PROSITE entry PS50244
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | S5A_REDUCTASE |
| Accession [info] | PS50244 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2002 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50244 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Steroid 5-alpha reductase C-terminal domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2548000; R2=0.0187626; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4466.8530273; R2=6.4534535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=7481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=6797; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-20; E1=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 9,-12,-25,-14,-18,-24, 45,-20,-28,-19,-18,-14, -5,-19,-18,-20, -1,-15,-20,-20,-25,-18; /M: SY='F'; M= 3,-22,-17,-28,-20, 13,-21,-19, 9,-21, 12, 7,-18,-22,-20,-19, -9, -4, 9,-17, -1,-19; /M: SY='V'; M= 2,-22,-23,-26,-24, -3, 1,-24, 2,-22, -2, -2,-17,-23,-22,-22,-10,-11, 5, -7, -8,-23; /M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-24, 5,-33,-23, 30,-28, 36, 22,-26,-26,-20,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-23; /M: SY='F'; M=-20,-29,-25,-35,-28, 61,-29,-12, -2,-24, 5, -2,-22,-30,-31,-18,-22,-12, -5, 29, 42,-27; /M: SY='V'; M= -2,-27, 3,-32,-27, 1,-27,-27, 9,-24, 5, 1,-25,-28,-24,-23,-15, -9, 14, -6, -5,-25; /M: SY='I'; M= -7,-23,-22,-30,-23, -1,-32,-25, 28,-25, 17, 12,-17,-20,-18,-23,-11, 3, 19,-23, -3,-23; /M: SY='G'; M= 5,-11, 6,-14,-19,-26, 34,-21,-32,-20,-26,-19, -4,-22,-19,-21, 3,-11,-20,-28,-28,-19; /M: SY='M'; M= -6, -4,-20,-10, -2, -8,-14, -2, -4, -6, -6, 14, 1,-15, 5, -7, 1, -2, -8,-26, -8, 2; /M: SY='W'; M=-13,-29,-31,-32,-25, 10,-21,-19, 8,-24, 10, 3,-26,-27,-20,-21,-25,-15, 0, 28, 16,-23; /M: SY='W'; M=-12,-16,-33,-18,-17, -9,-19,-23, 2,-12, -7, -4,-14,-19,-13,-16,-16,-11, -4, 15, 0,-16; /M: SY='N'; M=-11, 23,-24, 12, 7,-27, -8, 16,-21, 3,-26,-12, 35,-16, 22, 4, 5, -5,-30,-32,-14, 14; /M: SY='Y'; M=-15,-13,-16,-20,-18, 10,-27, 13, 2,-19, -2, 2, -3,-24,-14,-15,-13,-11, -4,-15, 15,-18; /M: SY='H'; M= -3, -5,-23, -7, -2,-17,-18, 13,-17, 5,-17, -5, -3,-15, 6, 1, -1, -3,-12,-20, 3, 1; /M: SY='S'; M= 1, -4, 0, -8, -8,-15,-10,-13,-10,-15,-15,-12, 5,-18, -7,-14, 18, 8, -6,-37,-17, -8; /M: SY='H'; M=-12, 21,-28, 29, 8,-29,-13, 40,-32, -5,-23,-15, 12,-14, 3, -7, -3,-13,-26,-33, -3, 3; /M: SY='H'; M=-11, -8,-24,-10, 2, -9,-24, 3, -2, -6, -2, 3, -7,-17, -2, -4, -9, -6, -4,-22, 1, -2; /M: SY='I'; M= -5,-12,-26,-18,-10,-15,-26, 4, 5, -9, -4, 4, -6,-16, 1,-10, -7, -4, 0,-23, -1, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /I: I=-5; MD=-24; /M: SY='R'; M= -4,-11,-19,-14, -7,-11,-15, -7, -8, 8, -7, 0, -6,-15, 0, 25, -6, -6, -3,-16, -8, -6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; /M: SY='N'; M= -9, 11,-18, 