PROSITE entry PS50826
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RUN |
| Accession [info] | PS50826 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50826 |
| Associated ProRule [info] | PRU00178 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RUN domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=135; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=130; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5367000; R2=0.0218570; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7839.8466797; R2=3.3516746; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=319; H_SCORE=8909; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; H_SCORE=8450; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='B'; M= -7, 3,-24, 3, 2,-17,-15, -1,-15, -7,-12,-10, 2,-15, -4, -7, -2, 0,-12,-21, -9, -1; /M: SY='E'; M= -5, -3,-21, -2, 4,-15,-14, -6, -7,-10, -7, -7, -2,-16, -5,-11, 1, -3, -4,-31,-13, -1; /M: SY='E'; M= -8, -1,-23, 0, 4,-17,-15, -7,-14, -3, -9, -9, -2,-12, -3, -1, -2, 1,-10,-29,-13, 0; /M: SY='D'; M= -7, 4,-13, 5, -2,-15,-10, -3,-17,-11,-13,-12, 3,-17, -6,-11, 5, 3,-14,-28, -6, -4; /M: M= -4, -7, -3, -7, 0,-17,-13,-14,-15,-10,-12,-11, -8,-12, -8,-13, -1, -3,-10,-28,-13, -5; /M: M= -5,-13,-24,-12,-11,-14, -1,-11, -6,-15, -8, -4,-10,-16,-11,-15, -4, -8, -2,-24,-10,-12; /M: SY='V'; M= -7,-14,-21,-16,-10, -5,-24,-15, 1, -8, 3, 1,-12,-20, -8, 0, -7, -1, 5,-23, -7,-10; /M: SY='Q'; M= -3, 1,-17, 0, 1,-24,-10,-11,-18, 1,-18,-10, 1,-14, 4, -4, 3, 1,-13,-28,-15, 2; /M: SY='S'; M= 1, 1,-20, -4, -2,-21, 0, -8,-20, -3,-19,-13, 8,-15, 1, 2, 9, 4,-16,-28,-17, -1; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-19, 16,-29, 41, 18,-28,-30,-23,-20,-28,-10, 8,-14, 6,-21; /M: SY='C'; M= 1,-21, 68,-29,-27,-12,-25,-28,-14,-25,-11,-12,-20,-33,-27,-26, -7, -6, 3,-39,-22,-27; /M: M= -5, -3,-24, -4, -2,-18, -9,-12,-12, -5,-12, -9, -1, -8, -6, -4, -2, -4,-10,-27,-15, -6; /M: SY='A'; M= 21, -8, -8,-14,-10,-16,-10,-15, -7,-13, -8, -8, -7,-15,-10,-17, 7, 5, 0,-27,-15,-11; /M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-31,-23, 10,-29,-19, 23,-26, 35, 23,-27,-28,-20,-19,-24, -9, 17,-20, 0,-21; /M: SY='E'; M=-12, 9,-30, 17, 39,-30,-19, 5,-30, 14,-22,-16, 2, -6, 20, 10, -2,-10,-28,-28,-15, 29; /M: SY='Q'; M= 14, -5,-13,-10, 3,-26,-11, 1,-18, -1,-16, -8, -4,-13, 15, -2, 4, -5,-15,-24,-14, 8; /M: SY='L'; M= -1,-25, 6,-31,-24, -3,-29,-25, 15,-27, 17, 8,-23,-27,-21,-25,-17, -8, 14,-27, -9,-24; /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-35,-25, 29,-30,-20, 16,-27, 25, 15,-25,-28,-24,-21,-25,-11, 7, 2, 11,-24; /M: SY='Q'; M= -3, -7,-22, -6, 4,-15,-18, -7, -6, -7, -3, -1, -7,-15, 5, -8, -1, -4, -8,-24, -7, 4; /M: SY='H'; M=-19, 3,-23, 6, 0,-18,-20, 63,-26,-10,-16, -4, 5,-20, 6, -4,-10,-16,-25,-27, 14, -1; /M: SY='G'; M= -2, -9,-30, -9,-17,-30, 60,-17,-38,-16,-29,-18, 0,-19,-14,-13, -1,-19,-29,-20,-28,-16; /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-21, 18,-30,-19, 16,-26, 38, 17,-26,-29,-20,-15,-27,-10, 8,-16, 4,-20; /M: SY='R'; M=-14, -7,-30, -7, 4,-24,-21, 0,-22, 25,-18, -5, -2,-16, 16, 35,-10,-10,-18,-20, -8, 8; /M: SY='E'; M= -2, 2,-24, 4, 9,-24,-14, -7,-19, 4,-19,-13, 1, -8, 4, 7, 3, -4,-15,-28,-16, 5; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='K'; M= -6, -4,-17, -3, 1,-18,-15,-10,-21, 5,-20,-14, -1, 3, -2, 5, 0, -4,-17,-26,-15, -2; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='A'; M= 7,-10,-18,-14, -6, -8,-13, -3,-11, -3, -6, -4, -7,-15, -1, 1, -2, -3, -8,-18, -6, -4; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='L'; M= -2,-18,-20,-19,-12, -1,-11,-18, 0,-16, 10, 2,-16,-14,-15,-15,-12, -6, -1,-18, -7,-13; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='F'; M= -3, -9,-10,-12,-11, 1, -8,-12,-11,-10, -7, -7, -7,-17,-13, -8, -1, 0, -5,-16, -3,-12; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='A'; M= 1,-11,-18,-14,-10, -5, -3, -7,-10, -8, -2, -3, -8,-16, -9, -6, -5, -4, -7,-14, -3,-10; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: M= -4,-11,-18,-13, -7, -1, -5,-12,-11, -7, -8, -7, -6, -9,-10, -3, -2, -3, -8,-15, -6, -9; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='R'; M= -4, -5,-13, -9, -5, -2,-12, -6, -7, 1, -7, -2, -2,-12, -2, 6, -1, 1, -4,-14, -4, -4; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='S'; M= 1, 0, -9, -2, -3,-10, 3, -6, -9, -5,-12, -8, 5, -7, -3, -3, 10, 5, -6,-17, -9, -3; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: M= -2, -6,-14, -5, -4, -7, -6, -7, -6, -6, -6, -5, -7, 0, -4, -8, -4, -4, -6, -3, -3, -4; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='A'; M= 1, -6,-11, -8, -5, -4, -4, -7, -5, 0, -6, -1, -3, -8, -4, -1, 0, -2, -3,-11, -5, -5; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='N'; M= 0, 8,-21, 3, 6,-23,-11, -3,-17, 3,-17, -9, 12,-13, 9, 1, 5, -1,-18,-29,-15, 7; /M: SY='T'; M= 1,-12,-13,-15,-10,-12,-16,-14, -7, -8,-10, -3,-10, -4, -8, -8, 4, 7, -3,-26,-10,-10; /M: SY='S'; M= 2, -3,-12, -5, -8,-14, -4, 8,-20,-12,-19,-12, 2,-17, -7,-12, 9, 0,-13,-28, -6, -8; /M: SY='F'; M= -7,-25,-25,-28,-19, 19,-26,-18, 6,-22, 10, 2,-21, -4,-22,-20,-17, -9, 0, -9, 7,-21; /M: SY='W'; M=-19,-39,-46,-39,-29, 14,-21,-29,-15,-21,-12,-15,-38,-30,-21,-20,-38,-27,-25,126, 27,-21; /M: SY='D'; M= -5, 10,-23, 14, 8,-26,-10, -3,-22, -5,-20,-15, 4, -4, 3, -9, 6, 1,-18,-32,-16, 5; /M: SY='F'; M=-14,-23,-24,-26,-19, 23,-28, -9, 3,-15, 6, 5,-19,-15,-19,-13,-18,-10, 0, -6, 17,-19; /M: SY='I'; M= -7,-29, -7,-34,-28, 3,-34,-28, 29,-27, 18, 12,-25,-27,-25,-25,-18, -7, 28,-25, -5,-28; /M: SY='E'; M= -3, -7,-23, -6, 11,-19,-15, -9,-13, 1, -5, -3, -8,-13, 6, -1, -5, -5,-12,-24,-13, 8; /M: SY='K'; M= -3, -2,-23, -2, 1,-19,-18, -2,-17, 8,-12, -7, -4,-15, 1, 4, -5, -3,-11,-22, -6, 0; /M: SY='F'; M= 0,-18,-18,-23,-19, 9,-22, -9, 6,-18, -1, 0,-13,-21,-17,-17, -3, 0, 9,-16, 6,-19; /M: SY='C'; M= -4, -9, 8,-14, -8,-14,-20,-10,-13, -7,-11, -5, -7,-21, -3, -7, -2, 1, -8,-25, -7, -6; /M: SY='H'; M= -9, -1,-27, 0, 0,-20, -8, 5,-25, 0,-24,-14, 2, -5, -1, 1, 1, -3,-21,-18, -6, -2; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-22,-13, -7, -1,-19, -9, -3, -5, 3, -1,-13, -8, -8, -4,-14, -8, -6, -4, 4, -8; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='A'; M= 4, -7,-13, -8, -2, -7, -7, -9, -9, 0,-10, -6, -5,-11, -5, -3, 1, -2, -3,-14, -5, -4; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='Q'; M= -6, -5,-28, -5, 6,-22, -5, -7,-22, 5,-20,-11, -1, -5, 7, 7, -4,-10,-21,-22,-15, 5; /M: SY='H'; M=-10, -3,-24, -5, 4,-12,-19, 13,-13, -8, -9, -5, 0,-12, 5, -6, -3, -5,-16,-25, -2, 4; /M: SY='L'; M= -4,-16,-14,-18,-12, -3,-26,-18, 9,-19, 10, 3,-16,-21,-15,-19,-12, -7, 7,-23, -4,-14; /M: SY='L'; M= -6,-21, -6,-26,-20, 3,-26,-18, 8,-19, 11, 6,-18,-24,-17,-15,-10, 1, 9,-20, 1,-20; /M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -1, 4,-23,-15, -2,-23, 9,-20,-11, 1,-14, 7, 11, 5, -1,-16,-29,-13, 4; /M: SY='Q'; M= -4, -2,-23, -3, 4,-19,-15, 4,-18, 0,-14, -7, 1,-14, 11, 3, 2, -2,-17,-25, -8, 7; /M: SY='V'; M= -4,-26,-17,-29,-26, 0,-31,-25, 27,-18, 11, 12,-24,-25,-22,-18,-12, -1, 34,-24, -3,-25; /M: SY='Q'; M= -7, 1,-27, 3, 18,-28,-13, 3,-22, 7,-17, -7, 0,-10, 21, 5, -1, -7,-22,-25,-12, 19; /M: SY='E'; M= -7, 6,-19, 6, 11,-22,-10, -1,-21, 1,-17,-11, 6,-14, 2, 0, 0, -6,-18,-31,-16, 6; /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-26, 7,-33,-23, 33,-27, 29, 22,-24,-25,-20,-23,-23, -9, 22,-19, 1,-25; /M: SY='N'; M= -5, 3,-24, 1, 4,-21,-10, -8,-12, -4,-14,-10, 6,-10, 1, -8, 1, -2,-13,-29,-16, 2; /M: SY='Q'; M= -2, 3,-24, 2, 8,-23, -7, -2,-22, 2,-21,-12, 4, -8, 9, -3, 3, -6,-20,-26,-15, 8; /M: SY='I'; M= -5,-18,-20,-23,-16, -6,-26,-19, 16,-18, 10, 10,-15,-19, -8,-16, -6, 4, 12,-25, -6,-13; /M: SY='H'; M= -4, -3,-25, -4, -2,-20,-15, 14,-21, 0,-18,-10, 0, -6, 0, 1, -2, -5,-18,-20, -6, -3; /M: SY='T'; M= -3, 2,-19, 0, 6,-18,-15,-11,-18, 0,-16,-13, 2, -6, -1, 0, 10, 15,-12,-30,-15, 2; /M: SY='N'; M= 1, 10,-23, 10, 10,-26, -1, -6,-25, -3,-25,-19, 11, -2, 0, -6, 7, -4,-22,-31,-21, 4; /I: I=-3; MD=-5; /M: SY='V'; M= -3, -6, -5, -6, -6, -6,-12, -7, -3, -1, -3, -2, -7,-11, -6, -1, -6, -4, 1,-11, -2, -7; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='B'; M= -8, 4,-22, 4, -5,-17,-18,-10, -6, -4, -9, -6, 2,-17, -5, 0, -4, -3, -2,-28,-12, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-5; /M: SY='G'; M= 13,-12,-19,-14,-15,-21, 24,-19,-18,-15,-18,-12, -7,-12,-16,-18, 4, -7, -8,-23,-22,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-5; /M: SY='R'; M=-12, -8,-26, -9, -1,-17,-21, 3,-16, 20,-13, -1, -5,-17, 5, 22,-11, -9,-10,-19, -2, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-5; /M: M= -2,-16, -9,-20,-15, 0, -8,-13,-14,-13, -8, -7,-12,-22,-14,-13, -7, -9, -9,-12, -5,-14; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -5, 7,-20,-21, 9,-25, 21,-17, -7, -1,-17, 13, 37,-10,-11,-21,-20, -3, 7; /M: SY='A'; M= 24,-15,-14,-22,-14,-11,-12,-20, 3,-15, 2, 0,-13,-15,-12,-19, 2, 1, 7,-23,-13,-14; /M: SY='W'; M=-18,-34,-35,-38,-28, 29,-25,-24, -5,-24, 3, -3,-32,-29,-24,-19,-32,-20,-13, 73, 23,-22; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28, 6,-34,-27, 34,-27, 23, 16,-25,-26,-24,-24,-19, -7, 30,-22, -2,-28; /M: SY='R'; M=-14,-12, -1,-13, -4,-17,-22, -2,-23, 7,-15, -9, -6,-23, 1, 27, -8, -9,-14,-26, -9, -5; /M: SY='L'; M= 0,-16,-20,-17, -8, -8,-19, -6, 2,-16, 10, 4,-15,-20, -8,-14,-11, -6, 3,-24, -7, -9; /M: SY='A'; M= 24,-10,-15,-15,-12,-18, 8,-19,-13,-14,-11,-10, -7,-15,-12,-18, 9, 1, -5,-24,-19,-12; /M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-30,-21, 7,-29,-20, 21,-28, 43, 20,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 13,-21, -1,-20; /M: SY='N'; M=-13, 11,-25, 2, 0,-14,-13, 5,-13, 3,-17, -5, 22,-19, 4, 10, -2, -6,-19,-25, -5, 0; /M: SY='E'; M=-11, 9,-28, 17, 35,-25,-19, -1,-26, 6,-17,-16, 1, -7, 12, 0, 0, -6,-24,-27,-13, 23; /M: SY='H'; M=-11, 5,-28, 2, 5,-27,-13, 20,-28, 20,-27, -9, 10,-14, 12, 13, -4,-10,-24,-26, -5, 7; /M: SY='V'; M= -5,-17, -6,-19,-12,-10,-22,-16, -2, -8, 2, 0,-14,-23, -9, -1, -8, -4, 3,-27,-11,-12; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-31,-21, 12,-30,-19, 21,-28, 43, 23,-28,-29,-19,-20,-28,-10, 11,-18, 2,-20; /M: SY='H'; M= -6, 3,-22, 6, 6,-23,-10, 12,-23, -7,-23,-14, 4, -3, 0, -9, 10, 2,-17,-34,-11, 2; /M: SY='E'; M= -2, -7, -9, -7, 3,-20,-13, -7,-19, 0,-12, -9, -5,-16, 0, 0, 0, -3,-14,-28,-14, 1; /M: SY='W'; M=-17,-26,-35,-27,-20, 8,-26, 1, -3,-17, -3, -2,-24,-27,-10,-15,-25,-17,-11, 47, 32,-16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24, 13,-32,-22, 26,-28, 34, 19,-26,-27,-22,-22,-24, -9, 18,-18, 2,-24; /M: SY='K'; M= -8, 6,-18, 5, 6,-24,-12, -6,-24, 8,-21,-14, 8,-10, 3, 8, 0, -4,-20,-29,-16, 3; /M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-18,-13, -2,-22, -6, 2,-16, 8, 2,-13,-12,-10,-14,-10, -2, -3,-17, 5,-13; /M: SY='L'; M= -8,-28,-22,-32,-22, 11,-28,-19, 19,-25, 31, 21,-25,-26,-18,-20,-24,-10, 10,-10, 3,-20; /M: SY='L'; M= 0,-21, -7,-25,-16, -4,-24,-18, 5,-16, 12, 5,-19,-24,-11,-10,-13, -7, 5,-22, -8,-15; /M: SY='S'; M= -4, 2,-22, 4, 7,-20, -8, -5,-20, -1,-17,-13, 3,-14, 3, 1, 8, 0,-16,-28,-12, 4; /M: SY='B'; M= -6, 19, -8, 17, 6,-25,-10, -6,-26, 0,-25,-20, 17,-14, -2, -6, 8, 2,-20,-36,-19, 2; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='K'; M= -4, -5,-23, -5, 3,-19,-12, 0,-18, 4,-14, -8, -4, -3, 2, 3, -2, -2,-15,-23,-11, 1; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= -3, -5,-22, -4, 7,-21,-10, -8,-14, 2,-15, -8, -4, -7, 7, 2, 2, -3,-11,-24,-14, 6; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='L'; M= -1,-13,-13,-14,-10, -3,-16, -5, 3,-10, 8, 3,-12,-16, -7, -7, -7, 0, 5,-15, 0, -9; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='L'; M= -3,-21,-10,-25,-19, -2,-27,-22, 11,-19, 16, 6,-19,-24,-18,-14,-10, 6, 14,-26, -7,-19; /M: SY='H'; M= -4, 3,-23, 3, 7,-24,-12, 12,-25, 6,-23,-13, 7,-13, 7, 11, 6, -3,-20,-29,-10, 5; /M: SY='K'; M=-10, 0,-26, 2, 12,-24,-19, -1,-23, 16,-18, -7, 0,-12, 11, 16, -3, -3,-18,-25,-10, 11; /M: SY='Y'; M=-16,-25,-18,-30,-24, 33,-28, -5, 4,-20, 12, 10,-22,-29,-20,-16,-22,-11, -2, 10, 35,-22; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='E'; M= -8, 11,-23, 13, 14,-25,-15, 0,-22, 4,-20,-14, 8,-11, 7, -1, 5, 1,-18,-31,-14, 10; /M: SY='P'; M= -6, 3,-28, 8, 12,-27,-14, -8,-26, 6,-26,-18, 2, 14, 2, 4, 2, -4,-23,-30,-20, 5; /M: SY='W'; M= -8, 3,-28, 3, -2,-14, -9, -9,-20, -8,-21,-17, 3,-12, -7,-11, -4, -5,-20, 4, -4, -4; /M: SY='A'; M= 35, -7,-11,-13, -7,-20, 3,-17,-15,-10,-17,-14, -3,-10, -7,-17, 19, 6, -5,-26,-20, -7; /M: SY='F'; M=-15,-29,-22,-34,-25, 42,-31,-17, 11,-28, 26, 9,-24,-29,-28,-20,-24,-10, 5, -2, 21,-25; /M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-31,-24, 9,-29,-20, 24,-25, 32, 23,-27,-28,-20,-19,-23, -8, 20,-21, -1,-22; /M: SY='R'; M= -1,-15,-17,-18, -9,-12,-15,-12,-11, 1, 0, -1,-11,-20, -5, 14, -9, -7, -7,-22,-11, -9; /M: SY='D'; M= -9, 11,-17, 15, 5,-23,-12, -6,-25, 0,-20,-17, 8,-15, 0, 5, 7, 1,-17,-34,-16, 1; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='P'; M= -1, 1,-24, 5, 3,-23,-13, -3,-20, -6,-19,-15, -2, 13, -3, -9, 3, 0,-18,-29,-16, -2; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='E'; M= 0, 5,-21, 8, 11,-23, -2, -9,-21, -3,-19,-15, 2,-11, -1, -6, 4, -3,-14,-28,-19, 5; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='H'; M= -4, -4,-17, -3, 1, -7, -4, 3,-13, -5, -7, -6, -3,-11, -3, -5, -3, -7,-11,-13, -1, -1; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= -2,-14,-18,-15,-15,-10, 2,-17,-16,-11, -9, -6,-11,-21,-14,-10, -8,-10,-11, -7,-10,-14; /M: SY='E'; M= -2, 0,-21, -2, 10,-20,-17,-10,-19, 4,-17,-13, 0, -5, 1, 5, 6, 10,-13,-28,-15, 5; /M: SY='Q'; M=-11,-10,-26,-12, -3, -6,-25, -5, -1, -9, 0, 1, -9,-17, 2, -7, -9, -6, -6,-19, 1, -2; /M: SY='L'; M= -6,-27,-20,-31,-22, 12,-29,-22, 20,-27, 29, 13,-24,-26,-22,-21,-19, -7, 15,-19, 0,-22; /M: SY='A'; M= 5,-17,-21,-21,-13, -7,-19,-18, -1,-10, 4, -1,-15,-14,-11,-11, -7, -1, -1,-11, -4,-13; /M: SY='R'; M= -4, -8, -9,-10, -5,-16, -6,-12,-21, -1,-17,-12, -4,-17, -4, 3, 2, 1,-14,-24,-11, -5; /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-21,-15, 2,-26, -8, 13,-21, 22, 17,-18,-23,-12,-17,-18, -9, 6,-22, -1,-14; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-22, 6,-29,-19, 24,-26, 37, 25,-28,-28,-18,-19,-25, -9, 17,-21, -1,-21; /M: SY='Q'; M=-11, -2,-25, 1, 6,-19,-22, -5, -9, 0, -8, -2, -6,-16, 7, 0, -6, -7, -7,-24, -7, 6; /M: SY='G'; M= 6,-10,-14,-11,-11,-22, 15,-18,-21,-16,-21,-15, -5, -4,-13,-17, 9, -1,-14,-29,-23,-13; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-27,-17, 7,-29,-20, 13,-27, 37, 13,-28,-12,-19,-20,-27,-10, 4,-20, -3,-19; /M: SY='S'; M= -3, 5, 8, 2, 4,-23,-11, -4,-24, -9,-25,-18, 8,-16, 0,-10, 15, 5,-17,-39,-19, 2; /M: SY='A'; M= 10, -5,-13, -7, -1,-16,-13,-13,-12, -5, -9, -6, -7,-15, -4, -8, 1, -4, -5,-25,-14, -3; /M: SY='F'; M= -9,-28,-14,-32,-26, 23,-30,-20, 16,-26, 19, 9,-24,-28,-26,-21,-19, -8, 14,-11, 11,-26; /M: SY='D'; M= -6, 9,-23, 12, 10,-24,-14, -2,-20, -3,-19,-15, 6, -3, 1, -6, 5, 1,-17,-33,-16, 5; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-12,-22,-19,-28,-21, 41,-25,-12, 4,-20, 6, 2,-16,-23,-22,-15,-14, -8, 2, 4, 24,-20; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='N'; M= -4, 11,-15, 9, 5,-17, -7, 6,-18, -1,-17,-12, 12, -9, 2, -1, 8, 3,-15,-25,-10, 3; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='L'; M= -7,-27,-22,-31,-21, 12,-28,-20, 17,-24, 26, 14,-23,-20,-19,-18,-21, -9, 9,-16, 1,-21; /M: SY='S'; M= -4, -2, 2, -2, -2,-23,-16,-14,-22, -4,-23,-17, -2, -2, -7, -7, 5, 2,-14,-35,-20, -5; /M: SY='L'; M= -5,-19,-18,-24,-19, 5,-25,-16, 12,-19, 15, 11,-17,-24,-15,-16,-12, 1, 12,-20, 0,-17; /M: SY='D'; M= -6, 13,-24, 16, 8,-24,-13, -6,-23, 6,-17,-15, 7,-13, 1, 3, 0, -2,-18,-30,-15, 4; /M: SY='S'; M= -2, -2,-21, -5, -9, -8, -5,-14,-13,-14,-12,-11, 2,-12,-12,-14, 3, 1,-12,-20,-11,-10; /M: SY='E'; M= 2, 2,-21, 4, 16,-24,-13, 2,-21, -3,-20,-14, 1, -5, 6, -7, 10, 2,-16,-31,-15, 10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 65 in 59 different sequences |
| Number of true positive hits | 65 in 59 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RUN |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
59 sequences
DEN5A_HUMAN (Q6IQ26), DEN5A_MOUSE (Q6PAL8), DEN5A_RAT (G3V7Q0), DEN5B_DANRE (Q6NXD8), DEN5B_HUMAN (Q6ZUT9), DEN5B_MOUSE (A2RSQ0), FYCO1_HUMAN (Q9BQS8), FYCO1_MOUSE (Q8VDC1), PKHM1_HUMAN (Q9Y4G2), PKHM1_MOUSE (Q7TSI1), PKHM1_RAT (Q5PQS0), PKHM2_HUMAN (Q8IWE5), PKHM2_MOUSE (Q80TQ5), RUBIC_HUMAN (Q92622), RUBIC_MOUSE (Q80U62), RUFY1_HUMAN (Q96T51), RUFY1_MOUSE (Q8BIJ7), RUFY2_HUMAN (Q8WXA3), RUFY2_MOUSE (Q8R4C2), RUFY2_PONAB (Q5R5R4), RUFY3_HUMAN (Q7L099), RUFY3_MOUSE (Q9D394), RUFY3_PONAB (Q5R4V2), RUFY3_RAT (Q5FVJ0), RUFY4_HUMAN (Q6ZNE9), RUFY4_MOUSE (Q3TYX8), RUN3A_BOVIN (Q17QK1), RUN3A_DANRE (A7YDW0), RUN3A_HUMAN (Q59EK9), RUN3A_MOUSE (O08576), RUN3A_PONAB (Q5R565), RUN3A_XENTR (Q0V9V7), RUN3B_BOVIN (Q08E29), RUN3B_DANRE (Q5U3W3), RUN3B_HUMAN (Q96NL0), RUN3B_MACFA (Q4R7B9), RUN3B_MOUSE (Q6PDC0), RUN3B_PONAB (Q5NVC2), RUN3B_RAT (Q3B7K9), RUND1_HUMAN (Q96C34), RUND1_MOUSE (Q0VDN7), RUSC1_HUMAN (Q9BVN2), RUSC1_MOUSE (Q8BG26), RUSC2_HUMAN (Q8N2Y8), RUSC2_MOUSE (Q80U22), SGSM1_HUMAN (Q2NKQ1), SGSM1_MOUSE (Q8BPQ7), SGSM2_HUMAN (O43147), SGSM2_MOUSE (Q80U12), SGSM3_BOVIN (Q2KI13), SGSM3_DANRE (Q7T2D0), SGSM3_HUMAN (Q96HU1), SGSM3_MOUSE (Q8VCZ6), SGSM3_RAT (Q6P6R7), SGSM3_XENLA (A6H8I2), SNX29_BOVIN (Q08DX0), SNX29_HUMAN (Q8TEQ0), SNX29_MOUSE (Q9D3S3), TBC8_CAEEL (I2HAA0)» more
|
| PDB [Detailed view] |
10 PDB
2CXF; 2CXL; 2DWG; 2DWK; 3CWZ; 4GIW; 6IF2; 7BQI; 8JC5; 8JCA |