PROSITE entry PS50095

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PLAT
Accession [info]	PS50095
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50095
Associated ProRule [info]	PRU00152

Name and characterization of the entry

Description [info]

PLAT domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=118;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=113;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5281; R2=0.03316360; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=181; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F';  M= -3,-17,-11,-22,-19,  3,-16,-15, -2,-15, -3, -1,-13,-21,-16,-16, -8, -4,  0,-12,  3,-18;
/M: SY='H';  M=-10, -5,-22, -5, -2,-16,-17,  7,-15, -1,-12, -5, -3,-15, -1,  3, -4, -4,-10,-27, -6, -4;
/M: SY='Y';  M=-11,-20,-24,-22,-19, 19,-20,  2, -3,-14, -1, -2,-18,-24,-14,-14,-16,-10, -8, 15, 43,-19;
/M: SY='Q';  M= -9,  2,-23,  0,  9,-21,-18, -1,-18,  3,-15, -9,  4,-11, 10,  6,  3,  6,-17,-28,-12,  9;
/M: SY='V';  M= -2,-27,-17,-30,-25,  6,-29,-26, 25,-23, 15, 10,-24,-25,-24,-21,-13, -3, 30,-23, -4,-25;
/M: SY='T';  M= -3, -8,-20,-10, -3,-12,-19,-11, -7,  1,-10, -6, -5,-16, -4,  0,  1,  4, -1,-24, -6, -5;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-19,-30,-24,  1,-29,-26, 27,-22, 15, 12,-24,-23,-22,-21,-15, -5, 29,-25, -6,-24;
/M: SY='H';  M= -8,-11,-21,-13, -5, -8,-21,  6, -7, -7, -4,  2, -8,-19, -2, -6, -8, -7, -7,-19,  0, -4;
/M: SY='T';  M= -4, -6,-16,-12,-10, -3,-21,-17, -7,-10, -4, -4, -6,-12,-11, -9,  5, 24, -1,-24, -7,-10;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-26, -6,-13,-21, 36,-17,-29,-14,-22,-16,  0,-18,-15,-14,  2,-12,-21,-23,-22,-14;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N';  M= -7,  9,-21,  8,  1,-18, -1, -4,-20, -4,-19,-14, 11,-14, -3, -5,  5, -1,-17,-24,-12, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -6, -1,-19, -2, -3,-14,-11, -5,-11, -2,-11, -7,  1,-15, -1,  4,  0, -1, -8,-22, -8, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M=-10,-11,-21,-12, -8, -4,-16,-12, -6, -8, -4, -4, -9,-17, -9, -5,-11, -8, -7, -5, -2, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='G';  M= -7, -5,-25, -6, -7,-13, 13, -8,-23,-10,-16,-12,  0,-18,-10, -7, -2, -8,-18,-21,-12, -9;
/M: SY='A';  M= 13, -2,-18, -3, -2,-20,  0,-12,-18, -7,-14,-13, -2,-13, -6, -9,  8,  0,-11,-25,-16, -4;
/M: SY='G';  M= -5,-10,-27,-10,-12,-17, 24,-13,-21,-16,-12, -9, -6,-18,-13,-15, -6,-13,-17,-21,-16,-13;
/M: SY='T';  M= -2,-10,-14,-17,-14, -2,-22,-20,  0,-15,  3, -1, -8,-16,-13,-13,  5, 26,  4,-25, -6,-14;
/M: SY='D';  M= -9, 13,-21, 17,  1,-26,  0, -9,-26, -6,-21,-18,  7,-14, -3, -8,  3,  0,-20,-28,-17, -1;
/M: SY='S';  M=  3,  3,-22,  4,  3,-26, -7, -9,-23,  1,-23,-15,  3, -5,  3,  0,  9,  3,-17,-29,-18,  2;
/M: SY='N';  M= -5,  2,-23, -2, -3,-19, -9, -3,-16, -3,-19,-12,  8,-11, -2, -1,  4,  1,-15,-24,-11, -4;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-17,-32,-27,  5,-31,-27, 30,-24, 21, 15,-27,-27,-25,-22,-17, -5, 33,-23, -4,-27;
