PROSITE entry PS50252

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50252
Entry name [info]	TBOX_3
Accession [info]	PS50252
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00972
Associated ProRule [info]	PRU00201

Name and characterization of the entry

Description [info]

T-box domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=180;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=175;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3213; R2=0.01478616; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=554; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=418; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-21,-19, -6,  0,-21,-16,  7,-22, 30,  9,-21,-23,-12,-16,-19, -8,  1,-23, -6, -9;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-14,  4,  8,-23,-18,  4,-16, -7,-15,-10,  1,-13,  2,-10,  0, -4,-13,-31,-12,  4;
/M: SY='N';  M= -8, 23,-22, 19,  5,-25, -5, -2,-24, -2,-24,-18, 24,-13,  3, -5,  9,  7,-23,-34,-18,  4;
/M: SY='R';  M= -9,  3,-25,  6,  9,-27,-15, -4,-25, 16,-24,-11,  3,-12, 13, 18,  3, -4,-18,-27,-14, 10;
/M: SY='E';  M= -9, 13,-29, 19, 26,-30,-14, -5,-28,  9,-25,-20,  5,  6,  6, -1, -1, -6,-26,-31,-20, 15;
/M: SY='L';  M= -9,-24,-21,-24,-13, -1,-28,-15, 13,-21, 31, 15,-24,-26, -6,-14,-22, -9,  7,-21, -3,-10;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-46,-40,-30, 19,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,132, 30,-21;
/M: SY='B';  M= -3,  9,-23,  7,  5,-25,-12, -3,-20,  6,-18,-10,  9,-14,  9,  5,  2, -4,-18,-28,-14,  7;
/M: SY='K';  M= -9, -7,-26, -7,  6,-21,-21, -8,-14, 15,-10, -3, -5,-14, 12, 11, -7, -5,-13,-22, -9,  8;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-10,-38,-29, 66,-30,-21,  0,-30, 12,  1,-21,-31,-37,-21,-20,-10,  0,  3, 23,-29;
/M: SY='H';  M=-14, -4,-22, -7, -5,-13,-20, 54,-17,-13,-14, -1,  6,-20,  2, -6, -5,-12,-18,-29,  9, -5;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-28,  3, 14,-26, -7, -5,-25,  3,-22,-15,  1,  2,  8,  0,  1, -8,-24,-25,-15, 10;
/M: SY='L';  M=-11,-13,-16,-13,-11, -6,-27, -7,  7,-19, 10,  4,-14,-22,-12,-18,-16,-10,  2,-23,  1,-13;
/M: SY='G';  M= -6, -6,-27, -7,-13,-23, 20, -7,-20,-13,-18,-10, -1,-18,-11,-14, -2, -9,-15,-24,-16,-13;
/I:         I=-6; MD=-33;
/M: SY='T';  M= -4,  8,-13, -3, -8,-10,-13, -7, -8, -6,-11, -3, 14,-13, -5, -6, 10, 24, -7,-28,-10, -6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='M';  M= -9,-19,-20,-27,-16, -4,-21, -2, 16, -9, 15, 49,-19,-20,  4, -9,-17, -9,  9,-21, -2, -6;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-21,-33,-27, -1,-33,-27, 36,-24, 15, 18,-22,-22,-21,-23,-14, -2, 31,-24, -4,-26;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-13,-15,-15,  2,-23,-18, -4,-13, -5, -6, -6,-15,-15,-12, 10, 35,  4,-22,  1,-15;
/M: SY='K';  M=-10,  5,-27,  1,  5,-25,-17, -7,-24, 35,-27,-11,  9,-14,  6, 25, -6, -8,-18,-24,-12,  5;
