PROSITE logo
Black ribbon
We are deeply saddened by the passing of Amos Bairoch (1957–2025), the creator of PROSITE. We wish to dedicate our latest paper, published shortly before his death, to him. He will always be a source of inspiration to us.
Our deepest condolences go out to his family and friends, and to all those who had the privilege of working with him. Rest in peace, Amos. Your work will live on long after you are gone.
Amos Bairoch

PROSITE entry PS50843


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50843

Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] EXPANSIN_CBD
Accession [info] PS50843
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2002 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50842
Associated ProRule [info] PRU00078

Name and characterization of the entry

Description [info] Expansin, Cellulose-binding-like domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=77;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9064000; R2=0.0129824; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6029.1855469; R2=4.6393919; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=585; H_SCORE=8743; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=431; H_SCORE=8029; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Y';  M=-14, -2,-25, -7,-10,  2,-15, 14,-12, -2,-14, -7,  6,-23, -6, -1, -7, -7,-15, -8, 23,-10;
/M: SY='Y';  M=-17,-20,-29,-23,-19, 30,-25, -1, -6,-15, -4, -6,-17,-27,-17,-13,-18, -9,-12, 35, 45,-18;
/M: SY='L';  M=-11,-21,-21,-25,-16, 14,-27,-16, 14,-24, 29, 13,-18,-26,-18,-18,-22, -9,  5,-18,  2,-17;
/M: SY='A';  M= 19,-14,-14,-19,-11,-11,-11,-16, -1,-14,  2,  1,-12,-16, -8,-16,  4,  2,  3,-25,-13,-10;
/M: SY='V';  M= -6,-29,-12,-32,-27,  7,-31,-26, 26,-25, 18, 11,-25,-28,-26,-22,-15, -4, 30,-24, -4,-27;
/M: SY='L';  M= -6,-20,-20,-22,-15,  2,-24,-15,  8,-16, 22, 10,-17,-25,-14,-11,-17, -5,  5,-20, -1,-15;
/M: SY='V';  M= -6,-30,-18,-34,-29,  7,-33,-29, 34,-25, 16, 13,-26,-27,-27,-23,-16, -5, 37,-23, -3,-29;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-23, -8,  7, -9,-21,-10,-11,  2, -3, -2, -8,-14,  0, -2, -5, -1,-10,-22, -6,  4;
/M: SY='Y';  M=-16,  2,-25, -7,-13, 16,-18, 12, -8, -8,-11, -8, 11,-26, -9, -7, -8, -6,-17,  0, 35,-13;
/M: SY='V';  M=  3,-10,-16,-12, -5,-13,-20,-16,  4, -9, -5, -3,-10,-19, -8,-12, -1,  2, 13,-29,-14, -7;
/M: SY='G';  M=  0,  7,-25,  3, -9,-27, 30,-10,-31, -7,-27,-19, 15,-18,-10, -7,  3,-11,-26,-26,-24, -9;
/M: SY='G';  M= -2,-10,-30,-10,-15,-28, 52,-19,-34,-16,-26,-18, -3,-14,-17,-18, -2,-18,-26,-21,-27,-16;