/M: SY='Y';  M= -6, -8,-20,-10, -8, -2,-16, -7,-14, -6,-15,-10, -6,-18, -7, -8,  1,  3,-10, -5,  8, -8;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-18,-33,-25, 13,-31,-23, 24,-27, 24, 15,-24,-26,-23,-22,-19, -7, 19,-18,  1,-25;
/M: SY='Q';  M= -6, -5,-21, -7,  0,-18,-15, -7,-12, -4,-15, -6, -3,-15,  4, -2,  2,  1,-11,-18, -8,  1;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-22,-31,-23,  5,-26,-23, 24,-28, 36, 17,-26,-27,-21,-22,-24,-10, 15,-21, -3,-23;
/M: SY='Y';  M=-10,-19,-22,-21,-16,  8,-27, -3,  6,-12,  3,  3,-17,-25,-14, -9,-12, -4,  8,-10, 18,-17;
/M: SY='G';  M=  4, -5,-24, -5,-12,-26, 42,-16,-31,-16,-27,-19,  2,-17,-13,-17, 10, -8,-22,-26,-26,-13;
/M: SY='S';  M=  6,  2,-19,  0,  4,-21,-11,-11,-16, -3,-17,-13,  3, -6,  0, -7, 10,  8,-12,-30,-16,  1;
/M: SY='E';  M=-10, 11,-25, 10, 14,-23,-16,  7,-21,  7,-18,-11, 10,-13,  6,  1, -1, -5,-19,-30,-11,  9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='G';  M=  3, -4,-22, -7,-13,-25, 37,-16,-31,-14,-25,-18,  3,-18,-14,-15,  2,-10,-23,-19,-24,-14;
/M: SY='E';  M=-11,  7,-25, 11, 15,-27,-13, -4,-27, 14,-23,-15,  4, -9,  9,  9, -2, -7,-23,-27,-14, 12;
/M: SY='T';  M=  1, -6,-17,-10, -6,-14,-14,-10,-11, -4,-11, -6, -2,-15, -1, -3,  9, 12, -5,-27, -9, -4;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-28,  5, 10,-26,  0, -7,-23, -2,-19,-14,  0, -8,  2, -5,  0, -8,-21,-27,-18,  5;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-26,  1,  7,-21,-15, -4,-21, 11,-20,-11,  5, -6,  5,  8, -3, -5,-19,-25,-12,  5;
/M: SY='I';  M=-10,-16,-28,-17, -8, -8,-24, -8,  2,-11, -1,  0,-13,-10, -7, -7,-13, -8, -2,-15, -1,-10;
/M: SY='P';  M= -2,-12,-23,-12, -4,-16,-19,-11,-11, -3,-11, -6,-11,  7, -5, -6, -6, -5,-10,-24,-11, -7;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L';  M= -8,-18,-20,-22,-17,  6,-24,-10, 12,-20, 17, 10,-14,-22,-14,-16,-13, -3,  5,-18,  4,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L';  M= -8, -4,-20, -3, -1, -9,-16, -7, -8, -7,  2, -3, -6,-16, -4, -5, -6, -2, -7,-22, -6, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-20,  5, 12,-21, -8,  2,-19,  6,-17,-10,  4, -9,  8,  3,  1, -5,-16,-22,-11,  9; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D';  M= -1,  3,-16,  5,  4,-16, -5, -6,-18, -2,-17,-13,  1, -3, -1, -4,  3, -3,-15,-18,-11,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M:         M= -4, -6,-19, -8, -8, -3,-10,-11, -9, -5, -5, -6, -5,-15, -9, -6, -5, -1, -7, -8, -2, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='H';  M= -9, -9,-23,-12, -8, -7,-13, 12, -8, -8, -6,  0, -5,-18, -2, -7, -8, -8,-10,-10,  7, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K';  M=-11,  5,-25,  7,  6,-21,-14, -3,-22,  8,-21,-14,  6,  4,  1,  7, -2, -4,-21,-26,-14,  2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -5, -3,-23, -3, -5,-13, -5,-11,-14, -5,-15,-10, -3, -7, -8, -9, -1, -2,-11,-20, -7, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='F';  M=-12,-26,-20,-31,-23, 31,-28,-18, 10,-24, 16,  6,-21,-24,-26,-17,-18, -7,  8, -6, 10,-23; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -2, -2,-20,  0, 11,-20,-16, -8,-15, -2,-12,-11, -5, -5, -1, -6, -1, -4,-12,-27,-14,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -1, -6,-19, -7, -3,-17,-15,-11,-17,  5,-16,-10, -3,-13, -2, 11,  1,  1, -9,-22,-13, -4;