/M: SY='N';  M=  1, 14,-18, 10,  3,-23, -5, -4,-22,  3,-28,-18, 21,-13,  2, -2, 18,  6,-18,-35,-18,  3;
/M: SY='G';  M= -2, -9,-17, -9,-12,-29, 52,-19,-38,-18,-28,-20, -2,-20,-17,-19, -1,-18,-28,-24,-29,-14;
/M: SY='R';  M=-19,-11,-18,-12, -2,-20,-21, -2,-30, 25,-20,-11, -2,-22,  7, 62,-10,-10,-19,-22,-12, -2;
/M: SY='R';  M=-16,-10,-28,-10, -1,-20,-21, -5,-23, 28,-18, -8, -3,-19,  7, 52,-10, -9,-13,-21,-10, -1;
/M: SY='M';  M=-11,-25,-22,-33,-23, 11,-26,-11, 23,-20, 25, 39,-22,-23,-12,-16,-22,-10, 12,-17,  3,-18;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='T';  M=  3,-10,-16,-14, -9,-11,-17,-17, -6, -3, -5, -4, -9,-16, -7, -7,  2, 11,  1,-24,-10, -8;
/M: SY='L';  M= -5,-25, -8,-27,-19,  2,-26,-19,  8,-23, 20,  7,-25,-16,-20,-20,-19, -8,  6,-21, -2,-20;
/M: SY='K';  M= -3,  0,-25,  0, 12,-26,-15,  1,-26, 20,-25,-12,  2,-10,  9, 16,  3, -4,-19,-26,-12, 10;
/M: SY='F';  M=-12,-26,-21,-30,-25, 29,-30,-11, 13,-21, 11,  6,-23,-29,-24,-18,-18, -7, 12,  0, 29,-25;
/M: SY='N';  M= -4,  5,-20,  0,  3,-20,-13, -8,-16,  7,-21,-12, 12,-13,  1,  4,  9,  6,-12,-31,-14,  1;
/M: SY='V';  M= -1,-29,-14,-32,-28,  5,-30,-28, 28,-22, 14, 11,-27,-28,-28,-21,-13, -3, 38,-25, -6,-28;
/M: SY='S';  M=  0, -6,-16, -9, -4,-11,-14, -3,-15, -7,-12, -9,  0,-15, -4, -1, 12, 12, -9,-29, -9, -4;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-29, -6,-17,-29, 60,-16,-37,-17,-30,-20,  8,-20,-17,-17,  1,-17,-30,-23,-29,-17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-21,  9,-30,-20, 21,-29, 46, 22,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='D';  M=-15, 28,-27, 38, 15,-30,-15, -1,-25, -2,-21,-20, 13,-12,  1, -9,  0, -6,-19,-36,-17,  8;
/M: SY='P';  M= -1,-14,-30, -9,  1,-25,-16,-18,-18, -6,-24,-16,-13, 49, -7,-15, -1, -2,-21,-29,-24, -6;
/M: SY='B';  M= -5, 12,-23, 10,  0,-15,-14,  2,-17, -2,-17,-11, 10,-16, -4, -6, -1, -4,-15,-26, -6, -3;
/M: SY='A';  M=  9, -7, -4,-10, -5,-21,-14,-16,-17,  6,-15,-10, -7,-15, -5, -3,  0, -2, -8,-27,-16, -5;
/M: SY='L';  M=-11,-16,-11,-18,-12, -6,-24, -9,  0, -9, 14, 11,-15,-24, -8, -5,-18, -9, -3,-24, -6,-10;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='S';  M=  4, -9, -1,-13,-10,-12,-14,-14,-10, -8,-13, -7, -4,-18, -9,-11,  9,  6, -3,-29,-12,-10;
/M: SY='M';  M= -3,-25,-17,-31,-24,  8,-26,-18, 22,-19, 16, 25,-23,-24,-18,-18,-15, -6, 22,-20, -1,-21;
/M: SY='L';  M= -7,-20,-12,-22,-14,  0,-17,-16,  5,-20, 12, 11,-17,-23,-14,-17,-12, -7,  4,-24, -7,-14;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-19,-32,-24, 11,-29,-19, 23,-25, 31, 23,-26,-27,-20,-19,-23, -8, 19,-19,  1,-22;
/M: SY='D';  M=-18, 19,-17, 27, 12,-30,-17, 24,-34, -1,-24,-17,  9,-15,  5,  1, -5,-13,-27,-34, -9,  7;
/M: SY='F';  M=-13,-29,-21,-36,-27, 33,-31,-20, 19,-26, 20, 17,-23,-27,-26,-21,-20, -9, 15,-10, 10,-26;
