PROSITE entry PS50051
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MCM_2 |
| Accession [info] | PS50051 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00662 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MCM family domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=207; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=202; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1582000; R2=0.0127085; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-17643.1796875; R2=32.5363235; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=932; H_SCORE=12681; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=657; H_SCORE=3733; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-37,-28, 6,-36,-28, 39,-29, 24, 18,-23,-24,-22,-26,-21, -9, 27,-20, 0,-28; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-28,-21,-18, 27,-24, 9, -1,-14, 0, -1,-17,-27,-14,-13,-17,-11, -7, 14, 51,-19; /M: SY='E'; M=-12, 22,-27, 28, 29,-30,-13, 8,-30, 5,-25,-20, 15, -8, 10, -2, 4, -7,-28,-34,-16, 19; /M: SY='R'; M=-13, -7,-27,-11, -5,-15,-22, -4, -8, 10, -7, -1, 0,-19, 1, 19,-11, -9, -8,-23, -7, -4; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-30, 39, 20,-27,-27,-20,-23,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='A'; M= 16,-12, -4,-18,-13,-11, -8,-19, -6,-16,-12, -9, -7,-16,-13,-18, 12, 5, 2,-28,-15,-13; /M: SY='K'; M= 3, 5,-21, 0, 1,-23,-10, -7,-22, 13,-22,-13, 9,-13, 3, 13, 4, 1,-16,-26,-15, 1; /M: SY='S'; M= 14, -1,-10, -2, -1,-20, 0,-11,-19,-10,-28,-19, 8,-10, -1,-11, 37, 18, -9,-38,-20, -1; /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24, 5,-33,-21, 32,-27, 34, 25,-25,-25,-17,-23,-25,-10, 18,-20, 0,-23; /M: SY='A'; M= 39,-12,-11,-21,-12, -8, -4,-19, -9,-12, -9, -9,-10,-12,-13,-19, 8, 0, -1,-18,-14,-12; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 7, 3,-13, 2, 8,-21, -4, -9,-20, -7,-26,-19, 9, -9, 2, -8, 30, 16,-13,-37,-19, 5; /M: SY='I'; M= -9,-30,-29,-39,-30, 0,-39,-30, 49,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 31,-21, -1,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-18,-29,-19,-18, 27,-28, 29, -5,-12, -2, 0,-15,-28, -9, -9,-18,-12,-12, 19, 67,-18; /M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -5, -6,-30, 54,-16,-38,-15,-28,-20, 0,-16,-13,-16, 0,-18,-30,-22,-28, -9; /M: SY='H'; M=-14, 9,-26, 3, -3,-19, -9, 55,-23, -8,-19, -4, 21,-20, 4, -3, -3,-12,-26,-32, 3, -2; /M: SY='E'; M=-11, 12,-27, 20, 23,-25,-18, 0,-23, 1,-13,-14, 1,-11, 5, 0, -4, -8,-19,-30,-14, 13; /M: SY='D'; M=-17, 25,-30, 38, 14,-25,-16, 3,-27, -3,-22,-21, 8,-13, 0,-10, -4,-10,-24,-21, -4, 6; /M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-36,-29, 0,-35,-28, 41,-25, 17, 19,-23,-23,-22,-25,-17, -7, 36,-23, -3,-29; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='K'; M=-11, -3,-28, -4, 