PROSITE logo

PROSITE entry PS50507


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] RDRP_SSRNA_POS
Accession [info] PS50507
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-NOV-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50507
Associated ProRule [info] PRU00539

Name and characterization of the entry

Description [info] RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile.
Matrix / Profile [info] 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6107; R2=0.020803; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=248; N_SCORE=7.75; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=187; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;

...
 
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -8, -7,-29, -6, -5,-17, -3,-10,-23, -4,-21,-14, -6,  2, -7, -5, -7,-11,-22, -7, -9, -7;
/M:         M= -9,-11,-17,-12,-11, -7,-22, -8, -2, -9, -4,  0,-10,-15,-11,-10,-10, -7,  0,-19, -1,-12;
/M: SY='V';  M=  0,-18, -8,-24,-20,  2,-14,-14,  0,-19,  1,  1,-15,-24,-19,-18, -9, -6,  4,-18, -1,-20;
/M: SY='F';  M=-10,-23,-13,-28,-23, 14,-25,-13,  8,-20,  9,  5,-19,-26,-20,-17,-16, -6,  5, -8, 14,-22;
/M: SY='E';  M=  4,  5,-14,  8, 13,-26, -3, -9,-26, -5,-21,-18,  1, -9, -1,-12,  5, -4,-19,-30,-21,  6;
/M: SY='V';  M= -1, -8,-13,-12,-14, -3,-17,-15, -1,-16, -2, -3, -7,-21,-15,-17, -4, -2,  2,-20, -5,-15;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Y';  M= -6,-18,-19,-23,-20, 13,-16, -9, -1,-17,  1, -1,-15,-23,-17,-16, -9, -1, -3, -3, 20,-20;
/M: SY='S';  M= 11, -2,-13, -5, -1,-19, -6,-13,-18, -5,-23,-16,  3, -9, -2, -6, 24, 17, -8,-33,-17, -2;
/M: SY='K';  M=  2, -4,-13, -7, -2,-26,  1,-11,-26,  7,-23,-13,  0,-16,  2,  6,  1, -7,-18,-25,-18, -1;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-20,-37,-28, 56,-28,-17, -5,-26,  2, -4,-23,-30,-31,-19,-23,-13, -7, 33, 32,-26;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='S';  M=  2, -4,-21, -7,  0,-23, -8,-10,-20,  5,-22,-11, -1,-12,  7,  3, 10,  5,-14,-19,-13,  3;
/M: SY='S';  M=  2, -1,-15, -3, -2,-18, -8, -1,-19, -6,-22,-13,  7,-13,  1, -2, 22, 14,-11,-34,-13, -1;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='M';  M= -8,-16,-20,-18, -8,-14,-26, -6,  7,-11,  4,  9,-14,-19,  8, -9,-11, -8,  3,-23, -5, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M= -3, 10,-17,  9, -1,-22, -5, -6,-22, -8,-23,-17, 10, -9, -3, -9, 15, 14,-16,-34,-16, -2;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='P';  M= -6, -3,-27,  1,  8,-23,-11, -8,-19, -2,-20,-13, -3, 11, -1, -5, -2, -7,-18,-27,-18,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:         M= -1,-11,-19,-13, -4, -2,-19,-11, -9,-10, -4, -5,-11,-17, -7,-10, -7, -6, -7,-11, -1, -6;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='M';  M= -3, -4,-22, -4, -7,-10,-17, -2, -4,-13, -2,  1, -7,-17, -8,-14, -8, -7, -4,-17, -4, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-19,-29,-20,  8,-29,-17, 18,-22, 26, 17,-23,-26,-18,-17,-21, -9, 12,-19,  0,-19;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-24,  1,  7,-19,-14, -3,-18,  3,-14, -9,  3,-15,  5,  5, -3, -6,-17,-22,-11,  6;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='F';  M= -1,-13,-14,-17,-15,  5,-20,-17,  0,-17,  0, -3,-12,-21,-17,-16, -7, -3,  3,-11, -1,-16; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -5, -2,-24,  2, 22,-18,-20, -8,-12, -2, -8, -8, -7,-11,  5, -7, -4, -7,-10,-27,-13, 14;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
/M: SY='M';  M= -3,-12,-17,-13, -4, -9,-19, -3, -5, -8,  0,  1,-10,-18, -5, -6, -7, -5, -3,-23, -5, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='E';  M= -2, -1,-19, -1,  7,-16,-11, -5,-13, -2,-10, -5, -1,-11,  2, -4,  1, -2,-11,-24,-11,  4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-22,-34,-26,  4,-33,-24, 32,-25, 24, 19,-24,-25,-21,-22,-20, -8, 25,-20, -1,-25;
/M: SY='Y';  M=-13,-19,-25,-21,-14,  6,-25, -6,  0, -7,  9,  7,-16,-24, -9,  1,-18, -9, -4, -3, 15,-13;
/M: SY='E';  M= -3, -3,-21, -5,  4,-16,-17, -6,-13,  3, -9, -6, -1,-15,  2,  4, -4, -6,-12,-24,-11,  2;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='R';  M= -4, -6,-13, -6, -1, -7,-11,  1,-11,  0, -7, -4, -4,-12, -1,  3, -4, -5, -9,-12,  0, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='F';  M= -5,-12, -1,-16,-11,  8,-14, -9,  0,-11,  5,  5,-11,-16,-11,-10, -9, -5,  0,-10,  1,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M:         M= -8, -4,-21, -5, -4, -5,-13, -1,-14, -7, -9, -3, -4,-17, -6, -6, -4, -4,-12,-20, -1, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-12,-23,-11, -6, -5,-11,-12, -9,-15,  2, -4,-11,-11,-12,-13,-12,-10,-10,-22, -9, -9;
/M: SY='G';  M= -5,  2,-24,  3,  0,-23, 14, -8,-28, -7,-23,-17,  4,-13, -5, -8,  2, -8,-23,-25,-18, -3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M:         M= -9, -8,-18, -8, -6, -9,-19,-11, -9, -9, -7, -6, -9, -8, -9, -9, -9, -7, -8,-17, -7, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -9,  0,-28,  3,  6,-23,-17, -3,-17, -2,-18,-12, -2,  9,  0, -6, -3, -6,-18,-28,-14,  1;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
/M: SY='E';  M= -3, -6,-23, -5,  1,-16, -7, -8,-15, -7, -8, -7, -7, -8, -3, -8, -6, -8,-14,-20,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -1, -6,-21, -7,  1,-11,-14, -8,-12, -6, -8, -7, -6,-12, -5, -6, -5, -6,-10,-17, -9, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M:         M= -4, -7,-18, -8,  0,-10,-16, -8, -6, -2, -3, -2, -7,-12,  0, -1, -5, -3, -5,-16, -7, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='A';  M=  5, -5,-13, -7, -4,-11,-10, -9, -7, -4, -5, -4, -6,-10, -4, -4, -1, -1, -4,-15, -8, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='L';  M= -5, -8,-13, -9, -7, -2,-15, -9,  2, -8,  4,  4, -8,-14, -7, -6, -7, -2,  1,-14, -2, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-22,-30,-22,  2,-29,-21, 23,-23, 24, 14,-23,-25,-18,-20,-20, -8, 16,-15,  0,-21;
/M:         M=-10,-10,-26,-11, -5, -8,-18,-10,-11, -5, -9, -6, -8,-18, -4, -2,-10, -8,-12,  0, -1, -5;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13;
/M: SY='E';  M= -5,  2,-17,  0,  5,-11,-12, -3,-15, -2,-11, -8,  3,-14,  0, -3, -1, -4,-14,-20, -8,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='Y';  M= -7,-12,-15,-13,-10,  5,-15, -2,  0,-10,  7,  2,-11,-16, -8, -7,-12, -5, -3,  3, 11, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M:         M= -2, -9,-11,-11, -7, -4, -9,-10, -5, -4, -2, -2, -6,-12, -7, -2, -3,  0, -2,-13, -4, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='H';  M= -6, -6,-13, -7, -1, -6,-14,  6, -6, -6, -2,  0, -5,-13, -2, -4, -5, -5, -5,-17, -2, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M:         M= -6, -5,-18, -9, -7, -7,-13, -5, -5, -6, -6, -2,  0,-14, -3, -4, -4, -3, -8,-17,  0, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -6,-11,-13,-13, -7,-10,-18, -9, -6, -2, -4, -2, -8,-18, -5,  3, -6, -5, -2,-21, -7, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='S';  M= -2,-10, -6,-12,-10,-13, -6,-14,-10,-12,-13, -9, -6, -7,-11,-14,  2,  0, -7,-24,-11,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MI=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='T';  M= -5, -7,-21,-10,-10, -8, -7, -3,-14,-10,-11, -8, -3,-14, -9, -9, -1,  1,-10,-21, -2,-10;
/M: SY='P';  M= -3,-14,-21,-14, -8,-15,-16,-16, -8,-11,-10, -7,-11,  4, -8,-11, -3, -3, -8,-22,-13,-10;
/M: SY='M';  M=-10,-10,-22,-13, -8, -9,-20, -7, -4,  0, -4,  2, -7,-18, -6,  1, -9, -5, -3,-21, -3, -8;
/M:         M= -3, -5,-16, -6,-10,-13, -8,  0,-12,-14, -8, -5, -5,-17,-10,-13, -1, -1, -7,-27, -8,-11;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M:         M= -4, -4,-22, -8, -7,-13,-14, -6, -7, -6, -7, -4, -1,-14, -6, -6, -3,  0, -7,-25, -8, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:         M= -3, -8,-14, -8, -9,-12,-14,-13,-12,-11,-12, -9, -8, -5,-10,-13, -2,  0, -8,-23, -9,-10;
/M: SY='B';  M= -5,  2,-23,  2,  0,-21,  0,-10,-22,  0,-18,-13,  1,-14, -5, -3, -2, -6,-15,-25,-14, -3;
/M: SY='G';  M= -4, -4,-20, -7,-11,-18, 13,-12,-17,-13,-13, -5, -1,-18,-10,-14, -3, -8,-15,-25,-16,-11;
/M:         M= -8, -7,-19, -8, -7, -9,-20,-14, -3, -7, -4, -2, -8,-18, -7, -8, -6, -2,  0,-24, -7, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-15,-20,-18,-13, -8,-17,-15,  0, -8, -3,  0,-11,-18,-10, -5, -7, -4,  3,-20, -7,-13;
/M: SY='Y';  M= -9,-22,-18,-26,-22, 10,-16,-14,  5,-19,  3,  3,-18,-25,-17,-18,-14, -8,  3, -5, 13,-21;
/M: SY='K';  M= -6, -4,-19, -5, -2,-19,-10, -8,-19,  3,-19,-11, -1,-10, -1,  3,  2,  0,-14,-26,-12, -2;
/M: SY='V';  M= -9,-20,-21,-22,-15, -1,-26,-16,  6, -5,  5,  4,-17,-23,-13, -1,-13, -5, 11,-20, -1,-15;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-24, -3,  2,-14,-12, -8,-21,  1,-17,-13, -2, -7, -3,  4, -2, -4,-17,-19,-10, -1;
/M: SY='G';  M= -6, -7,-19, -8,-11,-14,  8,-13,-21, -8,-18,-12, -4,-20,-12, -7, -5,-12,-16,-17, -8,-12;
/M: SY='G';  M= -6,-10, -7,-14,-10,-24,  7, -9,-18,-10,-14,  1, -7,-20,  4,-10, -5,-12,-16,-25,-17, -3;
/M: SY='R';  M=-15, -9,-26,-12, -5,-14,-19, -3,-13, 11, -6,  3, -2,-20,  5, 32,-10, -7,-11,-22, -9, -3;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-26, -9, -6,-16, -6,-10,-17, -1,-15, -6, -3,  4, -6, -2, -5, -7,-16,-24,-15, -7;
/M: SY='S';  M=  8,  0,-10, -2, -2,-18, -3,-11,-18,-10,-27,-18,  8,-10, -2,-10, 36, 25, -8,-38,-18, -2;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-19,-30,-20,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-19;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-11,  8,  9,-23,-16, -5,-19, -4,-17, -9,  0,-15,  8, -7, -1, -7,-15,-30,-15,  9;
/M: SY='P';  M=  2,-19,-20,-19,-13, -8,-15,-18, -4,-15, -8, -4,-16,  9,-14,-18, -5, -4, -2,-22,-11,-15;
/M: SY='S';  M= -3, -4, -8, -9,-12,-12, -6,-15,-13,-15,-13,-11,  0,-13,-14,-15,  2,  2, -8,-28,-15,-13;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 49,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M= -1,-16,-18,-18,-15,  7,-16,-10, -4,-15, -7, -6,-11,-20,-14,-14,  4,  3,  0, -9, 11,-15;
/M: SY='V';  M= -1,-17,-17,-20,-18,  0,-20,-18,  9,-20,  8,  5,-15,-21,-17,-19, -9, -5, 10,-22, -5,-18;
/M: SY='G';  M= -2,-10,-21,-11,-15, -6,  4,-17,-12,-18, -6, -7, -8,-20,-17,-17, -4, -7, -7,-19,-11,-16;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 59,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='T';  M=  2, -2,  0, -9, -9,-14,-14,-17,-15,-10,-17,-14,  2,-13, -8,-11, 22, 33, -5,-34,-14, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-23,-26,-18,  5,-29,-19, 19,-21, 21, 14,-21,-24,-17,-16,-19, -8, 13,-17,  0,-19;
/M: SY='I';  M= -5,-17, -9,-25,-20,  2,-25,-18, 10,-19,  7,  7,-14,-22,-16,-17, -8,  4,  9,-20, -1,-19;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='N';  M= -5, 11, -8, -1, -8,-15,-11,  1,-12, -6,-16, -8, 21,-20, -6, -4,  4,  2,-12,-33,-14, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='C';  M= -5, -6,  2,-10, -9, -3,-12, -5, -2, -8, -3,  0, -3,-15, -7, -9, -6, -4, -2, -8,  0, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='I';  M= -6,-26,-21,-32,-23,  2,-27,-20, 26,-24, 25, 23,-22,-23,-16,-21,-19, -8, 17,-21, -3,-21;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
/M: SY='A';  M=  6,-15,-13,-21,-14, -6,-16,-16,  0, -8, -1,  3,-12,-18,-11,-12, -6, -3,  3,-19, -6,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -5,-24,-16,-29,-22,  2,-28,-17, 20,-21, 18, 16,-22,-24,-18,-19,-16, -4, 18,-20,  0,-21;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6;
/M: SY='Y';  M= -7,-13,-20,-17,-12, -5,-20, -3, -1, -9,  1,  2, -9,-20, -7, -4, -9, -5, -3,-16,  3,-11; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='A';  M=  7, -7,-13,-11, -9,-11, -7, -4,-15, -7,-13, -9, -4,-16, -6, -5,  3,  0,-10,-17, -1, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='A';  M=  7,-13,-12,-18,-11, -6,-13, -9, -6,-11, -3,  0,-10,-18, -8,-10, -2, -2, -3,-15, -4,-10; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='M';  M= -5,-20,  0,-24,-18, -1,-23,-14,  3,-14,  7,  8,-18,-24,-13,-10,-13, -7,  5,-21, -4,-16; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='Y';  M=-10,-12,-22,-12, -2, -1,-22, -3, -7, -4, -3, -2,-11,-13, -5, -3,-10, -7, -8,-12,  8, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='K';  M= -5,  3,-19,  5,  5,-18, -9, -4,-16,  7,-14, -9,  1, -9,  3,  5, -1, -5,-12,-19,-10,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-12,  1,  4, -9, -7,  1,-10, -1, -8, -6,  0, -7,  1, -1, -2, -4, -9,-10, -4,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M:         M= -2, -4,-13, -6, -6, -7, -4, -7, -6, -7, -6, -4, -2,-13, -7, -6, -2, -4, -4,-16, -7, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='L';  M= -8,-11,-21,-12, -7, -3,-15,-12, -1,-12,  4,  1,-10,-17,-10,-10,-11, -7, -2,-18, -5, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-22,  2,  3,-14,-11, -8,-15, -6, -9, -9, -1, -8, -3, -7, -5, -6,-15,-24,-11, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
/M: SY='K';  M= -8,  5,-24,  7,  4,-24,-11, -7,-21,  8,-19,-12,  4,-13,  3,  8, -1, -5,-15,-25,-14,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=-6; IM=-6; DM=-6;
/M:         M= -8, -2,-20, -2, -5,-12,-16, -8,-10, -8, -8, -7, -2,-13, -7, -7, -5, -4, -8,-26, -9, -7;
/M:         M= -6,-14,-14,-16,-10, -4,-21,-13, -6,-11, -5, -4,-13,-16,-11,-11, -8, -5, -3,-13, -3,-11;
/M: SY='R';  M= -5,-10,-12,-11, -7,-11,-18,-12,-15,  1,-13, -8, -7,-12, -6,  5, -3, -3, -9,-24,-10, -8;
/M: SY='M';  M= -5,-23,-20,-30,-21,  8,-24,-15, 16,-20, 17, 22,-20,-22,-14,-18,-17, -8, 11,-16,  2,-18;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='L';  M=  2,-21, -9,-27,-20,  4,-22,-17, 10,-21, 12,  7,-18,-23,-18,-19,-11, -5, 10,-19, -2,-19; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=  0,-17, -9,-24,-21, 11,-22,-19,  6,-19,  0, -1,-12,-24,-22,-18, -5, -1, 11,-18,  0,-21;
/M: SY='S';  M= -1, -4, -7,-10,-11, -7,-11, -4,-11,-10,-13, -7,  2,-21, -8,-11,  3, -1,-10,-19,  3,-11;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-29,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20,  0,-20,-19,-20,  2,-18,-29,-21,-30,-19;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='C';  M= -2, -8, 15,-13,-13,-13,-10,-14,-11,-16, -8, -5, -3,-22,-12,-15,  2, -1, -6,-32,-16,-12; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -4,-28,-10,-31,-25,  4,-30,-25, 22,-23, 20, 12,-26,-28,-24,-21,-17, -5, 26,-24, -5,-25;
/M: SY='I';  M= -5,-26,-21,-29,-21,  2,-30,-23, 25,-22, 17, 12,-22,-24,-19,-20,-16, -6, 22,-21, -2,-22;
/M: SY='A';  M=  1,-11,-16,-17,-15, -3,-15,-14, -2,-13, -5, -3, -7,-19,-14,-13, -4, -4,  0,-20, -4,-15;
/M:         M= -1,-16, -4,-20,-16, -5,-13,-18, -8,-16,-10, -7,-12,-13,-15,-15, -1, -1, -2,-22, -9,-16;
/M: SY='E';  M= -6, -2,-23, -1,  5,-18,-18, -7,-13, -2,-14,-10, -2, -5, -2, -4, -1, -3,-11,-27,-11,  1;
/M: SY='P';  M= -8,  1,-25,  4,  4,-23,-16, -8,-19,  2,-19,-13,  0,  5, -1,  0, -2, -4,-18,-30,-17,  0;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-25,  5,  8,-21, -9, -5,-22, -2,-19,-13, -2, -3,  0, -5, -1, -7,-19,-24,-11,  3;
/M:         M=-10, -7,-23, -6, -3,-10,-22, -8, -8, -6, -4, -4, -8,-10, -6, -3, -9, -6, -7,-23, -7, -6;
/M:         M= -6, -8,-23, -9, -1, -5,-19,-11, -8, -5, -5, -5, -7,-14, -5, -4, -6, -5, -7,-21, -6, -4;
/M: SY='D';  M= -4,  1,-25,  2,  1,-19, -8, -6,-19, -5,-17,-13,  1, -4, -3, -7,  0, -5,-17,-25,-13, -2;
/M:         M= -5, -6,-22, -7, -3,-11,-17,-10,-11, -3,-11, -6, -6,-10, -5, -5, -3, -2, -9,-20, -6, -5;
/M:         M= -1,-10,-21,-12, -9,  0,-15,-10, -8,-12, -5, -6, -9,-16,-11,-12, -5, -5, -6,-12, -1,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.


Total number of hits 494 in 494 different sequences
Number of true positive hits 493 in 493 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 12
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 99.80 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 97.62 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] S_Spirin, N_Hulo
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] RdRp catalytic
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences		 493 sequences 

194K_TRVSY  (P05080), NS1AB_ANV1  (Q9JGF2), NS1AB_HASV1 (Q67726), 

NS1AB_HASV4 (Q3ZN06), NS1AB_HASV5 (Q4TWH8), NS1AB_HASV8 (Q9IFX2), 
NS1AB_MASV1 (Q80KJ7), NS1AB_OASV1 (Q9JH66), NS1AB_TASV1 (Q9JH69), 
NS1AB_TASV2 (Q9ILI5), POL1_APMV   (Q02941), POL1_ARMVN  (Q6W8W5), 
POL1_BAMMN  (P90245), POL1_BAYMG  (Q04574), POL1_BAYMJ  (Q01206), 
POL1_BAYMY  (Q9YJW3), POL1_BBWV2  (Q9WNW0), POL1_BBWVS  (Q76L40), 
POL1_BPMV   (Q9YJU5), POL1_BRAV   (Q8V5E0), POL1_BRSV   (P18522), 
POL1_CNSV   (Q8QVV0), POL1_CPMVS  (P03600), POL1_CPSMV  (P36312), 
POL1_CRLVP  (Q6EWG9), POL1_GCMV   (P13025), POL1_GFLV   (P29149), 
POL1_RCMV   (P35930), POL1_RRVC   (Q6W8W4), POL1_SDVS5  (Q9WAL8), 
POL1_TBRVM  (Q8B8X3), POL1_TORVR  (P29150), POL1_TOTV   (A1XIP9), 
POL1_TRSV   (Q88893), POLFS_SINV3 (C1JCT2), POLG_AEVCA  (Q9YLS4), 
POLG_AEVL2  (Q6WQ42), POLG_AEVVR  (Q6R325), POLG_AIVA8  (O91464), 
POLG_ALKV   (Q91B85), POLG_ASGVK  (Q6PLS1), POLG_ASGVP  (P36309), 
POLG_BANV   (C8XPA8), POLG_BCMNN  (Q65399), POLG_BECN1  (Q288N7), 
POLG_BECNB  (Q8JN60), POLG_BOVEV  (P12915), POLG_BSTV1  (Q65730), 
POLG_BSTVG  (Q65729), POLG_BTMV   (Q6XW15), POLG_BUSV   (Q32ZE0), 
POLG_BVDVC  (Q96662), POLG_BVDVN  (P19711), POLG_BVDVS  (Q01499), 
POLG_BVY3   (A0AUJ5), POLG_BYMV   (P17765), POLG_CACV4  (Q8V736), 
POLG_CILVC  (Q1KZ59), POLG_COSAA  (B8XTP8), POLG_CSFAT  (P19712), 
POLG_CSFVB  (P21530), POLG_CX16G  (Q65900), POLG_CX16T  (Q9QF31), 
POLG_CXA21  (P22055), POLG_CXA24  (P36290), POLG_CXA9   (P21404), 
POLG_CXB1J  (P08291), POLG_CXB2O  (Q9YLG5), POLG_CXB3N  (P03313), 
POLG_CXB3W  (Q66282), POLG_CXB4E  (Q86887), POLG_CXB4J  (P08292), 
POLG_CXB5P  (Q03053), POLG_CXB6S  (Q9QL88), POLG_DEN1B  (P27909), 
POLG_DEN1S  (P33478), POLG_DEN1W  (P17763), POLG_DEN26  (P29990), 
POLG_DEN27  (P29991), POLG_DEN28  (P14337), POLG_DEN2J  (P07564), 
POLG_DEN2N  (P14340), POLG_DEN2P  (P12823), POLG_DEN2Q  (Q9WDA6), 
POLG_DEN3C  (Q99D35), POLG_DEN3I  (Q5UB51), POLG_DEN3M  (Q6YMS3), 
POLG_DEN3P  (P27915), POLG_DEN3S  (Q6YMS4), POLG_DEN4D  (P09866), 
POLG_DEN4H  (Q2YHF2), POLG_DEN4P  (Q58HT7), POLG_DEN4S  (Q5UCB8), 
POLG_DEN4T  (Q2YHF0), POLG_DWV(Q8B3M2), POLG_EBHSG  (Q96725), 
POLG_EC01F  (O91734), POLG_EC05N  (Q9YLJ1), POLG_EC06C  (Q66474), 
POLG_EC09B  (Q66577), POLG_EC09H  (Q66849), POLG_EC11G  (P29813), 
POLG_EC12T  (Q66575), POLG_EC30B  (Q9WN78), POLG_EHV(C8XPB2), 
POLG_EMCV   (P03304), POLG_EMCVB  (P17593), POLG_EMCVD  (P17594), 
POLG_EMCVR  (Q66765), POLG_ENMGO  (P12296), POLG_FCV(N0A3C0), 
POLG_FCVC6  (P27407), POLG_FCVF4  (P27408), POLG_FCVF9  (P27409), 
POLG_FCVUR  (Q66914), POLG_FMDA1  (A2I7M2), POLG_FMDS2  (Q9Q2N9), 
POLG_FMDV1  (P03306), POLG_FMDV5  (P03307), POLG_FMDVA  (P03308), 
POLG_FMDVC  (P03309), POLG_FMDVI  (P03310), POLG_FMDVO  (P03305), 
POLG_FMDVP  (Q6PMV1), POLG_FMDVS  (P03311), POLG_FMDVT  (P15072), 
POLG_FMDVZ  (P49303), POLG_GBVB   (Q69422), POLG_HAV88  (Q8V0N6), 
POLG_HAVCF  (Q5Y944), POLG_HAVGB  (Q67825), POLG_HAVH2  (A3FMB2), 
POLG_HAVHA  (Q05794), POLG_HAVHM  (P08617), POLG_HAVJ8  (A5LGW7), 
POLG_HAVLA  (P06441), POLG_HAVMB  (P13901), POLG_HAVNO  (Q9DWR1), 
POLG_HAVS2  (P14553), POLG_HCV1   (P26664), POLG_HCV6A  (Q5I2N3), 
POLG_HCV77  (P27958), POLG_HCVBB  (Q68749), POLG_HCVBK  (P26663), 
POLG_HCVCO  (Q9WMX2), POLG_HCVED  (O39929), POLG_HCVEU  (O39927), 
POLG_HCVEV  (O39928), POLG_HCVH9  (Q81754), POLG_HCVIN  (Q913D4), 
POLG_HCVJ1  (Q03463), POLG_HCVJ4  (O92972), POLG_HCVJ6  (P26660), 
POLG_HCVJ8  (P26661), POLG_HCVJA  (P26662), POLG_HCVJF  (Q99IB8), 
POLG_HCVJK  (Q68801), POLG_HCVJL  (Q68798), POLG_HCVJP  (Q9DHD6), 
POLG_HCVJT  (Q00269), POLG_HCVK3  (Q81495), POLG_HCVNZ  (Q81258), 
POLG_HCVR6  (Q913V3), POLG_HCVSA  (O91936), POLG_HCVT5  (O92529), 
POLG_HCVTR  (Q81487), POLG_HCVTW  (P29846), POLG_HCVVA  (Q9QAX1), 
POLG_HCVVN  (O92530), POLG_HCVVO  (O92531), POLG_HCVVP  (O92532), 
POLG_HE701  (P32537), POLG_HE71   (B9VUU3), POLG_HE71B  (Q66478), 
POLG_HE71M  (Q66479), POLG_HED68  (Q68T42), POLG_HKV1   (C6KEF6), 
POLG_HPE1H  (Q66578), POLG_HPE2W  (O73556), POLG_HPEV5  (Q9YID8), 
POLG_HRV14  (P03303), POLG_HRV15  (E5D8F2), POLG_HRV16  (Q82122), 
POLG_HRV1A  (P23008), POLG_HRV1B  (P12916), POLG_HRV2   (P04936), 
POLG_HRV3   (Q82081), POLG_HRV8A  (P07210), POLG_ILHV   (Q32ZD7), 
POLG_JAEV1  (P27395), POLG_JAEV5  (P19110), POLG_JAEVJ  (P32886), 
POLG_JAEVM  (G3FEX6), POLG_KFDV   (D7RF80), POLG_KOKV   (Q32ZD5), 
POLG_KUNJM  (P14335), POLG_LANVT  (P29837), POLG_LIV(P22338), 
POLG_LJUV1  (Q8JV21), POLG_LMV0   (P31999), POLG_LMVE   (P89876), 
POLG_LORDV  (P54634), POLG_MCFA   (P33515), POLG_MNV1   (Q80J95), 
POLG_MRFVC  (Q91TW9), POLG_MVEV5  (P05769), POLG_NVN68  (Q83883), 
POLG_OHFV   (Q7T6D2), POLG_OMV(P20234), POLG_PEMVC  (Q01500), 
POLG_PEMVM  (O56075), POLG_PESV   (Q9QEJ5), POLG_PEV9U  (O41174), 
POLG_POL1M  (P03300), POLG_POL1S  (P03301), POLG_POL2L  (P06210), 
POLG_POL2W  (P23069), POLG_POL32  (P06209), POLG_POL3L  (P03302), 
POLG_POWVL  (Q04538), POLG_PPVD   (P13529), POLG_PPVEA  (Q01681), 
POLG_PPVNA  (P17766), POLG_PPVRA  (P17767), POLG_PPVSK  (Q84934), 
POLG_PRSVH  (Q01901), POLG_PRSVP  (P19723), POLG_PRSVW  (P19724), 
POLG_PSBMV  (P29152), POLG_PVMA   (Q85197), POLG_PVYHU  (Q02963), 
POLG_PVYN   (P18247), POLG_PYFV1  (Q05057), POLG_RGMVD  (O11436), 
POLG_RHDV3  (P27411), POLG_RHDVA  (Q86119), POLG_RHDVB  (Q89273), 
POLG_RHDVF  (P27410), POLG_RHDVS  (Q86117), POLG_ROCV   (Q32ZD4), 
POLG_RTSVA  (Q83034), POLG_RTSVT  (Q91PP5), POLG_SAFV   (C0MHL9), 
POLG_SALVA  (C5MSH2), POLG_SBMVG  (Q90069), POLG_SBMVN  (P21231), 
POLG_SMSV1  (P36286), POLG_SMSV4  (P36287), POLG_SOUV3  (Q04544), 
POLG_SPMMV  (P89201), POLG_STEVM  (P09732), POLG_SVDVH  (P16604), 
POLG_SVDVU  (P13900), POLG_SVM10  (Q6XDK8), POLG_SVM93  (Q69014), 
POLG_SVSAP  (Q672I1), POLG_SVV1   (Q155Z9), POLG_TBEVH  (Q01299), 
POLG_TBEVS  (P07720), POLG_TBEVW  (P14336), POLG_TEV(P04517), 
POLG_TMEVB  (P08544), POLG_TMEVD  (P13899), POLG_TMEVG  (P08545), 
POLG_TMUV   (G1CRV4), POLG_TRMVU  (A4KZ49), POLG_TUMVJ  (P89509), 
POLG_TUMVQ  (Q02597), POLG_TVMV   (P09814), POLG_USUV   (Q5WPU5), 
POLG_VESVA  (Q9DUN3), POLG_WMV2U  (P18478), POLG_WNV(P06935), 
POLG_WNV9   (Q9Q6P4), POLG_WSLV   (C5H431), POLG_YEFV1  (P03314), 
POLG_YEFVA  (Q6DV88), POLG_YEFVC  (Q6J3P1), POLG_YEFVE  (Q074N0), 
POLG_YEFVF  (Q89277), POLG_YEFVI  (Q98803), POLG_YEFVN  (Q1X881), 
POLG_YEFVT  (Q9YRV3), POLG_YEFVU  (Q1X880), POLG_ZIKV   (Q32ZE1), 
POLG_ZIKVF  (A0A024B7W1), POLG_ZIKVK  (A0A142I5B9), POLG_ZYMVC  (P18479), 
POLG_ZYMVR  (Q89330), POLG_ZYMVS  (O36979), POLN_ABPVR  (Q9DSN9), 
POLN_AHEV   (Q6QLN1), POLN_AURAV  (Q86924), POLN_BFV(P87515), 
POLN_CHIK3  (Q5XXP4), POLN_CHIKS  (Q8JUX6), POLN_CRPVC  (Q9IJX4), 
POLN_DCVEB  (O36966), POLN_EEEV1  (Q306W6), POLN_EEEV8  (Q306W8), 
POLN_EEEVF  (Q4QXJ8), POLN_EEVV   (Q8V294), POLN_EEVV3  (P36327), 
POLN_EEVVM  (Q9WJC7), POLN_EEVVP  (P36328), POLN_EEVVT  (P27282), 
POLN_ELV(P35928), POLN_EPMV   (P20126), POLN_GETV   (Q5Y389), 
POLN_GFKVM  (Q8UZB6), POLN_HEVBU  (P29324), POLN_HEVCH  (Q81862), 
POLN_HEVCT  (Q9IVZ9), POLN_HEVHY  (Q9WC28), POLN_HEVME  (Q03495), 
POLN_HEVMG  (Q6J8G2), POLN_HEVMY  (Q04610), POLN_HEVPA  (P33424), 
POLN_HEVUS  (Q9YLR1), POLN_KYMVJ  (P36304), POLN_MAYAB  (Q8QZ73), 
POLN_MIDDV  (P03318), POLN_ONNVG  (P13886), POLN_ONNVI  (O90370), 
POLN_ONNVS  (O90368), POLN_OYMV   (P20127), POLN_RRVN   (P13887), 
POLN_RRVT   (P13888), POLN_RUBVB  (Q6X2U4), POLN_RUBVC  (Q6X2U2), 
POLN_RUBVD  (Q9J6K9), POLN_RUBVM  (Q86500), POLN_RUBVN  (Q8BCR0), 
POLN_RUBVO  (Q99IE7), POLN_RUBVR  (O40955), POLN_RUBVT  (P13889), 
POLN_RUBVV  (Q99IE5), POLN_SAGV   (Q9JGL0), POLN_SFV(P08411), 
POLN_SINDO  (P27283), POLN_SINDV  (P03317), POLN_SLDV   (Q8QL53), 
POLN_SPDV   (Q8JJX1), POLN_TYMV   (P10358), POLN_TYMVA  (P20128), 
POLN_TYMVC  (P28477), POLN_WEEV   (P13896), POLR_NORAV  (Q27YG9), 
POL_SINV3   (C1JCT1), R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9), 
R1AB_BC512  (P0C6W0), R1AB_BCHK3  (P0C6W2), R1AB_BCHK4  (P0C6W3), 
R1AB_BCHK5  (P0C6W4), R1AB_BCHK9  (P0C6W5), R1AB_BCRP3  (P0C6W6), 
R1AB_BEV(P0C6V7), R1AB_BRV1   (P0C6V8), R1AB_BYVU   (Q08534), 
R1AB_CVBEN  (P0C6W7), R1AB_CVBLU  (P0C6W8), R1AB_CVBM   (P0C6W9), 
R1AB_CVBQ   (P0C6X0), R1AB_CVH22  (P0C6X1), R1AB_CVHNL  (P0C6X5), 
R1AB_CVHOC  (P0C6X6), R1AB_CVM2   (P0C6X8), R1AB_CVMA5  (P0C6X9), 
R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), R1AB_CVRSD  (Q9WQ77), R1AB_CVTMI  (Q9WQ76), 
R1AB_GLRV3  (O71189), R1AB_IBVB   (P0C6Y1), R1AB_IBVBC  (P0C6Y2), 
R1AB_IBVM   (P0C6Y3), R1AB_LIYV9  (Q83045), R1AB_MERS1  (K9N7C7), 
R1AB_SARS   (P0C6X7), R1AB_SARS2  (P0DTD1), RDRP_ACLSA  (P54891), 
RDRP_ACLSP  (P27738), RDRP_AHNNV  (Q9DIC5), RDRP_AMV(P03593), 
RDRP_ASPVP  (Q64962), RDRP_BBSCV  (Q65652), RDRP_BMV(P03594), 
RDRP_BOTVF  (Q9DRA1), RDRP_BOTVX  (Q6YNQ7), RDRP_BSMV   (Q80873), 
RDRP_BYDVM  (P29044), RDRP_BYDVP  (P09505), RDRP_BYDVR  (P29045), 
RDRP_CARMS  (Q9J5U7), RDRP_CARMV  (P04518), RDRP_CCMV   (P20179), 
RDRP_CFMVN  (Q0PW25), RDRP_CGMVS  (P69514), RDRP_CLBVS  (Q91QZ3), 
RDRP_CMVAS  (O39436), RDRP_CMVB   (Q66136), RDRP_CMVFN  (P16490), 
RDRP_CMVII  (Q83262), RDRP_CMVIX  (Q66117), RDRP_CMVK   (Q86783), 
RDRP_CMVKO  (Q96711), RDRP_CMVMB  (Q66145), RDRP_CMVNT  (O40977), 
RDRP_CMVQ   (P06012), RDRP_CMVY   (Q83265), RDRP_CNV(P15187), 
RDRP_CPVKS  (O15925), RDRP_CRSVL  (Q66096), RDRP_CRV(P17459), 
RDRP_CVB(P37987), RDRP_FXMV   (P22168), RDRP_GGNNV  (Q993M1), 
RDRP_GRVMC  (Q67683), RDRP_GVAIS  (Q67704), RDRP_ICRSV  (Q918W3), 
RDRP_LOLV   (B1PS76), RDRP_MBVLF  (Q9YPD5), RDRP_MCMVK  (P11640), 
RDRP_MNSV   (Q83424), RDRP_NMV(P15095), RDRP_NODAM  (Q9IMM4), 
RDRP_OCSVU  (Q83927), RDRP_OLV2I  (Q83944), RDRP_ORSVC  (P89659), 
RDRP_ORSVS  (Q84133), RDRP_P1AMV  (Q07518), RDRP_PAV(Q9J7Z2), 
RDRP_PCV87  (Q84687), RDRP_PEMVW  (P29154), RDRP_PLRV1  (P17520), 
RDRP_PLRVW  (P11623), RDRP_PMMVJ  (P89657), RDRP_PMMVS  (P29098), 
RDRP_PMTVS  (Q9QBU0), RDRP_PMV(P20951), RDRP_PMVK   (P89034), 
RDRP_PNLV   (Q5NDM9), RDRP_POLVP  (Q9IWA0), RDRP_PRV(Q3KSM3), 
RDRP_PSVJ   (P28727), RDRP_PVMR   (P17965), RDRP_PVSP   (P22657), 
RDRP_PVX(P09395), RDRP_PVXCP  (P22591), RDRP_PVXHB  (Q07630), 
RDRP_PVXX3  (P17779), RDRP_PZSVT  (Q9DUT2), RDRP_RBDVR  (Q05983), 
RDRP_RCNMV  (P22956), RDRP_SBWMN  (Q89249), RDRP_SCPMV  (P21405), 
RDRP_SHMV   (P89202), RDRP_SHVX   (Q04575), RDRP_SJNNV  (Q9QAZ8), 
RDRP_SMYEA  (P28897), RDRP_TAV(P29035), RDRP_TBRFV  (A0A0S2T050), 
RDRP_TBSVC  (P15962), RDRP_TCV(P17460), RDRP_TMGMV  (P18339), 
RDRP_TMOB   (P90211), RDRP_TMV(P03586), RDRP_TMVB   (Q9YQ08), 
RDRP_TMVKR  (P30738), RDRP_TMVOM  (O93058), RDRP_TMVRA  (Q98745), 
RDRP_TNVA   (P22958), RDRP_TNVD   (P27209), RDRP_TOBSV  (P89678), 
RDRP_TOMK1  (Q9Q1T8), RDRP_TOMK2  (P89676), RDRP_TOML   (P03587), 
RDRP_TOMS1  (Q9YKD6), RDRP_TRVPP  (Q9J942), RDRP_TVCV   (Q88920), 
RDRP_TYYVF  (P09507), RDRP_WCMVM  (P09498), RDRP_WCMVO  (P15402), 
RDRP_YOMV   (Q66220), RPOA_EAVBU  (P19811), RPOA_LDVC   (Q06502), 
RPOA_LDVP   (Q83017), RPOA_PRRS1  (Q9YN02), RPOA_PRRSB  (Q8B912), 
RPOA_PRRSL  (Q04561), RPOA_PRRSR  (Q9WJB2), RPOA_PRRSS  (A0MD28), 
RPOA_SHFV   (Q68772)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences		 12 sequences 

R1AB_CVHN1  (P0C6X2), R1AB_CVHN2  (P0C6X3), R1AB_CVHN5  (P0C6X4), 

R1AB_CVPPU  (P0C6Y5), R1AB_FIPV   (Q98VG9), R1AB_PEDV7  (P0C6Y4), 
R1AB_WBV24  (Q008X6), R1A_WBV24   (Q008X5), RDRP_BNYVS  (Q65667), 
RDRP_MRNV   (Q6XNL5), RDRP_SBMVA  (O72157), RDRP_SSDRV  (Q6YI57)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences		 1 sequence 

LITD_LATHE  (P0DJE7)


				
	

	

		PDB
[Detailed view]		
		
			338 PDB
			


			1C2P; 1CSJ; 1GX5; 1GX6; 1KHV; 1KHW; 1NB4; 1NB6; 1NB7; 1NHU; 1NHV; 1OS5; 
			
				1QUV; 1RA6; 1RA7; 1RAJ; 1RDR; 1S48; 1S49; 1S4F; 1TP7; 1TQL; 1XR5; 1XR6; 
				1XR7; 1YUY; 1YV2; 1YVX; 1YVZ; 2AWZ; 2AX0; 2AX1; 2BRK; 2BRL; 2CJQ; 2CKW; 
				2DXS; 2GIQ; 2GIR; 2HAI; 2HCN; 2HCS; 2HFZ; 2HWH; 2HWI; 2I1R; 2IJD; 2IJF; 
				2ILY; 2ILZ; 2IM0; 2IM1; 2IM2; 2IM3; 2J7U; 2J7W; 2JC0; 2JC1; 2O5D; 2UUT; 
				2UUW; 2WCX; 2WHO; 2WK4; 2WRM; 2XHU; 2XHV; 2XHW; 2XI2; 2XI3; 2XWH; 2XWY; 
				2XXD; 2XYM; 2YOJ; 2ZKU; 3BR9; 3BSA; 3BSC; 3CDE; 3CDU; 3CDW; 3CIZ; 3CJ0; 
				3CJ2; 3CJ3; 3CJ4; 3CJ5; 3CO9; 3CSO; 3CVK; 3CWJ; 3D28; 3D5M; 3E51; 3FQK; 
				3FQL; 3FRZ; 3G86; 3GNV; 3GNW; 3GOL; 3GSZ; 3GYN; 3H2L; 3H59; 3H5S; 3H5U; 
				3H98; 3HKW; 3HKY; 3HVO; 3I5K; 3IGV; 3LKH; 3MF5; 3MWV; 3MWW; 3NAH; 3NAI; 
				3OL7; 3Q0Z; 3QGD; 3QGE; 3QGF; 3QGG; 3QGH; 3QGI; 3QID; 3SFG; 3SFU; 3SKA; 
				3SKE; 3SKH; 3TYQ; 3TYV; 3U4O; 3U4R; 3UDL; 3UPF; 3UPH; 3UPI; 3UQS; 3UR0; 
				3VQS; 3VWS; 4ADP; 4AEP; 4AEX; 4C11; 4DRU; 4E76; 4E78; 4E7A; 4EAW; 4EO6; 
				4EO8; 4GMC; 4HDG; 4HDH; 4HHJ; 4IH5; 4IH6; 4IH7; 4IZ0; 4J02; 4J04; 4J06; 
				4J08; 4J0A; 4JJS; 4JJU; 4JTW; 4JTY; 4JTZ; 4JU1; 4JU2; 4JU3; 4JU4; 4JU6; 
				4JU7; 4JVQ; 4JY0; 4JY1; 4K4S; 4K4T; 4K4U; 4K4V; 4K4W; 4K50; 4K6M; 4KAI; 
				4KB7; 4KBI; 4KE5; 4MIA; 4MIB; 4MK7; 4MK8; 4MK9; 4MKA; 4MKB; 4MTP; 4MZ4; 
				4NLD; 4NLO; 4NLP; 4NLQ; 4NLR; 4NLS; 4NLT; 4NLU; 4NLV; 4NLW; 4NLX; 4NLY; 
				4NRU; 4NYZ; 4NZ0; 4O4R; 4OBC; 4OOW; 4R0E; 4RY4; 4RY5; 4RY6; 4RY7; 4TN2; 
				4V0Q; 4V0R; 4WFX; 4WFY; 4WFZ; 4WT9; 4WTA; 4WTC; 4WTD; 4WTE; 4WTF; 4WTG; 
				4WTI; 4WTJ; 4WTK; 4WTL; 4WTM; 4WYL; 4WYW; 4WZM; 4WZQ; 4X2B; 4Y2A; 4Y2C; 
				4Y3C; 5CCV; 5CZB; 5DTO; 5F3T; 5F3Z; 5F41; 5HMW; 5HMX; 5HMY; 5HMZ; 5HN0; 
				5I3P; 5I3Q; 5IQ6; 5JJR; 5JJS; 5JXS; 5N8X; 5N95; 5PZK; 5PZL; 5PZM; 5PZN; 
				5PZO; 5PZP; 5QJ0; 5QJ1; 5TFR; 5TMH; 5TRH; 5TRI; 5TRJ; 5TRK; 5TWM; 5TWN; 
				5U04; 5U0B; 5U0C; 5UJ2; 5W2E; 5Y3D; 6GVV; 6GVY; 6H80; 6H9R; 6I7P; 6IZX; 
				6IZY; 6LD1; 6LD2; 6LD3; 6LD4; 6LD5; 6M71; 6MVO; 6MVP; 6NUR; 6NUS; 6QSN; 
				6S2L; 6UX2; 6W4G; 6WCZ; 6XD0; 6XD1; 6YYT; 7BTF; 7BV1; 7BV2; 7BZF; 7C2K; 
				7CYQ; 7F0S; 7L1F; 7O7Y; 7O7Z; 7O80; 7O81; 7VB4; 7VW5; 7Y38; 8C1N; 8C2P; 
				8GY6; 9CPO
			
			

			» more