PROSITE entry PS50070
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50070
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | KRINGLE_2 |
Accession [info] | PS50070 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00020 |
Associated ProRule [info] | PRU00121 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Kringle domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=79; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=74; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7529000; R2=0.0095247; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6015.6655273; R2=8.3471975; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=814; H_SCORE=12810; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=604; H_SCORE=11057; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-15, 29,-30, 44, 37,-36,-15, 1,-34, 5,-25,-24, 10, -6, 13, -4, 0,-10,-30,-34,-19, 25; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M=-11,-21,-25,-25,-20, 16,-27, -1, 10,-12, 9, 15,-20,-25,-12,-12,-18, -9, 3, 1, 31,-18; /M: SY='H'; M=-13, -8,-26, -9, 0, -9,-23, 16,-13, -2, -9, -1, -5,-15, 2, 2, -8, -6,-13,-19, 4, -1; /M: SY='G'; M= -4, -5,-11, -4,-14,-29, 45,-17,-38,-18,-28,-21, 0,-21,-17,-19, -1,-17,-27,-26,-28,-16; /M: SY='N'; M= -9, 19,-22, 11, 2,-22,-10, 1,-19, 4,-22,-14, 26,-17, 5, 5, 5, 0,-21,-32,-14, 3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-10, -1,-27, 1, 17,-26,-19, 0,-19, 11,-16, -7, -2,-11, 16, 8, -4, -8,-17,-25,-11, 16; /M: SY='S'; M= -1, 8,-18, 3, -2,-19, 5, -6,-22, -7,-25,-17, 16,-15, -2, -7, 17, 6,-18,-33,-18, -2; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-18, -7,-30, -7, 3,-21,-19, 1,-27, 25,-18, -7, 0,-18, 12, 54, -9,-10,-20,-21,-10, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='T'; M= -4, 2,-18, -4, -3,-17,-18,-12,-16, 5,-16,-10, 5,-10, -3, 1, 8, 21, -9,-28,-11, -4; /M: SY='V'; M= -1,-19,-19,-22,-17, -2,-21,-13, 5,-12, 2, 5,-16,-21,-13,-12, -7, -1, 9,-13, 0,-16; /M: SY='S'; M= 14, 6,-13, 2, -1,-20, -1, -9,-19, -8,-25,-18, 12,-12, -3,-10, 25, 10,-12,-35,-19, -2; /M: SY='T'; M= -5, -8,-17,-14,-10,-10,-23,-15, -4, -2, -7, -4, -7,-15, -9, -3, 3, 20, 5,-27, -8,-10; /M: SY='T'; M= 0, 2,-12, -6, -9,-12,-19,-19,-10,-10,-11,-10, 1,-10, -9,-11, 17, 41, -1,-30,-11, -9; /M: SY='V'; M= -4,-12,-20,-14, -5,-12,-22,-13, -2, -2, -5, 0,-11,-17, -7, -2, -4, 3, 5,-20, -9, -7; /M: SY='S'; M= 5, 0,-13, -5, -5,-17, -6,-11,-15, -7,-19,-12, 6,-12, -4, -9, 22, 21, -8,-33,-15, -5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-19,-30,-20, 0,-20,-19,-19, 0,-20,-30,-20,-30,-19; /M: SY='R'; M= -5,-16,-23,-19,-11,-11,-23,-10, 0, -1, -1, 1,-10,-19, -7, 8, -9, -4, 3,-23, -7,-11; /M: SY='P'; M= -6, -4,-26, -3, 7,-23,-19,-13,-19, 1,-21,-14, -5, 19, 1, -5, 4, 9,-17,-29,-18, 2; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Q'; M= -9, -6,-27, -7, 10,-29,-22, 3,-11, 0, -7, 3, -5,-14, 40, 2, -4, -8,-20,-21, -8, 25; /M: SY='A'; M= 6, -6,-22, -8, 