 |
|
| Entry: PS50032 |
General information about the entry
| Entry name [info] | KA1 |
| Accession [info] | PS50032 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUN-2006 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 13-NOV-2019 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50032 |
| Associated ProRule [info] | PRU00565 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Kinase associated domain 1 (KA1) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1002729; R2=0.0181136; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2438.1193848; R2=2.0070176; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; H_SCORE=3171; N_SCORE=8.7; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; H_SCORE=2926; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= 4, 4,-22, 5, -2,-25, 2, -7,-23, -5,-20,-15, 3, -9, -3, -9, 7, -1,-17,-29,-17, -3; /M: SY='D'; M= -7, -1,-25, 5, -1,-20, -9,-14,-12,-10, -9, -9, -6, -7, -8,-13, -5, -6, -8,-29,-16, -5; /M: M= -5, -6,-24, -8, -7,-12, -5,-11,-12, -7, -9, -5, -3,-14, -4, -7, -4, -7,-11,-23,-11, -6; /M: SY='S'; M= -3, -4,-24, -4, 0,-20, 0,-13,-20, -7,-15,-13, -1, -3, -6, -7, 2, -1,-17,-27,-18, -4; /M: SY='G'; M= -4, 2,-25, 3, 2,-27, 7,-10,-28, 1,-26,-17, 4, -5, -1, -1, 5, -3,-22,-28,-20, 0; /M: SY='S'; M= 1, -2,-21, -3, 3,-19,-14, -2,-13, -8,-12, -7, -2, -5, 1,-10, 4, 3,-11,-29,-13, 1; /M: SY='V'; M= 2,-15,-19,-17, -9,-11,-20,-19, 3,-13, -1, -2,-13, -6,-13,-14, -2, 2, 6,-28,-14,-12; /M: SY='V'; M= -4,-28,-16,-30,-26, 1,-29,-24, 28,-23, 20, 17,-26,-27,-22,-20,-15, -4, 32,-26, -6,-25; /M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -3, 10,-22,-20, 4,-26, 25,-22, -9, 0,-13, 11, 23, -7, -8,-20,-21, -6, 9; /M: SY='F'; M=-19,-31,-24,-40,-30, 66,-29,-22, -2,-28, 6, -2,-23,-30,-37,-20,-22,-12, -2, 29, 28,-29; /M: SY='E'; M= -9, 11,-28, 19, 52,-29,-17, 0,-29, 8,-21,-20, 5, -2, 17, -1, 3, -7,-29,-31,-20, 35; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-36,-27, 5,-34,-25, 37,-27, 25, 22,-23,-24,-20,-24,-21, -9, 25,-20, 0,-26; /M: SY='E'; M=-12, 0,-29, 4, 29,-19,-22, 11,-22, 2,-14, -8, -3,-10, 22, 0, -5,-11,-25,-21, -5, 25; /M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-33,-27, 3,-33,-27, 33,-26, 24, 16,-27,-27,-24,-23,-18, -6, 33,-24, -4,-27; /M: SY='C'; M= -9,-21, 19,-25,-24, 2,-29,-16, -2,-15, -5, -4,-20,-30,-22,-16,-11, -3, 9,-19, 7,-24; /M: SY='K'; M=-10, -3,-28, -3, 7,-27,-20, -7,-25, 35,-24, -8, -1,-12, 14, 28, -7, -6,-17,-21,-10, 10; /M: SY='V'; M= -4,-19,-15,-23,-21, -1,-25,-21, 17,-20, 15, 9,-17,-24,-19,-17, -9, 4, 21,-27, -7,-20; /M: SY='P'; M=-11, -8,-33, -2, 15,-28,-19, -8,-25, 9,-25,-16, -7, 29, 8, 9, -5, -9,-26,-27,-20, 8; /M: SY='R'; M=-12, 0,-27, 0, 5,-18,-13, -7,-14, 2, -9, -8, 2,-17, -1, 9, -8, -9,-14,-26,-13, 1; /M: SY='L'; M= -8,-11,-22, -9, -4, -8,-18,-14, -2,-13, 4, 0,-12,-11,-11,-13,-10, -6, -1,-26,-11, -8; /M: SY='G'; M= -6, -1,-25, -2, -6,-20, 9, -4,-25, -1,-23,-14, 4,-14, -6, -4, 2, -4,-20,-22, -9, -7; /M: SY='L'; M= -8,-21,-23,-23,-18, 4,-18,-11, 7,-19, 19, 7,-18,-26,-16,-15,-19,-10, 1,-12, 10,-18; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='L'; M= -6,-13,-21,-16,-12, -4,-20, 1, 0,-11, 5, 2, -7,-23, -9, -3,-10, -6, 0,-20, 2,-12; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= 0, -9,-20, -9,-15,-18, 38,-15,-22,-15,-17,-12, -3,-16,-15,-15, 1,-11,-14,-17,-20,-15; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26, 3,-33,-25, 33,-26, 27, 19,-26,-26,-22,-23,-20, -7, 28,-23, -3,-26; /M: SY='D'; M=-16, 14,-28, 20, 9,-28,-16, 11,-28, 5,-20,-13, 7,-14, 12, 