/M: SY='G';  M= -1,  7,-26,  6, -6,-28, 30,-11,-32, -9,-28,-20, 11,-12,-10,-11,  3,-11,-26,-27,-25, -9;
/M: SY='S';  M=  4,  4,-17,  2,  3,-24, -4,-10,-23,  0,-24,-17,  7, -6, -1, -4, 10,  2,-17,-31,-19,  1;
/M: SY='T';  M= -4, -6,-15, -8, -3,-11,-20,-13, -8, -9, -5, -7, -7,-15, -8,-10,  3, 13, -2,-24, -8, -6;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D';  M=-10, 19,-25, 26, 11,-25,-12,  1,-24, -2,-20,-17,  9, -9,  1, -8,  0, -4,-19,-29,-11,  5; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -1, -3,-19, -5,  1,-17,-16,-10,-11,  0,-13, -7, -2,-13,  1, -1,  6,  7, -7,-26,-10,  0; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-16,-26,-24,-33,-26, 53,-28,-12,  1,-23,  5, -1,-20,-25,-29,-18,-18, -9, -2, 13, 35,-26;
/M: SY='E';  M= -9, -6,-24, -6,  5,-15,-16, -9,-11, -1, -4, -4, -5,-15,  0, -1, -5, -2,-10,-24, -9,  2;
/M: SY='V';  M= -2,-26,-15,-31,-25, 11,-21,-24, 14,-24, 13,  7,-22,-26,-25,-21,-14, -7, 17,-18, -2,-25;
/M: SY='E';  M= -7,  5,-23,  7,  8,-20,-18, -3,-19, -2,-17,-13,  0, -5,  5, -4,  4,  7,-16,-25, -6,  5;
/M: SY='F';  M= -2,-16,-15,-22,-18, 12,-15,-16, -5,-18, -3, -5,-11,-21,-20,-15, -2,  5,  1,-13,  1,-18;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D';  M= -4, 10,-22, 15, 14,-24, -9, -5,-21,  2,-18,-14,  3,  1,  4, -5,  0, -5,-19,-24,-15,  9; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E';  M= -4, -8,-13, -9,  4,-13,-18,-13, -9, -5, -7, -5, -9,-16, -3, -9, -5, -6, -6,-26,-12,  0;
/M: SY='D';  M=-11, 20,-25, 26,  8,-24, -9, -2,-25, -1,-22,-18, 11,-10, -1, -7,  3, -4,-22,-30,-11,  3;
/M: SY='L';  M=-11,-26,-22,-30,-22, 16,-30,-19, 17,-24, 20, 13,-21,-20,-21,-20,-19, -7, 12,-16,  3,-22;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-29,-10,-18,-28, 59,-19,-36,-19,-27,-19, -1,-17,-18,-18,  1,-17,-28,-21,-28,-18;
/M: SY='E';  M= -9,  0,-27,  5, 12,-22,-20,-10,-14, -4,-15,-13, -4,  8, -2, -9, -2, -2,-13,-30,-17,  4;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-25,-28,-19, -3,-30,-24, 19,-23, 18,  9,-24, -4,-18,-20,-19, -7, 12,-24, -8,-21;
/M: SY='G';  M= -4,-12,-12,-14, -9,-17,  3,-12,-16,-14, -8, -6, -8,-20, -7,-12, -6, -8,-14,-21,-13, -9;
/M: SY='A';  M= 14, -8,-17,-15, -8,-14,-11,-13, -8,  0, -9, -1, -5,-14, -5, -5,  2,  0, -3,-22,-11, -7;
/M: SY='I';  M= -9,-26,-22,-30,-24,  6,-31,-22, 28,-25, 23, 19,-23,-24,-20,-22,-19, -7, 22,-21, -1,-23;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-23,-11, -4,-16,-23, -9,-11, 12, -9, -4, -4,-19,  0, 24,-10, -6, -7,-22, -8, -5;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-19,-33,-27, 11,-30,-26, 27,-26, 24, 14,-26,-28,-26,-22,-19, -7, 26,-20, -1,-27;
