 |
|
| Entry: PS50824 |
General information about the entry
| Entry name [info] | DAPIN |
| Accession [info] | PS50824 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 07-APR-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50824 |
| Associated ProRule [info] | PRU00061 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | DAPIN domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2703000; R2=0.0157633; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4960.8281250; R2=6.5158372; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=459; H_SCORE=7952; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=332; H_SCORE=7124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 22, -4,-10, -9, -3,-16, -3,-11,-11, 1,-13, -9, -3, -7, -3, -6, 9, 1, -4,-17,-13, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='K'; M= -6, -1,-25, 0, 7,-25, 9,-10,-28, 16,-24,-13, 0,-10, 1, 6, -4,-11,-21,-18,-16, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='Y'; M= -8, -7,-24, -7, -1, -8, -6, -2,-19, -3,-16,-12, -4,-17, -3, 1, 2, 1,-16,-12, 9, -4; /M: SY='A'; M= 5,-10,-24,-13, -5, -9,-16, 1,-18, 4,-17, -8, -7, -1, -6, -3, -6, -9,-14,-18, -5, -6; /M: SY='R'; M=-12, -2,-29, -4, 5,-18,-15, -6,-26, 13,-24,-16, 3,-16, 4, 20, -4, -8,-23, -1, -8, 4; /M: SY='D'; M=-10, 4,-30, 8, 0,-24, 5,-14,-13,-13,-15,-12, 0,-14, -9,-17, -6,-13,-13,-27,-17, -6; /M: SY='H'; M= -3,-16,-20,-17,-13,-10,-22, 14, -3,-10, 0, 3,-11,-23, -9, -1,-10, -9, 4,-26, -2,-13; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='L'; M= -1,-23,-21,-26,-14, -3,-25,-17, 14,-21, 26, 12,-21,-22, -7,-17,-18, -8, 6,-20, -5,-11; /M: SY='T'; M= -6, 5, 2, 5, 5,-23,-18,-13,-24, -1,-21,-17, 1,-13, -3, -6, 8, 11,-14,-34,-17, 1; /M: SY='A'; M= 11,-13,-19,-17,-17,-11, 8,-15,-11,-14,-11, -8,-10,-19,-16,-17, 1, -1, -2,-15, -4,-17; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 20,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10, 9,-16, 4,-21; /M: SY='E'; M=-11, 16,-30, 27, 54,-31,-19, 0,-31, 9,-21,-21, 3, -1, 17, -1, 0,-10,-30,-31,-20, 36; /M: SY='N'; M=-12, 17,-21, 11, 2, -6,-13, -3,-14, -6,-17,-14, 22,-19, -8, -7, 0, -4,-14,-30,-11, -2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='T'; M= -1, 0,-17, -5, -8,-18, -2,-14,-15, -2,-19,-12, 6,-15, -8, -5, 10, 13, -7,-30,-16, -8; /M: SY='D'; M= 3, 16,-26, 23, 7,-31,-10,-10,-27, 4,-24,-20, 3, 3, -3, -8, 0, -7,-20,-30,-20, 2; /M: SY='Y'; M=-16, 3,-30, 11, 21, -6,-23, 8,-19, 0,-13,-13, -5,-14, 4, -6, -8,-10,-22, -6, 22, 10; /M: SY='E'; M=-13, 17,-29, 21, 32,-30,-16, 17,-28, 4,-23,-16, 13, -8, 19, 0, 0,-10,-30,-31,-13, 25; /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24, 39,-30,-20, 12,-30, 33, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10, 6, -7, 13,-24; /M: SY='K'; M=-14, 6,-30, 10, 15,-29,-19, -4,-31, 32,-26,-14, 3,-12, 10, 32, -7,-10,-23,-24,-13, 11; /M: SY='K'; M=-11, -6,-27, -7, 8,-20,-20, -4,-16, 24,-13, 9, -6,-13, 9, 19,-11,-10,-13,-22, -9, 7; /M: SY='F'; M=-17,-30,-19,-39,-30, 69,-30,-21, 4,-29, 10, 1,-21,-30,-39,-20,-19, -9, 7, 4, 24,-30; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='K'; M= -8, 0,-25, 0, 10,-27,-17, -5,-24, 36,-24, -7, 0, -8, 16, 22, -7, -8,-19,-17, -8, 13; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M= -7,-21,-19,-26,-19, 19,-23,-19, 8,-24, 12, 3,-14,-23,-20,-19, -6, -1, 5,-17, 3,-19; /M: SY='Y'; M=-13,-16,-26,-17, -9, 6,-26,-10, -7, 6, 4, 2,-15,-22, -9, 2,-19,-10, -7, -8, 12, -9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 15, -9,-17,-12, -6,-20, 3,-13,-14,-12,-12, -9, -4,-14, -1,-13, 10, 0,-10,-26,-17, -3; /M: SY='N'; M=-10, 28,-21, 24, 3,-23, -6, 3,-20, -3,-22,-11, 30,-16, 0, -6, 7, -2,-21,-37,-17, 1; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M= -5, -3,-14, -3, 3,-14, -8, 0,-14, 8,-13, -6, 2, -9, 11, 20, 3, -1,-11,-15, -7, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='R'; M= -9, -2,-17, 0, 10,-14,-11, -1,-17, 17,-13, -7, 0, -7, 7, 25, -4, -6,-13,-13, -7, 7; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='E'; M= -3, 1,-19, 4, 17,-22, 1, -3,-20, 0,-17,-12, 2, -6, 12, -3, 6, -4,-19,-20,-14, 14; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='D'; M=-12, 15,-27, 23, 20,-22,-15, 14,-27, -1,-22,-17, 6,-11, 6, -6, 2, -7,-24,-26, -1, 12; /M: M= -4,-17,-21,-17,-13, 0, -6,-17, -8,-20, -1, -6,-12, -5,-16,-17, -1, -3, -9,-23,-10,-14; /M: SY='R'; M=-14, -3,-29, -6, -5,-15, -5, 0,-26, 15,-21,-11, 5,-20, 1, 29, -7,-10,-21,-15, -1, -5; /M: SY='I'; M= -9,-24,-26,-28,-15, -3,-34,-24, 31,-22, 16, 12,-20,-20,-15,-23,-17, -9, 21,-23, -5,-18; /M: SY='P'; M= 1, 0,-22, -3, 5,-21,-14,-13,-17, -6,-20,-16, 1, 17, -4,-11, 6, 11,-17,-30,-20, -1; /M: SY='R'; M=-13,-11,-27,-11, -3,-17,-21,-10,-19, 13,-12, -7, -7, -1, 0, 27, -9, -2,-15,-23,-12, -4; /M: SY='A'; M= 