PROSITE entry PS50109
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | HIS_KIN |
Accession [info] | PS50109 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JAN-2002 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50109 |
Associated ProRule [info] | PRU00107 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Histidine kinase domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=217; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=212; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9493000; R2=0.0205773; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6812.4682617; R2=16.1011562; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=683; H_SCORE=17810; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=270; H_SCORE=11160; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='B'; M= -3, 4,-22, 3, -5,-14, -4, -4,-16, -8,-15,-11, 3,-17, -6,-10, 1, -1,-12,-21, -3, -7; /M: SY='I'; M= -3,-27,-21,-32,-24, 2,-29,-22, 27,-23, 23, 20,-24,-24,-18,-21,-18, -7, 21,-19, -2,-22; /M: SY='A'; M= 19, -6,-12,-11, -7,-18, -5,-11,-15, -6,-17,-12, -2,-12, -5, -8, 14, 5, -6,-28,-16, -7; /M: SY='H'; M=-19, 1,-30, 1, 3,-22,-20, 78,-29, -4,-20, -3, 8,-18, 12, 6, -9,-18,-29,-28, 13, 3; /M: SY='E'; M= -9, 12,-29, 21, 44,-30,-17, -1,-28, 7,-21,-19, 2, -4, 17, -1, 1, -9,-27,-30,-19, 30; /M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-23, 9,-32,-23, 27,-28, 32, 18,-25,-25,-21,-23,-24, -9, 18,-19, 0,-23; /M: SY='R'; M=-13, -1,-28, -3, 2,-24,-13, 3,-28, 25,-24,-10, 6,-17, 8, 38, -6, -9,-21,-23,-10, 2; /M: SY='N'; M= -5, 13,-18, 4, -1,-19,-12, -5,-16, -3,-19,-13, 18,-14, 2, -4, 12, 18,-14,-32,-14, 0; /M: SY='P'; M= -9,-18,-38, -9, 0,-28,-20,-19,-18,-10,-28,-18,-18, 78, -9,-19, -8, -7,-27,-30,-28, -9; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-21, 6,-31,-21, 24,-28, 40, 19,-28,-26,-19,-21,-26, -9, 14,-21, -1,-21; /M: SY='S'; M= 9, 1,-12, -6, -6,-17, -3,-10,-17, -8,-19,-14, 6,-13, -6,-11, 15, 14,-10,-29,-15, -6; /M: SY='A'; M= 11, -9,-19,-14,-11,-18, 7,-16,-13,-11,-14, -9, -5,-16, -9,-11, 5, -1, -6,-24,-17,-11; /M: SY='I'; M= -7,-27,-24,-33,-24, 0,-33,-24, 33,-25, 23, 19,-22,-23,-18,-23,-19, -8, 23,-22, -3,-23; /M: SY='R'; M= -6,-12,-23,-15, -6,-13,-19, -9, -6, 2, -3, 2, -7,-18, 2, 10, -6, -5, -5,-22, -8, -4; /M: SY='G'; M= -1,-12,-21,-16,-15, -3, 8,-15,-12,-17, -6, -5, -6,-20,-16,-16, -3, -6, -9,-19, -9,-15; /M: SY='Y'; M= -1,-10,-17,-15,-11, 3,-17, -6, -6,-12, -4, -3, -6,-20, -9,-11, -3, 0, -5,-15, 6,-10; /M: SY='A'; M= 10,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-15, -2,-11, 0, -1, -9,-17,-10, -9, 1, 4, 3,-25,-11,-11; /I: I=-8; MI=-20; MD=-15; IM=-20; /M: SY='E'; M= -8, 6,-27, 9, 23,-28,-14, 1,-26, 11,-21,-13, 3, -9, 17, 9, 1, -7,-24,-26,-14, 20; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= -2,-20,-19,-24,-16, 0,-23,-16, 12,-19, 20, 14,-18,-22,-13,-15,-14, -3, 8,-21, -4,-15; D=-2; /I: MD=-15; DM=-15; /M: SY='L'; M= -5,-25,-18,-27,-18, 4,-26,-18, 16,-24, 33, 18,-24,-25,-15,-18,-22, -8, 9,-20, -3,-17; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -4, -4,-18, -3, 7,-13,-13, -3,-10, 1, -4, -3, -5,-11, 7, 2, -4, -5,-10,-17, -7, 6; D=-2; /I: I=-5; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15; /M: SY='E'; M= -5, 1,-19, 3, 7,-15, -9, -3,-15, 2,-11, -8, -1, -9, 2, 2, -2, -6,-12,-19, -8, 4; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='S'; M= -3, -3,-18, -3, 2,-16, -8, -8,-13, -1,-12, -7, -2, -8, 0, -1, 3, 2, -9,-22,-11, 0; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -2, 0,-16, 1, 4,-17, -7, -8,-15, -3,-13, -9, -2, -8, -2, -5, 1, -1,-10,-23,-13, 1; D=-2; /I: DM=-15; /M: M= -4, -5,-21, -4, -2,-14, -9, -9,-10, -7, -3, -4, -5, -8, -3, -6, -4, -5,-10,-23,-11, -3; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='S'; M= -3, 0,-19, 1, 1,-18,-12, -9,-13, -6,-11, -9, -1, -7, -2, -6, 2, 2,-11,-27,-13, -1; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='D'; M= -6, 4,-25, 6, 6,-25,-10, -7,-21, 0,-21,-14, 3, 0, 2, -3, 1, -4,-19,-29,-17, 3; /M: SY='E'; M= -2, 2,-24, 5, 16,-24,-11, -7,-22, 0,-19,-14, -2, 0, 4, -6, 1, -4,-19,-26,-17, 9; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-25, -1, 9,-24,-15, -4,-16, 0,-14, -7, -2, -8, 12, -1, 0, -4,-15,-26,-13, 10; /M: SY='R'; M= -7, -3,-23, -3, 1,-18,-17, -3,-16, 5,-13, -6, -2,-15, 6, 8, -4, -5,-13,-23, -8, 2; /M: SY='R'; M= -5, -2,-24, -2, 7,-23,-14, -4,-20, 8,-17, -8, 0,-12, 10, 11, 0, -4,-16,-25,-13, 7; /M: SY='E'; M=-10, -2,-27, -1, 8,-17,-18, -2,-16, 3,-12, -6, -3,-11, 7, 4, -6, -8,-16,-21, -5, 7; /M: SY='L'; M= -5,-17,-20,-20,-15, 6,-22,-11, 4,-18, 10, 3,-15,-22,-14,-16,-11, -5, 1,-13, 7,-15; /M: SY='L'; M= -2,-12,-20,-14, -6, -9,-21,-14, 0,-10, 3, 0,-12,-18, -7, -9, -7, -2, 1,-24, -8, -7; /M: SY='E'; M= -4, 4,-23, 4, 9,-22,-13, -2,-20, 1,-18,-12, 3, -9, 5, 0, 4, 3,-17,-28,-13, 7; /M: SY='I'; M= -4,-15,-20,-19,-13, -7,-22,-15, 6,-12, 2, 2,-11,-19, -9, -8, -3, 2, 6,-22, -6,-12; /M: SY='I'; M= 0,-19,-21,-25,-17, -6,-23,-18, 16,-17, 9, 10,-14,-18,-13,-18,-11, -6, 11,-23, -7,-17; /M: M= -5, -7,-20, -8, -4,-12,-19, -7, -8, -4, -4, -4, -6,-17, -5, -2, -7, -6, -6,-23, -7, -5; /M: SY='E'; M= -4, 4,-11, 4, 10,-24,-10, -4,-24, 0,-21,-15, 4,-14, 4, -1, 5, -3,-19,-31,-16, 6; /I: I=-6; MI=-5; MD=-15; IM=-5; /M: SY='E'; M= -5, 1,-16, 3, 16,-23,-12, -3,-21, 2,-17,-11, 0,-10, 11, 0, 2, -5,-18,-26,-14, 13; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='A'; M= 7,-12,-15,-16,-11,-10,-10,-14, 0,-13, -1, -1, -9,-16, -9,-13, 1, 1, 4,-23,-10,-11; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='D'; M=-11, 10,-26, 12, 12,-25,-13, -1,-23, 8,-20,-13, 7,-12, 9, 9, -1, -6,-21,-27,-13, 9; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='R'; M=-12, -4,-27, -4, 5,-23,-17, 2,-22, 12,-17, -8, 1,-16, 15, 29, -4, -6,-19,-22,-10, 8; /M: SY='L'; M= -4,-26,-15,-30,-22, 2,-26,-20, 20,-24, 26, 18,-24,-25,-18,-21,-19, -8, 14,-22, -4,-21; /M: SY='E'; M= -5, 2,-23, 1, 4,-20, -8, -5,-18, -1,-15,-10, 4,-14, 3, 2, 3, -2,-16,-28,-14, 3; /M: SY='K'; M= -5, 1,-24, 1, 4,-20,-12, -4,-21, 8,-17,-10, 2,-14, 5, 8, -1, -4,-17,-23,-10, 4; /M: SY='I'; M= -6,-26,-23,-30,-22, 1,-28,-20, 25,-24, 25, 17,-22,-24,-16,-20,-19, -8, 16,-20, -1,-20; /M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-32,-26, 5,-33,-24, 30,-25, 22, 15,-24,-25,-22,-22,-18, -5, 27,-21, -1,-26; /M: SY='D'; M= -7, 15,-25, 16, 11,-25, -5, -2,-27, 3,-24,-18, 14,-13, 4, 2, 5, -4,-23,-30,-15, 7; /M: SY='D'; M=-13, 19,-27, 26, 19,-30,-14, 3,-28, 4,-23,-17, 10,-11, 12, 2, 1, -6,-25,-31,-14, 15; /I: MD=-15; IM=-3; /M: SY='L'; M= -9,-26,-19,-29,-21, 11,-28,-18, 20,-23, 28, 18,-24,-25,-19,-18,-21, -7, 14,-15, 4,-20; D=-1; /I: I=-6; MI=-10; MD=-3; IM=-10; DM=-3; /M: SY='L'; M= -7,-18,-20,-19,-11, -2,-22,-15, 8,-17, 19, 7,-16,-21,-11,-10,-15, -6, 3,-21, -5,-12; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='D'; M=-10, 13,-25, 19, 11,-24,-13, 0,-24, -2,-18,-15, 5,-11, 4, -3, 1, -4,-19,-29,-12, 7; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= -9,-24,-21,-27,-19, 13,-26,-16, 10,-21, 23, 12,-22,-24,-16,-14,-20, -8, 6,-13, 5,-18; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='S'; M= 11, 0,-15, -2, 0,-20, -6,-11,-16, -6,-18,-13, 1,-11, -2, -9, 14, 6, -9,-29,-17, -1; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M=-10, -2,-26, -4, 2,-22,-15, -4,-25, 21,-22, -9, 3,-14, 7, 31, -2, -4,-17,-23,-12, 2; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='I'; M= -8,-16,-25,-19,-12, -6,-25,-14, 8,-12, 5, 6,-13,-12, -9,-11,-12, -6, 3,-22, -5,-13; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -9, 7,-27, 11, 15,-25, -9, -6,-22, 0,-17,-14, 2,-10, 5, 0, -1, -7,-19,-28,-17, 9; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= 0, 5,-17, 6, 8,-19, -9, -1,-15, -1,-13,-10, 4, -8, 5, -3, 3, -2,-13,-23,-12, 6; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='G'; M= -1, -4,-22, -4, -5,-20, 19,-11,-22, -7,-18,-12, 0, -8, -5, -7, 1, -8,-18,-18,-17, -5; D=-1; /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -5, 0,-11, -1, 1,-10, -9, -3,-12, 1,-10, -7, 0,-10, 1, 0, 0, -2,-10,-15, -3, 0; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= -3,-12,-12,-14,-10, 2,-12,-11, 4,-12, 8, 3, -9,-14,-10, -8, -6, -1, 3,-13, -2,-10; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -5, 0,-17, 2, 4,-14,-10, -5,-10, -2, -8, -6, -3, -6, 0, -3, -3, -3, -8,-19, -9, 2; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= -6,-18,-17,-19,-13, 2,-20,-14, 10,-17, 19, 10,-16,-13,-12,-13,-14, -4, 5,-16, -2,-13; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -6, 4,-24, 6, 15,-22,-17, -1,-19, 2,-16,-11, 1, -8, 8, -2, 1, -3,-17,-26,-11, 11; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='M'; M= -7,-14,-22,-18,-10, -8,-21,-10, -1, -5, 3, 8,-11,-15, -6, -3,-12, -6, -3,-19, -5, -9; /M: SY='E'; M= -4, -1,-24, 0, 9,-22,-14, -5,-18, 4,-15,-10, -2,-12, 6, 7, 0, -3,-14,-26,-13, 6; /M: SY='E'; M= -6, -4,-25, -1, 8,-21,-18, -8,-16, -3,-14, -8, -6, 7, 1, -6, -4, -4,-15,-25,-15, 3; /M: SY='F'; M= -6,-23,-14,-27,-20, 15,-26,-19, 9,-21, 10, 5,-20,-23,-21,-18,-13, -4, 11,-17, 1,-20; /M: SY='D'; M= -7, 11,-23, 15, 3,-24, -9, -8,-24, -5,-23,-18, 7, 3, -5, -9, 3, -3,-20,-31,-18, -2; /M: SY='L'; M= -7,-28,-20,-31,-22, 8,-29,-21, 22,-26, 32, 18,-26,-25,-20,-20,-22, -8, 16,-19, -1,-22; /M: SY='E'; M= -3, 3,-24, 2, 6,-23, -6, 3,-22, 0,-21,-13, 6, -9, 4, 0, 3, -4,-19,-28,-13, 4; /M: SY='E'; M= -3, 5,-25, 9, 14,-24,-14, -5,-21, 0,-19,-14, 1, 0, 6, -5, 4, -2,-19,-28,-15, 10; /M: SY='V'; M= -2,-26,-16,-28,-22, 3,-27,-23, 19,-22, 20, 11,-24,-26,-21,-20,-15, -2, 22,-21, -4,-22; /M: SY='L'; M= -6,-27,-18,-31,-24, 10,-28,-22, 20,-25, 24, 13,-24,-25,-22,-21,-19, -6, 17,-18, 0,-23; /M: SY='E'; M= -8, 5,-23, 6, 11,-24,-13, -3,-20, 4,-18,-11, 5,-12, 8, 5, 1, -3,-17,-29,-14, 8; /M: SY='E'; M= 0, 2,-23, 3, 10,-23,-11, -3,-21, 3,-18,-12, 1,-11, 5, 3, 3, -3,-16,-27,-14, 7; /M: SY='V'; M= 5,-21,-14,-25,-20, 2,-22,-20, 12,-20, 9, 5,-18,-22,-19,-19, -6, 0, 17,-22, -5,-20; /M: SY='V'; M= -3,-19,-19,-22,-15, -6,-24,-19, 9,-15, 4, 3,-17,-14,-14,-14, -8, -2, 10,-21, -7,-16; /M: SY='E'; M= -3, 2,-21, 2, 7,-22,-11, -5,-21, 4,-20,-12, 4,-11, 4, 6, 6, 0,-16,-27,-14, 5; /M: SY='L'; M= -4, -9,-23, -9, 1,-12,-20, -8, -4, -9, 2, 1, -9,-15, 2, -8, -7, -5, -7,-21, -7, 1; /M: SY='V'; M= -2,-22,-17,-26,-20, 5,-23,-15, 11,-19, 11, 8,-20,-24,-18,-16,-12, -5, 14,-18, 1,-20; /M: SY='R'; M= -5, -7,-23, -8, 0,-15,-14, -5,-13, 3, -9, -1, -4,-15, 4, 10, -3, -4,-11,-23, -8, 0; /M: M= -4, -7,-23, -6, -2,-14,-16,-10, -9, -8, -8, -5, -7, -5, -6, -9, -4, -3, -8,-25,-12, -5; /M: SY='L'; M= -6,-12,-24,-14, -6,-10,-16,-10, -4, -7, 1, 1,-11,-18, -4, -4,-10, -7, -4,-20, -5, -6; /M: SY='A'; M= 12,-11,-10,-16,-12, -7, -7,-15, -9,-15, -6, -7, -8,-17,-13,-16, 3, -1, -4,-22,-11,-12; /I: MD=-17; /M: SY='R'; M= -6, -1,-22, -2, 3,-18,-11, -4,-15, 4,-14, -8, 0, -8, 5, 7, -2, -5,-13,-22,-11, 3; D=-3; /I: I=-5; MI=-5; MD=-17; IM=-5; DM=-17; /M: SY='E'; M= -1, 4,-20, 3, 8,-21, 0, -4,-20, -1,-17,-12, 5, -9, 5, -2, 3, -3,-17,-22,-14, 6; D=-3; /I: DM=-17; /M: SY='K'; M= -7, -2,-24, -3, 4,-21,-16, -2,-23, 24,-21, -8, 0,-12, 8, 22, -5, -6,-17,-19, -8, 5; D=-3; /I: DM=-17; /M: SY='G'; M= -5, 3,-25, 1, 1,-26, 10, -6,-26, 1,-24,-13, 8,-11, 2, 0, 2, -8,-23,-25,-18, 1; D=-3; /I: DM=-17; /M: SY='I'; M= -5,-25,-20,-29,-23, 1,-29,-24, 25,-21, 16, 13,-22,-24,-19,-20,-15, -5, 24,-23, -4,-23; /M: SY='Q'; M= -6, 2,-24, 1, 8,-23,-16, -4,-17, 4,-17, -9, 2,-10, 11, 5, 1, -2,-16,-26,-13, 9; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-32,-23, 11,-31,-22, 24,-27, 29, 15,-25,-26,-22,-22,-21, -7, 17,-18, 2,-23; /M: SY='S'; M= -6, -1,-22, -1, 0,-17,-18, -5,-10, -4,-12, -8, -1,-13, -2, -1, 2, 2, -6,-29,-11, -2; /M: SY='L'; M= -7,-17,-15,-21,-16, 3,-24,-15, 4,-16, 6, 3,-14,-23,-15,-11,-11, -3, 5,-17, -1,-16; /M: SY='D'; M= -8, 11,-24, 14, 14,-24,-13, 0,-23, 2,-20,-15, 7,-10, 5, 0, 1, -4,-20,-30,-14, 9; /M: SY='L'; M= -7,-19,-19,-22,-17, -3,-16,-18, 3,-18, 5, 1,-16,-15,-16,-17,-12, -6, 0,-15, -3,-17; /M: SY='P'; M= -5, 1,-27, 5, 8,-26,-12, -9,-22, -2,-23,-16, -2, 15, 0, -8, 0, -5,-21,-28,-18, 3; /I: MD=-18; /M: SY='P'; M= -4, -2,-24, 1, 6,-20, -9, -9,-17, -3,-16,-12, -2, 9, -1, -6, 0, -4,-17,-25,-17, 1; D=-4; /I: I=-7; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='D'; M= -5, 5,-19, 8, 4,-19, -7, -4,-17, -1,-13, -8, 1, -8, 0, -3, 1, -2,-13,-23,-11, 2; D=-4; /I: DM=-18; /M: M= -6, -4,-22, -3, 0,-17,-14, -7,-14, -1,-10, -7, -4, -4, 0, -1, -3, -3,-13,-24,-12, -1; D=-4; /I: DM=-18; /M: SY='M'; M= -5,-13,-21,-14, -8,-12,-20,-13, -1,-12, -2, 1,-12, -4, -8,-13, -7, -4, -3,-24,-10, -9; /M: M= -5,-12,-21,-14, -6, -8,-20,-12, -5, -8, -4, -2,-11, -9, -6, -7, -6, 0, -4,-18, -6, -7; /M: SY='V'; M= 0,-24,-16,-28,-23, 1,-27,-24, 20,-21, 13, 8,-22,-23,-22,-20,-12, -3, 24,-24, -6,-23; /M: SY='Y'; M= -9, -9,-23,-10, -4, -4,-20, -5, -6, -7, -3, -2, -9,-16, -5, -6, -9, -5, -7,-15, 5, -6; /M: SY='G'; M= 4,-10,-21,-12,-13,-20, 21,-14,-20,-14,-15, -9, -5,-18,-12,-15, -2,-10,-13,-22,-18,-13; /M: SY='D'; M=-15, 27,-28, 35, 11,-28,-12, 0,-25, -2,-21,-18, 14,-12, 2, -6, -2, -9,-22,-33,-15, 6; /M: SY='P'; M= -3, -8,-28, -7, 4,-23,-11, -9,-20, 0,-20,-12, -6, 9, 5, 2, -2, -7,-20,-21,-15, 3; /M: SY='D'; M= -8, -1,-23, 1, -3,-16,-19,-11, -5, -8, -4, -4, -4,-14, -6, -8, -6, -4, -3,-28,-11, -6; /M: SY='R'; M= -9, -9,-27, -9, 1,-19,-19, -1,-17, 5,-10, -5, -6, -9, 7, 16, -8, -7,-16,-21, -9, 2; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-22, 10,-31,-21, 23,-28, 39, 19,-28,-28,-20,-21,-26, -9, 14,-19, 1,-21; /M: SY='Q'; M= -8, -7,-23, -8, 2,-14,-21, -4,-10, 2, -8, -1, -6,-16, 8, 3, -5, -4, -9,-21, -4, 4; /M: SY='Q'; M=-13, -3,-28, -3, 11,-27,-19, 16,-21, 8,-17, -3, 0,-14, 33, 16, -3,-10,-25,-21, -5, 20; /M: SY='V'; M= 3,-25,-16,-29,-24, -3,-25,-25, 23,-21, 14, 11,-23,-23,-21,-21,-11, -3, 27,-25, -8,-24; /M: SY='L'; M= -7,-28,-16,-32,-24, 11,-29,-22, 21,-27, 30, 16,-26,-28,-22,-21,-22, -8, 17,-19, -1,-23; /M: M= -1,-12,-21,-15, -9,-10,-13,-13, -7, -7, -4, -2, -7,-18, -4, -1, -3, -2, -5,-20, -9, -7; /M: SY='N'; M=-11, 35,-23, 23, 9,-23, -5, 8,-22, 1,-27,-20, 45,-16, 3, -1, 7, -3,-29,-38,-19, 6; /M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-29,-21, 12,-25,-21, 15,-26, 29, 12,-23,-26,-20,-20,-18, -7, 10,-18, 0,-20; /M: SY='L'; M= -8,-29,-17,-32,-25, 9,-31,-23, 24,-26, 28, 17,-26,-28,-22,-21,-21, -7, 22,-20, 0,-24; /M: SY='D'; M= -7, 5,-23, 7, 3,-19,-11, -8,-19, 0,-15,-11, 3,-15, 0, 0, 2, -1,-14,-28,-12, 1; /M: SY='N'; M=-10, 31,-19, 14, -2,-19, -4, 14,-18, -3,-26,-16, 49,-20, -1, -2, 8, -1,-25,-38,-16, -2; /M: SY='A'; M= 35,-10,-12,-18,-12,-20, 6,-19,-12,-12,-13,-10, -8,-12,-11,-19, 9, -1, -3,-22,-20,-12; /M: SY='I'; M= -3,-26,-15,-31,-24, 0,-30,-23, 25,-23, 16, 12,-22,-24,-20,-21,-15, -6, 23,-23, -5,-24; /M: SY='K'; M=-12, 6,-29, 9, 18,-28,-18, 0,-28, 23,-24,-13, 5,-10, 13, 22, -5, -9,-24,-25,-12, 15; /M: SY='Y'; M= -2,-15,-22,-20,-15, 16,-20, 10, -8,-14, -4, -3,-11,-21,-13,-13, -8, -6, -8, -2, 26,-15; /M: SY='T'; M= 8, -9, -8,-15,-11,-13,-12,-17, -8,-12,-10, -5, -6,-10,-10,-14, 10, 15, -1,-29,-14,-11; /M: SY='P'; M= -5, -4,-29, -1, 6,-25,-10, -9,-21, -2,-21,-14, -4, 18, -1, -7, -2, -6,-21,-28,-20, 0; /M: SY='E'; M= 2, 0,-21, 0, 10,-23,-10, -6,-20, -1,-19,-13, -1, -4, 