PROSITE entry PS50042
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50042
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CNMP_BINDING_3 |
| Accession [info] | PS50042 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00691 |
| Associated ProRule [info] | PRU00060 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | cAMP/cGMP binding motif profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7862000; R2=0.0194000; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4941.5795898; R2=12.9449272; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=1; SCORE=398; H_SCORE=10094; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!!'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; H_SCORE=9097; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=269; H_SCORE=8424; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-32,-23, 16,-30,-22, 21,-28, 30, 15,-23,-26,-22,-21,-21, -6, 13,-17, 3,-23; /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-34,-23, 47,-29,-19, 7,-28, 25, 9,-23,-29,-29,-19,-23,-10, 3, -4, 16,-23; /M: SY='K'; M= -2, 0,-24, -2, 9,-25,-15, -3,-22, 16,-22, -9, 2,-11, 12, 12, 2, -3,-17,-25,-13, 10; /M: SY='N'; M= -6, 11,-22, 8, -1,-23, 1, 8,-26, -3,-26,-17, 18,-13, -1, 0, 10, 0,-22,-33,-15, -2; /M: SY='L'; M= -7,-27,-10,-29,-20, 4,-29,-21, 16,-27, 36, 15,-27,-29,-19,-20,-24, -8, 11,-23, -4,-20; /M: SY='D'; M= -9, 18,-25, 28, 19,-29,-13, -6,-28, -1,-24,-22, 6, 0, 2, -7, 6, 0,-23,-35,-19, 10; /M: SY='E'; M= -5, -2,-27, 1, 13,-24,-17, -8,-20, 5,-19,-12, -4, 7, 5, 2, -2, -5,-19,-27,-17, 7; /M: SY='E'; M= -7, 4,-26, 7, 8,-19,-10, -4,-21, -3,-21,-15, 3,-11, 4, -7, 3, -4,-21,-12, -6, 6; /M: SY='E'; M= -9, -5,-25, -4, 15,-16,-22, -4,-11, -2, -6, -2, -7,-12, 13, -3, -5, -4,-13,-24, -9, 14; /M: SY='L'; M=-13,-21,-25,-22,-13, -3,-27,-11, 2, -4, 14, 8,-17,-24, -7, 13,-19, -9, 1,-18, -1,-12; /M: M= -5, -5,-21, -6, -3, -8,-17, -8,-10, -5, -7, -4, -4,-17, -2, -2, -1, -2, -7,-24, -8, -3; /M: SY='E'; M=-10, 7,-28, 10, 15,-27,-17, -6,-25, 14,-22,-14, 2,-11, 12, 5, -2, -5,-22,-17,-11, 14; /M: SY='I'; M= -8,-29,-20,-33,-26, 6,-32,-24, 30,-26, 29, 19,-26,-27,-22,-22,-21, -7, 25,-22, -2,-25; /M: SY='V'; M= 7,-22,-15,-25,-20, 2,-21,-22, 12,-20, 12, 5,-20,-23,-20,-20, -8, -3, 17,-22, -6,-20; /M: SY='D'; M=-12, 29,-25, 37, 11,-29,-12, -1,-28, 0,-21,-20, 15,-13, -1, -7, 1, -5,-22,-35,-16, 5; /M: SY='A'; M= 14, -6, -3, -9, -8,-18,-13,-14,-12, -8,-13,-10, -7,-17,-11,-13, 3, -2, -1,-28,-16,-10; /M: SY='L'; M= -6,-24,-15,-29,-20, 2,-25,-15, 18,-21, 28, 28,-23,-24,-13,-18,-20, -7, 11,-22, -3,-17; /M: SY='E'; M=-13, -1,-27, 2, 11, -8,-17, -2,-19, 0,-13,-10, -4,-14, 1, -1, -7, -9,-17,-17, 0, 6; /M: SY='E'; M= -4, -9,-25, -6, 7,-18,-16,-14,-15, -7,-10,-11,-10, 5, -4, -9, -3, -1,-14,-20,-15, 1; /M: SY='R'; M= -7,-10,-15,-10, 0,-17,-23, -8,-10, 5,-12, -5, -9,-18, -2, 6, -5, -3, 