17, -6,-18, -9, -7,-24, 17,-16,-24, -5,-24,-16, 0,-13, -7,-10, 13, -1,-14,-26,-21, -7; /M: SY='Q'; M= 7, -4,-23, -7, 11,-26,-14, -4,-15, 7,-13, 1, -6,-10, 19, 0, -1, -7,-15,-22,-13, 15; /M: SY='I'; M=-11,-21,-29,-22,-12, -9,-28,-19, 8, -7, 8, 5,-17, -4,-10, -3,-18,-10, 1,-22, -8,-14; /M: SY='E'; M=-11, 2,-29, 8, 35,-24,-21, 13,-22, 2,-10, -9, -3, -8, 18, -1, -6,-11,-24,-27,-10, 26; /M: SY='K'; M=-10, -3,-29, -1, 11,-26,-20,-10,-26, 25,-24,-13, -3, 4, 6, 19, -4, -2,-20,-24,-14, 7; /M: SY='M'; M= 7,-17,-19,-24,-17, -1,-20,-13, 9,-16, 9, 10,-16,-19,-12,-17, -7, 2, 6,-15, 4,-16; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-14, 33,-25, 42, 11,-31, -8, 0,-33, 2,-29,-24, 21,-13, 1, 2, 6, -4,-26,-37,-19, 6; /M: SY='R'; M= -3, -7,-29, -6, 6,-26, -3,-10,-27, 11,-23,-14, -4, 0, 1, 16, -4,-10,-22,-23,-19, 1; /M: SY='I'; M= -9,-28,-24,-36,-27, 1,-34,-24, 39,-26, 23, 25,-23,-23,-18,-24,-20, -9, 27,-21, -1,-26; /M: SY='D'; M=-14, 23,-30, 34, 25,-37,-16, 1,-32, 11,-26,-17, 9, -8, 21, 2, -1,-10,-29,-30,-16, 23; /M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-31,-24, 4,-30,-22, 27,-24, 30, 22,-27,-27,-20,-20,-21, -7, 25,-23, -3,-23; /M: SY='A'; M= 43, -9,-10,-19,-10,-19, -3,-20,-10,-10,-10,-10, -9,-10,-10,-19, 11, 7, 0,-21,-19,-10; /M: SY='D'; M=-10, 21,-21, 27, 6,-26,-13, 8,-27, -6,-23,-18, 11,-12, -1, -8, 10, 9,-19,-36,-11, 1; /M: SY='L'; M=-12,-20,-24,-20,-11, 2,-27,-11, 2, -4, 19, 8,-20,-24,-10, -4,-23,-10, -2,-12, 9,-11; /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22, 4,-27,-13, 25,-22, 33, 37,-24,-24,-12,-17,-24,-10, 13,-20, 0,-17; /M: SY='V'; M= -1,-20,-16,-20,-13, -7,-26,-23, 17,-16, 1, 3,-18,-21,-17,-17, -2, 0, 27,-30,-11,-16; /M: SY='E'; M= 5, 0,-22, 0, 14,-26, -1, -9,-23, -3,-20,-14, 0, -9, 8, -7, 10, 2,-19,-27,-19, 11; /M: SY='Q'; M=-11, -6,-24,-10, -4, -4,-21, -1, -9, 2,-12, -3, -1,-20, 8, 0, -7, -7,-10,-14, 6, 2; /M: SY='Y'; M=-10,-21,-24,-26,-21, 37,-26, 3, -1,-16, 1, -1,-19,-27,-19,-14,-16, -9, -6, 17, 52,-21; /M: SY='G'; M= -6,-14,-24,-16,-16,-14, 16,-17,-17,-15, -3, -6, -9,-21,-14, -6, -7, -6,-13,-21,-16,-16; /M: SY='E'; M= 4, 0,-24, 3, 18,-27, 12,-10,-29, -4,-23,-19, 0, -9, 1,-10, 7, -7,-23,-27,-23, 10; /M: SY='T'; M= -7, 4,-21, 5, 8,-23,-20,-10,-16, 4,-16,-10, -1,-12, 6, -1, 3, 9, -9,-28,-13, 7; /M: SY='D'; M= -6, 7,-24, 11, -1,-12,-14, 1,-21, -1,-18,-15, 1,-17, -3, 1, 0, -4,-16,-15, 9, -4; /M: SY='A'; M= 