3, -5, 5, -1,-15,-28,-17, 6; /I: MD=-14; /M: SY='G'; M= -2, -4,-18, -5, -4,-16, 11, -8,-18, -4,-16,-10, 0,-10, -4, -1, 2, -4,-13,-17,-13, -4; D=-3; /I: I=-6; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='D'; M= -6, 4,-15, 5, 5,-14, -7, 3,-13, 0,-12, -7, 3, -8, 3, 1, -1, -4,-12,-16, -7, 3; D=-3; /I: DM=-14; /M: SY='G'; M= -1, -8,-22, -8,-12,-20, 26,-15,-21,-12,-17,-11, -3,-12,-12,-10, -1, -9,-15,-20,-19,-13; D=-3; /I: DM=-14; /M: SY='T'; M= -5, -5,-18, -7, 0,-16,-17,-11,-15, -2,-16,-10, -4,-11, -1, -2, 1, 3,-11,-18,-11, -1; /M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-34,-28, 1,-34,-28, 37,-25, 18, 15,-25,-25,-24,-24,-17, -6, 35,-24, -4,-28; /M: SY='T'; M= -3, -3,-21, -3, 2,-17,-15, -9,-15, -1,-14,-10, -2,-14, -1, -1, 2, 3,-10,-23,-11, 0; /M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-26, 2,-32,-27, 32,-26, 23, 15,-25,-25,-23,-23,-18, -6, 29,-23, -4,-26; /M: SY='S'; M= -3, 0,-20, -1, 2,-20,-12, -2,-19, 1,-20,-12, 4,-13, 4, 5, 11, 6,-14,-28,-11, 2; /M: SY='A'; M= 10,-17,-13,-23,-17, -8,-15,-21, 4,-17, 3, 0,-16,-19,-15,-18, -3, 2, 8,-18,-10,-16; /M: SY='R'; M= -5, -6,-21, -7, 0,-13,-15, -5,-16, 1,-13, -8, -4,-16, 0, 5, -1, -2,-12,-18, -7, -1; /M: SY='R'; M= -7, -8,-24, -8, -2,-16,-20, -2,-12, 0,-10, -5, -6, -9, 1, 3, -6, -4,-11,-21, -6, -2; /M: SY='D'; M= -5, 8,-22, 10, 6,-23,-12, -5,-20, -2,-18,-14, 5,-10, 2, -3, 4, 2,-16,-30,-14, 3; /I: I=-2; MI=-20; MD=-20; IM=-20; /M: SY='D'; M= -5, 0,-23, 3, 2,-22, 3, -6,-22, -4,-17,-13, 0, -7, -3, -5, -1, -7,-18,-24,-15, -1; D=0; /I: DM=-15; /M: SY='D'; M= -6, 8,-23, 11, 3,-20, -5, -2,-18, -5,-15,-11, 4,-14, -3, -8, -2, -8,-14,-25,-12, 0; D=0; /I: DM=-15; /M: SY='H'; M= -9, -4,-23, -5, -2,-13,-13, 6,-17, -1,-13, -6, -1,-16, 0, 4, -6, -8,-15,-18, -2, -2; D=0; /I: DM=-15; /M: SY='L'; M= -2,-26,-18,-29,-22, 3,-26,-22, 19,-23, 20, 10,-23,-24,-21,-20,-16, -5, 19,-17, -2,-22; D=0; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M= -7, -9,-20,-10, 2,-13,-22, -5, -8, -3, -7, -3, -8,-16, 1, -1, -5, -3, -7,-21, -6, 0; /M: SY='I'; M=-10,-29,-20,-35,-27, 17,-33,-24, 27,-27, 24, 15,-24,-26,-25,-23,-20, -8, 21,-17, 4,-26; /M: SY='E'; M= -7, -3,-19, -3, 7,-18,-18, -8,-15, 2,-14, -9, -2,-14, 3, 6, 2, 1,-11,-27,-12, 4; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-34,-29, 3,-33,-28, 35,-24, 15, 15,-26,-26,-25,-23,-15, -5, 38,-24, -4,-29; /M: SY='E'; M= -3, -5,-22, -6, 7,-18,-18, -9,-15, 3,-14, -9, -4,-12, 4, 3, 1, 1,-12,-19,-10, 5; /M: SY='D'; M=-19, 43,-26, 58, 16,-36,-11, 9,-38, -2,-29,-26, 20,-12, 0, -9, -1,-10,-29,-39,-16, 7; /M: SY='B'; M= -9, 20,-21, 18, 4,-23,-10, -2,-23, -2,-24,-19, 20, -7, 0, -4, 8, 7,-21,-34,-16, 1; /M: SY='G'; M= 1,-10,-30,-10,-20,-29, 67,-20,-39,-19,-29,-19, 0,-20,-19,-19, 0,-19,-29,-20,-29,-20; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='P'; M= -2,-14,-20,-13, -6,-20,-13,-16, -9, -9,-15, -9,-11, 12, -8,-12, -3, -6, -9,-28,-18, -9; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-18,-30, 65,-19,-39,-19,-29,-19, 0,-18,-18,-19, 0,-19,-29,-20,-29,-19; /M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-36,-28, 7,-35,-26, 36,-27, 22, 18,-23,-24,-21,-25,-20, -9, 26,-17, 2,-27; /M: SY='P'; M= 1, -2,-26, 2, 2,-26,-10,-13,-20, -7,-25,-18, -2, 27, -5,-13, 4, -1,-20,-31,-23, -3; /M: SY='P'; M= -5, -4,-29, 1, 14,-25,-17, -8,-20, 1,-19,-14, -6, 19, 3, -4, -3, -7,-21,-28,-19, 7; /M: SY='E'; M= -6, 12,-26, 17, 25,-28,-12, -1,-27, 4,-21,-17, 5, -7, 10, -2, 2, -6,-24,-29,-16, 17; /M: SY='E'; M= -7, -1,-24, 0, 2,-18,-20, -7, -9, -1, -5, -3, -5,-16, 1, -3, -8, -7, -7,-26,-10, 1; /M: SY='L'; M= -6,-19,-21,-21,-11, -7,-25,-15, 9,-12, 13, 9,-17,-21, -5, -8,-15, -8, 6,-22, -6, -9; /M: SY='E'; M= -5, 1,-27, 4, 10,-26,-13, -6,-22, 5,-19,-13, 0, 2, 6, 2, -1, -6,-21,-28,-17, 7; /M: SY='R'; M= -9, 0,-26, 0, 9,-22,-17, 5,-22, 9,-17, -9, 2,-14, 12, 15, -2, -6,-19,-25, -9, 9; /I: MD=-15; /M: SY='I'; M= -7,-24,-21,-28,-20, 0,-28,-19, 23,-17, 20, 20,-20,-22,-14,-15,-19, -8, 17,-20, -3,-19; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='F'; M=-10,-23,-19,-31,-24, 48,-16,-16, -4,-23, 4, -2,-16,-24,-30,-18,-13, -8, -3, 2, 17,-24; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -9, 9,-25, 14, 18,-23,-14, -2,-20, 3,-16,-12, 4, -9, 8, -2, -1, -5,-18,-26,-12, 12; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='P'; M= -7, -9,-27, -6, 2,-20,-15, -9,-18, 3,-19,-12, -8, 24, -2, 5, -6, -7,-18,-21,-15, -3; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='F'; M=-14,-18,-18,-23,-18, 38,-18, -9, -4,-15, 2, 0,-12,-22,-21,-10,-13, -8, -4, 2, 19,-17; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='Y'; M= -9,-14,-19,-17,-15, 14,-16, -5, -1,-11, -2, -2,-11,-21,-13, -9, -9, -5, 0, -2, 17,-15; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M= -6, -4,-17, -7, -1,-15,-15, -6,-14, 5,-11, -6, -1,-12, 6, 15, 4, 8, -9,-21, -9, 2; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='T'; M= 1, -9,-14,-12, -9,-10, -5,-15, -4,-11, -5, -4, -7,-12, -9,-11, 3, 8, 1,-21,-11,-10; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='D'; M= -6, 8,-20, 12, 8,-22,-10, -3,-22, 10,-19,-13, 5, -8, 4, 8, 1, -3,-16,-23,-12, 6; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -1, 1,-19, 1, 6,-19, -8, -4,-18, 2,-18,-12, 2, 0, 2, 0, 5, 1,-15,-23,-13, 3; D=-1; /I: I=-5; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15; /M: SY='S'; M= 5, -1,-13, -3, -1,-17, -4,-10,-15, -5,-17,-12, 1, -5, -2, -7, 13, 9, -9,-25,-15, -2; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='R'; M= -3, 1,-17, 0, 5,-17, -8, -2,-18, 5,-15,-10, 3, -8, 4, 11, 3, -1,-13,-21,-11, 3; D=-1; /I: MD=-15; DM=-15; /M: SY='R'; M= -4, 3,-17, 4, 4,-16, -4, -3,-18, 3,-15,-10, 4, -9, 3, 6, 3, -2,-14,-19,-11, 3; D=-1; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M= -6, -2,-18, -2, 1,-12, -8, -3,-13, 2,-13, -7, -1, -7, 2, 3, -2, -3,-11,-11, -5, 1; D=-1; /I: I=-5; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15; /M: SY='S'; M= 0, -1,-18, -1, 1,-20, 4, -7,-19, -3,-19,-12, 2, -5, -1, -5, 7, 0,-15,-23,-15, -1; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -7,-26, -7,-12,-26, 48,-15,-33,-15,-25,-17, 0,-14,-13,-16, 1,-15,-25,-20,-25,-12; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='T'; M= -4, -5,-15, -8, -3, -9,-13,-11,-12, -6, -9, -6, -3,-14, -5, -2, 5, 11, -7,-24, -8, -4; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-19,-29, 65,-16,-39,-19,-30,-19, 0,-19,-18,-19, 1,-19,-30,-21,-28,-19; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-22, 11,-30,-18, 21,-26, 33, 18,-26,-28,-20,-20,-24, -9, 15,-17, 4,-22; /M: SY='G'; M= 1, -9,-29,-10,-19,-29, 64,-19,-38,-19,-29,-20, 0,-19,-19,-19, 2,-17,-28,-21,-29,-19; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-19, 20,-28, 46, 22,-29,-29,-18,-19,-28,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='A'; M= 13, -3,-17, -5, -5,-16, -8,-11,-13,-10,-14,-11, -2, -8, -7,-14, 10, 3, -8,-26,-14, -6; /M: SY='I'; M= -7,-27,-23,-33,-27, 1,-28,-26, 32,-25, 17, 15,-21,-24,-21,-24,-16, -7, 25,-21, -2,-26; /M: SY='V'; M= 5,-17, 7,-21,-19,-10,-18,-21, 2,-17, -6, -1,-14,-22,-17,-17, 4, 4, 14,-33,-15,-18; /M: SY='R'; M=-10, -5,-26, -6, 4,-23,-18, -1,-25, 24,-21, -8, -1,-15, 12, 32, -6, -8,-18,-21, -9, 6; /M: SY='R'; M= -8, 4,-25, 4, 12,-25,-12, -2,-25, 14,-22,-13, 6,-12, 9, 16, 1, -4,-21,-27,-14, 10; /M: SY='I'; M= -9,-22,-23,-27,-20, 0,-30,-17, 20,-19, 16, 11,-17,-23,-14,-13,-17, -8, 12,-20, 0,-19; /M: SY='V'; M= 5,-24,-14,-29,-24, -3,-26,-26, 23,-21, 12, 9,-22,-23,-21,-22,-10, -2, 26,-25, -8,-23; /M: SY='E'; M= -8, 5,-26, 7, 19,-26,-15, -2,-23, 10,-19,-12, 3,-11, 13, 9, 0, -6,-21,-27,-15, 15; /M: SY='A'; M= 1, -8,-21, -9, -3,-14,-15, -8, -9, -4, -1, -1, -7,-17, -1, -4, -6, -6, -8,-23, -8, -2; /M: SY='H'; M=-14,-14,-24,-18,-12, -2,-23, 32, -2,-15, 8, 19, -9,-23, -3, -9,-17,-13, -7,-21, 11, -9; /M: SY='G'; M= -4, 4,-27, 1, -3,-26, 23, -4,-30, -5,-26,-16, 12,-17, -1, -5, 1,-12,-27,-25,-20, -2; /I: I=-6; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= 2,-10,-29,-11,-19,-28, 62,-18,-37,-19,-28,-18, 0,-19,-19,-19, 0,-18,-28,-20,-28,-19; /M: SY='R'; M= -9, 5,-24, 6, 6,-21,-15, -2,-21, 4,-19,-12, 4,-12, 4, 7, 2, 2,-16,-25,-10, 4; /M: SY='I'; M= -8,-29,-20,-34,-27, 4,-33,-26, 33,-26, 25, 18,-25,-26,-22,-23,-20, -7, 27,-22, -2,-26; /M: SY='E'; M= -8, -1,-24, -1, 4,-18,-14, -2,-19, 0,-18,-11, 1,-14, 3, 3, 2, 1,-15,-18, -8, 3; /M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-29,-24, 8,-28,-17, 17,-22, 13, 8,-22,-26,-21,-20,-14, -6, 19,-17, 5,-24; /M: SY='E'; M= -5, 0,-24, 2, 8,-19,-14, -5,-17, -1,-13,-10, -2,-13, 2, -1, 0, -3,-13,-25,-12, 5; /M: SY='S'; M= 0, 4,-13, 2, 1,-21, -6, -6,-22, -2,-27,-17, 13,-12, 2, 3, 22, 11,-16,-35,-18, 1; /M: SY='E'; M= -5, 1,-24, 1, 11,-22,-13, -4,-21, 5,-18,-11, 1,-10, 6, 6, 1, -2,-17,-24,-13, 8; /M: SY='P'; M= -2, -9,-27, -7, 4,-20,-14,-11,-13, -7,-14,-10, -9, 13, -2,-12, -3, -6,-15,-26,-16, -1; /M: SY='G'; M= -4, -3,-28, -2, -4,-26, 30,-12,-31, -9,-24,-17, 2,-13, -8, -9, 0,-13,-26,-22,-22, -6; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M= -7, -7,-25, -6, 0,-20, -1, -6,-20, 5,-17, -8, -3,-12, 1, 6, -5, -8,-15,-19,-12, -1; D=-3; /I: I=-7; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -8,-25, -9,-16,-21, 48,-16,-31,-16,-24,-16, -1,-18,-17,-16, 0,-13,-24,-16,-20,-17; D=-3; /I: DM=-15; /M: SY='T'; M= 5, -9, -9,-17,-13, 0,-16,-19, -7,-15, -6, -8, -6,-16,-15,-15, 11, 22, 1,-24, -7,-13; /M: SY='T'; M= -7, -9,-12,-12, -6,-11,-22,-15, -7, -6, -6, -5, -8,-17, -6, -2, -1, 7, -2,-26,-10, -7; /M: SY='F'; M= -8,-28,-19,-36,-28, 38,-29,-23, 15,-26, 12, 6,-21,-26,-30,-22,-16, -7, 15, -7, 12,-28; /M: SY='T'; M= -6, -7,-18,-10, -6,-14,-18, -9,-11, -2,-13, -7, -4,-16, -3, 3, 3, 8, -6,-20, -7, -5; /M: SY='I'; M= -5,-29,-19,-34,-27, 10,-31,-26, 28,-25, 19, 13,-24,-26,-25,-23,-17, -6, 26,-20, 0,-27; /M: SY='E'; M= -6, -4,-22, -4, 6,-15,-18, -6,-15, 0,-13,-10, -3,-14, 2, 1, 1, 2,-12,-19, -5, 3; /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-23, 15,-31,-22, 20,-29, 38, 16,-28,-29,-22,-21,-27,-10, 11,-11, 4,-22; /M: SY='P'; M= -5,-15,-34,-10, -1,-27,-17,-14,-19, -4,-25,-16,-14, 54, -6,-11, -7, -9,-24,-28,-24, -7; /M: SY='L'; M= -2,-20,-20,-22,-14, -6,-22,-15, 6,-13, 9, 7,-18,-17,-11,-11,-12, -5, 7,-22, -7,-13; /M: SY='T'; M= 3, -5,-19, -7, -3,-16,-13,-11,-13, -5,-13, -9, -4, -7, -5, -6, 3, 4, -8,-25,-11, -5; /M: M= -7, -8,-25, -8, -3,-15,-17, -3,-11, -4, -6, -3, -7, -5, -1, -2, -6, -4,-11,-24, -8, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 568 in 564 different sequences |
Number of true positive hits | 568 in 564 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 66 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 89.59 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 2 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Histidine kinase |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
564 sequences
AFSQ2_STRCO (Q04943), AHK1_ARATH (Q9SXL4), AHK2_ARATH (Q9C5U2), AHK3_ARATH (Q9C5U1), AHK4_ARATH (Q9C5U0), AHK5_ARATH (Q3S4A7), ARCB_ECO57 (P58363), ARCB_ECOLI (P0AEC3), ARCB_HAEIN (P44578), ARCB_SHIFL (P0AEC4), ARLS_STAA3 (Q2FH24), ARLS_STAA8 (Q9KJN3), ARLS_STAAB (Q2YY04), ARLS_STAAC (Q5HG05), ARLS_STAAM (Q7A2R7), ARLS_STAAN (Q7A5N3), ARLS_STAAR (Q6GGZ4), ARLS_STAAS (Q6G9E7), ARLS_STAAW (Q7A0W5), ARLS_STAEQ (Q5HPC4), ARLS_STAES (Q8CSL7), ARLS_STAHJ (Q4L6C5), ARLS_STAS1 (Q49XM6), ARSS_HELPY (O24972), ARUS_PSEAE (Q9HUI3), ATOS_ECOLI (Q06067), ATSR_BURTA (Q2T0V9), BAES_ECOLI (P30847), BARA_ECO57 (P0AEC7), BARA_ECOL6 (P0AEC6), BARA_ECOLI (P0AEC5), BARA_SHIFL (P59342), BASS_ECOLI (P30844), BASS_SALTY (P36557), BCES_BACSU (O35044), BCES_HALH5 (Q9K620), BCKD_BOVIN (Q2KJG8), BCKD_HUMAN (O14874), BCKD_MOUSE (O55028), BCKD_RAT(Q00972), BPHY_DEIRA (Q9RZA4), BPHY_PSEAE (Q9HWR3), BVGS_BORBR (P26762), BVGS_BORPA (P40330), BVGS_BORPE (P16575), CARS_PSEAE (Q9I0I2), CCKA_BRUA2 (P0DOA0), CHEAY_HELPY (O25153), CHEA_BACSU (P29072), CHEA_BORBU (Q44737), CHEA_CERSP (Q53135), CHEA_ECOLI (P07363), CHEA_HALS3 (B0R4J9), CHEA_KLEAK (P21813), CHEA_LISIN (Q92DW2), CHEA_LISMO (Q48768), CHEA_RHIME (Q52880), CHEA_SALTY (P09384), CHEA_THEMA (Q56310), CHEA_TREPA (P96123), CHK1_CANAL (Q5AHA0), CHVG_AGRFC (Q07737), CHVG_RHIME (P72292), CIAH_STRPN (P0A4I5), CIAH_STRR6 (P0A4I6), CIKA_SYNE7 (Q9KHI5), CIKA_SYNY3 (P74111), CIKA_THEVB (Q8DKG0), CITA_KLEPN (P52687), CITS_BACSU (O34427), CITS_HALH5 (Q9RC53), CKI1_ARATH (O22267), COMP_BACSU (Q99027), COPS_PSEUB (Q02541), CPXA_ECO57 (P0AE84), CPXA_ECOL6 (P0AE83), CPXA_ECOLI (P0AE82), CPXA_KLEPH (A0A0H3GPN8), CQSS_VIBC1 (A7N6S2), CQSS_VIBCH (Q9KM66), CRDS_HELPY (O25917), CREC_ECOLI (P08401), CSEC_STRAW (Q82EB2), CSEC_STRCO (Q9ZEP3), CSSS_BACSU (O32193), CUSS_ECO57 (Q8XBY4), CUSS_ECOL6 (Q8FK37), CUSS_ECOLI (P77485), CUTS_STRCO (P0A4I7), CUTS_STRLI (P0A4I8), CYAD_DICDI (Q55F68), CZCS_CUPMC (Q44007), DCTB_PSEAE (Q9HU20), DCTB_RHILE (P10047), DCTB_RHIME (P13633), DCTS_BACSU (P96601), DCTS_HALH5 (Q9K997), DCTS_RHOCA (P37739), DCUS_ECO57 (P0AEC9), DCUS_ECOL6 (P59340), DCUS_ECOLI (P0AEC8), DCUS_SHIFL (P59341), DEGM_BACB2 (Q03069), DEGS_BACSU (P13799), DEGS_BREBE (P54663), DEVS_MYCTO (P9WGK2), DEVS_MYCTU (P9WGK3), DHKA_DICDI (Q54U87), DHKB_DICDI (Q54YH4), DHKC_DICDI (Q95PI2), DHKD_DICDI (Q54SP4), DHKE_DICDI (Q55E44), DHKF_DICDI (Q551X9), DHKG_DICDI (Q54Q69), DHKH_DICDI (Q54W36), DHKI_DICDI (Q86AT9), DHKJ_DICDI (Q54YZ9), DHKK_DICDI (Q86CZ2), DHKL_DICDI (Q54RP6), DHKM_DICDI (Q54SK5), DIVJ_CAUVC (Q03228), DIVL_CAUVC (Q9RQQ9), DLTS_STRA3 (Q8E3C7), DLTS_STRA5 (Q8DXQ8), DOKA_DICDI (Q869S5), DPIB_ECOLI (P77510), DSPA_SYNY3 (P20169), ENVZ_ECOLI (P0AEJ4), ENVZ_SALTI (P41406), ENVZ_SALTS (A0A0H3NIL4), ENVZ_SALTY (P08982), ENVZ_SHIFL (P0AEJ5), ENVZ_SHIFM (A0A4P7TSF2), ERS1_ARATH (Q38846), ERS1_ORYSI (A2XL32), ERS1_ORYSJ (Q53RH0), ERS2_ORYSI (B8AY75), ERS2_ORYSJ (Q0DKM0), ETR1_ARATH (P49333), ETR1_BRAOL (O49230), ETR1_CUCMN (O82436), ETR1_CUCSA (Q9SSY6), ETR1_MALDO (O81122), ETR1_PASED (Q9ZWL6), ETR1_PELHO (Q9XH58), ETR1_PRUPE (Q9M7M1), ETR1_SOLLC (Q41342), ETR1_TOBAC (O48929), ETR2_ORYSI (Q8H1X1), ETR2_ORYSJ (Q7XX84), ETR2_PELHO (Q9XH57), ETR2_SOLLC (O49187), ETR3_ORYSI (Q6T5K2), ETR3_ORYSJ (Q0DWC7), EVGS_ECO57 (P58402), EVGS_ECOLI (P30855), FILI_METH6 (E5KK10), FIXL_AZOC5 (P26489), FIXL_BRADU (P23222), FIXL_RHIME (P10955), FLES_PSEAE (Q9I4N4), FLGS_HELPY (O25026), FRZE_MYXXA (P18769), GACS_PSEPH (Q9F8D7), GACS_PSESY (P48027), GCHK_ANADF (A7HD43), GLNK_BACSU (P40758), GLRK_ECOLI (P52101), GRAS_STAA1 (A7WZC5), GRAS_STAA2 (A6TZD7), GRAS_STAA3 (Q2FIX9), GRAS_STAA8 (Q2G0D9), GRAS_STAA9 (A5IQL3), GRAS_STAAB (Q2YSS1), GRAS_STAAC (Q5HI08), GRAS_STAAE (A6QEW9), GRAS_STAAM (Q99VW1), GRAS_STAAN (Q7A6Z3), GRAS_STAAR (Q6GJ10), GRAS_STAAS (Q6GBH0), GRAS_STAAT (A8Z182), GRAS_STAAW (Q8NXR5), GRAS_STAEQ (Q5HR80), GRAS_STAES (Q8CTL4), GRAS_STAHJ (Q4L482), GRAS_STAS1 (Q49VK4), GTCS_ANEMI (Q44930), GTRS_PSEAE (Q9HZ47), HIK2_SYNY3 (P73276), HIK2_THEVB (Q8DMC5), HIK34_SYNY3 (P74199), HK06_STRP2 (A0A0H2ZM62), HK06_STRR6 (Q8DN03), HK12_MYCTO (Q7D9K1), HK1_MYCTU (O07778), HPRS_ECOLI (P76339), HSSS_STAA1 (A7X5Y6), HSSS_STAA2 (A6U489), HSSS_STAA3 (Q2FED4), HSSS_STAA8 (Q2FVQ8), HSSS_STAA9 (A5IVE3), HSSS_STAAB (Q2YZ23), HSSS_STAAC (Q5HDJ3), HSSS_STAAE (A6QJK4), HSSS_STAAM (Q99RR5), HSSS_STAAN (Q7A3X0), HSSS_STAAR (Q6GE72), HSSS_STAAS (Q6G6V8), HSSS_STAAT (A8Z553), HSSS_STAAW (Q8NV46), HSSS_STAEQ (Q5HLN1), HSSS_STAES (Q8CRA8), HSSS_STAHJ (Q4L8M0), HSSS_STAS1 (Q49ZT9), IRLS_BURP2 (I1WSZ3), IRLS_BURPS (P0DMK6), KDPD_CLOAB (P94608), KDPD_ECOLI (P21865), KDPD_MYCTO (P9WGL2), KDPD_MYCTU (P9WGL3), KDPD_RATRA (O34971), KDPD_STAA8 (Q2FWH7), KINA_BACSU (P16497), KINB_BACSU (Q08430), KINB_PSEAI (O34206), KINC_BACSU (P39764), KIND_BACSU (O31671), KINE_BACSU (O31661), LIAS_BACSU (O32198), LOVHK_PSE14 (Q48IV1), LOVHK_PSESM (Q881J7), LOVHK_PSEU2 (Q4ZSY3), LUXN_VIBC1 (A7MRY4), LUXN_VIBHA (P0C5S6), LUXQ_VIBCH (Q9KLK7), LUXQ_VIBHA (P54302), LUXQ_VIBPA (Q87GU5), LUXQ_VIBVU (Q8D5Z6), LUXQ_VIBVY (Q7MD16), LVHK2_ERYLH (Q2NB77), LYTS_BACAN (Q81JL2), LYTS_BACCR (Q814J0), LYTS_BACSU (P94513), MAK1_SCHPO (Q9P7Q7), MAK2_SCHPO (O14002), MAK3_SCHPO (O74539), MALK_BACSU (O05250), MPRB_MYCA1 (A0QBR0), MPRB_MYCBO (Q7U0X3), MPRB_MYCBP (A1KHB8), MPRB_MYCLE (Q9Z5G7), MPRB_MYCPA (Q742C0), MPRB_MYCS2 (A0R3I7), MPRB_MYCSJ (A3Q5L8), MPRB_MYCSK (A1UL69), MPRB_MYCSS (Q1B3X9), MPRB_MYCTA (A5U124), MPRB_MYCTO (P9WGL0), MPRB_MYCTU (P9WGL1), MPRB_MYCUA (A0PWB3), MPRB_MYCVP (A1TEL6), MSMS_METAC (Q8THF6), MTRB_MYCBO (P59963), MTRB_MYCLE (Q9CCJ1), MTRB_MYCPA (Q93CB7), MTRB_MYCS2 (A0QTK3), MTRB_MYCTO (P9WGK8), MTRB_MYCTU (P9WGK9), NARQ_ECOLI (P27896), NARQ_HAEIN (P44604), NARS_MYCTU (O53857), NARX_ECO57 (P0AFA3), NARX_ECOLI (P0AFA2), NARX_SHIFL (P0AFA4), NIFL_AZOVI (P30663), NIK1_CANAL (Q5A599), NISK_LACLL (P42707), NODV_BRADU (P15939), NREB_STAA1 (A7X624), NREB_STAA2 (A6U4C1), NREB_STAA3 (Q2FEA5), NREB_STAA8 (Q2FVM6), NREB_STAA9 (A5IVH3), NREB_STAAB (Q2YZ41), NREB_STAAC (Q5HDG4), NREB_STAAE (A6QJN2), NREB_STAAM (Q931F6), NREB_STAAN (Q99RN7), NREB_STAAR (Q6GE41), NREB_STAAS (Q6G6S9), NREB_STAAT (A8Z581), NREB_STAAW (Q7A028), NREB_STACT (Q7WZY5), NREB_STAEQ (Q5HLK5), NREB_STAES (Q8CR97), NREB_STAHJ (Q4L8Q7), NTRB_AZOBR (P45670), NTRB_BRASR (P10578), NTRB_ECO57 (P0AFB6), NTRB_ECOLI (P0AFB5), NTRB_KLEOX (P06218), NTRB_PROHU (P28788), NTRB_RHILP (P41503), NTRB_RHIME (Q52977), NTRB_RHOCB (P09431), NTRB_SALTI (P0A2E0), NTRB_SALTY (P0A2D9), NTRB_SHIFL (P0AFB7), NTRB_VIBAL (P19906), NTRYL_RICBR (Q1RJB3), NTRYL_RICCN (Q92H24), NTRYL_RICFE (Q4UMD4), NTRYL_RICPR (Q9ZCU7), NTRYL_RICTY (Q68WC5), NTRY_AZOBR (P45675), NTRY_AZOC5 (Q04850), OHK1_ORYSI (A2YFR6), OHK1_ORYSJ (A3BE68), OHK2_ORYSI (A2YA15), OHK2_ORYSJ (Q5SML4), OHK3_ORYSI (A2WYI4), OHK3_ORYSJ (A1A696), OHK4_ORYSJ (A1A698), OHK5_ORYSJ (A1A697), OHK6_ORYSJ (A1A699), PCOS_ECOLX (Q47457), PDHK2_CAEEL (Q02332), PDHS_BRUA1 (B2S758), PDHS_BRUA2 (Q2YRB4), PDHS_BRUA4 (A6X5X4), PDHS_BRUAB (Q57BR6), PDHS_BRUC2 (A9M715), PDHS_BRUME (Q8YIM6), PDHS_BRUO2 (A5VRX4), PDHS_BRUSI (B0CI82), PDHS_BRUSU (Q8FZ86), PDK1_HUMAN (Q15118), PDK1_MOUSE (Q8BFP9), PDK1_RAT(Q63065), PDK1_YEAST (P40530), PDK2_HUMAN (Q15119), PDK2_MOUSE (Q9JK42), PDK2_RAT(Q64536), PDK3_HUMAN (Q15120), PDK3_MOUSE (Q922H2), PDK4_HUMAN (Q16654), PDK4_ICTTR (O88345), PDK4_MOUSE (O70571), PDK4_RAT(O54937), PDK4_RHIFE (Q1KMR4), PDK_ARATH (Q9SBJ1), PDK_ASCSU (O02623), PDK_DROME (P91622), PDK_SCHPO (Q9P6P9), PDTAS_MYCS2 (A0QTP6), PDTAS_MYCTO (P9WGL4), PDTAS_MYCTU (P9WGL5), PFES_PSEAE (Q04804), PGTB_SALTY (P37433), PHOQ_ECO57 (Q8X739), PHOQ_ECOL6 (Q8FIB8), PHOQ_ECOLI (P23837), PHOQ_PSEAE (Q9I4F8), PHOQ_SALCH (Q57QC4), PHOQ_SALPA (Q5PMJ0), PHOQ_SALT1 (D0ZV89), PHOQ_SALTI (Q8Z7H3), PHOQ_SALTS (E1WFA0), PHOQ_SALTU (F5ZP94), PHOQ_SALTY (P0DM80), PHOQ_SHIFL (Q83RR1), PHOR_BACSU (P23545), PHOR_ECOLI (P08400), PHOR_HAEIN (P71380), PHOR_KLEPN (P45608), PHOR_PSEAE (P23621), PHOR_SHIDY (P45609), PHY1_PHYPA (P36505), PHY1_SELMA (Q01549), PHY1_SYNY3 (Q55168), PHY2_CERPU (Q39557), PHYA1_MAIZE (P19862), PHYA1_TOBAC (P33530), PHYA2_SOYBN (B4YB07), PHYA3_AVESA (P06593), PHYA4_AVESA (P06594), PHYA_ARATH (P14712), PHYA_CUCPE (P06592), PHYA_LATSA (P93673), PHYA_NOSS1 (Q9LCC2), PHYA_ORYSI (A2XLG5), PHYA_ORYSJ (Q10DU0), PHYA_PEA(P15001), PHYA_PETCR (P55141), PHYA_POPTM (O49934), PHYA_SOLTU (P30733), PHYA_SORBI (P93526), PHYA_SOYBN (P42500), PHYB1_SOLLC (Q9ZS62), PHYB2_SOYBN (I1MGE5), PHYB_ARATH (P14713), PHYB_NOSS1 (Q9R6X3), PHYB_ORYSI (A2XFW2), PHYB_ORYSJ (Q10MG9), PHYB_SOLTU (P34094), PHYB_SORBI (P93527), PHYB_SOYBN (P42499), PHYB_TOBAC (P29130), PHYC_ARATH (P14714), PHYC_ORYSI (A2XM23), PHYC_ORYSJ (Q10CQ8), PHYC_SORBI (P93528), PHYD_ARATH (P42497), PHYE_ARATH (P42498), PHYE_IPONI (P55004), PHY_ADICA (P42496), PHY_MOUSC (P33529), PHY_PICAB (Q40762), PHY_PINSY (Q41046), PILS_PSEAE (P33639), PLEC_CAUVC (P37894), PLH4_FORAG (T2KMF4), PMRB_PECPM (Q70FG9), PMRB_PSEAE (Q9HV31), PPRA_PSEAE (Q9HWA7), PRRB_MYCBO (P0A5Z9), PRRB_MYCLE (O33071), PRRB_MYCTO (P9WGK6), PRRB_MYCTU (P9WGK7), QSEC_ECO57 (Q8X524), QSEC_ECOLI (P40719), QSEC_HAEIN (P45336), QSEC_SALTI (Q8Z3P2), QSEC_SALTY (Q8ZLZ9), QSEE_ECO57 (Q8XA47), RCSC_ECOLI (P0DMC5), RCSC_ECOLX (P0DMC6), RCSC_SALTI (Q56128), RCSC_SALTY (P58662), RCSD_ECOLI (P39838), REGB_CERS4 (Q3J6C1), REGB_CERSP (P0C0Z0), RESE_BACSU (P35164), RPFC_XANC8 (P0C0F7), RPFC_XANCP (P0C0F6), RPPB_SYNY3 (Q55932), RPRX_BACFR (Q08408), RSSA_SERMA (Q8GP19), RSTB_ECOLI (P18392), SAES_STAA3 (Q2FIT5), SAES_STAA8 (Q2G2U1), SAES_STAAB (Q2YSM6), SAES_STAAC (Q5HHW5), SAES_STAAE (Q840P7), SAES_STAAM (Q99VR8), SAES_STAAN (Q7A6V4), SAES_STAAR (Q6GIT7), SAES_STAAS (Q6GBC5), SAES_STAAW (Q7A1J2), SAES_STAEQ (Q5HR29), SAES_STAES (Q8CTI3), SASA_CROS5 (B1WYT4), SASA_GLOC7 (B7KFU0), SASA_MICAN (B0JK50), SASA_NOSP7 (B2J946), SASA_NOSS1 (Q8YR50), SASA_PARMW (Q7U871), SASA_PROM0 (A3PDI2), SASA_PROM2 (A8G5E7), SASA_PROM3 (A2C884), SASA_PROM9 (Q31AE8), SASA_PROMA (Q7BWI3), SASA_PROMM (Q7V6P7), SASA_PROMP (Q7V113), SASA_PROMS (A2BRQ6), SASA_RIPO1 (B7K3M6), SASA_SYNE7 (Q06904), SASA_SYNJA (Q2JWK9), SASA_SYNJB (Q2JKD9), SASA_SYNS3 (Q0IBF4), SASA_SYNS9 (Q3AYV8), SASA_SYNY3 (Q55630), SASA_THEVB (Q8DMT2), SASA_TRIV2 (Q3M8A7), SENX3_MYCBO (P0A601), SENX3_MYCLE (P54883), SENX3_MYCS2 (A0QR01), SENX3_MYCTO (P9WGK4), SENX3_MYCTU (P9WGK5), SILS_SALTM (Q9ZHD4), SLN1_CANAL (Q5A872), SLN1_YEAST (P39928), SPAK_BACIU (P33113), SPHS_SYNE7 (P39664), SPIR_SALTY (Q8ZPP5), SRRB_STAA8 (Q2FY80), SRRB_STAAC (Q5HFT1), SRRB_STAAM (Q99TZ9), SRRB_STAAN (Q7A5H7), SRRB_STAAR (Q6GGK7), SRRB_STAAS (Q6G973), SRRB_STAAU (Q9L523), SRRB_STAAW (Q8NWF3), TCRY_MYCTU (O69729), TCSA_EMENI (Q9P896), TCSB_EMENI (Q9P4U6), TDIS_THAAR (O87939), TMOS_PSEME (Q8KIY1), TODS_PSEP1 (A5W4E3), TODS_PSEPT (E0X9C7), TORS_ECO57 (P58356), TORS_ECOLI (P39453), TRCS_MYCTU (P96368), TTRS_SALTY (Q8ZPP6), UHPB_ECOLI (P09835), UHPB_SALTY (P27668), VANS_ENTFA (Q47745), VANS_ENTFC (Q06240), VIRAL_RHIRD (P07167), VIRAW_RHIRD (P07168), VIRA_AGRFC (P18540), VIRA_AGRT9 (P10799), VXRA_VIBCH (Q9KM24), WALK_BACSU (Q45614), WALK_MAMSC (A5A2P0), WALK_STAA1 (A7WWQ7), WALK_STAA2 (A6TXG9), WALK_STAA3 (Q2FKN7), WALK_STAA8 (Q2G2U4), WALK_STAA9 (A5INR0), WALK_STAAB (Q2YUQ2), WALK_STAAC (Q5HJX6), WALK_STAAE (A6QD58), WALK_STAAM (Q7A305), WALK_STAAN (Q7A8E0), WALK_STAAR (Q6GKS6), WALK_STAAS (Q6GD71), WALK_STAAT (A8YYU2), WALK_STAAU (Q9RDT3), WALK_STAAW (Q7A215), WALK_STAEQ (Q5HK19), WALK_STAES (Q8CU87), WALK_STAHJ (Q4LAJ8), WALK_STAS1 (Q4A159), WALK_STRP2 (A0A0H2ZNH9), WALK_STRR6 (Q8DPL8), Y1002_RHIME (Q52969), Y3689_SHEFN (Q02482), Y899_CHLAA (Q45827), YBDK_BACSU (O31433), YCBM_BACSU (P42245), YCF26_NEOYE (Q1XD95), YCF26_PORPU (P51392), YCLK_BACSU (P94414), YESM_BACSU (O31516), YKOH_BACSU (O34638), YVCQ_BACSU (O06979), YVRG_BACSU (O34989), YXDK_BACSU (P42422), ZRAS_ECO57 (Q8X614), ZRAS_ECOLI (P14377), ZRAS_KLEOX (Q9APE0), ZRAS_SALTI (Q8Z332), ZRAS_SALTY (P37461)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
66 sequences
BTSS_ECOL6 (P0AD15), BTSS_ECOLI (P0AD14), BTSS_SHIFL (P0AD16), CSK_ARATH (F4HVG8), CSK_PHATC (B7GDS0), DESK_BACSU (O34757), DOST_MYCTO (P9WGK0), DOST_MYCTU (P9WGK1), EIN4_ARATH (Q9ZTP3), ERS2_ARATH (P93825), ETR2_ARATH (Q0WPQ2), ETR4_ORYSI (Q6T5K3), ETR4_ORYSJ (Q7F239), HK2_MYCTU (O07777), HPTS_STAA3 (Q2FK46), HPTS_STAA8 (Q2G1E0), HPTS_STAAB (Q2YV55), HPTS_STAAC (Q5HJF6), HPTS_STAAM (Q99WZ9), HPTS_STAAN (Q7A7X8), HPTS_STAAR (Q6GK92), HPTS_STAAS (Q6GCQ2), HPTS_STAAW (Q8NYJ8), LNRJ_BACSU (P94438), LYTS_ENTFA (Q82Z75), LYTS_OCEIH (Q8EQQ2), LYTS_STAA3 (Q2FK10), LYTS_STAA8 (Q53705), LYTS_STAAB (Q2YV68), LYTS_STAAC (Q5HJB6), LYTS_STAAM (P60612), LYTS_STAAN (P60613), LYTS_STAAR (Q6GK52), LYTS_STAAS (Q6GCL2), LYTS_STAAW (P60614), LYTS_STAEQ (Q5HLG3), LYTS_STAES (Q8CR79), LYTS_STAHJ (Q4L8V3), LYTS_STAS1 (Q4A009), LYTS_STRA3 (Q8E7H4), LYTS_STRA5 (Q8E218), LYTS_STRMU (Q8DVB6), MCTS_RHIJ3 (Q1M799), NATK_BACSU (P70954), PDK2_YEAST (P53170), PM2P1_HUMAN (A4D2B8), VRAS_STAA1 (Q9KWK8), VRAS_STAAC (Q5HEN9), VRAS_STAAM (Q7A2Q0), VRAS_STAAN (Q99SZ7), VRAS_STAAR (Q6GFH2), VRAS_STAAS (Q6G849), VRAS_STAAW (Q7A0H9), VRAS_STAEQ (Q5HN49), VRAS_STAES (Q8CRV2), VRAS_STAHJ (Q4L7J6), VRAS_STAS1 (Q49YT0), Y166_STAES (Q8CU03), Y2405_STAEQ (Q5HKE1), YDFH_BACSU (P96685), YHCY_BACSU (O07527), YPDA_ECO57 (P0AA94), YPDA_ECOLI (P0AA93), YRKQ_BACSU (P54444), YVFT_BACSU (Q795K2), YXJM_BACSU (P55183)» more |
PDB [Detailed view] |
168 PDB
1B3Q; 1BXD; 1GJV; 1GKX; 1GKZ; 1I58; 1I59; 1I5A; 1I5B; 1I5C; 1I5D; 1ID0; 1JM6; 1JOY; 1R62; 1Y8N; 1Y8O; 1Y8P; 1YS3; 1YSR; 2BTZ; 2BU2; 2BU5; 2BU6; 2BU7; 2BU8; 2CH4; 2E0A; 2LFR; 2LFS; 2PNR; 2Q8F; 2Q8G; 2Q8H; 2Q8I; 2ZDX; 2ZDY; 2ZKJ; 3CGY; 3CGZ; 3CRK; 3CRL; 3D2R; 3EHF; 3EHG; 3EHH; 3EHJ; 3GIE; 3GIF; 3GIG; 3JA6; 3JZ3; 3SL2; 3TZ0; 3TZ2; 3TZ4; 3TZ5; 3UR1; 3VAD; 3ZCC; 3ZRV; 3ZRW; 3ZRX; 3ZXO; 3ZXQ; 4BIU; 4BIV; 4BIW; 4BIX; 4BIY; 4BIZ; 4CB0; 4CTI; 4DZY; 4E00; 4E01; 4E02; 4GCZ; 4GT8; 4H7Q; 4H81; 4H85; 4JPB; 4KP4; 4MP2; 4MP7; 4MPC; 4MPE; 4MPN; 4MT8; 4MTX; 4PL9; 4Q20; 4R39; 4R3A; 4V25; 4V26; 4XIV; 5B1N; 5B1O; 5IUJ; 5IUK; 5IUL; 5IUM; 5J6A; 5J71; 5LFK; 5M4K; 5M4M; 5M4N; 5M4P; 6LGQ; 6LIL; 6LIN; 6LIO; 6MI6; 6PAJ; 6S1K; 6TMP; 6TMQ; 6TMZ; 6TN0; 6TN2; 7EA0; 7EAS; 7EAT; 7EBB; 7EBG; 7EBH; 7RZW; 7SSI; 7SSJ; 7VBU; 7VBV; 7VBX; 8A3U; 8A52; 8A6X; 8A7F; 8A7H; 8AVV; 8AVW; 8AVX; 8C5V; 8DVQ; 8DWZ; 8EGD; 8EGF; 8EGQ; 8EGU; 8F4Q; 8F5F; 8F5J; 8F5S; 8F5Z; 8G3A; 8G3B; 8G3F; 8G3L; 8G4C; 8G4D; 8IFF; 8ISI; 8ISJ; 8SBM; 8SGK; 8ZM1; 8ZM2 » more |