1,-28,-11, -2; /M: SY='H'; M= -7, -5,-22, -7, -3,-11,-19, 2, -9, -3,-11, -5, -1,-17, -2, -3, -1, 0, -6,-23, 0, -3; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-25,-26,-22, 31,-30, 3, 5,-17, 6, 3,-20,-29,-19,-13,-18, -8, 1, 10, 46,-22; /I: I=-6; MI=0; IM=0; MD=-20; DM=-20; /M: SY='E'; M= -5, 0,-28, 4, 10,-27,-15, -7,-20, 1,-21,-14, -2, 10, 5, -3, 0, -5,-20,-29,-17, 6; /M: SY='P'; M= 7, 2,-24, 4, 4,-26,-11,-12,-21, -1,-21,-16, -2, 10, -3, -8, 3, -2,-16,-28,-20, -1; /M: SY='G'; M= -3, -3,-29, -3,-12,-30, 45,-13,-37, -7,-30,-18, 4,-18,-12, -9, -1,-16,-28,-22,-24,-12; /M: SY='E'; M= -7, 15,-25, 23, 30,-28,-14, -1,-27, 2,-22,-20, 6, -7, 8, -4, 6, -3,-22,-33,-18, 19; /M: SY='Y'; M= -6, -6,-16,-10,-11, -4,-21, 1, -8, -9, -8, -5, -6,-19, -8, -9, -2, 7, -4,-17, 9,-11; /M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-35,-29, 1,-35,-29, 37,-26, 20, 15,-25,-26,-24,-25,-18, -6, 34,-24, -4,-29; /M: SY='I'; M=-10,-29,-15,-37,-30, 8,-36,-28, 34,-28, 15, 13,-22,-25,-24,-27,-18, -8, 26,-19, 1,-30; /M: SY='R'; M=-11, -4,-26, -3, 3,-20,-19, 7,-20, 12,-13, -5, -2,-17, 6, 20, -7, -8,-15,-23, -6, 3; /M: SY='Q'; M= -5, 0,-28, 0, 21,-36,-18, 5,-21, 11,-20, -4, -1, -9, 45, 9, 0, -9,-27,-21,-12, 33; /M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -6,-17,-29, 61,-17,-38,-17,-30,-20, 5,-20,-17,-17, 1,-18,-30,-22,-29,-17; /M: SY='D'; M= -5, 25,-26, 36, 27,-33,-11, -3,-31, 1,-23,-23, 9, -7, 6, -8, 3, -7,-25,-33,-20, 16; /M: M= -3, -8,-26, -7, -1,-20,-14,-14, -9, -4,-13, -7, -9, -2, -4, -5, -5, -8, -8,-22,-15, -4; /M: SY='G'; M= 9,-12,-24,-14,-17,-25, 41,-20,-28,-18,-21,-15, -5,-11,-17,-20, 0,-14,-20,-21,-26,-18; /M: SY='D'; M=-11, 26,-24, 32, 13,-29,-12, -1,-29, 1,-24,-21, 14,-11, 2, -1, 5, 1,-22,-35,-16, 7; /M: SY='B'; M= -4, 10,-22, 8, 5,-18, -8, 0,-20, -5,-18,-14, 10,-14, -1, -7, 6, 3,-17,-27, -8, 1; /M: SY='F'; M=-14,-28,-18,-35,-25, 43,-29,-20, 9,-26, 17, 9,-23,-28,-29,-19,-20, -9, 8, -3, 14,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-21, 43,-30, 9, -1,-15, 2, 0,-20,-29,-18,-13,-20,-10, -8, 23, 64,-22; /M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-35,-28, 12,-34,-24, 32,-25, 15, 12,-23,-25,-24,-24,-17, -7, 28,-15, 7,-28; /M: SY='I'; M= -7,-28,-23,-34,-26, 0,-34,-27, 37,-26, 19, 17,-23,-23,-21,-24,-17, -7, 30,-23, -3,-26; /M: SY='E'; M= -2, -5,-21, -2, 6,-16,-20,-13, -5, -6, -3, -5, -9,-15, -4,-10, -4, -4, -2,-28,-13, 1; /M: SY='E'; M= -4, 4,-23, 5, 12,-23,-13, -5,-24, 11,-23,-14, 5,-11, 8, 9, 5, -2,-18,-27,-14, 9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M= -3, -2,-16, -3, 7,-19,-16,-10,-21, 5,-18,-13, -1,-13, 3, 6, 3, 2,-15,-23,-13, 5; /M: SY='V'; M= 2,-26,-11,-29,-25, 4,-26,-24, 19,-21, 12, 8,-25,-27,-24,-20,-12, -3, 28,-22, -4,-25; /M: SY='D'; M= -7, 13,-25, 18, 16,-27,-14, -4,-25, 8,-21,-15, 6,-11, 5, 6, 0, -6,-19,-30,-16, 