/M: SY='K';  M= -9,-10,-28,-11, -3,-17, -9, -9,-19,  1,-16,-10, -8,-17, -2,  0, -8, -5,-16,  0, -6, -3;
/M: SY='H';  M=-12,  4,-27, -2, -6,-15,-13, 20,-19, -5,-22,-11, 15,-17, -2, -4, -4, -9,-22, -8, -1, -5;
/M: SY='D';  M=-12, 18,-27, 21, 17,-25,-15,  5,-26,  3,-21,-17, 12,-12,  8,  0,  0, -5,-25,-26,-10, 12;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='N';  M= -3,  5,-18,  2,  0,-19,  8, -2,-19, -1,-20,-12, 10, -3,  0, -4,  3, -5,-18,-20,-14, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='S';  M=  1,  1,-13,  0,  2,-13, -6, -3,-12, -1,-13, -9,  2, -6,  0, -2,  7,  3, -9,-17, -7,  1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G';  M=  1, -5,-16, -5, -5,-15, 21,-11,-18, -9,-15,-11,  0,-11, -8,-10,  2, -6,-13,-13,-15, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='H';  M=-12, -1,-26, -1, -3,-10,-16, 20,-18, -5,-13, -5,  2,-14, -1, -1, -5, -8,-18,-22,  5, -4;
/M: SY='H';  M= -4, -2,-24, -3, -1,-18, -7, 14,-23, -2,-20,-10,  3,-13,  3,  2,  2, -7,-19,-24, -5, -1;
/M: SY='P';  M= -1, -3,-26,  1,  1,-24,-11, -7,-20, -4,-21,-14, -4, 13, -3, -7,  1, -5,-17,-30,-18, -3;
/M: SY='E';  M= -1,  5,-25,  5, 13,-28,  6, -7,-27, -1,-25,-17,  7, -6,  4, -6,  6, -5,-24,-28,-21,  8;
/M: SY='W';  M=-16,-32,-35,-36,-27, 20,-23,-21, -5,-20, -2,  0,-31,-28,-20,-18,-29,-18,-11, 73, 24,-21;
/M: SY='Y';  M=-16,-22,-24,-26,-21, 38,-26,  3, -1,-19,  5,  1,-18,-28,-21,-14,-18,-10, -4,  9, 41,-21;
/M: SY='L';  M= -6,-28,  3,-31,-25,  3,-30,-25, 17,-27, 24, 10,-27,-30,-24,-23,-20, -7, 18,-26, -6,-25;
/M: SY='K';  M= -8, 10,-26, 11, 13,-28,-10, -2,-29, 18,-27,-16, 11,-11,  7, 13,  1, -6,-23,-28,-15, 10;
/M: SY='Y';  M= -9, -3,-24, -4, -4, -9,-16,  0,-19,  3,-17,-11, -2,-17, -1,  5,  0,  2,-15,-10,  7, -4;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-19,-35,-29,  3,-35,-28, 37,-26, 20, 15,-25,-25,-24,-25,-18, -6, 33,-23, -3,-29;
/M: SY='T';  M= -8, -6,-22, -9,  0,-14,-22,-13, -6, -2, -7, -4, -6,-15, -2,  2, -2,  7, -3,-22, -9, -2;
/M: SY='I';  M= -4,-29,-19,-33,-26,  2,-32,-26, 32,-25, 24, 16,-26,-26,-23,-23,-18, -6, 30,-24, -4,-26;
/M: SY='K';  M=-10,  2,-23,  3,  8,-21,-20, -3,-23, 13,-19,-11,  0,-13,  5, 13, -3,  0,-16,-25, -9,  5;
/M: SY='D';  M=  0, 11,-23, 13,  3,-26,  2, -7,-25, -6,-22,-18,  7,-11, -3,-10,  5, -4,-20,-27,-18,  0;
/M: SY='L';  M= -6,-13,-22,-13,-10, -5, -9,-16, -5,-17,  2, -2,-11,-10,-15,-16, -9, -6, -4,-23,-11,-13;
/M: SY='E';  M= -7, -2,-29,  3,  8,-25, -2,-10,-22, -5,-21,-15, -4,  6, -2,-10, -3, -9,-19,-27,-20,  2;
/M: SY='T';  M= -6,  1,-18, -3, -3,-17, -4, -6,-18, -6,-16,-10,  4,-16, -1, -5,  5,  6,-15,-26,-11, -2;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-24,  1,  3,-25,  5,  2,-25,  1,-20,-10,  1,-10,  8,  0, -1, -9,-21,-20,-13,  5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='R';  M= -8,  2,-22,  2,  3,-21, -4, -3,-21,  5,-18,-10,  3,-13,  4, 10,  1, -3,-16,-23,-13,  2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='K';  M= -1, -9,-22,-12, -2,-17,-20,-13, -7,  3,-11, -5, -7,-11, -1,  3, -1,  2, -3,-24,-10, -3;
