PROSITE entry PS50058
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | G_PROTEIN_GAMMA |
Accession [info] | PS50058 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC01002 |
Associated ProRule [info] | PRU00592 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | G-protein gamma subunit domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-.1439; R2=.01493742; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=579; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=445; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M= 0, 6,-19, 0, -6,-19, 7, 5,-19, -9,-23, -9, 18,-16, -3, -8, 13, 0,-18,-33,-16, -5; /M: SY='T'; M= 5, -9,-16,-16,-13,-12,-10,-18, -1,-15, -8, -2, -4,-14,-10,-16, 11, 16, 2,-28,-12,-13; /M: SY='S'; M= 8, 4,-18, 0, 10,-22, -9, -6,-17, -3,-18,-10, 7,-10, 7, -7, 13, 5,-15,-30,-17, 8; /M: SY='S'; M= -2, 16,-19, 18, 11,-26, -6, -4,-26, 0,-29,-21, 17,-10, 3, -4, 20, 6,-19,-37,-19, 7; /M: SY='I'; M= -3,-28,-21,-33,-24, 2,-31,-25, 30,-27, 28, 16,-25,-25,-21,-24,-20, -8, 22,-21, -3,-24; /M: SY='A'; M= 19, -6,-16,-10, -4,-23, -2,-14,-16, -8,-19,-13, -3, -2, 0,-13, 16, 8,-10,-27,-19, -2; /M: SY='Q'; M= 1, 2,-26, 4, 29,-32,-16, 1,-22, 6,-18, -9, -2, -6, 32, 1, 2, -8,-24,-24,-16, 31; /I: I=-5; MI=-5; IM=-5; B1=0; /M: SY='L'; M= 11,-19,-19,-24,-13, -8,-19,-16, 9,-17, 15, 11,-18,-19, -6,-17,-11, -6, 5,-20, -8,-10; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 6,-26,-20, -4,-29, 38,-25, -9, 0,-15, 14, 47, -9,-10,-21,-20,-10, 8; /M: SY='K'; M= -4,-11,-23,-15, -6,-17,-19, -9, -8, 18, -9, 10, -9,-16, 1, 14,-10, -8, -3,-21, -9, -3; /M: SY='T'; M= 0,-10,-18,-10, 3,-11,-20,-15, -2,-10, 1, -1,-12,-15, -6,-12, -1, 4, 3,-28,-12, -2; /M: SY='V'; M= 0,-27,-10,-28,-28, -1,-29,-29, 26,-19, 8, 8,-27,-28,-28,-19, -7, 6, 44,-30,-10,-28; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 22, 50,-32,-19, 1,-30, 9,-21,-18, 2, -2, 24, 0, 0,-10,-30,-30,-19, 37; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-14, -6,-13, -7, 2,-25,-21, -8,-30, 33,-25,-11, -2,-17, 6, 39,-10,-10,-19,-23,-12, 2; /M: SY='M'; M= -4,-16,-24,-20,-10,-10,-22,-13, 2, 3, 7, 12,-14,-19, -5, 3,-15, -9, 0,-20, -6, -8; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23, 3,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20, 3, 0, 17,-23,-17,-17; /M: SY='N'; M= 2, 4,-11, -3, -7,-23, 9,-11,-25, -2,-25,-16, 12,-17, -7, -6, 7, 0,-19,-30,-20, -7; /M: SY='I'; M= -9,-23,-24,-30,-23, 1,-31,-21, 31,-25, 24, 18,-17,-24,-18,-22,-20, -8, 18,-23, -3,-23; /M: SY='E'; M=-13, 18,-22, 25, 26,-33,-16, -1,-29, 2,-25,-19, 8, 0, 15, -4, 0, -9,-29,-33,-20, 20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='M'; M= -3,-18,-23,-23,-13,-12,-26,-15, 15, -7, 3, 16,-15,-18, 0,-10,-11, -8, 11,-22, -6, -8; /M: SY='K'; M= -9, -6,-26, -7, 3,-21,-22,-11,-18, 26,-12, -4, -6,-14, 6, 15,-10, -4,-13,-21, -8, 4; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M=-10, 2,-30, 4, 24,-33,-20, -2,-27, 29,-25, -9, 0, -8, 28, 17, -5,-10,-25,-22,-12, 26; /M: SY='A'; M= 25,-12, 12,-20,-15,-17,-10,-22,-10,-15,-12,-11,-11,-17,-15,-20, 8, 5, 3,-29,-20,-15; /M: SY='A'; M= 21, -9, 15,-15,-12,-21, 0,-19,-20,-15,-20,-16, -5,-17,-12,-19, 14, 2, -8,-32,-23,-12; /M: SY='A'; M= 23, -4,-17, -7, 7,-24, -7,-14,-19, 6,-18,-13, -4, -8, 0, -5, 7, -2,-10,-24,-18, 4; /M: SY='E'; M=-13, 21,-30, 33, 43,-33,-17, -1,-33, 11,-24,-22, 6, -4, 13, 0, -1,-10,-29,-32,-19, 28; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-23, 