26,-12,-19,-17,-14,-15, 15,-14,-17,-13,-14,-11, -9,-16,-13,-18, 3, -7,-10,-12, -8,-14; /M: SY='V'; M= 1,-29,-21,-32,-26, 0,-26,-27, 18,-21, 10, 5,-27,-26,-23,-22,-16, -8, 22, 2, -2,-24; /M: SY='E'; M= -7, 6,-26, 11, 18,-27, -3, -3,-23, -1,-19, -8, 2,-10, 11, -6, 3, -7,-21,-29,-17, 14; /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-23,-15, 8,-27,-19, 5, -6, 16, 7,-20,-24,-16, -6,-20, -9, 6,-17, 0,-15; /M: SY='T'; M= 5, -9,-13,-17,-13, -7,-18,-17, -1,-13, 3, 5, -9,-14,-10,-13, 6, 25, 3,-26, -9,-11; /M: SY='I'; M= 0,-23,-21,-27,-18, -4,-27,-23, 18,-14, 15, 10,-20,-21,-16,-15,-16, -7, 16,-21, -6,-18; /M: SY='R'; M=-14, 4,-29, 3, 13,-25,-17, 17,-27, 17,-23,-10, 10,-14, 17, 26, -4,-10,-26,-26, -8, 12; /M: SY='V'; M= -4,-25,-18,-31,-27, -2,-33,-28, 32,-23, 11, 11,-21,-23,-23,-23,-10, 3, 34,-26, -6,-27; /M: SY='F'; M=-13,-27,-23,-31,-23, 26,-27,-22, 4,-25, 19, 4,-24,-27,-24,-18,-21, -4, 0, 13, 11,-21; /M: SY='R'; M=-16, 6,-30, 12, 23,-29,-18, 1,-30, 17,-22,-15, 3,-11, 18, 29, -4,-10,-26,-26,-14, 19; /M: SY='D'; M= 2, 6,-23, 8, 3,-15,-13, -8,-21, 1,-17,-12, 0,-13, 2, -6, -2, -7,-16,-21,-10, 3; /M: SY='I'; M=-10,-27,-26,-36,-26, 1,-33,-20, 37,-24, 24, 32,-21,-21,-14,-23,-21,-10, 21,-20, 0,-23; /M: SY='P'; M= -7, 2,-30, 0, -4,-27, 12,-10,-27, -1,-30,-19, 11, 13, -7, -7, -2,-10,-29,-28,-24, -7; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M=-11,-10,-24,-13, -7, -4,-23, -5, -1, -5, 10, 4, -7,-23, -1, -4,-16, -9, -8,-16, 6, -5; /M: SY='R'; M= -3,-10,-23,-12, 2,-18,-19, -6,-10, 5, -8, 3, -9,-16, 8, 14, -6, -7, -5,-23,-11, 4; /M: SY='L'; M= -8, -7,-21, -3, -2, -5,-21, -8, -3,-13, 4, -3,-11,-20, -9,-13, -6, -4, -1,-21, 2, -6; /M: SY='L'; M= 0,-26,-17,-29,-20, 3,-24,-19, 17,-23, 31, 20,-26,-26,-17,-19,-20, -7, 15,-22, -4,-19; /M: SY='A'; M= 20, 6, 4, 5, -4,-26, -8,-16,-22,-10,-17,-17, -3,-15,-10,-19, 4, -5,-10,-31,-22, -7; /M: SY='E'; M= 2, 7,-24, 11, 16,-28, 0, -9,-28, 4,-24,-19, 3, -9, 2, -5, 6, -5,-21,-29,-20, 9; /M: SY='Q'; M=-10, -9,-24, -9, 6,-17,-23, -6, -9, -2, 2, 1, -9,-16, 14, 5, -8, -2,-13,-23, -8, 10; /M: SY='L'; M= -1,-27,-18,-28,-18, 5,-25,-20, 15,-27, 41, 15,-27,-27,-18,-20,-24, -8, 8,-20, -3,-18; /M: SY='Q'; M= -4, -3,-27, -4, 9,-30,-17, 13,-23, 13,-20, -4, 0,-13, 29, 16, -3,-10,-23,-21, -8, 17; /M: SY='R'; M= -5, 5,-26, 3, 18,-24,-14, -3,-26, 17,-21,-14, 7,-11, 9, 21, -1, -7,-22,-26,-16, 12; /M: SY='A'; M= 18, -3,-19, -6, 8,-23, 2,-14,-20, -6,-16,-14, -4, -9, -3,-13, 7, 1,-13,-24,-20, 2; /M: SY='A'; M= 10, -3,-22, -6, 5,-24, -1,-14,-23, 8,-20,-13, -3,-10, -1, -2, 3, 0,-14,-23,-17, 2; /M: SY='Q'; M= -1,-10,-26,-11, 0,-19, -7, 2,-10,-11, -5, -2, -7,-16, 3,-11, -7,-11,-12,-23, -9, 0; /M: SY='Q'; M=-10, 8,-27, 11, 11,-31,-16, 14,-27, 14,-26,-10, 6,-12, 21, 8, 2, -7,-24,-27, -8, 15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 56 in 56 different sequences |
| Number of true positive hits | 56 in 56 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 94.92 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | DAPIN |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
56 sequences
AIM2_HUMAN (O14862 ), AIM2_MOUSE (Q91VJ1 ), ASC_BOVIN (Q8HXK9 ), ASC_DANRE (Q9I9N6 ), ASC_HUMAN (Q9ULZ3 ), ASC_MOUSE (Q9EPB4 ), CASPA_DANRE (Q9I9L7 ), CASPB_DANRE (Q504J1 ), IF16_HUMAN (Q16666 ), IF16_PONAB (Q5RD14 ), IFI3_MOUSE (O35368 ), IFI4_MOUSE (P0DOV2 ), IFI5A_MOUSE (Q8CGE8 ), IFI5B_MOUSE (P0DOV1 ), IFIXL_MOUSE (Q504N7 ), IFIX_HUMAN (Q6K0P9 ), IFIX_MOUSE (Q8BV49 ), MEFV_HUMAN (O15553 ), MEFV_MOUSE (Q9JJ26 ), MEFV_RAT (Q9JJ25 ), MNDAL_MOUSE (D0QMC3 ), MNDA_HUMAN (P41218 ), MNDA_MACFA (Q8SPH9 ), NAL10_HUMAN (Q86W26 ), NAL10_MOUSE (Q8CCN1 ), NAL11_HUMAN (P59045 ), NAL12_HUMAN (P59046 ), NAL12_MOUSE (E9Q5R7 ), NAL13_HUMAN (Q86W25 ), NAL14_HUMAN (Q86W24 ), NAL4A_MOUSE (Q8BU40 ), NAL4C_MOUSE (Q3TKR3 ), NAL4E_MOUSE (Q66X19 ), NALP2_HUMAN (Q9NX02 ), NALP4_HUMAN (Q96MN2 ), NALP5_BOVIN (Q647I9 ), NALP5_HUMAN (P59047 ), NALP7_HUMAN (Q8WX94 ), NALP8_HUMAN (Q86W28 ), NLR9B_MOUSE (Q66X22 ), NLR9C_MOUSE (Q66X01 ), NLRP1_HUMAN (Q9C000 ), NLRP3_BOVIN (A6QLE5 ), NLRP3_HUMAN (Q96P20 ), NLRP3_MACMU (B0FPE9 ), NLRP3_MOUSE (Q8R4B8 ), NLRP3_RAT (D4A523 ), NLRP6_HUMAN (P59044 ), NLRP6_MOUSE (Q91WS2 ), NLRP6_RAT (Q63035 ), NLRP9_BOVIN (Q288C4 ), NLRP9_HUMAN (Q7RTR0 ), PYDC1_HUMAN (Q8WXC3 ), PYDC2_HUMAN (Q56P42 ), PYDC3_MOUSE (Q3V3Q4 ), PYDC5_HUMAN (W6CW81 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
NAL4B_MOUSE (Q8C6J9 ), NAL4F_MOUSE (Q66X05 ), NLR9A_MOUSE (Q66X03 ) |
| PDB [Detailed view] |
33 PDB
1PN5; 1UCP; 2DBG; 2DO9; 2HM2; 2KM6; 2KN6; 2L6A; 2M5V; 2MPC; 2N00; 2N1F; 2NAQ; 2YU0; 3J63; 3QF2; 3VD8; 4EWI; 4N1J; 4N1K; 4N1L; 4O7Q; 4QOB; 4XHS; 5GPP; 5H7N; 5H7Q; 5WPZ; 6MB2; 6NCV; 6NDJ; 6NPY; 6Z2G » more |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission