PROSITE entry PS50834
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | HIN_200 |
Accession [info] | PS50834 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50834 |
Associated ProRule [info] | PRU00106 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | HIN-200 A and B domains profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=199; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=194; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6209000; R2=0.0130480; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-6550.8398438; R2=38.0582962; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=604; H_SCORE=16436; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=451; H_SCORE=10613; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= 7, -2,-19, -8, -4,-20,-13,-15,-16, 1,-19,-13, 0, 6, -6, -6, 7, 13,-12,-27,-17, -6; /M: SY='Q'; M= -8,-12,-26,-10, 5,-21,-24,-10, -6, -1, -5, -1,-13, -2, 10, -4, -9, -8, -7,-24,-12, 7; /M: SY='P'; M=-11, -8,-13, -9, -5,-19,-19,-12,-17, -1,-14,-11, -3, 10, -7, 0,-10, -8,-18,-30,-18, -8; /M: SY='Q'; M=-10, 1,-30, 2, 20,-34,-20, -1,-26, 30,-25, -7, 0, -9, 31, 19, -5,-10,-25,-21,-11, 25; /M: SY='E'; M= -8, 10,-22, 8, 21,-20,-16, -4,-13, 0,-16,-13, 11,-13, 2, -5, 1, -5,-12,-33,-18, 12; /M: SY='I'; M= -6,-10,-24,-10,-11,-15,-23,-20, 6,-16, -8, -5, -9, 3,-12,-19, 0, 3, 4,-30,-14,-14; /M: SY='P'; M= 8,-13,-20,-14, -7, -6,-11,-17,-14,-13,-19,-14, -8, 14,-12,-17, 9, 2,-12,-24,-14,-10; /M: SY='R'; M=-15, -6,-30, -6, 9,-22,-22, -6,-21, 25,-18, -8, -2,-14, 8, 37, -9,-10,-16,-22,-11, 6; /M: SY='G'; M= -8, -4,-30, -1, 8,-28, 23,-10,-35, 0,-25,-18, 0,-14, -1, 7, -2,-15,-28,-23,-22, 2; /M: SY='B'; M= 5, 22,-22, 22, 14,-27, -6, -4,-24, -1,-22,-20, 16,-10, 1, -9, 5, -5,-21,-32,-20, 7; /M: SY='V'; M= -1,-13,-17,-11,-19,-14, 1,-22, 0,-17, -9, -5,-13,-23,-21,-18, -1, -4, 15,-30,-17,-20; /M: SY='L'; M= -7,-19,-25,-19,-13, 0,-24, 9, -1,-18, 12, 5,-18,-12,-11,-15,-18,-11, -7,-14, 12,-14; /M: SY='H'; M=-17, 0,-30, 0, 7,-27,-20, 69,-27, -3,-20, 0, 7,-17, 27, 3, -7,-17,-30,-27, 10, 14; /M: SY='E'; M= -5, 6,-23, 5, 13,-26,-12, 7,-25, 12,-27,-14, 11,-11, 11, 6, 9, -1,-22,-30,-12, 11; /M: SY='D'; M=-10, 9,-30, 15, 9,-31, 14, -8,-36, 5,-27,-20, 5,-13, -1, 2, -2,-14,-28,-26,-21, 3; /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12, -2,-26,-21,-20,-16,-12,-21,-16,-21, 77,-11,-20,-12,-10,-26,-29,-27,-11; /M: SY='K'; M= -8,-15,-22,-16, -8,-12,-24,-15, -1, 12, -1, 9,-15,-19, -6, 5,-15, -8, 5,-22, -7, -7; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-22, -6, 6,-22,-22, -8, -9, -3,-11, -4, -2,-10, 17, -4, 6, 15,-11,-25,-10, 11; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='M'; M= -7,-21,-18,-27,-20, -3,-23, -9, 18, -7, 13, 41,-21,-22, -7, -9,-17, -7, 17,-23, -3,-13; /M: SY='V'; M= 7,-27,-10,-29,-27, -3,-26,-29, 24,-19, 7, 7,-27,-27,-27,-20, -7, 0, 43,-29,-11,-27; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M= -5, 4,-22, -1, 3,-23,-16,-11,-23, 24,-25,-12, 7,-11, 3, 13, 5, 10,-15,-26,-12, 3; /M: SY='A'; M= 37,-12,-10,-21,-13,-16, -7,-22, -4,-12, -7, -7,-12,-13,-13,-19, 8, 5, 8,-23,-17,-13; /M: SY='T'; M= -1, 0,-13, -9, -7,-13,-20,-19,-13, -2,-13,-10, 0,-10, -7, -5, 16, 42, -3,-29,-10, -7; /M: SY='E'; M= -5, 10,-28, 15, 28,-30,-16, -6,-29, 22,-24,-17, 2, -6, 10, 8, -3, -9,-23,-27,-16, 19; /M: SY='P'; M= -8,-20,-34,-12, -3,-23,-20,-19,-14,-13,-18,-14,-19, 63,-11,-19, -8, -7,-22,-29,-25,-11; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='T'; M= -5, 4,-18, 0, 8,-17,-19,-12,-14, 1,-15,-12, 4,-11, -1, -3, 8, 19, -8,-30,-14, 3; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 15, 0,-13, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21; /M: SY='E'; M=-13, 21,-30, 33, 42,-33,-17, -1,-33, 12,-24,-22, 6, -4, 13, 0, -1,-10,-29,-32,-19, 27; /M: SY='S'; M= 0, -5,-17, -6, 1,-10,-14,-14,-14,-11,-14,-13, -2, -2, -5,-11, 16, 16,-10,-30,-13, -2; /M: SY='P'; M= -9,-12,-33, -9, 2,-27,-12,-14,-15, 1,-21, -9,-10, 22, 3, -7, -8,-11,-19,-24,-18, 0; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 15, 47,-30,-20, -3,-30, 21,-23,-17, 0, -3, 17, 8, -3,-10,-27,-27,-17, 32; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='H'; M= -6, 5,-20, 3, -2,-20, 1, 11,-19, -6,-18, -5, 9,-14, 4, -6, 5, -2,-18,-27,-10, 0; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='K'; M= -8, 1,-28, 2, 16,-30,-18, -6,-28, 34,-27,-11, 1, -9, 17, 20, -2, -7,-22,-23,-12, 17; /M: SY='K'; M=-11, 7,-25, 2, 7,-21,-17, -5,-18, 14,-20,-11, 14,-14, 4, 14, -1, -1,-17,-28,-13, 4; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 75,-30,-20, 1,-30, 13, 1,-21,-30,-39,-20,-21,-10, 1, 8, 28,-29; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='T'; M= 1, 0,-10, -9, -9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11, 1,-10, -9,-10, 22, 47, -1,-31,-11, -9; /M: SY='E'; M=-10, 8,-27, 16, 32,-28,-20, -4,-22, 8,-18,-14, -1, -8, 13, 0, -2, -9,-17,-29,-17, 22; /M: SY='T'; M= 0, 4,-14, -3, -4,-16,-13,-13,-16, -1,-20,-14, 8,-11, -4, -4, 20, 29, -8,-32,-14, -4; /M: SY='E'; M=-10, 5,-30, 11, 42,-35,-20, 5,-25, 10,-20,-11, 0, -5, 38, 5, 0,-10,-30,-25,-15, 