PROSITE entry PS50191

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CRAL_TRIO
Accession [info]	PS50191
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-2002 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50191
Associated ProRule [info]	PRU00056

Name and characterization of the entry

Description [info]

CRAL-TRIO lipid binding domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=167;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=162;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2046000; R2=0.0139792; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10036.2558594; R2=6.3555093; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=558; H_SCORE=13583; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=451; H_SCORE=12903; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= -4, -6,-18,  1, 10,-20,-17,  2,-14,  4, -7, -7,-11,  9,  2,  1, -5,-11,-13,-22, -8,  6;
/M: SY='P';  M= -1, -2,-18,  4,  1,-19,-12,-13,-11,  2, -9,-10, -6,  6, -4, -6, -1, -1, -8,-24, -9, -3;
/M: SY='D';  M=  3,  3,-14, 11,  9,-26, -9,-14,-14,  0, -6,-11, -6, -1,  1, -9,  0, -2,-10,-24,-13,  5;
/M: SY='V';  M=  2, -8, -8, -6, -1, -3,-19,-17,  6, -7,  8,  1,-12,-19,-10,-13, -5,  0,  9,-23,  0, -4;
/M: SY='I';  M= -4,-13,-15,-17, -9,  4,-15,-14, 12, -7, 10,  2,-12,-10,-13,-13, -8, -2,  7,-21,  4,-11;
/M: SY='K';  M=  3,  1,-18,  1,  7,-15,-12,-11,-11,  9,-10,  4,  3, -9,  9,  8, -2, -5,-11,-26,-13,  6;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-18,  3,  9,-18, -8,-14,-12,  7, -9,  1,  1, -6,  7,  0, -1, -3,-12,-25,-12,  8;
/M: SY='Y';  M=-11,-15,-31,-16,-12,  8,-15,  2,  2, -6,  9,  3,-13,-16, -9, -8, -7, -4,  1, -8, 18,-12;
/M: SY='Y';  M= -8,-11,-20, -8, -1,  0,-10,-12,-10,  0,  3, -4,-13,-15, -2, -3, -7,-10, -7, -1,  9, -3;
/M: SY='P';  M= -4,-12,-29,-12, -3,-17,-11, 10, -7,  0, -8, -4,-11, 21, -4, -9, -2,  1,-11,-28, -7, -6;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  3,-10,-25,-14,-10,-13,  9,-15,  6, -9, -3, -3, -8,-16,  6, -5, -7, -4, -3, -9, -7, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=  3,  3,-23,  6, -8,-17,  5,-22, -3, -5, -6,-10, -2,-16,-14,-12,  0, -2, -1,-20,-10,-12;
/M: SY='F';  M=-13,-22,-17,-28,-22, 21,-19,-19, 19,-16, 20,  2,-18,-30,-19,-15,-15, -7, 17,  6, 21,-22;
/M: SY='L';  M= -7,-12,-17,-15,-14,  7,-20,  6,  7,-14, 11,  4, -8,-21,-14,-13, -8, -3,  5,-25,  7,-14;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-33,-10,-10,-18, 23, -9, -6, -6,-11,-13, -5,  0,-11,-15,  2, -5,-14,-10,-12,-13;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='Y';  M= -6, -7,-24, -4, -5, -4,-10, -7, -9, -5, -1, -7,-10,-10,  6,  3, -8, -6, -8,-10,  7, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D';  M=  4, 30,-25, 54,  9,-40, -7,-16,-29,  1,-10,-20,  5, -9, -3, -9,  4, -4,-17,-34,-14,  2;
/M: SY='K';  M=  1,  2,-25,  3,  6,-16,-11, -8,-14, 13,-13,  4,  3,  7,  2,  2, -2, -3,-15,-31,-13,  2;
/M: SY='D';  M=  1, 14,-24, 28,  6,-28,-10, -8,-22,  2, -8,-10,  4, -9,  0, -3,  0, -5,-13,-28,-10,  3;