10; /M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-28, 4,-31,-27, 30,-23, 13, 11,-26,-27,-25,-21,-13, -3, 37,-25, -5,-27; /M: SY='Y'; M= -7,-16,-18,-20,-16, 7,-23,-12, 3,-15, 7, 2,-13,-22,-14,-11, -5, 6, 3,-15, 8,-16; /M: SY='R'; M= -7,-10,-23,-12, -5,-18,-20,-10, -4, 3, -9, 0, -7,-18, 4, 9, -6, -6, 0,-24,-11, -2; /I: MD=-15; /M: SY='K'; M=-10, 4,-22, 3, 8,-20,-15, -5,-19, 9,-17,-10, 5,-14, 5, 7, -3, -3,-16,-24, -9, 6; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='D'; M= -8, 7,-19, 10, 0,-26, 0, -8,-26, 0,-22,-16, 4,-12, -2, 0, 2, -4,-18,-28,-17, -2; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='D'; M= -6, 9,-20, 12, 12,-22, -6, -4,-21, 2,-20,-14, 6, -2, 5, -3, 5, -1,-18,-25,-15, 8; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='D'; M= -6, 6,-17, 8, 6,-16, 3, -5,-16, -3,-13,-11, 4, 0, -2, -5, -1, -5,-15,-17,-13, 1; D=-2; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -6, 2,-20, 5, 8,-20, 1, -2,-20, 1,-16,-10, 1, -8, 6, 0, 0, -6,-17,-18,-11, 6; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -5, 3,-20, 7, 16,-17, -9, -6,-16, 0,-15,-12, -1, 4, 2, -6, 0, -4,-15,-20,-13, 8; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='K'; M= -2, -6,-18, -8, -4,-15,-15, -8, -7, 4,-10, 0, -5,-14, -1, 1, -2, 0, -1,-22, -9, -3; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='V'; M= -8,-17,-21,-18, -9, -1,-26,-13, 6,-11, 2, 1,-16,-21,-11,-13,-11, -7, 8,-15, 2,-11; /M: SY='V'; M= -6,-27,-18,-30,-23, 4,-30,-23, 24,-22, 21, 14,-26,-27,-20,-19,-17, -6, 26,-22, -3,-22; /M: SY='G'; M= 6, -6,-15, -9, -8,-20, 8,-15,-20, -8,-18,-13, -2,-15, -9, -7, 6, 1,-10,-27,-19, -9; /M: SY='T'; M= -7, -7,-22,-10, -3,-12,-21, -8, -7, -1,-10, -4, -5,-13, -2, 0, 0, 7, -4,-23, -4, -4; /M: SY='L'; M= -8,-26,-14,-29,-21, 9,-28,-17, 15,-25, 28, 13,-24,-27,-18,-19,-21, -7, 9,-16, 6,-20; /M: SY='G'; M= -1, -1,-23, -2, -8,-23, 19, -6,-26, -8,-25,-16, 6,-14, -7, -9, 7, -6,-20,-28,-19, -8; /M: SY='K'; M= -3, -2,-26, -1, 7,-25,-11, -8,-21, 9,-20,-10, -1, -2, 5, 6, -2, -7,-18,-25,-16, 5; /M: SY='G'; M= 1, -6,-27, -7,-14,-26, 45,-12,-34,-14,-28,-18, 3,-19,-14,-13, 3,-14,-26,-19,-23,-14; /M: SY='D'; M=-10, 19,-27, 27, 13,-32, 0, -4,-32, 3,-27,-20, 11,-11, 5, -3, 3, -7,-26,-31,-19, 9; /M: SY='Y'; M= -5,-16,-19,-19,-17, 11,-21, -8, 0,-15, -5, -3,-12,-22,-14,-14, -1, 3, 2, -6, 19,-17; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 71,-30,-20, 4,-30, 14, 3,-21,-30,-37,-20,-21,-10, 2, 6, 26,-29; /M: SY='G'; M= 3,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-19,-28,-20,-29,-19; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 19, 57,-29,-20, 0,-29, 10,-19,-18, 0, -1, 19, 0, -1,-10,-29,-30,-19, 38; /M: SY='L'; M= -5,-23,-21,-26,-18, 0,-27,-19, 18,-20, 25, 14,-20,-22,-15,-17,-20, -8, 11,-22, -4,-18; /M: SY='A'; M= 33,-10,-15,-16, -8,-20, 7,-18,-14,-11,-12, -9, -8,-10, -9,-18, 