/M: SY='D';  M=  0,  9,-23, 14,  2,-25, -2, -8,-21, -7,-17,-14,  1,-14, -1,-12,  1, -7,-14,-27,-14,  0;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-27, -1,-13,-28, 44,-16,-34,-14,-27,-19,  4,-18,-15,-14,  3,-10,-25,-24,-25,-14;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D';  M=-10, 31,-23, 39, 14,-30, -9, -3,-29, -2,-25,-23, 18,-10,  0, -8,  8,  2,-23,-36,-18,  7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-20,-34,-28,  5,-33,-27, 34,-25, 20, 17,-25,-26,-24,-23,-18, -6, 33,-23, -3,-28;
/M: SY='V';  M=  8,-13,-16,-14,-11,-14,-11,-19, -3, -8, -6, -4,-12,-19,-12, -9,  0, -1,  9,-27,-14,-12;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-13, -5,  1,-22, -4, -9,-18, -4,-20,-13,  4,-13,  2, -6, 10,  0,-14,-28,-16,  1;
/M: SY='V';  M= -2,-29,-14,-31,-28,  0,-30,-26, 30,-21, 15, 16,-27,-27,-25,-20,-13, -3, 40,-27, -7,-27;
/M: SY='E';  M= -8,  9,-27, 15, 25,-25,-16,  2,-28,  8,-23,-16,  2, -8, 11,  0,  1, -8,-24,-24,-12, 18;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-19,-33,-28,  2,-33,-28, 34,-26, 23, 16,-27,-27,-24,-23,-18, -6, 34,-24, -4,-28;
/M: SY='K';  M= -4, -5,-27, -7,  3,-24,-17, -7,-22, 26,-21, -4, -4,-13, 11, 20, -7, -8,-16,-15, -9,  7;
/M: SY='E';  M= -6, -4,-29, -2, 10,-29,  4, -9,-27, -2,-23,-14, -3,  3,  9, -4,  0, -5,-26,-25,-20,  9;
/M: SY='S';  M=  8, -5,-15, -8, -4,-17,-12,  0,-12, -7,-16, -9, -1,-14, -3, -8, 12,  7, -4,-30,-11, -4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='G';  M= -3, -3,-17, -4, -8,-15, 21, -9,-18, -5,-12, -7,  1,-12, -7, -5, -3, -9,-14,-14,-13, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-14, -3, -4,-23, 10,-11,-26, -4,-27,-17,  7,-14, -3, -5, 17,  6,-17,-31,-20, -4;
/M: SY='G';  M= -5,  3,-23,  2, -1,-22,  6, -8,-27, -3,-23,-16,  5,-14, -5, -5,  6,  5,-19,-23,-15, -3;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-26,  1, 16,-26, -6, -4,-24,  6,-20,-12,  2,-11, 13,  5,  1, -7,-21,-24,-14, 14;
/M: SY='W';  M=-20,-38,-47,-39,-30, 15,-21,-27,-18,-20,-17,-18,-38,-30,-21,-20,-38,-28,-27,136, 32,-21;
/M: SY='I';  M= -9,-20,-24,-24,-14, -4,-29,-17, 16,-13, 14, 13,-17,-20, -9,-12,-15, -5,  9,-20, -1,-13;
/M: SY='P';  M=  0, -8,-25, -6,  1,-21,-14,-10,-19, -3,-23,-14, -6, 18,  3, -7,  6,  0,-18,-26,-15,  0;
/M: SY='M';  M= -7,-21,-20,-30,-20,  0,-20, -3, 19,-12, 22, 52,-21,-21, -3,-12,-20,-10, 10,-20, -1,-11;
/M: SY='R';  M=  0, -1,-20, -3,  4,-23,-10, -8,-22, 10,-23,-13,  3,-12,  8, 12, 11,  6,-15,-28,-15,  5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-16, -4,-29, -2, 11,-25,-19, 10,-29, 22,-22, -9,  1,-15, 17, 40, -6,-10,-23,-23, -8, 11;
/M: SY='N';  M= -4, 13,-18,  5, -3,-18, -7, -3,-13, -2,-20, -9, 23,-17, -2, -4, 11,  3,-14,-35,-16, -2;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='W';  M=-18,-30,-41,-31,-23,  9,-16,-15,-18,-14,-16,-14,-28,-27,-15,-10,-30,-23,-24, 96, 28,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  0, -6,-28, -5,-16,-29, 58,-18,-38,-18,-30,-20,  2,-18,-17,-18,  5,-15,-28,-23,-28,-16;
