; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; /M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -3, 0,-13, -1, -5,-14, 6,-11, -7, 2, -7, 0, 10, -3, -5,-12,-14, -9, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-29; /M: M= -6, -6,-23, -5, -1,-15,-19, -1, -9, -4, -5, -3, -6,-13, -2, -1, -6, -5, -7,-26, -8, -2; /M: SY='R'; M= -4, -4,-18, -8, -4,-16,-12, -9,-17, 3,-16,-10, 0,-13, 0, 4, 2, 3,-12,-24, -9, -3; /M: SY='F'; M=-15,-26,-19,-34,-26, 59,-28,-14, 0,-26, 8, 0,-17,-28,-32,-19,-18, -9, -1, 5, 27,-26; /M: SY='N'; M= -4, 6,-19, 5, 1,-24, -1, -7,-23, -5,-22,-15, 9, -6, -3, -5, 3, -5,-20,-31,-20, -1; /M: SY='S'; M= 3, 5, -9, 2, -3,-19, -5,-12,-19, -9,-24,-18, 9,-12, -5,-10, 25, 20,-11,-36,-18, -4; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23, 11,-32,-23, 26,-28, 35, 18,-26,-25,-21,-22,-25, -9, 16,-19, 1,-23; /M: SY='P'; M= -1, -5,-24, -7, -3,-20,-10, -7,-14, -6,-16, -8, -3, 2, 2, -9, 0, -2,-14,-22,-12, -2; /M: SY='E'; M=-10, 13,-28, 21, 30,-28,-18, 1,-25, 3,-17,-15, 2, -8, 15, -4, -2, -8,-24,-27,-12, 22; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-31,-21, 8,-31,-20, 23,-27, 41, 22,-27,-28,-18,-18,-27,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='I'; M= -5,-30,-17,-35,-29, 0,-35,-29, 38,-25, 16, 15,-25,-25,-25,-25,-16, -5, 37,-25, -5,-29; /M: SY='E'; M= -8, 3,-25, 5, 11,-20,-15, 4,-19, 2,-16, -8, 2,-13, 9, 2, -1, -5,-18,-23, -6, 9; /M: SY='H'; M=-17, -5,-28, -5, -6, -2,-20, 49,-17,-10,-12, -3, -1,-22, -1, -6,-11,-14,-19,-11, 30, -7; /M: SY='Y'; M=-19,-16,-29,-17,-15, 19,-28, 32, -6,-12, -1, 1,-14,-27, -7, -9,-18,-12,-13, 11, 56,-15; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-23, -6, 4,-20,-17, -6,-17, 8,-15, -5, -3, -9, 10, 9, 2, 1,-14,-24,-10, 6; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-26, 1, 7,-23,-20, 9,-18, 10,-18, -6, 1,-14, 12, 6, -4, -6,-15,-24, -4, 8; /M: SY='N'; M= -5, 6,-21, 1, 1,-18,-12, 4,-14, -3,-15, -6, 11,-15, 1, -2, 3, 0,-13,-31,-12, 0; /M: SY='S'; M= 6, -5,-22, -5, 0,-24, -5, -6,-20, -2,-21,-11, -2, 1, 2, -6, 7, -2,-16,-27,-17, 0; /M: M= -2, -2,-20, -1, -6,-16,-12,-14, -6,-11, -1, -3, -7,-18, -8,-13, -8, -7, -4,-26,-13, -8; /M: SY='G'; M= -2, -9,-26, -7, -6,-20, 12,-15,-21, -9,-17,-12, -7, -8,-10,-10, -3, -9,-15,-22,-17, -9; /M: SY='L'; M=-11,-12,-19,-13, -5, -7,-25,-11, 3,-13, 15, 4,-10,-22, -6, -7,-16, -8, -3,-25, -7, -6; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; /M: SY='C'; M= -4,-14, 11,-20,-17,-11,-22,-17, -3,-15, -4, -3,-12,-21,-15,-16, -6, 0, 3,-29,-11,-17; D=-4; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: M= -9, -4, -6, -7, -3,-10,-17, -1,-16, -6,-15, -8, -1,-13, -4, -5, -1, -1,-13,-25, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M=-11, -9,-24,-10, -2,-14,-22, -7,-14, 14,-13, -5, -6,-15, 0, 17, -9, -5, -9,-20, -4, -3; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20, 11,-30,-16, 19,-27, 43, 19,-28,-29,-18,-19,-28,-10, 9,-15, 8,-20; /M: SY='R'; M= -7,-11,-22,-13, -7,-11,-20, -9, -8, 2, -4, -2, -8,-18, -3, 8, -5, 2, -4,-22, -4, -6; /M: SY='Y'; M=-12, -4,-25, -5, -4, -4,-20, 5,-12, -1,-12, -7, -4,-19, -1, 1, -5, -3,-12,-10, 16, -4; /M: SY='P'; M= -5,-18,-34,-12, -3,-26,-19,-18,-15,-11,-24,-15,-17, 65,-10,-19, -6, -6,-21,-29,-26,-10; /M: SY='V'; M= -5,-22, 7,-24,-20, -2,-28,-22, 7,-18, 4, 2,-22,-26,-22,-18,-12, -6, 17,-27, -8,-21; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 475 in 432 different sequences |
Number of true positive hits | 475 in 432 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 23 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 95.38 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 2 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | P_Bucher |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | SH2 |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]