Home  |  Contact
Entry: PS50139

General information about the entry

Entry name [info] Z_BINDING
Accession [info] PS50139
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2001 CREATED;
17-JUN-2020 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50139
Associated ProRule [info] PRU00073

Name and characterization of the entry

Description [info] Z-binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4455511; R2=0.0132900; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=456; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='T';  M=  0, -5,-21, -4, -5,-11, -6,-10, -4, -4, -2, -7, -6,  0, -6,-12,  0,  3, -7,-24, -6, -7;
/M: SY='T';  M=  1, -8,-21, -9, -5,-10, -8,-10, -3, -2, -3, -5, -8,  2, -5,-10,  0,  4, -5,-24, -7, -7;
/M: SY='A';  M=  4,  1,-18,  3, -3,-16,-10,-13, -3, -3, -2, -3, -1,-12, -3, -9,  0,  2, -3,-29,-11, -5;
/M: SY='M';  M=  4, -3,-18, -5,  0,-18, -8, -4, -6,  2, -2,  5,  0,-10,  0, -8,  0,  4, -9,-27,-12, -1;
/M: SY='Q';  M=  8, -3,-18, -1,  1,-23, -8,-11,-13, -1,-13, -9, -4,  7, 11, -2,  3,  5,-12,-30,-20,  2;
/M: SY='D';  M=  1, 13,-17, 25, 17,-32,-10, -6,-22,  4,-10,-13,  1, -2,  4, -7,  2, -7,-18,-27,-14, 12;
/M: SY='L';  M= -3, -8, -6,-10, -7, -6,-17,-11,  7,-10,  8,  3, -7,-18,  1, -5,-10, -1,  2,-23, -1, -5;
/M: SY='E';  M=  4, -2,-13,  2, 26,-25,-15, -9,-19, 15,-13, -1, -6,  2, 20,  5, -1, -8,-19,-18,-14, 24;
/M: SY='E';  M=  3,  1, -9,  7, 31,-31,-16, -4,-23, 10,-13, -9, -5,  2, 26,  3, -1, -9,-24,-17,-16, 30;
/M: SY='R';  M=  0, -6,-19, -4,  5,-14,-15,-11,-12, 10, -9,  5, -7, -7, 14, 18, -5, -9,-10,-18, -7,  7;
/M: SY='I';  M=  3,-18,-19,-31,-27,  3,-16,-21, 49,-19, 17,  8, -6,-32,-21,-23,-10,  3, 38,-30, -3,-27;
/M: SY='L';  M=-16,-14, 20,-16, -8,  9,-25,-11,  6,-18, 24,  6,-16,-26,-16,-16,-17, -5,  2,-15, 13, -9;
/M: SY='Q';  M=  3,  3,-16,  7, 12,-24,-13, -8,-20,  6,-13, -6,  0, -5, 20, 11, -1, -6,-17,-22,-14, 13;
/M: SY='F';  M= -7,-20,-29,-22,-19, 30,-22,-15,  7,-10, 15, -3,-16,-26,-14, -9, -9, -5, 14, -5, 22,-19;
/M: SY='L';  M= -9,-12, -4,-14,-12, 21,-20,-10, 20,-18, 35, 17,-18,-30,-19,-19,-18, -1, 12,-20, 26,-12;
/M: SY='R';  M= -2, -9,-21, -8,  2, -1,-13,-11,-13,  7, -6,  0, -9, -9,  5, 10, -2, -9, -9,-13, -2,  1;
/M: SY='D';  M=  5,  9,-18, 13, 10,-24, -7,-10,-15,  4,-11, -6,  7, -7,  5, -6,  2, -2,-14,-30,-17,  8;
/M: SY='I';  M=  4, -3,-11, -6, -6, -5,-13,-12,  6, -7,  3,  4, -1,-18, -8,-11, -1,  5,  3,-32, -7, -7;
/M: SY='G';  M=  1, -1,-28, -5, -9,-24, 38,-21,-12, -3,-16,-13, -1, -6, -9,-10,  2,-11,-22, -6,-22,-10;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='P';  M=  2,  0,-17,  5, 16,-28, -7, -7,-20,  9,-17,-14, -5, 19,  6, -6,  4, -2,-22,-24,-18, 11; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='T';  M=  7, -6,-20, -7, -3,-20, -5, -8, -8, -1,-12, -7, -4,  6,  1, -9,  7,  8, -8,-31,-19, -4;
/M: SY='T';  M=  4, -8,-16,-12,-12, -6,-16,-16,  7, -6,  0,  2, -3,-15, -7, -9,  2, 10,  9,-31, -7,-11;
/M: SY='T';  M= 16, -3,-25, -5, -2,-19,-10,-15, -7,  3,-11,  1, -1,  5,  5,-10, 10, 17, -1,-40,-21, -1;
/M: SY='A';  M= 12, -6,-17, -9, -9, -1,-12,-16, 12,-10, 12, 11, -8,-19, -7,-16, -3,  7, 12,-35, -5, -9;
/M: SY='M';  M=  3, -3,-24, -5, -4,-11,-13,  1, -1,  0, -5,  6,  2,-11, -3, -5, -2, -1, -2,-33,-10, -5;
/M: SY='I';  M=  1, -6,-16, -7, -6,-11,-16,-11, 13,-10,  6,  1, -7,-19,  3, -8, -9, -1,  7,-24, -3, -4;
/M: SY='I';  M= 11, -7,-15, -9, -8,  0,-10,-15, 14,-11, 14, 13, -9,-21, -7,-14, -5,  4, 12,-33, -5, -8;
/M: SY='A';  M= 13, -4,-22, -4,  4,-13, -9,-18, -7, 10,-12,  7, -4, -5,  6,  2,  4,  2, -3,-30,-18,  2;
/M: SY='K';  M=  2,  1,-24, -3,  1,-11, -3,-15,-12, 10,-15,  4,  8, -9,  4,  7, -2, -7,-13,-20,-15,  0;
/M: SY='M';  M=  0, -7,-12, -8,  3, -5,-16,-14,  3,  2,  5,  8, -9,-13, -2, -4, -8, -5,  0,-21,  0,  1;
/M: SY='G';  M= -7, -7, -4,-14,-13, -4, 20,-23,  2,-14,  6, -3, -8,-21,-19,-18, -9,-10,-10, -8, -7,-15;
/M: SY='M';  M= -4, -8,-21,-12, -6, -4, -5, -2, -4, -2,  1,  7, -4,-16,  2,  2,-10, -9,-10,-16, -1, -4;
/M: SY='M';  M=  5,-10,-20,-13, -9, -6,-15,-13,  7,  0,  2, 10, -6,-16, -6, -2, -3,  3,  8,-27, -4, -9;
/M: SY='P';  M=  1, -4,-22, -4,  5,-24,-10, -6,-17,  7,-17,-12, -4, 28,  4, -7,  6,  9,-18,-31,-16,  2;
/M: SY='K';  M= 12, -2,-28, -2, 10,-14, -8,-17,-13, 22,-16, 14, -1,  1,  5,  7,  3, -3, -9,-29,-19,  5;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-28, -3, 11,-12,-12, -9,-20, 26,-19, 11, -3,  7,  5, 17,  1,-10,-18,-20, -9,  6;
/M: SY='E';  M=  1,  8,-11, 19, 22,-30,-16, -8,-18,  6, -7,-10, -3, -3,  9, -8, -1, -8,-15,-24,-13, 18;
/M: SY='V';  M=  7,-18,-18,-22,-26,  7,-23,-25, 40,-19, 15,  5,-15,-35,-25,-16,-10,  7, 41,-30,  5,-26;
/M: SY='N';  M=  0, 38,-11,  9,-10,-10, -1,-10,  0,  0,-19, -1, 75,-29,-10,-20,  1, 11,-19,-68,-38,-10;
/M: SY='P';  M= -1,-12,-26, -7,  5,-22,-14,  1,-21,  8,-20, -9,-14, 25, 19, 19, -4, -6,-20,-21,-11,  6;
/M: SY='V';  M=  8, -6,-23, -6,-14, -6,-18,-13, 10,-11,  3,  0, -6,-20,-10,-14,  0,  9, 16,-34, -5,-14;
/M: SY='L';  M=-10,-10,  0,-10,-10, 19,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 29,-10;
/M: SY='Y';  M=-34,-26,-53,-11,-19, 25,-27,  1, -7,-10, 25, -8,-31,-20,-11, -3,-17, -8,  9, 35, 73,-19;
/M: SY='A';  M=  8,  3,-24,  8,  1,-18, -6,-15,-16,  5,-14, -4, -1, -8,  5,  7,  8,  0, -9,-28,-16, -1;
/M: SY='L';  M= -4,-14, -6,-17,-11,  9,-20, -2, 17, -8, 32, 30,-13,-32,-17,-14,-19,  0,  7,-23, 16,-11;
/M: SY='E';  M=  2, -4, -9,  0, 24,-21,-16, -6,-18, 11, -8,  0, -8, -2, 19,  5, -3,-10,-18,-15,-10, 23;
/M: SY='R';  M= -1, -2,-23,  2,  8,-15,-11,-12,-21, 18,-18,  3, -2, -2,  9, 21,  1,-10,-16,-19,-10,  6;
/M: SY='Q';  M=  4, -3,-18,  0, 15,-19,-13, -9,-17, 11,-14, -1, -5, -2, 19, 10,  2, -5,-17,-18,-11, 15;
/M: SY='G';  M=  0,  1,-35, -5, -9,-26, 36, -1,-12, -7,-16, -9,  3, -8, -8,-13,  1,-12,-24,-13,-22,-10;
/M: SY='E';  M= -1,  1,-14,  6,  7,-13,-15,-12, -8,  6,  1,  5, -6,-11,  1, -1, -7, -6, -8,-22, -2,  4;
/M: SY='I';  M=  6,-13,-15,-15,-19,  7,-19,-21, 28,-17, 17,  8,-15,-31,-20,-15,-10,  5, 28,-28,  8,-19;
/M: SY='H';  M= -8, -9,-12, -6, -6, -8,-19,  2, -9, -8, -3, -7, -9,-13, -3, -1, -1, -4, -5,-18,  0, -7;
/M: SY='R';  M= -4, -9,-14, -8,  3, -5,-15,-15,-13, 12, -8,  8, -8, -8,  5, 18, -5,-10,-10,-15, -4,  1;
/M: SY='D';  M=  3,  3,-17,  7,  5,-21,-14, -9, -9, -1, -7, -8, -1, -8,  5, -6,  0,  1, -8,-28,-11,  5;
/M: SY='G';  M=  5,  6,-21,  7,  3,-25, 10,-16,-13,  0,-14,-12,  3, -4, -2,-11,  4, -3,-16,-22,-21,  0;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M=  2,  7,-18, 13,  2,-22,  7,-14,-11, -2, -6,-10,  0, -8, -5,-11,  1, -4,-11,-17,-12, -1; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='T';  M=  4,  2,-16, -6, -6,-12, -9,-10, -2, -2, -6,  0, 10, -7, -1,-13,  7, 15, -3,-33,-13, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-27,-10,  7,-33,-10,  6,-25,  7,-25,-33,-25, 83,  0, -9, -5,  2,-33,-27,-17, -1;
/M: SY='P';  M= -3,-14,-29, -8,  6,-31,-10,  3,-21,  8,-23,-24,-20, 71,  0, -8, -6,  1,-27,-32,-19, -1;
/M: SY='M';  M=  1, -9,-16,-11, -8, -5,-18,-12,  6, -3,  7, 10, -8,-15, -5, -7, -4,  6,  7,-26,  2, -7;
/M: SY='W';  M=-49,-49,-20,-39,-10, 10,  9,-49,-30,-20,-19,-30,-69,-30,-10,  0,-29,-49,-29,196, 50,-10;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-13, -7, -4, -8,-13,-10,-12, -1, -7, -6, -5,-12,  1,  3,  5,  0, -6,-20, -9, -4;
/M: SY='I';  M= -2,-13, -9,-17,-15,  9,-18,-15, 26,-16, 25, 13,-14,-28,-19,-18,-13,  3, 19,-25, 12,-16;
/M: SY='T';  M=  0, -6,-22, -6, -6,-10, -6,-13, -8, -4, -4, -7, -5, -7, -4,-11,  5,  7, -4,-17, -3, -7;
/M: SY='D';  M=  3,  1,-15,  6,  3,-24, -7,-14,-15,  2,-12,-10, -4,  0,  4,  2,  0, -4,-12,-25,-16,  1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 15 in 9 different sequences
Number of true positive hits 15 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Z-binding
Version [info] 6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
9 sequences

DSRAD_HUMAN (P55265    ), DSRAD_MOUSE (Q99MU3    ), DSRAD_RAT   (P55266    ), 
E3_VACCC    (P21081    ), E3_VACCW    (P21605    ), E3_VAR67    (P33863    ), 
ZBP1_HUMAN  (Q9H171    ), ZBP1_MOUSE  (Q9QY24    ), ZBP1_RAT    (Q8VDA5    )
» more

PDB
[Detailed view]
20 PDB

1J75; 1QBJ; 1QGP; 1XMK; 2ACJ; 2GXB; 2HEO; 2L4M; 2L54; 2LNB; 3EYI; 3F21; 3F22; 3F23; 3IRQ; 3IRR; 4KA4; 5ZU1; 5ZUO; 5ZUP
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission