PROSITE entry PS50833
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BRIX |
| Accession [info] | PS50833 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50833 |
| Associated ProRule [info] | PRU00034 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Brix domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=190; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=185; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1403372; R2=0.0195778; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9989.8955078; R2=6.9338479; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=320; H_SCORE=12209; N_SCORE=8.4; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; H_SCORE=11536; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M=-10,-11,-34, -6, 6,-25,-20,-12,-20, 6,-24,-12,-12, 40, 0, -4, -8, -7,-24,-24,-17, 0; /M: SY='R'; M=-12, -4,-27, -6, 1,-22,-20, 6,-21, 24,-19, -1, 0,-15, 8, 26, -8, -8,-15,-23, -6, 3; /M: SY='I'; M= 3,-19,-14,-25,-19, -8,-22,-19, 16,-17, 4, 12,-15,-19,-12,-18, -4, 1, 16,-26, -9,-16; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-32,-23, 12,-30,-20, 22,-25, 33, 20,-26,-27,-20,-17,-24, -9, 15,-18, 1,-22; /M: SY='I'; M= -8,-30,-20,-34,-27, 14,-33,-26, 28,-27, 24, 14,-26,-27,-26,-23,-20, -7, 26,-19, 1,-27; /M: SY='T'; M= -4,-12,-12,-21,-17, -3,-23,-22, 5,-19, 4, 0,-10,-17,-15,-17, 2, 23, 6,-26, -7,-17; /M: SY='T'; M= -6, -3, -9, -8, -7,-14,-19, -2,-17, -6,-15, -9, -1,-12, -4, -3, 8, 20,-10,-28, -6, -6; /M: SY='S'; M= 3, -3,-15, -4, -5,-22, 11,-11,-25, -7,-27,-18, 6,-14, -4, -2, 22, 8,-15,-32,-20, -5; /M: SY='R'; M=-11, -5,-27, -5, -3,-23, -3, 1,-28, 11,-22,-12, 3,-16, 3, 29, -3, -8,-20,-24,-13, -3; /M: SY='K'; M= -9, 6,-22, 6, 5,-23,-10, -7,-26, 13,-20,-14, 7,-16, 1, 13, -4, -8,-20,-27,-15, 2; /M: SY='P'; M= 6,-15,-15,-16, -9,-20,-17,-21,-10,-13,-17,-12,-14, 28,-13,-19, -1, 2, -8,-29,-22,-14; /M: SY='S'; M= 0, 7,-13, 3, -4,-22, 7, -7,-24, -7,-28,-18, 16,-16, -5, -7, 18, 6,-18,-35,-20, -5; /M: SY='Q'; M= -4,-10,-25,-11, -3,-17,-14, -7,-13, 1,-15, -7, -6, -8, 4, 3, -2, -4,-11,-21, -9, -1; /M: SY='R'; M=-13, -4,-26, -8, -3,-16,-19, 0,-18, 13,-17, -8, 4,-16, 4, 29, -4, -2,-15,-21, -4, -3; /M: SY='T'; M= -3,-17,-14,-22,-18, -3,-24,-17, 9,-20, 10, 4,-15,-21,-16,-17, -5, 11, 11,-24, -4,-18; /M: SY='R'; M=-12, -8,-25,-10, -4,-13,-19, -2,-19, 13,-15, -8, -2,-17, 1, 28, -4, -3,-13,-20, -3, -4; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-24, 7, 5,-23,-11, 8,-21, 0,-19, -8, 6,-14, 9, 1, 5, -4,-19,-28, -8, 6; /M: SY='F'; M=-12,-29,-14,-35,-26, 41,-29,-22, 10,-28, 20, 7,-24,-29,-31,-21,-20, -9, 9, -7, 12,-26; /M: SY='M'; M= 8,-16,-12,-22,-15, -9,-11,-15, 3,-15, 4, 13,-14,-18,-10,-16, -4, -2, 5,-24,-11,-13; /M: SY='K'; M= -9, -3,-25, -5, 0,-18,-15, 0,-17, 11,-13, -4, 0,-16, 4, 10, -6, -6,-14,-24, -8, 1; /M: SY='D'; M=-14, 24,-28, 36, 24,-30,-16, -3,-26, 1,-20,-20, 8,-10, 3, -5, -2, -9,-20,-34,-18, 13; /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-32,-23, 12,-30,-20, 21,-27, 37, 20,-28,-28,-20,-20,-27,-10, 12,-13, 3,-21; /M: SY='R'; M= -7, -7,-23, -8, 1,-12,-18, -1,-17, 6,-15, -8, -3,-16, 3, 13, 0, -2,-12,-20, -2, 1; /M: SY='R'; M= -3, -2,-23, -4, -2,-14,-12, -8,-18, 2,-10, -9, 0,-17, -2, 12, -4, -6,-13,-23,-11, -3; /M: SY='I'; M= -7,-27,-13,-31,-25, 5,-31,-24, 24,-25, 24, 14,-24,-26,-22,-22,-18, -3, 22,-23, -3,-24; /M: SY='M'; M=-12,-22,-24,-28,-18, 13,-28,-17, 11,-10, 13, 15,-18,-22,-15,-10,-20,-10, 6,-14, 4,-17; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -8,-17,-35, -9, -1,-26,-14,-17,-18, -9,-26,-17,-17, 75, -9,-17, -8, -9,-26,-26,-26, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='N'; M=-12, 10,-25, 3, -7,-10, 0, 10,-20,-11,-16,-12, 19,-21, -8, -9, -3, -9,-23,-22, -6, -8; /M: SY='A'; M= 13,-10,-11,-16,-12,-13, -8,-18,-10,-13,-14,-10, -7,-15,-10,-16, 12, 10, -3,-15,-13,-11; /M: SY='K'; M= -1,-11,-22,-13, -3,-14,-20,-10, -8, 2, -9, -4,-10,-12, -2, 1, -5, -3, -2,-22, -8, -3; /M: SY='R'; M=-12,-11,-26,-13, -8, -4,-19, -5,-12, 8,-12, -5, -6,-20, -3, 14, -9, -7, -9,-12, 8, -8; /M: SY='M'; M=-12,-12,-24,-15,-12, 4,-25,-10, 4, -8, 3, 7,-10,-22,-11, -6,-14, -8, 2,-16, 4,-12; /M: SY='N'; M= -7, 7,-21, 1, -2,-16,-14, -6,-12, -2,-12, -9, 13,-13, 0, -3, 3, 5,-15,-30,-12, -1; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 3,-23,-20, 1,-30, 34,-23, -9, 0,-17, 12, 55,-10,-10,-21,-20, -9, 4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='K'; M= -5, -6,-14, -5, 0, -9,-10, -4, -6, 5, -4, -2, -5, -9, -1, 4, -6, -4, -3,-13, -5, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -6, -6,-28, -7, -9,-25, 24, -6,-31, 0,-23,-13, 1,-18, -5, 2, -3,-11,-24,-22,-17, -8; /M: SY='K'; M=-10, 1,-28, 0, 2,-23,-16, -1,-21, 11,-22, -9, 4, 3, 3, 6, -3, -6,-20,-26,-11, 1; /M: SY='F'; M=-12,-10,-23,-16,-12, 12,-22, -6, -6, -3, -3, 0, -4,-22,-11, -4,-11, -7, -7,-11, 11,-11; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='E'; M= -3, 6,-19, 9, 13,-22,-12, -7,-20, 0,-20,-16, 5,-10, 4, -1, 13, 5,-14,-32,-16, 8; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-12,-23,-11,-14, -7,-20,-17, 8,-18, 16, 9,-16,-23,-15,-17,-17,-10, 6,-25, -7,-15; /M: SY='K'; M= -5, -2,-27, -2, 11,-26,-15, -5,-20, 14,-20, -8, -1, -5, 12, 9, -3, -6,-19,-24,-13, 11; /M: SY='D'; M= -7, 14,-23, 19, 18,-27,-15, -6,-24, 2,-21,-17, 6, -9, 8, -4, 8, 5,-18,-32,-16, 13; /M: SY='L'; M= -8,-25,-17,-28,-20, 8,-27,-22, 15,-25, 16, 7,-20,-17,-20,-21,-13, -5, 10,-21, -3,-21; /M: SY='L'; M= -1,-19,-15,-25,-21, 4,-23,-19, 15,-21, 16, 9,-15,-25,-19,-19,-13, -5, 14,-22, -5,-20; /M: SY='E'; M= -6, -1,-21, 3, 19,-24,-14, -6,-18, 1,-15,-10, -5,-10, 4, -3, -4, -9,-14,-28,-16, 11; /M: SY='F'; M= -3,-16,-22,-21, -9, 5,-23,-14, 4,-12, 3, 3,-12,-19,-10, -9, -9, -6, 2,-17, -2,-10; /M: SY='A'; M= 20,-13, 6,-20,-15, -5,-10,-20,-11,-17, -8,-10,-11,-19,-17,-21, 1, -3, -3,-22,-13,-16; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='S'; M= 0, -6,-21, -8, 0,-16, -6,-10,-13, 0,-15, -9, -2,-12, -2, 1, 4, -1, -9,-21,-10, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='E'; M= -2, -4,-21, -5, 3,-13,-15, -9,-10, 0, -9, -3, -4, -6, 0, -3, -3, -4, -9,-22,-10, 1; D=-4; /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='R'; M=-11, -6,-23, -8, -1, -9,-17, -4,-15, 13, -9, -4, -2,-16, 0, 17,-10, -8,-13,-16, -2, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='G'; M= -6, 11,-22, 8, -3,-20, 17, -2,-26, -8,-23,-16, 