PROSITE entry PS50807

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	GCM
Accession [info]	PS50807
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2003 CREATED; 01-APR-2003 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50807
Associated ProRule [info]	PRU00245

Name and characterization of the entry

Description [info]

GCM domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=159;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=154;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0395; R2=0.01123855; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=575; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=397; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M=  1,-14,-15,-14, -9, -6,-14,-15, -1,-19,  8, -1, -9,-19, -9,-15,  7,  6, -1,-31,-11, -9;
/M: SY='D';  M= -6, 26,-21, 37, 11,-31, -5, -5,-31, -5,-30,-25, 15,-10,  0,-10, 19,  4,-21,-40,-20,  5;
/M: SY='W';  M=-20,-24,-39,-24,-14, -6,-20,-14,-25,  6,-20,-15,-19,-25, -4, 27,-24,-19,-25, 61,  9, -9;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E';  M=-10, -9,-30, -8, 17,-16,-29,-14,  8, -9, -1, -1, -9, -9,  1,-14, -9,-10, -2,-25,-11,  7;
/M: SY='W';  M=-15, -2,-36,-12,-16, -4,-11,-11,-20,-11,-25,-20,  7,-25,-11,-11,-16,-16,-30, 60,  6,-11;
/M: SY='D';  M=-15, 24,-30, 33, 15,-35,-15, -5,-35, 26,-30,-19,  9,-10,  5, 11, -5,-10,-25,-29,-15, 10;
/M: SY='K';  M= -5,-14,-21,-14, -9,-16,-25,-19, -2, 17,-11, -1,-14,-19, -9,  6,-10, -5, 13,-25,-10, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-16,-25,-16, -6, -9,-25,-15, -4,  8, 12,  6,-16,-21, -6,  4,-21,-10, -4,-20, -5, -6;
/M: SY='K';  M=-10,-14,-25,-14, -4,-11,-25,-15, -6, 12,  8,  4,-14,-19, -4,  6,-19,-10, -6,-20, -5, -4;
/M: SY='P';  M=-10, -9,-35, -5,  5,-30,-20,-15,-25, 22,-30,-15, -9, 37,  1,  6,-10,-10,-25,-25,-19,  1;
/M: SY='Q';  M=-10,-16,-30,-21, -6,-19,-31,-11, 17,-11,  1, 11,-11,-15, 18,-11,-11,-10,  2,-20, -5,  3;
/M: SY='N';  M=-10, 19,-25,  9,  5,-25,-11, -1,-25, 26,-30,-15, 28,-15,  5, 16, -1, -5,-25,-29,-15,  5;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='D';  M=-15, 26,-30, 37, 15,-35,-15, -5,-35, 24,-30,-21, 11,-10,  5,  9, -5,-10,-25,-31,-15, 10;
/M: SY='K';  M= -5,  0,-21, -5,  1,-21,-20,-15,-21, 22,-21,-10,  0,-10,  1, 11,  4, 18,-11,-25,-10,  1;
/M: SY='Y';  M=-11,-11,-21,-15,-15, 11,-25,  1, -5,-10, -5, -5,-11,-21,-10,-10, -1, 18, -5,  2, 37,-15;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='W';  M=-20,  7,-39, 18, -4,-16,-15,-14,-31, -9,-25,-25, -8,-19, -9,-15,-19,-19,-30, 50,  4, -4;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='N';  M=-10, 21,-25, 11,  9,-29, -9, 10,-20,  5,-25,-11, 32,-15, 28,  5,  5, -5,-30,-31,-15, 19;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-25,-35,-26,-16,-14,-31,-25, 17,-21, -4,  1,-20, 32,-15,-25,-15,-10,  2,-25,-14,-21;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-21, -5,-11,-25, 37,-15,-31,-15,-30,-20,  5,-15,-11,-15, 19, -1,-21,-29,-25,-11;
/M: SY='D';  M=-20, 17,-30, 27,  1, -7,-19,  9,-21, -5,-16,-16,  1,-19, -5,-10, -9,-10,-21, -7, 27, -4;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='T';  M= -5,  0,-19, -5, -1,-19,-20,-15,-19, 18,-19,-10,  0,-10, -1,  9,  6, 22, -9,-25,-10, -1;
/M: SY='H';  M=-15,-11,-25,-16,-11, -9,-20, 47, -4,-10,  1, 32, -6,-20,  5, -5,-15,-15, -9,-25,  9, -5;
/M: SY='R';  M=-15,-19,-30,-24,-14,-11,-29,-14,  8,  2, -1,  4, -9,-20, -4, 23,-15,-10,  4,-20, -5,-14;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='L';  M= -1,-16,-15,-16,-11, -4,-16,-15,  1,-21, 12,  1,-11,-21,-11,-15,  3,  4,  1,-29, -9,-11;
/M: SY='P';  M= -1,-11,-26, -5,  0,-25,-11,-15,-20,-10,-30,-20, -6, 43, -5,-15, 14,  4,-21,-35,-25, -5;