0,-21, -9, -8,-18, 1,-17,-10, -2, -1, -1, 3, 3, -3,-14,-26,-16, -2; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='N'; M= 3, 17,-18, 16, 2,-24, -2, -5,-23, -4,-26,-20, 18,-13, -2, -6, 16, 4,-17,-36,-20, 0; /M: SY='S'; M= 15, -3,-13, -5, -1,-20, -4, -9,-17, -7,-22,-15, 3,-11, 0, -9, 25, 11, -9,-33,-18, -1; /M: SY='L'; M= 5,-15,-20,-15, 3, -8,-20,-15, 0,-15, 18, 3,-18,-18, -8,-15,-13, -8, -3,-23,-10, -3; /M: SY='T'; M= -2, -8,-18,-12, -5, -6,-20,-10, -5,-11, -7, -4, -6,-12, -6,-12, 6, 14, -3,-22, -2, -7; /M: SY='P'; M= -7,-20,-34,-13, -3,-23,-21,-20,-12,-12,-18,-13,-20, 60,-11,-19,-10, -7,-18,-29,-24,-11; /M: SY='H'; M=-16, -1,-28, -1, -2,-17,-20, 68,-22, -8,-14, 0, 6,-20, 5, -2, -9,-15,-23,-28, 14, -2; /M: SY='R'; M= -6, -8,-26, -8, 1,-20,-15, -7,-19, 8,-15, -8, -5,-16, 8, 14, -4, -5,-15,-13, -9, 3; /M: SY='H'; M=-16, -3,-31, -2, 1,-22,-20, 59,-26, -3,-19, -4, 4, -4, 8, 0,-10,-16,-27,-28, 6, 1; /I: I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; /M: SY='S'; M= -6, -1,-24, -2, 1,-21,-11, -9,-15, 0,-18,-10, 3, -6, 2, 0, 4, 1,-13,-29,-15, 0; /M: SY='Y'; M=-18,-18,-27,-22,-15, 22,-27, 1, -7, -2, -4, -1,-12,-24,-12, 6,-16,-10, -8, 1, 28,-15; /M: SY='T'; M= -4, -3,-16,-10,-10,-10,-20, -8, -3,-13, -6, -5, 1,-15, -8,-11, 8, 21, -2,-28, -6,-10; /M: SY='P'; M= -1,-15,-31,-10, -2,-23,-15,-18,-18,-10,-24,-16,-14, 52, -7,-17, -3, -5,-22,-27,-23, -7; /M: SY='E'; M= -5, 2,-26, 5, 22,-23,-13, 1,-25, 0,-20,-16, 0, -9, 8, -2, 3, -2,-22,-19,-12, 15; /M: SY='R'; M= -9, 4,-22, -3, -2,-11,-15, -4,-18, 7,-18,-12, 11,-15, -1, 12, 2, 5,-15,-23, -5, -3; /M: SY='Y'; M=-13, -9,-25,-13,-12, 16,-20, 6,-12,-12,-10, -8, -3,-11,-13, -9, -8, -7,-15, -6, 20,-13; /M: SY='P'; M= -9, -4,-34, 3, 2,-29,-16,-13,-22, -4,-27,-19, -5, 49, -6,-11, -5, -8,-27,-31,-25, -5; /M: SY='N'; M= 3, 5, -5, 0, -6,-22, -1, -8,-23, -8,-21,-16, 10,-19, -6, -9, 3, -6,-19,-25,-19, -6; /I: MD=-23; /M: SY='A'; M= 13, -8,-20,-11, -3,-20,-10,-15,-11, 5,-12, -6, -7,-12, -2, -4, 0, -4, -5,-22,-14, -3; D=-4; /I: I=-5; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -8, 4,-26, 5, -7,-23, 18,-11,-24,-10,-14,-13, 6,-17,-10,-11, -5,-12,-21,-26,-19, -8; D=-4; /I: DM=-23; /M: SY='L'; M= -8,-26,-22,-27,-20, 5,-13,-20, 9,-28, 34, 12,-24,-28,-21,-20,-24,-12, 3,-19, -4,-20; /M: SY='E'; M= -9, 5,-26, 6, 16,-24,-18, -7,-20, 11,-19,-12, 3, -9, 7, 8, -1, -1,-17,-27,-14, 11; /M: SY='E'; M=-12, 3,-28, 6, 22,-23,-19, 17,-22, 9,-16, -2, 0,-10, 12, 6, -7,-12,-21,-27, -7, 15; /M: SY='N'; M= -9, 39,-20, 19, 0,-20, 0, 9,-20, 0,-30,-20, 58,-20, 0, 0, 10, 0,-29,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 13, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 1,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 69,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-20, 48,-30, 67, 19,-39,-10, 0,-40, 1,-30,-29, 19,-10, 0, -7, 0,-10,-30,-39,-20, 10; /M: SY='G'; M= 4, 1,-25, -3,-11,-25, 33,-12,-30,-10,-26,-18, 10,-16,-11,-10, 