5,-25,-20,-10,-26, 37,-23, -9, -1,-13, 7, 31, -8, -5,-17,-21,-10, 5; /M: SY='G'; M= 28,-10,-18,-15,-14,-24, 29,-20,-23,-14,-19,-14, -5,-14,-14,-20, 7, -8,-13,-21,-24,-14; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-34,-26, 1,-35,-27, 35,-27, 24, 16,-25,-21,-22,-25,-20, -8, 27,-23, -3,-27; /M: SY='L'; M= 10,-24,-16,-27,-18, 0,-21,-21, 11,-23, 28, 10,-24,-24,-18,-20,-16, -6, 10,-21, -7,-18; /M: SY='L'; M= -8,-26, 21,-30,-23, 0,-29,-23, 4,-29, 28, 7,-26,-32,-23,-23,-23,-10, 4,-29, -9,-23; /M: SY='M'; M= -1,-17,-20,-20, -8, -9,-20, -8, 4,-13, 15, 17,-16,-20, 5,-10,-12, -7, -2,-21, -6, -2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-19, 20,-29, 49, 22,-30,-30,-19,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M=-14,-29,-19,-36,-27, 47,-29,-19, 10,-26, 18, 12,-23,-29,-31,-19,-20, -9, 10, -4, 16,-26; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20, 0,-20,-19,-20, 1,-19,-29,-21,-30,-19; /M: SY='G'; M= 2,-10,-29,-10,-20,-30, 67,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-19,-29,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 1,-13,-14,-15,-11,-10,-21,-20, 5,-12, -5, -3,-12,-15,-15,-14, 4, 10, 17,-31,-14,-13; /M: SY='E'; M= -9, 4,-29, 8, 12,-27,-15, 4,-27, 7,-25,-16, 5, 7, 4, 7, -1, -7,-24,-30,-15, 6; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 10,-30,-20, -8,-29, 46,-29, -9, 0,-11, 13, 32, -9,-10,-21,-20,-10, 11; /M: SY='N'; M= -9, 10,-23, 6, 1,-20,-14, -5,-15, 4,-18,-11, 15,-16, 1, 5, 2, 0,-14,-31,-14, 0; /M: SY='L'; M= -9,-20,-21,-22,-16, 6,-25,-14, 5,-21, 12, 3,-17, -8,-18,-17,-13, -2, 3,-22, -3,-18; /I: MD=-27; /M: SY='P'; M= -5, -3,-27, -2, 4,-24, 2, -5,-25, 1,-24,-15, 2, 9, -2, -1, -1, -8,-23,-25,-19, -1; D=-5; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M= -8, 17,-28, 20, 11,-30, 6, -4,-32, 1,-26,-20, 13, -9, 1, -3, 1,-10,-28,-30,-21, 6; /M: SY='G'; M= -4, -8,-29, -8,-11,-28, 37,-15,-36, 1,-29,-17, 0,-18, -9, 2, -1,-15,-26,-21,-23,-11; /M: SY='H'; M= -8, -8,-23,-12,-10,-14,-13, 9, -6,-13, -5, 9, -5,-12, -2,-11, -4, -1, -8,-26, -5, -8; /M: SY='R'; M= -9, 1,-24, -2, 2,-21,-16, 5,-24, 18,-22,-10, 7,-15, 5, 20, 1, -1,-18,-27, -9, 2; /M: SY='I'; M=-11,-26,-24,-30,-22, 10,-31,-19, 21,-21, 19, 11,-21,-25,-19,-14,-18, -8, 14,-15, 7,-22; /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, 0,-20,-19, 0,-30, 29,-20,-10, 0,-20, 10, 67, -8, -9,-20,-21,-10, 0; /M: SY='G'; M= 3,-10,-28,-10,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-29,-20, 0,-19,-19,-20, 2,-17,-28,-21,-29,-19; /M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 63, 23,-38,-10, 0,-38, 1,-29,-29, 20,-10, 2, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 12; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 47,-29, 21, 19,-21,-21,-21,-29,-20, -9, 30,-21, -1,-30; /M: SY='N'; M=-11, 36,-21, 18, 0,-20, -2, 