10,-31,-20, 24,-27, 38, 23,-27,-27,-19,-21,-26,-10, 15,-19, 1,-22; /M: SY='M'; M=-11,-15,-24,-18, -7,-10,-23, -7, -1, 6, 8, 21,-14,-19, 3, 7,-17,-10, -4,-20, -4, -3; /M: SY='D'; M= 1, 16,-22, 18, 8,-30, -9, -4,-25, 3,-24,-16, 10,-11, 9, -4, 7, -1,-20,-30,-17, 8; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30, 9, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 24, 66,-23; /M: SY='C'; M= -8,-24, 69,-32,-30,-13,-32,-30, -5,-28, -7, -7,-22,-35,-28,-28,-12, -8, 8,-41,-21,-30; /M: SY='E'; M= -9, 5,-26, 11, 37,-22,-20, -4,-20, 2,-10,-10, -3, -6, 11, -4, -2, -4,-20,-29,-16, 24; /M: SY='E'; M= 6, 1,-24, 1, 23,-28,-15, -5,-21, 8,-18,-11, -2, -7, 19, 0, 3, -3,-19,-24,-16, 21; /M: SY='H'; M=-16, 10,-27, 6, 5,-21,-14, 49,-27, 1,-23, -9, 21,-18, 8, 12, -3,-12,-28,-31, 0, 4; /M: SY='A'; M= 27, -6,-14,-11, 0,-21, -6,-16,-13, -2,-15,-11, -6,-10, -4,-11, 10, 1, -4,-25,-18, -2; /M: SY='R'; M= -8, -7, -9, -9, -5,-27, 2,-10,-28, 3,-23,-12, -3,-18, 5, 9, -2, -6,-21,-25,-18, -1; /M: SY='E'; M=-12, 21,-27, 20, 28,-27,-13, 12,-27, 7,-25,-18, 22,-10, 10, 2, 2, -8,-29,-33,-16, 19; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M= -6,-19,-34,-14, -5,-20,-20,-14,-13,-10,-20, -8,-19, 57, -9,-18,-11, -9,-21,-22,-14,-11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M= -6,-30,-18,-31,-25, 5,-31,-25, 27,-26, 32, 16,-29,-29,-24,-21,-22, -6, 27,-24, -4,-25; /M: SY='T'; M= -3, -7,-17,-12, -8,-14,-21,-17, -5, 3,-11, -2, -6,-14, -7, -2, 5, 16, 3,-27,-10, -8; /M: SY='G'; M= -2,-12,-32,-10,-15,-30, 49,-20,-35,-18,-30,-20, -5, 5,-18,-20, -2,-18,-30,-22,-30,-18; /M: SY='V'; M= -6,-29,-21,-32,-27, 5,-32,-28, 28,-23, 9, 9,-25,-13,-26,-23,-14, -5, 29,-23, -5,-28; /M: SY='P'; M= -6,-14,-31, -9, -2,-25,-18,-19,-18,-10,-26,-18,-13, 59, -9,-17, 1, 6,-22,-31,-25, -9; /M: SY='E'; M= 13, 5,-17, 6, 14,-24, -9,-11,-21, -4,-19,-17, 1, -7, 1,-11, 13, 6,-13,-30,-19, 7; /M: SY='D'; M= 0, 12,-21, 16, 7,-30, -2, -5,-26, -4,-26,-18, 8,-11, 11, -7, 16, 1,-20,-33,-19, 9; /I: I=-6; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; /M: SY='E'; M= -8, 0,-25, 3, 20,-23,-20, 3,-21, 12,-19,-11, -1,-10, 7, 4, 0, -2,-15,-28,-11, 13; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 6,-26,-20, -3,-29, 35,-24, -9, 0,-15, 16, 48, -9,-10,-21,-20,-10, 8; /M: SY='E'; M=-12, 15,-31, 27, 47,-32,-18, -2,-31, 6,-23,-22, 2, 6, 13, -4, -1,-10,-30,-32,-21, 30; /M: SY='K'; M=-10, -5,-30, -4, 7,-27,-21,-10,-23, 34,-21, -7, -5, -4, 10, 19,-11,-10,-19,-21,-11, 8; /M: SY='K'; M= -8, -3,-28, -3, 3,-27, -3,-10,-31, 29,-28,-13, 1,-13, 4, 24, -3, -8,-21,-22,-14, 3; /I: I=-6; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; E1=0; /M: SY='S'; M= -2,-13,-18,-15,-14, 3, 1,-17,-14,-17,-16,-12, -5,-12,-17,-16, 10, 3, -7,-23,-10,-15; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= 9,-11,-13,-18,-15,-10,-17,-21, 4,-15, -6, -4, -8,-15,-13,-16, 11, 18, 11,-29,-12,-15; /M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-36,-28, 9,-35,-27, 35,-28, 23, 16,-24,-25,-24,-25,-20, -8, 28,-19, 1,-28; /M: SY='L'; M= -5,-22,-17,-22,-15, 2,-22,-17, 10,-25, 29, 10,-20,-25,-15,-17,-12, -2, 5,-25, -5,-15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 51 in 51 different sequences |
Number of true positive hits | 51 in 51 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 23 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 68.92 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]