4,-10,-24,-23,-24,-11; /M: SY='D'; M=-11, 24,-26, 35, 21,-32,-12, -3,-30, 3,-25,-21, 10,-10, 6, -4, 4, -6,-23,-34,-18, 13; /M: SY='E'; M= -1, -8,-24, -7, 7,-20,-18,-14,-11, 1,-13, -9, -8, 0, -1, -3, -2, -2, -8,-26,-16, 1; /M: SY='R'; M= -2, -2,-24, -5, 1,-23, -3, 0,-26, 8,-22,-12, 5,-15, 4, 17, 2, -5,-19,-25,-14, 1; /I: I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; /M: SY='P'; M= -8,-20,-39,-11, -1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-20, 85,-10,-20, -9,-10,-28,-30,-29,-10; /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-30, 11,-20,-28,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,146, 32,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-28,-24,-21, 39,-30, 15, -1,-15, 1, 0,-19,-30,-16,-12,-20,-10, -9, 22, 65,-21; /M: SY='T'; M= 0, -7,-10,-15,-15, -8,-22,-22, -1,-12, -5, -5, -7,-15,-15,-12, 13, 38, 12,-30,-10,-15; /M: SY='T'; M= -2, -9,-16,-16,-11, -8,-16,-14, -5,-10, -2, 4, -7,-15, -5, -8, 5, 20, -1,-25, -8, -8; /I: I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; /M: SY='D'; M=-12, 35,-26, 42, 9,-32, 0, -1,-33, -1,-29,-25, 25,-14, -1, -6, 3, -8,-28,-36,-20, 4; /M: SY='P'; M= -9,-16,-34, -9, -1,-26,-16,-16,-19, -8,-23,-16,-15, 56, -5,-13, -6, -8,-25,-29,-25, -7; /M: SY='R'; M= -7, 3,-23, 3, 7,-25,-10, -5,-24, 8,-22,-14, 6, -8, 6, 9, 3, -2,-20,-28,-16, 6; /M: SY='V'; M= -6,-18,-21,-20,-15, -8,-23,-19, 7, -5, 1, 4,-17,-20,-11, -8,-10, -3, 13,-22, -5,-14; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='R'; M=-15,-11,-27,-10, -3,-13,-21, -7,-19, 10,-10, -7, -5,-12, 0, 34, -9, -5,-14,-22, -9, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='W'; M=-16,-31,-34,-33,-25, 21,-24,-20, -8,-17, -7, -8,-28,-28,-21,-12,-25,-16,-10, 66, 25,-21; /M: SY='E'; M=-10, 17,-30, 27, 41,-33,-13, 0,-31, 6,-23,-20, 4, -5, 17, -3, 0,-10,-29,-30,-19, 29; /M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-19,-13, 28,-28, 8, -2,-12, 0, -2,-18,-26,-12,-11,-16, -9, -8, 15, 54,-15; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15; /M: SY='D'; M= -7, 23,-24, 24, 6,-28, -7, -1,-24, 0,-24,-15, 18,-10, 3, -5, 5, -3,-22,-34,-18, 4; /M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-34,-26, 3,-34,-26, 34,-27, 26, 18,-24,-25,-21,-24,-20, -6, 26,-22, -2,-26; /M: SY='P'; M= -7, -9,-30, -6, 1,-26,-18,-10,-20, 0,-25,-15, -7, 39, -2, -6, -2, -1,-23,-29,-20, -3; /M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -2, 5,-22,-17, -3,-18, 8,-17, -8, -1,-12, 13, 14, 0, -3,-15,-23, -9, 7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 199 in 96 different sequences |
Number of true positive hits | 199 in 96 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 1 |
Number of 'partial' sequences | 1 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.50 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 16 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Kringle |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]