19,-21, -1,-29,-18, 55,-20, 1, 0, 8, -2,-30,-39,-16, 0; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-28, 1,-33,-28, 35,-24, 19, 16,-26,-26,-24,-23,-16, -5, 37,-25, -5,-28; /M: SY='L'; M=-10,-27, 21,-30,-23, 1,-30,-22, 5,-29, 28, 10,-27,-33,-22,-23,-24,-10, 4,-29, -9,-23; /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21, 6,-29,-16, 24,-25, 38, 30,-26,-26,-15,-19,-26,-10, 13,-20, 0,-19; /M: SY='V'; M= -7,-26, 18,-31,-26, -3,-29,-24, 13,-24, 13, 12,-25,-30,-23,-22,-16, -7, 19,-31,-11,-25; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= 5, -5,-20, -5,-10,-25, 35,-15,-30,-15,-30,-20, 5,-15,-10,-15, 20, 0,-20,-30,-25,-10; /M: SY='T'; M= 0, -8,-10,-15,-15, -7,-23,-23, 1,-13, -5, -5, -8,-15,-15,-13, 12, 36, 14,-30,-10,-15; /M: SY='A'; M= 38, -7,-10,-14, -7,-20, 0,-17,-13,-10,-16,-13, -4,-10, -7,-17, 19, 6, -3,-26,-20, -7; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-34,-24, 23,-31,-21, 21,-29, 34, 17,-26,-28,-24,-21,-25,-10, 12,-14, 6,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-12, -3,-29, -3, 9,-29,-19, -3,-27, 34,-25, -8, 0,-13, 21, 34, -6, -9,-22,-21,-10, 14; /M: SY='Y'; M= -7,-18,-24,-22,-18, 27,-24, 12, -4,-14, -2, -2,-16,-26,-14,-13,-14, -9, -8, 12, 47,-18; /M: SY='V'; M= -2,-29,-13,-31,-29, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-28,-28,-28,-21,-11, 0, 46,-28, -8,-29; /M: SY='E'; M=-13, -6,-15, -4, 9, -8,-24, 7,-11, -9, -2, 0, -9,-17, -1,-10,-12,-11,-13,-22, 1, 3; /M: SY='N'; M=-11, 16,-22, 8, 9,-25,-12, 3,-26, 20,-28,-15, 24,-15, 7, 15, -1, -6,-25,-30,-15, 7; /M: SY='I'; M= -8,-23,-13,-30,-24, 9,-31,-25, 18,-24, 15, 8,-19,-24,-22,-21,-12, 4, 17,-21, -1,-24; /M: SY='A'; M= 26,-10,-10,-16,-11,-15, -7,-19, -6,-12,-10, -9, -8,-14,-11,-17, 14, 9, 5,-27,-17,-11; /M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -9, 0,-29,-19,-11,-21,-10,-29,-19,-16, 76, -8,-18, -7, -9,-29,-31,-26, -9; /M: SY='R'; M=-17,-16,-28,-17, -7,-12,-24, -7,-11, 12, -2, -1, -8,-22, 1, 41,-15,-10, -9,-20, -7, -7; /M: SY='A'; M= 29, -9,-17,-15,-13,-24, 26,-19,-22,-14,-19,-14, -5,-14,-13,-19, 8, -6,-12,-21,-24,-13; /M: SY='I'; M= -5,-25,-21,-28,-21, -7,-32,-23, 28,-18, 8, 12,-21,-23,-10,-18,-12, -5, 28,-25, -6,-17; /M: SY='Y'; M=-10,-18,-25,-20,-17, 24,-24, 6, -4,-13, -4, -4,-16,-19,-13,-13,-10, -6, -9, 12, 47,-18; /M: SY='T'; M= 3, -1,-10,-11,-10,-11,-19,-20,-10,-10,-10,-10, -1,-10,-10,-11, 19, 47, 0,-29,-11,-10; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15, 5,-10, -5,-10, 30, 35, -5,-35,-15, -5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-13, -3,-30, -3, 8,-28,-20, -4,-29, 38,-25, -9, 0,-13, 17, 40, -9,-10,-21,-20,-10, 11; /M: SY='G'; M= 6,-10,-27,-11,-19,-29, 61,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-17,-26,-20,-29,-19; /M: SY='S'; M= 16, -1,-10, -3, -1,-20, 0,-11,-19,-10,-27,-19, 7,-10, -1,-11, 36, 17, -9,-37,-20, -1; /M: SY='S'; M= 9, -1,-11, -1, -1,-21, 5,-11,-21,-11,-30,-20, 9,-11, -1,-11, 37, 17,-11,-39,-21, -1; /M: SY='A'; M= 32,-10,-17,-16,-14,-24, 25,-20,-21,-14,-17,-14, -6,-14,-14,-20, 6, -7,-11,-20,-24,-14; /M: SY='V'; M= 11,-25,-10,-27,-25, -5,-23,-27, 20,-18, 5, 5,-25,-25,-25,-20, -4, 0, 38,-28,-12,-25; /M: SY='G'; M= 1,-10,-29,-10,-20,-30, 68,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-19,-29,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 49, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 11,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='A'; M= 48,-10,-11,-20,-10,-20, -1,-19,-11, -9,-10,-10,-10,-10, -9,-18, 9, 0, -1,-20,-20,-10; /M: SY='A'; M= 19,-12,-17,-16,-12, -3,-10, -5, -8,-10,-10, -8,-10,-17, -8,-15, 5, 0, -5, -7, 13,-12; /M: SY='V'; M= -1,-30,-13,-31,-30, 0,-31,-30, 33,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 47,-29, -9,-30; /M: SY='T'; M= -6,-11,-17,-18,-12, -9,-22,-13, 2, -7, 0, 10,-10,-17, -3, -3, 0, 16, 5,-25, -7, -8; /M: SY='R'; M=-11, -4,-25, -6, 2,-22,-18, -7,-26, 26,-23,-11, 1,-14, 6, 37, 0, 2,-16,-24,-11, 2; /M: SY='D'; M=-20, 46,-30, 64, 18,-38,-10, 7,-39, -1,-29,-28, 20,-11, 1, -9, 0,-10,-30,-39,-17, 9; /M: SY='P'; M= -8,-10,-31, -4, 10,-29,-20,-10,-18, 1,-23,-12,-10, 30, 11, -5, -3, -7,-21,-27,-20, 8; /M: SY='E'; M= -8, 3,-25, 9, 26,-22,-21, -8,-12, -1,-12,-10, -5,-10, 4, -8, -2, -7, -8,-31,-16, 15; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13, 3,-10, -7,-10, 25, 42, -3,-33,-13, -7; /M: SY='G'; M=-10, -3,-29, -4, -7,-23, 17, -4,-33, 6,-26,-14, 4,-18, -5, 14, -5,-14,-25,-21,-16, -7; /M: SY='E'; M=-10, 10,-29, 16, 44,-32,-18, 3,-27, 9,-21,-15, 4, -4, 28, 2, 1, -9,-30,-28,-17, 36; /M: SY='F'; M=-16,-26,-27,-29,-19, 19,-25,-15, -3,-12, 11, 5,-21,-27,-16, 3,-23,-13, -5, 11, 9,-17; /M: SY='V'; M= -7,-18,-18,-21,-18, -6,-26,-18, 7, -6, -1, 1,-14,-22,-14, 4, -5, 7, 17,-24, -5,-18; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 8,-31,-20, 24,-29, 44, 23,-28,-28,-19,-21,-28,-10, 13,-20, 0,-21; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 18, 54,-32,-20, 1,-29, 10,-20,-17, 0, -2, 25, 1, 0,-10,-30,-29,-19, 39; /M: SY='A'; M= 23, -8,-16,-13,-12,-21, 17,-18,-19,-13,-18,-13, -3,-13,-11,-17, 12, 4,-10,-24,-21,-12; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-26,-13, 19,-23, 38, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 9,-17, 0,-17; /M: SY='V'; M= -1,-29,-11,-30,-29, 0,-29,-26, 29,-19, 11, 16,-29,-29,-26,-19,-11, -1, 45,-29, -9,-27; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-29,-19, 9,-29,-20, 18,-29, 47, 18,-28,-29,-19,-20,-27, -9, 9,-21, -1,-19; /M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17, 5, -2,-25,-20, -8; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='N'; M=-11, 6,-27, 0, -3,-24, 7, -2,-27, 8,-25,-13, 18,-19, 3, 18, -1, -9,-25,-26,-17, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30, 0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30; /M: SY='C'; M= -6,-24, 73,-30,-30,-13,-30,-30, -8,-26, -9, -9,-24,-36,-30,-26,-10, -6, 12,-43,-23,-30; /M: SY='C'; M= -6,-21, 92,-29,-27,-16,-28,-28,-22,-29,-10,-14,-21,-37,-27,-28,-11, -9, -7,-44,-25,-27; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='N'; M= -5, 23,-20, 19, 4,-24, -5, -1,-25, 0,-27,-20, 27,-15, 1, 3, 13, 3,-22,-36,-18, 1; /M: SY='D'; M=-15, 27,-28, 41, 26,-31,-16, -3,-28, 0,-18,-19, 7, -9, 4, -8, -3,-10,-23,-34,-18, 15; /M: SY='S'; M= 1, -1,-20, -1, 4,-23,-12, -7,-14, -2,-18, -7, 1,-12, 10, -2, 12, 2,-11,-30,-14, 6; /M: SY='D'; M=-14, 36,-24, 47, 11,-31,-13, -6,-31, -3,-24,-24, 14,-10, -3,-10, 6, 7,-21,-37,-17, 4; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 3,-23,-20, 1,-29, 27,-20, -9, 0,-19, 17, 62, -9,-10,-21,-20,-10, 6; /M: SY='T'; M= 3,-12,-10,-15,-15, -9,-18,-21, 3,-14, -8, -5, -9,-18,-15,-14, 14, 22, 17,-33,-13,-15; /M: SY='A'; M= 29,-14,-11,-20,-14,-14, -9,-21, 1,-13, -7, -5,-12,-15,-14,-19, 8, 3, 12,-25,-17,-14; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 41,-30, 29, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25, 9,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 24,-25,-15,-20; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='Q'; M= -9, -1,-30, -1, 17,-39,-13, 8,-22, 8,-21, -2, 0,-11, 54, 8, 0,-11,-30,-20,-12, 35; /M: SY='T'; M= 0, -1,-12, -8, -7,-13,-16,-17,-13, -7,-15,-12, 2,-11, -7, -4, 21, 40, -3,-31,-12, -7; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-37,-29, 1,-37,-29, 42,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29; /M: SY='S'; M= 8, 0,-10, -2, -2,-18, -4,-12,-18,-10,-26,-18, 8,-10, -2,-10, 36, 26, -8,-38,-18, -2; /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30, 0,-40,-30, 49,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 31,-20, 0,-30; /M: SY='A'; M= 34, -6,-10,-14, -8,-19, -2,-18,-12,-10,-15,-12, -4,-10, -8,-16, 18, 11, -2,-26,-19, -8; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='G'; M= 0,-11,-29,-11,-20,-29, 67,-20,-38,-20,-29,-19, -1,-20,-20,-20, 0,-19,-27,-20,-29,-20; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30; /M: SY='V'; M= -7,-10,-21,-15,-11,-12,-25, -4, 4, -7, -3, 2, -6,-18, -4, -8, -5, 3, 5,-26, -5, -9; /M: SY='T'; M= 14, -5, 3,-15,-12,-14,-15,-21,-12,-12,-11,-11, -5,-13,-12,-15, 14, 29, -1,-29,-15,-12; /M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -8, -5,-15,-17,-13,-12, -5,-14,-10, 2,-12, 0, -2, 17, 29, -5,-30,-12, -3; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-29,-19, 9,-30,-20, 19,-29, 47, 19,-30,-26,-20,-20,-29,-10, 9,-20, -1,-20; /M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 15, 3,-24, -1, 9,-21, 1,-28,-16, 47,-18, 11, 1, 8, -3,-30,-36,-18, 7; /M: SY='A'; M= 42, -8,-10,-17, -8,-20, -1,-18,-12,-10,-13,-12, -7,-10, -8,-18, 15, 5, -2,-23,-20, -8; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='C'; M= -2,-10, 53,-20,-19,-16,-23,-25,-20,-20,-16,-15,-10,-25,-19,-20, 6, 17, -5,-40,-21,-19; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, -2, -2,-19, -3,-12,-18,-10,-26,-18, 8,-10, -2,-10, 36, 23, -8,-38,-19, -2; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 15,-20, 0,-23; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='A'; M= 47, -9,-10,-18, -9,-20, 0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 12, 2, -1,-22,-20, -9; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M= -8,-18,-37, -9, 0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17, 81, -9,-19, -5, -7,-28,-31,-29, -9; /M: SY='I'; M= 1,-23,-20,-30,-25, -3,-29,-26, 30,-22, 12, 11,-18,-22,-21,-23,-12, -5, 28,-24, -7,-25; /M: SY='Y'; M=-10,-12,-28,-13,-11, 4, 7, -5,-19,-14,-15,-12, -6,-22,-13,-13, -7,-11,-19, 2, 14,-13; /M: SY='G'; M= 2, -8,-26, -8,-16,-28, 57,-18,-36,-18,-30,-20, 2,-18,-16,-18, 7,-13,-26,-24,-28,-16; /M: SY='R'; M=-17, -7,-29, -7, 3,-23,-20, 7,-28, 24,-20, -8, 1,-18, 16, 52, -7, -8,-21,-21, -8, 5; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-34,-25,-22, 25,-28, 9, -2,-13, -3, -3,-24,-30,-12,-13,-24,-14,-12, 51, 68,-20; /M: SY='D'; M=-16, 46,-26, 49, 11,-31, -6, 4,-31, 0,-30,-26, 37,-14, 0, -6, 4, -6,-30,-40,-20, 6; /M: SY='P'; M=-11, -7,-30, -2, 7,-25,-19,-10,-21, 4,-21,-13, -7, 21, 4, 7, -5, -6,-21,-27,-18, 2; /M: SY='R'; M= -6, 0,-20, -2, -2,-15,-13, -5,-18, 5,-19,-10, 5,-15, 0, 10, 9, 8,-13,-26, -6, -2; /M: SY='R'; M=-12,-13,-26,-14, -5,-13,-24,-12,-10, 14, 0, 2,-10,-19, -1, 19,-15, -7, -7,-21, -6, -4; /M: SY='T'; M= -1, -2,-20, -4, -5,-20, -6,-16,-18,-10,-22,-16, 1, 10, -8,-13, 15, 20,-14,-32,-19, -8; /M: SY='P'; M=-10,-20,-26,-18,-10, 0,-26,-19, 0,-18, 5, -2,-20, 12,-17,-18,-15, -6, -4,-22, -9,-14; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='T'; M= 0, -6,-19,-11, -5,-14,-10, -8, -8, -2, -8, -1, -3,-13, -3, -3, 0, 2, -6,-23,-10, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M=-13, 15,-29, 22, 30,-31,-17, 3,-28, 10,-23,-15, 7, -8, 22, 3, -1, -9,-28,-26,-12, 26; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30, 0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30; /M: SY='D'; M= -9, 24,-26, 25, 9,-31, 1, 1,-28, -1,-27,-19, 22,-13, 10, -5, 5, -7,-28,-33,-19, 10; /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 20,-29,-18, 17,-28, 41, 21,-27,-29,-21,-19,-27,-10, 8,-15, 5,-21; /M: SY='P'; M= -4,-10,-26, -8, 0,-24,-16,-12,-15, -7,-21, -8, -8, 29, 3,-11, 6, 5,-18,-30,-19, -1; /M: SY='P'; M= 5, 3,-25, 7, 11,-27,-12, -1,-23, -5,-21,-17, -3, 12, 0,-12, 2, -6,-20,-29,-18, 4; /M: SY='P'; M= 