8, -3, -6,-22,-20, -9; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-23, 6,-31,-22, 26,-27, 36, 20,-26,-28,-20,-21,-24, -8, 19,-22, -2,-22; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-21, 12,-30,-18, 21,-25, 33, 20,-25,-27,-17,-19,-24, -9, 12,-17, 4,-19; /M: SY='Y'; M=-12, -8,-18,-10,-11, 3,-18, 3, -8,-10, -5, -4, -7,-23, -9, -9, -8, -1,-11, -6, 25,-12; /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20; /M: SY='N'; M= -7, 21,-26, 19, 3,-24, 9, -1,-28, -4,-26,-20, 22,-16, -4, -8, 2, -8,-27,-28,-15, -1; /M: SY='R'; M= -7, -2, -3, -4, -3,-20,-18,-11,-22, 4,-17,-11, -1,-17, 0, 9, 2, 6,-13,-30,-14, -3; /M: SY='P'; M= -7,-15,-30,-10, -1,-25,-20,-17,-15, -6,-22,-14,-14, 48, -5,-13, -7, -5,-19,-29,-23, -6; /M: SY='R'; M=-17, -9,-29,-10, 0,-20,-16, 0,-28, 24,-19, -9, -1,-19, 11, 56, -8, -9,-20,-19, -9, 1; /M: SY='A'; M= 22, -7,-14,-13, -7,-17, -9,-17,-11, -8,-13,-11, -6, -4, -7,-14, 11, 11, -4,-24,-15, -8; /M: SY='A'; M= 37,-10,-11,-19,-11,-12, -4,-19, -9,-12,-10,-10, -9,-12,-12,-18, 11, 5, 0,-21,-15,-11; /M: SY='T'; M= 0, 3,-15, -5, -7,-13,-13,-15,-14, -9,-17,-14, 6,-11, -8,-10, 17, 28, -8,-22,-12, -7; /M: SY='V'; M= 2,-26,-13,-30,-26, -4,-27,-28, 27,-21, 8, 9,-24,-25,-24,-22,-10, -4, 35,-27, -9,-26; /M: SY='V'; M= -6,-13,-22,-16,-10,-11,-24,-12, 1, -1, -4, 0,-10,-19, -7, 4, -7, -1, 5,-22, -5,-11; /M: SY='A'; M= 35,-10, -7,-18,-11,-17, -5,-20, -9,-11,-10,-10, -9,-11,-11,-18, 11, 7, 2,-24,-18,-11; /M: SY='K'; M= -8,-11,-24,-14, -5,-13,-23,-13, -4, 5, -5, -2, -8,-16, -4, 5, -7, 1, -2,-22, -6, -6; /I: I=-7; MI=-23; MD=-23; IM=-23; /M: SY='S'; M= 3, -3,-17, -6, -1,-19, 2,-14,-19, -7,-19,-14, 1,-11, -5, -7, 14, 14,-11,-28,-17, -4; D=-4; /I: DM=-23; /M: SY='D'; M= -7, 8,-26, 12, 6,-20,-11, -4,-21, -4,-16,-15, 3, -3, -3, -6, -3, -5,-20,-26,-11, 0; /M: SY='C'; M= -2,-18, 22,-22,-22,-10,-19,-24, -2,-22, -2, -4,-17,-28,-22,-20, -4, 0, 10,-34,-17,-22; /M: SY='K'; M= -7, 3,-25, 2, 9,-24,-17, -7,-20, 18,-20, -9, 4,-12, 8, 12, -1, -3,-15,-26,-13, 8; /M: SY='L'; M= -9,-25, 17,-29,-24, 0,-30,-25, 9,-28, 19, 6,-24,-31,-24,-23,-19, -7, 11,-29, -9,-24; /M: SY='W'; M= -4,-29,-26,-31,-22, 4,-22,-18, 0,-21, 7, 0,-28,-27,-18,-19,-23,-15, -3, 35, 8,-19; /M: SY='A'; M= 8, -9,-20,-12, -4,-19, -7,-15,-13, 1,-13, -8, -7,-15, -5, -1, 1, -1, -4,-24,-15, -5; /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-25, 5,-34,-23, 34,-28, 31, 23,-24,-24,-19,-24,-24,-10, 20,-20, 0,-24; /M: SY='D'; M=-13, 32,-26, 44, 15,-33, -6, -1,-33, -3,-27,-25, 16, -9, 0,-10, 6, -5,-26,-38,-19, 7; /M: SY='R'; M=-16,-11,-29,-10, -2,-17,-17, -3,-24, 24,-18, -9, -3,-20, 5, 48,-10,-10,-15,-18, -5, -2; /M: SY='E'; M= -5, 4,-24, 5, 9,-25,-17, -5,-18, 5,-17,-10, 0, -8, 8, 1, 0, -2,-14,-27,-14, 8; /M: SY='T'; M= 2, -5, -5, -8, -7,-18,-13,-12,-17, -3,-17,-12, -2,-16, -6, 0, 9, 10, -6,-31,-15, -7; /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-27, 