/M: SY='G';  M=  3,  4,-33, -5,-12,-24, 44,-23, -6, -2,-15, -7,  9,-12,-14,-15,  0,-11,-20,-12,-27,-14;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7,-10, -8,-10, -6,-11, -8,-14,-15,  2,-12, -2, -7,-12, 11, 30, -7,-16,-11, -8, -8, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P';  M= -2,-14,-26, -6,  5,-26,-13, -3,-15,  7,-18,-21,-21, 58, -4, -8, -7,  0,-19,-30,-14, -2;
/M: SY='I';  M=  5,-16,-17,-20,-21,  5,-21,-20, 33,-17, 15,  6,-14,-32,-18,-13,-10,  6, 32,-28,  6,-20;
/M: SY='Y';  M=-13,-20,-18,-22,-19, 22,-21,-14, 10,-12, 21,  2,-18,-28,-18,-13,-11, -3, 11,  0, 26,-19;
/M: SY='Y';  M= -7,-18,-21,-18,-15, 12,-19,-17,  8, -9, 14,  3,-16,-24,-13,-11,-10, -2, 12, -3, 17,-16;
/M: SY='Y';  M= -9,-10,-21, -9, -6, 13,-20,-13,  1, -4, 12, -1,-10,-21,-10, -9, -9, -6,  3, -9, 16, -9;
/M: SY='R';  M= -8,-14, -4,-15, -5, -6,-15,-14,-11,  2, -7, -3,-11, -5,  2, 18, -8,-14, -8,-14, -8, -5;
/M: SY='V';  M=  5,-11,-23,-17,-15, 10,-14,-17, 10, -9,  8,  1, -5,-14,-10,-16, -3,  5, 11,-28, -2,-15;
/M: SY='G';  M=  3, -6,-23, -9,-11,-23, 30,-21,-13, -3,-15, -7, -5,-11, -2,  5, -2,-14,-16, -7,-24, -9;
/M: SY='R';  M= -5,-11,-23, -7,  1,-14,-14,  3,-17,  2,-11, -4,-10,  4, 17, 20, -7,-10,-16,-16, -2,  4;
/M: SY='L';  M= -8,-15,-17,-19,-10,  6,-17, -3,  8, -9, 11,  7,-11,-24, -6, -7,-12, -6,  3, -8, 10, -9;
/M: SY='D';  M= -2, 15,-27, 24,  5,-28,-13,  9,-21,  1,-14, -8,  8, -3, -2, -5,  2, -4,-18,-38,-13,  1;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='A';  M=  6, -8,-21,-11, -9, -6, -6, -9,  4, -5, -3, -2, -5, -4, -6, -9,  3,  6,  4,-25, -9,-10; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='K';  M=  1, -1,-14, -1,  5,-10,  1, -3, -9,  7,-10, -2,  0,  7, -1, -3,  4, -1,-11,-13,-10,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='R';  M= -2, -1,-24,  2,  1,-15,  2, -2,-16,  3,-12, -6, -5, -1,  4,  5, -1, -9,-17,-14, -8,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='D';  M=  7,  3,-22,  8,  3,-17,-13,-15, -9,  2,-10, -8, -1, -6,  4, -5,  4,  4, -6,-30,-12,  1;
/M: SY='T';  M=  5, -6,-14, -8, -9, -9,-18,-17,  3, -5,  0,  1, -2,-17, -1, -4, -1,  7,  7,-30, -7, -7;
/M: SY='T';  M=  2,  1,-24, -5,-11,-13, -1,-10, -1, -8, -5, -4,  6,-13, -5,-14,  7, 11, -3,-30,-10,-10;
/M: SY='H';  M=  0, -9,-22, -9,  3,-16, -9,  6,-11,  3,-11, -2, -6, -2,  0,  1,  1, -5,-12,-23,-12,  0;
/M: SY='H';  M= -5, -1,-26,  8,  9,-21,-18, 13,-20,  0, -8, -9, -8,  7,  7, -5, -2, -4,-18,-23, -1,  7;
/M: SY='E';  M=  1,  1,-15, 10, 12,-17,-16,-12,-14,  6, -5, -2, -7, -9,  4,  4, -3, -9, -8,-20, -5,  9;
/M: SY='Y';  M= -7, -9,-22, -5,-13,  8,-21,-11,  9,-10, 19,  4,-14,-27,-11, -9,-14, -3, 10,-13, 21,-13;
/M: SY='L';  M= -3,-11,-12,-12,-13,  7,-21,-15, 19,-13, 21,  8,-13,-26,-17,-17,-11,  4, 17,-23, 14,-13;
/M: SY='R';  M= -6,-13,-26,-10, -1, -7,-16, -5,-21,  7,-14, -1,-10, -7, 27, 36, -8,-15,-16, -6,  1,  6;
/M: SY='H';  M= -5,-12,-27,-12, -5, -1,-18,  9, -5, -4,  3,  3, -9, -8, -3, -5, -6, -4, -3,-20,  5, -6;
/M: SY='L';  M= -5,-10,-20,-10,-11,  7,-19, -5,  4, -7, 10,  5,-11,-20,-12, -6, -5, -1,  6,-22, 10,-12;
/M: SY='I';  M= -6,-17,-13,-23,-19, 18,-22,-19, 24,-13, 20,  8,-13,-30,-21,-15,-13, -2, 21,-17, 14,-20;