5, -9,-22,-10, -4,-21,-14,-18,-16,-10,-21,-16, -8, 30, -8,-15, 10, 14,-13,-30,-21, -8; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20, 0,-25; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21, 8,-29,-17, 22,-26, 43, 27,-28,-28,-16,-19,-28,-10, 11,-20, 0,-19; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='D'; M=-20, 47,-30, 67, 19,-39,-10, 0,-40, 1,-30,-29, 19,-10, 0, -7, 0,-10,-30,-39,-20, 10; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22, 6,-30,-19, 27,-27, 38, 26,-26,-26,-17,-20,-26,-10, 16,-20, 0,-21; /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-34,-25, 19,-33,-23, 25,-29, 32, 16,-26,-27,-24,-23,-24, -9, 17,-16, 4,-25; /M: SY='F'; M=-18,-27, -3,-35,-27, 48,-29,-17, -7,-25, 0, -5,-21,-31,-30,-19,-20,-12, -7, 15, 25,-25; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-27, 3,-33,-27, 34,-27, 27, 17,-27,-27,-23,-23,-20, -7, 30,-23, -3,-27; /M: SY='V'; M= -4,-29,-15,-31,-27, 1,-30,-24, 30,-21, 18, 20,-27,-27,-23,-20,-15, -4, 37,-26, -6,-26; /M: SY='L'; M=-10,-18,-22,-19,-10, -7,-26,-15, 1, -1, 13, 6,-17,-23, -6, 4,-17, -7, 2,-22, -6, -9; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M=-11, 0,-28, 3, 18,-24,-21, -7,-19, 5,-15,-11, -3, 0, 10, 6, -3, -2,-19,-27,-15, 13; /M: SY='M'; M= -7,-18, 2,-21,-15,-12,-24, 0, -3,-15, -6, 4,-15,-13, -8,-15,-10, -9, 1,-29, -8,-13; /M: SY='D'; M=-15, 44,-26, 50, 12,-32, -6, 3,-32, -1,-30,-26, 33,-13, 0, -7, 5, -5,-29,-40,-20, 6; /M: SY='E'; M= -8, -2,-30, 5, 32,-26,-19, -6,-23, 5,-19,-14, -6, 15, 9, 1, -4, -9,-23,-28,-20, 19; /M: SY='E'; M= -5, 1,-22, 5, 7,-18,-20,-13, -7, -5, -9, -7, -5,-13, -4,-11, -1, -1, -1,-30,-14, 1; /M: SY='R'; M= -6, -3,-22, -7, -5,-12,-18, -7, -9, -1,-11, -6, 1,-17, 2, 3, -1, 1, -8,-22, -5, -2; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='R'; M=-13, -9,-27, -8, 7,-13,-22, -2,-15, 10, -8, -4, -8,-17, 6, 22,-10, -9,-13,-16, 0, 4; /M: SY='R'; M= -4, -3,-24, -5, 9,-22,-16, 2,-19, 10,-16, -3, 0,-13, 12, 14, -1, -5,-16,-24,-11, 9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20, 0,-23; /M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-17, -9,-20, 0,-19,-11,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 14, 3, -1,-23,-20, -9; /M: SY='R'; M=-12, 7,-27, 8, 12,-26,-16, 3,-28, 20,-24,-13, 9,-12, 10, 22, -1, -5,-23,-27,-12, 10; /M: SY='H'; M=-20, -7,-28, -9, -6, -1,-22, 65,-24, -9,-14, -1, 3,-22, 1, 5,-12,-17,-23,-21, 18, -6; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-29, 1,-33,-29, 34,-24, 18, 14,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 39,-26, -6,-29; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 112 in 112 different sequences |
| Number of true positive hits | 112 in 112 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
112 sequences