16,-15, -6, -9, 4, -6,-23,-25,-17, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='V'; M= -3, -3, -8, -2,-10, -1,-17,-11, -7,-12, -8, -8, -8,-19,-14,-14, -3, -3, 1,-18, 0,-12; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='T'; M= 1, -1, -1, -6, -3,-17,-13,-16,-17, -9,-15,-13, 0,-14, -8,-11, 12, 20, -9,-32,-16, -6; /M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 15, 4,-24,-11, 14,-27, 0,-24,-16, 10,-10, 2, 2, 4, -5,-22,-30, -7, 1; /M: SY='L'; M= -9,-29,-15,-32,-24, 12,-30,-22, 22,-27, 30, 17,-27,-29,-23,-21,-22, -8, 19,-20, 0,-24; /M: SY='L'; M= -5,-26,-20,-30,-22, 13,-23,-20, 13,-23, 19, 13,-23,-26,-20,-19,-19, -9, 11, -9, 2,-20; /M: SY='V'; M= -7,-28,-19,-33,-27, 10,-32,-24, 28,-23, 16, 15,-24,-26,-24,-21,-16, -4, 29,-19, 2,-27; /M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-34,-27, 26,-31,-22, 21,-26, 20, 13,-24,-28,-27,-21,-20, -8, 20,-12, 9,-27; /M: SY='N'; M= -3, 4,-22, -1, -1,-20, 5, 6,-22, -9,-19,-11, 11,-16, -2, -8, 6, -1,-20,-29,-14, -2; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='E'; M= 2, 1,-14, 3, 22,-21,-13, -8,-18, -1,-16,-14, -1, -7, 6, -6, 9, 3,-13,-28,-17, 14; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M=-10, 4,-24, 4, 1,-16,-14, 4,-22, 5,-21,-13, 6,-16, 0, 10, 1, -2,-17,-20, -7, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='K'; M=-10, -2,-28, -3, 5,-26,-18, -3,-27, 32,-26,-10, 2,-10, 8, 31, -6, -7,-20,-23,-10, 5; /M: SY='G'; M= -4, -3,-27, -3, -2,-27, 14, -6,-32, 9,-27,-14, 2,-15, -3, 5, -1,-10,-23,-23,-17, -3; /M: SY='R'; M= -8, 6,-23, -1, -1,-21,-12, -5,-18, 12,-20,-10, 13,-16, 3, 15, 0, -1,-15,-27,-13, 0; /M: SY='P'; M= -9, -7,-34, 0, 1,-29,-15,-15,-21, -6,-27,-18, -8, 52, -6,-14, -5, -7,-25,-31,-25, -6; /M: SY='B'; M= -4, 7,-20, 4, -7,-15, -9, -6,-11,-12, -5, -8, 6,-19,-10,-12, -3, -1, -9,-30,-13, -8; /M: SY='N'; M= -5, -2,-18, -7, -9,-14, 0, -6,-16, -6,-19,-12, 7,-19, -5, -3, 4, -2,-15,-22, -5, -9; /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-32,-22, 12,-30,-19, 24,-27, 38, 24,-26,-27,-19,-20,-26,-10, 13,-18, 2,-21; /M: SY='T'; M= -7,-14,-22,-19,-15, -7,-24,-20, 1, -6, -4, -2,-11,-19,-12, -4, -6, 8, 4, -8, -4,-14; /M: SY='I'; M=-10,-29,-20,-34,-27, 20,-30,-23, 22,-25, 20, 15,-25,-27,-25,-21,-20, -8, 20, -9, 5,-26; /M: SY='V'; M= -3,-18,-12,-22,-20, -4,-11,-13, 3,-18, -3, 3,-13,-23,-15,-18, -4, -4, 4,-19, 1,-19; /M: SY='R'; M=-15, 4,-29, 6, 6,-24,-16, 24,-30, 14,-23,-11, 7,-16, 8, 27, -7,-12,-24,-26, -5, 3; /M: SY='L'; M= -8,-22,-19,-25,-17, 9,-26,-18, 10,-19, 18, 10,-20,-21,-18,-14,-14, -1, 10,-20, -2,-17; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='P'; M=-12,-14,-31, -9, 3, -6,-21, -5,-17, -8,-18,-13,-13, 31, -7,-10, -9, -9,-21,-17, -4, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M=-13, 5,-28, 5, 5,-16, -8, -2,-23, 1,-18,-13, 6,-13, 1, 1, -6,-10,-23,-16, -8, 3; /M: SY='G'; M= -4, -6,-28, -6,-15,-22, 40, -9,-32,-14,-26,-17, 1,-19,-14,-14, 0,-13,-25,-18,-14,-15; /M: SY='P'; M=-12,-14,-35,-10, 0,-21,-21, -7,-15, -4,-20,-12,-12, 40, -1, -6,-10,-10,-23,-22,-12, -5; /M: SY='T'; M= -2,-11,-15,-16,-11, -8,-22,-20, 3,-13, 0, -2, -9,-16,-12,-13, 6, 20, 8,-28, -9,-12; /M: SY='L'; M= 2,-23,-18,-26,-20, 5,-20,-17, 11,-21, 16, 7,-21,-24,-18,-19,-13, -6, 11,-15, 3,-20; /M: SY='Y'; M=-10, 3,-22, 5, -3, -3,-17, 0,-18, -4,-16,-12, 0,-17, -6, -7, 2, 2,-13,-18, 8, -5; /M: SY='F'; M=-17,-25,-20,-35,-26, 56,-27,-15, 4,-25, 13, 11,-17,-28,-30,-17,-20,-10, 1, 0, 20,-24; /M: M= -6,-12,-25,-16, -9, -9,-22,-13, -1, -1, -6, -1, -8,-12, -4, -4, -5, -1, -4,-19, -2, -8; /M: SY='L'; M= -5,-19,-19,-18, -5, -5,-26,-18, 12,-16, 13, 7,-19,-21,-12,-16,-11, -5, 13,-27, -9, -9; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='H'; M= -6, -9,-17,-10, -7, -8,-17, 7, -9, -9, -2, -2, -3,-19, -4, -7, -2, -4, -8,-26, -3, -6; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M= -4, 11,-23, 6, -1,-24, 14, -4,-25, -3,-25,-15, 18,-15, 0, -4, 6, -6,-24,-29,-20, -1; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='V'; M= -8,-29,-19,-32,-27, 12,-31,-21, 26,-23, 18, 14,-26,-28,-24,-20,-18, -6, 27,-17, 6,-26; /M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -7, -2,-17,-17, -3,-11, 2,-16, -7, -2,-15, -3, -1, 5, 5, -2,-30,-10, -3; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='L'; M= -8,-11,-19,-14, -9, -4,-22,-13, 0, -8, 12, 8,-11,-19, -8, -6,-11, 1, -1,-23, -5, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='R'; M= -3, -7,-21,-10, -5,-16,-12, -4, -9, -1,-11, -1, -2, -4, 2, 4, -3, -4, -9,-22,-11, -4; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='R'; M=-14, -6,-25, -6, -1, -6,-19, 12,-21, 10,-16, -7, -2,-17, 2, 18, -7, -9,-17,-13, 8, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='D'; M=-13, 20,-29, 30, 30,-33,-17, 0,-31, 14,-25,-19, 6, -7, 10, 3, -3,-10,-25,-31,-16, 20; /M: SY='I'; M= -5,-23,-22,-28,-21, -1,-27,-19, 22,-21, 14, 14,-18,-22,-15,-18,-11, -4, 16,-22, -1,-20; /M: M= -5, -9,-18,-11, -9,-16,-17,-16, -5, -3, -9, -4, -6,-10, -8, -6, -6, -6, -3,-27,-13,-10; /M: SY='N'; M= -7, 4,-23, 3, -4,-14, -6, -8,-18, -4,-18,-12, 6,-17, -5, -3, 2, -4,-14,-22,-11, -4; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='S'; M= -3, 0, -9, -1, -1,-16,-12, -3,-18, -6,-16,-11, 1,-15, -5, -6, 5, 1,-12,-29,-12, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='G'; M= -7,-15,-23,-17,-15, 0, 11,-13,-14,-15, -6, -5, -8,-20,-14,-13, -8,-12,-13,-13, -5,-14; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='R'; M= -8, 3,-22, -2, 1,-16,-14, -4,-17, 10,-18,-10, 9,-10, 1, 11, 1, 0,-15,-25,-11, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='R'; M= -5, -3,-12, -7, -3,-15,-15, -1,-14, 1,-14, -3, -1,-12, 2, 3, -2, -4,-13,-21, -5, -2; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='T'; M= -3, -6,-20, -7, -4,-14,-14, -9, -7,-12, -7, -6, -3, 1, -5,-12, 1, 3, -9,-27,-13, -6; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='K'; M= -8, -3,-23, -3, 5,-18,-17,-10,-16, 14,-16, -7, -3, -8, 1, 10, -4, -2,-10,-22,-11, 2; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: M= -1, -9,-17,-12, -9,-12, -5, -4, -9, -8, -9, 0, -6,-16, -4, -8, -5, -9, -8,-20, -8, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='H'; M= -7, -6,-20, -7, -5,-10,-12, 3, -9, -9,-10, -4, -3,-10, -5, -9, -1, -1, -7,-21, -3, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='D'; M= -4, 3,-15, 4, 4,-12, -9, -3,-11, 1, -9, -8, 2, -5, -1, 3, -2, -4, -9,-16, -7, 1; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -8, 2,-30,-16,-18,-22, -7,-30,-20,-16, 74, -8,-17, -7, -9,-29,-30,-28, -7; /M: SY='M'; M= -6,-14,-12,-17, -8, -6,-23, 1, 1,-16, 6, 7,-12,-21, -9,-14,-12, -9, 0,-26, -4, -9; /M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-24, 7,-31,-24, 24,-24, 29, 15,-28,-29,-23,-17,-21, -7, 24,-22, -3,-24; /M: SY='I'; M= -6,-24,-10,-30,-25, -1,-31,-26, 23,-22, 8, 8,-19,-23,-21,-20,-10, -2, 22,-26, -6,-25; /M: SY='F'; M=-11,-24,-20,-31,-22, 31,-27,-19, 7,-20, 16, 9,-20,-25,-24,-15,-18, -6, 6, -9, 9,-21; /M: SY='N'; M= -7, 18,-23, 12, 5,-23, -7, 0,-19, 0,-23,-15, 24,-15, 4, -2, 5, -2,-21,-33,-16, 4; /M: SY='N'; M= -2, 9,-23, 4, -5,-24, 17, -7,-25, -7,-25,-17, 19,-14, -5, -9, 7, -5,-24,-31,-22, -5; /M: SY='F'; M= -6,-14,-16,-19,-13, 20,-20,-15,-10,-13, -3, -7, -9,-15,-19, -9,-10, -8, -9,-13, 1,-15; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='S'; M= -2, -1,-20, -3, -1,-11, -6,-12,-18, -5,-17,-13, 1, -9, -6, -6, 6, 4,-12,-24,-12, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='T'; M= -7, -7,-12,-10, -8, 3,-15,-12,-12,-14, -9, -9, -6,-13,-13,-13, 1, 8, -7,-16, -4,-10; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='R'; M= -6, 5,-24, 8, 6,-24, -3, -3,-26, 8,-22,-14, 4, -6, 3, 9, 0, -7,-20,-24,-15, 3; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='L'; M= -4, -6,-18, -6, -8,-10,-11,-12, -4,-10, 3, 0, -7,-17, -8,-10, -6, -2, -2,-23, -9, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='G'; M= -3, -2,-22, -2, -7,-20, 10, -3,-20, -7,-17, -9, 0, -8, -6, -8, -2, -7,-16,-22,-15, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='H'; M= -7, -3,-23, -2, 6,-20,-13, 18,-18, 1,-15, -5, 0, -5, 7, 0, -3, -8,-17,-24, -5, 5; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: M= -6, -4,-13, -2, -1, -5, -9, 0, -5, -7, 0, -2, -5,-10, -4, -6, -6, -4, -4, -7, 0, -3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='R'; M=-10, -9,-25, -8, -1,-15,-21, -2,-13, -2, -3, -4, -7,-10, -1, 9, -9, -4,-12,-25, -9, -3; /M: SY='I'; M= -9,-28,-21,-33,-27, 15,-28,-24, 24,-25, 18, 14,-23,-26,-24,-22,-18, -7, 21,-17, 2,-26; /M: SY='K'; M= 4, -5,-22, -7, -4,-23, -3,-14,-19, 6,-17, -9, -4,-14, -1, 1, 0, -4,-10,-23,-15, -3; /M: SY='E'; M= -5, 6,-20, 5, 9,-23,-14, -6,-23, 6,-22,-15, 8, -8, 5, 9, 6, 3,-19,-30,-16, 6; /M: SY='L'; M= -4,-20,-20,-24,-20, 3,-22,-17, 13,-20, 18, 15,-20,-23,-17,-18,-15, -4, 11,-20, -1,-19; /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-34,-25, 42,-30,-18, 11,-28, 26, 11,-24,-29,-28,-20,-24,-10, 7, -5, 17,-25; /M: SY='Q'; M= -5,-12,-16,-14, -4,-14,-21,-12, -5, -3, -4, 1,-10,-18, 4, -4, -5, -3, -4,-23, -9, 0; /M: SY='B'; M= -7, 12,-21, 11, 1,-21,-10, 7,-18, -7,-19,-13, 12,-16, 0, -9, 2, -6,-17,-31,-10, 0; /M: SY='L'; M= -7,-20,-22,-24,-19, 9,-25,-16, 10,-22, 20, 11,-18,-24,-17,-18,-18, -6, 4,-11, 4,-18; /M: SY='F'; M=-17,-25,-20,-33,-26, 57,-28,-18, 3,-26, 11, 6,-18,-27,-32,-19,-18, -7, 2, 1, 21,-25; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='P'; M=-11, -9,-26, -7, 0,-24,-13, -6,-22, -2,-23,-14, -5, 28, -2, 1, -6, -8,-24,-27,-19, -5; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='G'; M= 1,-10,-20,-11, -9,-16, 4, -8,-14,-11,-15, -8, -5, -9, -5,-10, 3, -4, -9,-22,-13, -8; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='P'; M= -9, -5,-27, -2, 5,-19,-17,-11,-10, -5,-10, -9, -7, 16, -3, -8, -8, -7,-15,-24,-15, -1; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='P'; M= -9, -3,-24, -4, -1,-11,-15, -6,-15, 1,-17,-10, 2, 11, -5, -4, -4, -4,-16,-23,-11, -4; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='V'; M= -6, -8,-18, -8, -5,-12,-16,-10, -1, -5, -5, -2, -8, -8, -7, -7, -6, -4, 4,-23,-10, -7; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='D'; M= -6, 6,-22, 9, 2,-14,-13, 3,-17, -5,-15,-11, 2, -4, -1, -7, -2, -7,-15,-22, -7, 0; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='R'; M= -5, -2,-19, -4, -1,-16,-14, -8,-14, 4,-15, -9, 2, -3, 0, 8, 3, 6,-11,-23,-12, -2; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: M= -4,-11,-18,-13,-10,-12, -4,-12, -4, -6, -5, -1, -8,-15, -7, -5, -5, -4, 0,-19, -9, -9; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='R'; M= -8, 8,-17, 8, 5,-18, -8, 0,-19, 6,-18,-11, 10, -8, 6, 14, 4, -2,-16,-21,-11, 4; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='L'; M= -3, -9,-11,-10, -5, -4,-12, -8, 2, -4, 7, 3, -8,-11, -3, -4, -6, -3, 1,-12, -3, -4; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='R'; M=-14, -5,-25, -6, 2,-17,-18, 17,-22, 10,-16, -6, 1,-16, 12, 27, -4, -5,-19,-18, 2, 4; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='V'; M= 1,-23, -2,-26,-24, -7,-23,-21, 13,-17, 4, 6,-22,-26,-22,-18,-10, -5, 25,-29,-11,-24; /M: SY='I'; M= -5,-26,-16,-31,-24, 11,-29,-20, 20,-24, 20, 13,-23,-26,-21,-21,-18, -7, 17,-16, 5,-24; /M: SY='T'; M= -2, -4,-16,-10, -9,-12,-10,-11, -5,-13, -7, -5, 1,-17,-10,-12, 7, 12, 0,-30,-12,-10; /M: SY='F'; M=-14,-29,-16,-36,-28, 40,-31,-21, 14,-27, 16, 8,-22,-28,-30,-21,-20, -9, 12, -6, 15,-28; /M: SY='S'; M= 1, 5,-17, 2, -2,-19,-10, 7,-18, -7,-19,-12, 8,-14, -2, -7, 14, 10,-12,-33,-10, -3; /M: SY='N'; M= -2, 5,-19, -2, -2,-11,-15, -4, -6, -6,-11, -8, 9,-18, -6, -9, -3, -5, -9,-23, -3, -5; /M: SY='Q'; M= -4, 5,-22, 3, 1,-23,-12, -4,-14, -3,-14, -8, 5,-15, 8, -3, 2, 0,-13,-28,-13, 4; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M=-10, 6,-19, 10, 7,-22, -9, -2,-25, 0,-22,-17, 5, -8, 0, 4, 2, -5,-20,-29,-13, 2; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M= -2, 6,-13, 8, 6,-13, -4, -4,-10, -3,-10, -9, 3, -2, -1, -6, 1, -3, -8,-16,-10, 2; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='D'; M=-15, 26,-29, 37, 12,-33, -8, -1,-32, 0,-26,-20, 10, -4, 1, -5, -1, -7,-26,-34,-18, 6; /M: SY='Y'; M= -8, -9,-23,-11, -5, -1,-21, -4, -6, -2, -7, -4, -6,-20, -7, -5, -8, -6, -5,-12, 7, -7; /M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-34,-28, 2,-33,-28, 33,-26, 19, 14,-25,-25,-23,-24,-18, -5, 29,-16, -2,-27; /M: SY='F'; M= -5,-11,-23,-12, -5, 3,-18, -9,-10,-14, -6, -8,-10,-19, -9,-13, -4, -5, -9, -3, 2, -6; /M: SY='F'; M=-12,-24,-19,-32,-25, 38,-26,-17, 8,-22, 11, 10,-17,-27,-26,-15,-17, -8, 8, -7, 12,-23; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, -1,-18,-20, 0,-28, 28,-19,-10, -1,-20, 8, 62, -9, -8,-19,-18, -6, -1; /M: SY='H'; M=-12, 1,-24, -2, -4,-17,-14, 34,-20, -5,-16, -6, 7,-18, 1, 0, -2, -4,-16,-29, 0, -4; /M: SY='Y'; M=-16,-11,-23,-11,-11, 3,-25, 27,-11,-10,-10, -3, -9,-15, -7, -9,-13,-10,-13, -8, 28,-13; /M: SY='R'; M= -5, -9,-23,-10, 1,-16,-19, -4,-15, 10,-15, -6, -5,-16, 4, 16, -3, -5, -8,-21, -7, 1; /M: SY='Y'; M=-11,-23,-26,-25,-19, 8,-27,-11, 15,-19, 10, 6,-20,-21,-16,-18,-16, -7, 8, -7, 19,-21; /M: M= -6, -7,-22, -9, -6,-12,-21,-11, -2, -1, -3, 0, -6,-19, -5, -2, -7, -3, 0,-24, -6, -6; /M: SY='F'; M= -5,-18,-20,-21,-16, 9,-24,-15, 3,-11, 4, 2,-15,-22,-17,-10,-11, -5, 7,-16, 2,-16; /M: SY='K'; M= -6,-11,-17,-12, -5,-16,-16,-15,-14, 5,-15, -9, -9,-14, -6, 5, -5, -2, -5,-17, -9, -6; /M: SY='K'; M= -8, 5,-26, 4, 7,-22,-15, -5,-20, 10,-21,-13, 5, -6, 1, 3, -1, -2,-16,-26,-11, 3; /M: SY='S'; M= -4, -5,-20, -5, 1,-14,-11, -9,-12, -5,-12, -6, -2,-14, -3, -7, 3, -1, -7,-28,-13, -1; /M: SY='G'; M= -6, -3,-28, -3, 1,-19, 15,-10,-27, -7,-20,-15, 0,-16, -5, -8, -4,-13,-24,-14,-13, -2; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='L'; M= -6,-13,-16,-14, -7, -6,-21,-11, -4, -7, 2, -1, -9,-18, -4, -3, -7, -3, -4,-21, -5, -6; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: M= -5, -8,-20, -9, -3,-11,-15,-11, -7, 0, -8, -2, -6,-11, -5, 0, -4, -4, -3,-22, -9, -5; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='R'; M= -7, -3,-22, -3, -1,-15, -6,-11,-17, 1,-14,-10, -3,-12, -4, 4, -2, -2,-11,-21,-12, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: M= -2,-11,-20,-12, -9, -9,-15,-12, -2, -8, -3, -3,-10, -2, -9, -9, -7, -4, -3,-17, -5,-11; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='R'; M= -6, -5,-15, -5, 0,-10,-12, -6, -8, 3, -4, -2, -5,-12, -1, 10, -5, -3, -3,-16, -8, -2; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='K'; M= -6, -6,-15, -7, -4, -9, -9, -8, -3, 2, -2, 2, -6,-11, -2, 1, -8, -6, -2,-13, -5, -4; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -2, -5,-20, -7, 1,-18,-20, -3, -8, -3, -9, -2, -6,-14, 5, -3, 0, 4, -4,-26,-10, 2; /M: SY='E'; M= -9, 4,-30, 13, 47,-28,-20, -4,-26, 7,-18,-18, -4, 7, 14, -2, -2,-10,-27,-29,-20, 30; /M: SY='I'; M= -2,-25,-17,-31,-24, -1,-28,-23, 27,-22, 17, 19,-22,-23,-19,-21,-14, -4, 25,-24, -5,-23; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-11,-20,-27, 62,-20,-36,-20,-26,-18, -1,-20,-20,-20, 0,-16,-27,-20,-28,-20; /M: SY='P'; M=-11,-20,-38,-12, -2,-21,-21,-20,-19, -9,-27,-18,-19, 75,-12,-18,-11,-10,-27,-26,-24,-11; /M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -8, -1,-19,-17, -3,-22, 18,-15, -6, 1,-18, 8, 39, -4, -5,-16,-24,-11, 1; /M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-35,-25, 31,-30,-20, 18,-27, 24, 17,-23,-26,-24,-21,-22,-10, 10, -9, 10,-24; /M: SY='T'; M= -8, 7,-16, 8, 4,-20,-17,-10,-19, 0,-15,-14, 3,-14, -3, 1, 5, 11,-10,-32,-14, 0; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-24, 20,-30,-19, 21,-27, 32, 21,-26,-27,-22,-20,-24, -9, 13,-15, 5,-22; /M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -4, 6,-22,-16, -7,-19, 16,-16, -7, 0,-15, 7, 15, -5, -6,-14,-24,-12, 6; /M: SY='L'; M= -9,-20,-24,-21,-15, -4,-27,-19, 13,-15, 17, 12,-19,-14,-13,-14,-18, -8, 7,-23, -6,-15; /M: SY='I'; M=-12,-21,-27,-24,-18, 2,-24,-13, 5, -7, -2, 5,-15,-19,-11, 1,-14, -9, 3, -7, 5,-17; /M: SY='R'; M=-10, -9,-27,-10, 1,-20,-20, -7,-17, 18,-15, -4, -4,-15, 7, 27, -7, -7,-13,-18, -9, 2; /M: SY='I'; M= -8,-22,-22,-26,-19, -2,-30,-21, 22,-18, 17, 13,-18,-23,-16,-15,-16, -4, 17,-24, -5,-19; /M: SY='E'; M=-11, -4,-27, -4, 13,-15,-17, 3,-21, 6,-15, -6, -3,-13, 13, 7, -4, -8,-20,-21, -7, 13; /M: SY='E'; M= -5, -4,-24, -2, 7,-16,-17,-10,-11, -6, -2, -6, -7,-11, -3, -7, -6, -6,-10,-27,-13, 1; /M: SY='G'; M= 6,-10,-27,-11,-14,-28, 41,-18,-32,-12,-26,-18, -3, -9,-14,-13, 2,-14,-24,-22,-26,-15; /M: SY='T'; M= -4, -6,-18, -9, -7, -9,-18,-15, -4,-10, -7, -6, -2,-16, -8, -6, 7, 12, -1,-29,-10, -8; /M: SY='F'; M=-10,-10,-19, -8, -9, 2,-15,-15,-12,-13, -1, -7,-11,-18,-15,-10,-11, -9, -9,-17, -5,-12; /M: SY='D'; M= -8, 13,-28, 21, 18,-28, -2, -7,-31, -1,-24,-22, 4,-10, 2, -6, 2, -7,-25,-22,-18, 10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 71 in 71 different sequences |
| Number of true positive hits | 71 in 71 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Brix |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
71 sequences
BRIX_AERPE (Q9YC08), BRIX_ARCFU (O29159), BRIX_METAC (Q8TQ11), BRIX_METBF (Q467K0), BRIX_METBU (Q12ZB3), BRIX_METJA (Q58012), BRIX_METKA (Q8TYC5), BRIX_METMA (Q8PTT5), BRIX_METMP (Q6M0M3), BRIX_METTH (O26776), BRIX_PYRAB (Q9V200), BRIX_PYRAE (Q8ZVN2), BRIX_PYRFU (Q8TZI2), BRIX_PYRHO (O74104), BRIX_SACS2 (Q9UXB9), BRIX_SULTO (Q975H1), BRIX_THEKO (Q5JDM5), BRX11_ARATH (Q9LE16), BRX12_ARATH (Q9C928), BRX1_BOVIN (Q3SZZ0), BRX1_CAEEL (P34524), BRX1_DICDI (Q54JN0), BRX1_DROME (Q9VZE6), BRX1_HUMAN (Q8TDN6), BRX1_MOUSE (Q9DCA5), BRX1_PONAB (Q5RAN2), BRX1_RAT(Q4QQT6), BRX1_SCHPO (Q9HGL6), BRX1_XENLA (Q8UVY2), BRX1_YEAST (Q08235), IMP4_BOVIN (Q0VD01), IMP4_CANGA (Q6FNN7), IMP4_DEBHA (Q6BYD9), IMP4_EREGS (Q755T8), IMP4_HUMAN (Q96G21), IMP4_MOUSE (Q8VHZ7), IMP4_PONAB (Q5R947), IMP4_RAT(Q5PQR5), IMP4_SCHPO (O13823), IMP4_YARLI (Q6C804), IMP4_YEAST (P53941), PPAN_ARATH (Q9ASU7), PPAN_DICDI (Q54N44), PPAN_DROME (Q9VDE5), RPF1_DANRE (Q6IQU6), RPF1_DROME (Q9VKB4), RPF1_HUMAN (Q9H9Y2), RPF1_MOUSE (Q7TND5), RPF1_PONAB (Q5R631), RPF1_RAT(Q5RJS9), RPF1_XENLA (Q8AVP1), RPF1_YEAST (P38805), RPF2_ARATH (Q9LUG5), RPF2_BOVIN (Q2YDN6), RPF2_CAEEL (Q9N3F0), RPF2_DICDI (Q54DJ0), RPF2_DROME (Q9VEB3), RPF2_HUMAN (Q9H7B2), RPF2_MOUSE (Q9JJ80), RPF2_ORYSJ (Q9AWM9), RPF2_SCHPO (Q9UUG1), RPF2_YEAST (P36160), SSF1_HUMAN (Q9NQ55), SSF1_MOUSE (Q91YU8), SSF1_PONAB (Q5REM3), SSF1_YEAST (P38789), SSF2_YEAST (Q12153), YDD3_SCHPO (O14206), YDS4_SCHPO (O14180), YHPK_CAEEL (O62518), YUY1_CAEEL (P54073)» more
|
| PDB [Detailed view] |
88 PDB
1W94; 2CXH; 3JCT; 5A53; 5WLC; 5WXL; 5WYJ; 5WYK; 5Z1G; 5Z3G; 6C0F; 6CB1; 6ELZ; 6EM1; 6EM3; 6EM4; 6EM5; 6FT6; 6KE6; 6LQP; 6LQQ; 6LQR; 6LQS; 6LQT; 6LQU; 6LQV; 6M62; 6ZQA; 6ZQB; 6ZQC; 6ZQD; 6ZQE; 6ZQF; 6ZQG; 7AJT; 7AJU; 7BT6; 7BTB; 7D4I; 7D5S; 7D5T; 7D63; 7MQ8; 7MQ9; 7MQA; 7NAC; 7OH3; 7OHQ; 7OHR; 7OHS; 7OHT; 7OHV; 7OHW; 7OHX; 7R6K; 7R7A; 7R7C; 7SUK; 7UG6; 7UOO; 7UQB; 7UQZ; 7V08; 8E5T; 8ESQ; 8ESR; 8ETG; 8ETH; 8ETI; 8EUP; 8EUY; 8EV3; 8FKP; 8FKQ; 8FKR; 8FKS; 8FKT; 8FKU; 8FKV; 8FKW; 8FKX; 8FKY; 8FL0; 8IR1; 8IR3; 8V83; 8V84; 8V87 » more |