8, 4,-13,-11, 3,-15, 1,-15,-10, 13,-12, 5, 3, 2, 2,-16,-18, -2, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='L'; M= -8,-20,-19,-22,-14, 0,-26,-16, 13,-20, 26, 12,-19,-21, -8,-15,-16, -2, 6,-19, -2,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='R'; M= -8, -7,-24, -8, 1,-20,-15, -4,-24, 25,-18, -9, -1,-15, 6, 44, -6, -8,-15,-18,-10, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='K'; M= -5, 0,-26, -1, 7,-27,-15, -7,-23, 27,-24, -9, 2, -1, 11, 15, -5, -8,-19,-20,-12, 9; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='P'; M= 1, -1,-28, 3, 4,-28, -4, -2,-26, -1,-24,-16, -3, 13, -3, -9, -3,-10,-23,-27,-18, -1; /M: SY='G'; M= -6, 3,-28, -1,-11,-23, 31, -8,-29,-12,-28,-19, 15, -7,-12,-13, 0,-12,-29,-24,-19,-13; /M: SY='E'; M=-11, 1,-25, 1, 8,-18,-12, 7,-20, -1,-10, -9, 4,-17, 2, 7, -4, -8,-19,-28,-10, 3; /M: SY='S'; M= 4, -6,-17,-11,-12,-17, 1,-18,-11, -8,-15, -9, -1,-16,-12,-11, 8, 8, -2,-28,-16,-12; /M: SY='G'; M= -4, -8,-25, -9, -6,-22, 6,-14,-19, -1,-15, -8, -3,-16, -1, -4, 0, -4,-15,-23,-15, -4; /M: SY='Y'; M=-18,-21,-30,-24,-20, 19,-31, 7, 9,-11, 3, 4,-18,-27,-10, -7,-19,-10, -2, 14, 54,-20; /M: SY='R'; M= -9, -9,-24, -9, -2,-18,-18,-10,-18, 18,-14, -7, -4,-17, 2, 26, -3, -4, -9,-24,-11, -2; /M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-29,-25, -1,-32,-24, 34,-24, 15, 13,-14,-23,-20,-23,-15, -7, 25,-25, -5,-25; /M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-14, -5,-18,-22,-15,-13,-12,-17,-13,-21, 61,-11,-19,-14,-10,-23,-22,-13,-12; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M=-13, -5,-22,-11, -6, 1,-20, -8,-18, 7,-14, -9, 2,-18, -4, 18, -3, 5,-13,-18, -3, -6; /M: SY='G'; M= -2, -7,-28, -8,-11,-29, 42,-16,-34, -8,-27,-16, 0,-17, -7,-10, 1,-12,-26,-21,-24, -9; /M: SY='G'; M= -8,-14,-31,-15,-18,-12, 34,-10,-32,-15,-23,-15, -5,-22,-17, -8, -8,-19,-25, -2,-12,-17; /M: SY='L'; M=-13,-30,-11,-32,-24, 7,-29,-21, 8,-27, 21, 6,-29,-30,-20,-22,-28,-14, 0, 13, 8,-22; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29; /M: SY='E'; M=-10, 9,-25, 7, 20,-21,-16, -3,-22, 9,-16,-13, 11,-12, 7, 9, -1, -2,-21,-29,-15, 13; /M: SY='Y'; M=-15,-27,-27,-27,-21, 18,-29, -6, 8,-21, 23, 8,-27,-30,-16,-16,-27,-12, -2, 19, 34,-20; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-34,-30, 8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30; /M: SY='S'; M= 5, -5, 5, -8, -8,-16,-10,-16,-14,-13,-21,-15, 1,-15, -8,-13, 26, 20, -2,-38,-18, -8; /M: SY='C'; M= 4,-15, 50,-22,-21,-22, -2,-24,-28,-19,-20,-17,-12,-28,-21,-18, -4,-10,-13,-35,-26,-21; /M: SY='P'; M= 2,-18,-34,-12, -2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 71,-10,-20, -6, -8,-24,-28,-28,-10; /M: SY='H'; M=-14, 26,-24, 13, 0,-20, -7, 42,-24, -4,-26,-13, 42,-20, 4, 0, 3, -7,-30,-36, -6, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 12, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22; /M: SY='F'; M= -7,-23,-17,-29,-20, 25,-26,-20, 6,-25, 23, 6,-20,-25,-23,-18,-15, 2, 4,-13, 6,-20; /M: SY='G'; M= -9, -9,-28, -9,-18, -1, 29,-14,-27,-19,-18,-15, -4,-22,-21,-18, -6,-16,-21,-11, -6,-19; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='I'; M= -4,-28,-13,-35,-28, -2,-34,-29, 34,-27, 15, 13,-22,-23,-22,-27,-16, -7, 28,-24, -6,-28; /M: SY='I'; M=-10,-26,-11,-33,-27, -3,-22,-24, 17,-24, 8, 13,-22,-25,-18,-24,-19,-12, 10, -6, -4,-24; /M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -5, 14,-18,-22,-12, -1, -7, -9, -6, -6,-11, 4,-11, 2, -3, -3,-29,-13, 7; /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26, 17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,108, 48,-20; /M: SY='I'; M= -7,-22, -8,-29,-22, -4,-30,-25, 21,-25, 12, 8,-16,-22,-18,-23, -9, 1, 14,-27, -7,-22; /M: SY='G'; M= -1,-11,-27,-12,-18,-22, 42,-20,-32,-18,-27,-19, -3,-19,-16,-18, 3, -8,-24, -6,-20,-16; /M: SY='Y'; M=-16,-28,-27,-31,-24, 33,-30, -9, 9,-23, 15, 6,-24,-29,-22,-18,-24,-11, 0, 16, 36,-24; /M: SY='A'; M= 27,-13,-12,-21,-13, -3, -9,-19, -6,-15, -2, -6,-11,-15,-14,-18, 5, 4, 1,-19,-11,-13; /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-31,-22, 10,-31,-23, 20,-27, 28, 13,-26,-14,-22,-22,-23, -9, 11,-19, -1,-23; /I: I=-6; MD=-30; /M: SY='V'; M= 9,-20,-14,-25,-19, -4,-18,-18, 16,-16, 11, 14,-19,-19,-14,-17, -9, -4, 18,-20, -8,-17; D=-6; /I: I=-6; MD=-30; /M: SY='T'; M= 10,-10,-13,-17,-13, -3, -9,-18, -3,-14, -6, -6, -6,-13,-13,-15, 7, 11, 1,-19, -8,-13; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30; /M: SY='W'; M=-17,-24,-38,-24,-13, 2,-22,-12,-16, -9,-16,-11,-22,-11, -1, -6,-22,-18,-24, 52, 17, -6; /M: SY='N'; M= -6, 14, -8, 12, 7,-24, -9, 8,-26, -6,-27,-19, 18,-15, 1, -7, 14, 1,-21,-39,-16, 3; /M: SY='W'; M= -4,-26,-24,-28,-19, 4,-23,-20, 4,-19, 11, 3,-25,-25,-13,-17,-19,-11, 3, 13, 3,-15; /M: SY='P'; M= -8,-16,-30,-13, 0, -7,-22,-10,-11,-10, -9, -8,-16, 21, -4,-13,-11, -9,-17,-16, -3, -4; /M: SY='A'; M= 16,-19,-17,-25,-21, -4, -2,-23, 1,-19, -4, -3,-15,-19,-21,-21, -3, -6, 9,-19,-12,-21; /M: SY='Y'; M= -4,-26,-24,-29,-23, 11,-26,-15, 11,-20, 9, 4,-24,-26,-19,-19,-18, -9, 8, 12, 19,-22; /M: SY='L'; M= 10,-20,-18,-23,-15, -7,-12,-18, 0,-15, 14, 3,-18,-22,-14, -9,-11, -7, 2,-21,-10,-15; /M: SY='F'; M=-15,-27,-18,-35,-28, 60,-29,-21, 2,-27, 8, 0,-19,-28,-35,-19,-14, -2, 6, 1, 21,-28; /M: SY='A'; M= 14,-20,-17,-26,-16, 0,-17,-20, 7,-21, 14, 4,-17,-19,-16,-20, -7, -4, 6,-20, -7,-16; /M: SY='F'; M= -9,-24,-21,-30,-25, 14,-19,-23, 14,-26, 14, 7,-19,-24,-24,-21,-14, -4, 11,-16, 1,-25; /M: SY='F'; M=-15,-30,-26,-35,-28, 35,-26,-19, 4,-22, 3, 5,-27,-29,-26,-18,-23,-13, 3, 33, 22,-25; /M: SY='T'; M= -2,-14,-14,-19,-18, 1,-14,-22, 1,-17, -6, -4, -9,-19,-18,-16, 7, 16, 10,-25, -8,-18; /M: SY='L'; M= -9,-26, -8,-32,-25, 15,-31,-24, 16,-26, 18, 8,-22,-27,-25,-21,-16, -2, 17,-19, 1,-25; /M: SY='C'; M= 8,-11, 49,-20,-18,-18,-18,-23,-20,-19,-17,-16,-10,-24,-18,-21, 7, 8, -6,-38,-22,-18; /M: SY='N'; M= -9, 7,-21, -3, -4, -7,-14, -3, -8, -8,-15, -8, 19,-18, 3, -6, 4, 0,-15,-26, -8, -1; /M: SY='L'; M=-10,-18,-21,-25,-19, 2,-24,-11, 19,-20, 28, 28,-15,-25,-11,-16,-21, -9, 7,-22, -2,-16; /M: SY='T'; M= -1,-12,-20,-16,-13, -6, -3,-13,-10,-13, -8, -6, -9,-19, -8,-13, 0, 3, -5,-17, -2,-11; /M: SY='P'; M= 6,-16,-24,-20,-13,-15,-16,-21, 1,-15, -6, -3,-14, 12,-12,-20, -3, 2, -2,-24,-16,-15; /M: SY='R'; M=-15,-19,-30,-21,-12, -1,-21,-13,-13, 0,-13, -8,-11,-22, -4, 18,-12,-10,-13, 14, 3, -9; /M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-18, -9,-20, 0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 14, 2, -1,-22,-20, -9; /M: SY='M'; M= -1,-13,-21,-16, -7, -8,-19,-12, -6, 1, -5, 2, -9,-17, -1, 1, -5, -5, -3,-20, -6, -4; /I: E1=0;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 57 in 57 different sequences |
| Number of true positive hits | 57 in 57 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 10 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 85.07 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
57 sequences
CHO2_CANAL (Q59LV5), CHO2_CANAW (C4YL78), CHO2_CANDC (B9WL59), CHO2_CLAL4 (C4Y206), CHO2_DEBHA (Q6BY28), CHO2_LODEL (A5DS78), CHO2_PICST (A3LQW6), DET2_ARATH (Q38944), DET2_BRADI (I1HTF7), DET2_GOSHI (Q2QDF6), DET2_SOLLC (Q5K2N1), DFG10_YEAST (P40526), ENCR_TRYB2 (Q57ZC7), PLMT_EMENI (C8VRV0), PPRD1_ARATH (Q9CAH5), PPRD1_ORYSI (A2XWN6), PPRD1_ORYSJ (Q7XUH5), PPRD2_ARATH (Q9SI62), PPRD2_ORYSI (B8B6G5), PPRD2_ORYSJ (Q7F0Q2), S5A1_BOVIN (A5PJS2), S5A1_HUMAN (P18405), S5A1_MACFA (Q28891), S5A1_MOUSE (Q68FF9), S5A1_RAT(P24008), S5A2_HUMAN (P31213), S5A2_MACFA (Q28892), S5A2_MOUSE (Q99N99), S5A2_PIG(O18765), S5A2_RAT(P31214), SR5A3_AILME (D2HBV9), SR5A3_CAEBR (A8X8R3), SR5A3_CAEEL (Q17428), SR5A3_DANRE (Q5RIU9), SR5A3_DROME (Q9VLP9), SR5A3_HUMAN (Q9H8P0), SR5A3_MESAU (C7T2J9), SR5A3_MOUSE (Q9WUP4), SR5A3_RAT (Q5RJM1), SR5A3_XENLA (Q8AVI9), SR5A3_XENTR (Q0P4J9), TECRL_BOVIN (Q3SZ89), TECRL_HUMAN (Q5HYJ1), TECRL_MOUSE (Q8BFZ1), TECR_ARATH (Q9M2U2), TECR_BOVIN (Q3ZCD7), TECR_CAEEL (Q9N5Y2), TECR_DICDI (Q55C17), TECR_HUMAN (Q9NZ01), TECR_MOUSE (Q9CY27), TECR_RAT(Q64232), TECR_YEAST (Q99190), USTE_USTVR (A0A1B5L6A5), YFP9_SCHPO (O14264), YFY8_SCHPO (Q9UT20), YJD4_SCHPO (O74507), YN67_SCHPO (O94511)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
10 sequences
PEMT1_DICDI (Q54SD5), PEMT2_DICDI (Q54H80), PEMT_BOVIN (Q7YRH6), PEMT_HUMAN (Q9UBM1), PEMT_MOUSE (Q61907), PEMT_RAT(Q08388), PLMT_ARATH (Q9SAH5), PLMT_NEUCR (Q7S5W9), PLMT_SCHPO (O74827), PLMT_YEAST (P05375)» more |
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
7BW1 |