40; /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-32,-26, 54,-30, -6, 3,-22, 6, 1,-21,-30,-28,-16,-19, -9, 1, 13, 44,-26; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29; /M: SY='R'; M=-20, -9,-29,-11, -4, -6,-21, 32,-26, 8,-16, -5, 1,-21, 3, 34,-11,-13,-21,-19, 6, -4; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='K'; M=-10, -3,-29, -4, 6,-26,-20, -9,-23, 41,-23, 0, -3,-11, 9, 24,-11,-10,-16,-20, -9, 7; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 73,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='N'; M=-13, 38,-24, 33, 14,-27, -6, 6,-27, 1,-29,-23, 41,-14, 3, -3, 6, -4,-30,-39,-20, 9; /M: SY='T'; M= -6,-11,-21,-18, -8, -8,-27,-18, 11,-14, 2, 7, -9,-13, -8,-15, -1, 13, 7,-25, -7, -9; /M: SY='B'; M= -2, 22,-20, 20, 2,-22, -7, -4,-19, -7,-16,-16, 20,-16, -4,-10, 4, -2,-18,-34,-17, -1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-29, 1, 15,-28,-20, -8,-27, 40,-25, -7, -1, -9, 11, 23, -9,-10,-19,-21,-11, 13; /M: SY='E'; M= -8, 12,-27, 21, 38,-30,-15, -3,-30, 11,-24,-20, 4, -4, 13, 2, 5, -5,-25,-31,-19, 25; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='I'; M= -5,-13,-20,-22,-20, -5,-28,-23, 20,-19, 3, 4, -6,-17,-16,-19, -2, 14, 16,-27, -7,-20; /M: SY='P'; M=-10,-12,-35, -5, 7,-29,-11,-14,-26, 4,-28,-18,-11, 43, -2, -1, -8,-11,-28,-27,-24, -1; /M: SY='K'; M= -9, 5,-28, 1, 1,-27, 3, -7,-30, 23,-29,-14, 12,-15, 2, 17, -4,-10,-24,-24,-16, 1; /M: SY='K'; M=-11, 14,-26, 6, 5,-25,-12, -1,-26, 28,-29,-14, 23,-15, 6, 24, -2, -6,-24,-28,-14, 5; /M: SY='I'; M=-10,-26,-22,-35,-27, 19,-33,-26, 26,-26, 12, 9,-18,-22,-25,-23,-13, 0, 20,-15, 5,-27; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='A'; M= 17,-13,-16,-23,-16,-11,-18,-23, 8,-16, -1, -1,-10,-13,-13,-20, 4, 12, 9,-23,-11,-16; /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29, 1,-39,-29, 46,-30, 24, 20,-21,-21,-20,-29,-21,-10, 27,-20, 0,-29; /M: SY='S'; M= 19, -2,-10, -5, -2,-20, 0,-12,-18,-10,-25,-18, 5,-10, -2,-12, 33, 15, -8,-35,-20, -2; /M: SY='D'; M=-16, 30,-28, 34, 10,-30,-11, 8,-32, 9,-28,-20, 24,-14, 3, 9, -1, -8,-27,-34,-15, 6; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-31,-25, 43,-28,-15, 6,-24, 9, 2,-19,-27,-27,-18,-14, -6, 5, -1, 23,-25; /M: SY='E'; M= -8, 2,-14, 2, 12,-26, 9, -8,-32, -1,-24,-19, 5,-15, -1, 1, -1,-12,-27,-29,-23, 5; /M: SY='C'; M= -8,-11, 16,-15,-13,-12,-18, 5,-17,-11,-15, -3, -6,-24, -6, -6, 1, -4,-11,-30, -4,-11; /M: SY='N'; M= -7, 12,-22, 9, 1,-17,-10, 0,-21, 8,-26,-16, 17,-15, 1, 2, 7, 0,-19,-25, -3, 0; /M: SY='G'; M= 1, -9,-28, -9,-18,-29, 63,-19,-38,-19,-30,-20, 1,-19,-18,-19, 4,-16,-28,-22,-29,-18; /M: SY='F'; M=-10,-26,-20,-32,-25, 29,-28,-22, 15,-26, 11, 5,-18,-24,-26,-21,-11, -5, 13,-12, 8,-25; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-18, 20,-28, 47, 24,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='E'; M= -1, 7,-27, 14, 50,-29,-17, -3,-27, 7,-19,-19, -1, -1, 16, -3, 1, -9,-26,-29,-20, 33; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30, 0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30; /M: SY='N'; M=-14, 15,-25, 5, -4, -8,-13, 24,-17, 1,-21,-11, 26,-22, 0, 1, -3, -7,-24,-19, 12, -4; /M: SY='E'; M= -9, 3,-28, 10, 37,-27,-17, -3,-28, 8,-22,-18, -1, 4, 13, 8, 3, -6,-26,-30,-19, 23; /M: SY='A'; M= 14, -9,-16,-15, -7, -1,-14,-12, -9,-10, -8, -9, -9,-14,-10,-14, 4, 10, -4,-13, 2, -9; /M: SY='S'; M= 14, -1,-10, -3, -2,-19, -2,-12,-18,-10,-26,-18, 7,-10, -2,-11, 35, 21, -8,-37,-19, -2; /M: SY='T'; M= -1, -7, 7,-11, -9,-15,-15,-15,-17,-10,-15,-13, -2,-18, -7, -3, 14, 15, -7,-35,-16, -9; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='S'; M= 8, -9,-13,-10, -7,-12, -8,-14, -8,-16, -6, -8, -3,-16, -7,-14, 17, 10, -3,-32,-14, -7; /M: SY='D'; M=-15, 30,-30, 45, 40,-35,-15, 0,-35, 5,-25,-25, 10, -5, 10, -5, 0,-10,-30,-35,-20, 25; /M: SY='A'; M= 23,-20,-11,-26,-20, -2,-15,-24, 7,-16, 0, -1,-19,-20,-21,-20, -1, -1, 20,-21,-11,-20; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='N'; M= 8, 8,-19, 2, 5,-22, 1, -6,-20, 4,-20,-14, 13,-11, 0, -3, 4, -5,-18,-24,-17, 2; D=-6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='P'; M= 2,-13,-20,-11, -6,-15,-13,-15, -5,-10,-14, -9,-11, 26, -9,-14, 1, -2, -6,-22,-16, -9; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M=-10, 34,-22, 30, 7,-27, -5, 2,-27, 3,-30,-22, 36,-15, 1, -2, 10, -1,-26,-38,-19, 4; /M: SY='Q'; M=-11, -4,-32, -3, 15,-36,-20, 4,-21, 9,-22, -4, -3, 5, 44, 11, -3,-10,-29,-22,-13, 28; /M: SY='N'; M= -9, 8,-21, -3, -6,-14,-13, -1,-10, 5,-13, 5, 16,-17, 1, 6, -1, 3,-12,-29,-11, -3; /M: SY='F'; M=-12,-23,-22,-30,-22, 21,-27,-16, 12,-12, 8, 18,-18,-23,-18,-11,-17, -9, 11,-12, 7,-19; /M: SY='E'; M= -9, 8,-27, 11, 38,-24,-20, -3,-18, 3,-16,-15, 4, -7, 10, -4, -1, -8,-19,-31,-18, 24; /M: SY='V'; M= -5,-18,-18,-18,-23, -6,-30,-26, 25,-20, 7, 7,-20,-25,-23,-21,-11, -4, 33,-29, -9,-24; /M: SY='P'; M= -4,-14,-31, -7, 0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11, 60, -7,-17, 5, -1,-24,-33,-27, -7; /M: SY='N'; M= -7, 16,-21, 6, -1,-18, -8, -1,-17, 5,-19,-12, 27,-18, -1, 2, 5, -1,-19,-33,-15, -1; /M: SY='N'; M= -4, 7, -8, -1, -5,-20, -3, -8,-23, 0,-25,-16, 16,-17, -4, 2, 11, 7,-17,-33,-18, -5; /M: SY='I'; M= -7,-26,-25,-32,-23, 0,-32,-25, 32,-27, 20, 14,-18,-21,-17,-25,-14, -6, 19,-23, -3,-23; /M: SY='I'; M=-10,-12,-27,-16,-16,-10,-29,-21, 20,-17, 3, 5, -9,-17,-12,-15, -9, -3, 12,-25, -6,-18; /M: SY='R'; M=-15, 2,-29, 3, 21,-25,-18, 2,-28, 19,-21,-13, 6,-13, 17, 36, -4, -9,-25,-25,-14, 16; /M: SY='R'; M= -8, -1,-23, -5, -2,-19,-14, -6,-17, 11,-22,-11, 9,-16, 3, 21, 6, 0,-13,-29,-13, -2; /M: SY='A'; M= 41,-11,-14,-19, -9,-21, -3,-20,-11,-10,-13,-11,-11, 5,-10,-20, 7, -1, -4,-21,-21,-10; /M: SY='N'; M= -7, 6,-25, -3, -7,-19, -3, -9,-10, 0,-19, -9, 17,-17, -5, -4, 1, -5,-13,-29,-15, -7; /M: SY='E'; M= 9, -1,-22, 1, 25,-24,-15,-10,-18, 5,-15,-13, -6, -7, 5, -5, 1, -6,-12,-26,-18, 15; /M: SY='T'; M= -2, 0,-13, -7, -7,-13,-17, -1,-14,-10,-14,-10, 3,-11, -6, -9, 18, 35, -6,-31, -7, -7; /M: SY='P'; M=-10,-24,-33,-17, -7,-16,-24,-20, -6,-17, -1, -6,-24, 47,-14,-20,-17,-10,-16,-26,-19,-14; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='C'; M= -3, 8, 24, 3, -7,-22,-10,-10,-25,-13,-27,-21, 14,-21, -9,-14, 15, 4,-17,-43,-23, -8; /M: SY='D'; M=-13, 9,-27, 12, 4,-20,-21, -2,-16, 2,-16, -9, 1,-14, 8, -3, -3, -2,-16,-19, 2, 5; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 15,-20, 0,-23; /M: SY='H'; M=-14, -9,-14,-11, -2,-11,-24, 22,-18, -2,-12, -2, -5,-21, 12, -1,-10,-12,-19,-18, 9, 3; /M: SY='K'; M= -4, -3,-21, -3, 6,-19,-16,-12,-17, 10,-14, -9, -2,-12, 1, 3, 5, 6,-11,-28,-12, 4; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-29, -5, 10,-33, -8, 2,-18, 1,-13, -1, -4,-14, 39, 2, -4,-11,-25,-20,-12, 24; /M: SY='T'; M= 14, 0,-16, -4, -5,-20,-12,-18,-15, -9,-15,-14, -4, 4, -9,-15, 10, 17, -8,-28,-17, -8; /M: SY='S'; M= -2, -4,-19, -2, 8,-19,-12, -9,-19, 4,-17,-12, 0,-12, 3, 4, 12, 4,-13,-31,-15, 5; /M: SY='G'; M= -1, -7,-30, -6, -8,-30, 57,-17,-39,-16,-29,-20, 0,-17,-14,-17, 0,-19,-30,-21,-29,-11; /M: SY='T'; M= 0, 2,-14, -7, -7,-14,-15,-13,-15, -3,-15,-12, 6,-12, -5, 2, 16, 30, -7,-30,-13, -7; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-35,-26, 23,-31,-22, 23,-26, 24, 18,-24,-27,-24,-21,-21, -9, 18,-14, 6,-25; /M: SY='V'; M= -7,-30,-15,-34,-30, 23,-31,-27, 24,-24, 11, 8,-26,-29,-32,-21,-14, -4, 33,-17, 3,-30; /M: SY='Y'; M=-14, 10,-25, 7, -6, 0,-15, 11,-14, -5,-16,-12, 13,-22, -5, -7, -3, -4,-19, -8, 26, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -5,-18,-19,-15, 0, -7,-27,-18, 9,-13, 10, 3,-21,-21,-12,-14,-12, -5, 16,-28,-11, -6; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 76,-30,-16, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 34,-29; /M: SY='M'; M= 1,-13,-18,-17, -7,-10,-21,-15, 2, -3, 1, 10,-14,-17, -7, -7, -6, 2, 7,-24, -9, -7; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 24, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 36,-27, -7,-27; /M: SY='H'; M=-16, 0,-28, -2, 7,-12,-20, 39,-20, -3,-16, -4, 4,-17, 16, 0, -7,-12,-25,-17, 14, 9; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10, 0,-11, 10, 36,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='K'; M= -9, -4,-27, -4, 5,-26,-21,-13,-22, 40,-25, -7, -4,-13, 5, 23,-10, -9,-10,-21,-10, 5; /M: SY='T'; M= 0, 4,-15, -2, -2,-18,-12,-12,-18, 3,-22,-14, 9,-11, -2, -1, 20, 24,-10,-32,-14, -2; /M: SY='V'; M= -1,-14,-16,-11, 1,-12,-23,-18, 5,-10, -5, -3,-15,-18,-11,-13, 0, 0, 18,-31,-14, -5; /M: SY='R'; M=-12, 7,-27, 2, -1,-24, -1, 8,-29, 14,-26,-13, 18,-18, 3, 21, -3,-10,-25,-27,-13, -1; /M: SY='N'; M=-11, 14,-26, 11, 4,-27, -5, 4,-27, 12,-26,-14, 17,-15, 7, 9, 0, -5,-25,-29,-13, 5; /M: SY='K'; M=-10, 8,-29, 6, 18,-29,-17, -4,-28, 33,-28,-12, 9,-10, 14, 19, -5, -9,-24,-25,-13, 16; /M: SY='N'; M= -9, 6, 12, -7,-13, -1,-14, -9,-18,-14,-19,-15, 16,-24,-15,-12, 5, 3,-15,-32,-12,-13; /M: SY='I'; M= -6,-17,-21,-27,-21, -4,-31,-26, 24,-21, 7, 7,-11,-16,-16,-21, -2, 16, 17,-24, -4,-21; /M: SY='C'; M= -9,-20, 8,-26,-22, 0,-29,-17, 7,-22, 4, 1,-17,-26,-18,-21,-10, -1, 4,-20, 6,-22; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30, 10, 0,-15, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23; /M: SY='E'; M= -8, 8,-30, 15, 24,-31, 9, -7,-34, 4,-26,-20, 3, -9, 4, -4, -1,-13,-29,-27,-22, 14; /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29, 1,-39,-29, 46,-30, 24, 20,-21,-21,-20,-29,-21,-10, 27,-20, 0,-29; /M: SY='Q'; M= -7, -7,-30, -7, 1,-26, -3, -9,-26, 9,-26,-11, -5,-15, 14, 3, -3,-10,-25, 2, -9, 8; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='B'; M=-13, 37,-25, 36, 5,-29, 6, 2,-31, -3,-30,-24, 35,-16, -3, -7, 5, -7,-30,-37,-21, 1; /M: SY='T'; M= -2, 0,-14, -5, 1,-15,-17,-14,-16, -4,-15,-13, 1,-10, -3, -1, 18, 33, -7,-30,-13, -2; /M: SY='G'; M= -2, -3,-30, -1,-15,-31, 61,-18,-40,-18,-30,-21, 2,-19,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-16; /M: SY='K'; M= 1, 2,-23, -1, 3,-25,-11, -8,-24, 24,-26,-13, 7,-12, 4, 16, 4, -2,-17,-26,-14, 3; /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-33,-23, 0,-25, -8, 28,-15, 20, 50,-20,-20, -5,-15,-20,-10, 15,-20, 0,-15; /M: SY='E'; M= -8, 14,-29, 22, 34,-31,-17, -4,-31, 17,-24,-19, 3, -5, 11, 5, -2, -9,-25,-29,-17, 23; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29, 1,-30,-29, 29,-21, 15, 11,-30,-30,-29,-20,-13, -1, 45,-29, -9,-29; /M: SY='G'; M= -2,-22,-24,-22,-25,-13, 19,-25,-10,-20,-13, -8,-17,-25,-24,-20, -9,-13, 2, -4,-15,-24; /M: SY='S'; M= -3, -1,-17, 0, -6,-11,-14, 3,-12,-10,-17,-11, 0,-17, -6,-10, 12, 8, -5,-26, 2, -7; /M: SY='G'; M= -4, -9,-30, -9,-14,-29, 47,-16,-37, -5,-29,-17, 0,-19,-12, -2, -3,-17,-27,-20,-25,-14; /M: SY='Q'; M=-13, 4,-29, 3, 15,-29,-17, 3,-25, 20,-23, -9, 8,-13, 26, 26, -3, -9,-26,-24,-13, 19; /M: SY='W'; M=-12,-22,-17,-22, -8, -4,-25,-17, -6,-17, 8, -2,-24,-24, -6,-15,-23,-15,-12, 18, 1, -6; /M: SY='H'; M=-13, 11,-23, 9, 0,-20,-17, 41,-24, -8,-19, -9, 13,-16, 2, -4, 2, 5,-21,-32, 1, -2; /M: SY='N'; M= -5, 25,-16, 10, -2,-18, -5, 0,-18, -4,-25,-18, 39,-16, -2, -4, 17, 15,-20,-38,-18, -2; /M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-36,-29, 0,-34,-26, 40,-24, 17, 22,-23,-23,-20,-24,-17, -7, 33,-23, -3,-27; /M: SY='N'; M=-12, 17,-26, 8, 2,-23,-10, 1,-24, 16,-28,-16, 28, -7, 3, 16, 0, -5,-26,-31,-17, 1; /M: SY='C'; M=-11,-20,102,-29,-29,-14,-30,-24,-26,-28,-18,-18,-20,-39,-28,-28,-11,-10,-10,-41,-17,-29; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 14, 46,-30,-20, -3,-30, 21,-23,-17, 0, -3, 17, 8, -3,-10,-27,-27,-17, 32; /M: SY='E'; M=-10, -3,-32, 2, 26,-26,-23,-10,-17, 10,-18,-12, -6, 9, 7, -1, -7,-10,-19,-26,-16, 15; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-14, 41,-25, 52, 14,-34, -7, 0,-34, -2,-30,-27, 24,-11, 0, -9, 8, -4,-27,-40,-20, 7; /M: SY='K'; M= -9, 0,-27, -1, 7,-27,-20,-11,-27, 41,-27,-10, 0,-10, 7, 24, -6, -1,-17,-21,-10, 7; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-23, 7,-31,-23, 26,-29, 40, 19,-29,-29,-21,-21,-26, -9, 18,-21, -1,-23; /M: SY='R'; M=-17, -5,-30, -5, 5,-25,-20, 16,-28, 22,-21, -6, 1,-17, 21, 43, -8,-11,-24,-21, -6, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M= -9,-23,-15,-30,-25, 35,-28,-23, 7,-22, 5, 1,-18,-25,-30,-18, -8, 7, 15,-12, 8,-25; /M: SY='C'; M= -7,-17, 73,-25,-24, -6,-24,-24,-24,-26,-18,-17,-14,-32,-25,-24, -1, -4, -9,-40,-20,-24; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 73,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='E'; M=-12, 3,-27, 6, 25,-25,-20, 24,-26, 4,-19,-10, 3,-10, 16, 6, -1, -4,-25,-28, -6, 19; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M= -2, -4,-19, -8, -3,-18,-15,-11,-21, 11,-19,-11, 0,-13, 1, 20, 8, 13,-11,-26,-12, -3; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='K'; M= -3, -1,-21, -2, 3,-23,-14,-11,-24, 20,-26,-13, 3,-11, 4, 14, 10, 9,-14,-28,-13, 3; /M: SY='N'; M= -4, 6,-20, -1, -3,-18, -4,-10,-13, -3,-19,-12, 14,-16, -6, -6, 7, 5,-10,-31,-16, -5; /M: SY='N'; M= -1, 13,-25, 12, 3,-27, 10, -6,-29, 1,-25,-19, 15,-14, -3, -2, 2, -9,-24,-29,-21, 0; /M: SY='D'; M=-13, 17,-29, 22, 12,-31, 3, -2,-33, 3,-26,-19, 12,-13, 6, 6, -1,-11,-28,-29,-19, 8; /M: SY='K'; M= -7, -3,-26, -4, 9,-25,-13, -8,-19, 16,-18, -3, -4,-12, 10, 7, -4, -4,-14,-23,-12, 10; /M: SY='W'; M= -9,-24,-23,-22,-16, -9,-12,-22,-13,-20, -8,-10,-22, 4,-16,-20,-16,-13,-17, 14, -8,-16; /M: SY='K'; M=-11, -9,-28,-11, 4,-10,-25, -9,-10, 10, -9, -2, -7,-15, 9, 5,-11,-10,-12,-17, -3, 7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-11,-14,-22,-17,-12,-12,-24, -1, -5, 2, -7, -1, -8,-21, -6, 19, -7, 0, 4,-25, -6,-12; /M: SY='S'; M= 11, -6, 22,-10, -9,-20, -7,-16,-21,-15,-25,-19, 0,-17, -9,-16, 23, 10, -9,-40,-22, -9; /M: SY='G'; M= -1,-12,-22,-12,-13,-19, 23,-21,-17,-16,-16,-11, -8,-19,-17,-17, 0, -4, -5,-25,-21,-15; /M: SY='R'; M=-10, -3,-23, -5, -3,-16,-18, -7, -8, 2,-11, -2, 2,-18, -2, 13, -3, -4, -4,-28,-12, -5; /M: SY='H'; M=-20, -3,-30, -3, -3,-13,-21, 88,-26,-10,-17, 0, 6,-21, 7, -1,-11,-19,-27,-21, 29, -3; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='F'; M=-17,-20,-23,-26,-21, 43,-28, 4, -4,-19, 1, -1,-14,-26,-22,-14,-14, -3, -6, 7, 39,-21; /M: SY='I'; M= -9,-27,-25,-36,-27, 0,-33,-21, 39,-23, 19, 31,-21,-21,-15,-23,-19, -9, 25,-21, -1,-24; /M: SY='K'; M=-10, 2,-30, 3, 21,-33,-20, -3,-27, 32,-25, -9, 0, -8, 26, 19, -5,-10,-25,-22,-12, 24; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='I'; M= -7,-24,-26,-33,-25, -3,-34,-27, 37,-26, 12, 13,-15,-18,-17,-26,-10, 0, 23,-23, -3,-25; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 19 in 15 different sequences |
Number of true positive hits | 19 in 15 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 2 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | HIN-200 |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
15 sequences
AIM2_HUMAN (O14862), AIM2_MOUSE (Q91VJ1), IF16_HUMAN (Q16666), IF16_PONAB (Q5RD14), IFI2_MOUSE (Q9R002), IFI3_MOUSE (O35368), IFI4_MOUSE (P0DOV2), IFI5A_MOUSE (Q8CGE8), IFI5B_MOUSE (P0DOV1), IFIXL_MOUSE (Q504N7), IFIX_HUMAN (Q6K0P9), IFIX_MOUSE (Q8BV49), MNDAL_MOUSE (D0QMC3), MNDA_HUMAN (P41218), MNDA_MACFA (Q8SPH9)» more
|
PDB [Detailed view] |
23 PDB
2OQ0; 3B6Y; 3RLN; 3RLO; 3RN2; 3RN5; 3RNU; 4JBJ; 4JBK; 4JBM; 4L5Q; 4L5R; 4L5S; 4L5T; 4LNQ; 4QGU; 5YZP; 5YZW; 5Z7D; 6OE9; 8I6K; 8IDX; 8X70 » more |