64,-30,-15, 3,-27, 14, 3,-21,-30,-33,-19,-21,-10, 0, 9, 33,-27; /M: SY='R'; M=-13, 0,-27, -2, 10,-22,-19, 0,-19, 12,-14, -5, 5,-15, 15, 23, -5, -6,-19,-25,-12, 11; /M: SY='R'; M=-12, -2,-26, -4, 6,-24,-18, 2,-23, 14,-19, -9, 4,-15, 18, 32, 0, -2,-20,-24,-11, 10; /M: SY='I'; M= -6,-28,-23,-34,-25, 4,-33,-26, 32,-28, 27, 16,-23,-24,-21,-25,-20, -7, 22,-20, -1,-25; /M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-32,-23, 5,-30,-19, 26,-25, 34, 27,-26,-26,-17,-20,-24, -9, 16,-21, -1,-21; /M: SY='G'; M= -7,-14,-24,-18,-16,-11, 11, -6,-11,-13, -6, 11, -9,-20, -6,-10, -8,-12,-10,-20,-11,-11; /M: SY='P'; M= -5, -5,-24, -3, -1,-26, -4,-13,-24, 2,-24,-16, -3, 11, -5, 1, -4, -8,-20,-27,-21, -5; /M: SY='T'; M= -4, 0, 3, -7,-10,-12,-16, -7,-12,-14,-10,-10, 5,-20,-10,-13, 5, 8, -8,-33,-13,-10; /M: SY='A'; M= 3, -1,-18, -4, -8,-21, -1,-13,-15,-10,-17, -9, -1, -3, -9,-13, 3, 0,-11,-29,-19, -9; /M: SY='D'; M= -8, 7,-26, 13, 12,-19,-19, -7,-14, -7, -6, -9, -2,-13, 3,-10, -5, -7,-14,-27,-10, 7; /M: SY='I'; M= -9,-18,-27,-22,-15,-10,-29,-18, 14, -6, 6, 8,-13,-19, -8, -3,-15, -9, 9,-21, -5,-14; /M: SY='R'; M=-11,-11,-26,-13, -4,-15,-18, -4,-12, 12, -3, 6, -8,-18, 3, 16,-13,-10,-10,-21, -6, -1; /M: SY='R'; M=-15, -3,-29, -4, 4,-23,-20, 8,-22, 20,-18, -2, 1,-16, 13, 31, -9,-11,-19,-23, -7, 6; /M: SY='R'; M= -7, -9,-25,-10, 2,-16,-19, -8,-20, 19,-14, -6, -5,-16, 2, 29, -8, -7,-12,-20, -9, 0; /M: SY='M'; M= -9, 2,-23, -4, -1,-10,-17, -3, -1, -8, 1, 8, 5,-18, -2, -9, -9, -7, -9,-26, -7, -2; /M: SY='Y'; M=-13,-15,-25,-17,-17, 12,-26, 0, 6,-14, 2, 4,-14,-23,-11,-14,-11, -3, 0, 0, 34,-17; /M: SY='E'; M= 0, 5,-23, 8, 20,-26,-11, -5,-22, 1,-20,-14, 3, -6, 10, -3, 8, -2,-18,-30,-18, 14; /M: SY='D'; M= -9, 17,-25, 19, 17,-27,-14, 5,-25, 1,-21,-15, 13,-11, 11, -2, 4, -2,-23,-32,-14, 14; /M: SY='F'; M=-15,-24,-23,-29,-21, 38,-24, -8, 1,-20, 11, 6,-19,-27,-22,-14,-19,-10, -2, 4, 28,-21; /M: SY='L'; M= -2,-12,-20,-15, -5, -3,-21,-11, 3,-17, 14, 3,-10,-20,-10,-15,-12, -7, -1,-24, -7, -8; /M: SY='R'; M= -7, -3,-25, -2, 12,-23,-16, -3,-21, 15,-19, -5, -1,-12, 12, 19, 2, -4,-17,-26,-13, 11; /M: SY='R'; M= -8, -3,-24, -2, 7,-14,-16, -5,-23, 11,-21,-12, 1,-13, 7, 14, 4, -2,-17,-22, -6, 6; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 494 in 348 different sequences |
| Number of true positive hits | 485 in 339 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 1 |
| Number of false positive hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of false negative sequences | 21 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 98.38 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 95.85 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 4 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | NP_BIND |
| Feature description [info] | cNMP |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]