/M: SY='D';  M=-15, 24,-30, 33, 15,-35,-15, -5,-35, 26,-30,-19,  9,-10,  5, 11, -5,-10,-25,-29,-15, 10;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='R';  M=-15,-21,-30,-26,-16, -9,-31,-16, 12, -2,  1,  6,-11,-20, -6, 17,-15,-10,  6,-20, -5,-16;
/M: SY='D';  M=-15, 45,-25, 46, 11,-31, -5,  5,-31,  0,-30,-25, 39,-15,  0, -5,  5, -5,-30,-40,-20,  5;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  9,-29,-20,  5,-25, 21,-20, -5,  0,-15, 34, 42, -5,-10,-25,-20,-10, 19;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-21, -5,-11,-25, 37,-15,-31,-15,-30,-20,  5,-15,-11,-15, 19, -1,-21,-29,-25,-11;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M= -1,  0,-21,  0,  5,-25,-11,-10,-25, 22,-30,-15,  5,-10,  5, 11, 14,  4,-15,-29,-15,  5;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='F';  M=-11,-30,-15,-35,-30, 42,-30,-25, 14,-25, 10,  5,-25,-30,-35,-20,-15, -5, 24, -9, 11,-30;
/M: SY='L';  M= -5,-30,-15,-30,-25,  5,-30,-25, 25,-25, 31, 15,-30,-30,-25,-20,-21, -5, 29,-25, -5,-25;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='G';  M= -9, 18,-30, 28, -1,-35, 32,-11,-40,-11,-30,-25,  9,-15,-11,-15,  0,-15,-30,-29,-25, -6;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M= -6, -5,-21, -5,  0,-20,-11, -5,-25, 11,-25,-15,  5,-15,  5, 32, 14,  4,-15,-29,-15,  0;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='E';  M=  1,  5,-19,  9, 28,-25, -9, -5,-25, -1,-25,-20,  5, -5,  9, -5, 21,  6,-19,-35,-20, 19;
/M: SY='E';  M=  1,  5,-19,  9, 28,-25, -9, -5,-25, -1,-25,-20,  5, -5,  9, -5, 21,  6,-19,-35,-20, 19;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M=-15,  1,-30,  6, 32,-25,-20,  0,-30, 19,-20,-15,  0, -9, 15, 33, -5,-10,-25,-25,-15, 21;
/M: SY='I';  M=-10,-16,-30,-21,-11,-14,-31,-21, 12,  8, -4,  6,-11,-15, -6, -2,-15,-10,  6,-20, -5,-11;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='Y';  M= -9, -9,-19,-15,-15,  9,-25, -1, -5,-10, -5, -5, -9,-19,-10,-10,  1, 22, -5, -2, 33,-15;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-15,-30,-25,  5,-30,-25, 25,-25, 29, 15,-30,-30,-25,-20,-19, -5, 31,-25, -5,-25;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='T';  M= -5,-14,-19,-24,-19, -5,-29,-25, 18,-19,  4,  4, -9,-15,-15,-19,  1, 22, 14,-25, -5,-19;
/M: SY='C';  M=  1, -9, 52,-14,-14,-20,-14,-19,-25,-19,-25,-20, -4,-24,-14,-19, 16,  6,-10,-45,-25,-14;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 39,-25,-10,  0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 15,-35,-20, -1,-25, 31,-25, -5,  0,-10, 34, 21, -5,-10,-25,-20,-10, 24;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='G';  M= -5, -5,-30, -5, -1,-35, 27, -6,-31, -6,-25,-11,  0,-15, 18, -6,  0,-15,-30,-20,-21,  8;
/M: SY='D';  M=-20, 22,-30, 32, 11,-31,-15,  0,-35, 14,-25,-21, 11,-15,  5, 28, -5,-10,-25,-31,-15,  5;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='K';  M= -1,  0,-21,  0,  5,-25,-11,-10,-25, 22,-30,-15,  5,-10,  5, 11, 14,  4,-15,-29,-15,  5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M=-15, 14,-25,  4,  0,-20,-11,  5,-25, 16,-25,-15, 28,-20,  5, 37, -1, -5,-25,-29,-15,  0;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='T';  M=  0,  0, -5, -5, -5, -5,-11,-11, -5, -5, -5, -5,  0, -5, -5, -5, 11, 26,  0,-16, -5, -5; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  0, -5,-16, -5,-11,-16, 37,-11,-21,-11,-16,-11,  0,-11,-11,-11,  0,-11,-16,-11,-16,-11; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M=-15, 45,-25, 46, 11,-31, -5,  5,-31,  0,-30,-25, 39,-15,  0, -5,  5, -5,-30,-40,-20,  5;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M=-10, -9,-35, -5,  5,-30,-20,-15,-25, 22,-30,-15, -9, 37,  1,  6,-10,-10,-25,-25,-19,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F';  M=-15,-16,-25,-21,-11, 28,-25,-15,-14,  8, -9, -5,-11,-21,-16,  4,-15,-10, -9, -4, 11,-11;
/M: SY='H';  M=-15,-14,-25,-14, -9, -6,-25, 43, -6,-19, 13,  9, -9,-25, -4, -9,-19,-15,-11,-25, 11, -9;
/M: SY='M';  M=-10,-25,-25,-35,-25,  0,-29,-14, 34,-19, 20, 41,-20,-20, -9,-19,-20,-10, 19,-20,  0,-19;
/M: SY='P';  M=-10,-25,-35,-26,-16,-14,-31,-25, 17,-21, -4,  1,-20, 32,-15,-25,-15,-10,  2,-25,-14,-21;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M= 17,-10,-19,-15, -5,-20, -9,-11,-19,  9,-15,-10, -5,-15, -1, 23,  1, -5, -9,-20,-15, -5;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H';  M=-15,  0,-30,  0,  5,-25,-20, 42,-30, 22,-25, -5,  5,-15, 10, 16,-10,-15,-25,-25,  4,  5;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-19, -5, -9,-25, 33,-15,-29,-15,-30,-20,  5,-15, -9,-15, 21,  1,-19,-31,-25, -9;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-25,-25,-29,-25, 54,-30,  1,  0,-19,  5,  0,-20,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 21, 56,-25;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='H';  M=-15, 19,-25,  9,  0,-20,-11, 57,-25, -5,-25, -9, 34,-20,  5,  0, -1,-11,-30,-35,  1,  0;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H';  M= -9,-16,-19,-16,-16, -9,-25, 32,  2,-15, -4,  5,-11,-25,-11,-11,-10, -9, 12,-30,  4,-16;
/M: SY='D';  M= -9, 24,-19, 28,  4,-24,-15,-11,-24, -5,-19,-19,  9,-10, -5,-10, 11, 22,-14,-35,-15, -1;
/M: SY='D';  M=-11, 22,-30, 32,  1,-35, 28, -9,-40, -9,-30,-25, 11,-15, -9,-15,  0,-15,-30,-31,-25, -4;
/M: SY='R';  M= -9, -5,-19,-10, -5,-15,-20,-11,-19,  9,-15,-10,  0,-15, -1, 28,  6, 22, -9,-25,-10, -5;
/M: SY='F';  M= -9,-30,-15,-35,-30, 38,-30,-25, 16,-25, 10,  5,-25,-30,-35,-20,-15, -5, 26,-11,  9,-30;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-20,-35,-25, 43,-30,-20, 11,-30, 31, 11,-25,-30,-29,-20,-25,-10,  5, -6, 14,-25;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M= -5,-11,-19, -6, 13,-14,-25,-16,  2, -6, -4, -4,-16,-16, -6,-11, -5, -5, 12,-30,-15,  3;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='D';  M=-11, 26,-16, 37, 11,-21, -5,  0,-21,  0,-16,-16, 11, -5,  0, -5,  0, -5,-16,-21,-11,  5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -5,-11,-19, -6, 13,-14,-25,-16,  2, -6, -4, -4,-16,-16, -6,-11, -5, -5, 12,-30,-15,  3;
/M: SY='V';  M=  0,-16,-10,-21,-21, -5,-25,-25, 11,-15,  1,  1,-16,-21,-21,-15,  4, 24, 26,-30,-10,-21;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='T';  M= -5,-14,-15,-19,-15, -1,-25,-20,  4,-19, 18,  4,-14,-19,-15,-15, -4, 22,  5,-25, -5,-15;
/M: SY='E';  M= -5,  5,-19,  4, 23,-19,-20,-11,-19, -1,-15,-15,  0, -5,  4, -5, 11, 22,-14,-30,-15, 14;
/M: SY='A';  M= 29, -5,-10, -9, -5,-20,  0,-15,-15,-10,-21,-15,  1,-10, -5,-15, 26, 11, -5,-31,-20, -5;
/M: SY='Q';  M=-10,  5,-30,  9, 39,-35,-20,  5,-25, 10,-20, -9,  0, -5, 41,  5,  0,-10,-30,-25,-15, 40;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='R';  M=-15,-21,-25,-21,-11, -4,-25,-11, -4, -2, 17,  6,-16,-25, -6, 23,-21,-10, -4,-20, -5,-11;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='M';  M=-10,-25,-20,-30,-20,  5,-25,-11, 20,-21, 36, 39,-25,-25,-11,-15,-25,-10, 10,-20,  0,-15;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	7 in 7 different sequences
Number of true positive hits	7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	GCM
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

7 sequences

GCM1_HUMAN  (Q9NP62), GCM1_MOUSE  (P70348), GCM1_RAT(Q9Z288),

GCM2_DROME  (Q9VLA2), GCM2_HUMAN  (O75603), GCM2_MOUSE  (O09102), 
GCM_DROME   (Q27403)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

1ODH