/M: SY='Y';  M=-11,-24,-18,-27,-23,  9,-30, -9, 14,-18,  9,  8,-22,-27,-16,-16,-17, -7, 13, -5, 19,-21;
/M: SY='H';  M=-10, -9,-23,-11, -7, -7,-23,  4, -5, -6, -5, -1, -7,-17, -6, -2, -6,  0, -3,-21,  3, -8;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-21,-39,-29, 64,-30,-21,  6,-29, 13,  3,-22,-29,-36,-21,-21,-10,  4,  8, 24,-29;
/M: SY='P';  M= -5,-12, -7,-13,-10,-17,-20,-15, -8,-13,-12, -7,-10,  5,-10,-14, -2,  2, -6,-32,-17,-12;
/M: SY='C';  M=  1,-17, 51,-24,-22,-14,-23,-25,-13,-22,-14,-12,-16,-24,-23,-23, -3, -3,  2,-39,-22,-23;
/M: SY='N';  M=-11, 16,-25, 12, 12,-19, -8,  3,-23,  5,-23,-16, 21,-15,  5,  2,  1, -6,-25,-27,-10,  8;
/M: SY='S';  M= -4,  5,-15,  6, 10,-25,-10, -5,-25,  4,-26,-17,  9,-12,  7,  7, 15,  3,-19,-33,-18,  8;
/M: SY='W';  M=-17,-33,-44,-33,-23,  4,-20,-26,-18,-15,-17,-16,-33,-22,-15,-16,-31,-22,-26,108, 20,-16;
/M: SY='I';  M= -6,-25,-19,-27,-21,  4,-30,-23, 23,-23, 21, 13,-24,-25,-21,-20,-17, -5, 22,-23, -4,-21;
/M:         M= -6, -2,-25, -1, -2,-14, -8, -1,-17, -6,-14, -9, -3,-14,  0, -6, -1, -5,-15,-19,  0, -2;
/M: SY='P';  M= -5,-10,-27, -7, -3,-20,-10,-12,-15, -3,-16,-10, -8,  9, -5, -8, -4, -6,-13,-26,-15, -6;
/M: SY='D';  M= -5,  7,-25,  8,  5,-23, -6, -6,-23,  5,-20,-14,  6,-11,  0,  0,  1, -5,-19,-26,-13,  2;
/M:         M= -6, -7,-21, -9,  0, -9,-17, -5,-10, -3, -8, -4, -4,-16, -1, -2, -1,  0, -8,-23, -5, -1;
/M:         M= -4, -2,-19, -2, -2,-17, -9,-10,-16, -4,-14, -9, -3,-16, -6, -5,  0, -1, -9,-24,-13, -5;
/M: SY='D';  M=-11, -1,-24,  2, -4,-15,-14, -5,-16, -6,-12,-10, -2, -6, -5, -6, -7, -7,-16,-22, -5, -6;
/M: SY='G';  M= -5, -1,-24,  1, -3,-23,  2,-10,-24, -2,-21,-14, -1, -4, -6, -5, -1, -6,-18,-27,-18, -5;
/M:         M= -6, -9,-24, -8, -3,-11,-11,-10,-10, -8, -7, -5, -7,-10, -3, -9, -4, -5,-10,-21, -6, -4;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-25, -9, -4,-10,-12,-13,-13, -2, -6, -5, -7,-13, -8,  1, -8, -4,-11,-22,-10, -7;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-25, -5,  5,-14,-21, -8,-15,  7,-12, -9, -4,-13,  0, 15, -6, -4,-10,-23, -9,  0;
/M: SY='V';  M= -1,-14,-17,-17,-16, -9,-13,-18, -1,-11, -8, -4, -9,-19,-13, -7, -4, -5,  5,-21,-11,-15;
/M: SY='F';  M=-11,-11,-22,-14, -7, 16,-24,-15, -5,-12, -1, -4, -9,-19,-14,-11, -8, -2, -4,-15,  3, -9;
/M: SY='F';  M= -8,-18,-18,-24,-17, 18,-20,-15, -3,-16,  2, -2,-13,-23,-20,-12,-10, -2, -2, -8,  6,-17;
/M: SY='K';  M= -4, -9,-18,-11, -6,-10,-17,-11,-12,  2,-14, -8, -5, -9, -7,  0,  0,  0, -6,-24, -8, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	167 in 139 different sequences
Number of true positive hits	167 in 139 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	4
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	97.66 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	15
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PLAT
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

139 sequences

ALOX8_MOUSE (O35936), AOSL_PLEHO  (O16025), DEN5A_HUMAN (Q6IQ26),

DEN5A_MOUSE (Q6PAL8), DEN5A_RAT   (G3V7Q0), DEN5B_DANRE (Q6NXD8), 
DEN5B_HUMAN (Q6ZUT9), DEN5B_MOUSE (A2RSQ0), LIPC_BOVIN  (Q3SZ79), 
LIPC_HUMAN  (P11150), LIPC_MOUSE  (P27656), LIPC_RABIT  (O46559), 
LIPC_RAT(P07867), LIPE_CROAD  (J3RZ81), LIPG_HUMAN  (Q9Y5X9), 
LIPG_MOUSE  (Q9WVG5), LIPG_RAT(Q8VBX1), LIPL_BOVIN  (P11151), 
LIPL_CAVPO  (P11153), LIPL_CHICK  (P11602), LIPL_FELCA  (P55031), 
LIPL_HUMAN  (P06858), LIPL_MOUSE  (P11152), LIPL_NEOVI  (O46647), 
LIPL_PAPAN  (P49060), LIPL_PIG(P49923), LIPL_RAT(Q06000), 
LIPL_SHEEP  (Q29524), LIPP_CAVPO  (P50903), LIPP_HORSE  (P29183), 
LIPP_HUMAN  (P16233), LIPP_ICTTR  (O88354), LIPP_MOUSE  (Q6P8U6), 
LIPP_MYOCO  (Q64425), LIPP_PIG(P00591), LIPP_RABIT  (Q02157), 
LIPP_RAT(P27657), LIPR1_CANLF (P06857), LIPR1_HUMAN (P54315), 
LIPR1_MOUSE (Q5BKQ4), LIPR1_RAT   (P54316), LIPR2_BOVIN (A5PK46), 
LIPR2_CAVPO (P81139), LIPR2_HUMAN (P54317), LIPR2_MOUSE (P17892), 
LIPR2_MYOCO (Q64424), LIPR2_PIG   (D7EZN2), LIPR2_RAT   (P54318), 
LOX11_SOLTU (P37831), LOX12_HUMAN (P18054), LOX12_MOUSE (P39655), 
LOX12_RAT   (F1LQ70), LOX12_SOLTU (O24379), LOX13_SOLTU (Q43189), 
LOX14_SOLTU (Q43190), LOX15_BOVIN (P27479), LOX15_HUMAN (P16050), 
LOX15_MOUSE (P39654), LOX15_PIG   (P16469), LOX15_PONAB (Q5RBE8), 
LOX15_RABIT (P12530), LOX15_RAT   (Q02759), LOX15_SOLTU (Q43191), 
LOX16_SOLTU (Q41238), LOX17_SOLTU (O22507), LOX18_SOLTU (O22508), 
LOX1_ARATH  (Q06327), LOX1_HORVU  (P29114), LOX1_LENCU  (P38414), 
LOX1_ORYSJ  (Q76I22), LOX1_SOYBN  (P08170), LOX1_TANCI  (R9WTS6), 
LOX21_HORVU (P93184), LOX21_SOLTU (O24370), LOX22_HORVU (Q8GSM3), 
LOX23_HORVU (Q8GSM2), LOX2_ARATH  (P38418), LOX2_ORYSJ  (P29250), 
LOX2_PEA(P14856), LOX2_SOYBN  (P09439), LOX2_TANCI  (R9WS04), 
LOX31_SOLTU (O24371), LOX3_ARATH  (Q9LNR3), LOX3_ORYSJ  (Q7G794), 
LOX3_PEA(P09918), LOX3_SOYBN  (P09186), LOX4_ARATH  (Q9FNX8), 
LOX4_ORYSJ  (Q53RB0), LOX4_SOYBN  (P38417), LOX5_ARATH  (Q9LUW0), 
LOX5_HUMAN  (P09917), LOX5_MESAU  (P51399), LOX5_MOUSE  (P48999), 
LOX5_ORYSJ  (Q7XV13), LOX5_RAT(P12527), LOX6_ARATH  (Q9CAG3), 
LOX6_ORYSJ  (Q8H016), LOXA_PHAVU  (P27480), LOXA_SOLLC  (P38415), 
LOXB_PHAVU  (P27481), LOXB_SOLLC  (P38416), LOXC1_ORYSJ (P38419), 
LOXC2_ORYSJ (Q84YK8), LOXE3_HUMAN (Q9BYJ1), LOXE3_MOUSE (Q9WV07), 
LOXE3_RAT   (D3ZKX9), LOXH1_HUMAN (Q8IVV2), LOXH1_MOUSE (C8YR32), 
LOXX_SOYBN  (P24095), LX12B_HUMAN (O75342), LX12B_MOUSE (O70582), 
LX12B_RAT   (Q2KMM4), LX12E_MOUSE (P55249), LX12E_RAT   (D3ZQF9), 
LX15B_HUMAN (O15296), LX15B_RAT   (Q8K4F2), PHLC1_CLOPE (P0C216), 
PHLC_CLOHA  (P59026), PHLC_CLONO  (Q46150), PHLC_CLOP1  (Q0TV31), 
PHLC_CLOPF  (Q9RF12), PHLC_PARBF  (P20419), PHLC_PARSO  (Q8VUZ6), 
PK1L1_HUMAN (Q8TDX9), PK1L1_MOUSE (Q8R526), PK1L1_ORYLA (E7FKV8), 
PK1L2_HUMAN (Q7Z442), PK1L2_MOUSE (Q7TN88), PK1L3_HUMAN (Q7Z443), 
PK1L3_MOUSE (Q2EG98), PK1L_ACRMI  (B8UU59), PKD1_CAEEL  (Q09624), 
PKD1_HUMAN  (P98161), PKD1_MOUSE  (O08852), PKDRE_HUMAN (Q9NTG1), 
PKDRE_MOUSE (Q9Z0T6), PLAT1_ARATH (O65660), PLAT2_ARATH (Q9SIE7), 
PLAT3_ARATH (Q2V2V3)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

4 sequences

ATS3A_ARATH (Q681K2), ATS3B_ARATH (Q6NPM5), ATS3_ARATH  (Q9LYP6),

LIPR3_HUMAN (Q17RR3)

» more

PDB
[Detailed view]

85 PDB

1BU8; 1CA1; 1ETH; 1F8N; 1FGM; 1FGO; 1FGQ; 1FGR; 1FGT; 1GPL; 1GYG; 1HPL; 1HU9; 1IK3; 1JNQ; 1KHO; 1LNH; 1LOX; 1LPA; 1LPB; 1N8Q; 1N8S; 1NO3; 1QM6; 1QMD; 1ROV; 1RP1; 1RRH; 1RRL; 1Y4K; 1YGE; 2FNQ; 2IUK; 2OXE; 2P0M; 2PPL; 2PVS; 2SBL; 2WXT; 2WXU; 2WY6; 3BNB; 3BNC; 3BND; 3BNE; 3CWZ; 3DY5; 3FG1; 3FG3; 3FG4; 3O8Y; 3PZW; 3V92; 3V98; 3V99; 4NRE; 4QWT; 4WFO; 4WHA; 5EEO; 5T5V; 5TQN; 5TQO; 5TQP; 5TR0; 6A70; 6E7K; 6N2W; 6NCF; 6OAU; 6OAZ; 6OB0; 6U7M; 7LAF; 7SOI; 7SOJ; 7TTJ; 7TTK; 7TTL; 8ERL; 8GHB; 8GHC; 8GHD; 8GHE; 8I6Y
» more