/M: SY='V';  M= -2, -2,-20,  1, -6,-17,-21,-17,  2,-11, -6, -5, -9,-18,-11,-16, -4, -3, 11,-30,-13, -9;
/M: SY='P';  M= -2,-16,-24,-13, -5,-22,-19,-18,-12, -6,-16,-11,-15, 33, -9,-13, -7, -7,-13,-28,-21, -9;
/M: SY='V';  M=  6,-14,-15,-16,-15, -7,-20,-20,  5,-15,  4,  0,-14,-20,-16,-15, -3,  3, 13,-26,-10,-16;
/M: SY='D';  M=-13, 37,-25, 48, 14,-34, -4, -1,-34, -2,-30,-26, 21,-11,  0, -9,  8, -4,-27,-39,-20,  7;
/M: SY='D';  M= -6, 22,-25, 25,  9,-28, -6, -3,-26, -1,-26,-20, 18, -1, -1, -8,  6, -4,-24,-35,-20,  3;
/M: SY='H';  M=-13, -6,-17,-10, -6, -4,-21, 22,-20,  2,-15, -6, -1,-21, -3,  3, -9,-11,-17,-18, 10, -6;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-28, -8,  1,-21,-20,  0,-28, 29,-21,-10,  0,-18,  8, 55, -8, -5,-19,-21, -9,  1;
/M: SY='Y';  M=-19,-20,-30,-21,-18, 28,-26, -3, -6,-16, -1, -4,-20,-27,-14,-13,-21,-13,-12, 32, 41,-16;
/M: SY='K';  M=-11, -2,-28, -1, 12,-28,-18, -5,-28, 33,-26,-11,  1,-12, 15, 31, -4, -8,-21,-22,-12, 12;
/M: SY='F';  M=-20,-27,-27,-32,-26, 53,-29, -5, -2,-21,  3, -2,-22,-30,-26,-16,-22,-12, -7, 31, 50,-25;
/M: SY='N';  M= -2,  7,-17,  1, -5,-18,-12,  2,-12, -8,-18,-11, 13,-18, -2, -8,  5,  0,-11,-27,-12, -4;
/M: SY='N';  M=-12,  9,-26,  4, -3,-16, -1,  8,-26,  4,-24,-14, 17,-19, -2,  6, -2, -9,-24,-24, -6, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -2,  2,-25,  3,  1,-28, 19, -9,-30, -3,-28,-18,  8,-11,  0, -6,  9, -6,-24,-28,-22,  1;
/M: SY='Q';  M= -8,  2,-24,  4, 19,-30,-18, -1,-26, 18,-23,-11,  2,-10, 23, 16, -1, -8,-24,-25,-14, 21;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-18,-18,-22,-13, -7,-25,-18, 14,-15,  7, 11,-16,-19,-10,-16, -7,  2, 16,-25, -8,-12;
/M: SY='P';  M= -4,-10,-23, -8,  2,-18,-21,-16, -4, -6,-13, -9,-10,  8, -8,-12, -3, -1,  0,-30,-18, -5;
/M: SY='A';  M= 11, -7, -1,-14,-13,-14, -2,-15,-16,-13,-16,-13, -4,-17,-12,-16, 10, 10, -8,-24, -9,-13;
/M: SY='G';  M= -5, -2,-28,  2,-11,-27, 35,-16,-30,-12,-21,-16, -1,-19,-15,-14, -4,-15,-21,-24,-23,-13;
/M: SY='K';  M= -7,  1,-25, -1,  5,-25,-17,-10,-24, 31,-27,-11,  4, -9,  5, 19, -2, -1,-16,-25,-12,  5;
/M: SY='A';  M= 18,-12,-19,-15, -8,-21, -5,-18,-12, -9,-15,-10,-10,  5, -7,-14,  5,  2, -6,-24,-19, -9;
/M: SY='E';  M=-10, 14,-27, 23, 32,-30,-17, -3,-26,  6,-22,-18,  3, -7, 12, -2,  2, -6,-21,-32,-18, 22;
/M: SY='P';  M=-10, -4,-31, -4, -1,-19,-14, -8,-20,  2,-26,-15,  2, 28, -6, -5, -5, -8,-24,-27,-17, -6;
/M: SY='H';  M= -8, -2,-15, -3,  6,-23,-19, 18,-22,  2,-19, -8,  0,-10,  7,  0, -2, -6,-19,-29, -7,  5;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='M';  M= -8,-12,-25,-11, -3,-15,-22,-11, -2, -4, -2,  7,-13,  0, -1, -6,-11, -7, -4,-24,-11, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -8,-10,-28, -4,  5,-16,-14,-13,-17, -6,-18,-14,-11, 38, -6,-12, -6, -8,-21,-22,-18, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -2, -1,-17, -1, -1,-24, -4,-11,-22,  2,-26,-16,  4,  7, -2, -5,  7,  0,-19,-29,-19, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-12, -7,-17, -6,  4,-23,-19, -8,-27, 17,-23,-13, -3, -6,  4, 28, -3, -3,-19,-26,-15,  2;
/M: SY='V';  M= -5,-18,-13,-23,-18,  4,-24,-18,  6,-10,  3,  7,-16,-22,-16,-11, -7,  2, 12,-21, -2,-17;
/M: SY='Y';  M=-11,-21,-24,-24,-21, 26,-26,  2,  4,-16,  3,  2,-18,-26,-16,-15,-14, -7, -1,  7, 41,-20;
/M: SY='I';  M= -7,-26,-14,-29,-21, -1,-29,-23, 17,-21,  9,  9,-25,-25,-19,-20,-18, -9, 16, -5, -2,-21;
/M: SY='H';  M=-17, -2,-29, -3, -2,-19,-20, 84,-24,-11,-18,  0,  8,-19,  7, -3, -7,-17,-25,-30, 16, -2;
/M: SY='P';  M= -5,-17,-33,-11, -2,-25,-18,-13,-17,-11,-22,-15,-16, 60, -9,-18, -6, -6,-23,-29,-24, -9;
/M: SY='D';  M= -9, 29,-25, 38, 11,-32, -4, -3,-30, -3,-24,-19, 14,-12,  1,-10,  4, -7,-23,-35,-19,  6;
/M: SY='S';  M=  2, -4,-15, -5, -2,-21,  5,-13,-20, -9,-24,-16,  3,-13, -4, -8, 19,  6,-13,-33,-20, -4;
/M: SY='P';  M= -8,-22,-23,-19,-11,-20,-25,-23, -2,-17,-16, -9,-19, 43,-14,-22,-10, -8, -9,-30,-22,-17;
/M: SY='A';  M=  8,  0,-21, -5,  5,-19,-11, -7,-19,  5,-16,-11,  4,-13,  3,  7,  2, -4,-15,-24,-15,  3;
/M: SY='T';  M= -4, -2,-17,-10, -8, -5,-17,-13,-12, -5,-13, -7,  2, -8, -8, -5, 10, 21, -7,-26, -8, -8;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20, -1,-17,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 11,  6,-20,  7, 11,-20,-10,-10,-22,  0,-18,-16,  0, -9,  0, -8,  5, -4,-15,-25,-16,  6;
/M: SY='H';  M=-13,  3,-30,  6,  5,-23,-18, 23,-24,  0,-17, -8,  0,-16, 10, -1, -9,-12,-24,-10,  1,  7;
/M: SY='W';  M=-19,-38,-44,-39,-29, 15,-22,-28,-14,-22, -9,-14,-37,-30,-21,-20,-37,-26,-23,119, 26,-21;
/M: SY='M';  M=-10,-19,-20,-28,-19, -1,-20, -2, 17, -9, 18, 52,-18,-20, -1, -8,-17, -6,  8,-21, -1,-10;
/M: SY='K';  M= -4, -2,-24, -5,  1,-21,-14, -8,-22, 18,-21,-11,  3,-14,  5, 17,  2,  0,-16,-20,-11,  2;
/M: SY='Q';  M= -5, -1,-25,  0,  7,-25,-10,  0,-22,  6,-18, -9,  2,-14, 16,  8,  1, -6,-20,-24,-11, 11;
/M: SY='P';  M= -6,-10,-28, -8, -7,-20,-10,-18, -9,-13,-15,-11, -9, 21,-13,-18, -5, -4,-10,-29,-20,-12;
/M: SY='V';  M= -3,-29,-18,-33,-29,  0,-32,-28, 35,-23, 14, 17,-25,-25,-24,-23,-14, -4, 39,-26, -6,-28;
/M: SY='S';  M=  3,  8, -4, 10,  5,-24, -6, -9,-24, -8,-27,-21,  9,-12, -1,-11, 23,  8,-15,-39,-21,  2;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-20,-39,-29, 75,-29,-19,  1,-29, 11,  4,-20,-29,-37,-19,-20,-10,  1,  8, 28,-29;
/M: SY='D';  M= -9, 14,-26, 20, 13,-30, -4, 14,-31, -2,-26,-17, 10,-12,  8, -5,  4, -8,-26,-32,-13, 10;
/M: SY='K';  M= -8,  5,-28,  7,  9,-29,-17, -7,-28, 32,-25,-10,  2,-11,  9, 22, -7, -9,-20,-23,-12,  9;
/M: SY='L';  M= -5,-28,-17,-30,-24,  9,-29,-23, 22,-25, 27, 14,-27,-28,-24,-20,-19, -4, 23,-21, -2,-24;
/M: SY='K';  M=-11,  0,-28, -2,  6,-20,-19, -9,-27, 39,-26,-10,  3,-13,  6, 26, -9, -9,-19,-19, -8,  6;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 17,-20,  0,-24;
/M: SY='T';  M= -1, -2,-11,-11,-11, -4,-19,-19,-10,-11,-10,-10, -1,-11,-11,-11, 19, 43, -1,-28, -8,-11;
/M: SY='N';  M= -8, 34,-18, 16, -1,-19, -1,  6,-19, -2,-29,-19, 52,-18, -1, -2, 13,  5,-26,-39,-19, -1;
/M: SY='N';  M= -8, 18,-17,  6, -3,-18, -9,  1,-16,  3,-24,-15, 32,-19, -1,  3,  6, -1,-20,-33,-14, -3;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='E';  M= -2, -8,-22, -9,  1,-16,-18,  1, -7, -5, -8, -4, -6, -1, -1, -8, -4, -3, -9,-23, -8, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='L';  M= -6,-15,-22,-15, -3, -7,-21,-13,  0,-10,  9,  4,-14,-19, -4, -8,-10, -5, -2,-23, -7, -3;
/M: SY='D';  M=-14, 33,-27, 41, 19,-32, -9,  0,-31,  0,-29,-25, 21, -3,  2, -7,  4, -6,-29,-38,-21, 10;
/M: SY='K';  M= -8,  6,-26,  6,  1,-27,  0,-10,-27, 10,-26,-15,  7, -6, -1,  2,  0, -3,-21,-27,-18,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 13,-23,  8, -2,-17, -6, 11,-19, -8,-21,-13, 20,-17,  0, -7,  4, -4,-20,-31,-10, -2;
/M: SY='G';  M=  4, -4,-26, -6, -9,-27, 40,-15,-33,-11,-26,-18,  3,-17,-11,-10,  2,-13,-25,-23,-25,-11;
/M: SY='H';  M=-10, -4,-24, -5,  2,-15,-17, 29,-21, -2,-18, -5,  2,-16, 14,  1,  2, -5,-20,-24,  3,  6;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-23,-34,-27, -1,-35,-28, 38,-26, 16, 15,-21,-22,-21,-25,-14, -2, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='I';  M=-11,-21,-14,-26,-18, -2,-31, -5, 18,-20,  6, 13,-16,-22,-13,-19,-15,-10, 13,-23,  1,-18;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 46, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='N';  M=-10, 16,-23,  6, -2,-17, -9, 18,-17, -7,-18,-11, 29,-12,  0, -5,  2, -4,-23,-34,-11, -2;
/M: SY='S';  M=  7, -4,-14, -4, -3,-19, -6,-13,-14,-11,-25,-17,  5, -3, -3,-12, 31, 17, -8,-37,-19, -3;
/M: SY='M';  M=-12,-17,-23,-22,-12, -7,-21,  6,  7, -7, 13, 37,-15,-20,  6, -2,-17,-11,  0,-21, -1, -4;
/M: SY='H';  M=-18, -3,-17, -4, -4,-16,-21, 75,-26,-11,-18, -2,  5,-21,  4, -4, -8,-13,-25,-27, 18, -4;
/M: SY='K';  M=-12, -4,-29, -5,  5,-25,-20, -7,-26, 40,-24, -5, -2,-13,  9, 37,-11,-10,-18,-20, -9,  6;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-21,-21, 34,-30, 17,  0,-11,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 76,-21;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-27, -4, 12,-27,-22, -1,-11,  3,-11, -1, -2,-12, 29,  3, -2, -3,-18,-23,-10, 20;
/M: SY='P';  M=-10,-21,-39,-12, -2,-28,-22,-21,-15,-12,-26,-17,-20, 82,-11,-21,-11,-10,-25,-29,-28,-12;
/M: SY='R';  M=-15,-16,-26,-16, -8,-14,-23, -8,-12, 15,-11, -4, -8,-22,  0, 44,-11, -8, -2,-22, -9, -8;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-20,-35,-27, 20,-32,-24, 25,-27, 25, 15,-25,-27,-26,-22,-21, -8, 21,-16,  4,-26;
/M: SY='H';  M=-15,  1,-26,  2, -1,-20,-19, 59,-24, -6,-19, -4,  6,-18,  4, -1, -5, -9,-20,-30,  8, -2;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-36,-28,  2,-36,-28, 40,-27, 23, 17,-24,-24,-23,-26,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='V';  M= -8,-26,-19,-28,-26, 11,-31,-12, 22,-18,  8,  8,-25,-29,-22,-18,-15, -5, 27, -8, 23,-26;
/M: SY='R';  M=-14, -1,-30,  3, 26,-24,-21,  1,-27, 19,-20,-12, -1,-11, 17, 27, -6,-10,-24,-21, -8, 20;
/M: SY='V';  M=  8,-17,-12,-20,-15,-11,-13,-19,  2,-11, -1,  3,-15,-20,-12,-12, -1, -1, 11,-26,-13,-14;
/M: SY='D';  M= -6, 14,-25, 19,  3,-29, -2, -7,-24, -6,-25,-18,  8, -4,  0,-10,  5, -4,-19,-33,-20,  1;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='D';  M= -8, 12,-17, 14,  5,-24, -4, -3,-24, -5,-21,-17, 10, -8, -2, -8,  3, -5,-22,-32,-18,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='D';  M= -7,  4,-25,  7,  4,-22, -8, -8,-16, -4,-16,-12,  3, -5, -2, -3,  0, -6,-15,-28,-16,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='H';  M= -5, -1,-12, -2, -1,-14, -1,  3,-17, -5,-13, -8,  3,-14, -2, -5,  0, -6,-15,-21, -8, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='B';  M= -3,  1,-18,  1, -1,-17, -7, -6,-11, -1,-13, -2,  0,  0, -1, -5,  0, -2,-10,-22,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L';  M= -6,-12,-14,-13, -6,  4,-15, -9,  1,-11,  5,  1,-10, -8, -5, -9, -6, -4, -1,-12, -1, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='P';  M= -5,  0,-12,  2,  4,-17, -5,  2,-16, -4,-15, -9, -1,  6,  3, -6,  1, -5,-15,-18,-10,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M= -1,  2,-15,  2, 10,-16, -9, -5,-13,  2,-14, -8,  2, -6,  4, -1,  7,  3,-10,-21,-11,  7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='Q';  M=-10, -4,-25, -5,  2,-11,-18, -3,-11,  1, -7, -1, -4,-13,  5, -2, -8, -6,-14, -8,  1,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-25, -5,  7,-23,-12,  1,-18,  4,-17, -7, -1,-13, 10,  8,  1, -4,-16,-25,-11,  7;
/M:         M= -5, -6,-23, -9, -5,-12,-13, -7,-10, -3, -5, -3, -3,-17, -5, -1, -5, -1, -9,-21, -4, -6;
/M: SY='V';  M=-10,-25,-19,-30,-25, 19,-30,-15, 17,-22, 13,  8,-20,-28,-25,-17,-16, -7, 20,-16,  6,-25;
/M: SY='K';  M=  0, -6, -6,-10, -3,-22,-15, -4,-22,  8,-19,-10, -3,-16,  1,  6,  0, -2,-13,-27,-12, -2;
/M: SY='T';  M=  2, -1,-13, -6, -1,-16,-15,-14,-13, -6,-15,-11,  0,-10, -1, -7, 19, 29, -5,-30,-13, -1;
/M: SY='F';  M= -5,-19, -9,-26,-20, 27,-23, -2, -7,-19, -2, -4,-14,-25,-21,-16,-10, -4, -4, -5, 19,-20;
/M: SY='T';  M= -2,-10,-17,-12, -9,-15,-18,-15, -8,  2,-14, -7, -6,-15, -7,  7,  7, 10,  4,-29,-13, -9;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-21,-39,-29, 68,-31,-21,  5,-30, 15,  3,-21,-29,-37,-21,-21,-10,  3,  5, 25,-29;
/M: SY='P';  M=-10, -8,-34,  0,  7,-29,-18,-15,-23, -3,-28,-19,-11, 55, -4,-11, -4, -5,-27,-30,-25, -2;
/M: SY='E';  M=-12,  5,-30, 13, 44,-22,-21, 12,-26,  6,-18,-15, -1, -6, 16, -1, -3,-11,-28,-23, -4, 29;
/M: SY='T';  M=  1, -1,-11,-10,-10,-11,-17,-17, -9,-10,-10, -5,  1,-11, -8,-10, 18, 40, -1,-30,-11, -9;
/I:         I=-6; MD=-33;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-22, -6, 10,-21,-19, -7, -7,  0,-11, -4, -5,-11, 13,  1,  1, -3, -8,-23,-12, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='I';  M= -7,-23,-23,-32,-25, -2,-33,-24, 33,-23, 13, 18,-17,-19,-16,-23,-11,  3, 23,-23, -3,-24;
/M: SY='A';  M= 27, -5,-10,-14, -8,-17, -7,-18,-12,-10,-13,-12, -4,-10, -8,-15, 18, 20, -2,-26,-17, -8;
/M: SY='V';  M= -1,-29,  1,-30,-30, -2,-30,-30, 25,-21,  7,  7,-29,-31,-30,-21,-10, -1, 45,-32,-12,-30;
/M: SY='T';  M=  1,  0,-10, -9, -9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,  1,-10, -9,-10, 22, 48, -1,-31,-11, -9;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-14,-18, -6,-18, -7,-17, -5,-10, -7, -3,-10,-11, -7,-18,  6, -1,  0,-22,-17, -7;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Q';  M=-12, -2,-30, -2, 15,-35,-20, 12,-23, 15,-21, -2,  1,-12, 44, 21, -3,-11,-28,-21, -8, 28;
/M: SY='N';  M= -9, 33,-21, 16, -1,-21,  5,  6,-22,  1,-30,-19, 51,-19, -1,  0,  8, -2,-29,-37,-20, -1;
/M: SY='Q';  M=-12,  6,-29, 11, 18,-31,-13, 17,-28,  4,-22,-11,  4, -9, 22,  5, -1,-10,-28,-27,-10, 19;
/M: SY='E';  M= -7, -2,-26,  2, 16,-22,-21, -9,-18, 14,-14, -9, -5,-12,  5,  9, -7, -8,-11,-26,-13, 10;
/M: SY='I';  M= -3,-21,-23,-30,-25, -3,-30,-25, 32,-23, 13, 11,-14,-22,-19,-24,-13, -6, 24,-24, -6,-25;
/M: SY='T';  M= -6,  0,-17, -8, -7,-14,-20,-14,-14,  3,-14, -9,  3,-13, -4,  8,  9, 27, -6,-27,-10, -7;
/M: SY='E';  M= -6,  1,-25,  4, 17,-27,-18, -6,-20, 14,-20,-10, -1,-10, 16,  6,  1, -2,-16,-26,-14, 16;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-15,-30,-20,  8,-29,-19, 18,-28, 45, 22,-29,-29,-19,-19,-28,-10,  9,-21, -1,-19;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-26,-30,-22, -4,-34,-26, 30,-19, 13, 12,-16,-18,-16,-20,-14,  0, 19,-22, -3,-22;
/M: SY='D';  M= -6, 12,-25, 16, 12,-26, -6, -7,-26,  5,-20,-16,  8,-12,  1, -2,  1, -7,-21,-30,-17,  7;
/M: SY='N';  M= -8,  5,-22, -4, -8, -9, -4, 13,-13, -6,-15,  1, 15,-20, -3, -6, -1, -6,-17,-24, -2, -6;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-16,-37, -9,  1,-29,-19,-17,-22, -1,-29,-18,-15, 66, -6, -6, -8, -9,-27,-29,-26, -7;
/M: SY='F';  M=-20,-26,-23,-33,-26, 63,-29, -3, -3,-25,  6,  0,-17,-29,-31,-17,-19,-11, -4,  9, 37,-26;
/M: SY='A';  M= 38, -9,  2,-18,-10,-20, -3,-19,-13,-12,-14,-13, -8,-13,-10,-19, 13,  2, -3,-26,-21,-10;
/M: SY='K';  M=-12, -3,-29, -3,  6,-26,-20, -8,-29, 40,-26,-10,  0,-13,  9, 38, -8, -6,-19,-21,-10,  6;
/M: SY='G';  M=  3, -8,-26,-10,-16,-26, 44, -8,-33,-17,-25,-16,  0,-18,-15,-17,  2,-11,-24,-22,-22,-16;
/M: SY='F';  M=-17,-20,-20,-26,-22, 58,-26,-17, -5,-25,  4, -4,-14,-26,-32,-18,-14, -8, -3,  0, 20,-23;
/M: SY='R';  M=-18,-14,-28,-14, -4,-14,-22, -4,-19, 17, -5, -4, -6,-22,  4, 51,-14,-10,-14,-20, -8, -4;
/M: SY='D';  M=-13, 23,-30, 32, 21,-34, -8, -4,-34, 14,-28,-21, 11, -9,  5,  3, -2,-10,-27,-31,-18, 13;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	104 in 104 different sequences
Number of true positive hits	104 in 104 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DNA_BIND
Feature description [info]	T-box
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

104 sequences

BRC2_HALRO  (O01409), BYN_DROME   (P55965), EOMES_HUMAN (O95936),

EOMES_MOUSE (O54839), EOMES_XENLA (P79944), H15_DROME   (Q94890), 
MGAP_HUMAN  (Q8IWI9), MGAP_MOUSE  (A2AWL7), OMB_DROME   (Q24432), 
TBR1_HUMAN  (Q16650), TBR1_MOUSE  (Q64336), TBR1_PATPE  (Q9NL40), 
TBX10_HUMAN (O75333), TBX10_MOUSE (Q810F8), TBX11_CAEEL (Q20257), 
TBX12_CAEEL (P90971), TBX15_HUMAN (Q96SF7), TBX15_MOUSE (O70306), 
TBX18_CAEEL (O02073), TBX18_HUMAN (O95935), TBX18_MOUSE (Q9EPZ6), 
TBX19_CANLF (Q5XNS0), TBX19_CHICK (P79778), TBX19_HUMAN (O60806), 
TBX19_MOUSE (Q99ME7), TBX1A_XENLA (Q8AX98), TBX1B_XENLA (Q32NI9), 
TBX1_CAEEL  (O17212), TBX1_DANRE  (Q8AXX2), TBX1_HUMAN  (O43435), 
TBX1_MOUSE  (P70323), TBX1_XENTR  (Q3SA49), TBX20_CHICK (Q8UW76), 
TBX20_DANRE (Q9I9K7), TBX20_HUMAN (Q9UMR3), TBX20_MOUSE (Q9ES03), 
TBX20_XENLA (Q8AXW8), TBX20_XENTR (Q3SA46), TBX21_HUMAN (Q9UL17), 
TBX21_MOUSE (Q9JKD8), TBX22_HUMAN (Q9Y458), TBX22_MOUSE (Q8K402), 
TBX2A_XENLA (Q9IBC8), TBX2B_XENLA (Q6PCL0), TBX2_CAEEL  (Q19691), 
TBX2_CANLF  (Q863A2), TBX2_DANRE  (Q7ZTU9), TBX2_HUMAN  (Q13207), 
TBX2_MOUSE  (Q60707), TBX2_XENTR  (Q3SA48), TBX30_CAEEL (Q9N2K7), 
TBX31_CAEEL (Q9TZL0), TBX32_CAEEL (O61764), TBX33_CAEEL (O45291), 
TBX34_CAEEL (Q9NAH2), TBX35_CAEEL (Q09376), TBX36_CAEEL (Q23622), 
TBX37_CAEEL (Q9U2C9), TBX38_CAEEL (Q9XVD5), TBX39_CAEEL (Q9NA56), 
TBX3_CHICK  (O73718), TBX3_HUMAN  (O15119), TBX3_MOUSE  (P70324), 
TBX3_RAT(Q7TST9), TBX40_CAEEL (Q9NA55), TBX41_CAEEL (Q22813), 
TBX4_CANLF  (Q861Q9), TBX4_HUMAN  (P57082), TBX4_MOUSE  (P70325), 
TBX5A_DANRE (Q9IAK8), TBX5_CHICK  (Q9PWE8), TBX5_HUMAN  (Q99593), 
TBX5_MOUSE  (P70326), TBX5_RAT(Q5I2P1), TBX5_XENLA  (Q9W7C2), 
TBX5_XENTR  (Q3SA47), TBX6L_CHICK (P79779), TBX6L_DANRE (P79742), 
TBX6_BOVIN  (E1BEA8), TBX6_DANRE  (Q8JIS6), TBX6_GORGO  (A1YF56), 
TBX6_HUMAN  (O95947), TBX6_MOUSE  (P70327), TBX6_RAT(D3ZJK7), 
TBX6_XENLA  (Q8AV66), TBX6_XENTR  (Q66JL1), TBX7_CAEEL  (Q95PX3), 
TBX8_CAEEL  (Q22292), TBX9_CAEEL  (Q22289), TBXT1_BRAFL (Q17134), 
TBXT2_BRAFL (P80492), TBXTA_DANRE (Q07998), TBXT_CANLF  (Q9GL27), 
TBXT_CHICK  (P79777), TBXT_HALRO  (P56158), TBXT_HEMPU  (Q25113), 
TBXT_HUMAN  (O15178), TBXT_MOUSE  (P20293), TBXT_PATPE  (Q9U903), 
TBXT_XENLA  (P24781), VEGTA_XENLA (P87377), VEGTB_XENLA (O13161), 
VEGT_XENBO  (Q98UD2), VEGT_XENTR  (Q28HY0)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

65 PDB

1H6F; 1XBR; 2X6U; 2X6V; 4A04; 4S0H; 5BQD; 5FLV; 5QRF; 5QRG; 5QRH; 5QRI;
» more