/M: SY='A';  M= 21, -6,-18,-11, -1,-23, -5,-14,-12, -7,-15,-10, -4, -4,  0,-14,  7, -2, -9,-25,-19, -1;
/M: SY='V';  M= -3, -6,-16,-14,-18, -7,-20,-16, 12,-15, -2,  0,  2,-23,-16,-14, -2,  2, 15,-31,-12,-18;
/M: SY='W';  M=-20,-37,-47,-37,-28, 13,-21,-21,-18,-19,-17,-17,-36,-30,-19,-19,-37,-27,-27,129, 33,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  4,-22,  6, 16,-29,-17,  5,-26, 11,-22,-11,  4,-12, 21, 16, -1, -7,-24,-27,-13, 17;
/M: SY='I';  M= -4,-22,-14,-26,-21,  0,-24,-22, 16,-23, 13,  8,-17,-23,-18,-20, -8,  1, 14,-25, -6,-21;
/M: SY='B';  M= -5, 14,-21, 14,  2,-18,-10, -1,-21, -1,-22,-14, 13,-15, -1, -5,  6, -2,-16,-31,-12,  1;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-17, -5, -2,-19, -6,-11,-15, -7,-17,-13,  4, -5, -2,-10, 13,  7,-11,-31,-18, -3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='B';  M=  2,  6,-24,  6, -4,-23,  2,-10,-21, -7,-22,-17,  6, -1, -9,-13,  2, -6,-17,-27,-17, -7;
/M: SY='P';  M= -9,-17,-26,-15, -8,-11,-19,-11, -7, -7,  0, -2,-15,  5,-10, -7,-12, -7, -9,-24,-10,-10;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -4, -7,-27, -8, -3,-20,-18,-12,-15, -1,-15,-10, -5, 14, -3,  0, -4, -1,-15,-25,-15, -6;
/M: SY='G';  M= -2,-16,-24,-17,-17,-14, 19,-15,-14,-20,  1, -3,-11,-23,-17,-17, -9,-13,-11,-22,-15,-17;
/M: SY='Q';  M= -7,  1,-27,  0,  7,-30,-14, -3,-23, 10,-22, -9,  2, -4, 20,  9,  1, -1,-22,-25,-14, 13;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='G';  M=  5,-10,-23,-10,-10,-22, 24,-15,-23,-12,-19,-13, -5, -2,-10,-13,  2, -9,-18,-20,-22,-11; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -5, -8,-19, -4,  1,-15,-10, -9,-11, -2,-15, -9, -8, 37, -2, -7, -5, -5,-15,-14,-13, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-14,-29,-20,-34,-24, 36,-29,-19, 12,-29, 33, 15,-26,-29,-27,-19,-26,-10,  6, -9, 11,-23;
/M: SY='S';  M=  2,  8,-14,  3,  1,-21, -5, -6,-19, -4,-27,-17, 17,-12,  4, -5, 26, 16,-15,-36,-17,  2;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-22,-37,-28, 37,-33,-24, 21,-29, 20, 10,-23,-27,-30,-23,-21, -9, 15, -8, 12,-28;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-29, -5,  7,-24,-19, -1,-29, 30,-22,-10,  0,-16, 14, 51, -7, -9,-21,-21,-11,  7;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-18,-33,-26, 18,-31,-24, 23,-26, 26, 15,-26,-28,-26,-21,-21, -7, 23,-18,  2,-26;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-14,-15,-12, -8,-23,-19, -2, -8, -1, -3, -9,-16,-10, -6,  5, 26,  6,-27, -9,-12;
/M: SY='S';  M=  7, -7,-12, -8, -3,-14,-12,-15, -8,-11,-13,-10, -3,-13, -7,-12, 18, 16,  1,-33,-15, -5;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -4,  7,-23, 10, 12,-24,-10, -8,-23,  3,-21,-15,  2,-10,  2, -3,  6,  4,-16,-28,-13,  7;
/M: SY='S';  M= -2,  8,-22, 11, -1,-26, 10,-11,-28, -7,-28,-21,  9, -8, -6,-10, 15,  4,-20,-33,-21, -3;
/M: SY='G';  M= -4, -6,-30, -7,-12,-27, 37,-12,-32, -8,-27,-16,  1,-18, -9,-11, -2,-16,-26,-16,-20,-11;
/M: SY='K';  M=-10, -5,-29, -6,  1,-22,-17, -8,-18, 18,-18, -2, -4,-15,  9, 11,-10,-11,-16, -7, -7,  5;
/M: SY='T';  M= -5, -8,-17,-13,-11,-10,-21,-16, -8, -3,-11, -7, -6,-16,-10, -3,  4, 21,  1,-15, -7,-11;
/M: SY='I';  M= -9,-18,-24,-23,-16, -5,-27,-17, 16,-18, 12,  8,-12,-23, -8,-16,-15, -8,  8,-17, -4,-14;
/M: SY='V';  M=  3,-17,-16,-20,-18, -7,-22,-22, 10,-16, -1,  0,-15,-20,-15,-17,  0,  7, 18,-21, -8,-17;
/M: SY='A';  M= 15, -7,-11,-12,-11, -4, -7,-16,-11,-14,-10,-10, -6,-17,-13,-17,  5, -1, -4,-22,-11,-11;
/M: SY='D';  M=-11,  2,-27,  4,  1,-16,-13,  0,-22,  3,-20,-14,  2,-10,  0,  1, -3, -5,-20,-13,  0, -1;
/M: SY='B';  M=-12, 33,-25, 31, 11,-28, -4,  3,-28,  1,-27,-22, 32,-14,  3, -2,  5, -3,-28,-36,-19,  7;
/M: SY='V';  M=  5,-28,-11,-29,-27, -2,-27,-28, 25,-19,  9,  8,-27,-27,-27,-20, -9, -1, 42,-28,-11,-27;
/M: SY='I';  M= -2,-27,-24,-35,-26, -1,-32,-27, 36,-26, 19, 16,-21,-21,-20,-26,-16, -8, 26,-21, -4,-26;
/M: SY='P';  M= -9,-19,-38, -9,  0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18, 85, -9,-19, -7, -8,-29,-31,-29, -9;
/M: SY='A';  M= 17, -3,-18, -5, -1,-22, -9,-14,-16, -2,-16,-13, -3, -3, -5, -8,  6,  1, -9,-26,-18, -4;
/M: SY='N';  M= -8, 15,-26, 10, -2,-20,  3,  3,-25, -2,-25,-18, 21,-18, -3, -3,  1, -8,-26,-19,-10, -3;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-47,-40,-30, 17,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,135, 30,-21;
/M: SY='K';  M= -5, -2,-23, -6, -1,-21,-15, -9,-15,  8,-17, -8,  1,-14,  7,  5,  1,  2,-12,-20,-10,  3;
/M: SY='P';  M=  3,-19,-22,-21,-13,  1,-17,-19, -6,-15,-10, -8,-16, 10,-16,-18, -4, -3, -4,-18, -7,-15;
/M: SY='G';  M= -3,  0,-29,  1,-13,-30, 53,-15,-38,-14,-30,-21,  7,-19,-15,-15,  0,-17,-30,-24,-27,-14;
/M: SY='Q';  M=  2, -3,-21, -5,  3,-22,-16, -5,-16,  5,-13, -5, -3,-13, 10,  3,  2,  2,-13,-24,-11,  6;
/M: SY='T';  M=  2, -8, -6,-17,-15, -7,-21,-21,  0,-15, -5, -5, -6,-16,-14,-15,  9, 24,  7,-29,-10,-15;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 14,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22;
/M: SY='R';  M=-11,  6,-26,  8,  7,-25,-14,  0,-25,  9,-21,-12,  3,-13,  9, 11,  0, -1,-20,-22,-11,  7;
/M: SY='S';  M=  8, -5,-17, -5, -5,-22, 10,-15,-22,-12,-27,-18,  3, -1, -6,-14, 23, 10,-14,-33,-22, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_04 which contains 573'661 sequence entries.


Total number of hits 107 in 107 different sequences
Number of true positive hits 107 in 107 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 2
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Expansin-like CBD
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
107 sequences

EXB10_MAIZE (Q1ZYQ8), EXB10_ORYSJ (Q8H7T4), EXB11_MAIZE (P0C1Y5), 
EXB11_ORYSJ (Q6H676), EXB12_ORYSJ (Q10G40), EXB13_ORYSJ (Q946J4), 
EXB14_ORYSJ (Q6H677), EXB15_ORYSJ (Q7XT40), EXB16_ORYSJ (Q0DZ85), 
EXB17_ORYSJ (Q7X6J9), EXB18_ORYSJ (Q5W6Z9), EXB6L_ARATH (F4IBJ3), 
EXLA1_ARATH (Q9LZT4), EXLA1_ORYSJ (Q10S70), EXLA2_ARATH (Q9SVE5), 
EXLA2_ORYSJ (Q7XCL0), EXLA3_ARATH (Q9LZT5), EXLA3_ORYSJ (Q8H274), 
EXLA4_ORYSJ (Q5Z980), EXLB1_ARATH (O23547), EXLB1_ORYSJ (Q850K7), 
EXP10_ARATH (Q9LDR9), EXP10_ORYSJ (Q7XUD0), EXP11_ARATH (Q9LNU3), 
EXP11_ORYSJ (Q4PNY1), EXP12_ARATH (Q9LDJ3), EXP12_ORYSJ (Q7G6Z2), 
EXP13_ARATH (Q9M9P0), EXP13_ORYSJ (Q4PR52), EXP14_ARATH (Q9FMA0), 
EXP14_ORYSJ (Q4PR51), EXP15_ARATH (O80622), EXP15_ORYSJ (Q4PR50), 
EXP16_ARATH (Q9M2S9), EXP16_ORYSJ (Q69XV9), EXP17_ARATH (Q9ZSI1), 
EXP17_ORYSJ (Q4PR49), EXP18_ARATH (Q9LQ07), EXP18_ORYSJ (Q4PR48), 
EXP19_ORYSJ (Q7G6Z5), EXP20_ARATH (Q9SZM1), EXP20_ORYSJ (Q10RK1), 
EXP21_ARATH (Q9FL81), EXP21_ORYSJ (Q10KN4), EXP22_ARATH (Q9FL80), 
EXP22_ORYSJ (Q4PR44), EXP23_ARATH (Q9FL79), EXP23_ORYSJ (Q4PR43), 
EXP24_ARATH (Q9FL76), EXP24_ORYSJ (Q4PR42), EXP25_ARATH (Q9FL77), 
EXP25_ORYSJ (Q4PR41), EXP26_ARATH (Q9FL78), EXP26_ORYSJ (Q2QP13), 
EXP27_ORYSJ (Q7XE35), EXP28_ORYSJ (Q4PR40), EXP29_ORYSJ (Q4PR39), 
EXP30_ORYSJ (Q8W2X8), EXP31_ORYSJ (Q75I75), EXP32_ORYSJ (Q6YYW5), 
EXP33_ORYSJ (P0C1Y4), EXPA1_ARATH (Q9C554), EXPA1_ORYSJ (Q7XWU8), 
EXPA2_ARATH (Q38866), EXPA2_ORYSJ (Q40636), EXPA3_ARATH (O80932), 
EXPA3_ORYSJ (Q40637), EXPA4_ARATH (O48818), EXPA4_ORYSI (A2Y5R6), 
EXPA4_ORYSJ (Q0DHB7), EXPA5_ARATH (Q38864), EXPA5_ORYSJ (Q6ZGU9), 
EXPA6_ARATH (Q38865), EXPA6_ORYSJ (Q9M4X7), EXPA7_ARATH (Q9LN94), 
EXPA7_ORYSJ (Q852A1), EXPA8_ARATH (O22874), EXPA8_ORYSJ (Q9XHX0), 
EXPA9_ARATH (Q9LZ99), EXPA9_ORYSJ (Q4PR53), EXPB1_ARATH (Q9SKU2), 
EXPB1_MAIZE (P58738), EXPB1_ORYSJ (Q40638), EXPB1_PASNO (B8PYF3), 
EXPB2_ARATH (Q9SHY6), EXPB2_ORYSJ (O24230), EXPB3_ARATH (Q9M0I2), 
EXPB3_ORYSJ (Q336T5), EXPB4_ARATH (Q9SHD1), EXPB4_ORYSJ (Q94LR4), 
EXPB5_ARATH (Q9M203), EXPB5_ORYSJ (Q7XT39), EXPB6_ARATH (Q6IVU7), 
EXPB6_ORYSJ (Q7XCA7), EXPB7_ORYSJ (Q9LD07), EXPB8_ORYSJ (Q10T32), 
EXPB9_MAIZE (Q07154), EXPB9_ORYSJ (Q7XCG7), MPAC1_CYNDA (O04701), 
MPAG3_DACGL (P93124), MPAH1_HOLLA (P43216), MPAL1_LOLPR (P14946), 
MPAL2_LOLPR (P14947), MPAL3_LOLPR (P14948), MPAP1_PHAAQ (Q41260), 
MPAP1_PHLPR (P43213), MPAP2_PHLPR (P43214)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
2 sequences

EXPB1_PSEMZ (P85909), EXPB_PASNO  (P85293)

		
PDB
[Detailed view]
6 PDB

pdb_00001bmw; pdb_00001n10; pdb_00001who; pdb_00001whp; pdb_00002hcz; pdb_00002vxq