12, -2, -6,-23,-29,-10, 8; /M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-33,-23, 37,-30,-18, 8,-21, 18, 8,-20,-27,-25, -9,-21,-10, 4, -6, 13,-23; /M: SY='K'; M=-12, 0,-29, -2, 9,-29,-19, 2,-24, 25,-21, -6, 3,-14, 24, 25, -6,-10,-23,-22, -9, 16; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10, 0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='I'; M= -7,-27,-21,-31,-24, 0,-31,-23, 29,-20, 21, 19,-24,-25,-19,-19,-19, -7, 25,-23, -3,-23; /M: SY='S'; M= 2, -1,-12, -1, 2,-22, -6,-11,-23, 0,-23,-16, 2,-13, -1, 0, 14, 5,-14,-32,-18, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M= -9, 16,-26, 17, 3,-27, -7, -6,-24, -5,-28,-21, 16, 15, -4,-11, 6, 1,-25,-36,-22, -2; /M: SY='T'; M= 5, -7,-19,-11, -3,-17,-13, -8,-11, -7,-10, -4, -5,-11, 7, -8, 7, 9,-10,-22, -7, 1; /M: SY='W'; M=-16,-31,-33,-33,-25, 22,-25,-20, -3,-23, 3, -4,-29,-29,-21,-19,-27,-17,-11, 60, 25,-21; /M: SY='Q'; M= -3,-10,-23,-11, -5,-16,-17, -4, -2,-11, 4, 5, -9,-19, 6,-10, -9, -9, -5,-23, -8, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24, 51,-30, 3, 0,-19, 4, 0,-20,-30,-23,-14,-20,-10, -6, 21, 59,-24; /M: SY='K'; M=-12,-12,-27,-12, -2,-12,-23,-11,-13, 17, -2, 0,-10,-18, 2, 17,-16,-10,-11,-19, -5, -1; /M: SY='D'; M=-12, 14,-25, 15, 11,-18,-15, -4,-23, 2,-20,-14, 10, -7, 0, 0, 1, -1,-20,-29,-14, 5; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-33,-25, 11,-32,-22, 28,-27, 32, 20,-26,-27,-21,-22,-24, -9, 19,-19, 1,-24; /M: SY='C'; M= 12,-19, 24,-27,-22, -7,-20,-23, -4,-20, -6, -6,-18,-25,-21,-23, -5, -5, 8,-26,-11,-22; /M: SY='S'; M= 3, 3,-19, 4, 9,-24,-12,-10,-20, 4,-21,-14, 2,-10, 5, -2, 12, 7,-12,-30,-16, 7; /M: SY='Q'; M= 5, -2,-24, -3, 4,-25,-10, -1,-21, 6,-15, -9, -2,-13, 9, 8, -2, -8,-16,-23,-12, 5; /M: SY='I'; M=-12,-30,-27,-39,-29, 20,-37,-27, 35,-30, 21, 15,-21,-23,-25,-27,-21,-10, 21,-13, 7,-29; /M: SY='L'; M= -5,-22,-19,-24,-16, 2,-24,-10, 11,-24, 28, 14,-20,-25,-14,-17,-16, -6, 5,-24, -2,-15; /M: SY='R'; M= -8, 6,-23, 4, 3,-18,-15, -3,-21, 5,-20,-13, 9,-14, 2, 10, 4, 3,-16,-28,-11, 1; /M: SY='E'; M= -8, 6,-26, 9, 19,-21,-13, -3,-24, 6,-19,-12, 3,-10, 10, 3, 1, -7,-21,-26,-14, 15; /M: SY='L'; M= -8,-22, 1,-24,-19, 1,-27,-19, 8,-26, 30, 12,-24,-29,-19,-20,-23,-10, 4,-26, -7,-19; /M: SY='R'; M=-12, 0,-28, 0, 11,-26,-10, -3,-28, 20,-23,-12, 4,-13, 12, 26, -3, -7,-23,-23,-14, 10; /M: SY='L'; M= -1,-27,-17,-29,-22, 6,-22,-22, 15,-24, 27, 13,-26,-27,-22,-20,-19, -7, 16,-21, -4,-21; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of true positive hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | KA1 |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
35 sequences
AMPKA_DICDI (Q54YF2 ), KIN10_ARATH (Q38997 ), KIN11_ARATH (P92958 ), KIN12_ARATH (Q9FLZ3 ), KIN1_SCHPO (P22987 ), KIN1_YEAST (P13185 ), KIN2_YEAST (P13186 ), MARK1_HUMAN (Q9P0L2 ), MARK1_MOUSE (Q8VHJ5 ), MARK1_RAT (O08678 ), MARK2_HUMAN (Q7KZI7 ), MARK2_MOUSE (Q05512 ), MARK2_RAT (O08679 ), MARK3_HUMAN (P27448 ), MARK3_MOUSE (Q03141 ), MARK3_RAT (Q8VHF0 ), MARK4_HUMAN (Q96L34 ), MARK4_MOUSE (Q8CIP4 ), MELK_CAEEL (U4PR86 ), MELK_DANRE (F1QGZ6 ), MELK_HUMAN (Q14680 ), MELK_MOUSE (Q61846 ), MELK_XENLA (Q91821 ), MELK_XENTR (Q28GW8 ), MRKA_DICDI (Q54DF2 ), MRKB_DICDI (Q54MV2 ), MRKC_DICDI (Q54TA3 ), OSK1_ORYSJ (Q852Q2 ), OSK3_ORYSI (A2XFF4 ), OSK3_ORYSJ (Q852Q0 ), OSK4_ORYSI (B8BBT7 ), OSK4_ORYSJ (Q852Q1 ), PAR1_CAEBR (A8WYE4 ), PAR1_CAEEL (Q9TW45 ), RKIN1_SECCE (Q02723 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1UL7; 1V5S; 3OSE; 6C9D |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission