PROSITE entry PS50524
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| PURL [info] | https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50524 |
| Entry name [info] | RDRP_DSRNA_BIR |
| Accession [info] | PS50524 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50507 |
| Associated ProRule [info] | PRU00539 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RdRp of Birnaviridae dsRNA viruses catalytic domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=205; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=200; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2377453; R2=0.0095943; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=757; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=549; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 41, 32,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='I'; M= 6,-25,-25,-35,-25, -5,-30,-27, 34,-25, 12, 12,-17,-17,-17,-27,-12, -7, 22,-20, -5,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='Y'; M=-12,-25,-22,-25,-22, 17,-30, -4, 13,-18, 18, 8,-25,-30,-18,-15,-21, -8, 10, 1, 34,-22; /M: SY='H'; M=-15, -9,-28,-11, -3, -9,-23, 32, -9, -4, -7, 12, -7,-20, 18, -2,-12,-12,-17, -9, 23, 5; /M: SY='D'; M=-10, 20,-28, 33, 10,-33,-10, -8,-30, -5,-30,-25, 7, 16, -3,-13, 7, -3,-25,-37,-23, 2; /M: SY='N'; M=-12, 30,-22, 14, 0,-20, -4, 8,-22, 6,-28,-18, 48,-20, 2, 14, 6, -2,-28,-36,-18, 0; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='T'; M= -3, -8,-15,-18,-15, -7,-25,-23, 6,-15, -2, -2, -5,-13,-13,-15, 10, 34, 8,-27, -7,-15; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 40,-30, 12, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 70,-22; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M= -7, 7,-25, 12, 42,-25,-20, -5,-25, 5,-17,-17, 0, -3, 12, -3, 5, 6,-22,-30,-17, 27; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='C'; M= 2,-18, 95,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28, -6, -8, -8,-44,-28,-26; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='P'; M=-15,-15,-35,-10, 0,-25,-20,-10,-25, 10,-25,-15,-10, 35, 0, 25,-10,-10,-25,-25,-20, -5; /M: SY='Q'; M=-13, 15,-30, 22, 28,-38,-17, 5,-27, 7,-23,-12, 5, -8, 36, 3, 0,-10,-30,-27,-15, 32; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='H'; M= -2, -3,-25, -5, -3,-20,-15, 69,-25,-10,-17, -3, 5,-17, 5, -5, -5,-15,-22,-27, 10, -3; /M: SY='M'; M= 2,-18,-18,-28,-18, -4,-16, -4, 14,-10, 14, 46,-18,-18, -2,-12,-14, -8, 8,-20, -4,-10; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-25, -3, 12,-32,-20, 2,-17, 5,-17, -3, 0,-10, 42, 5, 5, 6,-22,-23,-10, 27; /M: SY='A'; M= 37, -7,-10,-17,-10,-17, -5,-20,-10,-10,-10,-10, -7,-10,-10,-17, 13, 13, 0,-23,-17,-10; /M: SY='A'; M= 22,-17,-13,-25,-17,-10,-12,-16, 7,-12, 3, 15,-17,-17,-11,-17, -3, -3, 13,-22,-12,-14; /M: SY='M'; M= -6,-16,-18,-24,-16, -4,-16, -2, 12,-10, 10, 44,-14,-18, 0,-10, -8, -4, 6,-24, -4, -8; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-15,-15,-22,-15,-15, 22,-22, 15, 0, -7, 0, 0,-15,-22, -7, -7,-15, -7, -7, 22, 59,-15; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12, 2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='N'; M= -2, 12,-15, 6, 4,-19, -4, 2,-15, -1,-21,-11, 21,-11, 12, -1, 14, 3,-18,-27,-13, 8; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M=-14, 25,-30, 36, 30,-34,-16, -3,-34, 16,-27,-22, 9, -7, 9, 4, -3,-10,-27,-32,-17, 19; /M: SY='D'; M=-15, 35,-28, 40, 15,-35,-10, 5,-30, 3,-27,-20, 24,-12, 16, -2, 2, -8,-30,-35,-17, 16; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 0, 12,-15, 14, 2,-22, -8,-10,-22, -8,-25,-20, 10,-10, -3,-10, 25, 21,-12,-37,-17, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='M'; M= -1,-18,-24,-25,-15,-10,-21,-12, 7, -3, 2, 14,-12,-18, -4, 7,-11, -8, 4,-20, -7,-12; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24, 52,-30, 3, 0,-19, 4, 0,-20,-30,-23,-14,-20,-10, -6, 21, 58,-24; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M= -1,-13,-29,-12, -2,-15,-19, -2,-13, -5,-16, -8,-13, 15, 6,-10, -6, -8,-19,-10, 5, -1; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='T'; M= -5, -5,-15,-13,-13, 0,-23,-10, -7,-10, -7, -7, -5,-15,-10,-10, 10, 34, -3,-14, 14,-13; /M: SY='F'; M=-15,-30,-22,-37,-27, 46,-32,-22, 15,-30, 22, 9,-23,-28,-31,-22,-23,-10, 9, -4, 16,-27; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20, 3,-23, -5, 20,-15, 28, 50,-23,-23, -5,-13,-23,-10, 10,-20, 0,-13; /M: SY='N'; M=-13, 13,-23, 0, -9, -3,-12, 11, -7, -5,-12, 1, 23,-23, -3, -5, -4, -5,-17,-18, 10, -7; /M: SY='I'; M= -4,-25,-24,-29,-27, -8, -8,-27, 20,-24, 4, 6,-18,-23,-23,-24,-12,-10, 20,-23,-11,-27; /M: SY='A'; M= 27,-15,-18,-24,-17,-16, -1,-23, 1,-17, -5, -4,-11,-14,-14,-23, 1, -5, 4,-20,-16,-17; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 12, -8,-15,-10, -8, -7, -8, -4,-12,-10,-17,-12, -3,-15, -5,-12, 17, 7, -8,-17, 6, -8; /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20, 4,-24, -9, 20,-19, 33, 43,-24,-24, -9,-14,-24,-10, 10,-20, 0,-14; /M: SY='V'; M= 0,-22,-10,-25,-25, -3,-27,-27, 20,-17, 5, 5,-22,-25,-25,-17, -2, 13, 37,-30,-10,-25; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 3, -8,-15,-12, -9,-13,-13,-17, 0,-15,-14, -8, 1,-13, -7,-15, 21, 16, 2,-33,-13, -9; /M: SY='C'; M= -5,-15, 86,-22,-22,-20,-22,-25,-27,-25,-23,-20,-12,-32,-22,-25, 3, -2,-10,-47,-27,-22; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 40, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 20,-23, -3,-23; /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24, 21,-32,-22, 23,-30, 35, 16,-26,-28,-24,-22,-26,-10, 13,-14, 6,-24; /M: SY='M'; M=-10,-15,-23,-22,-12, -8,-20, -3, 7, 6, 7, 42,-15,-17, 3, 0,-17,-10, 2,-20, -3, -5; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 28,-30,-20, 15,-30, 40, 15,-27,-30,-25,-20,-27,-10, 7,-12, 8,-23; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 35,-30, 35, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20, 0,-25; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='T'; M= -3, 10,-13, -2, -7,-13,-15,-12,-13, -7,-15,-13, 16,-13, -7, -7, 17, 37, -8,-33,-13, -7; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-33,-17,-15, 14,-27, 10, -5,-10, -8, -5,-20, 1,-10,-13,-17,-10,-15, 14, 51,-17; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 34,-13,-18,-17, -7,-23, -5,-20,-13,-10,-15,-13,-13, 16,-10,-20, 5, -3, -8,-23,-23,-10; /M: SY='W'; M= -4,-30,-31,-35,-25, 24,-18,-25,-12,-21, -8,-12,-27,-25,-24,-20,-22,-17,-14, 67, 18,-21; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='N'; M=-10, 26,-22, 8, -6,-16, -8, 2, -6, -6,-20,-12, 44,-20, -4, -6, 4, -2,-18,-36,-16, -6; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='L'; M= -5,-24,-15,-26,-21, 3,-28,-23, 17,-23, 28, 12,-24,-26,-21,-18,-15, 4, 19,-25, -5,-21; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 41, 32,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -5,-13,-17,-10,-25,-17, 7,-10, -3,-10, 35, 28, -7,-37,-17, -3; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28, 2,-38,-28, 43,-30, 27, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 25,-20, 0,-28; /M: SY='V'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 28, 15,-30,-30,-25,-20,-19, -5, 32,-25, -5,-25; /M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-30,-25, 2,-27,-20, 25,-20, 22, 25,-27,-27,-20,-17,-17, -5, 30,-25, -5,-22; /M: SY='B'; M= 8, 17,-21, 14, -2,-27, 11, -7,-26, -7,-24,-19, 17,-15, -7,-12, 6, -6,-21,-30,-22, -5; /M: SY='E'; M=-10, 3,-30, 6, 28,-32,-20, -2,-28, 28,-25,-11, 0, -7, 25, 16, -5,-10,-25,-23,-13, 26; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='N'; M= -5, -1,-19, -8,-11,-13,-16, 3, 0,-13,-12, -4, 9,-19, -7,-12, 6, 0, 0,-33, -9,-11; /M: SY='E'; M=-10, -2,-28, 2, 26,-21,-22, -8,-18, 13, -7, -8, -7,-10, 8, 4,-10,-10,-18,-25,-12, 17; /M: SY='A'; M= 20,-18,-18,-28,-18,-10,-15,-18, 13,-15, 5, 14,-15,-15,-10,-20, -5, -5, 10,-20,-10,-15; /M: SY='G'; M= -2, -8,-30, -8,-13,-30, 49,-18,-38, -4,-30,-18, 0,-18,-13, -8, -2,-18,-28,-20,-25,-13; /M: SY='Q'; M=-11, -1,-30, -1, 13,-33,-20, 0,-26, 30,-24, -6, 0,-11, 32, 27, -6,-10,-24,-20,-10, 22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='N'; M= -5, 20,-20, 10, 5,-25, -5, 5,-20, 0,-27,-15, 32,-15, 16, 0, 14, 2,-25,-35,-17, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M= -9, 4,-22, 5, -1,-19,-12, -3,-14, 0,-13, 4, 1,-15, 2, 6, 2, -2,-11,-30,-12, -1; /M: SY='S'; M= 3, -5,-18, -4, -2,-21, -9,-14,-18,-10,-27,-18, 1, 16, -4,-13, 24, 17,-14,-36,-21, -4; /M: SY='K'; M=-13, 15,-30, 23, 24,-33,-17, -5,-33, 27,-28,-18, 5, -8, 10, 12, -5,-10,-25,-28,-15, 17; /M: SY='E'; M= -7, 0,-25, 7, 36,-22,-23, -8,-14, 2,-12,-12, -8, -8, 7, -5, -3, -7, -9,-30,-17, 22; /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30, 59,-33,-23, 13,-30, 13, 5,-20,-27,-35,-23,-20,-10, 8, 2, 22,-30; /M: SY='M'; M=-10, -7,-25,-10, 8,-15,-20, -2, -5, 9, -2, 23,-10,-12, 8, 2,-12,-10, -8,-23, -8, 8; /M: SY='D'; M=-10, 25,-25, 35, 13,-33,-10, -5,-33, 11,-30,-22, 12,-10, 3, 0, 7, -3,-23,-35,-17, 8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='E'; M= 6, 5,-25, 10, 42,-27,-15, -5,-25, 5,-17,-17, -3, -3, 12, -5, 3, -7,-22,-27,-20, 27; /M: SY='S'; M= 13, 10,-18, 13, 11,-26, -6, -9,-23, -4,-22,-19, 4, -8, 0,-12, 14, 1,-15,-32,-20, 6; /M: SY='K'; M= 2, -7,-23,-12, -2,-20,-16, -9,-13, 23,-13, 8, -7,-13, 3, 10, -9, -8, -8,-20, -9, 1; /M: SY='T'; M= -2, -7,-12,-15,-12, -5,-22,-20, -3,-15, 4, -3, -7,-15,-12,-12, 8, 36, 2,-28, -8,-12; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 33, 5,-25, -3, 7,-25, 0,-30,-23, 50,-17, 0, -3, 7, -3,-30,-40,-20, 3; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30, 0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-17,-15,-27,-15, -5,-12,-23, -5,-17, 14, -2, -2, -8,-23, 2, 46,-15,-10,-12,-20, -7, -5; /M: SY='E'; M= -3, -3,-20, 2, 22,-20,-18,-10,-12, -3,-14,-12, -6,-10, 2, -8, 7, 0, -4,-32,-17, 12; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-34,-27, 3,-34,-27, 36,-27, 27, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 29,-23, -3,-27; /M: SY='D'; M=-10, 14,-25, 18, 17,-27,-18, -8,-27, 15,-23,-17, 5, -8, 4, 4, 2, 6,-19,-29,-14, 11; /M: SY='B'; M=-12, 34,-26, 33, 4,-30, 10, 0,-31, -4,-30,-24, 33,-16, -4, -8, 4, -8,-30,-36,-22, 0; /M: SY='L'; M=-13,-30,-22,-35,-25, 26,-32,-22, 22,-30, 32, 15,-25,-28,-25,-22,-25,-10, 12,-12, 8,-25; /M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10, 0,-22,-20, -4,-28, 22,-22,-12, -4, 2, 6, 52,-10,-10,-22,-22,-14, -2; /M: SY='E'; M= -3, 2,-23, 4, 19,-25, 4,-10,-27, -4,-22,-18, 1, -8, 2, -8, 10, 4,-21,-29,-20, 10; /M: SY='K'; M=-10, -6,-27, -9, -1,-20,-23,-13,-15, 25,-18, -6, -3,-13, 2, 23, -7, 0,-10,-22, -9, -1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='M'; M=-12,-18,-29,-24,-12,-13,-29,-11, 13, -5, 3, 15,-11,-18, 6, 4,-14,-10, 4,-20, -4, -6; /M: SY='E'; M= 6, 2,-25, 5, 32,-30,-15, -3,-22, 5,-17,-13, -3, -5, 22, -3, 3, -7,-22,-25,-18, 27; /M: SY='A'; M= 36,-15,-12,-22,-12,-13, -7,-20, -3,-15, 4, -3,-15,-15,-12,-20, 1, -2, 2,-20,-15,-12; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='V'; M= -5,-28,-17,-33,-28, 0,-31,-24, 33,-21, 15, 22,-25,-25,-22,-21,-15, -5, 37,-25, -5,-26; /M: SY='P'; M=-13, 9,-35, 22, 17,-33,-17,-10,-28, -3,-28,-23, -3, 41, -2,-13, -5,-10,-30,-33,-25, 5; /M: SY='T'; M= -4, -7,-16,-13, -8, -9,-22,-18, -7, -3, 0, -3, -7,-15, -8, -5, 2, 24, -2,-26, -8, -8; /M: SY='A'; M= 40, -7,-10,-15, -7,-20, 0,-17,-13,-10,-15,-13, -5,-10, -7,-17, 18, 5, -3,-25,-20, -7; /M: SY='P'; M= -8, -2,-27, -4, -1,-24,-17, -7,-10, -5,-20, -9, 4, 14, 5, -8, -2, -5,-14,-30,-19, 0; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='H'; M= -7, -4,-14, -4, 0, -9,-11, 18, -6, -5, 0, 3, -2,-10, 9, -1, -6, -7, -9,-12, 2, 4; D=-4; /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; /M: SY='D'; M= -8, 11,-21, 17, 4,-21,-12, -9,-19, -4,-18,-16, 1, 16, -4,-10, 2, 4,-16,-25,-15, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='G'; M= 0, -7,-22, -7,-15,-22, 52,-15,-30,-15,-22,-15, 0,-15,-15,-15, 0,-15,-22,-15,-22,-15; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='Y'; M=-15,-17,-20,-19,-17, 32,-22, 7, 0,-11, 2, 0,-15,-22,-13, -9,-15, -7, -5, 18, 49,-17; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='L'; M= -7,-22,-15,-22,-15, 7,-22,-15, 15,-22, 37, 15,-22,-22,-15,-15,-22, -7, 7,-15, 0,-15; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='A'; M= 18, -5,-11, -8, -7,-17, 14,-12,-16, -9,-16,-12, -1, -9, -7,-12, 12, 1, -8,-19,-17, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='D'; M=-10, 23,-22, 33, 5,-27, 11, -5,-30, -5,-22,-20, 10,-10, -5,-10, 0,-10,-22,-25,-17, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='G'; M= -5,-10,-30,-10,-15,-27, 46,-15,-37, -7,-27,-17, 0,-20,-12, 4, -3,-17,-27,-20,-25,-15; /M: SY='V'; M= 3,-15,-10,-17,-17, -8,-19,-22, 7,-15, -6, -3,-12,-20,-17,-15, 11, 16, 22,-33,-13,-17; /M: SY='E'; M=-11, 20,-26, 29, 34,-29,-17, -4,-29, 3,-21,-21, 6, -5, 8, -5, 4, 2,-24,-33,-18, 21; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='L'; M= -5, -1,-10, -5, -6, -1, -9, -4, 2, -9, 9, 2, 3,-13, -6, -6, -7, -3, -3,-14, -4, -6; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='P'; M= -5,-10,-20, -5, 0,-15,-10,-10,-10, -5,-15,-10,-10, 45, -5,-10, -5, -5,-15,-15,-15, -5; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M=-14, 7,-28, 8, 26,-24,-17, 2,-28, 16,-22,-16, 10,-11, 13, 28, -2, -8,-26,-28,-16, 17; /M: SY='R'; M= -8, -6,-22, -9, 0,-21,-21, -9,-14, 12,-15, -5, -4,-14, 11, 14, 0, 7, -7,-24,-10, 4; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='P'; M= -7, -9,-28, -2, 12,-22,-15,-11,-17, -3,-20,-15,-11, 49, -2,-11, -5, -7,-22,-22,-20, 2; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='G'; M= 2, -5,-17, -5,-10,-20, 35,-12,-25,-12,-22,-15, 2,-12,-10,-12, 9, -5,-17,-19,-20,-10; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='P'; M= -7, -9,-26, -4, 3,-22,-15,-12,-18, 11,-22,-12, -9, 36, -1, 1, -7, -7,-19,-19,-16, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='T'; M= 13,-11,-15,-21,-15,-10,-19,-23, 6,-15, -2, -2, -8,-13,-13,-18, 6, 19, 8,-24,-10,-15; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='E'; M=-12, 18,-30, 30, 52,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 4, -2, 16, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 34; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-15, 20,-25, 42, 30,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-15, 20,-25, 42, 30,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='S'; M= 2, 13,-15, 18, 5,-25, -3, -7,-25, -7,-30,-23, 13,-10, 0,-10, 30, 12,-15,-40,-20, 3; /M: SY='A'; M= 37,-15,-10,-23,-15,-15, -8,-23, 0,-13, -5, -5,-15,-15,-15,-20, 5, 0, 13,-23,-17,-15; /M: SY='T'; M= -2, -9,-13,-18,-16, -7,-25,-23, 6,-15, -2, -2, -8,-14,-14,-15, 9, 33, 12,-28, -8,-16; /M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15, 17,-27, 41, -8,-10, -5, 0,-12,-27, -5, -7,-17,-13,-15, 14, 64,-15; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -5,-13,-17,-10,-25,-17, 7,-10, -3,-10, 35, 28, -7,-37,-17, -3; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='R'; M=-12, -5,-22, -5, 2,-17,-15, -2,-22, 27,-17, -7, 0,-12, 7, 42, -7, -7,-15,-15, -7, 2; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M=-14, 14,-30, 22, 27,-33,-18, 23,-29, 4,-22,-12, 7, -9, 26, 1, -2,-12,-30,-29, -9, 25; /M: SY='L'; M=-13,-26,-20,-33,-23, 25,-26,-13, 15,-23, 29, 29,-24,-26,-18,-16,-24,-10, 7,-12, 8,-19; /M: SY='G'; M= -7, 8,-30, 15, 12,-32, 27,-10,-37, -7,-27,-22, 4,-12, -4,-12, 0,-15,-30,-27,-25, 4; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='M'; M= -7,-17,-17,-24,-17, 0,-19, -7, 22,-12, 15, 35,-15,-15, -5,-12,-15, -7, 12,-15, 0,-12; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-20,-30,-28,-35,-28, 54,-28,-13, -4,-23, 2, -4,-24,-30,-29,-18,-24,-14, -8, 42, 42,-26; /M: SY='V'; M= 0,-22,-10,-25,-25, -3,-27,-27, 20,-17, 5, 5,-22,-25,-25,-17, -2, 13, 37,-30,-10,-25; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -2,-30,-13,-32,-30, 0,-32,-30, 33,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 47,-28, -8,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M= -9, 25,-25, 36, 27,-32,-10, -3,-32, 0,-27,-24, 11, -7, 6, -7, 10, -2,-25,-37,-20, 17; /M: SY='K'; M=-10, 12,-27, 6, 7,-27,-14, -4,-27, 35,-30,-13, 18,-13, 7, 21, -4, -7,-23,-26,-13, 7; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M=-15,-30,-23,-38,-28, 42,-33,-23, 19,-30, 21, 10,-22,-27,-30,-23,-22,-10, 11, -5, 15,-28; /M: SY='C'; M= 12, -8, 15,-13, -8,-23,-12,-18,-22, 1,-22,-14, -6,-17, -8, -7, 6, -1,-10,-31,-20, -8; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 27,-18,-15,-27,-18,-12,-15,-24, 11,-17, 1, 1,-15,-15,-15,-23, -1, -3, 15,-21,-13,-18; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 90.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | S_Spirin, N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RdRp catalytic |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
RDRP_BSNV (Q8AZL8), RDRP_DXV96 (Q91CD5), RDRP_IBDV (Q9Q6Q5), RDRP_IBDV5 (P31817), RDRP_IBDVA (P12918), RDRP_IBDVB (A7L9Z4), RDRP_IBDVU (Q82630), RDRP_IPNVJ (P22173), RDRP_IPNVS (P22174)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
RDRP_HPBVH (Q50LE4) |
| PDB [Detailed view] |
10 PDB
2PGG; 2PUS; 2QJ1; 2R70; 2R72; 2YI8; 2YI9; 2YIA; 2YIB; 3ZED |