MC6ZA_XENLA (Q498J7), MC6ZB_XENLA (Q7ZY18), MCM2_ARATH (Q9LPD9), MCM2_DROME (P49735), MCM2_HUMAN (P49736), MCM2_MOUSE (P97310), MCM2_ORYSI (B8BKI8), MCM2_ORYSJ (Q2R482), MCM2_SCHPO (P40377), MCM2_XENLA (P55861), MCM2_XENTR (Q6DIH3), MCM2_YEAST (P29469), MCM31_MAIZE (Q43704), MCM32_MAIZE (Q9SX04), MCM33_MAIZE (Q9SX03), MCM3M_XENLA (P49739), MCM3Z_XENLA (Q7ZXZ0), MCM3Z_XENTR (Q28BS0), MCM3_ARATH (Q9FL33), MCM3_BOVIN (A4FUD9), MCM3_CHICK (Q5ZMN2), MCM3_DROME (Q9XYU1), MCM3_ENTH1 (Q24849), MCM3_HUMAN (P25205), MCM3_MOUSE (P25206), MCM3_ORYSI (B8AZ99), MCM3_ORYSJ (Q0DHC4), MCM3_PONAB (Q5R8G6), MCM3_SCHPO (P30666), MCM3_YEAST (P24279), MCM4A_XENLA (Q5XK83), MCM4B_XENLA (P30664), MCM4_ARATH (Q0WVF5), MCM4_CAEEL (Q95XQ8), MCM4_DROME (Q26454), MCM4_HUMAN (P33991), MCM4_MOUSE (P49717), MCM4_ORYSJ (Q5JKB0), MCM4_SCHPO (P29458), MCM4_XENTR (Q6GL41), MCM4_YEAST (P30665), MCM5A_XENLA (P55862), MCM5B_XENLA (Q6PCI7), MCM5_ARATH (O80786), MCM5_BOVIN (Q0V8B7), MCM5_CAEEL (Q21902), MCM5_DICDI (Q54CP4), MCM5_DROME (Q9VGW6), MCM5_HUMAN (P33992), MCM5_MOUSE (P49718), MCM5_ORYSI (B8AEH3), MCM5_ORYSJ (Q6KAJ4), MCM5_SCHPO (P41389), MCM5_XENTR (Q561P5), MCM5_YEAST (P29496), MCM6M_XENLA (Q5FWY4), MCM6M_XENTR (Q28CM3), MCM6Z_XENTR (Q6P1V8), MCM6_ANOGA (Q7Q0Q1), MCM6_ARATH (F4KAB8), MCM6_BOVIN (Q2KIZ8), MCM6_CAEBR (Q61J08), MCM6_CAEEL (P34647), MCM6_DICDI (Q86B14), MCM6_DROME (Q9V461), MCM6_DROPS (Q29JI9), MCM6_HUMAN (Q14566), MCM6_MOUSE (P97311), MCM6_ORYSI (B8AZX3), MCM6_ORYSJ (Q6F353), MCM6_RAT(Q62724), MCM6_SCHPO (P49731), MCM6_YEAST (P53091), MCM7A_XENLA (Q91876), MCM7B_XENLA (Q7ZXB1), MCM7_ARATH (P43299), MCM7_BOVIN (Q3ZBH9), MCM7_DROME (Q9XYU0), MCM7_HUMAN (P33993), MCM7_MOUSE (Q61881), MCM7_ORYSI (B8BMI1), MCM7_ORYSJ (Q2QNM1), MCM7_SCHPO (O75001), MCM7_XENTR (Q6NX31), MCM7_YEAST (P38132), MCM8_ARATH (Q9SF37), MCM8_BOVIN (E1BPX4), MCM8_CHICK (I0IUP3), MCM8_HUMAN (Q9UJA3), MCM8_MOUSE (Q9CWV1), MCM8_ORYSI (B8AZ14), MCM8_ORYSJ (B9FKM7), MCM8_RAT(D3ZVK1), MCM8_XENLA (Q5F310), MCM8_XENTR (Q0V9Q6), MCM9_ARATH (F4IFF3), MCM9_BOVIN (F1N2W9), MCM9_CHICK (I0IUP4), MCM9_DANRE (F1QDI9), MCM9_HUMAN (Q9NXL9), MCM9_MOUSE (Q2KHI9), MCM9_ORYSI (B8B406), MCM9_ORYSJ (Q69QA6), MCM9_RAT(F1M5F3), MCM9_XENLA (Q6NRM6), MCM9_XENTR (F6RIX4), MCMR_DROME (Q9VF30), MCM_SACS2 (Q9UXG1), Y1489_METJA (Q58884), Y3513_METJA (Q60275), Y363_METJA (Q57809), Y961_METJA (Q58371)» more
|
| PDB [Detailed view] |
75 PDB
3F9V; 3JA8; 3JC5; 3JC6; 3JC7; 4FDG; 4R7Y; 5BK4; 5U8S; 5U8T; 5V8F; 5XF8; 6EYC; 6F0L; 6HV9; 6PTJ; 6PTN; 6PTO; 6RAW; 6RAX; 6RAY; 6RAZ; 6RQC; 6SKL; 6SKO; 6U0M; 6WGC; 6WGF; 6WGG; 6WGI; 6XTX; 6XTY; 7P30; 7P5Z; 7PFO; 7PLO; 7PMK; 7PMN; 7PT6; 7PT7; 7QHS; 7V3U; 7V3V; 7W1Y; 7W68; 7W8G; 7WI7; 7Z13; 8B9A; 8B9B; 8B9C; 8B9D; 8EAF; 8EAG; 8EAH; 8EAI; 8EAJ; 8EAK; 8EAL; 8EAM; 8KG6; 8KG8; 8KG9; 8OUW; 8P5E; 8P62; 8P63; 8Q6O; 8Q6P; 8S91; 8S92; 8S94; 8W7M; 8W7S; 8XGC » more |