/M: SY='Y';  M= -8,-15,-28,-13, -7,  2,-11, -7, -8, -2,  0, -3,-16, -9, -4, -1, -3, -5, -6,  1, 11, -9;
/M: SY='V';  M=  4,-12,-19,-13, -6, -8,-19,-11,  9, -4,  8,  6, -9,-19, -5,-12, -4,  7, 12,-23,  1, -5;
/M: SY='L';  M= -7,-11, -5,-19,-14, 14,-18,-11, 12, -9, 18, 10, -4,-30,-17,-15,-10, -1,  6,-21,  6,-16;
/M: SY='E';  M=  3,  6, -5, 17, 37,-35,-11, -8,-24, 14,-10,-10, -5,  3,  9,-10,  2,-13,-22,-18,-19, 28;
/M: SY='E';  M= -3, -5, -7, -3,  9,-18,-10,-13,-16,  5, -9, -5, -8,  3,  4, -2,  0, -3,-16,-17,-10,  6;
/M: SY='I';  M=  2,-14,-25,-18,-19,  4, -5,-20, 14,-11,  6,  0,-10,-23,-12, -7, -5, -2, 14,-16,  1,-18;
/M: SY='L';  M= -4,-16,-13,-17, -4, -4,-20, -5,  2, -4,  4,  0,-14, -2, -5, -7,-10, -3, -1,-21,  1, -5;
/M: SY='Q';  M=  3,  0,-18,  6,  8,-19,-15, -6,-15,  2, -8, -4, -6, -6, 14,  6,  1, -1,-12,-23, -7,  9;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='F';  M= -4,-10,-18,-11, -6,  4,-15,-13,  1,  0,  2,  1, -7,-14, -5,  2, -2, -4,  3,-15,  3, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='C';  M= -3,-13,  7,-15, -3, -4,-19,-15,  2, -5,  3, -3,-12, -7, -9, -7, -9, -5,  2,-19, -8, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='E';  M=  2, -3,-12,  1,  9, -9,-13, -9,-10,  5, -3, -3, -7,  0,  0, -4, -3, -7, -7,-17, -6,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='P';  M=  2, -4,-16, -1, 10,-20,-11, -2,-15,  5,-10, -8, -6, 16,  9, -6,  0,  1,-15,-21,-12,  9; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='Q';  M=  7,  1,-17, -4,  0,-14, -1, -7, -5,  1, -8,  1,  6, -6,  9, -3,  1,  4,-10,-24,-15,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='A';  M=  3, -8,  1, -8,  0,-12,-14,-14, -2, -4, -2, -2, -6,-10,  3, -1,  0,  1,  2,-18,-10,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='K';  M=  3,  3,-14,  2,  4,-13, -7, -7,-11,  9,-11,  0,  7, -3,  1,  1,  5,  1,-11,-24,-14,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='K';  M=  2, -1,-17,  0,  4,-17,  1,-12,-10,  6,-10, -4, -3,  2,  1, -2,  2, -2,-10,-15,-11,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='L';  M=  0, -2,-13, -2, -5, -1, -8, -8,  0, -3,  3,  0, -1, -9, -2, -5,  0,  3,  0,-14,  2, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='G';  M=  5,  0,-16, -4, -7,-10, 16,-13, -1, -5, -5, -3,  1, -8, -4, -8,  0, -1, -5,-10,-12, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='R';  M= -2, -5,-13, -5, -8, -3, -3,-10, -2, -2, -1,  0, -4, -9, -1,  6, -3, -2,  0, -8,  2, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -2, -6,-13, -4,  3, -8, -7,  2, -8,  2, -6, -5, -8, 13,  4,  2, -1, -1,-10,-11, -2,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='F';  M= -6,-11,-13,-17,-12,  6,-10,-15,  2, -6,  5,  0, -6,-22,-12,-12, -5, -4,  0, -3,  1,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='T';  M= -3, -9, -6,-11, -4,-11,-18,-10, -2, -4,  0, -2, -6, -2, -6,-14,  1,  9,  0,-23, -4, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='V';  M=  0, -8,-12,-11, -8, -1,-19,-17,  4, -7,  4, -3, -6,-19, -6,-11, -2,  3,  6,-23, -3, -9;
/M: SY='I';  M=  0,-16,-19,-21,-21,  5,-18,-19, 35,-17, 19,  6,-12,-30,-19,-19,-11,  2, 31,-23,  8,-22;
/M: SY='F';  M= -7,-19,-25,-23,-16, 24,-24, -9,  7, -8, 13,  1,-15,-22,-13, -8,-12, -5, 10,-11, 17,-16;
/M: SY='D';  M= -5, 36,-20, 67,  9,-40,-13,-19,-34,  0, -7,-24,  6,-11, -9, -9, -3,-10,-18,-31, -6,  0;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='L';  M= -4,-11, -7,-15,-11, 11,-19, -9, 11, -7, 22, 18, -9,-28,-15,-12,-14, -1,  7,-21, 11,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -2,  1,-11,  3, 10,-23,-15, -7,-12,  6, -8, -3,  1,  3,  3, -7, -2, -2,-13,-29,-14,  7;
/M: SY='G';  M=  0,  3,-38, -5,-15,-28, 58,-16,-11, -8,-19,-14,  5, -9,-16,-18,  0,-16,-27, -5,-28,-15;
/M: SY='F';  M= -4,-17,-18,-25,-23, 27,-19,-21, 17,-14, 17,  0,-11,-28,-19,-18, -6,  2, 16,-14, 12,-22;
/M: SY='T';  M=  4,  1,-15, -8,-10,-17, -2,-17, -1, -5,-10, -8, 11, -6, -6,-19, 14, 19, -5,-36,-20,-10;
/M: SY='L';  M= -1,-15,-21,-20,-16,  7,-17, -8, 10, -4, 14, 11,-10,-24,-16,-11, -7,  4,  8,-19,  8,-17;
/M: SY='S';  M=  3,  0,-23,  4, -5,-14, -6,-17, -7, -1,-11, -9, -3,-14, -2,  4,  6, -2, -3,-18,-11, -8;
/M: SY='H';  M= -3,  1,-25, -9, -5,-16,-12, 22, -3, -4,-13,  2, 16, -5,  1, -5, -3, -2,-13,-43,-18, -5;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='L';  M=  2, -2,-22,  0, -6,  2,-13,-16, -3,  2,  3,  3, -4,-15, -7, -3, -4, -4,  1,-23, -2, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='W';  M= -6, -8,-16, -3, -4, -4, -9, -9, -7, -1,  1,  0,-11,-17, -6, -1, -5, -7, -5,  8,  6, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='P';  M= -3, -9,-21, -9, -5, -9,-14, -2, -7,  0, -7, -8, -8, 13, -2,  0, -6, -3, -9,-25, -7, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='A';  M=  4, -5,-24, -4, -8,-13,  2,-16, -6, -3, -9, -8, -6, -4, -1, -2,  1, -1, -5,-19,-11, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='I';  M= -2, -6,-21, -8,-14, -3,-16,-14, 10, -8,  8,  3, -3,-17,-11,-13, -4,  7, 10,-26,  5,-14;
/M: SY='E';  M=  3,  4,-15,  4, 10,-22,  7,-17,-17,  9,-17, -8,  2, -4, -3, -7, 10, -4,-20,-20,-22,  3;
/M: SY='W';  M=-12,-19,-10,-17,-10,  2,-13,-22, -5,-11, -1,-13,-24, -7,-12,-11, -9, -7, -4, 19,  8,-12;
/M: SY='L';  M= -4, -8,-12, -9,-14,  9,-13,-18,  8,-14, 17,  2,-12,-24,-16,-17, -8,  2,  8,-18, 12,-14;
/M: SY='R';  M= -1, -6,-20, -6, -2, -9,-12,-14,-12,  8,-11,  3, -5, -8,  9, 19,  1, -3, -9,-19, -5,  0;
/M: SY='K';  M=  2, -6,-22, -7, -2, -6,-17,-18,  0,  7, -3,  5, -4,-11, -5, -2, -2, -2,  4,-24, -6, -4;
/M: SY='I';  M= -3,-17, -7,-21,-10,  0,-17,-18, 11, -3,  8, 11,-12,-25,-14, -9,-11, -5,  8, -8,  0,-13;
/M: SY='I';  M= -6,-17,-16,-21,-16,  8,-14,-19, 14,-13, 12, -1,-16,-19,-14,-16, -8, -1, 12, -5,  8,-17;
/M: SY='N';  M= -1,  0,-17, -1,  1,-14, -7, -9, -9,  0, -8, -5,  2,-11,  0, -5,  2, -1,-11,-23,-10, -1;
/M: SY='I';  M= -1,-16, -2,-22,-14,  3,-22,-18, 24,-14, 16,  7,-11,-29,-12,-14,-12,  1, 19,-24,  2,-14;
/M: SY='F';  M= -7,-11,-17,-15,-16, 27,-21,-18, 10, -8, 19,  4,-11,-28,-20,-12,-10, -4, 10,-16, 16,-18;
/M: SY='Q';  M=  2, -1,-18,  3, 13,-24,-14, -9,-18,  5,-13,-11, -5,  3, 24,  6, -4, -5,-19,-19,-11, 16;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M=  8, 10,-20, 15,  6,-25, -2,-14,-13,  0, -8, -6,  3, -7,  8, -7,  0,  0,-12,-27,-16,  6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='H';  M= -2, -5,-28, -7, -1,-12,-16, 27,-10, -4, -7,  5,  4,-11,  0, -3, -2, -6,-10,-33, -7, -2;
/M: SY='Y';  M=-21,-23,-45,-16,-18, 30,-24, -4, -9, -6, 15, -8,-23,-20,-10,  0, -9, -9,  5, 17, 46,-19;
/M: SY='P';  M=-15,-22,-32,-16, -2, -8,-16,  2,-21,  4,-13,-30,-27, 64, -5, -6,-11, -5,-24,-14,  2, -8;
/M: SY='E';  M=  3, -1, -8,  7, 29,-29,-16, -6,-20, 10,-10, -9,-11, 11, 11, -5, -1, -9,-19,-20,-15, 23;
/M: SY='R';  M=  0, -7,-10,-10, -7, -3,-16,-18, -9,  2, -6,  2, -2,-13,  2, 11, -1, -2, -3,-25,-10, -6;
/M: SY='L';  M= -4, -4, -4,-12,-12,  8,-18,-12, 17,-12, 19, 13,  2,-30,-17,-18,-13,  3,  8,-31,  5,-12;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-27, -7, -9,-12,  7,-12, -3, -1, -6,  0, -1,-13, -3,  1, -4,-10, -8,-15, -8, -8;
/M: SY='K';  M=  4, -6,-23, -6,  9,-18,-12,  2,-17, 13,-15,  9, -5,  1, 11,  9, -1, -8,-15,-26,-16,  8;
/M: SY='I';  M= -1,-14, -7,-21,-18, 10,-19,-21, 22,-13, 13,  5, -7,-29,-19,-16, -9,  0, 19,-24,  1,-19;
/M: SY='Y';  M=-12,-19,-27,-20,-19, 22,-23,  0, 13,-16, 22,  5,-18,-26,-17,-13,-14, -5, 14,-10, 28,-19;
/M: SY='I';  M= -3,-19,-18,-30,-25, 13,-18,-18, 40,-17, 23, 10,-10,-32,-22,-21,-13,  0, 31,-22,  8,-25;
/M: SY='I';  M= -1,-20,-24,-28,-26,  3,-20,-11, 40,-19, 15,  6,-10,-29,-21,-19,-10,  3, 35,-26,  5,-26;
/M: SY='N';  M= -2, 11,-18, -4,-10, -8, -7, -6,  3, -1,-10,  4, 30,-21, -7, -5, -3,  0, -7,-43,-19,-10;
/M: SY='A';  M= 11, -7, -5, -9,  1,-18,-12, -8, -4, -2, -8,  3, -4,-10,  3, -5,  3,  1, -1,-35,-26, -1;
/M: SY='P';  M= -9,-15,-29, -9,  8,-38, -7,  7,-27,  9,-29,-37,-21, 97, -1,-11, -9,  0,-38,-32,-22, -1;
/M: SY='W';  M= -7, -9,-21, -6, -8, -5,-10,-21,-11, -5, -7,-12,-14,-14, -6, -6,  4,  1, -5, 12,  6, -9;
/M: SY='W';  M=-14,-18,-25,-23,-20, 12, -2,-22,  5,-12,  6, -4,-14,-29,-18,-12,-14,-13,  2, 26, 16,-20;
/M: SY='F';  M= -8,-24,-27,-39,-33, 67,-25,-27,  9,-11, 16,-11,-10,-36,-25,-12, -8,-11, 16, -5, 17,-33;
/M: SY='W';  M=-11,-13,-23,-13, -8, -8, -6,-12,-14, -4,-14,-13,-11, -4,  3,  9, -6,-13,-15, 13, -1, -6;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='T';  M=  9, -8,-17, -9, -9,-10,-12,-19,  6, -7, -1, -1, -7,-10, -6,-14,  2, 13, 11,-23, -7, -8; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Y';  M= -7,-15,-14,-15,-11, 11,-20,-14,  6, -7, 15,  5,-17,-15,-13, -8,-12, -2,  7,-14, 16,-12;
/M: SY='W';  M=-20,-25,-25,-23,-12, 14,-12,-17, -7,-13,  4, -9,-29,-22, -4, -6,-13,-13, -6, 49, 29,-10;
/M: SY='S';  M=  6,  5,-23,  5,  1,-15, -9,-15,-10,  8,-14, -2,  6, -8,  0,  1, 10,  5, -8,-32,-16, -3;
/M: SY='I';  M=  4,-14,-18,-20,-17,  4,-17,-13, 22,-10, 17, 14, -8,-27,-15,-16, -7,  6, 19,-27,  3,-17;
/M: SY='I';  M=  1,-13,-14,-24,-20,  2,-18, -9, 26,-15, 10,  6, -2,-26,-17,-19, -5,  4, 20,-33, -6,-20;
/M: SY='K';  M= -1, -6,-27, -6,  1,  1,-13,-11,-11, 12,-10,  0, -5, -7, -5,  3,  5, -5, -7,-18, -4, -4;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-26, -8,  4,-24, -5, -3,-18,  8,-20,-19,-15, 51, -2, -3, -3, -2,-25,-25,-15, -3;
/M: SY='F';  M=-17,-24,-16,-35,-25, 56,-22,-25,  1,-12, 15,-13,-15,-28,-23,-12, -9,-13,  4,  9, 20,-27;
/M: SY='I';  M= -5,-11,-11,-18,-15, 11,-17, -8, 24,-17, 22, 10, -8,-27,-16,-18,-12,  1, 14,-26, 11,-15;
/M: SY='D';  M=  3, 14,-26, 27,  4,-28,-10,-15,-21,  6,-14,-12,  2,  2,  1,  0,  4, -1,-13,-32,-14,  0;
/M: SY='P';  M= -5, -4,-19,  5, 17,-21,-11, -5,-24,  8,-13,-22,-13, 28,  0, -9,  0, -8,-24,-17,-10,  9;
/M: SY='K';  M=  2,  3,-21,  6,  4,-13,-14,-17, -5,  7, -5,  4, -1,-10, -1, -2, -4, -3, -4,-27, -6,  1;
/M: SY='F';  M= -1,-11,-22,-19,-19, 15,-22,-21,  4, -7,  7, -3, -3,-16,-12,-18,  4, 15, 10,-24,  6,-16;
/M: SY='R';  M=  0, -9,-21, -7,  0,-13, -7,-16,-13,  8,-13,  1,-10, -8,  8, 22, -3,-12, -8,-13, -8,  1;
/M: SY='Q';  M=  5, -4,-15, -5, 11,-16,-14, -8,-14,  8, -9, -1, -2, -6, 15,  3,  4,  0,-13,-22,-13, 12;
/M: SY='K';  M= -1, -4,-26, -3,  9,-10,-13,-18,-18, 28,-18, 13, -2,  2,  4, 20,  0, -9,-14,-19, -8,  5;
/M: SY='I';  M=  1,-17,-19,-28,-21, 10,-18,-19, 30,-11, 14,  7, -7,-28,-17,-15, -9,  0, 25,-24,  0,-21;
/M: SY='I';  M= -2,-18,-22,-21,-15,  7,-23, -5, 11, -6,  7,  6,-13,-19, -9, -1,-11, -4, 11,-21,  6,-14;
/M: SY='V';  M= -4,-20,-24,-26,-24, 19,-20,-19, 21,-12, 11, -3,-12,-25,-19,-11, -6,  1, 22,-16, 10,-25;
/M: SY='L';  M= -3,-10,-20,-11,-16, 10,-20, -7, 10,-13, 15,  3,-10,-23,-16,-15, -6,  4, 11,-24, 12,-16;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-21, -7,  4,-18, 10, -8,-11,  4,-10, -3, -2, -4, -4, -9,  0, -9,-18,-15,-16,  1;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='N';  M=  3, 11,-17,  9, -1,-15,  3,-12, -8, -2, -8, -7, 15,-12, -6,-13,  5,  4,-10,-28,-15, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='N';  M= -2,  6, -9,  5, -1,-12, -4, -4, -7, -2, -6, -7,  7, -6, -4, -7,  2,  0,-10,-21, -9, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='W';  M=-10,-11,-11, -9, -5,  0,  3,-13, -8, -6, -3, -9,-15,-11, -6, -5, -2, -7, -7, 27,  9, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='P';  M= -2, -7,-15, -7,  1, -7, -9, -3, -2,  6, -5,  2, -7,  9, -2,  0, -5, -3, -5,-15, -3, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M=  1,  2,-16,  4,  5,-18,  4,-10,-14,  3,-14,-11,  0,  0,  3, -3,  3, -4,-17,-10,-14,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M=  2,  0,-16,  5, 21,-28, -2, -6,-20, 10,-14, -9, -6,  9,  2, -9,  4, -7,-21,-19,-18, 14;
/M: SY='L';  M=-10,-13, -4,-16,-14, 27,-21,-13, 20,-19, 36, 15,-18,-31,-21,-19,-18, -2, 12,-18, 28,-14;
/M: SY='L';  M=  0, -8,-21, -8, -6, -6,-15,  0,  1, -8,  5,  5, -7,-14, -2, -9, -4,  4,  1,-25,  3, -4;
/M: SY='E';  M=  2,  7,-18, 11, 22,-27, -9,-12,-22, 16,-16, -3,  3,  1, 17,  2, -1, -7,-24,-21,-15, 20;
/M: SY='H';  M=-16,-19,-36,-21,-13,  7,-25, 33,  3,-14, 10,  4,-13,-15, -7,-10,-12,-10,  1,-14, 21,-12;
/M: SY='I';  M=  3,-19,-19,-29,-27,  7,-18,-21, 44,-18, 18,  9, -9,-33,-22,-20,-11,  3, 37,-29,  0,-27;
/M: SY='D';  M= -2, 15,-23, 31, 15,-38, -8, -8,-29,  8,-18,-23,  0, 25,  0, -8, -2, -6,-27,-31,-17,  7;
/M: SY='P';  M= -1, -6,-24,  0,  9,-19,-13, -3,-16, 11,-10, -1,-11, 16,  2,  2, -4, -7,-15,-23, -8,  4;
/M: SY='E';  M= -1,  4,  5,  9, 26,-29,-15, -4,-20,  6,-12,-12,  1, -3,  5,-10,  6, -7,-21,-24,-22, 19;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='Q';  M=  0, -9, -8,-13,  3,-10,-18, -9, -6, -3, -6, -7, -4,-10, 19,  2, -6, -2,-10,-16, -7,  7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L';  M= -8,-14, -6,-18,-15, 14,-16,-14, 27,-19, 31, 15,-17,-29,-19,-20,-17, -2, 16,-14, 20,-15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='P';  M= -8,-12,-29, -4,  2,-28,-13,  1,-23,  4,-18,-30,-21, 71, -3,-13, -6,  6,-26,-29,-10, -4;
/M: SY='E';  M=  3, -2,-13,  5, 18,-25, -9, -4,-16,  7, -9, -6, -8, -2,  3, -4,  1, -9,-14,-20,-15, 13;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-13,  5,  6, -5,-15,-10,-17,  1, -1, -8, -6,-12,  0, -2, -6,-13,-12,-14, -1,  3;
/M: SY='Y';  M=-21,-23,-21,-23,-21, 33,-23,-18,  4,-15, 23, -4,-24,-28,-18,-12,-15, -7,  9, 18, 40,-20;
/M: SY='G';  M= -1,  2,-31, -2,-11,-23, 48,-24,-10, -6,-13,-13,  0,-11,-15,-14, -1,-15,-23, -2,-20,-13;
/M: SY='G';  M=  2, -1,-37, -9,-15,-28, 64,-27,-11, -6,-20,-16, -1, -9,-12,-13,  1,-17,-27,  4,-27,-15;
/M: SY='T';  M=  0, -1,-14,  1,  3,-16,-14,-12, -8,  0, -1, -3, -3, -6, -1,-12,  1,  6, -6,-24, -4,  2;
/M: SY='D';  M= -2,  3,  1,  6,  0,-12,-12,-15, -3, -8,  5, -2, -2,-20, -7,-10, -5, -3, -5,-27, -7, -3;
/M: SY='D';  M=  0,  3,-20, 11, 10,-21,-12,-13,-15,  7, -8, -7, -6,  4, -2, -7, -2, -3,-13,-24, -8,  5;
/M: SY='Y';  M=-11, -5,-14,  0, -3,  1,-15,-19,-12, -2,  1,-10, -9,-16,-10, -9, -5, -8, -6, -3,  8, -7;
/M: SY='B';  M= -4,  6, -6,  6,  2,-14,-15, -9, -8, -2,  0, -1,  6,-12, -7,-11, -3, -1,-10,-31, -8, -1;
/M: SY='H';  M= -7,  1,-27,  3,  2,-15,-14, 15,-11, -2, -4,  0,  2, -8, -2, -9, -3, -3,-13,-27,  0,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	160 in 160 different sequences
Number of true positive hits	160 in 160 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	8
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	95.24 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CRAL-TRIO
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

160 sequences

ATCAY_HUMAN (Q86WG3), ATCAY_MACFA (Q9GKT0), ATCAY_MOUSE (Q8BHE3),

ATCAY_RAT   (Q1M168), BNIP2_HUMAN (Q12982), BNIP2_MOUSE (O54940), 
BNIPL_HUMAN (Q7Z465), BNIPL_MOUSE (Q99JU7), CLVS1_HUMAN (Q8IUQ0), 
CLVS1_MOUSE (Q9D4C9), CLVS1_PONAB (Q5RCA6), CLVS1_RAT   (A6JFQ6), 
CLVS1_XENLA (Q5M7E1), CLVS2_DANRE (Q5SPP0), CLVS2_HUMAN (Q5SYC1), 
CLVS2_MACFA (Q95KF7), CLVS2_MOUSE (Q8BG92), CLVS2_RAT   (A6JUQ6), 
CSR1_EREGS  (Q757H2), CSR1_YEAST  (Q06705), CTG1_CAEEL  (O17907), 
GACY_DICDI  (Q54TH9), GDAP2_DICDI (Q54PT1), GDAP2_DROME (Q7JUR6), 
GDAP2_DROPS (Q292F9), GDAP2_NEMVE (A7T167), KALRN_HUMAN (O60229), 
KALRN_MOUSE (A2CG49), KALRN_RAT   (P97924), MCF2L_HUMAN (O15068), 
MCF2L_MOUSE (Q64096), MCF2L_RAT   (Q63406), MCF2_HUMAN  (P10911), 
MF2L2_HUMAN (Q86YR7), MSPD2_HUMAN (Q8NHP6), MSPD2_MOUSE (Q9CWP6), 
NF1_HUMAN   (P21359), NF1_MOUSE   (Q04690), NF1_RAT (P97526), 
NFAA_DICDI  (Q55AR6), PATL1_ARATH (Q56WK6), PATL2_ARATH (Q56ZI2), 
PATL3_ARATH (Q56Z59), PATL4_ARATH (Q94C59), PATL5_ARATH (Q9M0R2), 
PATL6_ARATH (Q9SCU1), PDR16_YEAST (P53860), PDR17_YEAST (P53844), 
PINTA_DROME (Q9VD09), PITC_DICDI  (Q55CU8), PRUN2_HUMAN (Q8WUY3), 
PRUN2_MOUSE (Q52KR3), PRUN2_PONAB (Q5R4Q8), PRUN2_RAT   (Q5BJR4), 
PRUN2_XENTR (Q0IHU9), PTN9_HUMAN  (P43378), PTN9_MOUSE  (O35239), 
PTN9_RAT(Q641Z2), RALB_TODPA  (P49193), RETM_AEDAE  (Q16KN5), 
RETM_ANOGA  (Q7PWB1), RETM_DROME  (Q9VMD6), RETM_DROPS  (Q29JQ0), 
RG68F_DROME (Q9VTU3), RHG01_HUMAN (Q07960), RHG01_MOUSE (Q5FWK3), 
RHG08_HUMAN (P85298), RHG08_MOUSE (Q9CXP4), RLBP1_BOVIN (P10123), 
RLBP1_CHICK (E1C1U1), RLBP1_HUMAN (P12271), RLBP1_MOUSE (Q9Z275), 
S14L1_HUMAN (Q92503), S14L1_MOUSE (A8Y5H7), S14L2_BOVIN (P58875), 
S14L2_HUMAN (O76054), S14L2_MOUSE (Q99J08), S14L2_RAT   (Q99MS0), 
S14L3_HUMAN (Q9UDX4), S14L3_RAT   (Q9Z1J8), S14L4_HUMAN (Q9UDX3), 
S14L4_MOUSE (Q8R0F9), S14L5_HUMAN (O43304), S14L5_XENTR (Q0V9N0), 
S14L6_HUMAN (B5MCN3), SEC14_CANAL (P46250), SEC14_CANGA (P53989), 
SEC14_EREGS (Q75DK1), SEC14_KLULA (P24859), SEC14_SCHPO (Q10137), 
SEC14_YARLI (P45816), SEC14_YEAST (P24280), SES1A_XENLA (Q6GPX2), 
SES1B_XENLA (Q6GNM9), SESD1_DANRE (Q7SX85), SESD1_HUMAN (Q86VW0), 
SESD1_MOUSE (Q80UK0), SESD1_XENTR (Q5M7P4), SFH10_ARATH (Q9SI13), 
SFH11_ARATH (F4JYJ3), SFH12_ARATH (Q94A34), SFH13_ARATH (Q501H5), 
SFH14_ARATH (F4K6D3), SFH1_ARATH  (F4JLE5), SFH2_ARATH  (F4JVA9), 
SFH3_ARATH  (Q93ZE9), SFH4_ARATH  (F4HP88), SFH5_AJECN  (A6QT51), 
SFH5_ARATH  (Q8GXC6), SFH5_ASPCL  (A1C4X0), SFH5_ASPFU  (Q4WEP0), 
SFH5_ASPNC  (A2QUR1), SFH5_ASPOR  (Q2UA18), SFH5_ASPTN  (Q0CE43), 
SFH5_BOTFB  (A6S3N2), SFH5_CANAL  (Q5AP66), SFH5_CANGA  (Q6FQI6), 
SFH5_CHAGB  (Q2GLX8), SFH5_COCIM  (Q1DSY1), SFH5_CRYNB  (P0CR45), 
SFH5_CRYNJ  (P0CR44), SFH5_DEBHA  (Q6BWE5), SFH5_EMENI  (Q5ATZ7), 
SFH5_EREGS  (Q75BM4), SFH5_KLULA  (Q6CXS7), SFH5_LODEL  (A5DSN2), 
SFH5_NEOFI  (A1CZU9), SFH5_NEUCR  (Q7S4C1), SFH5_PHANO  (Q0V0B0), 
SFH5_PICGU  (A5DEQ9), SFH5_PICST  (A3LPR9), SFH5_PYRO7  (A4R6K8), 
SFH5_SCLS1  (A7EXH9), SFH5_VANPO  (A7TK50), SFH5_YARLI  (Q6C9R9), 
SFH5_YEAS7  (A6ZQI5), SFH5_YEAST  (P47008), SFH6_ARATH  (F4JVA6), 
SFH7_ARATH  (Q9SIW3), SFH8_ARATH  (F4IHJ0), SFH9_ARATH  (F4J7S8), 
TRIO_DANRE  (Q1LUA6), TRIO_HUMAN  (O75962), TRIO_MOUSE  (Q0KL02), 
TRIO_RAT(F1M0Z1), TTPAL_HUMAN (Q9BTX7), TTPAL_MOUSE (Q9D3D0), 
TTPAL_PONAB (Q5RFR0), TTPA_HUMAN  (P49638), TTPA_MOUSE  (Q8BWP5), 
TTPA_RAT(P41034), Y8031_DICDI (Q54YX3), YAS2_SCHPO  (Q10138), 
YGR1_SCHPO  (Q9UUC2), YJX4_SCHPO  (Q9UU99), YKJ1_YEAST  (P33324), 
YKP9_SCHPO  (Q9HDZ5), YN02_CAEEL  (Q03606), YQF6_CAEEL  (Q09270), 
YUQP_CAEEL  (Q19895)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

8 sequences

GDAP2_BOVIN (Q2KIX2), GDAP2_DANRE (Q66HX8), GDAP2_HUMAN (Q9NXN4),

GDAP2_MACFA (Q4R678), GDAP2_MOUSE (Q9DBL2), GDAP2_RAT   (Q66H63), 
GDAP2_XENLA (Q5XGM5), GDAP2_XENTR (Q5CZL1)

» more

PDB
[Detailed view]

65 PDB

1AUA; 1O6U; 1OIP; 1OIZ; 1OLM; 1R5L; 2D4Q; 2E2X; 3B74; 3B7N; 3B7Q; 3B7Z; 3HX3; 3HY5; 3P7Z; 3PEG; 3PG7; 3Q8G; 3W67; 3W68; 4CIZ; 4CJ6; 4FMM; 4J7P; 4J7Q; 4M8Z; 4OMJ; 4OMK; 4TLG; 4UYB; 5MUE; 5MUG; 6F0E; 6R3V; 6SLD; 6W32; 6ZPD; 7MOC; 7MP5; 7MP6; 7PGP; 7PGQ; 7PGR; 7PGS; 7PGT; 7PGU; 7R03; 7R04; 7UR2; 7WVT; 7WWD; 7WWE; 7WWG; 7Y10; 7Y11; 7ZG9; 7ZGA; 7ZGB; 7ZGC; 7ZGD; 8E20; 8EDL; 8EDM; 8EDN; 8EDO
» more